2O7UA

Crystal structure of k206e/k296e mutant of the n-terminal half molecule of human transferrin
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVEHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFEDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of two mutants that probe the role in iron release of the dilysine pair in the N-lobe of human transferrin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serotransferrin
total genus 92
structure length 329
sequence length 329
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o7uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o7uA02
4ZEFA 3MZ1A 4X1BA 1LAHE 4F1VA 5I2NB 1HSEA 3KN7A 1P1QA 4F31B 1AOVA 1I6QA 2ANJA 1FTKA 1OMPA 3TTNA 2G93A 3TAJA 1FTLA 2CZLA 4PFUA 4ELQA 1XVXA 2RKMA 5DEXA 4ZECA 3TDJA 2NOOA 1US4A 1Y4CA 3MP1A 4IY5A 4NF6B 5DVIA 4PP0A 3QUFA 3O28A 3B7DA 4I1DA 1B52A 2HXWA 2XXUA 1MDQA 4DCYA 4RJZA 5CRYA 2X7QA 1P1OA 4FJPA 1IXIA 4GXSB 1GV8A 4PETA 2QPQA 2VHAA 3B6TA 3MW0A 3VLVA 3G3FA 3CRBA 3K01A 3TZAA 3RN8A 3WAFA 1AIVA 4ISUA 4BDOA 2F78A 3SDFA 2XXPA 3OEKA 4EUOA 2HCAA 3N6UA 4P0GA 3DP6A 5ITPA 1PEBA 3RT6B 4GVOA 4R2BA 1N76A 2DE3A 1L5TA 4POXA 1N7WA 1LAGE 3TKDA 1UIVA 2OWSA 5A5XB 2QL3A 1D3KA 1MY2A 5AA2D 2Z8EA 4XKNA 1P1WA 4WKMA 1B3GA 1SYIA 4JWOA 3PUWE 3IJOB 2ZXTA 3OMBA 1VFDA 3EF7A 5HBCA 2ZNUA 4OMBA 3MC2A 2I0CA 3OO7A 3W15C 4F3SA 1ZIUA 3G3IA 2BJJX 1MQHA 1MS7A 1LGBC 3UA8A 2Y7KA 1DMBA 1IITA 3D4CA 3MJNA 3K4UA 3MVYA 2WKYA 2I3VA 3L6HA 1ATGA 3FUZA 4JXIA 5H8NB 4RK9A 4F3GA 5H8QA 4HW8A 1RKMA 4G8HA 4FE8A 3OOAA 1MXVA 4XKQA 1HSLA 3S9LC 4WXJA 5CMMA 2DE2A 3K1MA 3KJTA 3QUJA 5TU0A 4JBZA 4YKKA 1UTHA 2X7PA 4PQJA 3VE1B 4EF2A 1XHYA 3IB0A 1N3WA 4QHQA 4DXUA 3PGFA 4X9TA 4U23A 3LR1A 1GVCA 2DP8A 2W7YA 4GD5A 3KZGA 1DPPA 2ONSA 4YKJA 1TT1A 1BLFA 4F3BA 3PU5A 3SESA 2ZMBA 4GL8A 3TQWA 3QXMA 2UVJA 2XX8A 1QUJA 4NF6A 3LSWA 2XXVA 3O66A 4OENA 1LB8A 4OFLA 4RYAA 2O51A 3MAMA 3PPQA 5F7VA 4F19A 4ZEBA 4EXKA 2NUVA 3TELA 4F2OA 2V25A 2XD2A 1VFEA 3JYRA 1I6AA 1WVJA 1TXFA 3LSLA 1B5IA 1IXGA 4H5FA 4LUBA 1NNKA 3MP8A 3PD8A 1JW1A 2H98A 3VVFA 1B3FA 4ZS9A 4TLMB 5L9MA 3H03A 3H6WA 4WEDA 4BDQA 1B1HA 3I6VA 3QK6A 4THIA 3G3HA 3IR1A 4YKPA 1MPBA 4EQ7A 3VVEA 4OFOA 3MVXA 2AIXA 3B6WA 4ZDMA 4ONYA 4KD5A 2ESNA 4G77A 2PT2A 1POY1 3C36A 3L6GA 1B1XA 1WODA 1CB6A 3FXQA 1MXUA 3VFJA 1B5JA 2B3BA 1S50A 4N6PA 3EPEA 5H8SA 3PUYE 5KZTA 3MBPA 2ZNSA 5I2KA 1BIYA 3LC8A 2DE4A 1IEJA 2Y7RA 4KHZE 1OLCA 4R74A 2THIA 1MPCA 4OYVA 3RNNA 1I6BA 2HEUA 1B7UA 3M3LA 1ZMGA 2XX9A 3DLNA 4KFQA 2PX1A 3C9HA 2DVZA 5DEXB 4R6YA 1FQEA 1I69A 1S9TA 3U8QA 3I3VA 3KBRA 2Y7WA 2AL5A 3GBAA 4BDRA 3RTFB 5H8FA 4POWA 5DVJA 3FV1A 3THIA 5DYHA 4JWYA 2V3QA 2QMXA 3PUZE 3O9PA 2XX7A 1HSJA 1S7YA 2OZZA 1UTBA 2UVIA 3IORA 2QRYA 3O6HA 2DWAA 4QSDA 2HAVA 3U92A 1NFTA 5B7DA 4BDMA 4XXUA 1FQDA 3CFZA 1OQGA 3HO7A 4IO4A 2OK2A 5CMKA 3C4MA 2H5YA 3ZKKA 3HHGA 2P0SA 4NF4A 3A3UA 4QF9A 4YICA 2Q88A 3I5OA 3F11A 3O29A 2ONRA 3T66A 2F8DA 4ESXA 1B9JA 3G3KA 5I59B 4BLAA 4QFNA 1MY3A 1Q35A 1NKXA 3UIFA 1VSOA 3TODA 2QJEA 3O2AA 2FNCA 4ZE8A 1II5A 3N26A 1FCKA 4Q8RA 4OWDA 4F39A 3T96B 3CG3A 3Q27A 2DS9A 1M5CA 3DELB 3CI8A 1D9VA 2Z22A 4DCXA 1ELJA 4Q0CA 5IKBA 1ZBMA 2DVCA 4OEUA 5L9SA 5ITOA 3PMVA 2IEEA 3Q29A 4R9FA 1B0LA 1LCFA 4I62A 3BBRA 2Q2AA 3O6GA 3V89B 5H8QB 1NL5A 1SW4A 3FD3A 5BUUA 1M5EA 4F22A 1IXCA 2X26A 3SEVA 5FHNA 3V8XB 3UORA 1B0HA 1SQYA 1H76A 3H6TA 3E13X 3JV9A 1MH3A 3C35A 1UTHB 2M8CA 4NTLA 1MQDA 4QFOA 3RUMA 3OSRA 5EYFA 5AA2A 2REJA 2Y7PA 3ILTB 4IB2A 4XKRA 3T9XB 4RY1A 4EDPA 3OO8A 4QRZA 1FTOA 4KQPA 2O6AA 1MM6A 4IO2A 3T9HB 3PUVE 4HCYA 4XIGQ 1R9QA 4X48A 1TFAA 1B3EA 1Y9UA 2F97A 1SI0A 3CVGA 4QFPA 4GQOA 1MH4A 4Q30B 1B3LA 2UVHA 1VR5A 2PYYA 1IQ7A 2YPNA 3TMGA 1JEVA 4U2RA 3KSXA 4OFJA 1SVXB 2F7AA 4RK2A 4R6KA 4JDFA 1B40A 4F2QA 2F5XA 4JB7A 4ZEDA 4G8NA 3S9NC 1A7LA 1A40A 2O68A 3E9XA 1N7XA 2RINA 3HN0A 3PMXA 1A55A 4RNSA 5ICTA 2ZYOA 4H65A 1MQGA 4E0XA 1WDNA 2HZLA 3E3KA 3KJ7A 3CSGA 1MY4A 3RGYA 4N13A 1QW0A 5AA3A 5K2XA 2DWJA 3OSQA 4XTCQ 1JEUA 5KDTA 1LFHA 1B6HA 5M2VA 4F18A 3O97A 3KSJA 3QIMA 5I59A 3U93A 4MBPA 4O3CA 4M4GA 3C32A 1JNFA 3Q25A 4FEBA 1MY0A 4R2FA 5I2KB 5DVFA 3VDFA 3K02A 3IX1A 4AQ4A 2D5WA 4JSOA 4GIZA 3JZJA 3G3GA 1B32A 3MP6A 2E0SA 5HPQA 4KYSA 4RXLA 3TCGA 3VVDA 2B65A 1EH3A 1LAXA 2DYXA 5H8FB 1PC3A 3KEIA 1VE4A 3HCQA 3H3GA 1KWHA 3EQ1A 4P0IA 3WAEA 4DXCA 2DXYA 4EQ9A 1GR2A 3PPNA 2VGQA 5JEIA 3IJXB 2CMOA 1UTBB 4LZ5A 4OERA 4YB6A 3TQLA 2H25A 4R6HA 4U4SA 4NF8A 5F1QA 5KCJA 3RTWB 4ZE9A 1MXYA 1QULA 2AYSA 1Y3NA 2DWHA 2P2AA 1Y1ZA 3KOSA 3U72A 3CG1A 4LQ2A 1B7ZA 2ONKE 3MWBA 1NH7A 4HCWA 4OESA 1JQFA 2RC9A 1LSTA 1POTA 2RCBA 4NF4B 4EXLA 1URDA 4U21A 3O6IA 5BWJA 1LFGA 1MDP1 3P7IA 4RPOA 1QKAA 3PPRA 4K3FA 3FXRA 4BDNA 1R9LA 4OXVA 1SBPA 1US5A 4LONB 1JW4A 2XXTA 4KCCA 3PPPA 2HAUA 2HFBA 2QS3A 1MM7A 4F29A 3M3KA 3OXNA 3CR9A 4IO5A 4G2ZA 1PB8A 3BKIB 1PDAA 3MPLA 3R26A 4FAJA 3ODBA 3IL1B 4UACA 1XT8A 3LSFB 4C0RA 5I58A 1FTMA 3DP4A 1T0KA 3C33A 4LA9A 5AE4A 2PT1A 3PUXE 2XXRA 5IAIA 2XXIA 1N0TA 5I84A 2OBGA 1PB9A 1B4ZA 4C1TA 4MFIA 3M8UA 3IOWA 3LSXA 4YAHX 2A5SA 1XS5A 2ABHA 2ZYMA 3R7XA 1NMUA 2I48A 1MXXA 1QUIA 3EHUA 1YTVA 3RLFE 2O84X 4GOTA 5JTYA 4PFTA 5AA2B 4ZZAA 3IO4A 5EHSA 2Y84A 4OETA 2E1SA 3H6UA 3CFLA 4NF5B 4R75A 2ZYNA 3TTKA 3K6XA 2AL4A 2P1SA 1USYH 1B46A 2PMSA 3HSTA 3TCFA 1MXWA 3K6UA 3SERA 4PE5B 3SEYA 5TP9B 3SEUA 4WEPA 2I4BA 3HV1A 4N07A 5ELVA 4IGRA 4AB5A 4ELPA 2R6GE 2R71A 1OIBA 4NWCA 4NEDA 4JWXA 4C1UA 3VXBA 3OELA 3EN3A 3RQTA 2DXRA 3KFMA 2D21A 1DSNA 1LCTA 1PBPA 4G68A 1H45A 4GF8A 3MVWA 1Y1MA 5FTHA 5JK4A 1GGGA 5KDTB 1Y4TA 4OVJA 1M5BA 4U4XA 3Q26A 3G7WA 1PB7A 3FJGA 4Z0IA 1IIWA 3IAZA 1AH5A 3CIJA 3B6QA 3H6VA 4MH5A 1AMFA 2FA7A 1H44A 4F3PA 2I6EA 1N3XA 1R1NA 4MLQA 2XXWA 3SEWA 2XXHA 3K1NA 3FVNA 4GXAA 4QSEA 3TTRA 3VV5A 4R73A 1Y20A 3IOUA 2DSFA 4FIMA 1N04A 2F7BA 4GWOA 2V3TA 1MXZA 3HPIA 1OVTA 3VXCA 1MPDA 1FW0A 3H06B 4YKIA 2GHAA 4ZEIA 4NF8B 5KCJB 3UK4A 4G4PA 1MQJA 2Q89A 4ND9A 2GHBA 2UYEA 1URGA 1JVXA 2O69A 4DDDA 4X1DA 2ZNTA 3LBSA 1M5DA 4FATA 2Z8FA 3FV2A 3E4RA 4YB5A 4LZ8A 4MF3A 4YZZA 3K00A 3CFXA 1B2HA 3GBBA 2F6PA 1FQBA 1SW2A 3BFUA 5FTIA 5L9OA 3TTMA 1H43A 5EHMA 4L17A 3ONMA 3HHFA 4NF5A 4RPNA 3RPWA 1URSA 1LBBA 1B05A 2XXQA 2YJPA 4ZEKA 2F6GA 4H1XA 1YPNA 1Y3PA 1ZU0A 2F36A 3MPKA 3W9WA 5TP9A 1MQIA 2LAOA 3K1PA 1EZPA 2YLNA 1Z7NE 3KGCA 3UN6A 4M1VA 5B70A 4YB7A 3PMWA 5I58B 4R9GA 3TUSA 2VD3A 1SI1A 5CBSA 3T9VA 3PV0E 4H8JA 1B58A 4NE4A 4U1OA 4IY6A 2NXOA 3IOTA 4KYEA 2XXXA 1Q1KA 4OZ9A 4DE8A 1USYE 4ELRA 2DOJA 4ZZEA 4I9DA 2NWJA 4U22A 1NNFA 1JW5A 1BP5A 5I57A 1UQWA 3KOTA 5L8DA 3MZBA 3OO6A 2R9JA 4PFWA 3QSLA 5JTYB 3MUQA 4DXBA 3S9MC 4RA1A 4H8IA 1PBQA 1DTZA 3GZGA 1Y3QA 1ZTYA 4IO7A 1QUKA 2O7IA 3M3FA 3VLWA 2H9BA 5ICQA 2DQVA 3OENA 4Z7EA 1ZJLA 1UIUA 1BTJA 2NVUB 1J1NA 3BFTA 2VOZA 4QSCA 1OQHA 2V3UA 1DOTA 2O1MA 1N84A 5ISUA 2A5TA 1RYOA 1XVYA 3K0VA 3SKPA 5I56A 2I0BA 1FTJA 1B5HA 1LB9A 2RCAA 5AA4A 2XHDA 4IO3A 3FJ7A 5CMCA 4OTEA 2PVUA 5H8HB 1YAEA 1IXHA 1B51A 3H7MA 5TPAA 4ELOA 2QS2A 2GRVA 3MVZA 1BKAA 3TYHA 3PD9A 2I49A 1YCJA 2O7UA 4ESWA 1R6ZA 3T9UA 3FATA 3TPAA 4TOZA 3FVKA 4G68B 4FECA 3IK6B 1O63A 1O64A 3IB2A 1DTGA 5I2NA 4FORA 3U1OA 3SETA 4GL0A 3AXFA 3R6UA 3K2DA 5CM6A 2QMWA 1SD3A 3UGWA 4KPTA 3C34A 1XOCA 1SYHA 2KLFA 4O3AA 3MZ9A 3OO9A 1EZ9A 3FJMA 3T93B 4GFRA 2PBWA 3FZVA 4DZ1A 3K6VA 3EHTA 2GFEA 1SW1A 2RC7A 3IB1A 4I8CA 4BDLA 2RC8A 3K6WA 2I58A 4E0WA 1D9YA 2Z8DA 3TEPA 4DIGA 5LOMA 3S9EA 1EU8A 3KG2A 4NWDA 1JETA 3FIRA 4KCDA 2IA4A 3OEMA 2HZKA 2UYFA 1TWYA 2OLBA 3DP8A 3RY3A 2H99A 1F9BA 2ZYKA 3IOVA 3USDA 3RT8A 3MQ9A 3S4UA 1QKBA 5DTBA 2UVGA 1DPEA 2XD3A 3ILUB 1CE2A 1FQCA 2ALUA 5J1DA 2F34A 1O7TA 3TTLA 1EZOA 1MY1A 4LP2B 1NNPA 4GLIA 4FEDA 1QJMA 2QSXA 4P11A 3FASA 2OJTA 5A5XA 5CC2A 2Z23A 2H4IA 4DLDA 3ZKLA 2HQ0A 2V93A 3A09A 1ZKBA 3A3CA 2GH9A 3N6TA 1MG1A 4KYDA 2I4CA 1GTKA 1IUDA 2Y7IA 3W9VA 2B3FA 4IGTA 4KI0E 3LUYA 3TCHA 4LZ7A 3EHSA 5FHMA 3QAXA 5HM4B 4OQOA 1ANFA 2V84A 2Q8JA 2QS4A 3S2VA 3KN3A 1M5FA 3GLBA 4H67A 2FYIA 2I3WA 4YU0A 2RF1A 4EF1A 3N5LA 4JSDA 5H8HA 2REGA 4F1YA 1NH8A 4LQ5A 4QFLA 5H8NA 2XXYA 4AB6A 1AL3A 4NMYA 2D3IA 4G8MA 5CMBA 3FVGA 1TFDA 3V5AA 3OD7A 1B4HA 1FQFA 3FXUA 4H5GA 4OHNA 4H0WA 3C31A 3DM0A 1ZLQA 2OCUA 1QVSA 1A54A 3FGSA 1OLAA 3ZS6A 3V83A 1P99A 1RYXA 3VLUA 1LAFE 1A8FA 3KN8A 5AA1A 5I57B 2G29A 3ZSFA 4GRKA 2F35A 5K2YA 4LATA 1A99A 1NNTA 2O1LA 5CI5A 3IO6A 1B7HA 3H4ZA 3UP9A 1D4NA 3Q28A 3N94A 5FHOA 4F1UA 4TQUQ 1A8EA 4TLLB 3U94A 2UXAA 3FVOA 4OEVA 3T22A 4IO6A 1OVBA 1H3DA 3CSBA 1SDXA 4PFYA 3GXAA 4MLVA 3TFLA 3ECRA 4U1ZA 2A5TB 5DT6A 3G3JA 4XKPA 2Q9TA 4HTGA 4YMBA 2F7CA 5I56B 4G68C 4QFKA 5AA4B 1IZ1A 4O3BA 1MRPA 3D4GA 4KR5A 1P1UA 4H6DA 1LLSA 4Q5TA 4ECFA 2OWTA 1XC1A 4UA8A 4LVQA 3SEXA 2Q2CA 4YMAA 2VD2A 1Z7ME 2DWIA 5TPAB 1LBCA 3PPOA 3QYTA 2VP1A 4EQBA 4R72A 1B3HA 1FQAA 1JVYA 1SW5A 5CBRA 1P1NA 4HS7A 1LFIA 2QS1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZEFA 3MZ1A 4X1BA 1LAHE 2XWVA 4F1VA 5I2NB 1HSEA 3KN7A 1P1QA 4F31B 1AOVA 1I6QA 2ANJA 1FTKA 1FJ9A 1OMPA 3TTNA 2GQ1A 5A5LA 2G93A 3TAJA 1FTLA 1QGXA 2CZLA 3B8BA 4PFUA 4ELQA 5I5PA 1XVXA 2RKMA 5DEXA 4MAGA 4ZECA 3TDJA 2NOOA 1US4A 4H45A 1FRPA 1Y4CA 3MP1A 4IY5A 4NF6B 5DVIA 4PP0A 3QUFA 3O28A 3B7DA 4I1DA 1B52A 2HXWA 2XXUA 4O7MA 1MDQA 4DCYA 4RJZA 2VPNA 2X7QA 5CRYA 1P1OA 4FJPA 1IXIA 4GXSB 1GV8A 4PETA 4O94A 2QPQA 2VHAA 3B6TA 3MW0A 3VLVA 1NUYA 4HE2A 3G3FA 4N4UA 3CRBA 3K01A 3TZAA 3RN8A 3WAFA 1AIVA 4ISUA 4BDOA 2F78A 3SDFA 2XXPA 3OEKA 4EUOA 2B4MA 2HCAA 3N6UA 4PE3A 4P0GA 3DP6A 4N8GA 5ITPA 1PEBA 3RT6B 4GVOA 4R2BA 1N76A 2DE3A 1L5TA 4POXA 1FJ6A 1N7WA 3B50A 1FPGA 1LAGE 4P1EA 3TKDA 1UIVA 2OWSA 5A5XB 2QL3A 1D3KA 1MY2A 5AA2D 2Z8EA 4XKNA 1FBPA 1P1WA 2FBPA 4WKMA 1B3GA 2KQZA 1SYIA 4JWOA 3PUWE 3IJOB 2ZXTA 3OMBA 1VFDA 3EF7A 5HBCA 2ZNUA 1YYZA 1IMFA 4OMBA 3MC2A 4N81A 2I0CA 3OO7A 3W15C 4F3SA 1ZIUA 3G3IA 2BJJX 1MQHA 1MS7A 1LGBC 3UA8A 2Y7KA 2XA5A 2Y5KA 1DMBA 1IITA 3D4CA 3MYUA 3MJNA 3K4UA 3MVYA 2WKYA 2I3VA 3L6HA 1ATGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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