2OCUA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with n-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 a resolution
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with N-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 106
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA02
2OWTA 2DVCA 3H6UA 1B52A 3GBAA 1MPDA 1S7YA 2DQVA 2I49A 5L9OA 3KSXA 4KCCA 1I6AA 4ESXA 3VLVA 3K1MA 3M8UA 3OOAA 1OVTA 1MXYA 2Y7RA 3THIA 5CC2A 4LP2B 2VOZA 2Q2CA 2X7QA 1JVYA 5M2VA 2Z22A 4F1VA 1EH3A 3C36A 1IIWA 2I58A 3QXMA 1DOTA 3L6GA 3UGWA 1FQAA 5ITOA 4X48A 1GR2A 2A5TA 4M1VA 1MDQA 1DMBA 3W15C 4JWOA 3K6WA 2I6EA 4BDLA 3KSJA 4ND9A 4ELPA 2XXUA 1IXCA 4H8JA 3Q28A 4HTGA 1LAGE 4F3BA 4OXVA 3IOUA 4GL8A 1B6HA 4Q5TA 4PP0A 1MH4A 3RLFE 3FGSA 5FTIA 4ZDMA 3DELB 1MXVA 4KR5A 3CFXA 3G3HA 3K00A 1MM7A 1ZBMA 3MP1A 4KD5A 3MP8A 1B32A 5B70A 5A5XA 3QUFA 3DM0A 4IO4A 2LAOA 4I8CA 4RK2A 3ONMA 3VVFA 4H8IA 4EQBA 4XXUA 1B7UA 5TU0A 3OO6A 3KOTA 4PQJA 2YJPA 1GVCA 4HCYA 4C1UA 2NVUB 3TAJA 5KCJA 3C33A 1JEVA 5I57A 1MRPA 2B65A 3H03A 2OWSA 3DP8A 2DWHA 1UIUA 4U21A 2Q9TA 4R72A 3SETA 3TYHA 1RYXA 2P1SA 4FATA 5I59A 4OQOA 4QFKA 3T9VA 4JWYA 1VSOA 4QHQA 3USDA 1H76A 4Z0IA 1N76A 3W9WA 4R74A 4IO5A 4DDDA 1LB8A 4AQ4A 5H8FB 3V83A 2A5TB 3K0VA 2KLFA 3KJTA 2PMSA 3TUSA 1YTVA 4FEDA 1SDXA 1B5IA 1UTBA 1IZ1A 1SVXB 5FHOA 3ODBA 4TQUQ 3S4UA 2P0SA 3V89B 4LUBA 2F8DA 4OETA 1LFGA 2CMOA 4NF4A 2CZLA 2O1MA 3MQ9A 3G3GA 1B0LA 1FQCA 5FHMA 1N7WA 4GLIA 1B3HA 2RC7A 4H0WA 1CB6A 3QIMA 1MXWA 3TFLA 4R75A 2DP8A 3O97A 1VFEA 5H8QB 1BIYA 4JBZA 4MFIA 1B4HA 1B3EA 1MQDA 1UQWA 1XVYA 2F6GA 3FJ7A 5A5XB 1KWHA 1YCJA 4EUOA 4EF1A 3IO6A 1PB9A 1SW2A 4XKRA 3FJGA 4FJPA 2P2AA 3KFMA 1LGBC 3LSFB 4LZ7A 4HW8A 4YKIA 3HSTA 4I1DA 4GVOA 2UVJA 3T9HB 2ONKE 3KN7A 4NWDA 4G8HA 3CFZA 1ATGA 4IO6A 2UYEA 2OLBA 1URDA 3TODA 1B58A 1YAEA 3H6VA 4RXLA 5ICQA 3IAZA 2UVGA 3FUZA 3PD8A 2DWJA 1TWYA 1LFHA 4Q0CA 1XC1A 5HPQA 2PX1A 2ZXTA 1US4A 2QPQA 2I48A 3EHSA 3IJOB 3IK6B 2Q88A 1A99A 3IOVA 4IGRA 4F29A 1B1HA 1AL3A 4GIZA 3Q25A 5TP9A 1H43A 4ZEIA 3IB1A 1N04A 1B0HA 3KGCA 1MY4A 4FAJA 4M4GA 3K1PA 1PBQA 2VD2A 4TOZA 1IXIA 4Q30B 1NL5A 1FQBA 1QJMA 3VFJA 1M5FA 4NF4B 1RKMA 3OSQA 2I0CA 4PFUA 3T93B 4NF8B 1HSJA 4YB6A 1Z7NE 3IOTA 1PBPA 2Z23A 3CIJA 4RA1A 1MH3A 1GGGA 4DXCA 1Y3NA 2YLNA 5K2XA 1FQEA 4JSDA 4OESA 1YPNA 4YB5A 1SD3A 1II5A 5I56A 3H06B 1QKAA 1XOCA 2DE4A 1N7XA 3RPWA 3DP4A 2Y7IA 1A54A 1NFTA 4FORA 3K02A 4IO3A 1B40A 1FQDA 2GRVA 1SYIA 1R9LA 4F3SA 3K6XA 3MUQA 3CSBA 3TTRA 4BDMA 1Y3QA 2Y84A 3PUWE 3MVZA 5IAIA 4UACA 3V8XB 2NWJA 4C0RA 3LUYA 2ABHA 1P1QA 4BDNA 2XXWA 4PFWA 2WKYA 1P1NA 1USYE 4K3FA 3HV1A 1POY1 3KEIA 3HHGA 1M5DA 3SESA 4Z7EA 1D3KA 2O69A 2G93A 2O6AA 1AH5A 2NXOA 4P0IA 4U4XA 2XXPA 3TTMA 1AMFA 3U94A 4OERA 1MY3A 1DPPA 1NNFA 1QUIA 2DXYA 2GHBA 1SBPA 5JK4A 3TEPA 3FATA 5CMCA 2DVZA 2HAVA 3O28A 3LSLA 3O6GA 2Y7PA 3OO9A 5DYHA 4EXLA 5AA1A 3K6UA 4GF8A 4YAHX 2PVUA 4PETA 5BUUA 5F7VA 3PPQA 5TPAB 3E13X 3MBPA 1SW4A 3MZBA 1URGA 3JV9A 1Y3PA 3K4UA 2GHAA 3K01A 4KI0E 3SEYA 4LQ2A 1AOVA 1PEBA 2QS1A 4GXAA 2F7CA 2NUVA 4ELQA 1MXZA 4EF2A 4GL0A 5I56B 2I4CA 1MS7A 4DXUA 1LSTA 2A5SA 2ZNUA 3G3FA 1OIBA 2V25A 1FQFA 2DOJA 2V84A 4KYEA 1LLSA 3S9EA 2ZYKA 3FASA 2QSXA 3B6QA 5I2KA 5H8FA 2YPNA 3LR1A 1NMUA 1I6BA 1OLAA 4IY5A 1B46A 3M3FA 1R9QA 1XT8A 3RY3A 2F34A 2FYIA 1UTHB 1QVSA 3T22A 1OVBA 1XHYA 4RK9A 3T96B 3B6TA 4G68B 3S9LC 2D3IA 5ELVA 5JTYA 3TCFA 1BP5A 3IL1B 4RPNA 1MQJA 3OENA 2F36A 4XKPA 1MY0A 5H8QA 2D21A 1O63A 4E0WA 2W7YA 2AIXA 3B7DA 4MLQA 1QUJA 1MG1A 1PC3A 5H8NB 2F35A 1QKBA 3RT8A 3OSRA 4R2FA 3TELA 1XVXA 1NH8A 4C1TA 1ZJLA 1XS5A 4R6YA 2RF1A 1SW1A 4YMAA 3PPRA 4AB6A 1TFDA 4FIMA 4XKQA 4F2OA 4ZEKA 3KG2A 3HN0A 5L9SA 2HQ0A 4XKNA 1D9VA 4LATA 1ZIUA 3MZ1A 3SERA 5K2YA 4R73A 3MC2A 1EU8A 4OTEA 4QFLA 3KJ7A 1D9YA 5CBSA 2DYXA 3PPNA 5AA2A 3GXAA 2HCAA 5I2KB 2H25A 4ZE8A 3TZAA 1M5CA 2DXRA 3EN3A 5HM4B 1M5BA 4F19A 3UN6A 4U1OA 4JDFA 4UA8A 4OYVA 4NTLA 1JQFA 1MQHA 3VDFA 2GH9A 2RCBA 1B1XA 2PYYA 4LA9A 2Z8EA 3FV1A 1B7HA 3T9UA 2V3TA 3O9PA 3TTNA 3PPOA 3OEKA 4F31B 3PMXA 4R9GA 3CG3A 4KYDA 5CMKA 2F97A 5JTYB 2OZZA 4NF8A 2H4IA 4YKPA 1I6QA 3ECRA 1B9JA 1A8FA 2DSFA 2B3BA 4NE4A 3WAEA 1NH7A 3FV2A 5JEIA 3FJMA 1Q1KA 2H99A 5KDTA 2ESNA 1Q35A 1B05A 4BLAA 2AL5A 5HBCA 2X26A 4IGTA 3PGFA 4X1DA 1P1WA 3LSWA 2ZNTA 5CI5A 4N13A 3TPAA 3HPIA 2UXAA 3E9XA 2QRYA 4R2BA 3R7XA 4H65A 1ZU0A 4U22A 1FTMA 3A3UA 3N94A 3FVOA 3S9MC 3D4CA 5KZTA 1H45A 1MXXA 3O6HA 3FXRA 1MDP1 1B5JA 3WAFA 1A55A 3Q29A 5EHSA 2ALUA 4XTCQ 4HS7A 4LVQA 3V5AA 3G3IA 4OEVA 1VR5A 3FZVA 1DTZA 3RUMA 1PB7A 4U4SA 5AA4A 4GOTA 2ZYMA 5ICTA 1FTJA 3M3KA 5AA2B 3E3KA 4TLLB 5DEXA 4LONB 4YZZA 1HSEA 3F11A 4FECA 2RC9A 5AA3A 4OFLA 3S2VA 2VHAA 1N84A 3HCQA 1FTLA 1QUKA 3U72A 2RC8A 4ZEDA 3ZKKA 4NWCA 1HSLA 4IY6A 3CSGA 3RQTA 5AA2D 2ANJA 3K2DA 1IITA 1SI0A 3IX1A 4FEBA 2OBGA 2XD3A 4JWXA 3DLNA 3PMWA 4WEDA 4NF5A 4RYAA 5TPAA 4JXIA 5LOMA 3RT6B 1LCTA 4ISUA 1GV8A 4PE5B 4QSCA 3GLBA 3BKIB 4POWA 3TQLA 1PB8A 3PMVA 4OHNA 1IEJA 3QYTA 3IB0A 3IB2A 2B3FA 2FA7A 5KDTB 4DIGA 3MPLA 3OEMA 4GXSB 3TTKA 3QSLA 4F2QA 3QK6A 4RPOA 4EXKA 3H6TA 3N5LA 2O7UA 1IQ7A 4F1UA 3K1NA 1DSNA 2XXRA 3T9XB 2I3VA 1GTKA 2AL4A 4R6HA 3BBRA 4GQOA 4YICA 1B7ZA 3A09A 3RTFB 1EZ9A 2Q8JA 3VV5A 4R9FA 2HFBA 2THIA 3UK4A 4YMBA 3VLUA 1B3LA 1URSA 3FD3A 1B2HA 1JVXA 3HO7A 2RCAA 4GRKA 3VXBA 4ELOA 5AA4B 1UTHA 2VD3A 2R9JA 4ZEBA 4OMBA 3T66A 3RNNA 3SEUA 2AYSA 5ISUA 2BJJX 5J1DA 4G68A 4WEPA 4RY1A 3TTLA 5I2NA 1B3GA 1B51A 3QAXA 5DEXB 3RTWB 1LAFE 2I0BA 4P0GA 1LCFA 1VFDA 2Y7KA 4ZECA 1N3XA 3GZGA 4QSEA 3H3GA 1T0KA 1S50A 1A7LA 1FTOA 3KOSA 3CVGA 1MPCA 4U1ZA 3EPEA 1ZTYA 2E0SA 2VGQA 1WODA 4KYSA 3MWBA 4NF5B 3SDFA 5H8NA 3C9HA 1OLCA 2ONSA 3N26A 3U8QA 3CFLA 1EZOA 2X7PA 3KN8A 2DWIA 1BKAA 2PT1A 4L17A 3LC8A 3TKDA 3BFUA 4POXA 3MZ9A 1PDAA 2HEUA 1Y4CA 1LBBA 2REGA 1BTJA 2I3WA 5L8DA 3TDJA 2QS3A 4LZ5A 3OO7A 1AIVA 1MY1A 4MBPA 3BFTA 3OO8A 3DP6A 3C4MA 3O6IA 1FTKA 4ZEFA 1S9TA 1R6ZA 3FVNA 4OZ9A 3VVDA 3KBRA 1R1NA 2O84X 3VLWA 1ZLQA 1DTGA 2Z8DA 1F9BA 4THIA 3CRBA 2V93A 4QFPA 3N6TA 2XHDA 1RYOA 4HCWA 3GBBA 4I62A 1JEUA 3C34A 3JYRA 1A8EA 3ILTB 1H44A 2V3QA 4DCYA 4FE8A 5I58A 4YKJA 1FCKA 5CRYA 3MW0A 4DE8A 2PBWA 1ZKBA 3ILUB 4Q8RA 1B5HA 5FTHA 1DPEA 2XXYA 4F3GA 2H98A 1ELJA 3G3JA 3IOWA 1VE4A 2R71A 5I2NB 4IB2A 2NOOA 3PUZE 3UP9A 3SEVA 1SI1A 2XXIA 2OK2A 3CR9A 4BDQA 1LAXA 2E1SA 4N6PA 1MXUA 1IXGA 4KFQA 1ZMGA 1TXFA 4F1YA 3KZGA 4KHZE 3AXFA 4OVJA 1P1UA 4MF3A 1MPBA 2ONRA 1JNFA 1IXHA 2UVHA 2OCUA 4QRZA 5ITPA 4YU0A 4RJZA 4OEUA 2DWAA 1Y20A 3SEXA 1LBCA 3G3KA 1OQGA 4H67A 4GWOA 3G7WA 3OMBA 2R6GE 3A3CA 1SQYA 1MM6A 3UORA 4EQ9A 3PUXE 1O64A 2HZLA 4YB7A 3H7MA 5L9MA 3TMGA 3IO4A 4F22A 5DVFA 1US5A 3K6VA 1P99A 2RINA 2F78A 1WDNA 2QMWA 4DCXA 4EQ7A 4OFOA 2F5XA 3H4ZA 1B3FA 1QULA 3MAMA 2QS4A 3U92A 3R6UA 2HAUA 2PT2A 2D5WA 1MQGA 3IORA 1FW0A 3P7IA 3RGYA 2DE2A 4I9DA 4OENA 3PUVE 3R26A 5I58B 1WVJA 1JETA 3C35A 4JB7A 2F7AA 3TCGA 2ZYNA 4F39A 3VVEA 4QFOA 1B4ZA 3PU5A 1OMPA 2XX8A 4YKKA 3MVWA 5F1QA 1USYH 1A40A 3I3VA 3IR1A 1P1OA 4ONYA 4O3AA 4IO2A 5DTBA 3UIFA 3PD9A 4GD5A 3C31A 3KN3A 3ZS6A 3OXNA 4OFJA 3MJNA 1TT1A 2DS9A 4H6DA 1D4NA 4G68C 4X1BA 3O29A 2O7IA 5H8HA 3VXCA 1L5TA 1TFAA 1Y4TA 4KQPA 4GFRA 4PFTA 1NNPA 3FVKA 4JSOA 2H5YA 3MVXA 2XXVA 1SYHA 2RKMA 5B7DA 2OJTA 2QJEA 3O66A 1QW0A 3JZJA 3N6UA 4H5FA 1LAHE 4KPTA 1MQIA 4X9TA 5I84A 1NKXA 4G4PA 1UIVA 3EF7A 1JW5A 3TCHA 5DVIA 3B6WA 3S9NC 3Q27A 1OQHA 4ZZAA 4WKMA 3IJXB 1CE2A 5KCJB 5I57B 4G2ZA 3E4RA 1JW1A 4P11A 4F18A 1Z7ME 3I6VA 4AB5A 2XXXA 5CBRA 1Y9UA 3ZKLA 4G77A 4PFYA 5I59B 1LFIA 2O51A 3MPKA 4NF6A 4TLMB 1JW4A 1Y1MA 2ZNSA 4LQ5A 5DT6A 1Y1ZA 4ZE9A 1LB9A 1POTA 3VE1B 2GFEA 2Z8FA 3PUYE 5CM6A 3U1OA 3CI8A 3D4GA 4U2RA 3PPPA 3OD7A 4ZZEA 1BLFA 2I4BA 2XX9A 4IO7A 3PV0E 1UTBB 3U93A 3QUJA 2REJA 4DXBA 2XXTA 2QMXA 3MVYA 1NNTA 3CG1A 2UVIA 3OELA 2HZKA 1O7TA 3Q26A 5H8SA 2F7BA 4R6KA 5FHNA 5CMMA 5H8HB 1SW5A 4O3BA 2Y7WA 1N3WA 1NNKA 4G8MA 5AE4A 2Q2AA 4LZ8A 4XIGQ 4ECFA 2VP1A 2ZMBA 2O1LA 4EDPA 2G29A 3MP6A 2XX7A 2IA4A 1H3DA 2O68A 4ELRA 1ANFA 2F6PA 1N0TA 2Q89A 3L6HA 4WXJA 4G8NA 3O2AA 3LBSA 4MH5A 4DLDA 3RN8A 5EYFA 4BDRA 3EQ1A 3FIRA 4OWDA 4QSDA 2XXHA 1MY2A 5EHMA 2H9BA 3EHTA 1M5EA 4MLVA 5CMBA 3EHUA 4RNSA 2QS2A 1I69A 3FVGA 3FXQA 4ESWA 4DZ1A 4U23A 2HXWA 4NF6B 1J1NA 2IEEA 3LSXA 3UA8A 2FNCA 4H5GA 3SKPA 3M3LA 4ZS9A 4O3CA 3H6WA 4KCDA 2XXQA 3FXUA 3SEWA 3TQWA 5BWJA 2V3UA 1EZPA 5TP9B 1IUDA 2ZYOA 4NMYA 5IKBA 2QL3A 2M8CA 4QFNA 4H1XA 5DVJA 4BDOA 3HHFA 2UYFA 4QF9A 4F3PA 3ZSFA 3I5OA 2DE3A 3C32A 4E0XA 4NEDA 4N07A 3W9VA 2XD2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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