2OK2A

Muts c-terminal domain fused to maltose binding protein
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
MIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTHMEETSPAVEALENLDPDSLTPRQALEWIYRLKSLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Escherichia coli MutS Tetramerization Domain Structure Reveals That Stable Dimers but Not Tetramers Are Essential for DNA Mismatch Repair in Vivo.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli k12
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, DNA mismatch repair pro
total genus 132
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ok2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ok2A01
2HZKA 3V83A 1D4NA 1B05A 4QRZA 1DPPA 5DVFA 4I62A 3IO6A 4OEUA 4FEBA 3H3GA 3N26A 1FQFA 2REJA 4KHZE 4F2OA 3VXCA 4ECFA 4X1BA 2IA4A 1ZIUA 4TQUQ 3OO7A 5I2KB 1A40A 2O69A 4WEDA 5LOMA 3VLWA 1TT1A 4H8IA 4MF3A 3EN3A 4XKRA 2UVJA 1MXWA 4LA9A 3MJNA 3QIMA 2DVZA 1USYE 3TFLA 1YTVA 2I58A 4ND9A 1MQIA 5AA3A 2HQ0A 2DSFA 1M5EA 5AE4A 1LAGE 3H6WA 4LATA 1ATGA 3MW0A 5JTYA 1GGGA 3M3LA 2ANJA 4XKPA 4H6DA 1IXGA 4AB6A 3HPIA 5FHMA 4R6HA 4F3BA 4TOZA 3OD7A 2PT2A 1JEVA 4NF6B 1EU8A 3C35A 2NUVA 2H4IA 5TP9B 4Q8RA 1NL5A 3RUMA 1UIVA 4KFQA 5H8FB 1US4A 3ILUB 4NF5A 3WAEA 1UTHB 4P0GA 4KQPA 2XD3A 4R73A 4H5GA 3IOUA 3FJGA 4NWCA 5AA1A 1PBQA 3KFMA 4FJPA 2O7UA 1IXCA 4X9TA 1SBPA 1MPDA 1GR2A 1TXFA 3GXAA 2V3TA 3HHFA 2KLFA 2AIXA 2Y7KA 3MBPA 2Q8JA 4QSEA 2DE3A 4G77A 2ZNSA 5CMKA 3FUZA 3FV1A 1N3XA 2R71A 3TTNA 4WXJA 1NNKA 3OMBA 2XHDA 1VSOA 5DEXB 3RY3A 1B4ZA 1XVYA 4G68B 1FTKA 4N07A 2XXXA 2ZMBA 4X1DA 5I57A 2YLNA 2M8CA 1QUJA 3LSWA 2UYEA 3T9VA 4QFPA 4EQBA 4EXKA 4GL8A 1AH5A 3FVNA 5AA2B 2DP8A 3QYTA 4UA8A 1ZBMA 1XS5A 3EHUA 3SERA 4GIZA 4POXA 4KYDA 2O68A 1JETA 3K2DA 4RA1A 1NNPA 3KN3A 4JSDA 1TWYA 4Q30B 1QULA 4EQ7A 2ALUA 2FA7A 1LCFA 1WDNA 2B65A 2ZNUA 4E0XA 1EZPA 3T96B 3K1NA 2Q89A 4H65A 2Z8EA 2GHAA 3GLBA 2QS3A 4IO5A 1UTBA 3B6TA 4G8HA 2VP1A 4F19A 1Y1ZA 2DWHA 2R9JA 2RC8A 5H8QA 3K02A 3F11A 1B40A 3CFXA 5KCJB 2HCAA 3K4UA 1B5HA 2F35A 1Y20A 5EYFA 3SESA 4OMBA 1B7HA 3IX1A 3CFLA 2F6PA 2O51A 3UK4A 3TDJA 5KZTA 4EF2A 4NF8A 3FD3A 1LBCA 4U21A 2HEUA 4RXLA 3I6VA 1LFHA 2XXTA 3TQWA 3CRBA 3D4GA 4ELOA 4GQOA 3DP4A 2RINA 1SI0A 3JYRA 1LSTA 2B3FA 1S50A 3PUZE 1NNTA 4JDFA 4YICA 3TAJA 2W7YA 3PPNA 1AIVA 4RNSA 3IL1B 3OSQA 4R6KA 2F5XA 4THIA 3G3KA 3FJ7A 3R7XA 4QFKA 1O64A 4U23A 3CSBA 3MP6A 3T9UA 4ZEDA 1DSNA 3MP8A 5FTIA 3RN8A 1H45A 2I48A 3UA8A 2UVGA 3KN8A 3FATA 4F3SA 3E3KA 4ISUA 4GXAA 3K1PA 4F3GA 1YCJA 1CE2A 3RNNA 1XHYA 2ONKE 1MY1A 4EUOA 1BLFA 2H9BA 3D4CA 4IO4A 1XC1A 3TYHA 3ECRA 1Y3QA 1LAXA 4EF1A 1B0HA 3U8QA 1QUKA 2Y7IA 5TU0A 2OJTA 1DPEA 3UP9A 1Y9UA 3CI8A 1DTZA 5H8HB 1PEBA 2BJJX 3O29A 4DZ1A 3G3FA 1GV8A 3MVZA 5CBSA 3FVGA 2DWJA 1BIYA 4P11A 3TCGA 4NWDA 4KD5A 1N04A 3PPOA 4LONB 4XXUA 3KSXA 4OERA 4R75A 4U4SA 2V25A 5TPAA 3LBSA 1FQAA 3KJ7A 3ONMA 3IORA 2H25A 3AXFA 5HM4B 4M4GA 4FE8A 3DM0A 1OQHA 4O3BA 3PU5A 4H1XA 3ILTB 3MP1A 4BDRA 3S9EA 4IO7A 4KR5A 1IITA 1A54A 3G3HA 5I84A 2ABHA 4OZ9A 5CC2A 1UQWA 3G3IA 1LLSA 1IXHA 1OVBA 4G4PA 5I57B 3PPRA 2F78A 1M5BA 3CIJA 3LUYA 1PC3A 1N0TA 3BBRA 1H76A 1JW1A 2RCBA 1OQGA 1MY0A 4IGTA 2NVUB 3H06B 5L8DA 3FXUA 2Y7WA 5HBCA 5DVIA 3U72A 2B3BA 4OXVA 3OELA 2DWAA 3LR1A 4BDOA 1TFAA 1WODA 4OFJA 1F9BA 1IQ7A 3C9HA 3EHTA 1HSLA 4M1VA 1I6BA 1ZU0A 3EPEA 4H0WA 2XXWA 5JEIA 1MQDA 1H3DA 2XXQA 4HS7A 4AQ4A 2DE4A 1OLCA 3VV5A 1Q35A 2Z8FA 3N6UA 2GHBA 1IUDA 2HZLA 2P2AA 3GBBA 3K6WA 2QPQA 3DLNA 5AA4B 1PB8A 1A7LA 3TELA 2VOZA 4QFLA 3UGWA 3W15C 2DQVA 4KPTA 5I59B 1ZJLA 2OBGA 4GF8A 2QSXA 2XXPA 1LCTA 1B3HA 1M5FA 4HCYA 2NWJA 4K3FA 4EXLA 3LSFB 3B6WA 1WVJA 5H8NB 2A5TB 3THIA 1Y3NA 2Q2CA 3UORA 2DVCA 2RKMA 5K2YA 1B3EA 1AMFA 3RT8A 2DOJA 4RPNA 5DT6A 1MXUA 3RGYA 3Q26A 2I3VA 3Q28A 4O3CA 3QAXA 4AB5A 4WKMA 5L9MA 4QHQA 3PPPA 2OZZA 2QMWA 4MH5A 2XD2A 3A3UA 4ELRA 1IXIA 1RKMA 5CI5A 4ZE9A 1P1QA 3KEIA 4DDDA 2ZYOA 5A5XB 1VFEA 1LB9A 4GL0A 3QXMA 2F97A 3OEMA 4F18A 1MDQA 2O1LA 4QSCA 1R9LA 2NXOA 3SDFA 2Q88A 3MVYA 4ZZEA 3PMWA 3RTFB 1Z7NE 1OIBA 1Z7ME 3KOSA 4DXCA 5KDTB 2OLBA 1RYXA 1PBPA 4OESA 3EF7A 5CMMA 2D21A 4ZZAA 1JQFA 3EHSA 5CRYA 1B3FA 3I5OA 4NE4A 4RJZA 4R9GA 4LZ7A 4O3AA 4JBZA 4PFUA 3VE1B 4FIMA 3G7WA 3S9MC 1MM7A 4TLMB 4JWOA 4LQ5A 3OEKA 4LUBA 1Y3PA 5I2NB 4YU0A 3O66A 3M3KA 2H99A 5L9SA 2F7AA 5I58A 3OXNA 1A99A 5CBRA 3H6VA 5HPQA 3I3VA 4F22A 1P1WA 1B1HA 3TODA 3QUFA 1B4HA 3U93A 4EQ9A 1GTKA 2QJEA 1OLAA 4XKQA 3C36A 3DP8A 1O7TA 4JXIA 1NH7A 4UACA 4F1YA 2UXAA 1SW1A 2D5WA 4G2ZA 1MQHA 4RK2A 1SI1A 5H8SA 5ICQA 4YB5A 2O1MA 1R6ZA 2I4BA 2X7QA 2HAUA 1SW2A 3R6UA 3G3JA 2PBWA 3KGCA 1CB6A 3RQTA 3C4MA 2PYYA 4JB7A 1YPNA 1P1UA 4WEPA 4PFYA 3ZS6A 5I2KA 4F3PA 3PMXA 3MQ9A 4IO2A 3TKDA 2GRVA 1MY4A 3H6UA 3SEVA 1B9JA 4IO6A 1JW4A 4RPOA 1JEUA 1QJMA 1J1NA 3MZ1A 3IB0A 4X48A 4Q0CA 4KYSA 4LVQA 1A8FA 2Z22A 3Q29A 2NOOA 2AL4A 2XXYA 1ZLQA 1BP5A 4PP0A 4F39A 3IOTA 3JZJA 3O2AA 3C34A 3FXQA 5DTBA 1ZTYA 2CMOA 1H43A 3LC8A 4QSDA 3IAZA 1ANFA 3PPQA 4KCDA 1MS7A 4HW8A 2QL3A 3TCFA 1DMBA 4GLIA 4KI0E 2I0CA 3VLVA 4NF6A 1BKAA 5TP9A 1POTA 3BFTA 2YJPA 1P1NA 4PFTA 5H8FA 3MPLA 1BTJA 1B7ZA 1UTHA 1MG1A 1I6QA 2FNCA 3O6HA 1B46A 4PE5B 2ZYMA 2ONSA 1KWHA 3LSLA 3PD9A 3MUQA 3KZGA 4BLAA 2V93A 1HSEA 2OK2A 5I56A 4YMAA 1NMUA 2THIA 3N5LA 5FHNA 3S9NC 3CFZA 2YPNA 3FGSA 5JTYB 1I69A 3VFJA 1B5IA 3V8XB 1HSJA 2DE2A 1B58A 3IO4A 3RTWB 2XXVA 3JV9A 3TEPA 1Y4TA 2DS9A 2DWIA 2E1SA 3HCQA 4DE8A 3TUSA 3V5AA 5CMCA 3BFUA 2XXHA 4YKIA 3FZVA 5EHMA 3VVFA 5DEXA 4QF9A 4G68A 4NF5B 4JWYA 2A5SA 1ZMGA 1YAEA 4ZEKA 2Z8DA 2ZYKA 5M2VA 3O97A 4ZEIA 1XVXA 3K00A 1LBBA 1B7UA 4XIGQ 3T93B 2I49A 4DCYA 1QW0A 5AA2A 4U1OA 3WAFA 1IIWA 4ONYA 1M5DA 4LZ5A 2H5YA 3ZKKA 4RK9A 1VR5A 1N7WA 3SKPA 4DCXA 1L5TA 3K0VA 1B6HA 5J1DA 2GFEA 3LSXA 1R1NA 2R6GE 2Y7RA 3PUXE 3PV0E 4IO3A 1N84A 1JVYA 3FIRA 3PD8A 3IOVA 2DXYA 3O28A 3UIFA 3B7DA 4OETA 2OCUA 3Q25A 1B3GA 5CM6A 2PMSA 1LFIA 2Z23A 4ZECA 2I3WA 3RPWA 4YZZA 1UIUA 3FJMA 2E0SA 5B70A 5KCJA 4RYAA 4NMYA 4RY1A 2WKYA 3USDA 1QKBA 3A3CA 2O7IA 1LAFE 3PMVA 4L17A 4F29A 4G8MA 2IEEA 1Q1KA 1PB7A 1LAHE 1MPCA 5IKBA 2Y7PA 4C1TA 2XX8A 4ESXA 5BWJA 4BDLA 4GXSB 4PETA 2P0SA 4GOTA 5IAIA 1MXZA 3IB1A 4OTEA 4ZS9A 3ODBA 3O6GA 3H03A 3HN0A 5AA2D 4NF4A 2G29A 1D3KA 2VHAA 1SYIA 1UTBB 2F6GA 2XXRA 5ITOA 2O84X 4IY5A 4LZ8A 1FTOA 3OOAA 1T0KA 2Q2AA 4ZEBA 3ZSFA 5H8QB 4G68C 3TTRA 3G3GA 2O6AA 4FAJA 2X7PA 4LP2B 4R2FA 5F7VA 3K6XA 3FXRA 1XT8A 5JK4A 3H7MA 2QRYA 4FORA 4R72A 1B32A 2QS2A 1SVXB 1FTJA 1FQBA 4GD5A 4NF8B 3SETA 2F34A 1FQDA 3RT6B 3W9WA 4Q5TA 4R2BA 3PUVE 3VDFA 3U92A 2ZNTA 2F7CA 2VGQA 4OFOA 1IEJA 2XX7A 3E13X 3W9VA 4JWXA 3C33A 4YKPA 3U1OA 2G93A 3BKIB 1MXVA 3L6GA 5ICTA 4F31B 3FVOA 1MDP1 3B6QA 4OEVA 3K1MA 5H8HA 3VLUA 3M8UA 4GWOA 3DELB 4YB7A 3TCHA 4IGRA 1I6AA 4IB2A 4E0WA 2GH9A 2I0BA 4R9FA 4YKKA 3TZAA 2RCAA 3PUYE 3V89B 1FW0A 4EDPA 4U2RA 1MY3A 5I56B 4YMBA 3QSLA 1B2HA 4NTLA 1A55A 2Y84A 4H67A 3FASA 1US5A 3QUJA 4U1ZA 3SEUA 4I1DA 4R6YA 1OVTA 3CG3A 4OQOA 4G8NA 3IB2A 2F36A 3S2VA 2PX1A 3HHGA 4ZE8A 2P1SA 3T9XB 2LAOA 1FTMA 1N3WA 2PT1A 5FHOA 3K01A 3KN7A 4OHNA 1MY2A 3E4RA 1B0LA 4OVJA 1NFTA 2HFBA 3CVGA 1SW5A 3T9HB 1Y1MA 3C31A 4P0IA 3C32A 4R74A 3OO6A 1USYH 4DXBA 4HTGA 4GFRA 2XXUA 1LB8A 4Z7EA 1Y4CA 1URGA 2V3QA 3TTMA 2VD3A 5EHSA 3IR1A 3O9PA 5TPAB 2OWSA 3SEXA 4TLLB 4GRKA 3TQLA 2RC9A 4ELPA 4C0RA 3EQ1A 1P99A 4ESWA 2F7BA 3DP6A 4XTCQ 3VVEA 3SEWA 3CG1A 3KG2A 5DVJA 1URDA 1JNFA 5CMBA 3KJTA 1URSA 1ZKBA 3MC2A 4OENA 4XKNA 2QS4A 1NNFA 1EH3A 1MH4A 3IOWA 4H8JA 1GVCA 3IK6B 3OENA 4YAHX 5AA4A 2OWTA 1MQJA 4KCCA 3PUWE 1DOTA 4FATA 3MZ9A 5I59A 4GVOA 3VVDA 3CR9A 5ISUA 4DXUA 2ESNA 1OMPA 1AOVA 5ELVA 1P1OA 4MBPA 2AL5A 2V3UA 4OWDA 5H8NA 4BDQA 2RC7A 2A5TA 3TTLA 4ZDMA 4Z0IA 1QKAA 3QK6A 4F2QA 2XX9A 1TFDA 3S4UA 3L6HA 4NF4B 1JW5A 2CZLA 1R9QA 2ZXTA 4I8CA 4KYEA 1EZ9A 5DYHA 3O6IA 1MXXA 5BUUA 4MLQA 1M5CA 1LGBC 1B51A 3MWBA 2ONRA 3R26A 1FQCA 2UVHA 3PGFA 3IJOB 4ELQA 3MAMA 3TTKA 2AYSA 4YKJA 2RF1A 5A5XA 5K2XA 1II5A 2H98A 1A8EA 4IY6A 4JSOA 3T66A 2ZYNA 3OO9A 1PDAA 3KOTA 3U94A 4U22A 3FV2A 5ITPA 4PQJA 3MPKA 1SD3A 4FECA 4F1UA 4DIGA 4QFNA 3OO8A 1FCKA 3GZGA 1N7XA 3OSRA 3TMGA 5KDTA 1VE4A 5F1QA 1B52A 4N6PA 1EZOA 1B1XA 2F8DA 1D9YA 1SQYA 2FYIA 1SDXA 1SYHA 2HAVA 2PVUA 1JVXA 4POWA 5I2NA 3K6UA 1MQGA 4ZEFA 1MPBA 3TPAA 1MRPA 4OFLA 4BDMA 1B3LA 1FTLA 1PB9A 1VFDA 2Q9TA 3HSTA 5L9OA 1MXYA 1S7YA 1ELJA 1XOCA 2QS1A 3E9XA 1N76A 1AL3A 1RYOA 4N13A 4YB6A 5FTHA 1NH8A 1MH3A 3RLFE 2UYFA 4DLDA 2V84A 1QUIA 1O63A 3M3FA 2I6EA 3GBAA 3H6TA 3H4ZA 3N94A 1SW4A 4C1UA 1DTGA 1B5JA 4OYVA 2DYXA 2HXWA 3CSGA 3UN6A 5B7DA 1S9TA 1POY1 3A09A 3KSJA 4BDNA 3P7IA 3KBRA 2UVIA 3ZKLA 1IZ1A 4F1VA 3MVWA 4H5FA 1H44A 4MLVA 3S9LC 4I9DA 1NKXA 3VXBA 2REGA 4LQ2A 1D9VA 3SEYA 1QVSA 3K6VA 3IJXB 4PFWA 3MZBA 4HCWA 5I58B 2QMXA 4FEDA 1LFGA 2VD2A 1FQEA 4U4XA 2DXRA 3MVXA 3Q27A 2X26A 4QFOA 4MFIA 1MM6A 3HO7A 3HV1A 2I4CA 2D3IA 2XXIA 3N6TA 4NEDA 3FVKA 3T22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HZKA 3V83A 1D4NA 5LTCA 3RPLB 4HE0A 1B05A 4QRZA 1DPPA 5DVFA 1KA1A 1G0HA 4I62A 3IO6A 4OEUA 4FEBA 3H3GA 3N26A 1FQFA 2REJA 4KHZE 4F2OA 3VXCA 4ECFA 4X1BA 2IA4A 1ZIUA 4TQUQ 3OO7A 5I2KB 1A40A 2O69A 4WEDA 5LOMA 3VLWA 1TT1A 4H8IA 3NOHA 4MF3A 3EN3A 4XKRA 2UVJA 1MXWA 4LA9A 3MJNA 3QIMA 2DVZA 1USYE 3TFLA 1YTVA 2I58A 4ND9A 1MQIA 5AA3A 2HQ0A 2DSFA 1M5EA 5AE4A 1LAGE 3H6WA 4LATA 1IMCA 4P56A 1ATGA 4XEQA 4MAGA 3MW0A 5JTYA 1GGGA 3M3LA 2ANJA 4XKPA 4N91A 4H6DA 1IXGA 4AB6A 3HPIA 5FHMA 2Q74A 4R6HA 4F3BA 1QGXA 4TOZA 3OD7A 4O94A 2PT2A 1JEVA 4NF6B 1EU8A 3C35A 2NUVA 2H4IA 5TP9B 4Q8RA 1NL5A 4UABA 3RUMA 4DI3D 1UIVA 4KFQA 5H8FB 5F24A 1US4A 3ILUB 4NF5A 3WAEA 1UTHB 4P0GA 1CNQA 4KQPA 2WYPA 2XD3A 4R73A 4H5GA 3IOUA 3FJGA 4NWCA 5AA1A 1PBQA 3KFMA 4FJPA 1FJ9A 4MNIA 5T3JA 2VPOA 2O7UA 1IXCA 4X9TA 1SBPA 2WEFA 1K9ZA 4HXVA 1MPDA 1GR2A 5IZ3B 1TXFA 3GXAA 2V3TA 3HHFA 2ZZXA 2KLFA 2AIXA 2Y7KA 3MBPA 2Q8JA 4QSEA 2DE3A 4G77A 2GQ1A 2ZNSA 4QBAA 5CMKA 3FUZA 3FV1A 2Y5LA 4PDHA 1N3XA 2R71A 3TTNA 3RYDA 4WXJA 1FPIA 1NNKA 3OMBA 2XHDA 1VSOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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