2ONSA

Crystal structure of a. fulgidus periplasmic binding protein moda with bound tungstate
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
GHMNVKLKVFHAGSLTEPMKAFKRAFEEKHPNVEVQTEAAGSAATIRKVTELGRKADVIATADYTLIQKMMYPEFANWTIMFAKNQIVLAYRNDSRYADEINSQNWYEILKRPDVRFGFSNPNDDPCGYRSLMAIQLAELYYNDPTIFDELVAKNSNLRFSEDNGSYVLRMPSSERIEINKSKIMIRSMEMELIHLVESGELDYFFIYKSVAKQHGFNFVELPVEIDLSSPDYAELYSKVKVVLANGKEVTGKPIVYGITIPKNAENRELAVEFVKLVISEEGQEILRELGQEPLVPPRADTAVPSLKAMVEVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of an ABC transporter in complex with its binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ligand binding protein
source organism Archaeoglobus fulgidus dsm 4304
molecule keywords UPF0100 protein AF_0094
total genus 110
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2onsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2onsA02
2B3BA 3E13X 3HHGA 3VLUA 1A54A 4AB6A 2DP8A 3SETA 4GL0A 2UXAA 1I69A 1O7TA 2H99A 3WAEA 3LBSA 1D9YA 3MVWA 3V8XB 4ESXA 4DIGA 4R9FA 4RPOA 1ZBMA 2O6AA 4G68A 2OLBA 3IX1A 1A40A 4RXLA 3PMXA 1N0TA 3BFUA 4EUOA 3SEVA 3TQWA 5M2VA 5DEXB 1EH3A 1PEBA 5IAIA 3C9HA 1B05A 2LAOA 5I59A 3KOSA 4KCCA 2HCAA 4U4XA 4EF2A 2G93A 4Q30B 3EHUA 2B65A 2Q8JA 4OTEA 3MWBA 2ONSA 3EQ1A 1IXCA 2QS4A 4FORA 2HFBA 4G4PA 3N6TA 4F3BA 4G2ZA 1ZIUA 4ZEIA 2RF1A 2F35A 4RYAA 4HTGA 1MY2A 1LAXA 1US4A 1GVCA 2G29A 3OENA 4BDOA 4PE5B 2F5XA 2HZLA 1QUKA 1LFHA 3Q26A 2VP1A 3O66A 3HV1A 4JSDA 2F6GA 1OVBA 4KQPA 4NF8B 4F3SA 3P7IA 3PPOA 4QF9A 3Q25A 4NF5A 4JWYA 5AA4A 3SKPA 2I6EA 2X7PA 1QVSA 1OQHA 1XVXA 3RY3A 4IY6A 4YB7A 1POY1 4LONB 3CIJA 3SEYA 2F7CA 1AL3A 1MY0A 2QMXA 4P0GA 1MY4A 2V93A 5DTBA 4G68C 1ZU0A 2DYXA 4EXLA 4O3CA 3K1PA 4X48A 1II5A 1LGBC 2VOZA 3H6WA 3UA8A 4DE8A 1QUJA 3FVKA 3OSQA 1FQAA 4ELQA 2PT2A 4IO2A 5L9OA 3KSJA 1LB9A 1FTOA 2NOOA 1MQDA 3PUXE 4RPNA 2GHBA 3USDA 1MQIA 4BLAA 3FUZA 4DZ1A 4Z7EA 5HM4B 1FQEA 1H3DA 4XKPA 5I56B 3TKDA 3MP6A 3VFJA 1NMUA 5L9SA 3FXQA 2UYEA 2QPQA 1QUIA 3H6TA 2WKYA 1GV8A 3GZGA 4XTCQ 4L17A 3S2VA 1LFIA 2P1SA 5ISUA 3FVNA 4TOZA 1A99A 3TCGA 4ESWA 2OCUA 2RC9A 2I58A 4NWDA 3FASA 2H98A 3PPPA 3E3KA 2O1LA 1MM7A 1OIBA 3GLBA 3C31A 2V3UA 3RN8A 3QUJA 4U1ZA 3FXUA 4IO7A 2VGQA 2R71A 3K6WA 1B46A 4WXJA 2P2AA 3SEXA 4MLQA 2REJA 3MQ9A 5CBSA 3DP6A 5H8NB 1UIUA 4H1XA 4F18A 1JVXA 5AA2D 1Y3NA 3MJNA 4GFRA 3TDJA 5H8QB 4P11A 3FIRA 4LZ5A 3ECRA 1B7UA 4OESA 4ZZEA 3TZAA 1SW1A 4R2BA 4IGTA 1SW4A 2ZNUA 4H67A 4QSCA 3FJ7A 1BIYA 5ITOA 1Z7NE 1R9QA 5JK4A 2XX7A 3FATA 1PBPA 1JW4A 2GHAA 4KYSA 3CG3A 2A5TB 4LVQA 1AOVA 5I59B 1PB7A 2CZLA 4HW8A 2ONRA 3TTMA 4QFNA 4MH5A 4EXKA 3IK6B 3KSXA 1B7HA 4LUBA 1BTJA 5I2KB 3IORA 4HS7A 1N3XA 4LQ2A 4NTLA 2XX9A 3PPRA 2X7QA 4Q0CA 1M5EA 1IEJA 3T96B 1DTZA 1MPCA 1B1XA 4I1DA 4GLIA 3VDFA 1MXZA 2PBWA 2ANJA 1TXFA 2RKMA 1LB8A 4PFYA 4OENA 1Q35A 3TTNA 2OK2A 4U23A 4MLVA 3JZJA 4ZEBA 3A3CA 2I4BA 2UVJA 1UQWA 4XKNA 5J1DA 1R9LA 4THIA 2XXRA 1SW5A 3IB1A 3HO7A 5EHSA 4GVOA 2QS1A 2O1MA 2HQ0A 2ESNA 2O51A 2Y7IA 3L6GA 3ILUB 4AQ4A 1BKAA 1ELJA 1R1NA 1M5CA 1VE4A 3G3FA 3CR9A 4RK9A 4GQOA 4U4SA 5L9MA 3ODBA 3O9PA 2H9BA 5BUUA 1LFGA 2RINA 2I48A 4RY1A 2I4CA 2RC8A 3VLVA 1HSEA 1B3FA 3CFXA 3SEWA 1A55A 4HCWA 4OEUA 3H6VA 4ELOA 2X26A 1Y20A 4JDFA 3CSGA 5I2NB 4QFLA 4ELPA 2Q89A 2NUVA 4R2FA 3PU5A 3CI8A 1YPNA 2IA4A 1WVJA 2ZYNA 4WKMA 3TCFA 1MXYA 3OO9A 4ONYA 1H43A 1PBQA 1DMBA 5I56A 1VSOA 4GD5A 4QSDA 4QRZA 3EN3A 3FZVA 3N94A 5ICQA 1VFDA 5F1QA 4LA9A 1MRPA 1PB8A 3PGFA 3H6UA 3R7XA 1TFAA 3DLNA 4OXVA 4PFUA 1MQHA 3B7DA 4RK2A 1RYOA 2D3IA 3QUFA 3KN7A 1IQ7A 4NF4B 4DDDA 2XXPA 1FQDA 4FEBA 3T9VA 1XHYA 3SEUA 2F7BA 4FIMA 5F7VA 1TT1A 4IO3A 1NKXA 3U93A 5DVFA 2OZZA 3IOWA 4OEVA 3FV2A 2NVUB 2OBGA 4KFQA 2Z8EA 3G3JA 3AXFA 4G8MA 1WDNA 3M3FA 5H8NA 4X9TA 2DWJA 3O28A 3K6XA 3T93B 4R74A 1LCTA 2DQVA 5H8QA 1LBBA 2VD3A 3OELA 2I3VA 1CE2A 1EZ9A 4MFIA 1FQCA 1B4ZA 4YMAA 2M8CA 2YPNA 2XXHA 3CSBA 4F39A 5TPAB 1HSJA 1N76A 3K1NA 1NFTA 2A5TA 2QS3A 5AA2B 1FW0A 1AMFA 2XXUA 4PETA 4JBZA 4FJPA 3PUVE 3H7MA 2R6GE 1LAGE 5I2KA 1RKMA 5FHNA 2XHDA 1OLCA 4H5GA 3K6UA 4GXSB 4O3AA 1YTVA 5CBRA 1PDAA 2PX1A 3RTWB 1OLAA 3HN0A 2RCAA 2HAVA 2FNCA 3PD8A 2XXXA 4PQJA 5KCJB 3O6GA 2PT1A 1MPDA 1P1UA 1MY1A 3W9WA 1JW1A 3B6TA 3T22A 3UORA 1IXGA 3N26A 4FECA 3VVDA 1M5FA 4F19A 3G3HA 4KPTA 1URGA 1OQGA 1LBCA 4POXA 1B58A 1MS7A 5KZTA 3H03A 5KDTA 1POTA 3LC8A 3PUZE 3C36A 2Y7PA 5H8FA 5H8SA 1URDA 4FAJA 5CMKA 4QSEA 4Q8RA 1JEUA 3U72A 3LSLA 3LR1A 1JNFA 4E0XA 3PV0E 2Z22A 4R75A 1IUDA 1A8FA 1B1HA 3TTKA 3T9UA 1H76A 1B3LA 4YKPA 2O84X 2VD2A 3GBAA 3FVOA 3V89B 4OETA 2ZMBA 3O97A 4ZZAA 3THIA 4R72A 3VE1B 2A5SA 1Y9UA 1N3WA 3M3KA 2QSXA 4N13A 5I2NA 1B0LA 5K2XA 5CMCA 3GBBA 3UN6A 4OVJA 1M5DA 5TP9A 3G3KA 5CMBA 3C34A 4DCXA 3K1MA 1EU8A 5DT6A 2O68A 3KG2A 4LQ5A 3S9EA 1Y3PA 2V3QA 1MH4A 3TCHA 1RYXA 4POWA 1OVTA 2F6PA 3KOTA 3FVGA 1MY3A 3H06B 3ZSFA 1MXVA 1B5IA 3TUSA 1ANFA 2AL5A 4NF4A 4BDMA 2D21A 2RCBA 1QJMA 1NNTA 1O63A 3B6WA 1JVYA 2XXYA 2DWIA 3MW0A 4JXIA 4GXAA 1SYHA 4YB5A 1SD3A 1Y4CA 4U2RA 3FD3A 3H3GA 1GR2A 1S50A 2XXWA 4XKQA 4M1VA 5CRYA 5I57B 1JETA 1FTJA 4GIZA 4EDPA 3O29A 5K2YA 3VXBA 4GF8A 1A8EA 4I8CA 1LCFA 4H0WA 1FCKA 3VVEA 4OMBA 3ZKKA 2NXOA 4O3BA 5FHMA 1ZJLA 3TAJA 1DPPA 5B70A 2YJPA 3I6VA 5TPAA 5CC2A 2DWAA 4KCDA 1MQGA 3EPEA 4BDLA 5DVIA 5AA2A 1ZLQA 4QHQA 2XD2A 3UIFA 3W9VA 3LSFB 1NNPA 4F2QA 1N7WA 5TU0A 3IOVA 2CMOA 3EHSA 3PD9A 1SI1A 1MH3A 3MAMA 1PC3A 2ONKE 4NF6B 2V3TA 4F22A 4JWXA 1M5BA 1YCJA 5KCJA 4DCYA 2ALUA 3LUYA 1I6AA 1MQJA 4UACA 4F31B 4JSOA 4RA1A 3D4CA 4OHNA 4R6HA 4LATA 2F36A 1YAEA 3KN8A 1FTLA 1FQBA 3I5OA 1B4HA 1SQYA 3S4UA 4ZE8A 1ZMGA 4YMBA 3TELA 2B3FA 3FGSA 4IO6A 3QAXA 3MVZA 1ZKBA 5KDTB 4ZEDA 4BDRA 1EZOA 2Y7WA 1S7YA 2DSFA 2I3WA 1DTGA 4NEDA 3IB0A 5H8FB 3LSXA 3ZKLA 1QKBA 1UTBB 3TEPA 3OEMA 2UVGA 3IJOB 2O7UA 2OJTA 3ZS6A 2RC7A 1MM6A 2E0SA 3K2DA 2PVUA 3H4ZA 4F3PA 1FQFA 2YLNA 4JB7A 2VHAA 4G77A 2THIA 3CFZA 2ZNTA 2O69A 4IO4A 2DXYA 1B32A 3M8UA 3C4MA 4KI0E 2DE3A 4IO5A 4DLDA 4ZE9A 3RUMA 5TP9B 5B7DA 1LLSA 2AYSA 1T0KA 5AE4A 1S9TA 1NNKA 4G8HA 5FHOA 3U8QA 1A7LA 3RTFB 4IY5A 3MPKA 3Q29A 1NH8A 4QFOA 3VVFA 3KN3A 3QSLA 4OWDA 2I0BA 2W7YA 1GGGA 3CFLA 3QIMA 4WEPA 1B3HA 4YKJA 4F3GA 1UIVA 3IL1B 5L8DA 3HCQA 4EQ9A 4BDNA 3N6UA 3KGCA 2Q9TA 4MBPA 4HCYA 5I57A 1Q1KA 3G3IA 1B52A 3BKIB 4KYEA 4JWOA 3RGYA 4FE8A 3QYTA 3U94A 2UYFA 2ZNSA 1I6QA 4Z0IA 4XIGQ 5IKBA 3FV1A 3IR1A 1N7XA 3PMVA 2I49A 3MPLA 3A09A 2UVHA 3MZ9A 3PMWA 2IEEA 3KZGA 1D9VA 1IXHA 3PUWE 3IJXB 3V5AA 2F8DA 3FJGA 5A5XB 3U1OA 3CRBA 4XXUA 4ND9A 3Q28A 4OFJA 4U21A 5ELVA 1MXUA 5JTYB 3TFLA 1WODA 4OERA 5I58B 2QMWA 1SBPA 3C33A 2ZYMA 3OO6A 3DM0A 4PP0A 5DYHA 4OZ9A 1BLFA 4LP2B 3FXRA 4KD5A 4NF6A 1IITA 3TODA 3S9NC 1P1OA 1QW0A 1LAHE 1F9BA 3TMGA 3KJ7A 2GFEA 5CI5A 1IXIA 3HHFA 4GOTA 2H25A 4EF1A 3OO8A 3IB2A 4U22A 3F11A 1TFDA 4YU0A 3RT6B 3TQLA 3SESA 1P1QA 4UA8A 1AIVA 4N07A 2PMSA 1UTHB 2Q2CA 2XD3A 1SI0A 1N04A 4P0IA 5CMMA 3ILTB 3K01A 2KLFA 3A3UA 1QKAA 3GXAA 1H44A 3BBRA 4AB5A 5CM6A 5DVJA 2Q2AA 4H8IA 2F34A 3K4UA 3OD7A 4EQ7A 3TPAA 4R6KA 1DSNA 1UTBA 2Q88A 5AA1A 4K3FA 1USYH 1MXWA 1LSTA 3CG1A 4LZ7A 4RJZA 3MUQA 3OXNA 4E0WA 3UP9A 1DOTA 4C1UA 2UVIA 3VV5A 4X1DA 2P0SA 3ONMA 3RLFE 3OO7A 4BDQA 2GRVA 4TLMB 4XKRA 4LZ8A 1R6ZA 3I3VA 2V84A 1B5JA 5JEIA 4F1VA 4ZS9A 3RQTA 3FJMA 4R73A 3D4GA 4U1OA 3KEIA 3K6VA 4X1BA 1Y1MA 4GL8A 1SW2A 3TTLA 1CB6A 4C1TA 4FATA 2GH9A 4IGRA 3B6QA 1NL5A 1VR5A 3UGWA 5I84A 3IO4A 4MF3A 2Y7KA 3BFTA 2HZKA 3E4RA 3PPNA 2HAUA 4KHZE 3EHTA 1B5HA 1MXXA 1MPBA 3K00A 2AL4A 3PPQA 1AH5A 2XXIA 4G8NA 5ITPA 2QJEA 5H8HB 4C0RA 1H45A 2XXTA 3MC2A 4OFLA 1B3GA 1B3EA 2R9JA 3OSRA 1MDQA 2HXWA 3JV9A 4YAHX 4KR5A 1PB9A 1GTKA 1D4NA 1O64A 1JW5A 1ZTYA 1MG1A 4NWCA 2OWSA 2XX8A 1SDXA 3EF7A 4YKKA 2F78A 1B51A 3CVGA 2QRYA 3MP1A 1VFEA 4OYVA 4H65A 1B40A 2DVZA 2DS9A 4R9GA 3G3GA 1J1NA 5ICTA 5A5XA 4YKIA 1DPEA 3O6IA 4ZDMA 3DP4A 5JTYA 1D3KA 3OEKA 4YICA 3IAZA 1N84A 1B6HA 5I58A 4IB2A 4H8JA 4G68B 1Y4TA 2QS2A 5DEXA 4F1UA 1XT8A 4DXCA 3T9XB 3IO6A 4ZEKA 2F7AA 3U92A 2ZXTA 4GWOA 3T66A 4F1YA 1ATGA 4EQBA 1L5TA 1US5A 4GRKA 2O7IA 2FA7A 2DE2A 3TYHA 1Y1ZA 2H5YA 4YB6A 4NE4A 1LAFE 2F97A 3W15C 4DXUA 3SDFA 2E1SA 3MZBA 1UTHA 4R6YA 1P99A 1B2HA 3M3LA 1BP5A 1QULA 2DOJA 2ABHA 4YZZA 3S9MC 4WEDA 4KYDA 1IZ1A 3IOUA 5AA3A 4ELRA 3MZ1A 3RT8A 4QFPA 3V83A 1URSA 3N5LA 3QK6A 3SERA 3C35A 4DXBA 3RPWA 4PFTA 4NF8A 5FTHA 1XOCA 1MDP1 4Q5TA 3MBPA 3VXCA 4F29A 2ZYOA 3MVXA 1NNFA 4F2OA 5HPQA 5EYFA 3E9XA 1XS5A 3O2AA 4NF5B 2BJJX 3HSTA 3TTRA 3Q27A 5AA4B 1I6BA 1IIWA 3IOTA 5LOMA 2XXQA 4M4GA 2ZYKA 3KFMA 2HEUA 3RNNA 3MVYA 2DXRA 3R26A 2DVCA 1P1NA 3UK4A 1B7ZA 1HSLA 5HBCA 2XXVA 1JQFA 4ZEFA 3DP8A 4TLLB 3S9LC 3LSWA 2AIXA 5BWJA 3T9HB 5EHMA 1Z7ME 4PFWA 2FYIA 2V25A 2NWJA 4H5FA 4N6PA 1JEVA 3MP8A 1OMPA 4OQOA 3R6UA 3K0VA 1SYIA 3HPIA 1FTMA 4ZECA 2Y84A 1KWHA 3QXMA 4OFOA 2REGA 4I62A 4NMYA 2D5WA 3VLWA 3L6HA 1TWYA 1P1WA 4I9DA 1EZPA 1XC1A 4ISUA 3KBRA 2Z8FA 3KJTA 5H8HA 3O6HA 1Y3QA 2Y7RA 4RNSA 4H6DA 3JYRA 1B9JA 3PUYE 1B0HA 2DWHA 4ECFA 3G7WA 3C32A 4TQUQ 5FTIA 4QFKA 2Z23A 3OMBA 1SVXB 3OOAA 2PYYA 1USYE 2H4IA 1XVYA 2QL3A 2Z8DA 3DELB 3K02A 1NH7A 2I0CA 4FEDA 1FTKA 3WAFA 2OWTA 2DE4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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