2OWSA

Crystal structure of bordetella pertussis holo ferric binding protein bound with two synergistic oxalate anions
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
318
structure length
314
Chain Sequence
DEVSLYTTREPKLIQPLLDAFAKDSGIKVNTVFVKDGLLERVRAEGDKSPADVLMTVDIGNLIDLVNGGVTQKIQSQTLDSVVPANLRGAEGSWYALSLRDRVLYVEKDLKLDSFRYGDLADPKWKGKVCIRSGQHPYNTALVAAMIAHDGAEATEKWLRGVKANLARKAAGGDRDVARDILGGICDIGLANAYYVGHMKNAEPGTDARKWGDAIKVVRPTFAGGTHVNISGAAVAAHAPNKANAVKLLEYLVSEPAQTLYAQANYEYPVRAGVKLDAVVASFGPLKVDTLPVAEIAKYRKQASELVDKVGFDN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Anion-dependent hinge motion in ferric binding proteins
rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Bordetella pertussis tohama i
molecule keywords Putative iron binding protein
total genus 110
structure length 314
sequence length 318
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2owsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2owsA02
3H6WA 4JSOA 2ALUA 3CFLA 5CMBA 3T9XB 4EUOA 3H06B 5TU0A 4ZZAA 2RC7A 1SQYA 4C1UA 1Q35A 4GWOA 1POY1 3K01A 3MQ9A 4YB7A 3B6QA 3FATA 3IX1A 2ESNA 1R1NA 1MH3A 4TQUQ 2V3QA 3TPAA 1B3LA 1IQ7A 1Y4CA 5I56B 4FAJA 4F19A 5CMMA 1A8EA 3B6TA 3PPOA 3OO6A 4WXJA 2OLBA 2V3TA 2QL3A 4YKKA 2E1SA 2HCAA 4NWDA 2Q2AA 3TMGA 4R6KA 4U4XA 4RXLA 3CFZA 3EHTA 3FVOA 3H4ZA 3O6GA 1TFAA 4C1TA 2I0CA 3KSJA 2H4IA 4E0WA 4KYEA 1VSOA 2PT2A 1RYXA 4PFUA 1HSEA 1FQAA 3CFXA 4F2OA 1I6BA 3ECRA 3VLVA 4H6DA 1PB8A 1MG1A 1QW0A 3SEUA 3BFUA 3HHGA 2Y84A 3G7WA 4QHQA 2I58A 1MXUA 3JV9A 2ONRA 5J1DA 4BDLA 3B7DA 2Y7WA 1WDNA 4I8CA 2QS2A 3K4UA 2V93A 4XXUA 3KG2A 4ZEDA 2O68A 2O6AA 3W15C 4AB5A 3MAMA 1PDAA 1HSLA 3S9NC 1M5BA 2HFBA 4YICA 1NNPA 3OOAA 3EN3A 1SW2A 1US5A 2R6GE 4O3AA 1LB8A 4XKRA 1XT8A 2RINA 3ODBA 1B5HA 1XOCA 5ISUA 1FQFA 4WEDA 1B52A 1MM7A 3O28A 4MH5A 4R73A 5EHMA 1Y9UA 3KN3A 2H25A 4Z0IA 3VXCA 3TAJA 1MS7A 1UIUA 5K2YA 4NF8B 4XKQA 3E4RA 1LCFA 3FJ7A 3FXQA 3RQTA 5CMCA 1LGBC 3TFLA 3LC8A 4NF6B 2GHAA 3H3GA 5DVIA 2QJEA 3KJ7A 1DOTA 1KWHA 3FJGA 3T9HB 1NH7A 1MH4A 3PUZE 5DVJA 1FTKA 1P1NA 1ZIUA 1B05A 3DP6A 1QUJA 2NOOA 3Q27A 3CG1A 3QUFA 4OERA 2A5TB 3IOVA 4U2RA 4U22A 1UQWA 3LBSA 5JTYB 5BUUA 1S7YA 1F9BA 2UYEA 3TTLA 1B2HA 2Z23A 4XIGQ 3UORA 4P0GA 4NF8A 3TELA 4R72A 3LUYA 4BLAA 1VFDA 4ZECA 4NF6A 3GBBA 4GOTA 3ONMA 4XTCQ 4OFOA 1ZLQA 4ESWA 2QS4A 4M1VA 5KDTA 1MQDA 3MBPA 1VE4A 4EDPA 3VV5A 2OBGA 5TP9A 4DDDA 1D3KA 3EHUA 1NMUA 2CMOA 4UACA 3OMBA 4LVQA 3O97A 3SETA 2RC8A 1MRPA 1ZBMA 2ZYMA 5AA1A 2Y7PA 5IKBA 3KN8A 1B40A 1M5EA 4OWDA 4ELPA 4XKPA 3U1OA 5LOMA 4NF5A 3FXRA 3GXAA 3O29A 3OO9A 4FEBA 3EQ1A 2RKMA 5FHNA 4KYDA 3PPRA 3CRBA 3RPWA 4X48A 4MF3A 2DE2A 4DCYA 2V25A 4JBZA 4R74A 1O64A 2UVJA 2DWHA 1N04A 5I2KB 1Y3QA 3FVGA 1N3XA 4DCXA 3ILUB 1AH5A 3U94A 4WKMA 3HSTA 4O3BA 1B46A 1H43A 5BWJA 3I5OA 1H76A 3OSRA 1QULA 3IOUA 1WVJA 4YMAA 3EHSA 1NKXA 4Q5TA 1O7TA 4KCDA 1EH3A 3RTFB 1CB6A 3RLFE 1JEUA 2HQ0A 4OENA 1MXZA 1GVCA 2H98A 2D3IA 4KQPA 5ICTA 2XXQA 3MC2A 2F6GA 2DWIA 5I2NB 1LAXA 1SW1A 4P11A 3USDA 5FHOA 4ECFA 1FQBA 2F7AA 1N76A 3MVXA 2UYFA 1BP5A 4MLQA 4EXKA 1SYHA 4QSDA 2OJTA 1H3DA 1YAEA 4N6PA 1SDXA 1QKBA 3M3KA 1R6ZA 3OXNA 5I57B 2H5YA 3MZBA 4RPNA 3S4UA 3RT6B 3BKIB 3BBRA 2DYXA 4LONB 5CM6A 3ZKLA 4YMBA 4R2BA 3K6WA 2F35A 3PMWA 3VDFA 2Y7RA 4LP2B 3TZAA 3R6UA 3E13X 5TPAB 1B9JA 1N0TA 3MP6A 5B70A 3TUSA 4WEPA 3N5LA 2VP1A 3D4CA 4F31B 3FV1A 1LAGE 4R9GA 2DS9A 5I2NA 4FORA 2B65A 2QPQA 4PETA 4YU0A 4H8IA 4X1DA 2VD2A 3CSBA 3OENA 3CSGA 1M5DA 2QSXA 2PT1A 3VFJA 5I59A 3RT8A 3MZ9A 3UA8A 3CI8A 1URGA 4OFJA 1JW5A 4QFNA 2GH9A 1B7HA 4THIA 1M5FA 1IXHA 4BDMA 4UA8A 5CI5A 4OXVA 2XXTA 3IOTA 3PPNA 4LZ5A 4KFQA 2DXRA 2Q8JA 3KJTA 1BLFA 5TPAA 2V3UA 3GBAA 4QF9A 1D9YA 3PUXE 2ZXTA 4G68B 4EQBA 3L6HA 2DOJA 4LZ8A 5FHMA 1XHYA 3K1NA 3I6VA 3LSLA 2Q9TA 4C0RA 1MPCA 2XXHA 4QFKA 2UVHA 2HZKA 3THIA 1P1WA 2ZNSA 3N26A 4BDQA 1SW4A 1POTA 4R2FA 1USYH 5L9OA 2AIXA 4BDRA 1OLCA 3S9MC 1NNTA 1DTZA 3KSXA 2XD3A 3FV2A 2GFEA 1PB9A 3C32A 5ICQA 1R9LA 1AMFA 2QMWA 4GXSB 3G3GA 3FUZA 1VR5A 1I6QA 2GRVA 2ONKE 3IK6B 1H45A 2GHBA 3QAXA 3O66A 3C36A 4QFOA 4G8NA 3A3CA 1B3GA 3SEWA 4OHNA 4IO4A 2Q88A 3K02A 4G68A 2V84A 1YCJA 2O7IA 4F22A 2F78A 2XHDA 1B4HA 5HBCA 3AXFA 3TODA 1AOVA 1OVBA 4F3GA 1VFEA 3FVKA 1XC1A 5H8QB 4PP0A 3N94A 2QRYA 5AA2A 4JSDA 1DSNA 4NEDA 3MWBA 5CRYA 4JWOA 5KCJA 1PBPA 4H67A 1AIVA 3RTWB 1URSA 4TLMB 3IJXB 3H7MA 3T96B 1XS5A 3K1MA 4ZEFA 2Z8EA 1SVXB 4DIGA 4U23A 2ZMBA 1SI0A 4ESXA 3EF7A 3V5AA 1A99A 2XXWA 2REJA 3U92A 3M3LA 4TOZA 3U93A 1MXWA 4IO3A 2DWJA 3PUWE 1B58A 1IIWA 5H8SA 1MXXA 2O51A 4GRKA 4L17A 5H8QA 1DPPA 3IJOB 3TYHA 3G3JA 5H8NA 2RCAA 1LBBA 1B3EA 2XX8A 2F5XA 2FYIA 3LR1A 4LATA 3CIJA 4ZEBA 1JEVA 4N13A 1MY3A 1URDA 1LAFE 4HS7A 1Y3PA 4R9FA 4IO5A 3UN6A 1MDP1 2THIA 2NVUB 3HHFA 5KDTB 1B3HA 3Q28A 2HAUA 5TP9B 2XXVA 3IL1B 3IOWA 4QSCA 3IB0A 1B32A 2O7UA 4G77A 3FZVA 4KI0E 1MY1A 2RCBA 4F1YA 3T66A 3JYRA 3MP1A 4U4SA 4NF5B 1FQCA 1D9VA 3U8QA 2HEUA 2DVZA 3VXBA 4ZE9A 2F8DA 3FASA 4NTLA 4ELQA 3O2AA 1MY0A 1NNFA 4EQ9A 1A7LA 4OYVA 4F18A 3Q29A 2XXYA 4YAHX 4JB7A 4PQJA 3OEKA 1II5A 3MPKA 1JW1A 3FD3A 1LFHA 2NXOA 1N7WA 1SBPA 1IXGA 3V89B 4OESA 3PGFA 3TTNA 4GQOA 2F7BA 4G2ZA 4I1DA 2M8CA 3OD7A 4KHZE 3OSQA 3IAZA 3VVEA 1B1HA 3QIMA 3L6GA 4YKIA 1IEJA 1LFIA 1A55A 1QUIA 2OWSA 5I84A 3M8UA 1FW0A 3T22A 1MDQA 3HN0A 2X7PA 4ZS9A 1L5TA 4QRZA 1B0LA 4LA9A 3WAEA 5FTHA 2E0SA 3TTMA 3VE1B 3MVZA 1ELJA 2F34A 1NH8A 3SESA 3E3KA 3F11A 2XXUA 3QK6A 3IB2A 3LSFB 3T93B 2YJPA 1B5JA 1OVTA 3T9VA 1J1NA 2IEEA 5H8FA 1Y4TA 3V83A 3W9VA 1B1XA 2B3FA 4IY6A 4KCCA 1ZU0A 1US4A 4DXBA 1BIYA 3SEVA 3CVGA 4I9DA 4R6HA 3DLNA 4AB6A 4NF4B 4POWA 4M4GA 4EF1A 1Y1ZA 3TCGA 3TQLA 1NFTA 2PBWA 3O6HA 4IO6A 4RY1A 2F36A 1GR2A 1LSTA 3TTRA 4RPOA 2W7YA 2A5SA 2RC9A 5AA4B 1B6HA 3QSLA 2ABHA 1MXYA 1JNFA 3K6VA 1PB7A 3UP9A 3TDJA 5EYFA 5F1QA 1EU8A 4F3SA 1MQHA 5A5XB 5AA2D 2Z8FA 4RYAA 4F1VA 4YZZA 1TXFA 3W9WA 4OTEA 1RKMA 3PU5A 1N7XA 1FQDA 3HV1A 2YPNA 2PMSA 5I59B 2F97A 1OLAA 3FJMA 1IXIA 1Y3NA 4NF4A 1MY4A 1ATGA 3IR1A 5L9MA 1B4ZA 1SD3A 4GIZA 3SEXA 4U1ZA 4X9TA 4H1XA 1Y20A 5L8DA 1BKAA 3DM0A 5KZTA 4GF8A 3C4MA 1JVXA 2AL5A 2BJJX 4H8JA 3G3FA 3MZ1A 3SKPA 1QJMA 3S9LC 2OCUA 5AA4A 1MPDA 5L9SA 3IB1A 1MXVA 2I48A 5A5XA 2VD3A 3FXUA 4ONYA 3O9PA 2YLNA 4LZ7A 1MQIA 2ANJA 1SW5A 1USYE 2PVUA 3FGSA 1ZKBA 2XX7A 4U1OA 4Q30B 3K2DA 2XX9A 4GL8A 1A54A 3EPEA 1QVSA 2VOZA 2Q2CA 4QFPA 1MQGA 3PV0E 2DQVA 1MPBA 1TFDA 3OELA 3C34A 2I3VA 2ZNTA 1QUKA 1B7ZA 1B51A 3TCHA 4YKJA 3MVWA 1UTBB 3K6UA 3ZSFA 2FNCA 4P0IA 1B7UA 4LUBA 3PMVA 2QS1A 1EZOA 3UK4A 5DEXB 4Z7EA 1FTJA 1LB9A 4RK9A 4BDOA 3K00A 3K0VA 3TCFA 2B3BA 2XXRA 1Z7ME 2XD2A 1ZMGA 5AA2B 3KN7A 4IGTA 1JETA 5ITPA 1LFGA 5KCJB 4JXIA 2QMXA 2F7CA 2REGA 5CC2A 1P1QA 5B7DA 4QFLA 3VVFA 2QS3A 3N6UA 4R6YA 4RA1A 5ITOA 1OIBA 3QYTA 1PEBA 1EZPA 3MP8A 3PUYE 2OK2A 2O1MA 3PUVE 4HW8A 2DVCA 5F7VA 4DE8A 2ZNUA 1UTBA 3ZS6A 5CBSA 3I3VA 4G68C 1BTJA 5DEXA 4OEUA 4QSEA 4ZEIA 1OQGA 3U72A 4RNSA 3B6WA 4EXLA 2NUVA 3CR9A 4FJPA 3LSWA 3RGYA 5ELVA 5H8NB 3SEYA 1JQFA 4ZZEA 3IO4A 2I4CA 3KFMA 1P99A 3OO8A 4RK2A 2UVGA 1ANFA 3HCQA 3S9EA 5I56A 1LLSA 4N07A 3H6TA 1TT1A 2R71A 4AQ4A 3QUJA 3G3IA 3O6IA 4H5FA 2F6PA 2Y7IA 1OQHA 5DYHA 5HM4B 4R75A 4ELOA 3SDFA 4KD5A 3TEPA 3N6TA 4FEDA 4JWYA 2Y7KA 2ZYOA 3IORA 2IA4A 3K1PA 3GLBA 1H44A 4EQ7A 2AYSA 4IGRA 1YPNA 2Q89A 2P2AA 1QKAA 3RY3A 1T0KA 4O3CA 1FTMA 3QXMA 1FTOA 1DMBA 3KBRA 2D21A 1RYOA 1ZJLA 4JDFA 1TWYA 4OZ9A 1P1OA 4Q0CA 2X26A 5IAIA 3C35A 3MVYA 3M3FA 3UIFA 1JVYA 4MFIA 1A8FA 1ZTYA 3D4GA 2VHAA 4OETA 3TKDA 4GVOA 4ZEKA 4DZ1A 2H99A 3PPPA 4K3FA 1LAHE 5CMKA 3HO7A 4F39A 4FE8A 1B5IA 2VGQA 3H03A 2G93A 3DP4A 1AL3A 2DXYA 4DLDA 1IXCA 4KYSA 2AL4A 2UVIA 3RN8A 1Q1KA 3DP8A 3PMXA 1I6AA 3IO6A 3RNNA 4U21A 3P7IA 3C9HA 4BDNA 1PBQA 2RF1A 3KOTA 1FQEA 1UIVA 4RJZA 2I3WA 4ISUA 4PFTA 4YB6A 4HCWA 2DSFA 4YKPA 2I4BA 2D5WA 4NE4A 4NMYA 5H8HB 4DXCA 2P0SA 1IUDA 5H8FB 4IB2A 2DWAA 3C31A 1YTVA 4F3PA 5DTBA 5DVFA 1A40A 2Z8DA 3GZGA 3PPQA 1S50A 1JW4A 2WKYA 2KLFA 4HCYA 1MY2A 3C33A 2HZLA 3VLWA 1FTLA 2X7QA 3MPLA 4GL0A 4G4PA 2G29A 4KR5A 3G3HA 5K2XA 5I58B 1GGGA 1NNKA 3CG3A 4H5GA 5JEIA 1LBCA 5JK4A 1M5CA 1HSJA 1CE2A 2A5TA 3ILTB 1GTKA 2I6EA 3G3KA 1I69A 5JTYA 5DT6A 4DXUA 1O63A 2OWTA 2DE3A 2FA7A 4GD5A 2XXXA 5H8HA 4GLIA 3RUMA 3MUQA 4G8MA 5HPQA 2HXWA 1DTGA 4TLLB 3Q26A 2Z22A 4OVJA 2O69A 1FCKA 2O84X 3Q25A 2H9BA 2UXAA 2OZZA 3ZKKA 4MLVA 4IY5A 1R9QA 3A09A 3H6UA 1EZ9A 5I58A 4XKNA 5EHSA 3A3UA 1B3FA 4H65A 1GV8A 3MW0A 4IO2A 3KGCA 3UGWA 3TQWA 1N3WA 3SERA 1IITA 1S9TA 3HPIA 3KOSA 4PFWA 3H6VA 1MQJA 3VVDA 4E0XA 3KZGA 1SYIA 3FIRA 1XVXA 2I49A 1N84A 2DE4A 4MBPA 3FVNA 2XXIA 4X1BA 2PYYA 4YB5A 4ND9A 3R26A 1NL5A 4EF2A 3S2VA 4HTGA 3R7XA 1MM6A 4F2QA 1XVYA 3E9XA 5I2KA 4PFYA 3JZJA 4ZE8A 1D4NA 4GFRA 1UTHB 3OO7A 3PD8A 3TTKA 5M2VA 3PD9A 4H0WA 5AE4A 1LCTA 3K6XA 4FECA 4LQ2A 2I0BA 1DPEA 2R9JA 3BFTA 4G8HA 3KEIA 4F1UA 4POXA 2PX1A 4ELRA 3DELB 5CBRA 4OMBA 4I62A 1Z7NE 2HAVA 3T9UA 2NWJA 3V8XB 4JWXA 1B0HA 4OQOA 4PE5B 2CZLA 2DP8A 1IZ1A 2O1LA 4OEVA 2LAOA 4Q8RA 4IO7A 1SI1A 4GXAA 2ZYKA 1Y1MA 4ZDMA 4KPTA 3LSXA 4OFLA 3WAFA 1UTHA 3OEMA 1OMPA 2XXPA 1WODA 4NWCA 3VLUA 4F29A 1P1UA 2P1SA 1PC3A 4F3BA 4FATA 5I57A 3MJNA 5FTIA 2ONSA 4FIMA 4LQ5A 5AA3A 2ZYNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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