2P2AA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with 2-bn-tet-ampa at 2.26a resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
259
structure length
258
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A tetrazolyl-substituted subtype-selective AMPA receptor agonist.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 80
structure length 258
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2p2aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2p2aA02
3VXCA 2FA7A 1IXGA 4IO3A 3M3KA 2ONRA 5TP9B 1HSEA 1L5TA 3TTMA 1N7XA 1P1UA 2RC9A 4JDFA 2R71A 5I59A 4DCXA 3JYRA 1M5EA 4POWA 2X7QA 3MJNA 3V5AA 2UVIA 1SI1A 4DXBA 3CR9A 4HCWA 4Q0CA 1O7TA 2I6EA 3PPOA 1USYH 4E0WA 1B5JA 3EF7A 2OK2A 2BJJX 3TUSA 3K1NA 1S50A 4R72A 1A99A 2A5TB 4JWYA 4GQOA 2XXRA 2THIA 3G3JA 2XXPA 3TEPA 1ZBMA 2XXVA 2DYXA 2AYSA 1KWHA 4GIZA 3UA8A 1M5DA 5TPAB 1SW4A 1H44A 2V3TA 4F3SA 2ZYMA 4R6KA 1OMPA 4PFUA 2UVHA 3I5OA 2QPQA 5I2KB 4K3FA 1GVCA 3THIA 1TFAA 3EHSA 2Q2CA 1JQFA 1YPNA 4NF8B 1B9JA 4C1TA 2FYIA 2REGA 1UIVA 2V25A 4DZ1A 1O64A 3UK4A 3I6VA 2Y7PA 2ZMBA 2OZZA 3EHUA 2ONKE 5AA2B 1SYHA 1B7UA 2I48A 2DWHA 3H3GA 3QIMA 2HFBA 1DTGA 4ZZAA 4ESWA 1ZMGA 2Q9TA 3SDFA 3LSFB 3KN7A 3SETA 4YICA 4NTLA 1LFHA 4EF2A 1AL3A 2F78A 1B32A 3N6UA 4GWOA 2V84A 4LA9A 5A5XB 3K6WA 1LAFE 3PMWA 4PP0A 5JK4A 4HCYA 1IZ1A 1A55A 3OEKA 3IL1B 4YB7A 2F36A 2XXIA 4PQJA 4IGTA 2OWTA 3K00A 4U2RA 3WAFA 4JBZA 2OBGA 2XX9A 1IXCA 3S9EA 4N07A 1TWYA 5L9OA 1POY1 1NNKA 4R2FA 1OLAA 3T66A 3MZBA 3EPEA 1XS5A 5AA3A 3EN3A 3TMGA 4LQ5A 3LR1A 3MBPA 1SI0A 4OQOA 3P7IA 4U23A 2QRYA 3K1MA 1PC3A 4GXAA 3PUYE 4ELQA 1MQHA 5EHSA 1I6AA 4OFLA 4XKQA 5AA1A 2NXOA 3IB1A 4ELRA 2A5SA 3TZAA 4HS7A 2I3VA 2CZLA 2F97A 4XKPA 4H0WA 3V83A 4GLIA 2HQ0A 4QFNA 1LB8A 2ZNUA 2AL4A 4RK9A 3KN8A 1MY1A 1MQDA 4H5FA 2V3UA 4RYAA 3O28A 1MY3A 2UXAA 1ATGA 3BKIB 1UIUA 1R6ZA 3FXQA 2HCAA 2XX7A 2D5WA 4OMBA 3R6UA 3MZ1A 5I2NB 3O66A 1B3FA 2Y7KA 1Y1ZA 4G8HA 2Z23A 1MRPA 4DLDA 1B5HA 3HHGA 4NF6B 1XVYA 5CMBA 3PUXE 1AIVA 4RY1A 1MXZA 1R9LA 3RTFB 3CFLA 5KZTA 5H8QB 3K01A 2OJTA 4XKRA 1MS7A 2I49A 4U4XA 5ITOA 3E9XA 5CMKA 3PU5A 4H8IA 4KHZE 3RUMA 4XXUA 5DEXA 2RCAA 4GOTA 2DXRA 4LUBA 4LVQA 4O3AA 2ZNSA 2HEUA 1PB8A 2RC8A 4H8JA 3IOUA 3L6GA 3R7XA 2QL3A 3K6UA 4YMAA 2QS2A 1N7WA 4QFKA 5H8NB 1OVTA 1ZIUA 3E3KA 4R9FA 4Q8RA 4OVJA 5CC2A 4I62A 1ANFA 4GL8A 1USYE 3TCFA 1JW1A 3FJ7A 4YU0A 3B7DA 2HXWA 3PPRA 5HM4B 3C34A 1Y20A 3PPPA 3GXAA 4ZEDA 2DWAA 2VD3A 2B3BA 3T22A 1MXVA 3RQTA 1NH8A 4NF5B 2PT1A 1FTKA 3IO6A 4AB6A 3SEUA 3OEMA 3DELB 3OSRA 3MPKA 4LZ8A 4MLVA 1Y3QA 2Q89A 3FGSA 1PB7A 4IO6A 1QKAA 4G2ZA 3TQWA 5I84A 4NWCA 3FXUA 3IK6B 4ELPA 2PYYA 2ABHA 4FATA 4Z7EA 4RPOA 2O1MA 2F7AA 1UTBB 3L6HA 1B7HA 1YCJA 4YZZA 5KDTA 3H6TA 5H8FA 4BDQA 4KFQA 2CMOA 2VHAA 3IB2A 3Q27A 2Y7RA 2XXXA 3MVXA 2H99A 3IOVA 3OMBA 3KFMA 3C4MA 3UGWA 3C36A 3FV2A 3OD7A 1MY4A 1H76A 4IB2A 3M3FA 2M8CA 1I6QA 4F3PA 2XXHA 3Q25A 3H7MA 3PUWE 2DXYA 5L9SA 4FAJA 2E1SA 2OWSA 1JVYA 3ZSFA 1B40A 3FJMA 3PV0E 2DVCA 1B05A 2DVZA 2F34A 4EF1A 1MPDA 3OSQA 4G8NA 2O84X 2XHDA 4BDRA 4AQ4A 4QSDA 5HBCA 2V3QA 2QS4A 5I58A 4F3BA 1IEJA 4OESA 1GR2A 4KD5A 2ZXTA 3IJXB 1D9VA 4WXJA 4FEBA 5L9MA 3MVWA 1B2HA 2I4BA 3HN0A 5AA4A 1QKBA 3K6VA 1N04A 3MP1A 4NMYA 5ITPA 5F7VA 1SDXA 4G4PA 2FNCA 3N94A 1FCKA 4F31B 2B3FA 3G7WA 1EZOA 4G68B 1A8EA 4FECA 2IA4A 3N6TA 4IO4A 3HPIA 4RJZA 3SEVA 3T9XB 4YMBA 4L17A 3O9PA 3QYTA 3UORA 2GH9A 3O6HA 4O3BA 4Q30B 1AH5A 1OIBA 3PMXA 4FIMA 1IIWA 3MP6A 1A8FA 4QFOA 3DP4A 1LBCA 5JEIA 3ECRA 3SEYA 4H65A 1LB9A 3HHFA 3F11A 3G3FA 2DQVA 2O1LA 3C32A 3ODBA 3QXMA 2RCBA 1SVXB 4PFWA 1JNFA 2D3IA 1B1XA 1ZLQA 3FVGA 2R9JA 1B0LA 2RF1A 4DCYA 3B6QA 1TT1A 1AMFA 4H5GA 4OFJA 3TAJA 3U8QA 2ZNTA 5H8HB 1P1WA 1OLCA 4R73A 3RTWB 4N6PA 1UQWA 1FQAA 5I57B 4M4GA 3FZVA 1B5IA 3OOAA 5J1DA 3U94A 4H1XA 3KJTA 2Q8JA 3ONMA 4X1BA 3IOTA 3DM0A 3AXFA 4DDDA 3GBAA 1GTKA 1LLSA 4NE4A 1JEUA 1URSA 1TFDA 3C9HA 3KOSA 4F1UA 4YB5A 2DS9A 1VSOA 4QSCA 2Z8DA 4LATA 1URDA 4LP2B 1FQFA 4OEVA 4P0GA 1S7YA 4O3CA 5M2VA 2F6PA 1YTVA 3VLVA 4KYSA 1GGGA 1J1NA 4F2OA 4QFPA 2XD3A 4NF4A 2O69A 2Q2AA 4MF3A 2LAOA 3O29A 4THIA 3TKDA 1OQHA 4F39A 2HZLA 4WEDA 1RYXA 4X1DA 4GD5A 2UYEA 4IGRA 2UYFA 2AL5A 4R74A 4GFRA 4QHQA 2O7UA 5KCJB 2E0SA 3LSLA 2XXWA 5CMCA 4EXKA 2P0SA 1NMUA 2I0CA 4I9DA 4OFOA 3TCHA 1DMBA 1UTHA 4OHNA 5I59B 4OETA 2QMXA 1Z7ME 3MP8A 3K0VA 1Y1MA 4JWOA 1MPCA 1BP5A 2H25A 3T9HB 5EHMA 3S9MC 3OO8A 3T93B 3GBBA 3KSXA 4G77A 4ISUA 1LGBC 3VV5A 5ICTA 1M5CA 3C33A 1DPEA 5F1QA 1CB6A 1XC1A 3CIJA 5CM6A 3W9WA 4X48A 3V89B 1RYOA 3VDFA 1PDAA 4PETA 3TDJA 4MLQA 2Z22A 4ZEFA 1A54A 4RK2A 3UN6A 3R26A 2RC7A 4IO5A 5B70A 3ZS6A 1I69A 3G3IA 5CBRA 4XKNA 2P2AA 3KEIA 3VLUA 3Q29A 3MC2A 2QS3A 3DP8A 4M1VA 3VLWA 1FQBA 2GFEA 3IB0A 2PBWA 3MQ9A 3OO9A 4EXLA 2F7CA 1B0HA 3TTKA 4ECFA 3LC8A 3FVKA 2Q88A 4RNSA 4NEDA 4DE8A 1JETA 3TQLA 3IORA 2RINA 5AA2D 3A09A 1WVJA 1D4NA 4F1YA 2RKMA 2ALUA 3OELA 2H98A 3SEXA 5TP9A 3RT6B 3CFXA 3PUZE 2KLFA 1Y3PA 4IO2A 3KN3A 1MPBA 1ZKBA 3B6WA 4Q5TA 1B4HA 4F29A 1H43A 4JSOA 3O6GA 2PVUA 1QUJA 3PD9A 1JVXA 1QVSA 3QK6A 1I6BA 1MY2A 2A5TA 3K6XA 3EQ1A 4N13A 4EDPA 4TOZA 2I58A 4U4SA 1MG1A 1BIYA 1D9YA 1MDP1 4OWDA 1VFDA 4R2BA 5TPAA 4GRKA 3H03A 4RA1A 1M5FA 1WODA 1MXXA 4HW8A 1Z7NE 1NNTA 2R6GE 5I2KA 3IJOB 2YPNA 3ILUB 4OENA 4NF8A 4YKJA 4KYEA 3VVDA 1PB9A 5FTHA 3FXRA 1PEBA 3TPAA 1LCTA 5HPQA 2GRVA 2OCUA 3O2AA 3S9LC 1EZ9A 1NFTA 3ILTB 3GZGA 3LSWA 5BUUA 1QJMA 5AA2A 1XHYA 1EU8A 4PFYA 3U72A 5ICQA 2F8DA 3FATA 2B65A 2XXQA 3H4ZA 3TFLA 2Z8FA 1SQYA 4ESXA 3ZKLA 1FQEA 4YKIA 4E0XA 3CG1A 2Z8EA 5DT6A 4X9TA 4OTEA 1LAGE 1YAEA 3PPQA 3IX1A 1Y4CA 2Y7IA 1II5A 5A5XA 3OXNA 2G93A 4QF9A 3DP6A 3TODA 1N76A 3RGYA 3KJ7A 5B7DA 4TQUQ 3QUFA 1P1QA 4ZECA 3U92A 3LUYA 3LBSA 5DEXB 1N3XA 1LFGA 1B3HA 1LFIA 3WAEA 4WKMA 3MVYA 3FUZA 5I56A 3FASA 4FEDA 1IXHA 4MBPA 1Q1KA 2XD2A 1N0TA 2NWJA 1MXUA 4XTCQ 4ONYA 2I0BA 1MQIA 3U1OA 4TLLB 3K2DA 3MZ9A 5CI5A 1XT8A 2DE2A 3E4RA 3BFTA 1QULA 1MM6A 3RN8A 4MH5A 4BDOA 3T9VA 2DSFA 4TLMB 3KG2A 3QUJA 2ONSA 3N26A 1MDQA 5CBSA 1Y3NA 1B3GA 3TTRA 1A40A 1FTJA 4P11A 4EQ9A 1BLFA 5DTBA 3FIRA 1B51A 1N3WA 5AE4A 3FJGA 4JXIA 4G8MA 1IQ7A 5I2NA 1NNPA 1F9BA 1JW4A 3BFUA 1BTJA 2XXUA 2F6GA 3TTNA 3C35A 5BWJA 4NF6A 1Y9UA 1MXYA 4FORA 3SKPA 4ELOA 4F19A 2PMSA 1LAXA 5H8QA 1BKAA 4ZS9A 4LONB 5DVFA 4AB5A 3CSBA 1LSTA 1OVBA 1SD3A 3TELA 2I4CA 1M5BA 2HAVA 1DOTA 3GLBA 3OO6A 3SEWA 4IO7A 3IO4A 5KDTB 3Q28A 3MW0A 1P99A 5H8FB 2QSXA 2F35A 1B3LA 3H6UA 1RKMA 1PBQA 2O7IA 4POXA 3RNNA 3EHTA 4F22A 1HSLA 3MWBA 3M3LA 1B58A 4ZE9A 3FD3A 5H8NA 4IY5A 1N84A 4U21A 2H9BA 2X26A 2HZKA 4KI0E 1R9QA 4ZZEA 1Y4TA 4QRZA 3OENA 4FJPA 4KQPA 3DLNA 5FHMA 4EQBA 4WEPA 1POTA 5ISUA 4EUOA 5FHOA 4C0RA 2H4IA 2VD2A 4YAHX 3HSTA 1ZTYA 4IY6A 1A7LA 3RPWA 4NF5A 1NKXA 3PGFA 1JEVA 1JW5A 5EYFA 1MQGA 1US4A 1TXFA 4U22A 2XXYA 5I58B 1B52A 1SW5A 3PD8A 2Y7WA 5LOMA 2H5YA 3C31A 1H3DA 2ZYOA 3FV1A 3K02A 1SW1A 4OERA 1SW2A 2Y84A 5I56B 2PT2A 5CRYA 3U93A 5AA4B 3MVZA 4LQ2A 4BDNA 2YLNA 1QUIA 1DPPA 3H6VA 1UTBA 3S2VA 4OEUA 1OQGA 3BBRA 3SESA 3USDA 1NNFA 2VP1A 2QMWA 4ZDMA 3MPLA 4H6DA 3SERA 2VOZA 3KSJA 4ZE8A 3W9VA 4JWXA 1LCFA 3PMVA 3VE1B 4F3GA 5IAIA 3N5LA 2UVGA 2OLBA 4PFTA 4H67A 3FVNA 2PX1A 1H45A 4FE8A 4YB6A 2XX8A 1WDNA 3T9UA 3KBRA 4YKPA 1LBBA 3RY3A 2GHAA 3KGCA 3H6WA 3K4UA 3PPNA 3IAZA 1US5A 1S9TA 4F18A 2I3WA 1R1NA 1O63A 4KPTA 2X7PA 4R6HA 4BLAA 2XXTA 5IKBA 2P1SA 1Q35A 4RXLA 1MXWA 1PBPA 2W7YA 3CRBA 5DYHA 2G29A 2YJPA 5CMMA 1B7ZA 1ELJA 4GL0A 4DXCA 3G3GA 5JTYA 4BDLA 2DE4A 4ZEIA 1MH4A 4R6YA 5FTIA 1FTOA 4NWDA 1FTMA 2IEEA 2O6AA 1FW0A 4QSEA 3H06B 2F7BA 3TYHA 1P1OA 1SYIA 4G68A 3A3CA 4JSDA 3Q26A 4KR5A 1HSJA 3B6TA 3HCQA 1QUKA 4F2QA 4YKKA 3JV9A 4GVOA 2AIXA 4DXUA 3VFJA 2NUVA 3A3UA 4U1OA 3JZJA 4G68C 3HO7A 3G3KA 1NL5A 4R75A 3G3HA 3QAXA 1XVXA 3IOWA 5ELVA 2V93A 3LSXA 1T0KA 1FQDA 3O97A 3CVGA 2UVJA 4ND9A 1DTZA 1FTLA 1ZJLA 4NF4B 1MM7A 2NVUB 4ZEKA 3VXBA 4EQ7A 1NH7A 2O51A 4I8CA 1B3EA 3TTLA 3UP9A 5TU0A 3W15C 3KOTA 3CFZA 3CG3A 1IUDA 2REJA 3D4CA 4JB7A 1B4ZA 1ZU0A 2QS1A 5DVJA 5H8HA 4DIGA 1VR5A 4UACA 1MY0A 2DP8A 5K2XA 5I57A 1URGA 1CE2A 3TCGA 3CI8A 1UTHB 1VFEA 3ZKKA 4GXSB 3VVEA 4KCCA 5L8DA 3S4UA 1EZPA 2D21A 2ANJA 3MAMA 4UA8A 2DWJA 1FQCA 4KYDA 4PE5B 2ESNA 3S9NC 3T96B 4R9GA 1SBPA 1IXIA 5H8SA 1LAHE 2F5XA 1VE4A 4Z0IA 3VVFA 4ZEBA 3RT8A 4RPNA 4BDMA 3CSGA 3D4GA 4I1DA 3V8XB 1QW0A 3I3VA 1DSNA 3M8UA 1EH3A 1XOCA 1B46A 4U1ZA 3IR1A 1D3KA 1AOVA 1B6HA 3MUQA 1GV8A 3QSLA 4XIGQ 1MH3A 5DVIA 3O6IA 2O68A 3K1PA 5FHNA 2HAUA 2NOOA 4MFIA 4OXVA 2ZYNA 3PUVE 2DOJA 2DE3A 2VGQA 3E13X 3UIFA 4LZ5A 5JTYB 1MQJA 4HTGA 4P0IA 1B1HA 4C1UA 5K2YA 2ZYKA 3HV1A 2DWIA 4GF8A 3RLFE 4KCDA 4OZ9A 4QFLA 3KZGA 4OYVA 1P1NA 5KCJA 2QJEA 1IITA 2WKYA 2GHBA 4F1VA 3FVOA 3OO7A 4LZ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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