2Q2CA

Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
KKVVVGTDAAFAPFEYMQKGKIVGFDVDLLDAVMKAAGLDYELKNIGWDPLFASLQSKEVDMGISGITITDERKQSYDFSDPYFEATQVILVKQGSPVKNALDLKGKTIGVQNATTGQEAAEKLFGKGPHIKKFETTVVAIMELLNGGVDAVITDNAVANEYVKNNPNKKLQVIEDPKNFASEYYGMIFPKNSELKAKVDEALKNVINSGKYTEIYKKWFGKEPKLDRLKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures and mutational analysis of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein ArtJ from Geobacillus stearothermophilus. Implications for interactions of ArtJ with its cognate ATP-binding cassette transporter, Art(MP)2
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Geobacillus stearothermophilus
molecule keywords ArtJ
total genus 74
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2q2cA02
1LAGE 4ESWA 1M5FA 3BFTA 3RTWB 2AYSA 3GZGA 3VVEA 1NL5A 4H65A 4EXLA 4JXIA 4R6YA 4U23A 4M4GA 1S7YA 5FHNA 1IXHA 4OHNA 3ZKLA 4ZECA 3O28A 5I58A 2DE4A 3PMXA 4IO5A 4R9FA 2O6AA 2IEEA 3FIRA 2O7UA 4OFLA 1OLAA 4F3GA 1IUDA 4GXAA 2VGQA 1AMFA 4YKJA 3TEPA 1B52A 4RA1A 3MVYA 5B70A 5I2KB 5H8SA 2F34A 3V5AA 3DP6A 5ISUA 4H8IA 2F5XA 4ZS9A 1YCJA 4OTEA 4GRKA 2GFEA 1SBPA 4DXBA 3SEYA 5KDTA 1I6QA 1AIVA 4H8JA 2V93A 1SDXA 4RY1A 3FASA 3VVDA 2HQ0A 3KFMA 1ZLQA 2ZNTA 2I4BA 5H8NB 4BDOA 4MF3A 1EH3A 4FATA 3G3KA 4IO7A 2XX8A 5TP9B 4NF5A 3CR9A 5BUUA 3U1OA 5ITPA 3O6IA 2B3FA 1GV8A 5AA4A 3O29A 3G3JA 4HCYA 4QSCA 4FORA 1NNPA 4R2BA 4GL8A 1URDA 1O64A 1Q35A 2XXHA 2G29A 3MZ9A 2THIA 2ZNSA 5EHMA 2OBGA 3KJ7A 4NEDA 3IOUA 3K6WA 4ZZEA 3Q27A 2DVZA 4EQ9A 3OOAA 4YKIA 3QYTA 5L9MA 4NTLA 4QF9A 2WKYA 3B6QA 4PE5B 4OMBA 1MDP1 3OENA 4H5GA 1WVJA 3UP9A 4PP0A 4QFLA 2P2AA 3PPOA 4GQOA 2DXYA 2DSFA 4U21A 1LB8A 1M5CA 3BFUA 1N3XA 4RPOA 1MH3A 3IX1A 1D9VA 3KJTA 3IAZA 1IEJA 5CBRA 3FD3A 3CG1A 1WODA 3ECRA 2DWIA 2HZKA 2PMSA 4EXKA 2H98A 2I48A 2VD2A 1B2HA 2M8CA 4NE4A 4LQ5A 3D4CA 2Z8DA 4X48A 4F19A 5FTIA 3FXQA 1QUJA 4NF4B 5ICTA 1OMPA 4G77A 3RT8A 1MQHA 4NF8A 4LP2B 4X1DA 1SYHA 4PFYA 5L9OA 3HCQA 1TXFA 3QAXA 4NWDA 1P1WA 1BLFA 2V3TA 3K4UA 2DQVA 1B4ZA 5CMBA 4RJZA 1HSLA 2DE2A 2YJPA 2XXTA 5H8HB 4FEBA 4OWDA 3SEWA 4DXCA 3LC8A 1LLSA 5DYHA 1ZU0A 4R6HA 5CM6A 1MRPA 1UTHB 1OVBA 4LZ7A 4MFIA 2H25A 2QSXA 2ZNUA 1ELJA 2RC8A 4F3BA 4OESA 4ND9A 4OYVA 4U2RA 3R26A 3TMGA 1S50A 2Q8JA 4XKPA 2I0CA 5J1DA 3A3UA 5HPQA 5AA2B 2UVIA 1B6HA 1GVCA 2OZZA 4OFJA 2RINA 2H99A 1CB6A 4IO4A 1A55A 2DWHA 1FTLA 1FTOA 1FTKA 3PD9A 4EQBA 1B46A 3TTNA 4OETA 4GL0A 3Q28A 4DZ1A 5IKBA 1NFTA 5CI5A 1MXVA 4I1DA 3B6WA 1XT8A 3FUZA 3L6HA 1USYE 3BBRA 3HSTA 3DELB 2UYEA 1B5JA 1B5HA 3LSLA 2I0BA 4OZ9A 4KD5A 5HM4B 4G68A 3V8XB 3K6XA 3SESA 2XXQA 4DIGA 3TZAA 4FE8A 2XXWA 4F18A 3EHSA 4WEPA 3UK4A 3TTRA 2E1SA 4OFOA 3KN7A 1MG1A 2QMXA 3PPPA 3EHUA 4RK2A 2QS3A 3TCFA 1URGA 4PFTA 1Y4TA 5JTYA 3KEIA 4JSDA 3VDFA 1FTMA 4N07A 3QK6A 3RT6B 1B05A 3S2VA 1POY1 4OEVA 3CIJA 4YKPA 2A5TB 1PEBA 3Q26A 3S9MC 1MPDA 4EF2A 2OWSA 4TLLB 3TDJA 3FXUA 3GXAA 3TPAA 1TFAA 2I6EA 1FQCA 1B1XA 2XHDA 3O66A 4R9GA 1OQHA 1ZBMA 1FW0A 2NWJA 2BJJX 1MY2A 4AB5A 1MXWA 4IY6A 2OLBA 3U94A 2HZLA 1Y1ZA 4DE8A 4P11A 4Q30B 4N13A 2CZLA 4KPTA 1JVYA 3IK6B 5CMMA 3TTLA 5F7VA 1TT1A 1QUKA 4WXJA 4NF6B 2XXUA 4QSDA 3EN3A 4ELQA 3THIA 2V3UA 3FVNA 3M8UA 2HAVA 3MC2A 1D4NA 4F22A 3T9XB 3M3LA 3RPWA 4EF1A 3FV2A 3TUSA 1JETA 3DP4A 2NVUB 3PUVE 1FTJA 3K6VA 2Q9TA 2Z8FA 2Z22A 3V89B 3OELA 4NF5B 3W15C 5DTBA 1UTBA 4IGRA 3JZJA 1ATGA 1R6ZA 1VE4A 1MQDA 4F3PA 5A5XA 2F78A 3CFXA 2QJEA 2F6GA 3K1MA 4OERA 1LFGA 1VR5A 3PV0E 2UVGA 4TQUQ 1EZ9A 3TAJA 3MW0A 1Q1KA 3IL1B 5AE4A 3OSRA 4U4XA 2FNCA 3O6GA 2ZYOA 1POTA 2DWJA 1UIVA 3D4GA 3OMBA 2VP1A 4GD5A 1Y4CA 4JWYA 1GR2A 1AH5A 3K1PA 3VLVA 2F7AA 1XVXA 3UN6A 1B3LA 3USDA 3IR1A 1PC3A 4GFRA 4UACA 4BDMA 1ZIUA 1QVSA 2H9BA 1N0TA 4BDRA 3C9HA 3OEKA 4XKRA 3O9PA 3ZSFA 1A54A 3S9EA 1DPEA 2KLFA 1MH4A 1P1QA 4YAHX 5TPAB 4EUOA 3SEVA 3HHFA 1FQBA 1M5DA 4JB7A 4RK9A 3A3CA 2UXAA 3WAEA 3C34A 3CI8A 3H6WA 3ZS6A 4JDFA 3VXCA 1N7XA 1MPCA 3MUQA 4U22A 4NMYA 4JWOA 3RQTA 1IZ1A 2CMOA 3G3GA 3EPEA 2Y7WA 1NNKA 4XIGQ 3WAFA 4HCWA 1QW0A 3GLBA 1MQIA 3RY3A 3FVOA 2ZYKA 2ZXTA 4FIMA 2XX9A 4RNSA 2UYFA 2QPQA 3VLUA 2Y7PA 4R6KA 3TFLA 3K6UA 5EHSA 3I5OA 1MXZA 3KG2A 5CC2A 1JW4A 3PMVA 4K3FA 5H8QA 1IXIA 4F1UA 4O3BA 3OO9A 4QFKA 1CE2A 4MBPA 5I59B 2YPNA 4GOTA 3VXBA 1SI1A 5DEXB 3KBRA 1IITA 1NH7A 4N6PA 3ILTB 2DP8A 4DDDA 1B0LA 3I6VA 4ZE8A 4P0GA 1LGBC 3AXFA 4YB6A 3FV1A 5JEIA 1B9JA 3K1NA 4DXUA 4ESXA 2F35A 5I84A 1LBCA 3MVZA 3TTKA 4FEDA 3U72A 3SERA 3KN3A 3T9UA 3N94A 1O63A 2RCAA 4QFOA 4G8NA 3N26A 3TKDA 4BDNA 1P1NA 4IY5A 1S9TA 4G68C 1I6AA 4OXVA 1JW1A 1B7HA 3MVXA 4C0RA 2OK2A 4JSOA 1M5BA 3CFLA 4ZDMA 2Y7IA 4G68B 4IO6A 1IXCA 1Y9UA 2GH9A 2XX7A 4BLAA 2PYYA 3IORA 2PVUA 1LAHE 3GBBA 1JEUA 3MAMA 2HEUA 1SYIA 4FECA 3IO4A 1SW2A 1A40A 1XC1A 4AB6A 2NXOA 1FQEA 2DS9A 4ZZAA 1SVXB 2D3IA 2IA4A 2XD3A 3R7XA 3KGCA 2DYXA 4C1UA 4MLVA 4IO2A 5I2KA 2ALUA 5I2NB 1QJMA 3HV1A 4MLQA 5H8FB 2I58A 3O97A 1JNFA 1B3GA 5AA1A 4IGTA 1IIWA 4G8HA 2XXXA 3FZVA 3BKIB 4GXSB 1BKAA 1B5IA 3H06B 4X1BA 1Y3PA 3OO8A 1MQJA 3VLWA 3QUJA 4R75A 1J1NA 1JVXA 3E4RA 3S4UA 1P1UA 4PETA 5H8NA 4BDQA 1QUIA 3S9LC 4KI0E 3VFJA 3RGYA 2PX1A 1MXUA 5TP9A 1Z7NE 1H44A 5M2VA 2D5WA 4PFUA 3PMWA 3SEXA 3HPIA 3B6TA 3RN8A 1EU8A 3MP1A 3G3FA 3O2AA 3JYRA 5BWJA 5LOMA 2F6PA 1SQYA 4ZEDA 2X7QA 2F8DA 3GBAA 2UVHA 4F29A 1P1OA 5JK4A 1IXGA 5FHOA 1LCFA 3TELA 1UTBB 4DLDA 2HCAA 2Q2CA 3E9XA 1B32A 4HTGA 3EQ1A 4YMBA 1N3WA 5TU0A 1MPBA 3VE1B 1A7LA 4ELOA 2QS2A 5KCJB 1RYOA 4YKKA 3DM0A 5B7DA 1B58A 1F9BA 4KYDA 2OJTA 1B3HA 3N6UA 4QFPA 1L5TA 5CMCA 4QSEA 3CSBA 4MH5A 1SW4A 4U1ZA 2F7BA 4GLIA 3V83A 4THIA 4NF4A 3FVGA 3VV5A 1D3KA 2DVCA 5FHMA 4G4PA 3Q25A 1H3DA 2PT1A 2QMWA 5I58B 2I49A 4KR5A 2W7YA 1MXYA 3IJOB 1LSTA 4Z0IA 5IAIA 2XXYA 5F1QA 3IB0A 4YB7A 1JW5A 5KZTA 2REGA 4XXUA 1USYH 2AL4A 5CBSA 3G3IA 2XXPA 5H8HA 3UA8A 4F3SA 2Z8EA 2QS1A 4X9TA 1O7TA 1B51A 1P99A 3C35A 4QRZA 3OO7A 1II5A 3Q29A 4RPNA 1SW1A 1UTHA 2R71A 3FXRA 4DCXA 1FCKA 1H76A 3U93A 1MXXA 5KDTB 1PDAA 1B40A 1QULA 3CVGA 1Y1MA 2O84X 2ZYMA 3RTFB 2H4IA 1PB7A 3PD8A 4Z7EA 1LAFE 5AA2A 3H6VA 1RYXA 3ZKKA 1EZPA 4FAJA 2AIXA 1JQFA 4WKMA 4ISUA 1MM6A 5AA4B 1DTZA 4EDPA 3IOWA 4ZEKA 4FJPA 1B3EA 4OEUA 3TTMA 1LCTA 3IOTA 1HSEA 3T9HB 3MWBA 2B65A 1DOTA 3C4MA 1MY3A 2DXRA 4JBZA 3KN8A 2I3VA 3H7MA 4LUBA 4E0XA 2F97A 1LB9A 5AA2D 1URSA 4KFQA 2O7IA 3SKPA 2O69A 4HS7A 2H5YA 3OO6A 1UIUA 2R6GE 5K2YA 1BP5A 1RKMA 3RNNA 1N04A 1KWHA 3TODA 4O3CA 1AL3A 3UGWA 3QSLA 3T22A 2LAOA 4LATA 3ILUB 3MQ9A 1B1HA 4KCDA 2ANJA 1ZMGA 2I4CA 4XKQA 1NMUA 2HXWA 4M1VA 4XKNA 2R9JA 3H3GA 5I56A 2Q89A 2O51A 2A5TA 1B3FA 3CRBA 2B3BA 3W9WA 2VOZA 2NOOA 3H6UA 4KYSA 2PT2A 3OSQA 3IB1A 1PB9A 2QS4A 5EYFA 4NF8B 3MP6A 1WDNA 3K00A 4OQOA 1H45A 1YAEA 4KQPA 1N7WA 3PUWE 3TYHA 2QL3A 1TFDA 3KSXA 3HO7A 4OENA 1B0HA 3G3HA 5CRYA 1OQGA 1TWYA 4GVOA 1HSJA 2XXRA 1ZJLA 4NF6A 4ZEIA 3OXNA 4I62A 1PBPA 5DVFA 4F31B 2ZMBA 1YPNA 3H4ZA 1B4HA 4GWOA 3L6GA 2ONRA 3UORA 3CSGA 3O6HA 1BIYA 1VFDA 3PUXE 1GTKA 4H1XA 3LR1A 2PBWA 3K2DA 2UVJA 1LFIA 4HW8A 5K2XA 3K01A 3MPKA 1FQFA 2V3QA 2XXIA 3PU5A 2V25A 2Y7RA 3S9NC 2GRVA 2P0SA 4Q8RA 3FATA 3JV9A 1XS5A 3LUYA 5I57A 3LBSA 2DOJA 1N76A 3G7WA 4RXLA 1ANFA 1LAXA 3E3KA 4YB5A 2QRYA 1R9QA 1H43A 3A09A 2ESNA 1I69A 1T0KA 2HAUA 2ONSA 3DLNA 3TCHA 1MS7A 3FJMA 3H6TA 4UA8A 2NUVA 1BTJA 4H6DA 4O3AA 4G8MA 4LONB 2OCUA 1SD3A 1OVTA 2Z23A 1B7UA 4ECFA 3RLFE 3MZ1A 5JTYB 3M3FA 1NNFA 1A99A 4OVJA 3E13X 3SDFA 1Z7ME 4KHZE 5TPAA 2OWTA 2E0SA 4KCCA 4ELPA 1FQAA 3H03A 1LFHA 1A8FA 1FQDA 3SETA 1VSOA 4ZEBA 3HN0A 3IO6A 1NKXA 3MPLA 2VD3A 5L9SA 4PFWA 4GIZA 4GF8A 2O1MA 5DVIA 4WEDA 4EQ7A 1XOCA 1SI0A 3K0VA 4IB2A 4POWA 4R74A 2XXVA 3MBPA 1ZTYA 2O1LA 4F2QA 4ZE9A 1A8EA 3IB2A 1DMBA 1DTGA 2VHAA 5I59A 1I6BA 3QUFA 2RKMA 3SEUA 5HBCA 5DEXA 3PUYE 4RYAA 4U4SA 1US5A 3DP8A 2Q88A 1IQ7A 3KZGA 1MY1A 5AA3A 3LSFB 4P0IA 4IO3A 4PQJA 3KSJA 1ZKBA 1UQWA 2P1SA 5L8DA 1QKBA 2Y84A 1NH8A 4H5FA 3C31A 4LZ5A 4YMAA 2DWAA 1DSNA 4POXA 4YZZA 3TQLA 5A5XB 4E0WA 2ONKE 1MDQA 2RCBA 3EF7A 3OEMA 4R2FA 2A5SA 3W9VA 1NNTA 1AOVA 2GHBA 4H0WA 3N5LA 5CMKA 3T93B 1OLCA 3T9VA 4ELRA 2RC9A 2FA7A 3VVFA 4BDLA 1Y3NA 4YICA 3P7IA 2X26A 3PPRA 2RF1A 4XTCQ 2ZYNA 3C32A 1R1NA 2F36A 5ICQA 4R72A 4LZ8A 2XD2A 4QHQA 4ONYA 5ITOA 1B7ZA 1SW5A 3UIFA 1DPPA 1R9LA 1OIBA 2I3WA 3U92A 1PB8A 3FVKA 4C1TA 4Q5TA 4G2ZA 3CFZA 3LSWA 4U1OA 2YLNA 1EZOA 3IJXB 3QXMA 2ABHA 3F11A 1PBQA 2DE3A 4I8CA 2V84A 2REJA 1LBBA 3T96B 3K02A 4I9DA 5I2NA 5I56B 3U8QA 1XHYA 5H8FA 1MY4A 1QKAA 4F39A 3MZBA 3LSXA 4ZEFA 2Y7KA 3KOSA 3PPQA 3R6UA 2X7PA 4LA9A 3C33A 5DT6A 4F1YA 1MY0A 2GHAA 3OD7A 4JWXA 3IOVA 3TQWA 4NWCA 1MQGA 4DCYA 2Q2AA 1D9YA 3FJ7A 3FJGA 2FYIA 1M5EA 1MM7A 4L17A 3M3KA 3FGSA 2RC7A 1YTVA 1VFEA 2G93A 3CG3A 3RUMA 4H67A 3MP8A 4QFNA 2AL5A 1N84A 4TOZA 3HHGA 1US4A 4YU0A 4Q0CA 3ODBA 5H8QB 1XVYA 3T66A 3TCGA 4LQ2A 5DVJA 4AQ4A 1Y3QA 2D21A 3EHTA 3KOTA 3N6TA 4LVQA 4F1VA 4F2OA 4R73A 3I3VA 3MJNA 4TLMB 1Y20A 2F7CA 1GGGA 5FTHA 4KYEA 3PUZE 3ONMA 3PGFA 3MVWA 5KCJA 5ELVA 5I57B 2HFBA 3B7DA 3QIMA 3C36A 1JEVA 2O68A 3PPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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