2R71A

Crystal structure of the complex of bovine c-lobe with inositol at 2.1a resolution
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex of bovine C-lobe with inositol at 2.1A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 114
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2007-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r71A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r71A02
2RC8A 3MPLA 2XXYA 3ZS6A 3C34A 1ATGA 4PFUA 1O7TA 3RTFB 5CMBA 5AE4A 3OELA 4YKJA 3QK6A 3K6WA 4ZEDA 1SYHA 3IO6A 4BDNA 4IB2A 2F7AA 4X9TA 4ONYA 2NOOA 2ZNTA 3CFLA 3H3GA 4FEBA 4TQUQ 5H8QB 1XHYA 1M5CA 4GL0A 1II5A 3Q27A 3TCGA 2HFBA 4ZEFA 3OOAA 2H4IA 4FAJA 1UTBB 3DP8A 4LUBA 3FUZA 4OENA 2QJEA 3LBSA 4R72A 2Y7PA 4Q0CA 2NWJA 3TPAA 4YB7A 4RXLA 4KYDA 2DP8A 3CG1A 2DE4A 3ZKKA 2QS2A 1MXVA 4DE8A 3FATA 4BDRA 4JSOA 1ZBMA 3QIMA 2DWAA 5JTYA 1L5TA 5CRYA 3EHUA 3TZAA 3G3IA 4JDFA 3TYHA 3IOVA 1B2HA 1POY1 4F3PA 2XXHA 2F34A 5ITOA 2PVUA 4RYAA 4LQ2A 4ZEKA 3JZJA 3UIFA 3W9VA 2Y7KA 4FATA 4BLAA 4FORA 1Y9UA 3WAEA 2I4BA 5CM6A 4RJZA 3K1PA 1IXHA 1LLSA 2XHDA 4EUOA 4ZEIA 5DVIA 3T66A 2Y7IA 1QJMA 4N07A 4OYVA 2ABHA 4R75A 1B05A 4R73A 5I2NA 2B65A 1LBBA 1JVXA 3C35A 4PP0A 1FQFA 1TFDA 1NH8A 3IR1A 2V3TA 2ESNA 5KDTA 4ND9A 1MQIA 2H99A 3SEXA 4F2OA 1LCFA 1TFAA 3OEMA 5DT6A 4GVOA 2D5WA 3TTKA 4PFYA 2B3BA 3MVWA 3SETA 1ZKBA 1SW1A 2QS1A 2AL4A 3H4ZA 3B6TA 4H1XA 2GRVA 2I48A 1R1NA 1SYIA 4NF6B 1UIVA 2HAUA 3D4CA 1Y20A 5AA1A 4OFJA 1OLAA 4EDPA 1D9YA 3TMGA 1LSTA 4G4PA 3PUZE 2QMXA 5AA2B 2P2AA 1MY4A 4HS7A 3EQ1A 2XXVA 3KN8A 1XVXA 2FYIA 4GIZA 4NWCA 2REJA 3MBPA 3OO7A 4R6KA 3CIJA 1GR2A 4BDQA 4ZECA 5K2YA 2IA4A 4YU0A 1FQCA 2PBWA 3CG3A 5FTIA 2QL3A 4XKPA 2XXIA 1QKBA 5AA4B 3FXUA 4JWYA 4XTCQ 1H76A 3FZVA 3U72A 1MY3A 3H7MA 1EZPA 4UA8A 1OMPA 3N5LA 3O2AA 3TDJA 3M3LA 4LA9A 2H9BA 2O7UA 4U22A 3TTRA 4ESXA 5I2KA 1QUJA 3DP4A 1N3WA 1GV8A 1P99A 2ZXTA 3M3KA 3LSWA 2PT2A 3EHSA 3OENA 3PMWA 1JW1A 5M2VA 1JETA 1IXCA 2O68A 3UGWA 4BDOA 4U2RA 1MQGA 1NNTA 1DOTA 4RNSA 4XXUA 5F7VA 4IO4A 5L9MA 2VD2A 3TODA 4P0GA 3H6VA 3G3FA 2AYSA 2PX1A 4H5GA 5TU0A 1MM7A 3LSFB 3SEWA 3T9VA 4PQJA 3E13X 3H06B 2YJPA 4QHQA 4G8MA 2H98A 3Q25A 1ZLQA 2GHAA 4YKKA 2F6GA 3U92A 5FTHA 1OIBA 3MP6A 1LB9A 2RCBA 2LAOA 1B0HA 3K4UA 3PD9A 3KG2A 4OXVA 4OTEA 1NNFA 4ELRA 5L8DA 5H8HB 4ZEBA 1NFTA 3Q28A 5CMKA 3C32A 1N7WA 3USDA 1UIUA 4GWOA 4U23A 2ZYOA 3VXBA 4E0XA 4YKIA 3T22A 2F7BA 4GRKA 1B5IA 3V5AA 3V89B 3RNNA 3SDFA 3WAFA 2G93A 2QPQA 1Y4TA 1EH3A 3TCFA 3JV9A 2DWJA 3MZ1A 3OEKA 2Y84A 4NWDA 3KJ7A 4DIGA 3T9XB 3LSLA 4N6PA 1PDAA 5HBCA 3TCHA 4OHNA 1I6QA 4Z7EA 1MG1A 4IO3A 3C9HA 1MXUA 3BFTA 3FJGA 4F19A 1A8EA 1ANFA 4LQ5A 3CFZA 4AB5A 2AIXA 4U1ZA 4DDDA 5I59A 1US5A 2Y7RA 4R9GA 1BLFA 1XC1A 3L6GA 1A40A 2KLFA 1MQJA 1B3LA 1P1WA 1GTKA 4IO7A 5KCJA 1CE2A 4OQOA 3ONMA 4I8CA 3TAJA 2ZNUA 1SW5A 2HQ0A 3UA8A 4F3GA 3OO6A 1MXZA 4R2BA 2I0BA 4FEDA 3H6UA 3TUSA 2QSXA 3PD8A 2UVHA 1SI1A 2VHAA 3MZBA 3N26A 3RN8A 3U8QA 4KR5A 5F1QA 3K2DA 4GXAA 3OMBA 1N04A 2FNCA 3U94A 3QXMA 4LONB 1MRPA 4PE5B 3M8UA 4ZE8A 5I2NB 5TPAA 5HPQA 4IO2A 2O6AA 4MBPA 1IZ1A 4OEVA 3S9NC 1J1NA 3N6TA 3CRBA 3RPWA 2NVUB 4F3SA 5KDTB 1N3XA 4XKRA 1UTHA 3OXNA 4POXA 4C1UA 1LAXA 2HZLA 1WDNA 3FVGA 4R6HA 4AB6A 4KFQA 2OCUA 4QSDA 4EF2A 2RINA 5CI5A 3KGCA 4G8NA 1PC3A 3KSXA 3IO4A 1B3GA 4M4GA 3Q29A 1WVJA 3TELA 1GVCA 1VE4A 4U21A 2RF1A 3VVFA 4QFNA 1MDQA 4R2FA 3FJ7A 3PV0E 3MVZA 5I58A 3IAZA 3O29A 1B4HA 3D4GA 4G68A 2ONKE 4H8JA 5ITPA 2GH9A 5EHSA 4M1VA 1XVYA 4X48A 4C0RA 3OSQA 4WEDA 2XXUA 4OERA 3TEPA 1Y1MA 1QW0A 2O84X 2F36A 4FECA 4NF8A 4Q8RA 1MH3A 1DSNA 1MDP1 3QUFA 2XX9A 3DP6A 2I58A 2ZYKA 1FTKA 1FTJA 3B6QA 2XD2A 1MY2A 3E4RA 1SW4A 2F35A 1XT8A 3ZKLA 5I2KB 3PU5A 1P1QA 3F11A 3G3HA 3RGYA 4GXSB 4E0WA 3PPRA 4I1DA 4OFLA 1HSEA 4RA1A 1I6BA 1JVYA 4O3CA 3KOSA 1B0LA 3MUQA 1F9BA 4UACA 2R6GE 4YB5A 2QS4A 1XS5A 2Z23A 5B7DA 5ICTA 4F1VA 3SESA 5JK4A 3G3GA 2X26A 3VV5A 3C33A 3IB2A 3EPEA 4ZE9A 2D3IA 4EQ9A 1MY1A 2Q2CA 4FJPA 1Q35A 1JNFA 4LVQA 2Q89A 4F3BA 1S50A 2Z22A 1Y3QA 4JB7A 3O6IA 3MP8A 1MPDA 4OESA 1MXYA 2CMOA 2HCAA 3C4MA 3IOWA 4QFLA 3I6VA 3FGSA 3TTNA 4F1UA 1A54A 5JEIA 2QS3A 2REGA 2XXRA 2VGQA 3TKDA 3O66A 3AXFA 2R9JA 1TT1A 4TOZA 2F6PA 1I69A 3W9WA 4IY5A 3VFJA 2OK2A 1AH5A 3U1OA 5ICQA 1NH7A 1Y4CA 2UVIA 1RYOA 4HCWA 4F22A 3K6UA 5BUUA 1ELJA 3QUJA 3Q26A 1URSA 2D21A 3DLNA 2I0CA 2OJTA 3B7DA 2Z8FA 4OFOA 2HZKA 1MQDA 1EZ9A 2M8CA 1VFDA 4YMBA 3IL1B 2ZYMA 1FQDA 1SBPA 3PUVE 5KZTA 4YICA 3SEVA 1KWHA 4GL8A 3LUYA 1FTLA 3MAMA 3FASA 1YPNA 2UXAA 3KOTA 4MLQA 3S2VA 4QFKA 3IOTA 1B3FA 1Z7NE 1H43A 2VP1A 4MLVA 1AMFA 4H67A 4OETA 3IJOB 5A5XB 2ZNSA 4O3BA 4GFRA 5IAIA 4ZDMA 5KCJB 2O69A 2XXPA 2GFEA 4ZZAA 4QSCA 3O6GA 1SD3A 4KQPA 4RY1A 3VLVA 4RPNA 5BWJA 3PPNA 1ZTYA 4OVJA 5H8NA 1ZU0A 4EXLA 4YAHX 1TWYA 1PBPA 3K1MA 1SDXA 3MQ9A 4LZ7A 5EHMA 2B3FA 3T93B 2DS9A 2RC7A 1AIVA 1URDA 4LZ5A 4JSDA 2QMWA 4ESWA 5TPAB 4OWDA 4NMYA 1H3DA 3QSLA 4QFPA 3S9LC 1US4A 5DVJA 3MVXA 4IO5A 1MY0A 4G68C 1FTMA 1UTHB 3M3FA 1A99A 1PB9A 1BTJA 4L17A 4YZZA 1LAHE 4N13A 1WODA 3A3UA 5I57A 3IJXB 2E1SA 1B52A 4BDMA 1NNKA 4X1DA 4HCYA 1FCKA 1B7ZA 4NE4A 1B40A 1DTZA 2I4CA 1VR5A 2DVCA 3VLUA 4MFIA 2ZMBA 3FV1A 4NF4A 2V93A 4H5FA 2E0SA 4H6DA 2O51A 1CB6A 4KCCA 3HPIA 4PFTA 4PFWA 1M5BA 1MQHA 3SERA 1LFHA 3FXQA 4RK9A 2V3UA 1IQ7A 1NKXA 3PUYE 3TTLA 1FQAA 3H6WA 2V25A 3ZSFA 3GLBA 4F2QA 2DXRA 5I56A 4KYEA 2F5XA 5JTYB 3MZ9A 3T9UA 1ZJLA 1JEUA 2YLNA 4NF8B 3DELB 4NF5A 4RK2A 4ECFA 4QRZA 3K00A 3K01A 4THIA 4GQOA 3O9PA 3K6VA 3PGFA 4YMAA 4ZS9A 2VD3A 3FXRA 3PPQA 2HXWA 2XXTA 3PMXA 2DOJA 2OBGA 3I5OA 4F31B 3S9MC 1QULA 1I6AA 2PT1A 2V84A 1IXGA 3FIRA 3HHGA 4LZ8A 1O64A 3BFUA 5AA3A 4GOTA 1QKAA 3RT6B 3VDFA 4ELPA 2CZLA 3TTMA 3ODBA 3S9EA 1FQBA 3ILTB 3GXAA 4KCDA 3FD3A 4HTGA 3PMVA 1POTA 3OD7A 1M5EA 4IGTA 3KBRA 2F8DA 2XXXA 2ZYNA 5H8HA 4NEDA 4OZ9A 5L9SA 4MF3A 2I3VA 3CVGA 3L6HA 4WKMA 1NL5A 1YTVA 5LOMA 1B46A 1T0KA 3EF7A 3FVKA 1R9QA 4DXCA 1LAGE 1EZOA 3T96B 1Y1ZA 3KN7A 4EQ7A 3U93A 2RKMA 1EU8A 1B32A 3TQWA 4RPOA 2HEUA 2Z8EA 4KYSA 4IO6A 4QSEA 2DE2A 1R6ZA 5TP9A 1MS7A 4QF9A 2XX7A 4F29A 3CI8A 2A5TA 3QYTA 4YKPA 3K6XA 1DMBA 1B7UA 4XIGQ 4GLIA 1B7HA 2DE3A 5I84A 4R74A 3OSRA 1N7XA 1YCJA 5DEXA 2UYFA 1B1XA 1FW0A 1R9LA 1A7LA 2P0SA 1OLCA 3IX1A 4HW8A 2GHBA 3TQLA 4I62A 3K0VA 5HM4B 4DLDA 5FHOA 3R7XA 2RC9A 5H8SA 1SVXB 2NUVA 2ONRA 4DXUA 1OVBA 4PETA 4JBZA 1B4ZA 4BDLA 2DXYA 1NNPA 3PUXE 4DZ1A 4EQBA 3W15C 5CMCA 3MPKA 3G3KA 3MJNA 1RYXA 1Y3PA 1IITA 2W7YA 4X1BA 3CR9A 3IB0A 3K1NA 4TLLB 4DCYA 4NTLA 3VXCA 3LC8A 2X7PA 5H8FA 4GD5A 1ZIUA 4R6YA 3T9HB 5CC2A 1AL3A 2I3WA 4EXKA 2ANJA 3LR1A 1IEJA 1B3HA 3VE1B 1B58A 5H8NB 1M5DA 1USYE 2XD3A 2UVGA 2H25A 4O3AA 2OLBA 2UVJA 3E3KA 3HHFA 1DTGA 3C31A 2O7IA 3RTWB 4G8HA 3R26A 1B9JA 2UYEA 1IXIA 2FA7A 2DWIA 5H8QA 3KJTA 1JEVA 1LFIA 5DVFA 3ECRA 1A55A 2DQVA 3A3CA 3KEIA 1UTBA 1MPBA 3CFXA 3PPOA 3VLWA 2I49A 3UK4A 2A5SA 4Q5TA 1VSOA 3O6HA 1PB7A 1SW2A 1D9VA 3GBBA 1N84A 1NMUA 3MWBA 4U4SA 2OWTA 5I57B 1Z7ME 3FJMA 2DWHA 5ELVA 4FIMA 2IEEA 2Q8JA 3R6UA 4OMBA 3TFLA 3EHTA 2R71A 3O28A 1N76A 3SEUA 1MM6A 1UQWA 2XX8A 3RY3A 2Q88A 4EF1A 3HO7A 4H8IA 4NF4B 1QUKA 2Q9TA 4WEPA 1VFEA 4DXBA 2AL5A 1B5JA 4KI0E 1OQGA 4LP2B 3N6UA 3ILUB 2DYXA 3RQTA 1QVSA 1LBCA 1PBQA 4DCXA 1BKAA 3VVDA 1MXWA 3KSJA 3OO8A 3E9XA 4JXIA 3HCQA 4XKQA 5I56B 5I59B 2YPNA 4ISUA 4G77A 1LAFE 4R9FA 4NF5B 2THIA 3THIA 3FVNA 2ALUA 4MH5A 3IOUA 2DVZA 5DYHA 5B70A 1BP5A 3CSGA 4H0WA 4KD5A 2X7QA 2BJJX 5L9OA 3P7IA 3FVOA 3PUWE 2DSFA 1FQEA 1LB8A 4P0IA 1ZMGA 5CMMA 1JW4A 2HAVA 4F18A 3HSTA 3O97A 1Q1KA 1URGA 1B6HA 1BIYA 4NF6A 1MH4A 4Z0IA 1LGBC 1P1OA 2F97A 3SKPA 2OZZA 4F1YA 1DPPA 5CBSA 1FTOA 3HV1A 3MVYA 2VOZA 1AOVA 3I3VA 1SI0A 1D4NA 5AA2A 2H5YA 3IB1A 3BBRA 1P1UA 1PB8A 3OO9A 3UP9A 3GZGA 1D3KA 1S9TA 2I6EA 4IGRA 2XXQA 3BKIB 1OVTA 4WXJA 1B1HA 4IY6A 2P1SA 4JWOA 1B5HA 3SEYA 4H65A 3MC2A 3RT8A 3RLFE 1LFGA 1P1NA 3IORA 4LATA 3EN3A 5AA4A 1O63A 3GBAA 4C1TA 3LSXA 1H45A 1QUIA 2F78A 1JQFA 4GF8A 4OEUA 2Z8DA 2PMSA 3KN3A 3FV2A 1B3EA 5I58B 1H44A 3HN0A 1TXFA 4G68B 5IKBA 1HSLA 1B51A 3JYRA 2XXWA 1OQHA 4QFOA 3A09A 3KZGA 3S4UA 4ELQA 2WKYA 5TP9B 1Y3NA 2Y7WA 3UORA 3H03A 1IUDA 2A5TB 3G3JA 3IK6B 4U4XA 3H6TA 2NXOA 2O1MA 5EYFA 3UN6A 2V3QA 2G29A 1GGGA 3B6WA 1RKMA 5DEXB 2OWSA 3QAXA 1M5FA 2F7CA 3V8XB 5FHMA 3G7WA 5A5XA 2O1LA 1S7YA 1XOCA 3V83A 3PPPA 4P11A 5AA2D 3N94A 4XKNA 4KPTA 3MP1A 5DTBA 2RCAA 1HSJA 1A8FA 1YAEA 1PEBA 2QRYA 4POWA 1LCTA 5ISUA 3KFMA 4ZZEA 3CSBA 4JWXA 1USYH 1MXXA 3C36A 4YB6A 1IIWA 3MW0A 4G2ZA 4Q30B 4AQ4A 4KHZE 5FHNA 1JW5A 1MPCA 3K02A 4K3FA 4I9DA 4U1OA 2Q2AA 1DPEA 3VVEA 4F39A 4TLMB 3RUMA 5CBRA 4ELOA 3DM0A 1N0TA 5K2XA 1SQYA 5H8FB 5J1DA 2ONSA 2PYYA 4FE8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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