2THIA

Thiaminase i from bacillus thiaminolyticus
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
ITLKVAIYPYVPDPARFQAAVLDQWQRQEPGVKLEFTDWDSYSADPPDDLDVFVLDSIFLSHFVDAGYLLPFGSQDIDQAEDVLPFALQGAKRNGEVYGLPQILCTNLLFYRKGDLKIGQVDNIYELYKKIGTSHSEQIPPPQNKGLLINMAGGTTKASMYLEALIDVTGQYTEYDLLPPLDPLNDKVIRGLRLLINMAGEKPSQYVPEDGDAYVRASWFAQGSGRAFIGYSESMMRMGDYAEQVRFKPISSSAGQDIPLFYSDVVSVNSKTAHPELAKKLANVMASADTVEQALRPQADGQYPQYLLPARHQVYEALMQDYPIYSELAQIVNKPSNRVFRLGPEVRTWLKDAKQVLPEALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thiaminase-I from Bacillus thiaminolyticus at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Paenibacillus thiaminolyticus
molecule keywords THIAMINASE I
total genus 115
structure length 362
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.2: Thiamine pyridinylase.
pdb deposition date 1998-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2thiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2thiA02
2HXWA 3U1OA 1MDP1 1O7TA 1PBQA 3TYHA 3MZ1A 2DSFA 2HQ0A 4R2BA 4ZE9A 4O3CA 2XXUA 4OYVA 3H6UA 3OO6A 1A55A 1O64A 1B05A 3FIRA 4Q5TA 3K6VA 3V89B 3UGWA 4OEVA 4ZE8A 3QSLA 1OIBA 2V93A 3R7XA 2HZLA 4EXKA 3BBRA 3G3IA 3T22A 4YKKA 3H6WA 5H8NB 3A3CA 1FTLA 3DELB 4EUOA 2DWJA 4ZZEA 2HAVA 1OLCA 2I48A 3RN8A 2O7UA 2IA4A 4U4SA 1FQEA 1JVXA 3CFLA 1OVBA 2XXTA 3IR1A 4ZS9A 1B3HA 3C32A 3K2DA 3MPKA 3Q25A 1MDQA 3KEIA 5TP9A 3V5AA 2XD2A 1NNTA 3KN8A 1MXZA 4OMBA 1OMPA 3KSXA 1B3LA 3IOWA 4QSDA 5I57B 1EZOA 4P0GA 1DPEA 2Q89A 2P1SA 4RY1A 3K00A 3IK6B 1I6QA 1WDNA 3VXBA 3Q27A 4POWA 4H8JA 4F3BA 4OEUA 5KZTA 1M5FA 2GH9A 1YCJA 1LAHE 3QAXA 4LZ7A 5ITOA 4OERA 4G4PA 4U1OA 3OSQA 2XXQA 3HHGA 4QF9A 3IO6A 3KZGA 1A8EA 4LP2B 2YPNA 3O29A 2RC9A 1B1XA 1Y1ZA 1XHYA 2RKMA 1GVCA 3PUXE 5H8FA 1QKAA 1ZBMA 3RGYA 1B7HA 3TQLA 2RF1A 1RYXA 4KPTA 1JVYA 4F39A 5DT6A 2X26A 3O2AA 1ELJA 1JW4A 4R72A 3PPOA 4DCXA 4HS7A 1AOVA 4NWCA 2A5TA 1P99A 4TLMB 1DSNA 2OK2A 2UYEA 2ZYKA 1IIWA 3THIA 2DXYA 2QS3A 4F2OA 5H8QA 1LAFE 3SDFA 1ZU0A 1ZJLA 2DOJA 1PEBA 5K2YA 2O51A 2RCAA 2Y7PA 3L6HA 3M3KA 3UP9A 1LAGE 4NF4A 3RTFB 3TQWA 1Q35A 4IO2A 1QUIA 4ONYA 3VVEA 4FJPA 4YAHX 4EXLA 4ZEBA 1N3XA 4HCWA 1QVSA 4GVOA 1LFIA 5BWJA 4MFIA 1H44A 1LFGA 4DXUA 4QSCA 3E9XA 3SKPA 1FQBA 2F8DA 4MLVA 3S9EA 4YMBA 5CRYA 4FECA 5JK4A 2YJPA 5L9OA 4OFOA 3T9XB 1VSOA 1B32A 3B6WA 3F11A 3PD8A 4IO6A 1TXFA 1Y3NA 4DE8A 1SW4A 4OFJA 4QFKA 1II5A 3O28A 4GQOA 1TFDA 1GR2A 2M8CA 3MVYA 5I2KB 4NTLA 3MZBA 2VGQA 2F34A 2NVUB 4U2RA 1N84A 3PPNA 3B6QA 3PMXA 1MPDA 3HPIA 3D4CA 3QIMA 1T0KA 1Y3QA 1JW5A 4RXLA 4YICA 3LSLA 3OELA 4QFLA 4KYSA 3FD3A 4ZEFA 3WAEA 1D9VA 2ESNA 3HV1A 3ILTB 1P1UA 2Q2CA 4PFWA 1AIVA 4FE8A 3TEPA 3TCGA 3LUYA 2HEUA 5FTHA 3TTMA 1N76A 3UIFA 2H99A 4IY6A 2F97A 2XXRA 4X1DA 4F31B 1FTKA 3E13X 5JTYA 1VE4A 3M8UA 5AA4A 3RTWB 1UTBA 2A5SA 1H76A 4BDRA 3MJNA 4NF8A 2XHDA 4KCCA 5KCJB 2RC7A 5AA3A 1JNFA 3LSXA 3JZJA 3TCHA 4ZEKA 4QSEA 2HCAA 2OJTA 3U92A 1OQHA 3T66A 1NKXA 4IO5A 4GIZA 2E1SA 1N7XA 1B40A 2XXIA 2O84X 2F6GA 3PUVE 1QULA 4H67A 4NF5A 1SBPA 1LCTA 3H4ZA 3K6XA 4GL8A 1GTKA 3A09A 1B4HA 3KN3A 4G68A 2QMWA 1MQGA 4ECFA 3JYRA 1VR5A 2ZNUA 2V3QA 2WKYA 2Y7IA 3G3KA 1Y4TA 3K1MA 2QRYA 4YZZA 5AA2D 4JB7A 3T9HB 4E0XA 4NEDA 4OFLA 1B5IA 1IXCA 3MVWA 1D3KA 4MF3A 2F5XA 2UVGA 4U21A 1EZ9A 3VV5A 1LBCA 3C9HA 1QUJA 2F7CA 5I59A 2ONKE 4KYDA 5CBRA 4LZ5A 1AMFA 1SYIA 4PFYA 3R6UA 4LATA 4RYAA 1O63A 4PFUA 1PBPA 1NMUA 3N6UA 1B1HA 3EHSA 3P7IA 3MZ9A 4JBZA 2H98A 2D5WA 3C31A 5H8HA 1A8FA 4U4XA 5CMCA 5KDTA 1M5CA 1USYE 4QHQA 2HAUA 4H8IA 2DE3A 4F3SA 4JSDA 4R6KA 3QUFA 4JXIA 1NNFA 3CSBA 5HBCA 3H03A 4OQOA 5TPAB 2VD3A 3T96B 4QFNA 4RK2A 3S9LC 1SQYA 2OWTA 4R73A 5ELVA 2VHAA 4R6YA 3SESA 4MLQA 1B51A 4OTEA 3C34A 5TP9B 3PV0E 3CR9A 2GFEA 2I0CA 2F78A 3CG1A 1USYH 5FHOA 2I0BA 1M5DA 3G3FA 1JEVA 1Y4CA 5FTIA 2OZZA 4FEBA 1B7ZA 3PMWA 4DLDA 4O3BA 2F7AA 4NF6B 2LAOA 3CI8A 2NOOA 3B7DA 2Z8DA 1XVYA 1B52A 1DMBA 4JWYA 3MC2A 3VLUA 5I56B 2FA7A 4TQUQ 3Q26A 2O69A 2AL5A 4POXA 1CE2A 2ZNSA 4YB5A 3MP6A 1ANFA 2ZXTA 4PP0A 5A5XB 3U93A 1R9QA 1H43A 4ZDMA 3O6HA 1P1WA 3IX1A 1IQ7A 4OETA 4ZECA 2QMXA 3IORA 1N7WA 2A5TB 1EZPA 1JW1A 2REGA 4R75A 2P0SA 3ECRA 4GRKA 4KYEA 2ZYMA 5ISUA 3KBRA 2I6EA 3FVOA 3Q28A 1BP5A 4R2FA 3G3JA 2Y7RA 1FQDA 3E4RA 2HZKA 4ND9A 4ELRA 4HW8A 3GZGA 1VFEA 4YB6A 2I49A 1Y3PA 2R6GE 3KJTA 5ICTA 2G29A 3MVXA 3VXCA 1F9BA 3PPPA 1I6BA 2AIXA 2QS2A 1DOTA 4IO4A 2F6PA 2X7PA 4F3GA 2ABHA 2Y84A 4G8MA 3FV2A 3IL1B 1LSTA 3OENA 1JQFA 1S50A 3GXAA 1N04A 2H4IA 3K01A 4U23A 3EN3A 4ELOA 3HHFA 5H8NA 3LBSA 2XXVA 4XKQA 4G68C 3OSRA 5I58A 1MXYA 1QW0A 3AXFA 3FATA 5HPQA 1MXWA 4YB7A 1UIUA 3GLBA 1AH5A 3EQ1A 2ONRA 4DIGA 5ICQA 4Q0CA 4ELPA 4F18A 4NE4A 3MW0A 1L5TA 3TAJA 5I57A 3FJMA 1SW5A 2QL3A 3ZKLA 2QJEA 2UVHA 4F29A 1SVXB 4I62A 1SD3A 1POY1 3IOVA 3T9VA 3CG3A 2IEEA 4Z7EA 4KD5A 3VFJA 2F35A 1Z7NE 3C35A 1FQFA 2Z8EA 3VVFA 5J1DA 4L17A 1SI1A 1TT1A 5DYHA 3E3KA 2GHAA 4KR5A 3I3VA 1QUKA 4YKPA 4IGTA 3U8QA 1UTBB 2DE2A 3MPLA 5CMKA 3ILUB 1PB9A 4H1XA 4NF8B 5EYFA 5DTBA 1B4ZA 5H8SA 4GLIA 2UVIA 2F7BA 3D4GA 4I8CA 1DTGA 1UIVA 2RCBA 2P2AA 4N07A 1LCFA 2G93A 1UTHB 3S9NC 5AA2B 3QK6A 2DVCA 3TMGA 2V25A 3RUMA 1MG1A 1URDA 3RT6B 5AA1A 2D3IA 4GWOA 4OHNA 2X7QA 3DP8A 1B46A 4LA9A 2D21A 1JETA 4BLAA 4UA8A 4NF5B 1QJMA 3W9VA 3PUZE 3K4UA 4BDOA 5IAIA 3O9PA 1NNKA 1URGA 4FORA 3K1PA 4G68B 3MWBA 2B3BA 3IB0A 1M5EA 2DS9A 2UYFA 4RA1A 4PQJA 4M4GA 3IB2A 1QKBA 1IZ1A 1WVJA 1BIYA 2PBWA 3KG2A 1PB8A 1HSEA 1DTZA 1KWHA 3N94A 3A3UA 5L9SA 2Q8JA 4YKJA 5CBSA 2DYXA 4GFRA 4UACA 1N0TA 3H3GA 4NMYA 1GV8A 3LSFB 3W9WA 5I2KA 3PMVA 1BTJA 4ESXA 4JSOA 2XX9A 4DDDA 1PC3A 1SYHA 5DEXB 1B7UA 3PPQA 1NFTA 1MY2A 3RQTA 1B2HA 2DE4A 2THIA 1A7LA 2XXXA 3V83A 1N3WA 5DVJA 1UQWA 2I3WA 3H06B 4F22A 3EPEA 4YU0A 2QS4A 1H45A 4K3FA 2Q2AA 2VP1A 1B0HA 3M3FA 3DLNA 1EH3A 1URSA 3OOAA 5CC2A 5IKBA 3TUSA 3KGCA 1IXIA 2OBGA 5I2NB 3K1NA 2YLNA 3HSTA 3EHTA 2ANJA 4R9FA 2PVUA 3VDFA 3FVKA 3VVDA 3ZSFA 1ZKBA 1MS7A 1FW0A 4R74A 4IGRA 4EDPA 1R1NA 1FTOA 2O1LA 4KI0E 1S9TA 3K6WA 2UXAA 1R6ZA 1OLAA 1D4NA 5HM4B 3RT8A 1AL3A 1A40A 2XD3A 3IAZA 3OXNA 3C4MA 3TTLA 2W7YA 2XXYA 3LSWA 3VLWA 2XXWA 3IOTA 3O97A 1Y9UA 1MH4A 1YAEA 4ESWA 4EQBA 4XKNA 1D9YA 2DWAA 1A54A 4KQPA 2V84A 3QXMA 4WKMA 1MRPA 1ZTYA 1M5BA 4LZ8A 1TFAA 4PFTA 1ZMGA 3EHUA 3OEKA 4Q30B 3B6TA 4BDQA 2I4CA 1MXVA 1H3DA 4TOZA 2ZNTA 2AL4A 3CRBA 3USDA 4QRZA 4WEDA 1MY0A 4NWDA 4H6DA 4U1ZA 2RC8A 2H25A 3FXQA 4BDNA 3H6TA 4IY5A 3OEMA 4DCYA 1YTVA 3BFTA 3JV9A 4LQ2A 3T93B 3FVGA 1B3FA 2QSXA 3LR1A 1MQIA 5AE4A 2H5YA 1EU8A 1LAXA 1MM7A 1POTA 1SW2A 4YMAA 2VOZA 2DQVA 4ELQA 5DVFA 3TCFA 1P1NA 3VE1B 4F1YA 1XVXA 4PE5B 1R9LA 3RLFE 1YPNA 4XKRA 4G8NA 3MP1A 1B6HA 4ZZAA 4XTCQ 4MBPA 5H8FB 3N26A 4PETA 3K02A 3OO9A 4WEPA 4F2QA 3RPWA 4ISUA 4DXCA 5TPAA 4E0WA 5BUUA 3K0VA 1CB6A 2PT2A 5I58B 1MH3A 1ZLQA 2B65A 2Z22A 3M3LA 1XC1A 4EF1A 3IOUA 4R6HA 4AB6A 1XT8A 3MBPA 2DP8A 1FCKA 5CMMA 5F1QA 5H8QB 4FEDA 4F1UA 3RY3A 3N6TA 2ONSA 3CIJA 4HCYA 4JDFA 4N13A 3H6VA 2Y7WA 4NF4B 3KOSA 3FUZA 3IJOB 4X1BA 1MXXA 2F36A 3OD7A 3ZKKA 5JEIA 2V3TA 4LVQA 1B9JA 3SEYA 4QFOA 4FATA 1FTJA 2DWIA 1NL5A 3ONMA 4WXJA 2O1MA 3ZS6A 4NF6A 3FV1A 3L6GA 1I69A 5F7VA 2H9BA 2PYYA 1RYOA 3QYTA 2XXPA 5FHMA 4RJZA 2XX7A 1LB9A 2Z23A 1GGGA 5I56A 5LOMA 4KCDA 3CFXA 2V3UA 1LGBC 3FJGA 3TKDA 5A5XA 4G77A 4OENA 4F3PA 1XOCA 3OO8A 4KFQA 2OLBA 3T9UA 3OO7A 3TDJA 3IB1A 1LFHA 2CMOA 1HSLA 2FYIA 1RKMA 1XS5A 4ZEIA 3S2VA 4XIGQ 3DP6A 3FGSA 3UORA 3UA8A 1B3GA 4THIA 4U22A 4FAJA 3LC8A 3MUQA 2DWHA 4YKIA 4G2ZA 3H7MA 3S4UA 2I4BA 2AYSA 4C1TA 3ODBA 2BJJX 1FTMA 3FVNA 3TELA 4GXSB 5ITPA 4C0RA 3PUWE 3G7WA 3V8XB 3IO4A 4KHZE 2R71A 4RPOA 1MM6A 1IEJA 2I58A 5FHNA 4RNSA 3CSGA 3PUYE 4JWXA 3U94A 4P11A 1SW1A 2OCUA 2CZLA 5JTYB 1B5JA 2QPQA 3I5OA 5AA4B 2R9JA 2PX1A 3SEVA 4IB2A 1Z7ME 2GHBA 5TU0A 1DPPA 3FASA 4QFPA 3SETA 3FJ7A 5DVIA 1NH7A 3IJXB 1S7YA 3C36A 4OXVA 3SEUA 2O7IA 3TODA 3HO7A 1MY4A 3EF7A 3GBAA 4RPNA 4OVJA 3MQ9A 4GOTA 1ZIUA 4LUBA 1MQDA 3TTRA 1MY3A 2XXHA 3KN7A 2PT1A 1MQHA 4GXAA 4X9TA 2FNCA 1VFDA 5I84A 1MY1A 1B5HA 2Y7KA 4BDMA 2O6AA 4R9GA 1US4A 4H5GA 1LLSA 1LB8A 3QUJA 3BKIB 4H5FA 1PDAA 2ALUA 3U72A 5M2VA 4C1UA 2RINA 3PPRA 3KFMA 2Z8FA 3UK4A 3DP4A 5EHSA 4F1VA 3S9MC 4OESA 1P1OA 3MAMA 4AQ4A 2XX8A 1SI0A 3KJ7A 5L9MA 5I59B 1IUDA 1OQGA 1HSJA 2NXOA 1UTHA 3O6IA 2E0SA 4F19A 5AA2A 3MP8A 4OZ9A 1B3EA 3W15C 1SDXA 3CVGA 4XKPA 3VLVA 2B3FA 1WODA 3I6VA 2Q9TA 3KOTA 1Q1KA 3UN6A 5H8HB 5KDTB 2VD2A 1IITA 4IO3A 3TTNA 1OVTA 3C33A 1PB7A 2KLFA 1MXUA 4N6PA 4P0IA 3SEWA 3FZVA 4DZ1A 2DXRA 4GF8A 4EQ7A 5CMBA 2GRVA 3PD9A 4ZEDA 3MVZA 4AB5A 3HN0A 3RNNA 5K2XA 3FXRA 3Q29A 2QS1A 2UVJA 3O66A 1FQCA 5KCJA 3PU5A 4BDLA 4RK9A 3CFZA 1A99A 1MPBA 3TZAA 5EHMA 1ATGA 1BLFA 1MPCA 3G3GA 3N5LA 1MQJA 4TLLB 2REJA 3WAFA 3TPAA 4LQ5A 2HFBA 3OMBA 4MH5A 3SEXA 4HTGA 4X48A 3GBBA 1NNPA 1Y1MA 4Z0IA 4DXBA 1BKAA 5DEXA 4I1DA 1Y20A 4FIMA 1J1NA 1IXHA 3BFUA 4H0WA 4OWDA 4GL0A 2ZYOA 1JEUA 2I3VA 4Q8RA 3PGFA 4GD5A 3R26A 2ZYNA 1P1QA 4LONB 4G8HA 5L8DA 2NWJA 4O3AA 3G3HA 5B7DA 1IXGA 3O6GA 1LBBA 4JWOA 2OWSA 2NUVA 4IO7A 1NH8A 4I9DA 5I2NA 2ZMBA 5CM6A 2PMSA 2DVZA 3KSJA 4M1VA 5B70A 1TWYA 1US5A 3TTKA 3DM0A 3FXUA 1B58A 3HCQA 3TFLA 5CI5A 3SERA 4XXUA 2Q88A 1I6AA 3K6UA 4EQ9A 1B0LA 4H65A 1FQAA 2O68A 4EF2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PFIA 2HXWA 3U1OA 1MDP1 1O7TA 1PBQA 3TYHA 4OVQA 3MZ1A 2DSFA 2HQ0A 3GYYA 4R2BA 3IFAA 4ZE9A 4O3CA 2XXUA 4OYVA 3H6UA 3OO6A 1A55A 1O64A 1B05A 3FIRA 4Q5TA 3K6VA 3V89B 3UGWA 1KA0A 4OEVA 2XWVA 4N4UA 4ZE8A 3QSLA 2FVZA 1OIBA 3BIGA 2V93A 3R7XA 2HZLA 4EXKA 3BBRA 3G3IA 4HE1A 3T22A 4YKKA 3H6WA 5H8NB 3A3CA 1FTLA 4GWZA 3DELB 4EUOA 2DWJA 5ET8A 4ZZEA 4PAIA 2HAVA 1OLCA 2I48A 3RN8A 4NQ8A 4N81A 2O7UA 2IA4A 4U4SA 1FQEA 1JVXA 3CFLA 1OVBA 4OA4A 2XXTA 3IR1A 4ZS9A 1B3HA 3C32A 3K2DA 3MPKA 3Q25A 1MDQA 3KEIA 5TP9A 3V5AA 2XD2A 1NNTA 3KN8A 3RPLB 1MXZA 4OMBA 1OMPA 3KSXA 1B3LA 2XWOA 1NV1A 3IOWA 4QSDA 5I57B 1EZOA 4P0GA 1DPEA 2Q89A 4MMPA 2P1SA 4RY1A 3K00A 3IK6B 1I6QA 1WDNA 3VXBA 3Q27A 4POWA 4H8JA 4F3BA 4OEUA 5KZTA 1M5FA 2GH9A 1YCJA 1LAHE 3QAXA 4H45A 4LZ7A 5ITOA 4OERA 4G4PA 1FBHA 1D9QA 4U1OA 3OSQA 2XXQA 2ZZWA 3HHGA 4OVSA 4QF9A 3IO6A 1IMDA 3KZGA 1LBVA 1A8EA 4LP2B 2YPNA 4FBPA 3O29A 2RC9A 4GWSA 1B1XA 1Y1ZA 1XHYA 2RKMA 1GVCA 3PUXE 5H8FA 1QKAA 1ZBMA 3RGYA 1B7HA 3TQLA 2RF1A 1RYXA 4KPTA 1JVYA 4XEQA 4F39A 3O2AA 2X26A 5DT6A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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