2V3TA

Structure of the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor-like glurdelta2 in the apo form
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
262
structure length
244
Chain Sequence
GVVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPSMYSQMWRMINNNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWPKNGQC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Receptor
source organism Rattus norvegicus
publication title Ionotropic Glutamate-Like Receptor {Delta}2 Binds D-Serine and Glycine.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR DELTA-2 SUBUNIT SYNONYM GLURDELTA2, GLUR
total genus 65
structure length 244
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA02
1S50A 3WAEA 1II5A 1ZTYA 4KYSA 5TP9A 5JEIA 4ESXA 4IO5A 2OBGA 4KCDA 2FA7A 2PVUA 4LATA 2QS1A 1LAXA 1Y20A 2ZNTA 2Z23A 5I56A 1FTOA 4DE8A 1B4HA 4NF4B 3KOSA 1B51A 2F8DA 3M3LA 4ZZEA 3KFMA 2QJEA 4JDFA 4ECFA 5L9MA 3PPQA 4ZEDA 1B32A 5F7VA 2HAVA 1MM6A 5JTYB 5AA3A 1Q1KA 4QHQA 4BDLA 1URSA 5KDTA 1DPPA 2R6GE 3K6UA 3OD7A 3T9XB 1POY1 5H8FB 1B1XA 1JNFA 4OMBA 3Q25A 1QW0A 2VD2A 4R2BA 4X1DA 2Y7RA 2O1LA 4MF3A 1NFTA 1MXUA 3K2DA 1OQHA 3TPAA 4IO2A 3S9LC 4PQJA 3H4ZA 3R6UA 3IB0A 1VFDA 5EYFA 2F5XA 3HV1A 1MXWA 2H98A 1JEUA 1UTBB 3IJOB 1TT1A 2F6GA 2RINA 4EQ9A 1FQBA 3JYRA 3D4CA 3F11A 4G77A 4H1XA 2OCUA 1NNFA 4RNSA 3V5AA 3DP8A 3FJ7A 2WKYA 1DTZA 4GL8A 1JETA 2GRVA 3K1NA 3OO6A 4NF6B 3Q27A 3S9NC 3CG1A 2Y7PA 3RLFE 3K1PA 4OENA 3PMWA 5KZTA 1BP5A 4C1UA 4G8HA 4R6KA 3OMBA 1O7TA 3QIMA 1FTKA 5CRYA 5TPAA 3FZVA 3ODBA 5KCJB 4RPNA 1H76A 3QK6A 1F9BA 1TFDA 2VP1A 1QUIA 3MPKA 3UIFA 2RCBA 3OOAA 1QULA 1VR5A 3BFUA 1UTHA 3WAFA 2I48A 3TODA 2F97A 4F39A 4F3SA 1B4ZA 1NNKA 3IOWA 3T66A 2OJTA 4LP2B 3KN7A 4U4SA 1EH3A 3U8QA 2PBWA 5H8NA 2QSXA 5CMMA 4LQ5A 3FXRA 1A55A 2RCAA 4YB7A 3GBAA 3PU5A 3S4UA 5B7DA 4FIMA 1MXZA 3HCQA 2XXTA 3KBRA 2Z8DA 5EHMA 2O7UA 4IO4A 1IXGA 1D9YA 2XXVA 4GL0A 3TFLA 5AA2B 3N6TA 3IB1A 4QRZA 1FQEA 3TCGA 3UN6A 5HPQA 1VE4A 2RC7A 4IO3A 1S7YA 2YJPA 4F3BA 1MQJA 4O3CA 4F1UA 3CRBA 2O84X 3O6GA 3LSWA 4HCYA 4ZZAA 1FQCA 2DE3A 3QAXA 2AL4A 5I84A 4R74A 4GWOA 3OSQA 4IO6A 1AH5A 3R26A 3MZBA 3G3GA 4U21A 4GFRA 1IZ1A 4ZS9A 4EQ7A 3OEKA 4GD5A 1R1NA 2E0SA 4Q0CA 2O69A 1BIYA 4ZEIA 4OETA 3FVOA 2P1SA 4BDQA 4ZE9A 5AA4B 1P1QA 3GLBA 1WVJA 1QUKA 3UORA 4XXUA 2VOZA 3FUZA 2F7AA 3I3VA 2G93A 1EZPA 1PB8A 4TLMB 3TTRA 2V3UA 5CMCA 1LAGE 1ZMGA 4XKPA 3O29A 1AL3A 4PP0A 2HQ0A 3TYHA 3K6XA 3HPIA 3HHFA 5DYHA 3T93B 3THIA 2I58A 3MBPA 2G29A 3MVYA 3BFTA 3VV5A 1D3KA 5FHNA 3RPWA 3P7IA 1B5JA 4BDRA 5H8HB 4RYAA 4ELOA 5H8QB 4FATA 4OQOA 4G8NA 1Y1ZA 3C33A 5ITPA 3K6VA 5A5XB 4XKRA 1CB6A 1QUJA 3V89B 2Y84A 5CBRA 4N13A 4MBPA 4LA9A 3H6UA 4IY6A 3E4RA 3N6UA 2I3VA 2ESNA 2GHBA 4EF2A 2HXWA 4QFOA 3IOVA 1Y1MA 4P0GA 4I1DA 2A5SA 1SW4A 1B58A 2XXRA 4IO7A 4ZEKA 4F1VA 3VE1B 1DOTA 4NF5B 4ZECA 2GHAA 3TZAA 1ZIUA 4X1BA 1M5BA 3TKDA 2O68A 2F35A 2GH9A 1R9LA 4H8IA 1ZLQA 4BDNA 5F1QA 2FYIA 2XXPA 5HBCA 5CM6A 3PPNA 2ZMBA 1GTKA 3VXBA 5AA2D 5I58A 2REGA 3MP6A 3CI8A 1MRPA 3EHTA 1MDQA 3BKIB 3K4UA 5I59A 2F6PA 3H6TA 3SERA 4F1YA 2DYXA 2RC9A 2A5TA 4DXUA 1OIBA 3KJ7A 4LUBA 3KG2A 1PBQA 4O3BA 4E0XA 3Q28A 3IR1A 3LUYA 5DVIA 3SEYA 4C0RA 4WEPA 2V93A 1IIWA 2YLNA 4FORA 2FNCA 3PUWE 4KD5A 3C36A 1N04A 1EU8A 2H9BA 5CMBA 1NKXA 5TP9B 3K0VA 3RY3A 3VFJA 2XD3A 3O6IA 3MP1A 2NWJA 2BJJX 2O1MA 1OLAA 3HHGA 1SQYA 4JWYA 1LAFE 1JW1A 4KYDA 5I56B 4G2ZA 4L17A 3ZKLA 2Y7IA 4OFLA 3VLWA 1XC1A 2UYEA 1SW2A 3IOTA 4YZZA 5B70A 1B7HA 1WODA 4X48A 1N3WA 3I5OA 3T9HB 5KDTB 2Q2CA 1PB9A 3LC8A 1ANFA 3PUVE 3TTMA 1LFGA 1MG1A 1URDA 4QFPA 3FVNA 1LFIA 2V25A 1GVCA 2I49A 1A8FA 2PT2A 4RY1A 3EHSA 3VVFA 3M3KA 4R9GA 1XOCA 3MZ1A 4G4PA 4LZ5A 4OVJA 3C9HA 1FW0A 1R6ZA 4U1OA 2Q2AA 1J1NA 4JWOA 1BTJA 2QRYA 2E1SA 3O9PA 2F7CA 1SD3A 1QVSA 5H8FA 2B3FA 2O6AA 4U22A 3PPPA 4Z0IA 1P1OA 1IXIA 3TCHA 4TOZA 2O51A 5FTIA 4ELQA 4JBZA 1FQAA 1FTJA 1AMFA 3OXNA 4ZE8A 2OWSA 1H43A 3T96B 1QKAA 4FJPA 1US4A 4TQUQ 1HSJA 1B7UA 3PUZE 3OO9A 2XXIA 3SKPA 3ILUB 1NL5A 4G8MA 2Q8JA 1LAHE 5ISUA 1LLSA 4R75A 1PEBA 1ZKBA 1A40A 1IXHA 1MY4A 2DVZA 2HCAA 5TPAB 3MVZA 1EZ9A 1Y3QA 4EXLA 1DMBA 3C31A 4OTEA 1LCFA 3UK4A 5DVJA 1N3XA 5I2KA 3CIJA 3MWBA 2I0BA 4ZEBA 2QMXA 4LQ2A 2NVUB 4H65A 4GF8A 1YAEA 4OEVA 3FVKA 4H6DA 3RN8A 1MXXA 4OYVA 3MP8A 4EUOA 3MVXA 2R9JA 4RK2A 2DWIA 3TEPA 4IB2A 3W9VA 4F19A 1YTVA 5HM4B 1SDXA 4OEUA 4KR5A 1PBPA 1CE2A 2UXAA 3MC2A 2RKMA 4KQPA 3MQ9A 1B9JA 3G7WA 3CFZA 5DEXA 4BDMA 1QJMA 4IY5A 5H8NB 3SEUA 1VFEA 1H44A 5DT6A 4KCCA 1I6BA 4QFNA 2Z22A 3JV9A 4BDOA 2Q88A 2HZKA 4ONYA 4PFYA 1NH8A 3VXCA 1A7LA 1ZU0A 4IGRA 4KFQA 1LB9A 4AB5A 1YCJA 3TELA 1Y3PA 2PMSA 1MXYA 1H45A 3MZ9A 2XX9A 3PPRA 1B5HA 4Q5TA 4KPTA 2HZLA 4P11A 3IB2A 4YICA 1PB7A 1JW4A 3K01A 5CI5A 4DIGA 1LCTA 3N5LA 3K1MA 1B46A 2DWJA 4F18A 1FCKA 3B6QA 2VGQA 1URGA 1D9VA 1M5EA 4OERA 5AA2A 1JVXA 2P0SA 1SI1A 1ZJLA 3KEIA 1EZOA 4LZ7A 4DLDA 1IEJA 1JEVA 3ECRA 1NH7A 4QFKA 1NNTA 2Q9TA 2IA4A 1N7WA 1LGBC 3IL1B 1AIVA 2D5WA 1SVXB 4OWDA 3U94A 3Q26A 4FAJA 4EF1A 3EHUA 3ZKKA 3DLNA 3RQTA 2UVGA 2XX7A 4YKIA 5DTBA 2P2AA 4ESWA 3OSRA 3CG3A 3LR1A 1Y9UA 2DXYA 3SEVA 2UVHA 3KN3A 2ZXTA 1XVXA 3QYTA 5LOMA 2AIXA 3TUSA 1MY0A 1L5TA 3FXUA 3PD8A 3UGWA 3FV2A 2UYFA 2YPNA 2F36A 5I57A 2OLBA 2XXYA 4EQBA 3SEWA 1PDAA 4YMAA 3RNNA 3FV1A 1MY3A 1MH3A 3B6TA 1TFAA 3VVDA 1M5FA 3O6HA 4POWA 4EDPA 1JVYA 5I2NA 3K00A 4KHZE 3S2VA 1LB8A 1OLCA 5FTHA 3U72A 1GR2A 4HW8A 3IO6A 1H3DA 4N6PA 5L9OA 1TXFA 1NMUA 2O7IA 3A09A 4ELPA 4YB6A 3ONMA 1POTA 3PD9A 1D4NA 2ZNUA 5L8DA 2NXOA 5A5XA 4HS7A 4LVQA 1B2HA 4K3FA 2DWHA 3KN8A 3PUXE 2H5YA 4GXAA 1BKAA 3TAJA 1SYHA 5IAIA 4GQOA 4FE8A 1XS5A 3IX1A 1MQHA 1SI0A 4FEDA 2CMOA 2KLFA 1SYIA 5I58B 4YKJA 3UA8A 2B3BA 4GRKA 3LBSA 3PV0E 2M8CA 3DELB 1B52A 2PYYA 1I6AA 1A54A 2I6EA 1MPBA 5I59B 3TCFA 3TMGA 1LSTA 4NF8A 1B1HA 4YKKA 3MAMA 1FTMA 3H3GA 4QF9A 3SESA 1A99A 2A5TB 4RJZA 3G3HA 3D4GA 4OFOA 4WXJA 3B6WA 2XHDA 2QS4A 4DXCA 4THIA 3H03A 1B3FA 3CR9A 3OENA 3IOUA 4QSCA 3K6WA 3H6WA 4UA8A 3TQLA 4LONB 3V8XB 4DCXA 5FHOA 3VLUA 4E0WA 3TTKA 2X7QA 1I69A 3VDFA 2Q89A 1P1NA 1MPDA 4FECA 2H4IA 3O66A 2XXXA 4RK9A 2NOOA 1MY1A 2ZYKA 4C1TA 4QFLA 1OQGA 4XTCQ 3EN3A 1IXCA 3PMVA 1OVBA 4G68A 1Z7NE 3G3IA 1M5CA 1FQDA 2OZZA 2REJA 3FGSA 3B7DA 2DS9A 3PPOA 3PUYE 1FQFA 1B0LA 4F3PA 1BLFA 3A3CA 4G68C 2HAUA 1B3EA 2DWAA 4GVOA 5BWJA 3EPEA 3RTFB 4R9FA 4QSDA 1UQWA 1N0TA 1O64A 4H5FA 1NNPA 3FD3A 3OELA 3CVGA 4POXA 4RPOA 4RA1A 2Z8EA 4P0IA 4NF4A 2I0CA 3CSGA 3W15C 2F34A 4RXLA 3FIRA 1LBCA 4OHNA 3G3KA 2ONSA 1MQDA 3RGYA 1Y3NA 2ONKE 2QL3A 4R6YA 5JTYA 4I8CA 1Y4CA 3ZS6A 3KSXA 3E3KA 4R2FA 4F2OA 4F29A 5M2VA 4I9DA 2QMWA 5ITOA 5ICQA 1JW5A 2DQVA 3MPLA 2H99A 3C34A 3U1OA 5K2YA 2V3QA 3U92A 3GBBA 4JB7A 4LZ8A 5FHMA 1Z7ME 1P1UA 3O97A 1US5A 1OVTA 3LSFB 1B6HA 1IUDA 3KGCA 4OXVA 3QUJA 5ICTA 3O28A 2XD2A 4H0WA 4NMYA 3CFLA 1UTBA 1B7ZA 3KOTA 1MPCA 1DPEA 3MJNA 2I4BA 3DM0A 3T9UA 3TTNA 3PGFA 1N76A 3CSBA 4JSOA 4YAHX 5I2KB 3OO8A 2GFEA 3S9MC 3L6HA 2DSFA 4ISUA 1XVYA 4ZEFA 4WEDA 4NF6A 4R73A 4FEBA 1MQIA 2OK2A 4YKPA 1UTHB 3N94A 1LBBA 3RT8A 3MVWA 2THIA 3C35A 3K02A 4U1ZA 3OEMA 2I4CA 4I62A 3G3FA 1MXVA 3Q29A 2DE2A 4Z7EA 5KCJA 4N07A 5DEXB 4F3GA 1MH4A 1N7XA 3JZJA 4AB6A 3W9WA 3V83A 1PC3A 2AL5A 3DP6A 4U4XA 1N84A 2NUVA 1RYXA 3IK6B 1Q35A 4GLIA 3FXQA 4Q8RA 3RT6B 1M5DA 4F22A 2QS3A 3E9XA 4O3AA 2PT1A 2ABHA 1YPNA 2ZYMA 4JXIA 4MLVA 1MQGA 3USDA 3BBRA 3T9VA 3TDJA 4H8JA 4WKMA 5L9SA 3H6VA 1USYH 1B40A 2X26A 1O63A 3SEXA 3I6VA 4DCYA 4NTLA 2V84A 2RC8A 1UIVA 4AQ4A 5DVFA 3FVGA 3RUMA 3O2AA 2I3WA 2RF1A 5ELVA 1RKMA 1DTGA 5CC2A 2QPQA 4F2QA 4DZ1A 1R9QA 5K2XA 3LSXA 2HEUA 3H7MA 4KI0E 5H8SA 3S9EA 5IKBA 5JK4A 4BLAA 1OMPA 4XIGQ 1VSOA 2DE4A 3SDFA 4ZDMA 1IITA 2LAOA 1WDNA 3IJXB 4R72A 2DP8A 3L6GA 5J1DA 2B65A 4R6HA 2DVCA 4PFWA 1JQFA 2CZLA 1SBPA 1KWHA 4PFTA 3OO7A 3DP4A 3M3FA 2UVJA 3FJMA 5EHSA 3TQWA 4PETA 2W7YA 3AXFA 2ZYNA 1B3LA 4EXKA 3IO4A 4NE4A 3GZGA 3N26A 4H5GA 4OZ9A 1MDP1 2IEEA 3HN0A 3VVEA 3R7XA 3G3JA 4U2RA 5BUUA 4DXBA 1ELJA 1MS7A 3KSJA 4TLLB 4ELRA 4JWXA 2R71A 1HSEA 2F7BA 5I57B 5AA4A 4M1VA 1P1WA 1RYOA 4Q30B 1S9TA 2UVIA 1ZBMA 3RTWB 2XX8A 3EF7A 3UP9A 3MUQA 4U23A 4PE5B 3A3UA 5CBSA 2ONRA 5I2NB 1XHYA 2ANJA 1AOVA 1B05A 1P99A 1QKBA 2QS2A 2ALUA 3FATA 1B0HA 5AE4A 5TU0A 1I6QA 2XXWA 4HTGA 4YU0A 4M4GA 1SW1A 1LFHA 3QXMA 3ZSFA 5H8HA 4QSEA 3C32A 5H8QA 1B5IA 2DOJA 3EQ1A 1T0KA 3FJGA 1GGGA 2D3IA 2VHAA 4XKNA 1MY2A 4ND9A 2ZYOA 3C4MA 2F78A 4HCWA 3GXAA 3H06B 3QSLA 3U93A 3MW0A 3M8UA 4IGTA 1IQ7A 3IORA 4H67A 3CFXA 2XXUA 2AYSA 2PX1A 3FASA 4NWDA 2ZNSA 4NF5A 4F31B 3VLVA 4NF8B 3KZGA 3QUFA 2VD3A 1B3GA 2Z8FA 4NWCA 3IAZA 1UIUA 4PFUA 4UACA 1TWYA 4OESA 1B3HA 3SETA 3T22A 2X7PA 2D21A 1GV8A 3KJTA 4MH5A 4GIZA 4NEDA 4MLQA 1HSLA 3E13X 4X9TA 3HSTA 4YB5A 1A8EA 5CMKA 2Y7KA 4DDDA 3HO7A 1DSNA 4JSDA 1USYE 4XKQA 2H25A 2DXRA 4GXSB 2XXHA 1FTLA 3LSLA 3TTLA 4YMBA 4MFIA 1XT8A 4G68B 1MM7A 3PMXA 5AA1A 1SW5A 4OFJA 4KYEA 2V3TA 4GOTA 1Y4TA 2HFBA 2OWTA 2Y7WA 3ILTB 1ATGA 2XXQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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