2V3TA

Structure of the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor-like glurdelta2 in the apo form
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
262
structure length
244
Chain Sequence
GVVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPSMYSQMWRMINNNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWPKNGQC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ionotropic Glutamate-Like Receptor {Delta}2 Binds D-Serine and Glycine.
pubmed doi rcsb
molecule tags Receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR DELTA-2 SUBUNIT SYNONYM GLURDELTA2, GLUR
total genus 65
structure length 244
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA02
5JEIA 1MPCA 1FQDA 2PYYA 2F97A 4LUBA 3TPAA 3FJMA 4BDQA 3P7IA 1DMBA 4ZECA 1SQYA 4YKKA 2UYFA 1ZMGA 2RKMA 1GGGA 5H8QB 4PQJA 2W7YA 3M3LA 2XX7A 3VLWA 2FYIA 2GFEA 3U94A 5CMMA 3TYHA 1Y1ZA 3VLVA 2REGA 3C9HA 4LZ5A 4NF5B 4QSEA 5FHMA 3C4MA 3A3CA 3BKIB 4I9DA 4HW8A 1OLCA 2O7IA 1MS7A 3H6VA 3MVXA 3KG2A 3H3GA 5I59A 1B1XA 1UTBB 1BP5A 2HQ0A 3GZGA 1IIWA 3O9PA 4F3BA 5CI5A 4GFRA 5TU0A 1B51A 4NF4B 4OFOA 5CMBA 4OEUA 1R9LA 4ZZEA 4OFLA 4KPTA 2VHAA 4G8MA 2O68A 1ZIUA 4RPOA 1P99A 3VVFA 4R6YA 3D4GA 5I84A 3OEKA 5KCJA 1A7LA 4KD5A 1XVYA 4F1YA 2V3UA 3FVNA 1M5CA 1N04A 3T22A 3CFXA 2ZYOA 5AE4A 3FD3A 1LGBC 3H4ZA 3M3FA 3G7WA 1Q35A 4HTGA 3VVDA 2UVJA 3IOTA 4EQ7A 2AYSA 1Y4TA 4PFYA 1US4A 2XXXA 4X9TA 4DLDA 3Q28A 1Z7NE 3SETA 4FEDA 3E3KA 4R72A 1LAFE 3L6HA 1R1NA 4PFTA 1P1OA 3T96B 3TUSA 5EYFA 3RGYA 2BJJX 3LUYA 4FAJA 3ZS6A 3OXNA 4U1OA 1VE4A 2QSXA 1A54A 4AQ4A 4GVOA 4QFOA 3H06B 2OCUA 2IEEA 3CSGA 1D9YA 1FTLA 3IO6A 3Q26A 1Y3NA 3GXAA 4IO6A 1TT1A 5CRYA 4WKMA 3QIMA 4RNSA 3QSLA 2XXIA 2XX9A 3LSWA 2XXYA 4O3BA 3V5AA 1O64A 2HCAA 3PMXA 1MQHA 2QMWA 4RXLA 3K6UA 3OELA 3U93A 4H8JA 4MLVA 4OXVA 3FJGA 2DE4A 5TPAB 2VD3A 1UTHB 1VSOA 4EQBA 3R7XA 1MPBA 2R71A 4P11A 3EPEA 5ITPA 4Q5TA 4F3SA 1MXZA 3D4CA 4XKRA 5TP9B 4R9GA 2O51A 2I58A 1URGA 4P0GA 5CMCA 3MQ9A 5AA4A 3PGFA 4YAHX 3SEUA 3SESA 4GL0A 3TQLA 4KHZE 2XD3A 1Y20A 2Z22A 1H44A 3KN7A 4U4XA 4ZEIA 2Y7WA 4GXAA 5IAIA 3C34A 1OQGA 4Q8RA 3FVGA 1IQ7A 3SEWA 2DOJA 2P2AA 2F35A 3MBPA 3VXCA 1UQWA 1FTOA 4HCWA 4GQOA 3MP1A 4ZEDA 2H98A 5K2YA 1USYE 4U1ZA 1IXCA 3KN3A 5I58B 3UK4A 4O3CA 4ONYA 1CB6A 2Q9TA 5H8NA 3GBAA 2I3WA 4DCYA 1FW0A 4OFJA 2I6EA 4LATA 4YICA 4YKIA 4QRZA 5IKBA 4EF1A 3ILTB 1N76A 2I48A 3QUJA 5HM4B 2Q89A 3PPQA 1QKBA 5CBSA 3CR9A 4ZS9A 2F6PA 3TDJA 4UA8A 1SYIA 1SW2A 1N0TA 2F6GA 2ONSA 1MXWA 5I57A 3PD9A 2ZYNA 4NE4A 4RPNA 2DVCA 4N6PA 4TOZA 4IGRA 5ELVA 4FIMA 4MLQA 2NXOA 1H3DA 2H4IA 1O63A 2F8DA 1BKAA 3OMBA 4ELPA 2FA7A 2RF1A 3MPLA 3QAXA 3N5LA 2M8CA 4TQUQ 3FV1A 3CFZA 1QULA 1M5BA 5I2KB 2AL4A 2DWHA 1URDA 1AOVA 1OIBA 4NF6B 4ZE8A 2LAOA 3IO4A 2P0SA 3TCGA 1VFDA 4KCDA 1ZU0A 5DVJA 3MVYA 5ISUA 3HPIA 3KN8A 3KZGA 1Z7ME 3OD7A 4C1TA 3KJ7A 3CVGA 3PV0E 3PPPA 1XVXA 3E4RA 1NKXA 5JTYB 3LSXA 1MY3A 3G3HA 4Z7EA 2ZYMA 2ZMBA 5DYHA 5DT6A 4YB7A 4MFIA 2THIA 1JEUA 3RNNA 3TZAA 5CM6A 1DTZA 4KQPA 4N13A 4THIA 2PVUA 1POY1 4RK2A 5FTIA 1P1UA 4G8HA 4F22A 3V8XB 1ZTYA 3K6WA 3UN6A 1FCKA 4R75A 2Q88A 3SERA 3TODA 4BDRA 2RCAA 4E0WA 5ICQA 3KEIA 1D3KA 3RPWA 3B7DA 2V3QA 3MWBA 3THIA 3RQTA 2VGQA 4K3FA 3CG1A 5FHOA 3H03A 1B52A 2RC7A 4G8NA 4HCYA 4KI0E 3FATA 4ND9A 1LB8A 4IO7A 3KOSA 2Y7RA 3W9WA 1RYXA 4QFNA 3FVOA 2F7BA 1P1NA 2XXWA 3VFJA 3IOUA 3ONMA 3GBBA 2RC9A 1LFIA 4EUOA 3Q29A 3E13X 1MM6A 3UORA 2Z23A 2X26A 2X7PA 3CSBA 1F9BA 4FE8A 4KYSA 1FQBA 3HHFA 3V89B 4G68B 1VFEA 3M8UA 3ODBA 1LBCA 3ZKLA 4R2BA 3G3GA 1B5JA 3KOTA 3OENA 4OEVA 1LCTA 1TXFA 1YPNA 4DXBA 1NNKA 4AB6A 1II5A 4U22A 2PMSA 1IITA 3K0VA 1JQFA 1B1HA 3MC2A 2O7UA 4EDPA 3VXBA 1WVJA 3B6QA 2OJTA 4POWA 1Y4CA 2Y7KA 4ZEKA 1SD3A 1RKMA 3LBSA 3VVEA 5H8SA 1B3GA 3HSTA 1I6QA 2DS9A 3G3JA 1POTA 4OYVA 3IX1A 2E1SA 2I49A 2RC8A 2A5TB 3LSFB 2VP1A 4F18A 2QJEA 2V93A 2QS3A 2P1SA 2O6AA 1FQFA 1QJMA 2I0CA 1OQHA 3C31A 1MG1A 2I4BA 2OK2A 3USDA 1OVTA 1H45A 3TKDA 2O84X 1A40A 3TMGA 5AA3A 1JVXA 4NTLA 1WDNA 2NWJA 3KFMA 1CE2A 4LA9A 2A5SA 3FIRA 1IUDA 1LAXA 2ZNSA 1PBPA 1NNTA 2VD2A 4GIZA 4H65A 5KDTA 3ILUB 5CBRA 1YCJA 2V84A 3KBRA 2UXAA 1USYH 2ONRA 5ITOA 4LQ2A 4ELQA 3K6VA 2DWJA 2DE3A 3B6WA 4H1XA 1IXGA 2Z8FA 4N07A 3O2AA 4P0IA 4DXUA 2H9BA 4ZE9A 5M2VA 4OHNA 4F29A 5DEXA 1BLFA 3PUVE 2RINA 3H6UA 1KWHA 4ZEBA 3IL1B 4OZ9A 1H76A 3KJTA 4NWCA 5A5XA 5AA1A 1NL5A 1SVXB 1N84A 1MXYA 4G68C 4KFQA 3AXFA 5K2XA 2F7AA 3SEYA 3O6IA 1N7XA 1BIYA 1RYOA 1A8FA 1XT8A 2Q2CA 1EZOA 5AA2A 1B7ZA 3N6TA 3TCHA 3IK6B 3FXQA 1T0KA 4LZ7A 1B3FA 1SW5A 3HO7A 4F1UA 2G29A 5H8HB 3KSXA 4LP2B 3RY3A 1B58A 1VR5A 4Z0IA 2ZNUA 5I56A 1FQCA 3CG3A 3OSRA 1XS5A 5HBCA 3U72A 1GVCA 3MP6A 4WXJA 4KYDA 3FV2A 2V25A 3S4UA 3TTNA 2GHAA 4ELOA 5FTHA 4WEDA 4GLIA 1UIUA 1MM7A 3SKPA 3DP8A 4LONB 2XXTA 3MVWA 4NF8A 4GWOA 1PB7A 2ONKE 3CFLA 4QSCA 2XHDA 3C32A 1N7WA 1LAGE 4NF5A 5FHNA 4BDOA 3HCQA 3K01A 3OSQA 3T9HB 4OWDA 3IB0A 3OEMA 1ZBMA 4TLLB 4XTCQ 1AIVA 4GXSB 4QFPA 1M5DA 5I59B 3PD8A 4LZ8A 4OERA 5DTBA 3IJOB 1WODA 3PPRA 1O7TA 3UA8A 4U23A 3MJNA 1EU8A 1FTKA 4U4SA 1Y3PA 3EHSA 4XXUA 3S9LC 4R6KA 5B70A 5HPQA 1I69A 4YKJA 4AB5A 4BDNA 1NFTA 4NF4A 1TFDA 4F1VA 2D5WA 3CRBA 1SDXA 2HXWA 4DCXA 2ZYKA 4PFUA 3VLUA 4GF8A 1S9TA 3E9XA 3EQ1A 5KCJB 3H6TA 1NH7A 3I3VA 2Y7PA 3O6GA 2F36A 3MPKA 4R6HA 4L17A 4YKPA 3L6GA 1B40A 4ESWA 1B05A 2OWSA 5B7DA 2VOZA 3K1MA 3LSLA 1NH8A 4GL8A 1PEBA 2HEUA 2XD2A 1QUIA 2F78A 4IGTA 3FVKA 1H43A 1GV8A 4JWXA 4I1DA 2Z8DA 3H7MA 4O3AA 1Q1KA 5KDTB 1NNFA 2V3TA 3JZJA 2OBGA 3LC8A 2O1MA 4X48A 4IY6A 3OO6A 3FUZA 3TFLA 2CZLA 3I5OA 4Q0CA 4DDDA 2PX1A 2QS4A 5DEXB 4RY1A 1HSJA 1MQJA 3Q27A 4RA1A 1B9JA 1IXIA 3C36A 4PFWA 5I2NA 4DZ1A 3TAJA 3CIJA 3PUZE 1IZ1A 2DWAA 3PUXE 2UVGA 2H5YA 3K4UA 5EHMA 1MXVA 3CI8A 3VE1B 2DP8A 2F34A 4YB6A 1JVYA 3TTKA 1Y1MA 2KLFA 1B3HA 2ANJA 1PB9A 3UIFA 4F39A 4I62A 5L9OA 3VV5A 4XKNA 5AA2B 2R9JA 5TPAA 4KYEA 3R6UA 1B46A 2YJPA 2GRVA 2REJA 3T9XB 4F2QA 2HAVA 4JSOA 3B6TA 2QRYA 3U8QA 3BBRA 1YAEA 3PMVA 3UP9A 4R9FA 4R2FA 3SDFA 1FQEA 2I0BA 3G3KA 5TP9A 1FQAA 5H8FA 2NUVA 5AA4B 2X7QA 1A8EA 4QHQA 1MQDA 1MXXA 2XXQA 4ZZAA 2OZZA 4QFKA 4YMBA 4QSDA 4OESA 4POXA 1SBPA 1IEJA 3IOVA 4MH5A 5CC2A 1BTJA 4IO4A 4JWYA 4GRKA 3SEVA 1MH3A 3WAFA 3BFTA 1R9QA 1SI1A 4NF8B 3H6WA 3IORA 5L8DA 5I58A 1LAHE 3S2VA 3RLFE 3R26A 5H8NB 3S9MC 3RTWB 2Z8EA 2Q8JA 3W9VA 4IO2A 4C1UA 3U92A 2DSFA 3DP4A 1US5A 5F7VA 1DOTA 1JW5A 1YTVA 3S9EA 1URSA 4PETA 2NVUB 1PDAA 3TCFA 4DIGA 1B5HA 3MUQA 1LCFA 3FXRA 3WAEA 5I57B 2I3VA 1AH5A 4TLMB 4RK9A 2HFBA 2UYEA 4KR5A 2G93A 4FORA 1DTGA 1GR2A 3EF7A 4OMBA 1TFAA 1MY1A 1JETA 2OLBA 4OQOA 1PC3A 3O28A 3T93B 1DSNA 3K6XA 4IO5A 3S9NC 2HAUA 4F19A 2RCBA 1D9VA 3OO8A 3K2DA 1B0LA 2B3FA 3FXUA 2OWTA 2F5XA 1I6BA 1OVBA 3O29A 3LR1A 3T9VA 3N94A 4E0XA 4M1VA 3A3UA 2XXRA 1B7UA 3MW0A 5I2KA 5BUUA 1A55A 4U21A 3T66A 2DWIA 4M4GA 3MZBA 2ZXTA 4YB5A 2UVHA 4PP0A 1MRPA 3IJXB 3K02A 3N6UA 4MBPA 5F1QA 4NF6A 5EHSA 3QK6A 1M5EA 1SI0A 4XKQA 4GD5A 3TTRA 3F11A 2DYXA 1MDP1 3TQWA 1MQIA 3M3KA 4C0RA 1MQGA 4QFLA 4HS7A 3K1NA 4ZEFA 5JTYA 5KZTA 1QVSA 4YMAA 4XKPA 1DPPA 4F3PA 1S7YA 1IXHA 1D4NA 4OENA 4PE5B 3K1PA 5I2NB 1HSLA 2PT2A 2E0SA 3U1OA 3IOWA 2QS2A 4IO3A 3W15C 2Y7IA 5ICTA 2QPQA 3Q25A 4FECA 3RT6B 1MPDA 4I8CA 1P1QA 3MZ1A 1R6ZA 3HN0A 3KGCA 2YLNA 2H99A 3PPNA 3RTFB 1GTKA 3PPOA 4FEBA 3UGWA 4JDFA 4EQ9A 2GHBA 3IB2A 1B2HA 1QKAA 4JXIA 4H6DA 1Y3QA 3TELA 4DXCA 4XIGQ 3O6HA 4GOTA 4YU0A 4FJPA 1EZPA 2O69A 5H8FB 3GLBA 1DPEA 2PT1A 5L9SA 5BWJA 3PUWE 1QUJA 4H5FA 1XOCA 3MVZA 3IR1A 2DVZA 1OMPA 1B5IA 5LOMA 3HV1A 4RYAA 3PU5A 2R6GE 4F31B 2B65A 4JSDA 3T9UA 3ZSFA 2CMOA 4UACA 1S50A 3C33A 1XC1A 5H8QA 4IB2A 1B3EA 2XXVA 4EXLA 3N26A 4BDMA 1Y9UA 3DM0A 5AA2D 1HSEA 1SW4A 4G68A 1B0HA 3O97A 3TEPA 2B3BA 2HZLA 4OETA 1JW1A 3A09A 1LSTA 1FTJA 2ESNA 3SEXA 3KSJA 1UTBA 4OTEA 3MZ9A 1B6HA 2DXYA 4JBZA 1ATGA 3FZVA 1OLAA 3IB1A 1UIVA 5CMKA 1MY0A 4YZZA 2GH9A 4U2RA 2QMXA 2XXHA 2AL5A 1B32A 2PBWA 3VDFA 4R73A 2DQVA 1AL3A 1JNFA 2XXPA 1ANFA 4WEPA 2A5TA 3OO9A 2AIXA 4F2OA 4IY5A 1ZKBA 4NMYA 3JV9A 1B4ZA 3FJ7A 3RN8A 4RJZA 1MH4A 4JB7A 4ISUA 3EN3A 4DE8A 1JEVA 4H8IA 3OO7A 1I6AA 2F7CA 3EHTA 2ZNTA 1P1WA 1FTMA 1M5FA 2FNCA 5J1DA 1ZJLA 1EH3A 3TTLA 4ECFA 2WKYA 3C35A 4H0WA 2DE2A 3RUMA 1LBBA 3RT8A 2H25A 4Q30B 1J1NA 5L9MA 4NWDA 1PB8A 4H5GA 4OVJA 3OOAA 1JW4A 3DELB 4ESXA 1QUKA 1ELJA 2D21A 3ECRA 3DP6A 1MDQA 4BLAA 1B7HA 4R74A 3ZKKA 1EZ9A 1LB9A 3MP8A 4JWOA 4H67A 3I6VA 1QW0A 4BDLA 1MY2A 1N3WA 1L5TA 1XHYA 3JYRA 3PUYE 1TWYA 1LFHA 1MXUA 2IA4A 4LQ5A 1B3LA 1SW1A 5A5XB 4MF3A 4G77A 3QYTA 4KCCA 3FASA 3G3IA 1B4HA 3QXMA 1LFGA 3TTMA 2ABHA 2XXUA 2NOOA 3QUFA 4NEDA 4EF2A 3G3FA 4LVQA 2HZKA 4EXKA 5DVFA 4G4PA 3FGSA 1A99A 1LLSA 2ALUA 1UTHA 4QF9A 4ELRA 4G2ZA 3K00A 2QL3A 3HHGA 1NNPA 2QS1A 1SYHA 2I4CA 4X1BA 5H8HA 2D3IA 2YPNA 2Y84A 1MY4A 1AMFA 3PMWA 5DVIA 1PBQA 4X1DA 5I56B 2XX8A 2O1LA 2Q2AA 1ZLQA 4FATA 1NMUA 3DLNA 5JK4A 3MAMA 3O66A 3EHUA 3BFUA 3IAZA 2DXRA 4ZDMA 4F3GA 3V83A 2UVIA 1N3XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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