2WKYA

Crystal structure of the ligand-binding core of glur5 in complex with the agonist 4-ahcp
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The Glutamate Receptor Glur5 Agonist (S)-2-Amino-3-(3-Hydroxy-7,8-Dihydro-6H-Cyclohepta[D]Isoxazol-4-Yl)Propionic Acid and the 8-Methyl Analogue: Synthesis, Molecular Pharmacology, and Biostructural Characterization
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2wkyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2wkyA02
2ONSA 4DCYA 3PGFA 4NMYA 3TTNA 2XXIA 4TQUQ 3PPRA 2VGQA 1B9JA 4OFJA 1II5A 2HXWA 1MG1A 4N07A 1US4A 4GD5A 3ZSFA 4Q5TA 5BUUA 3IOTA 3MP8A 3FASA 2O1LA 5TPAB 3RGYA 1AL3A 3TCFA 1O63A 5AA3A 4BDMA 2QMXA 2ZYOA 5DEXB 3MQ9A 1KWHA 3N6TA 4FE8A 5AA1A 2F97A 3OD7A 3QUJA 3Q29A 3MBPA 1YPNA 2HZKA 5LOMA 4FORA 4R2FA 1B5HA 3JV9A 4C0RA 5CMBA 5KDTA 4GL8A 4XKPA 4GL0A 5ITOA 4PFUA 3O66A 3QAXA 4R6YA 1JEUA 3OMBA 3C35A 5CBRA 3G3HA 4OXVA 2KLFA 1H44A 4DXUA 4NF8B 4NTLA 1SW4A 3OXNA 2QS3A 2DWJA 3FV1A 5JEIA 3BFTA 4OZ9A 1EZ9A 2I0BA 4O3BA 4IO2A 3KJTA 5EHMA 1LAXA 2O69A 1MDP1 2CZLA 4G68A 4P0GA 1MS7A 2HEUA 3TFLA 5I2NB 2V25A 1UIUA 1NNPA 3TEPA 3LSXA 2O84X 5I57B 3DELB 1SDXA 4UA8A 1QJMA 1VFDA 1POTA 4RXLA 2V3TA 1Y4CA 4ELRA 3HSTA 3N6UA 2LAOA 2DE2A 4FATA 2XD2A 4GVOA 3K1MA 4F1UA 2P2AA 4YB7A 2Z8DA 5CBSA 1D9VA 5L9OA 2DVCA 1Y1ZA 3KGCA 3DP8A 5AA2D 1N76A 1FTMA 4X9TA 5B7DA 1P99A 1GVCA 3Q28A 3FV2A 3IB0A 4ESXA 4YKPA 3MPLA 4HW8A 2NWJA 4GRKA 5JTYB 3EHUA 4Q8RA 4Q30B 5CM6A 4H5FA 3MZ9A 3H6TA 4QFOA 3DM0A 5H8NB 4YMAA 4LZ5A 1R9LA 3USDA 3H6WA 4JWXA 3MW0A 1ZU0A 3TELA 1LFHA 2DQVA 3CG3A 4O3AA 2XXYA 2YJPA 3IK6B 3W15C 1Z7ME 5H8SA 3JZJA 3MVWA 1IQ7A 4ZEFA 4ZS9A 3P7IA 4MF3A 3KN7A 1AIVA 4FEBA 1SVXB 1MY1A 2ZNUA 3GLBA 4ZE9A 3K02A 2GRVA 3G3GA 3O6IA 4ZEKA 1QUIA 1MPBA 3OO6A 4LP2B 1R9QA 5ICQA 1IXGA 4KYEA 4TLMB 1YCJA 3I6VA 3GZGA 3EQ1A 5AE4A 1Z7NE 3C32A 1MM7A 4RK9A 1NNFA 2AYSA 3IORA 1B32A 4LATA 3MVXA 1B6HA 2AL4A 3K00A 3MZ1A 5CMKA 3TKDA 1QKBA 4TLLB 1A55A 1LAFE 4JB7A 5BWJA 3R7XA 5I58B 1LLSA 1IXCA 5KDTB 2R6GE 1NKXA 1B0LA 3MVZA 4NF4A 2B3FA 4THIA 3E3KA 3RNNA 3FJGA 2UVIA 1ANFA 3SEWA 2Y7WA 1XVYA 5FHNA 3C34A 1MH3A 3BKIB 1UIVA 3E13X 1JVXA 4IGTA 3R26A 1OVTA 1AH5A 4MBPA 3VE1B 3RLFE 3O97A 2G29A 4EDPA 1GGGA 1H45A 1FTKA 3OEMA 4FEDA 2O68A 1P1WA 4QFLA 4YKJA 2W7YA 1UTBA 1OLCA 3MC2A 4F31B 1N04A 3ECRA 1NNTA 1A40A 3KJ7A 1B52A 4QFNA 4G8MA 3DP6A 5FTHA 1JVYA 2CMOA 3EHSA 4RNSA 1A8EA 1Y1MA 3FD3A 2OWSA 1MRPA 5M2VA 5KCJA 3LSFB 2NOOA 2XXUA 2NXOA 1FQBA 4E0WA 3KN8A 3CSGA 1B5IA 1FQFA 4GFRA 2F5XA 4BDQA 3TPAA 4F3GA 4ONYA 2QPQA 2XX8A 3OSRA 1VR5A 2DXRA 3K4UA 3TCGA 3MP1A 3QXMA 2QRYA 3B6TA 4F29A 4K3FA 3E9XA 1ZLQA 4KYSA 3IOUA 5DVJA 1US5A 5EHSA 2PT2A 3IX1A 4R72A 5A5XB 1PB9A 4ELQA 4ZEDA 3IB2A 4XKNA 1R6ZA 3MUQA 3K01A 4U23A 4QHQA 1CE2A 2XXHA 3HV1A 3RPWA 3SETA 2Y84A 2Z22A 2BJJX 1A99A 1MXZA 4OFOA 2NUVA 1P1NA 4Z0IA 4QFKA 4JXIA 3EF7A 4POWA 3ODBA 3T9UA 4YKIA 3THIA 3W9WA 5J1DA 3TAJA 3JYRA 1JEVA 3TQWA 3SERA 4OVJA 3KG2A 1OLAA 1ZTYA 4M4GA 1ZIUA 4AQ4A 4WEPA 5H8HA 4H8JA 1XOCA 4U21A 1N7WA 2PT1A 2I4BA 5K2XA 3UK4A 4BDRA 1YAEA 1MXVA 4NF4B 2QS2A 1OQHA 1SW5A 4OERA 3TTKA 3O28A 5H8FB 4QFPA 4MLVA 1BTJA 4IY6A 1FTOA 2NVUB 3G3IA 5IKBA 4H0WA 2QS4A 3PMWA 4ELPA 4C1TA 1SYIA 3ONMA 4NF6A 2ZXTA 1EZOA 3QSLA 2P0SA 1PBQA 4NF5B 4MFIA 3RUMA 4OMBA 5TU0A 2A5TA 4OQOA 4AB6A 3VXCA 1A8FA 1QUJA 1WVJA 2Q88A 1QULA 3HN0A 3CIJA 1UTBB 2FA7A 1B1XA 5K2YA 3MPKA 2X26A 2XXQA 1XC1A 4LVQA 4H65A 4C1UA 1B3LA 3KSXA 3M3KA 3EPEA 1S9TA 2F35A 1B0HA 2Q89A 5KCJB 3IO6A 4U1OA 4GIZA 3SEYA 1GTKA 1FTLA 3CSBA 3UIFA 4OEVA 2DP8A 2R71A 3IR1A 4LQ2A 1MQHA 1IITA 4BLAA 4N13A 1O64A 4Z7EA 2O7IA 1B4HA 2UVHA 1PC3A 1N84A 4HCYA 1B3GA 3RQTA 5ELVA 4WXJA 3TYHA 1JW5A 3FJMA 4EUOA 4KCDA 1ZBMA 1USYE 3V5AA 2ZNSA 4U4SA 4GLIA 3PUVE 3VVFA 1DTGA 4XIGQ 1FQDA 3UORA 3E4RA 4ZECA 4DDDA 2RINA 3O2AA 3O6HA 5H8QA 3PU5A 1MY0A 5AA2A 5TP9B 2XX7A 3OOAA 1DPPA 3K1PA 3OELA 3WAFA 3UA8A 2DWHA 3PV0E 3KOSA 3PD8A 2V3UA 3A3UA 1EH3A 5CMCA 4ESWA 1XT8A 1SW2A 2OBGA 3SEUA 3QK6A 4G2ZA 1O7TA 1LB9A 1I6BA 3ILTB 5H8HB 5I56A 2ESNA 4JSOA 1PEBA 4POXA 1UTHB 1EZPA 4I8CA 3PUXE 4IO5A 1LAGE 4ZZEA 3H4ZA 4YMBA 3ZKLA 4IB2A 3KOTA 3O9PA 5CMMA 1N3WA 5I59B 4HTGA 2GHBA 3PD9A 5AA4A 2AL5A 3U94A 3QUFA 1FQEA 1NMUA 4F3BA 4ISUA 1RKMA 1QKAA 5JK4A 4XKRA 3SEXA 1SW1A 2XXWA 1ZJLA 2VHAA 1SD3A 3H7MA 3IJXB 4DE8A 1BKAA 5I2KA 2RF1A 2DYXA 4LUBA 2DE4A 4YB5A 1HSJA 3T66A 1A7LA 2HAUA 2H98A 3GBAA 1USYH 4U2RA 4LA9A 1IXHA 2ZYKA 1LBBA 1M5EA 3AXFA 3B6QA 1VFEA 3V83A 1MQIA 3VV5A 1SQYA 2ONRA 3U1OA 4U1ZA 2GH9A 3K6VA 4EF2A 3PPOA 1NH8A 1MXXA 4PFTA 3LSLA 5I84A 4EQ9A 4KI0E 1I6AA 2OCUA 4YZZA 3VLUA 3KEIA 3KFMA 1OIBA 2H5YA 3MJNA 4DZ1A 2RC7A 1TFDA 1XVXA 5DVFA 4KYDA 2XXTA 4QSDA 3TODA 4EXKA 3T9HB 5ICTA 2O1MA 1P1OA 4G68B 2V84A 1MY2A 3T93B 4R6HA 3S9LC 1XS5A 1TWYA 3FXRA 3CR9A 1S50A 4ZDMA 4F18A 2I49A 5AA2B 4QF9A 4O3CA 3H06B 2I4CA 2F34A 2XXVA 5DVIA 2Y7KA 3TTLA 5ITPA 5TPAA 3QIMA 2V93A 4RYAA 3OO9A 4ZZAA 3L6GA 1N0TA 5DEXA 1QUKA 3VXBA 1B7HA 3H6UA 4M1VA 4F1YA 4R6KA 3A09A 4KHZE 2DWAA 3FVOA 4H1XA 2I3VA 4IY5A 4JBZA 2IA4A 1HSLA 1WDNA 2THIA 1P1QA 3RY3A 5EYFA 1PB7A 4U22A 3K0VA 3K1NA 4F3PA 3RT6B 4F19A 4NEDA 3G3JA 4RPOA 3LC8A 2REJA 1MH4A 1DTZA 1SYHA 2XD3A 4DLDA 2UVGA 2XXRA 3M3LA 4KFQA 4OENA 4BDLA 2GFEA 3SDFA 3TUSA 4KR5A 1MM6A 5F1QA 4N6PA 5I2NA 1NFTA 1B4ZA 3IO4A 4IO4A 5L9SA 4GQOA 2I0CA 4BDOA 4OYVA 3N5LA 3UGWA 1LAHE 3N94A 4GXAA 1B3FA 1F9BA 4JWOA 4R73A 3EN3A 4XKQA 3DLNA 4H6DA 1D3KA 4NWDA 3VVDA 2HCAA 2X7PA 1JNFA 4DXBA 2QSXA 3S4UA 2DXYA 2PX1A 4R9GA 4WKMA 1DSNA 2E0SA 1YTVA 1URGA 2F6GA 3HHGA 4JSDA 3MZBA 5L9MA 2GHAA 2DS9A 1B7UA 3D4CA 2P1SA 4F2OA 4G8NA 4JDFA 4RY1A 5HM4B 5JTYA 3VFJA 1SI0A 3LBSA 1M5DA 5F7VA 1Y20A 4PP0A 3PUWE 2Q9TA 4H67A 3C4MA 2ANJA 4I1DA 4LQ5A 5FTIA 2DSFA 2VOZA 1MY4A 1P1UA 4XXUA 3Q26A 4OWDA 4MLQA 3TTMA 3KZGA 4H8IA 2QS1A 4DCXA 2YLNA 4KCCA 2O6AA 2RC8A 3FVKA 1OMPA 1B05A 4QSEA 2Y7IA 3I3VA 1MQDA 5B70A 1FW0A 5FHOA 3KSJA 3FJ7A 3K6XA 2ONKE 3RTWB 5ISUA 1JETA 3GXAA 1HSEA 3T96B 4IGRA 4YU0A 3HO7A 4JWYA 4QRZA 2V3QA 4HS7A 4YB6A 1URSA 4PQJA 3CFLA 4ECFA 3V89B 3MP6A 1MQGA 1LFIA 1GV8A 1Q35A 5KZTA 5I58A 1DPEA 2DOJA 4IO6A 4ELOA 3HCQA 1FTJA 4GXSB 3TZAA 1ATGA 1VSOA 1ZKBA 4G77A 2B65A 4AB5A 4LZ7A 1H76A 3SESA 3OENA 5CRYA 3K6UA 1LSTA 4OESA 2Y7PA 2H25A 3PPQA 3MWBA 3O6GA 1R1NA 1Y3PA 4U4XA 4UACA 2PMSA 2PBWA 3S9NC 1VE4A 3V8XB 4GOTA 3U72A 3VVEA 3HHFA 3CRBA 3R6UA 2VP1A 1LBCA 3ILUB 1MY3A 3IB1A 2ABHA 2F7AA 3OEKA 5CI5A 4F39A 1N7XA 4PETA 3H3GA 3LUYA 2PYYA 2F7CA 2Z8EA 3RN8A 2RKMA 4EF1A 2AIXA 1PB8A 4DIGA 3FATA 4LONB 1ZMGA 2DVZA 1Y3NA 2D5WA 3LR1A 3IL1B 2F8DA 4LZ8A 2ZMBA 4RPNA 3OO8A 1NH7A 3HPIA 1FQAA 3OO7A 1PDAA 2F7BA 2B3BA 2OWTA 3CI8A 4F3SA 2FYIA 3TCHA 2E1SA 2RC9A 3G3KA 4G68C 4X1BA 2I3WA 4OHNA 1H43A 4XTCQ 2M8CA 3KBRA 1SBPA 2Z8FA 2VD2A 2UYFA 3K6WA 4NF6B 1MDQA 1I69A 1SI1A 3FVNA 1RYXA 3H03A 4I62A 1DMBA 5DTBA 1L5TA 2OJTA 1TFAA 2A5TB 4EQBA 4R2BA 3S9MC 1B46A 2OK2A 1OVBA 3TTRA 5A5XA 1GR2A 1J1NA 2Q8JA 2G93A 3T9VA 2I58A 4PE5B 2XHDA 3FUZA 4RJZA 4TOZA 3BBRA 1MXUA 2O51A 3W9VA 1Y4TA 4Q0CA 5HBCA 2PVUA 3C33A 1LCTA 4YAHX 3N26A 2X7QA 3FXUA 1OQGA 3PMXA 4PFWA 2DE3A 1MPCA 1Y9UA 2H4IA 1LFGA 3B7DA 1IIWA 1D9YA 1MXWA 4F2QA 2DWIA 2F6PA 4EQ7A 4HCWA 4MH5A 2HAVA 2VD3A 1MQJA 4KQPA 5IAIA 1FQCA 4I9DA 1B1HA 1IEJA 4L17A 4WEDA 1B51A 1B5JA 3S9EA 3ZS6A 4FJPA 5H8FA 1LB8A 3G7WA 3K2DA 1QW0A 5HPQA 1LGBC 2HFBA 4R74A 2ALUA 4OEUA 1IZ1A 3C9HA 1TT1A 3T9XB 1CB6A 2XXPA 5DT6A 3CFXA 4NF5A 3PPNA 4OFLA 2UXAA 2YPNA 1Q1KA 1M5FA 3Q25A 3RT8A 4R9FA 3OSQA 4IO3A 5H8QB 1MPDA 4F1VA 3KN3A 3VLWA 1QVSA 4FAJA 1DOTA 1M5CA 2QJEA 4NE4A 4BDNA 2RCAA 3U93A 3FVGA 2R9JA 1B7ZA 4X48A 3IJOB 4RA1A 4G8HA 4P0IA 2OZZA 4FECA 4NWCA 3M3FA 3C31A 1EU8A 4PFYA 1B3EA 5DYHA 2Q2CA 5I56B 2QL3A 3LSWA 2H9BA 2WKYA 1ELJA 3B6WA 1XHYA 4KPTA 1IUDA 4EXLA 3VDFA 4GWOA 2I48A 1S7YA 1D4NA 1A54A 2FNCA 1POY1 3MAMA 2ZYMA 3O29A 4P11A 5AA4B 1URDA 3TDJA 2F78A 2REGA 3CG1A 1BIYA 4ZE8A 4OTEA 1AMFA 3SKPA 1AOVA 4NF8A 3CVGA 1UQWA 4YICA 2A5SA 3TQLA 4OETA 2QMWA 3ZKKA 3D4GA 3CFZA 2ZNTA 3FIRA 5FHMA 3EHTA 2D21A 4ZEBA 4FIMA 3PUYE 3FZVA 5I2KB 1MXYA 3UP9A 3WAEA 3BFUA 3A3CA 1WODA 1BP5A 4QSCA 3UN6A 1M5BA 4G4PA 4ZEIA 1B3HA 2UVJA 1N3XA 5I57A 1JW1A 5TP9A 3U8QA 1H3DA 3PPPA 2RCBA 5L8DA 2OLBA 3PUZE 3M8UA 4IO7A 1I6QA 2F36A 2O7UA 3T22A 2I6EA 2HZLA 1NNKA 3SEVA 1PBPA 3FXQA 3GBBA 3RTFB 1B58A 2UYEA 3TMGA 1T0KA 4H5GA 2H99A 1LCFA 2Y7RA 1RYOA 4YKKA 3I5OA 4X1DA 1BLFA 2XXXA 2IEEA 2D3IA 3G3FA 1UTHA 4RK2A 3IOVA 1JW4A 2HQ0A 2Z23A 2ZYNA 1JQFA 4DXCA 3DP4A 3IOWA 1TXFA 5I59A 5H8NA 2Q2AA 3Q27A 3C36A 3FGSA 3S2VA 4ND9A 3QYTA 4R75A 3F11A 1B40A 1IXIA 4GF8A 1Y3QA 1NL5A 1B2HA 1FCKA 2XX9A 4E0XA 4F22A 3PMVA 4KD5A 3IAZA 3VLVA 3L6HA 3U92A 3H6VA 5CC2A 3MVYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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