2XXIA

Crystal structure of 1-((4-(3-(trifluoromethyl)-6,7-dihydropyrano(4,3- c(pyrazol-1(4h)-yl)phenyl)methyl)-2-pyrrolidinone in complex with the ligand binding domain of the rat glua2 receptor and glutamate at 1.6a resolution.
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Integration of Lead Optimization with Crystallography for a Membrane-Bound Ion Channel Target: Discovery of a New Class of Ampa Receptor Positive Allosteric Modulators.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 89
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxiA02
3C35A 2QL3A 3K6VA 3KZGA 1A8EA 4GQOA 4GRKA 2QS4A 4GF8A 1D9VA 2DWJA 1N04A 3FUZA 2ZNTA 1I6AA 4C1TA 3DELB 2VHAA 4ISUA 3K1NA 5H8NA 3N5LA 4LA9A 3MWBA 2UVHA 2ANJA 2DWAA 3IB0A 1MQGA 3T22A 2XXQA 2DWIA 4X1BA 3UP9A 2Z22A 4DZ1A 3G3HA 4THIA 2VP1A 4GFRA 2A5TB 3O6GA 2X26A 2E0SA 3C36A 1UQWA 1PBQA 1GV8A 5FHOA 2ZYKA 1MQJA 1B5IA 4KHZE 4H8IA 2ZNSA 1MPDA 3A09A 4U1OA 3FV2A 3S4UA 4PFUA 2G29A 2GHBA 3EQ1A 3QK6A 1R9QA 3Q26A 4QHQA 1AH5A 1US5A 2XD2A 3IORA 4P11A 1SW4A 3PV0E 4YZZA 1B40A 1N7WA 3FVGA 4WKMA 1MXUA 3ODBA 3N6TA 2D5WA 3SESA 1B0LA 1LB8A 1Y9UA 1MXVA 3RT8A 1FTMA 2VGQA 1A8FA 4G8NA 2I49A 1M5EA 4PFTA 4N07A 4NF6B 3DP4A 4LQ2A 1LFGA 3LC8A 4L17A 5EYFA 1LBCA 4WEDA 3QUJA 4OEUA 4F1VA 4H1XA 1B4ZA 1B3FA 1TXFA 5FHNA 4KFQA 2ZMBA 4NWDA 1FQEA 1R9LA 2O7IA 4NF8B 3JYRA 4XKNA 4Q8RA 1A40A 4O3CA 3B6WA 4EQ9A 1Y20A 2I3WA 3IO4A 4JXIA 4OENA 1UIVA 4PETA 5H8QA 1WDNA 3T9UA 3OELA 2O1LA 2H99A 4IO7A 2RC8A 2P2AA 3MZ9A 1FQAA 2XXVA 1SW2A 2F5XA 3A3CA 1QUIA 2B3FA 2Y7PA 4IO6A 2OJTA 3TODA 1SW5A 4HW8A 1IIWA 4NF4B 1PDAA 2FYIA 1MQHA 3VXCA 1XC1A 4Z0IA 3T9XB 1TFDA 1MG1A 5CBSA 1B4HA 2ZYOA 5ITOA 2ESNA 4R75A 4R9GA 3LSLA 1NNTA 2GHAA 5AA4B 2V93A 3GBBA 3M3LA 1NH7A 4O3AA 1M5DA 3KOTA 4KD5A 3KOSA 1SVXB 5ICTA 2V3TA 1Z7NE 3MPKA 2H5YA 2HZLA 3UA8A 3MAMA 4XXUA 2UYEA 5A5XA 1MY4A 4KYDA 3SETA 3GXAA 1RYOA 1A7LA 5ISUA 3SEUA 3OO6A 1PB9A 2REJA 1DTGA 4ZEDA 1FCKA 5DEXB 3G3GA 5TPAA 3EN3A 4PE5B 4Z7EA 2QSXA 3S9EA 5DTBA 2OK2A 3QXMA 1MDP1 2PMSA 1VSOA 2B3BA 4Q0CA 4LATA 1LLSA 3DP8A 1M5FA 4OEVA 1NNPA 1DMBA 2X7QA 3TTMA 1MXWA 4NMYA 4M1VA 2ALUA 4H8JA 3G3FA 4YMAA 1I6BA 2BJJX 5L8DA 2W7YA 1T0KA 1SD3A 1JW5A 4ESXA 3CRBA 3O28A 1BKAA 4RA1A 2F8DA 4ELPA 4FJPA 1F9BA 3K2DA 5I2KB 2Z8FA 4WXJA 3TEPA 4QFOA 4DCXA 3QIMA 1IZ1A 2DYXA 1Y3NA 4N13A 4KYSA 3KFMA 2HZKA 1EZ9A 3N26A 5M2VA 4QF9A 1P1NA 3FVOA 3IL1B 3PD8A 1TWYA 3CVGA 2I58A 3P7IA 4EUOA 2F6GA 1MY3A 1B46A 4R74A 4KI0E 3KSJA 2ONKE 3C33A 4FIMA 4IO4A 3AXFA 5I84A 3IAZA 2QJEA 3IO6A 4KR5A 1ZTYA 2OBGA 4NEDA 3W9VA 5I58A 2VD3A 4F39A 5AA2A 1QULA 1OIBA 2YJPA 4XKQA 1ATGA 3PMVA 3TKDA 4LUBA 3LBSA 4PP0A 2DQVA 4JWXA 3OO7A 1XT8A 2QS3A 4FATA 1R1NA 3RTWB 3SEYA 1WODA 4BDRA 4NWCA 3U72A 1ZBMA 2DP8A 5KZTA 2XX9A 1USYH 1B6HA 3H4ZA 2UVGA 3ZSFA 3IJOB 1ZU0A 4FORA 4OMBA 5FTIA 3PPOA 4PFYA 3D4CA 2HAUA 2OWTA 2ABHA 3H6UA 4IB2A 4LP2B 4ZDMA 1J1NA 4H65A 4IGRA 2XXRA 2ONSA 5DVJA 4G68C 3IK6B 4YKJA 1MM7A 1Q1KA 4FEBA 3V83A 5F7VA 3MJNA 4I8CA 4P0IA 1SBPA 5FTHA 1POTA 2Z8DA 3TTNA 2RC7A 5L9SA 3GBAA 4R6KA 1FQFA 4OXVA 1ANFA 1NKXA 4ZEIA 3C34A 3KJ7A 4GD5A 4TOZA 1YCJA 4U21A 4OESA 3TCHA 4H0WA 1IUDA 3TFLA 4G4PA 1XOCA 3USDA 1JVYA 2Z23A 3DLNA 3OO8A 4R6YA 4YICA 4KYEA 5TP9B 3TTLA 3C31A 5B70A 3PU5A 2H25A 5CMKA 5JTYB 4JWYA 3VVEA 4KCCA 3TMGA 3B6TA 4I9DA 4DXUA 1B05A 2UVIA 1MY1A 4F22A 3HSTA 1LFHA 4MFIA 4R6HA 2O6AA 1A54A 4C1UA 1B9JA 3H6WA 3MP6A 1B0HA 2B65A 2IEEA 3OD7A 2F6PA 4I1DA 3HCQA 2KLFA 3K0VA 4ELRA 1MXZA 4NTLA 2F35A 4F19A 1VFEA 3CG3A 3ILUB 3PUXE 2ZYMA 3H6TA 4OWDA 1USYE 1MY2A 3N94A 2Q89A 4K3FA 3LSFB 1B3HA 1FQCA 1FQDA 3Q28A 2Z8EA 5IAIA 3UIFA 1HSEA 2R71A 5EHMA 1B5HA 1Y1ZA 4G68A 1NL5A 1LFIA 3ECRA 3MPLA 3SKPA 2Q9TA 3CFZA 3PD9A 2V84A 5ICQA 4GWOA 1HSLA 1ZMGA 3LUYA 4XKPA 4EQ7A 1B1HA 1MXYA 1UTHB 3M3FA 5ITPA 3GZGA 5CMBA 1PBPA 1S9TA 3FZVA 2PYYA 3PUYE 1ELJA 3PPRA 2O84X 5AA2D 2E1SA 3G3IA 3EHSA 4MBPA 2F7CA 3K6WA 2FNCA 1B58A 3RUMA 1UIUA 4IY5A 3OOAA 5H8NB 1IITA 4LONB 4QFPA 1SW1A 5BUUA 3TYHA 1AOVA 3SDFA 2THIA 2DE3A 4G8MA 3PGFA 1GR2A 1B1XA 3S9NC 3ZS6A 3I6VA 1B7ZA 1OQHA 5AA1A 5B7DA 3FJGA 2QMXA 2DS9A 1P1WA 1FTOA 3F11A 4BDLA 3RGYA 4IGTA 3C4MA 1AIVA 3KGCA 3EPEA 4PQJA 3EHTA 1DPPA 2V3QA 1H43A 2NOOA 5I57A 3VVFA 2OLBA 4NF5A 1B51A 3SEXA 3O97A 4U22A 2O68A 3U94A 3KSXA 1PB8A 4EF2A 4IO5A 4IO2A 2G93A 3RT6B 5I59A 4P0GA 1JW4A 3K02A 4GXSB 2YLNA 4DCYA 3U8QA 4F3BA 3G3KA 5CMMA 1N76A 2Y7KA 1OVBA 4JB7A 1VE4A 4EF1A 1B7UA 2H98A 4PFWA 4DIGA 1UTBA 3CG1A 5EHSA 3O2AA 2CZLA 3O6IA 5JK4A 4X48A 4ZS9A 1PEBA 4XTCQ 3V5AA 4ESWA 2HEUA 1OQGA 1O7TA 1MH3A 1H44A 4AB5A 5H8FA 1N7XA 2QRYA 1H45A 1L5TA 3TCGA 3Q29A 5H8QB 2Y84A 4JSOA 2D21A 4F1YA 1SDXA 1LAGE 3IB1A 1EZPA 2I48A 4JDFA 5I56A 2FA7A 1BIYA 2QPQA 1I6QA 3TELA 3CFXA 4O3BA 2Q2CA 4DE8A 3QSLA 2QS2A 3VFJA 1ZIUA 4G8HA 4ZEBA 2NUVA 4ZZAA 2PT2A 1JEUA 5DVIA 3MC2A 4DXCA 3IOVA 2DXRA 2XD3A 4RPNA 2ZXTA 5H8SA 4R72A 4BDQA 5L9MA 3SEVA 3KBRA 2PT1A 5H8HA 2UYFA 3MBPA 5CC2A 2Q8JA 4X9TA 3MP8A 3CI8A 3HPIA 3FV1A 5HM4B 5KDTA 1MPBA 4HTGA 3VE1B 3C9HA 2F34A 1IXIA 4BDMA 1D3KA 3UGWA 1O63A 4OFJA 4RY1A 2GRVA 4GIZA 5I2NA 1BTJA 3PUVE 2DWHA 5A5XB 1IXCA 1B32A 4Q30B 5AA3A 3O9PA 5FHMA 2I0CA 2HXWA 4H5FA 4H67A 1LB9A 1BLFA 1B5JA 3M8UA 1MXXA 3IX1A 2P0SA 2DVZA 1JNFA 2REGA 4ND9A 3S2VA 4DLDA 1QJMA 5TPAB 1OLCA 4EQBA 3H7MA 4YMBA 3U92A 3S9MC 1XVXA 3MW0A 3VLUA 2XXYA 1HSJA 3D4GA 3OEKA 3FIRA 2O69A 4OZ9A 1MPCA 1TFAA 1GVCA 3B7DA 5K2YA 3GLBA 2M8CA 2OZZA 4XIGQ 2O7UA 3FD3A 3MVYA 4AB6A 5KDTB 4RJZA 5BWJA 3RPWA 4RYAA 4F18A 3TZAA 4ZE8A 2R6GE 1LCFA 4AQ4A 3CSBA 1CE2A 1DTZA 4ZE9A 2H4IA 2XX8A 1MM6A 4OTEA 5HPQA 4MH5A 3Q27A 4GOTA 1NNFA 1SQYA 5KCJA 1URGA 4R73A 4POWA 1Y4TA 3PMXA 1RKMA 1KWHA 3KJTA 4R2BA 1Y4CA 4FAJA 4F29A 1DSNA 2NWJA 2R9JA 3K00A 4H5GA 2XXWA 4OFLA 3VLVA 1N3WA 3PPPA 3I3VA 2QS1A 5I58B 3UN6A 3U1OA 5AA2B 1NH8A 2AIXA 3HHFA 1P1UA 1LBBA 3KN3A 4GXAA 3PPNA 1B3LA 3Q25A 1N84A 4QFNA 3K1PA 1MQIA 1MY0A 4ELOA 3HHGA 4LZ8A 2A5TA 4IO3A 3FASA 1QVSA 3OSRA 2OWSA 1URDA 4ZECA 3MP1A 4QSEA 3M3KA 3PUWE 4LZ7A 4LVQA 3MUQA 3N6UA 3PMWA 2RCAA 4E0WA 2XXXA 3O6HA 3SERA 3MZ1A 2Q2AA 2DSFA 1B3GA 1MDQA 3TTRA 4MF3A 1MQDA 3G3JA 3HO7A 2ONRA 4HS7A 3RTFB 4U2RA 4OHNA 3K1MA 2NVUB 3IOUA 3K6UA 4OFOA 3OEMA 2A5SA 2Q88A 1EZOA 1MS7A 3OXNA 3RN8A 3TTKA 1SI1A 1IEJA 3ILTB 3KN8A 3K01A 4NF6A 4MLQA 4YAHX 3WAEA 4UACA 2NXOA 4BLAA 1EU8A 2VD2A 4RXLA 3O29A 3VV5A 2DXYA 1Z7ME 1B3EA 1I69A 3MVZA 1YAEA 3T93B 3FJ7A 1R6ZA 4RPOA 2P1SA 3C32A 5DYHA 1LAHE 1FTKA 4NF8A 1SI0A 5DVFA 3T9VA 4X1DA 1O64A 3JV9A 1JVXA 3MVXA 1Y3PA 3SEWA 4TLMB 4FE8A 3FVNA 3K4UA 4ZEKA 4OYVA 2RCBA 4TQUQ 5IKBA 2XXUA 2ZYNA 4Q5TA 1QKAA 2PBWA 3EHUA 1LGBC 2WKYA 2O1MA 5CRYA 4NF4A 2F97A 1PC3A 1QKBA 2XXPA 4QFLA 3DP6A 1D9YA 3KN7A 2X7PA 2I0BA 3LSWA 2QMWA 4IY6A 1US4A 1VR5A 4RK2A 4LZ5A 3FJMA 1GGGA 3BBRA 1JETA 4G68B 1B2HA 5AA4A 2HFBA 3U93A 4U23A 1A55A 1FW0A 2HAVA 3A3UA 4F31B 2RC9A 1BP5A 4YB5A 4NE4A 3TDJA 2HQ0A 1Q35A 1N3XA 4POXA 3E9XA 3TCFA 4M4GA 5HBCA 4E0XA 5CMCA 3MZBA 1LAFE 4EXLA 2I3VA 3UORA 4GLIA 2HCAA 3V89B 2D3IA 4U1ZA 3KG2A 5DEXA 4ECFA 4F2QA 2XXTA 5TU0A 1EH3A 3VDFA 3EF7A 4QSDA 1NMUA 3E13X 4G77A 3LSXA 1QUJA 4F3PA 3OSQA 3L6GA 1B52A 4YB7A 3OENA 2IA4A 3QYTA 3FATA 1QW0A 4F3GA 1YTVA 2Y7IA 3BFUA 4ONYA 1AL3A 5I57B 3ZKKA 3FGSA 4NF5B 1TT1A 3E4RA 1JQFA 2LAOA 4FECA 5L9OA 3THIA 4QFKA 3CFLA 2YPNA 3CR9A 5I2KA 4G2ZA 1D4NA 1WVJA 3G7WA 1LAXA 4YB6A 1H76A 1A99A 2DE4A 2UVJA 2PVUA 4KPTA 4GL0A 5F1QA 4C0RA 3HV1A 3W9WA 4QRZA 3I5OA 3H06B 1NNKA 5I59B 1SYIA 2O51A 3RNNA 1XVYA 3R6UA 4KCDA 4YKPA 5CI5A 2DOJA 4XKRA 2F7BA 3CSGA 2V25A 4LQ5A 3TAJA 3RLFE 3JZJA 3TPAA 3FXQA 1UTBB 4ZEFA 4OERA 2OCUA 1OVTA 3IR1A 2UXAA 1ZKBA 1FQBA 4JWOA 1MH4A 1P1QA 2VOZA 1XHYA 3TQLA 3FVKA 1CB6A 5H8FB 4MLVA 5CBRA 1S50A 3ZKLA 1IXHA 1FTLA 1JEVA 1QUKA 3QAXA 3TQWA 1B7HA 1OMPA 4GVOA 3MVWA 1PB7A 4OVJA 1IXGA 3L6HA 1ZJLA 4TLLB 1LCTA 3ONMA 2I4BA 4GL8A 5I56B 3VVDA 1M5BA 1Y1MA 2AL5A 1FTJA 4KQPA 2CMOA 1MRPA 4WEPA 2XXIA 3FXRA 4JBZA 3W15C 4U4XA 1JW1A 1VFDA 2F36A 3H6VA 3K6XA 1ZLQA 3T96B 1AMFA 1POY1 4OETA 4YU0A 3CIJA 3H03A 4JSDA 4FEDA 2F7AA 4DDDA 5H8HB 4U4SA 3VLWA 1DOTA 1GTKA 2AYSA 1NFTA 2ZNUA 4YKKA 2XX7A 3OMBA 4HCWA 3E3KA 4BDNA 4HCYA 1XS5A 3IOTA 1URSA 4YKIA 2PX1A 3UK4A 5I2NB 1IQ7A 5TP9A 4DXBA 4H6DA 4ELQA 5CM6A 3IB2A 3T9HB 1P99A 1N0TA 2GFEA 2V3UA 3WAFA 5ELVA 4N6PA 4UA8A 3H3GA 3DM0A 4RK9A 5JTYA 5JEIA 3R7XA 1DPEA 4OQOA 3PUZE 3QUFA 2I4CA 1M5CA 3LR1A 4ZZEA 2F78A 3BKIB 2DE2A 2Y7RA 3IOWA 5LOMA 1Y3QA 2XXHA 3KEIA 3OO9A 1II5A 3TUSA 5J1DA 4F3SA 3PPQA 3VXBA 3S9LC 2RKMA 2XHDA 2GH9A 1YPNA 3FXUA 4R9FA 3RY3A 3B6QA 3T66A 1LSTA 4EXKA 1H3DA 3BFTA 3IJXB 4I62A 5DT6A 3V8XB 2I6EA 1P1OA 3MQ9A 4EDPA 4F1UA 3RQTA 2AL4A 2RF1A 2Y7WA 4R2FA 5AE4A 1S7YA 5K2XA 2H9BA 4QSCA 3R26A 1SYHA 4BDOA 2DVCA 3O66A 1OLAA 4F2OA 3HN0A 5KCJB 1UTHA 2RINA 4RNSA 1RYXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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