2XXRA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) wild-type lbd dimer in complex with glutamate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
SLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
total genus 86
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxrA02
3TYHA 1B1HA 3Q28A 3RT8A 2DP8A 4GOTA 3OMBA 2XXUA 1CE2A 4R72A 3EHTA 4KYSA 4YKJA 3QUJA 1MG1A 4LA9A 3Q25A 3TTLA 1NNKA 4IGRA 3HO7A 3LSXA 2QJEA 5AA1A 4YB6A 3K01A 3C36A 3FJGA 4R6KA 5DTBA 4JXIA 2Z8EA 2XXHA 1LCTA 4FEDA 5F1QA 1B7ZA 2XXQA 3R6UA 2H98A 3C35A 4OETA 1FTOA 4UA8A 4AQ4A 1FQEA 3K6UA 2PYYA 2F7AA 4XIGQ 3IB1A 4TLMB 4H8IA 3F11A 3S9LC 2XX7A 3N6TA 2ZNTA 4LP2B 4UACA 1MQGA 1NMUA 1PB8A 3VLWA 2DYXA 2GRVA 3RY3A 2P2AA 1B40A 4DXUA 1I6BA 3MVZA 2XX9A 1BKAA 4H5GA 1US5A 5AA2D 3RTFB 4HCYA 1LFIA 3QIMA 2I0BA 1URDA 5I2NB 3LBSA 3K00A 1SW5A 4QF9A 1LAFE 3SEWA 1FQAA 5A5XB 5BWJA 2XD3A 2UVGA 4FATA 1JVYA 2D5WA 3GBBA 3LC8A 1B5IA 4DLDA 4KQPA 1SW4A 4U4XA 4YKIA 3RTWB 1PC3A 5H8SA 3FD3A 4XKNA 2I0CA 4IB2A 2XX8A 2H99A 2F97A 2XD2A 4DXBA 1QUJA 3C4MA 1OVTA 1VE4A 3CI8A 4F2QA 4G68A 1XVXA 2XXWA 2QS1A 2HZKA 2DWJA 4YMBA 3THIA 2Z8FA 1RKMA 1Q35A 2YPNA 2GHAA 4OERA 1R1NA 3ECRA 4TLLB 5JTYB 4U21A 4ZECA 2DOJA 3PMVA 4F1UA 1MY1A 5DEXB 3VXCA 4YMAA 4Q5TA 4AB6A 5ITPA 4QFPA 5LOMA 3IK6B 3LR1A 4G4PA 4R2BA 5DVIA 1HSJA 1A55A 4DE8A 4EDPA 1MQDA 3KOSA 4ELPA 2ZYOA 4YICA 5J1DA 3E3KA 4OFLA 1N76A 4IY6A 3G3FA 4XKPA 5CMMA 1N3XA 5BUUA 3KZGA 4EQ9A 1PBPA 4KYEA 4GIZA 3KEIA 4GXAA 4MFIA 4N07A 5I2KB 2NVUB 5KCJA 1NH7A 1WVJA 2R71A 1F9BA 1MQHA 4RPNA 5I58A 1I6AA 3JYRA 4IY5A 3W9VA 3O9PA 4G2ZA 3N94A 3HHFA 3H6UA 1YPNA 1DTGA 3KOTA 2XXRA 4KCDA 3U94A 2V93A 3USDA 3UP9A 1IIWA 3M3FA 4JSDA 4WXJA 1AOVA 4TOZA 4YAHX 4GVOA 1LFHA 2RINA 3G3HA 5FHNA 4ISUA 5KCJB 1D9YA 3SEYA 2O7UA 1MXZA 3FXRA 3O6HA 1SBPA 4NF5B 1B3LA 3K1NA 1A40A 1OVBA 1NL5A 3S9NC 3PPRA 1LBBA 5CMKA 2Y7WA 4R2FA 3AXFA 1H76A 5ITOA 4OXVA 3I5OA 4EQBA 4EQ7A 2R9JA 1R6ZA 1N84A 4FJPA 1AMFA 3T22A 3LUYA 3ZSFA 4R73A 1B05A 4C1UA 3FZVA 4XXUA 1B51A 5I59A 2O1MA 4LQ2A 4ZEDA 2THIA 3ZS6A 4NF6A 3K1MA 2AYSA 2F36A 4RXLA 4F3GA 3IOTA 5L9MA 1Y3PA 1AIVA 3K6WA 3OEMA 3CVGA 2PVUA 3FXUA 1FTJA 4F1VA 4ZEFA 1B9JA 5CM6A 1B2HA 1XS5A 4OWDA 4RYAA 3KN8A 3C32A 2ZNSA 1IXIA 3UGWA 1N0TA 3OSQA 4RA1A 4DZ1A 2IEEA 1NH8A 1IXGA 3BFUA 5I59B 1DMBA 5DYHA 1UTBA 3R7XA 5HPQA 2I4BA 4NF6B 4L17A 1POTA 3HV1A 2IA4A 1OQHA 3HHGA 3LSFB 1YTVA 1SVXB 1Q1KA 1JW1A 1MRPA 1FQFA 1IQ7A 5H8NA 2F5XA 3TUSA 2DWAA 1H44A 3B6TA 2LAOA 1SI1A 4PFWA 5AA2A 1POY1 2I3WA 4MLVA 4F18A 3QYTA 4EXLA 5TP9B 1DOTA 2ABHA 2B65A 1BTJA 4H8JA 3T66A 4I1DA 3MP8A 3B6WA 2F35A 3K0VA 3QAXA 1GGGA 4JB7A 3V83A 3TQWA 3FVKA 1LFGA 2F34A 4ELQA 1N3WA 4Z0IA 4F31B 3MZ1A 1IEJA 5AA2B 4KPTA 2ALUA 4GF8A 1D9VA 5CMCA 4Q30B 5AA3A 1FTLA 4ESXA 2YLNA 4MF3A 4IO7A 1M5DA 2KLFA 2HCAA 3KGCA 1J1NA 1MY0A 4OENA 3CR9A 1Y1ZA 1DPPA 4OMBA 2ZYNA 1EZOA 4RK9A 1P1UA 4LATA 1SW2A 4F3SA 1Z7ME 3H6VA 1ATGA 3IX1A 4OTEA 2VD2A 4ZEIA 1LB8A 4C0RA 2ONKE 3SKPA 4O3BA 4G77A 3MPKA 1OQGA 1P1OA 1XVYA 2PT2A 5ELVA 1OIBA 4HCWA 3Q29A 2I58A 5B70A 1B52A 2FA7A 3WAEA 4R9FA 1EZPA 1NKXA 4ECFA 4ZDMA 2HXWA 1A8FA 3DELB 4JDFA 2OCUA 1B1XA 3N5LA 1WODA 3EPEA 4NMYA 2Q89A 2V84A 4E0XA 3RN8A 2P0SA 3O6GA 2F78A 2Y7IA 2WKYA 3KBRA 2RCAA 1O7TA 1SQYA 3H6WA 4WEDA 5H8FA 1YAEA 3O2AA 5FHOA 4YB7A 3CIJA 4KD5A 2FYIA 2OZZA 1ANFA 4PFYA 4U1ZA 1B46A 4XTCQ 4QFKA 3T9UA 4U23A 3SEVA 4F39A 2RF1A 1ZKBA 2UVJA 5CMBA 4IO3A 3MVWA 4PQJA 2V25A 1JEUA 4P0IA 4GD5A 4U1OA 1O63A 1ZBMA 1MXWA 1A99A 5EYFA 1Z7NE 3PGFA 3OO9A 2D3IA 2DXYA 2E0SA 2I4CA 4XKQA 3PMXA 2DE2A 1XHYA 3SERA 1FQBA 2A5SA 2F6PA 3G3JA 1Y3NA 5K2YA 1LBCA 2UVHA 4YU0A 4LZ8A 4RY1A 3TPAA 4Z7EA 5K2XA 3KG2A 3IOVA 3VDFA 5JEIA 1P1QA 3IJOB 4GLIA 1TT1A 4BDLA 4YKKA 2RC8A 2Y7KA 2YJPA 1B32A 4POWA 3DP6A 2VHAA 3TELA 4H65A 3TEPA 1ELJA 2RC9A 3C9HA 3VV5A 3MQ9A 1ZIUA 4X48A 1AH5A 5CBSA 2QSXA 2OK2A 3TZAA 3MBPA 3RLFE 5CI5A 4BDRA 4IO4A 4LUBA 5AA4A 1MH4A 3L6GA 4NF8A 1B0HA 1JETA 4I8CA 3K6XA 3SETA 2ONSA 4O3CA 2Z23A 3PPQA 3U8QA 2DS9A 3FJMA 3R26A 3TAJA 4G68B 4Q0CA 3W15C 1SYHA 3S2VA 5CRYA 1S50A 1MS7A 3SEXA 2P1SA 3MVXA 3H4ZA 2H4IA 1H45A 2H5YA 2Z8DA 3PUWE 5CBRA 2VGQA 2PT1A 3TDJA 1JEVA 1M5CA 3ZKLA 3UK4A 3C34A 3G3KA 2X7QA 1P99A 3MPLA 1MXYA 3SDFA 4NE4A 3RQTA 4GL8A 1IZ1A 4JBZA 2XXTA 1NNPA 1PEBA 2OBGA 4M4GA 3M8UA 2XXIA 4ELRA 1NNTA 4NWDA 1XC1A 2REGA 4N13A 4DXCA 5EHSA 2DE3A 1S9TA 3MP1A 3FV1A 3K2DA 3OO7A 4DCXA 3PD9A 2O51A 2Z22A 4QFOA 4ZEBA 3T9VA 3JV9A 3CSGA 2F7BA 4U4SA 4X1DA 3RPWA 3VLUA 5FTHA 5I58B 1B7HA 4H0WA 3VXBA 1ZJLA 2W7YA 3E9XA 3FATA 4BDQA 4MH5A 1JW4A 1YCJA 3GZGA 4OEVA 2ZXTA 1AL3A 1PBQA 1H3DA 2UXAA 3U92A 1TXFA 5B7DA 1BLFA 1B4ZA 3M3KA 4ONYA 4R6YA 3BKIB 1LCFA 3IO4A 3A3UA 4R75A 1PDAA 5H8HA 2XXPA 3RT6B 2A5TA 1LB9A 3E13X 3RGYA 2D21A 1MDP1 1UIUA 5L9OA 4ND9A 4ZS9A 1H43A 3HN0A 1GTKA 1B5JA 4OYVA 4BDNA 2DWHA 3CRBA 1IXHA 3IB2A 1LLSA 1MXUA 1KWHA 1Y9UA 3G3GA 3TTRA 2OLBA 4P11A 3GXAA 3ILUB 1B58A 1B7UA 3LSWA 3QUFA 5TPAA 4F3BA 3U1OA 5AE4A 5ISUA 5I57A 2A5TB 4JWOA 3T9HB 1I6QA 2GFEA 4JWXA 5IKBA 3PV0E 1ZTYA 2F8DA 4BLAA 4GWOA 3OOAA 1P1NA 3PPPA 3H03A 4IO2A 1UTBB 1A7LA 3OD7A 2ZMBA 3CFZA 3TMGA 2UVIA 4ZEKA 4R74A 4R6HA 1SW1A 4OFOA 1DPEA 1SI0A 3PUYE 2I3VA 2Q88A 4FAJA 1UIVA 4ZE9A 5H8NB 1VFDA 2HEUA 4THIA 4WEPA 3FUZA 2RKMA 3OENA 4KI0E 1MM7A 1SDXA 1M5FA 5KDTA 4KCCA 4OQOA 3TCHA 1R9LA 2VOZA 4G68C 1MXVA 4F3PA 4ZZAA 1N7WA 3VVDA 1N04A 2DSFA 1QKBA 3IOWA 3FIRA 1D4NA 4WKMA 1BIYA 3DLNA 4NTLA 1QUKA 1QKAA 3VLVA 1HSEA 2NUVA 1LAXA 1T0KA 4POXA 4MBPA 1EU8A 2DWIA 1PB7A 3I6VA 4U2RA 5L8DA 4EXKA 3OSRA 3TTMA 1B4HA 4E0WA 4ZZEA 1FW0A 4GL0A 3UIFA 3MW0A 3RNNA 1R9QA 3SESA 3CG3A 1M5BA 1DTZA 3LSLA 4P0GA 3B7DA 5DT6A 1USYE 2DVZA 1Y1MA 3HSTA 4HS7A 3DM0A 5DVJA 1B3GA 2CMOA 1PB9A 3A3CA 5JK4A 5H8QA 4LZ7A 1UQWA 2ANJA 1URSA 3FVOA 1QVSA 2O84X 3H7MA 3K1PA 4RK2A 3MZ9A 2PX1A 4NEDA 3FVGA 3OO8A 4GRKA 1TFAA 3PD8A 3GLBA 3FGSA 3EHUA 2B3BA 3EN3A 1Y4CA 3UA8A 3EQ1A 3RUMA 3DP4A 2AL5A 1Y4TA 1CB6A 5H8QB 3K02A 3ODBA 1O64A 1B0LA 3KN3A 2NWJA 3N6UA 3CFLA 3Q27A 2X7PA 2AIXA 4G8HA 3MVYA 3TCFA 1LAGE 2FNCA 4EUOA 3IAZA 3S9MC 2GHBA 5F7VA 5TU0A 2NXOA 1TFDA 3WAFA 3FJ7A 3BFTA 2UYEA 4N6PA 1MPCA 5H8FB 4DCYA 2HAVA 3JZJA 3N26A 3UN6A 4X1BA 5I2NA 1LGBC 1EZ9A 2Y7PA 1FQCA 1WDNA 2QS2A 1MH3A 1MQJA 3KN7A 2QS4A 5A5XA 3E4RA 4AB5A 3IR1A 3KFMA 3V5AA 1JQFA 2CZLA 2VD3A 1FCKA 3QXMA 4TQUQ 3OO6A 2I6EA 3TTNA 3VFJA 2OWTA 3QSLA 4FEBA 3MAMA 1MPBA 3KJTA 2PMSA 3C31A 4OVJA 2O7IA 1XT8A 2UYFA 2H9BA 1B3EA 3O6IA 1LSTA 2F7CA 3D4GA 4LVQA 3C33A 2ZYKA 3TFLA 2Y7RA 4EF1A 3A09A 1JW5A 4FORA 3IORA 5JTYA 3P7IA 4ESWA 4NF4A 1P1WA 5DEXA 1B3FA 3L6HA 1GR2A 1VSOA 3O28A 4PFUA 5DVFA 3M3LA 3VVEA 3CFXA 3TQLA 4H67A 1ZMGA 3KJ7A 4LZ5A 2XXXA 4BDMA 3U93A 3U72A 4QSCA 3K4UA 3I3VA 2DE4A 4PE5B 4IO6A 1RYOA 3ZKKA 4I9DA 2M8CA 2I49A 4YKPA 4LONB 2REJA 1N7XA 4F1YA 4NF4B 1OLCA 3ILTB 2AL4A 4U22A 3VE1B 5ICTA 1D3KA 5I2KA 5AA4B 3IL1B 3H06B 1SD3A 4NF8B 1QJMA 1DSNA 1OMPA 3D4CA 1FTKA 1HSLA 2XXYA 2R6GE 2XHDA 4QHQA 3FVNA 5KZTA 5FTIA 4C1TA 3SEUA 5HBCA 2ONRA 1A8EA 5I84A 1MXXA 4BDOA 4IGTA 2QMXA 2HZLA 2Q2AA 4ELOA 3DP8A 5L9SA 3VVFA 1RYXA 4FIMA 4MLQA 4YZZA 4PP0A 1JVXA 1MY3A 4OFJA 2X26A 3MZBA 2DQVA 3KSJA 4NF5A 3EF7A 3GBAA 3KSXA 2GH9A 1VR5A 1MPDA 4M1VA 1TWYA 5FHMA 2QS3A 3OXNA 4HTGA 3QK6A 1IITA 1L5TA 3PPNA 1ZU0A 3MJNA 2Q8JA 2OWSA 4OEUA 4KHZE 1XOCA 2BJJX 4F2OA 2O6AA 1II5A 2ZNUA 1FQDA 3FASA 3H6TA 1LAHE 1BP5A 1Y3QA 2QRYA 2HAUA 2H25A 2O69A 4H6DA 4RNSA 3IOUA 1MM6A 5IAIA 3MC2A 1MY4A 1URGA 3HCQA 2PBWA 4H5FA 1GVCA 3EHSA 3UORA 1M5EA 3PMWA 1US4A 3T9XB 4DDDA 3FXQA 3HPIA 1A54A 3CSBA 1IUDA 3PUZE 3O97A 2B3FA 4F22A 4QRZA 4O3AA 4OESA 4NWCA 1GV8A 2G93A 3T96B 4LQ5A 3G7WA 1I69A 2V3TA 4IO5A 1UTHA 3IJXB 4Q8RA 1MY2A 3H3GA 1EH3A 3IO6A 2QMWA 5ICQA 3G3IA 4KR5A 1QW0A 2HQ0A 2DVCA 2V3QA 2ESNA 4K3FA 3ONMA 3S9EA 5H8HB 3IB0A 3O29A 2RCBA 4QSEA 3PUVE 2I48A 4EF2A 4R9GA 4F19A 4FECA 4X9TA 4DIGA 5TP9A 3BBRA 2QL3A 3T93B 2E1SA 5HM4B 4I62A 1UTHB 1FTMA 4JWYA 1VFEA 2QPQA 4QSDA 3S4UA 5CC2A 1SYIA 4PFTA 1QUIA 2ZYMA 2Y84A 3OEKA 2V3UA 2O1LA 5TPAB 3PPOA 2XXVA 3MWBA 2DXRA 4KFQA 5I57B 1NNFA 4GFRA 4QFLA 3B6QA 4JSOA 3K6VA 2Q9TA 1OLAA 3TCGA 3V8XB 4G8NA 2O68A 1S7YA 2RC7A 1IXCA 3TKDA 1MQIA 4HW8A 2NOOA 5EHMA 5I56A 4YB5A 2OJTA 2HFBA 4H1XA 4RJZA 3MP6A 4GXSB 3TTKA 2Q2CA 1B3HA 4PETA 3PU5A 4F29A 4KYDA 5KDTB 1JNFA 4GQOA 1ZLQA 1NFTA 4OZ9A 4RPOA 4OHNA 1MDQA 3W9WA 3MUQA 4ZE8A 3Q26A 1Y20A 1USYH 4QFNA 3OELA 5I56B 1B6HA 3V89B 4G8MA 4FE8A 2G29A 1B5HA 3O66A 5M2VA 3FV2A 2VP1A 3TODA 1QULA 4XKRA 3PUXE 3CG1A 2F6GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TYHA 1B1HA 3Q28A 3RT8A 2DP8A 4GOTA 3OMBA 2XXUA 1CE2A 4R72A 3EHTA 4KYSA 3HFUA 4YKJA 3QUJA 4GX6A 1MG1A 4LA9A 3Q25A 4DI4B 3TTLA 1NNKA 4IGRA 3HO7A 3LSXA 2QJEA 5AA1A 4YB6A 3K01A 3C36A 3FJGA 4R6KA 5DTBA 4JXIA 2Z8EA 3EKIA 2XXHA 1LCTA 4FEDA 4QXDA 5F1QA 1B7ZA 2XXQA 3R6UA 2H98A 3C35A 4OETA 1FTOA 4OVQA 1LBWA 4UA8A 4AQ4A 1FQEA 3RYDA 3K6UA 2PYYA 2F7AA 4XIGQ 3IB1A 4TLMB 1VDWA 4H8IA 3F11A 4XEQA 4GWUA 3S9LC 4NX1A 3MYUA 4PE3A 2XX7A 2WYPA 3N6TA 1FPKA 2ZNTA 4LP2B 4UACA 1MQGA 1NMUA 1PB8A 1FPEA 3VLWA 2DYXA 2GRVA 3RY3A 2P2AA 1B40A 1IMDA 4DXUA 1I6BA 1QGXA 3MVZA 2XX9A 1BKAA 4H5GA 4UABA 1US5A 5AA2D 3RTFB 4HCYA 1LFIA 3QIMA 2I0BA 1URDA 5I2NB 1G0HA 3LBSA 3K00A 1SW5A 4QF9A 1LAFE 3SEWA 1FQAA 1Q9DA 5A5XB 5BWJA 2XD3A 2UVGA 4FATA 1JVYA 2D5WA 3GBBA 3LC8A 2CEXA 1B5IA 4DLDA 4KQPA 1NUWA 1SW4A 4U4XA 4YKIA 3RTWB 4P56A 1PC3A 5H8SA 3FD3A 4XKNA 2I0CA 4IB2A 2XX8A 2H99A 2F97A 2XD2A 4DXBA 1QUJA 3C4MA 1OVTA 1VE4A 3NOHA 3CI8A 4F2QA 4G68A 1XVXA 2XXWA 2QS1A 2HZKA 2DWJA 4YMBA 3THIA 2Z8FA 1RKMA 1Q35A 2YPNA 2GHAA 4OERA 4TLLB 1R1NA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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