2XXVA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) m770k lbd dimer in complex with kainate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
SLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPKGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
total genus 85
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxvA02
4PFTA 1A8EA 1P1UA 3O6HA 3V8XB 2R71A 4F3GA 3RN8A 3KN3A 3F11A 1Y3QA 3S4UA 4NF4A 1A54A 3MPLA 3C31A 4EUOA 1MY3A 4JSOA 2CMOA 2O6AA 1F9BA 3OENA 3TQLA 3MVWA 3IOVA 4GRKA 2I4BA 4F3BA 3TUSA 4OHNA 3HPIA 4U1OA 1B46A 1HSLA 1BIYA 2ZYOA 5H8NB 3JV9A 3LSLA 4JXIA 2OBGA 4G8NA 3GXAA 4GXSB 1KWHA 1FQDA 1B51A 1TFAA 3G7WA 1B1HA 4H8IA 4JSDA 1D4NA 3OXNA 4P11A 5JTYA 1ATGA 1WODA 3CSBA 4IGTA 3SEVA 3HCQA 5DEXA 4EQ7A 1MDQA 3T9UA 2H9BA 4ZEIA 1M5BA 5B70A 2H5YA 4ESXA 3E13X 5I58A 1JNFA 3ILTB 4XXUA 4QF9A 1FCKA 4R6KA 1AH5A 2I48A 1SDXA 2O7IA 1IEJA 1XVYA 2QSXA 5KDTA 3IR1A 1MQJA 1RYOA 5CMBA 1JVXA 1LB8A 4YB7A 4C1UA 2PT1A 2I0CA 2GHBA 5I2NB 4RYAA 1B0LA 1SYHA 2VP1A 2HZLA 2F6GA 4POXA 3FATA 3H3GA 1H44A 1ZU0A 1TFDA 1LAXA 1VSOA 1LSTA 3RGYA 3EHTA 5ITPA 2NUVA 2YPNA 1XHYA 3K1MA 2QS4A 3K00A 1MXZA 1EZ9A 3PUVE 4ELQA 5I2KA 3DP6A 4YU0A 3U1OA 1FQEA 3S9MC 1Y3NA 1URDA 1NNTA 3FUZA 1HSJA 1UTBB 3C32A 4XKRA 1BP5A 3MUQA 3S9LC 1AMFA 3UP9A 4RJZA 2IEEA 3TAJA 4HCWA 2VGQA 4RXLA 1MPCA 1R9LA 5DT6A 2HAUA 5DTBA 3S9NC 3SEUA 2I58A 1LFHA 1JW5A 2R6GE 2DE2A 4EF2A 3PD8A 4U21A 5TPAA 5ICQA 1LCTA 1IIWA 4G68C 1DMBA 3PGFA 2QS1A 1R9QA 2OWTA 3ONMA 5DVIA 2X7PA 3V83A 4ZZEA 3T9HB 3CG3A 2H99A 3T66A 3LUYA 5AA3A 4Q8RA 3QK6A 1M5DA 2ESNA 3QSLA 4U23A 4YAHX 3TYHA 2IA4A 2DS9A 4P0IA 1PB8A 3KBRA 3M3KA 3PV0E 2PT2A 2ZYMA 4KYEA 4U4SA 4FE8A 4OEUA 3OEKA 4NTLA 2HXWA 1LFGA 4PFWA 3M3FA 3IL1B 3I6VA 2V25A 1B2HA 5ISUA 5KCJA 2I0BA 4X9TA 4TOZA 4ZEDA 2OK2A 4ELRA 2GFEA 2I3WA 3RLFE 2VD2A 1DOTA 3FVOA 3PUXE 2OJTA 3TTLA 1MPBA 3LSFB 2QS3A 2OCUA 1B32A 1T0KA 3G3FA 3PUYE 3FGSA 3TTKA 4H5GA 4IO4A 3LSWA 3K1NA 1ZKBA 2NXOA 3R26A 1URSA 3VE1B 1USYH 1Q1KA 3BFTA 2FA7A 3Q26A 1B3HA 3E3KA 3KEIA 1OVBA 4DXUA 3N6UA 1MQDA 5L9OA 4RNSA 4F22A 4UACA 3OSRA 1BKAA 2Q9TA 2XX7A 4THIA 4EQ9A 3MP1A 3CIJA 2E1SA 4TLLB 5F1QA 2REJA 4Q0CA 4ECFA 3IOWA 2UYEA 2YLNA 1LBCA 4HTGA 1EZOA 5CM6A 3TZAA 1IZ1A 2ZNTA 5I84A 5TU0A 2DXRA 1QJMA 4MFIA 2I4CA 2XX9A 2O84X 4G4PA 2HFBA 1LAGE 4UA8A 1QKAA 2Y7IA 3G3KA 5DVJA 3KJTA 3H06B 5L9SA 1D9YA 4BLAA 2Z8FA 5IKBA 4H5FA 3SKPA 2YJPA 4M4GA 4MLVA 3FV1A 1XC1A 3C35A 3C9HA 3IO6A 3KN8A 1Z7NE 3CI8A 4L17A 3IB1A 1LLSA 2F34A 2CZLA 3HO7A 3KOSA 4AQ4A 3KN7A 4Q5TA 2DP8A 1DPPA 4NE4A 4G2ZA 2UVGA 4R72A 1A7LA 3M8UA 4QRZA 2QMXA 3G3GA 3O29A 1SI1A 4H0WA 1GR2A 2XD3A 1B4HA 2ZYKA 3Q29A 2PVUA 3DP8A 1B40A 2F7BA 4YB6A 3KFMA 3MVZA 5DYHA 2F36A 4F19A 1B5HA 4Z0IA 5H8NA 1Y4CA 2Y84A 3IO4A 1OLAA 4DDDA 3EHSA 3UGWA 1SBPA 3OO8A 5H8HA 2F78A 1JVYA 3C4MA 1SQYA 2RF1A 4JDFA 1M5EA 5AA2B 3FXRA 4GD5A 5AA2D 1IITA 4PE5B 4KR5A 3K6VA 1LFIA 4PFYA 2ZXTA 3GBAA 1P99A 1Y1MA 4FECA 3EN3A 4KCCA 3KOTA 4O3CA 4QHQA 4E0XA 1LB9A 3BFUA 3G3JA 1POTA 1MQIA 4NF5A 3MBPA 4NF6B 4M1VA 4ZE9A 4YKIA 3HHFA 4N13A 3EHUA 4YZZA 3TTNA 2F5XA 2ZNSA 2UVJA 3TKDA 3THIA 1L5TA 3IJXB 5CMKA 1TXFA 1WVJA 3CFLA 1BLFA 3HSTA 5I2NA 5H8FB 3Q28A 1CB6A 3UN6A 4TLMB 1EZPA 3K6UA 3WAFA 3VLVA 3G3HA 4R73A 3O6IA 3IB0A 1MXUA 3O97A 2VHAA 3HV1A 3TCHA 4LZ8A 2V3UA 3CSGA 4GQOA 4LQ2A 4OETA 3IAZA 2H25A 2Z22A 2H4IA 1PEBA 3IOTA 4ESWA 1CE2A 3A09A 1MXWA 4G68B 4Q30B 2P2AA 3TELA 3VDFA 3UA8A 3IB2A 3B7DA 1ANFA 2O7UA 4KHZE 3B6QA 5FHNA 3H6TA 1LBBA 1B5IA 3MPKA 2Q88A 4FATA 4ZEKA 3ODBA 3GZGA 4XKPA 4FORA 4NF8A 4NF4B 3N26A 1M5CA 4R2BA 1N7WA 1B5JA 2Y7RA 5H8QB 3TMGA 5I57A 1ELJA 3VFJA 2DWJA 1UIUA 3FASA 3U8QA 3KG2A 3A3UA 3N5LA 2QJEA 4ELOA 2DVZA 3K6WA 3FXQA 3H4ZA 3TEPA 2DE4A 3N94A 1GGGA 3KSJA 1GV8A 3B6TA 4R75A 3VLUA 4X1DA 4RK2A 1USYE 3PMWA 3BKIB 3MWBA 4PETA 2UXAA 3K01A 1AL3A 4ISUA 2RINA 1B3LA 3MZ1A 3IORA 4QSEA 2O1LA 1NNKA 5BWJA 1OIBA 3RY3A 2DYXA 2ONKE 3GLBA 5ELVA 4MBPA 1RYXA 4IO5A 1Y4TA 3E4RA 5EHSA 4RPNA 3OOAA 5I59B 2F8DA 4QFNA 4ND9A 5JTYB 5TP9B 1OLCA 3DELB 1JETA 2XXYA 2E0SA 4EQBA 1M5FA 1YCJA 5KZTA 1MQHA 5A5XA 4IB2A 3MC2A 4JWXA 1FTOA 1SI0A 1SW1A 5I58B 2THIA 1GVCA 4F18A 2WKYA 1XS5A 1FTLA 4LATA 1GTKA 4BDQA 4F1VA 1B7HA 4LP2B 5LOMA 4LZ5A 4R9FA 1MH4A 1FW0A 2QS2A 1VFEA 3PPPA 5CMMA 4H67A 3T9VA 1UTHA 2OLBA 3G3IA 1FQCA 1DPEA 1QW0A 2PX1A 3USDA 4U1ZA 2F35A 1II5A 3SETA 4LQ5A 3E9XA 3CR9A 3O9PA 4KYSA 2A5TA 3VVDA 2GRVA 2B3FA 4KFQA 1A99A 3D4CA 1AOVA 4IGRA 1Y20A 4F1UA 4OWDA 3QUFA 4QFPA 5DVFA 2H98A 4BDOA 2NWJA 4I9DA 5I2KB 4F3PA 1SVXB 3O6GA 4ONYA 3T93B 3DM0A 4MLQA 3TDJA 3N6TA 3KZGA 2XXPA 3RPWA 2O1MA 3CVGA 3L6GA 4H65A 4GLIA 3SEYA 3PPOA 1QUKA 3C33A 3MVYA 3UORA 4DCXA 3VXCA 3T96B 4PQJA 3SERA 1I69A 3FJ7A 1N0TA 1MS7A 5J1DA 1I6BA 3K4UA 4X48A 5AA4A 5M2VA 5TPAB 1US5A 4POWA 1SW5A 3TQWA 5I56B 2Z23A 2I3VA 2UVHA 3K0VA 1B0HA 3PMXA 1B6HA 3IJOB 1SW2A 3EF7A 2QMWA 1DTZA 4I8CA 3WAEA 5K2XA 2DWIA 3VXBA 4QFLA 1ZJLA 1PB9A 1MY0A 3QUJA 4R74A 3H6WA 3A3CA 4YKJA 1NKXA 4JWOA 3TCFA 3LSXA 4F39A 1Y3PA 3R7XA 3R6UA 2A5SA 4GFRA 3K6XA 4BDLA 1B1XA 4EDPA 1FTKA 1UQWA 2HZKA 4DXCA 3IK6B 4FEBA 4WEPA 1VR5A 1S7YA 2R9JA 1MY4A 4MH5A 1POY1 5CBSA 4IO3A 2DWHA 3K1PA 2V93A 2O68A 4KQPA 4WKMA 2XXHA 4ZE8A 2XXIA 1XT8A 1WDNA 3GBBA 3FXUA 3U92A 4XTCQ 1LAFE 4XIGQ 4GXAA 2G93A 5AA1A 4H8JA 2NOOA 4IO6A 1BTJA 2VOZA 3MW0A 3U94A 3FVKA 4YICA 3ECRA 4YMAA 4AB6A 4F29A 2RCBA 4C1TA 3C34A 2GH9A 1ZTYA 2PMSA 3JZJA 4N07A 3PUZE 1MQGA 2X7QA 3TCGA 3O28A 3UK4A 4JBZA 2RC7A 2B3BA 3FVGA 5EYFA 1TT1A 3RNNA 5CC2A 4WEDA 4OQOA 2XXWA 4FAJA 3FD3A 5IAIA 3B6WA 3K02A 2OZZA 4F31B 3KGCA 3M3LA 3RT8A 2LAOA 3PPQA 1PB7A 4KPTA 1MXXA 4LA9A 3P7IA 3RUMA 2DWAA 4JWYA 3PMVA 4GWOA 3EQ1A 4IY5A 4YMBA 1JQFA 4F3SA 3IX1A 1EU8A 1MXVA 3FJMA 1HSEA 4NEDA 4G68A 1NH7A 2AL5A 3L6HA 3LC8A 2ANJA 5ITOA 1N76A 5FTHA 4OXVA 2P0SA 4LONB 3C36A 1NH8A 3MJNA 1MH3A 2KLFA 4KI0E 2QRYA 4OFJA 3TTRA 1S50A 2RC8A 3TTMA 2ALUA 1A55A 1PBPA 4DIGA 3SEXA 5H8QA 1N7XA 2BJJX 3OMBA 4RK9A 1JEUA 4KYDA 4C0RA 2QPQA 1PDAA 2UYFA 5L8DA 4GL8A 1R6ZA 1O63A 5K2YA 2XXQA 4HW8A 2HAVA 1B05A 1MRPA 4FEDA 3ILUB 2DVCA 4G8MA 2RCAA 4ZS9A 1FQAA 4RA1A 4U2RA 3W9WA 2F7AA 1N04A 2DQVA 1O64A 4I1DA 2Y7KA 1ZBMA 2O69A 3S2VA 4OFLA 3FVNA 3ZKLA 5FTIA 4I62A 4PP0A 2UVIA 1DSNA 1MM7A 3DP4A 5H8HB 1Y1ZA 2XXRA 4DLDA 1H3DA 5HBCA 2AIXA 4DCYA 1B3GA 2XXTA 1URGA 1TWYA 2Q8JA 4QSCA 1UTBA 3AXFA 2Q2CA 5I59A 1FQBA 4E0WA 3TFLA 3ZKKA 4H1XA 2I49A 1VE4A 3V5AA 4WXJA 1PBQA 2ZMBA 5TP9A 3HN0A 3ZS6A 2P1SA 2ZNUA 4KD5A 3CFXA 4ZEFA 4EXLA 3MZBA 2FNCA 5JEIA 3U72A 2RC9A 4NF5B 2ZYNA 1NFTA 4OERA 4TQUQ 4XKQA 2V3TA 1FTMA 1NL5A 2B65A 1LCFA 3PPRA 3MVXA 3MQ9A 1P1WA 1I6QA 4HCYA 2DXYA 1SD3A 4RY1A 1YAEA 5AE4A 1Z7ME 4X1BA 1SW4A 1P1QA 2I6EA 5CI5A 3RTFB 2REGA 3CG1A 2XX8A 3CFZA 4DXBA 2G29A 1FTJA 2HQ0A 1XOCA 4OVJA 1QUJA 4PFUA 1B7UA 4F1YA 3HHGA 3BBRA 1LAHE 3I3VA 4AB5A 4N6PA 5ICTA 1MXYA 4ZECA 3MP6A 4R6YA 4YKKA 3KSXA 3OSQA 1OQHA 2RKMA 3VLWA 3ZSFA 2HCAA 4GIZA 1XVXA 1QULA 1JW1A 2DE3A 3IOUA 3UIFA 1ZLQA 2F7CA 5DEXB 4K3FA 3TODA 3QYTA 3PU5A 4RPOA 3FZVA 1NNPA 3PUWE 5H8SA 4HS7A 1MY1A 2HEUA 4R6HA 4R9GA 4QFOA 1B52A 4F2OA 5F7VA 4NF8B 5KDTB 1QVSA 1YTVA 4OFOA 1US4A 2XXXA 5I57B 1Q35A 1B3FA 1B9JA 4NWCA 1MY2A 5I56A 4F2QA 3FIRA 5FHOA 3SESA 2M8CA 3O2AA 4FIMA 4Z7EA 2W7YA 2ONRA 2F6PA 3H7MA 4QFKA 3H6UA 2O51A 2XXVA 5FHMA 1IQ7A 3QXMA 3FJGA 4ZZAA 1N84A 2XD2A 3VV5A 3LBSA 3H6VA 2AL4A 3D4GA 4BDNA 5B7DA 1ZIUA 3W15C 4MF3A 1IXGA 1OVTA 3O66A 3T9XB 1H45A 1J1NA 5JK4A 4DE8A 3RT6B 1FQFA 4R2FA 1Y9UA 2DOJA 4DZ1A 2D3IA 5CMCA 4YKPA 2VD3A 4U22A 4IO7A 2QL3A 4KCDA 5A5XB 1VFDA 4H6DA 3TPAA 3Q27A 1NMUA 4JB7A 1QKBA 1JW4A 2V3QA 3Q25A 3MAMA 1OMPA 2Y7WA 4XKNA 4IY6A 4OENA 3S9EA 2Z8EA 4FJPA 1O7TA 2OWSA 4EF1A 1LGBC 3OO6A 3VVEA 5BUUA 4OMBA 1S9TA 1UTHB 4ZEBA 4G77A 3OO9A 3RTWB 4YB5A 3JYRA 1R1NA 1AIVA 4LVQA 4GVOA 4LUBA 3T22A 3DLNA 1JEVA 4GF8A 4IO2A 1PC3A 2PYYA 4BDRA 2A5TB 2D5WA 3V89B 3EPEA 4OEVA 2ABHA 3U93A 2Y7PA 3OO7A 3W9VA 3MZ9A 4LZ7A 4G8HA 4OZ9A 5KCJB 1MDP1 4EXKA 4ZDMA 5AA2A 3H03A 1NNFA 1D9VA 2XXUA 3SEWA 1MM6A 1A40A 2NVUB 1QUIA 1D3KA 5HPQA 3K2DA 3RQTA 4U4XA 4OTEA 3CRBA 1N3WA 1EH3A 4OESA 1SYIA 4QSDA 4NF6A 2D21A 3MP8A 2XHDA 5AA4B 1UIVA 3KJ7A 4NMYA 4O3AA 1B4ZA 4GOTA 1RKMA 1IUDA 1B58A 2Z8DA 1DTGA 1MPDA 2X26A 3SDFA 3FV2A 3LR1A 2AYSA 2F97A 1N3XA 3VVFA 5H8FA 1H43A 1IXHA 3OELA 3QAXA 1MG1A 4ELPA 5HM4B 1A8FA 2FYIA 4O3BA 3PD9A 4OYVA 5EHMA 5CRYA 1YPNA 2Q89A 3QIMA 1IXIA 3I5OA 3OD7A 2GHAA 2ONSA 3PPNA 3OEMA 1I6AA 1P1NA 4NWDA 1B3EA 4P0GA 5L9MA 1B7ZA 1IXCA 4BDMA 2Q2AA 2V84A 1ZMGA 2PBWA 4GL0A 1P1OA 5CBRA 1OQGA 2DSFA 1H76A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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