2YLNA

Crystal structure of the l-cystine solute receptor of neisseria gonorrhoeae in the closed conformation
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
AISGSLIERINNKGTVTVGTEGTYAPFTYHDKDGKLTGYDVEVTRAVAEKLGVKVEFKETQWDSMMAGLKAGRFDVVANQVGLTSPERQATFDKSEPYSWSGAVLVAHNDSNIKSIADIKGVKTAQSLTSNYGEKAKAAGAQLVPVDGLAQSLTLIEQKRADATLNDELAVLDYLKKNPNAGVKIVWSAPADEKVGSGLIVNKGNDEAVAKFSTAINELKADGTLKKLGEQFFGKDISVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structures of Two Solute Receptors for L-Cystine and L-Cysteine, Respectively, of the Human Pathogen Neisseria Gonorrhoeae.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Neisseria gonorrhoeae
molecule keywords PUTATIVE ABC TRANSPORTER, PERIPLASMIC BINDING PROTEIN, AMINO
total genus 90
structure length 240
sequence length 240
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ylnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ylnA02
4QSCA 1SW5A 1EH3A 2D3IA 4KCDA 3FIRA 4Z7EA 4O3BA 1US5A 3FXUA 3QYTA 3C33A 1A7LA 3EHSA 1TWYA 3PPNA 4HCYA 4FECA 1LBCA 5L9MA 4UACA 2DQVA 3PUZE 2QMXA 2Y7IA 1H76A 1DPPA 1Z7NE 5A5XA 2R9JA 4I9DA 4ZEFA 4OQOA 2PT2A 1EZOA 1MY1A 3FVGA 4XIGQ 4BDMA 2X26A 1S7YA 3R26A 2DOJA 5CC2A 2XXQA 3UN6A 3T9HB 5I59B 3RY3A 1MXUA 3QUJA 3TTKA 4H65A 1D4NA 3ECRA 4ELPA 3VLUA 3TCHA 5DT6A 2FYIA 3O66A 4MFIA 3JZJA 1B7ZA 3FVOA 2XXWA 2I0BA 3O6GA 1LAHE 2H98A 1P1WA 3O6IA 1XOCA 4OETA 3QK6A 4LZ8A 5F7VA 3B6TA 4BDLA 4H5GA 3IO4A 3ZKKA 2A5TB 2RCAA 3K1PA 4ESXA 4ELQA 5I57B 3HPIA 4IO7A 4NF8B 2R6GE 4BDRA 3DP6A 4JXIA 4YKKA 3B6WA 1MH4A 3SETA 3PMVA 1Y1MA 5FTIA 5ICQA 2O1MA 1B3FA 3CVGA 4JWOA 5FHMA 1USYE 3MVYA 3K6XA 1YCJA 3TTMA 2OBGA 4HS7A 2HXWA 1M5BA 1QJMA 5KCJA 2V3TA 3K1MA 2XD3A 4LZ5A 5KZTA 3OO7A 3UK4A 3N6UA 1B3LA 3LSWA 3MP1A 3S4UA 1XC1A 2RC8A 3TODA 4MH5A 3SEWA 3IK6B 4IY5A 2XXIA 1B2HA 4F1UA 3H03A 3KOTA 1SBPA 1Y4TA 1S50A 3GXAA 3A3UA 3MVZA 4DXBA 3TZAA 1AIVA 1MQGA 1NH8A 4TQUQ 2WKYA 1HSJA 2F36A 1M5DA 4F18A 3E13X 2F7BA 5LOMA 4WKMA 1TT1A 3PPQA 3R7XA 2DE3A 2LAOA 2I0CA 1Y9UA 4X1DA 1B0LA 3S9MC 2XXVA 1Y3QA 3PUYE 3FJGA 4GVOA 3JYRA 4YKPA 3D4CA 3PMWA 1XVXA 3E3KA 1AMFA 3FZVA 2DVCA 3GLBA 3IL1B 2DYXA 2QS4A 3TQWA 1B51A 2XXRA 4QFNA 3U8QA 1B4HA 1EU8A 2HQ0A 5I59A 3IORA 3IB0A 5ISUA 4IO3A 1ATGA 4KPTA 3G3HA 3T9XB 3K6UA 3K01A 4QFOA 5CBRA 1DTZA 1B32A 3D4GA 3DLNA 3MPLA 1EZPA 1B7UA 3OO8A 1URSA 4NTLA 3C4MA 2ESNA 3U92A 3VLVA 3CI8A 1R6ZA 3PU5A 1VFEA 3G3FA 4NWDA 5AE4A 4FAJA 1L5TA 4JWXA 1MXXA 3RGYA 1LCTA 2A5TA 3E9XA 3OMBA 5H8SA 3CSBA 3CIJA 2OK2A 5I57A 5CMKA 4KYDA 1OVTA 4E0XA 1URGA 2UVGA 5AA1A 4ELRA 5JTYA 3Q25A 2Q2AA 1B5HA 1B6HA 3VE1B 5ITOA 4NF6B 4E0WA 5DTBA 1IXIA 4GL0A 4OYVA 2AL4A 3CR9A 1FQBA 1LCFA 4Q30B 2G93A 4GOTA 4RPOA 1GVCA 1LLSA 4XXUA 4PFTA 2DP8A 1YAEA 2THIA 4WEDA 5BUUA 4LONB 2GFEA 1HSEA 1A8EA 3RN8A 3IB2A 1UTHA 2I58A 4LP2B 5DVJA 1SVXB 4OTEA 1N7XA 3IOWA 1H45A 4YB7A 3ODBA 3WAFA 2RCBA 3LSFB 1NKXA 5K2XA 4GXAA 1I6BA 3FVKA 3KFMA 2XXHA 3ILUB 1BP5A 2YPNA 3IO6A 1JQFA 2Q88A 1I6QA 4X9TA 3KN7A 3MBPA 4YZZA 2Z22A 3K00A 1B1XA 5IAIA 1A40A 4YMAA 1LAFE 2CZLA 4KD5A 3K1NA 4QHQA 2REGA 2NUVA 1JETA 3LC8A 5I56B 3S9EA 3BFUA 4F29A 1GV8A 3VDFA 1OLCA 1ZMGA 1UIUA 1II5A 2M8CA 4HCWA 5HPQA 3IB1A 3KSJA 1OIBA 1SI1A 3MZBA 4JSOA 3SEUA 3I5OA 4F19A 4QF9A 3TEPA 1LAGE 3KGCA 1LFHA 4WXJA 4I1DA 3LSXA 3IOUA 1H43A 5B70A 3OO9A 2VOZA 1T0KA 5JEIA 1UQWA 2I4CA 3Q29A 3T9VA 1N0TA 5I2KA 3FXRA 4BLAA 1CE2A 3DELB 4DDDA 2OWTA 4U1ZA 1IIWA 4EF1A 5CMMA 1N84A 3V83A 1WVJA 4O3CA 2FNCA 3P7IA 3OD7A 1GGGA 3T9UA 2H25A 3UORA 1TXFA 3Q28A 3HN0A 5HBCA 3W9VA 1B1HA 1B52A 3EPEA 4GQOA 4OZ9A 4POXA 2HCAA 1DOTA 1US4A 1M5EA 1N3WA 5KCJB 2DS9A 4U4SA 4RJZA 1MY4A 1A8FA 1Y4CA 3TPAA 3OELA 3HO7A 4OVJA 3BKIB 3FV2A 2PBWA 5BWJA 4GFRA 3I6VA 2PMSA 3DP8A 1B3EA 3MZ1A 4H8JA 4R6HA 3CSGA 1M5CA 1GR2A 1Q35A 2P1SA 3O2AA 3M3FA 1A55A 1SD3A 5H8FB 2ONSA 2DSFA 3PUXE 4O3AA 1FQFA 2AIXA 4PFUA 5AA4B 1B3HA 1O7TA 1Q1KA 1MXVA 1MRPA 5ICTA 2QPQA 2A5SA 2KLFA 1RKMA 5JK4A 3A3CA 3GBBA 4H0WA 4IO4A 4OFOA 1MY3A 1MPCA 5I56A 2E0SA 3MP6A 3CFZA 5H8QB 5ELVA 3IJOB 4YKJA 4IGTA 3RT8A 3FJMA 3PGFA 1LAXA 1GTKA 4FIMA 3RLFE 4OEVA 3T93B 3V5AA 1D9VA 1MG1A 4EQ7A 1JW4A 1SI0A 3K6VA 5F1QA 3N26A 4X48A 1MQIA 3TKDA 4KI0E 3A09A 1S9TA 1FCKA 4POWA 4RXLA 1PC3A 5CRYA 3FASA 1BTJA 3N6TA 3BFTA 4KHZE 4BDQA 2H9BA 3ZSFA 3LUYA 2QL3A 5FHNA 4NWCA 3FGSA 4U4XA 4FJPA 4KYEA 4GIZA 4OXVA 2PT1A 4R6KA 4NMYA 1SW1A 4PQJA 2GHAA 5JTYB 2V84A 4KFQA 4ZZAA 3H6TA 1LGBC 2IEEA 5DVFA 4ZE9A 3QAXA 3HCQA 3UIFA 3TMGA 1M5FA 3FVNA 1BIYA 1J1NA 4OWDA 2Q9TA 4ZZEA 4KCCA 2QS1A 4ZDMA 3OXNA 2UVIA 2XXTA 4F3SA 3VV5A 2OWSA 3KZGA 2Y7PA 4IY6A 1UTHB 3RTWB 3IR1A 2F8DA 5H8FA 4ONYA 3K02A 2OJTA 2UYFA 1QVSA 1N7WA 2DE2A 3L6GA 5AA4A 1MS7A 3EQ1A 1JW5A 4XKNA 3FUZA 2V25A 4MLQA 4EQBA 3VXCA 4ZEBA 1JEVA 2ZYNA 3PV0E 2F7CA 2H99A 5TPAA 2O68A 2NWJA 4YU0A 2HEUA 4GXSB 3TTLA 1QUIA 4R73A 3MW0A 1B3GA 1MH3A 1PDAA 1VSOA 4F3PA 4HW8A 5H8QA 4ND9A 1OLAA 3KJTA 1DSNA 4ZE8A 5I84A 1FQEA 1SYHA 3SERA 3O6HA 3IOTA 1FQCA 3U72A 4AQ4A 3PPPA 4FEBA 4DXUA 1USYH 4ESWA 1QW0A 3OEKA 4OEUA 2X7QA 5L9OA 3MJNA 1IITA 5I2KB 1SQYA 4X1BA 2XX9A 3G3GA 1D3KA 4F1YA 1Y20A 3SKPA 1JVXA 2O6AA 2HAUA 3HHFA 1TFDA 4C1TA 1YTVA 1NNFA 2VD2A 2PYYA 5HM4B 1QKAA 4TOZA 4G68B 1QUJA 4XKQA 4R2FA 2I3WA 3LBSA 2Q8JA 4EF2A 3OO6A 1A54A 2B65A 1SW4A 5TP9B 2ZYMA 2ZNTA 1FW0A 3ONMA 1N3XA 2DXYA 4F3GA 3S2VA 2Y7KA 2ONRA 3HSTA 2F34A 4R74A 1BKAA 3MQ9A 1IUDA 1PBQA 3C32A 1VFDA 2F35A 3K6WA 4P11A 5EHMA 2Y7WA 1B40A 1FTOA 4IO5A 1FQAA 4DIGA 3VLWA 4HTGA 3R6UA 5AA3A 4R75A 2DWIA 1LBBA 2P0SA 3OENA 4Z0IA 3H06B 3W15C 3PMXA 4G8NA 1CB6A 2DWJA 3DM0A 5DYHA 3EHUA 3CG3A 1MM7A 3E4RA 4F22A 1NL5A 4FORA 1FQDA 3H7MA 2PX1A 2W7YA 1IEJA 2HZLA 1I69A 2IA4A 3GZGA 4YAHX 1AL3A 3M3LA 3H6WA 4H67A 1IXGA 2B3BA 3FXQA 1XHYA 4LATA 2D5WA 1VR5A 1ZTYA 4EXLA 3MZ9A 5CM6A 3O28A 3PUWE 1AOVA 4OESA 1H3DA 4IO6A 3U93A 5I58B 3N94A 3OSRA 5TU0A 1A99A 1QULA 2RC9A 4ELOA 2O7UA 4MF3A 2Z8EA 3PD8A 4DLDA 2AL5A 5DEXA 3SDFA 1AH5A 4THIA 1OVBA 3FV1A 3M8UA 3OEMA 3U94A 2REJA 1IQ7A 2VHAA 4G4PA 2I48A 3T66A 4OFJA 5H8HA 4I62A 2RF1A 1O63A 2I6EA 4Q5TA 1R9QA 4U2RA 5I2NB 4R6YA 2O7IA 1EZ9A 4GLIA 3L6HA 2VP1A 4U22A 4G77A 2XXYA 4OHNA 4ZEIA 1P1QA 4EQ9A 4XKPA 2XX8A 2XXPA 3H6UA 3Q27A 2Q2CA 3F11A 4RYAA 2F7AA 2B3FA 1POTA 4G68A 2G29A 1ZKBA 2F6PA 1TFAA 3QXMA 1MQJA 4PFWA 4C1UA 5TP9A 3EF7A 4N6PA 1PB7A 1FTMA 3OOAA 4NE4A 4G68C 5L9SA 2O84X 1NMUA 4PETA 4U23A 1H44A 1B46A 5CMBA 4IGRA 4LA9A 3QSLA 3MVWA 1YPNA 3KEIA 4EXKA 5CI5A 4LZ7A 2F5XA 4QFPA 2FA7A 4GRKA 5H8NA 2DXRA 4JWYA 4JB7A 1PBPA 3MWBA 2HZKA 4DZ1A 4H1XA 1B05A 3FATA 1JNFA 1DPEA 4IB2A 4TLMB 4NEDA 4BDOA 1NNTA 3GBAA 3VXBA 5TPAB 3K2DA 3PUVE 1P1UA 3TCFA 3PD9A 4ZEKA 4MBPA 3QIMA 3KN8A 2XXXA 1MY2A 2VD3A 4QFLA 4YB6A 2DWHA 1B5IA 3K0VA 3THIA 5AA2B 5I58A 4RK2A 3ZS6A 2NXOA 4FE8A 3S9NC 2DWAA 3K4UA 1B0HA 3IJXB 3MVXA 2V3UA 3TUSA 4LQ5A 1LSTA 4AB5A 3TTRA 4H8IA 1DMBA 3C9HA 5FTHA 2QMWA 5L8DA 4JSDA 3RQTA 2ZXTA 3RT6B 3CG1A 2F78A 1ELJA 5I2NA 2D21A 4M1VA 2E1SA 4YKIA 3N5LA 3PPOA 3TYHA 2UXAA 4YICA 4ECFA 2YJPA 3U1OA 4Q0CA 3UGWA 3MP8A 4QRZA 4KR5A 1JEUA 2XD2A 3Q26A 4NF5A 5M2VA 3C36A 2CMOA 1ANFA 4OERA 4GF8A 1RYOA 4KQPA 3TCGA 3V8XB 1FTJA 2ZYOA 3B7DA 3FD3A 3EHTA 3I3VA 4DXCA 1NNPA 2Z23A 2F6GA 3KBRA 4NF4A 1OQGA 1ZJLA 3RUMA 1MQHA 3IOVA 4EDPA 3T22A 3LSLA 4N13A 1QUKA 4DCXA 2I4BA 1SW2A 1MQDA 3SEVA 1O64A 3O97A 4FATA 1MXWA 2ALUA 3EN3A 3G7WA 1LFIA 4C0RA 2QS2A 5KDTA 3RNNA 3C31A 3B6QA 4U1OA 2RINA 1PEBA 1Y3PA 5B7DA 2HAVA 4BDNA 4RNSA 3JV9A 1WDNA 5AA2A 2AYSA 4IO2A 1OMPA 1MDP1 1P1OA 2UYEA 4ISUA 1R1NA 4R72A 5DEXB 4GL8A 3TTNA 1NNKA 4F2OA 2RC7A 3M3KA 1KWHA 1UIVA 4LQ2A 1ZIUA 1N04A 4R2BA 3G3JA 3H6VA 3UA8A 2OCUA 1R9LA 2QS3A 3FJ7A 5H8HB 4QSEA 4JBZA 4OENA 2ZNSA 3HHGA 3O29A 2PVUA 1I6AA 1FTLA 4WEPA 1NFTA 4AB6A 3S9LC 1MDQA 4FEDA 2O51A 2RKMA 3MAMA 1IXCA 1NH7A 3H4ZA 4G2ZA 2UVJA 3H3GA 1ZU0A 3BBRA 4P0IA 3OSQA 1UTBB 2GRVA 1XVYA 5J1DA 3IX1A 1MM6A 2O69A 4JDFA 3RPWA 3SEXA 3VVFA 1BLFA 2ZMBA 3KSXA 4H5FA 4OFLA 5ITPA 3W9WA 2XHDA 1B7HA 1IZ1A 4QFKA 1SDXA 4Q8RA 4OMBA 4NF8A 4R9FA 3QUFA 4P0GA 4DCYA 4U21A 3DP4A 2H4IA 2HFBA 3TDJA 1B4ZA 1MY0A 5K2YA 4I8CA 2ABHA 1LFGA 2P2AA 4GWOA 1PB9A 3KG2A 2F97A 2YLNA 2Y84A 1LB9A 1LB8A 5H8NB 1N76A 3ILTB 3MPKA 1Y1ZA 4RPNA 3SEYA 3USDA 1DTGA 1HSLA 2ZYKA 4LVQA 3KN3A 2BJJX 4PFYA 1WODA 1ZLQA 1Y3NA 2R71A 3UP9A 4KYSA 2H5YA 4F2QA 2XXUA 4QSDA 2O1LA 4PP0A 1Z7ME 1D9YA 5CBSA 3HV1A 5EYFA 4F31B 1ZBMA 4F1VA 5CMCA 4GD5A 4K3FA 4G8MA 1P1NA 2X7PA 1PB8A 5A5XB 4LUBA 5IKBA 3T96B 4G8HA 2NOOA 4ZECA 3KJ7A 1B58A 1MXYA 3C34A 3ZKLA 3PPRA 2QJEA 2DE4A 3G3KA 4R9GA 3TFLA 1XS5A 4RA1A 2Y7RA 1URDA 1JVYA 3MC2A 2GHBA 4RY1A 1POY1 4XKRA 4F3BA 3LR1A 1MPDA 2Z8FA 4EUOA 4H6DA 3IAZA 2V93A 2ONKE 4ZS9A 1IXHA 3VVDA 1JW1A 4TLLB 2ANJA 1UTBA 4NF5B 3CFLA 3VFJA 3MUQA 2Z8DA 3V89B 1VE4A 4UA8A 2QSXA 2V3QA 1OQHA 2QRYA 3KOSA 4PE5B 1F9BA 1MXZA 3CFXA 4F39A 3WAEA 4RK9A 3TELA 1B5JA 2Q89A 4L17A 1XT8A 5FHOA 4M4GA 3O9PA 2OZZA 2UVHA 2I49A 4DE8A 2ZNUA 2DVZA 4YB5A 1B9JA 3AXFA 4NF4B 4NF6A 4MLVA 5AA2D 4N07A 1P99A 3RTFB 1MPBA 4ZEDA 1RYXA 2XX7A 1SYIA 3TQLA 5EHSA 3G3IA 3VVEA 2GH9A 4XTCQ 3TAJA 1FTKA 3CRBA 5KDTB 5DVIA 3C35A 2OLBA 1QKBA 3SESA 2I3VA 2NVUB 4YMBA 2VGQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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