2ZNTA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, dysiherbaine
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 82
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zntA02
2YLNA 3G3IA 3VXBA 5CI5A 4RJZA 2QJEA 1FTLA 1LFHA 1XS5A 4MBPA 1SW5A 1QULA 2QS4A 5H8HB 3N94A 1SYIA 3W9VA 2I0BA 4WXJA 1QKBA 5L9SA 4POXA 2YPNA 2F35A 1O63A 5AA4A 1NFTA 1OMPA 3I3VA 3TQWA 3MVWA 3W9WA 2UVHA 1MDP1 1POTA 4KFQA 4X48A 4EQ9A 2DSFA 1NL5A 2H25A 1ZKBA 1L5TA 1DPPA 4XTCQ 3FVOA 4R9GA 3O97A 1I6BA 2UVIA 3MZ1A 1MY1A 4G68B 3G3KA 4FECA 2RCBA 1PB8A 4Q5TA 3BFTA 2HZKA 2AL5A 1LCTA 4O3BA 1OIBA 4X1BA 1A54A 1Y1MA 2XX8A 3LR1A 1EH3A 2QMWA 3KSXA 2OK2A 1SQYA 1A7LA 3M3FA 4EQBA 1BIYA 5H8NB 3OO9A 2O1MA 3B6TA 3BKIB 1HSJA 2WKYA 1QUIA 4WEPA 5CC2A 5FHMA 4JXIA 1H44A 3T9VA 1B3HA 2GRVA 4KI0E 4KD5A 1LAHE 5CMKA 3FUZA 3SKPA 1MG1A 5DEXA 2AIXA 3FXUA 5I2KA 3IO6A 4C1TA 3QUJA 3S9EA 4RK2A 1Q35A 4IB2A 4BDOA 1PC3A 2DXYA 3PPOA 3BFUA 2PMSA 3QUFA 2RINA 1AOVA 3THIA 4LVQA 3K6WA 4F1UA 1SW1A 4EQ7A 4FJPA 1YPNA 3Q25A 4U1OA 2O68A 2OBGA 4I8CA 3RY3A 4FEBA 5CMBA 3M8UA 4JWOA 1PBQA 2XXVA 2RC9A 2H99A 4YMBA 5I59B 4EDPA 4P0IA 4LA9A 5EHMA 3K02A 3TZAA 1SBPA 3QSLA 4X9TA 3CRBA 1ZMGA 3OEKA 4F3GA 4IGTA 4ZE9A 3FASA 1LBBA 1R9LA 3SERA 1MXYA 1JNFA 1MQIA 2NXOA 2ONKE 3C34A 3MC2A 4QSEA 4FEDA 1YTVA 4NF5B 5TP9A 4NEDA 2RC7A 3OELA 3TCGA 2XXPA 2H98A 5AA2B 3FV2A 2VD3A 4U2RA 2W7YA 3TDJA 4NF4A 3EN3A 3KSJA 2R71A 2NUVA 3T9HB 1MY0A 4PP0A 5DT6A 4YKPA 2AL4A 2XHDA 1MXZA 1BKAA 2XXQA 4PFUA 2REGA 1IXIA 1Y1ZA 2QL3A 3FVKA 3SEWA 1MH3A 4G68C 4MH5A 3U94A 3IL1B 3TPAA 2O51A 5CBRA 1JW5A 3MAMA 3TODA 2PVUA 4HTGA 2DE2A 4TLLB 5BWJA 2HQ0A 3OOAA 4GLIA 2DVZA 4I1DA 4N07A 3HPIA 3UORA 2RKMA 1WDNA 3MPKA 1CE2A 3EHUA 4QSCA 4Q30B 1XVYA 2F7BA 3MVXA 5TU0A 3UK4A 1B1HA 4R75A 3HSTA 3H03A 3LSWA 2ESNA 1OVBA 3T9XB 1NNTA 2XXIA 4ZEDA 4DXUA 5B70A 4FORA 1H43A 3PPPA 1NNPA 1B9JA 4NF6A 3HCQA 3C31A 1DTGA 3CG3A 4G68A 4R6YA 4EF1A 4YICA 3PMWA 1H3DA 2PT2A 3PU5A 4F19A 4F3SA 1DSNA 5K2XA 3KOSA 2PYYA 4ISUA 1IITA 4TQUQ 2A5SA 4KCCA 1TXFA 1M5DA 1UTHA 5I58A 5HBCA 3MJNA 4IY5A 4KYDA 2F78A 1A8FA 3OMBA 3SDFA 4JSDA 1LFGA 4H67A 4UACA 1OQHA 2ZYOA 3KFMA 4QF9A 4K3FA 1NMUA 3C4MA 4ZECA 1EZOA 3KBRA 5EHSA 4GD5A 1HSLA 3SEYA 5KZTA 3ILUB 2F36A 3CG1A 3CSBA 1B58A 4GL0A 1ANFA 4KCDA 4ESXA 3OO7A 3I5OA 1XC1A 4OFLA 1MQHA 2O84X 1Y9UA 4LZ7A 1ELJA 1LSTA 3OO8A 1IQ7A 2V25A 4YKKA 2QSXA 4H65A 1TT1A 2CZLA 4U21A 2XXWA 4IO3A 4IY6A 4GIZA 4ELQA 4EUOA 2Z8EA 2LAOA 2ZYMA 4G2ZA 3CI8A 4BDNA 4F39A 3KG2A 3IOTA 2ONRA 2B3BA 1Y3QA 1HSEA 4H6DA 4UA8A 1N3XA 1QJMA 4G8NA 4ZZEA 4F31B 4R2FA 2VP1A 4F1YA 4OTEA 3CR9A 4O3AA 3GXAA 3FXRA 3JYRA 3DLNA 3HO7A 4XKNA 3O6GA 1VE4A 4NF5A 3O6HA 3N6TA 4XKRA 3PD8A 4LUBA 1KWHA 3DP6A 3FJ7A 3DELB 5F1QA 3RLFE 3VVDA 2I3VA 4YMAA 1FQDA 4AB6A 3ECRA 1I69A 3C36A 2KLFA 3F11A 5CRYA 2XX9A 3GBAA 4QHQA 2F6GA 3H6UA 3TFLA 4DIGA 3G3JA 3IB0A 4YB7A 5ITOA 1Y4TA 3TEPA 3U72A 3L6GA 1B3EA 1UIVA 1M5BA 3S9NC 4XKPA 3B6QA 1NH7A 2GFEA 2BJJX 2ALUA 4ZEFA 5B7DA 2XXHA 5JK4A 3PUYE 3SESA 1D9YA 4HCYA 1N3WA 3RUMA 2OWSA 4GRKA 4R73A 1YCJA 4NF6B 1R6ZA 4WKMA 4NMYA 1B5JA 1P1OA 4OENA 2X26A 3MP1A 1B0HA 1MQDA 3HHFA 2F34A 1MXWA 4KHZE 3PUXE 3JZJA 3VXCA 3WAEA 2Y7IA 1XT8A 5L9OA 1UTHB 3OD7A 5I58B 3PUWE 3VE1B 4ELOA 1URSA 1FCKA 3HN0A 4ECFA 3RTWB 1ZU0A 4DXBA 3H7MA 3TTLA 2GHBA 2VD2A 3K1NA 2HCAA 3P7IA 4LQ5A 4NE4A 3TKDA 1JEVA 1FTMA 3T93B 1F9BA 1LAGE 4RPNA 5DVFA 3UP9A 4RXLA 5KDTA 3G7WA 5CMMA 1M5FA 3ZKLA 1MPBA 3E13X 3I6VA 3S4UA 4JWYA 3ONMA 4F3BA 4OEVA 2H9BA 2I4CA 2NVUB 3PMXA 3RNNA 2IEEA 2HAVA 1AIVA 1VFEA 3S9LC 3MVYA 3OEMA 3SEUA 4RK9A 1B51A 1N7WA 3E9XA 4LONB 1UTBB 1LAFE 1I6QA 1URGA 3TQLA 5ICTA 4Z7EA 3PPQA 4QFKA 2QS1A 1FQBA 3VLWA 4BDQA 4H0WA 4C1UA 4FE8A 3K0VA 4HS7A 4OHNA 4E0WA 5KCJA 3IR1A 2F7AA 5LOMA 1B3LA 3E4RA 4ONYA 3T66A 3PV0E 1FQFA 1LB8A 2ABHA 2DE4A 2RF1A 3K4UA 4DE8A 2V3UA 1B4ZA 1MQJA 1B1XA 3JV9A 5I57B 2P2AA 3OXNA 4IO2A 3LBSA 3SETA 4PFTA 3K6XA 3C32A 2DE3A 5HPQA 4X1DA 3TTKA 2REJA 2F5XA 3IB2A 4KR5A 4MLQA 3MWBA 1TFAA 4ZZAA 4BDRA 4Z0IA 4G8HA 1AL3A 3IOVA 3M3LA 1MY3A 2A5TA 3CIJA 1OQGA 1BLFA 3PUZE 4N6PA 4KYEA 3TYHA 5JTYA 4YKIA 2I0CA 3OO6A 1R9QA 4F2OA 2UVJA 2Z22A 3O66A 1LCFA 2UYEA 4GQOA 3H4ZA 4E0XA 1FTKA 2FA7A 4F1VA 1Y4CA 4NTLA 2E0SA 4M1VA 3VVEA 2V93A 3U93A 1GVCA 2DS9A 3MVZA 4GOTA 4YB5A 5K2YA 1PDAA 3A09A 1VSOA 1B7ZA 3CSGA 1GV8A 4OETA 1N84A 1LGBC 4L17A 2M8CA 4OESA 4DCXA 3MZ9A 2DWJA 1QKAA 3VDFA 1NNFA 3VLUA 1SYHA 3V8XB 1Y20A 4PQJA 4F22A 3T96B 3AXFA 2G93A 4HCWA 4JSOA 3UA8A 1BTJA 3QYTA 1Z7ME 3FVNA 1MM6A 3IJXB 4IO5A 1RYXA 5ITPA 1B6HA 1EZPA 3BBRA 3VFJA 2Z23A 2FNCA 1MM7A 1UQWA 2UXAA 2F97A 3MQ9A 1FW0A 3RPWA 5CBSA 3B7DA 4GFRA 3FV1A 2DYXA 4GVOA 4YU0A 1D9VA 3B6WA 1I6AA 4PE5B 1LLSA 1OLAA 2Q2CA 3S2VA 1TWYA 5HM4B 3RTFB 3KOTA 5H8SA 1GGGA 2F6PA 2XD3A 5KDTB 4QFPA 4ZEIA 1PB9A 5ELVA 1NNKA 3IOWA 3C33A 3G3FA 5AE4A 3FZVA 1YAEA 3KZGA 5I84A 3TMGA 4IO6A 2AYSA 3CVGA 5DYHA 1MPDA 1P99A 2OWTA 4G8MA 1Q1KA 1O64A 3K2DA 1B40A 5ISUA 1ZJLA 3QXMA 4JB7A 3U8QA 3FVGA 3UN6A 1UTBA 4XKQA 4MF3A 3MPLA 3KJTA 1JEUA 3ILTB 4PFYA 2O1LA 5KCJB 1JETA 1NH8A 3Q28A 3R26A 3HV1A 1WODA 5H8FA 1M5EA 4RNSA 1A40A 1DMBA 1LB9A 3FJMA 2RC8A 2QS3A 4GF8A 1J1NA 2Q2AA 1O7TA 3Q27A 3TAJA 3R7XA 1N7XA 3RQTA 5DTBA 3K01A 5DVIA 4TLMB 5I57A 2O7IA 3LUYA 3IOUA 2FYIA 1ZTYA 3M3KA 2YJPA 3V89B 1FQAA 4MLVA 2F8DA 2Y7PA 1XVXA 3QK6A 3C35A 1FQEA 4GXAA 5AA3A 3IJOB 4OEUA 1P1WA 4POWA 3DM0A 3EQ1A 4TOZA 3U92A 4I62A 2V3QA 1M5CA 2A5TB 2H5YA 3EHTA 4U23A 4R74A 3IX1A 5JTYB 2Q8JA 2ANJA 1XHYA 3MUQA 4FATA 4H5GA 2PT1A 1SW4A 1JVYA 3MZBA 1PEBA 4OYVA 2Z8DA 5L8DA 3DP8A 2Z8FA 3T9UA 2ZNTA 4AB5A 1SD3A 2ZNUA 1B7UA 2PX1A 5BUUA 2QS2A 2B65A 4DDDA 4R6KA 3N6UA 3RN8A 3R6UA 5FTIA 1JW1A 1MY2A 4NF8A 3RT8A 4ESWA 3VVFA 4F3PA 1T0KA 3O2AA 4BDLA 2CMOA 1IUDA 5ICQA 3OENA 4H1XA 2OCUA 4ZE8A 2X7PA 4M4GA 2I4BA 1JQFA 1B05A 1H45A 4H8IA 3WAFA 5CM6A 2VHAA 3H6TA 1B46A 1FTOA 3PPRA 1FTJA 2XX7A 2OJTA 4DZ1A 2OZZA 5H8QB 4AQ4A 3USDA 4NWCA 3W15C 1D3KA 4Q0CA 4F2QA 1MXVA 3G3GA 5I56A 3L6HA 3D4GA 3PPNA 4QRZA 3T22A 1QW0A 3LSXA 2H4IA 5J1DA 3TCFA 2HFBA 1IXHA 3D4CA 3PMVA 5AA2D 4I9DA 4LQ2A 4OZ9A 1QUJA 3RT6B 2GHAA 1S50A 4KYSA 1SDXA 4OFOA 5A5XB 1B0LA 3FIRA 4O3CA 5TPAA 2ZNSA 3N5LA 3PD9A 2VGQA 4BDMA 2XXTA 1PB7A 4YB6A 2Q88A 1JVXA 3CFZA 4RPOA 4F18A 3C9HA 1IZ1A 4MFIA 2O7UA 4N13A 2V84A 3GZGA 4GWOA 3PGFA 1B2HA 1EU8A 4U4SA 1P1UA 2I3WA 4BLAA 1RYOA 4QFLA 2P1SA 2DWHA 2OLBA 2ZYKA 1NKXA 2XXXA 5F7VA 3CFLA 2DXRA 3Q26A 3A3CA 2DOJA 1N76A 4KPTA 2UYFA 2ZXTA 3TCHA 4RA1A 3KN3A 2I58A 1URDA 1D4NA 4JDFA 5H8FB 3O6IA 2XD2A 1WVJA 3IO4A 1P1NA 3EPEA 4ND9A 1LBCA 3V5AA 2R6GE 4Q8RA 4FAJA 4RY1A 5AA1A 3MP8A 1LFIA 3MW0A 1QUKA 1DPEA 4U4XA 4P11A 4P0GA 5IAIA 4PETA 4G4PA 4ZDMA 3IK6B 4GL8A 3H3GA 4THIA 2Y7WA 4HW8A 5M2VA 1MXXA 2IA4A 1ATGA 3KN7A 3OSQA 1B7HA 4R6HA 2G29A 2X7QA 2P0SA 1ZIUA 2D21A 5I2NA 5IKBA 4OFJA 2HZLA 4LP2B 1MY4A 2DVCA 2VOZA 2QMXA 4OQOA 4QSDA 3OSRA 1US5A 3SEXA 4R2BA 1SI0A 3FATA 4YKJA 2UVGA 3FD3A 3H06B 1MS7A 3GBBA 1B52A 2HEUA 4JBZA 5H8HA 1B5HA 4LATA 2I6EA 4NF8B 3KN8A 5AA4B 1MDQA 4YAHX 2Y84A 1FQCA 3Q29A 1VFDA 1Z7NE 1DTZA 3VLVA 3K00A 4ZS9A 1SVXB 5FHOA 4EF2A 3FJGA 1ZBMA 4LZ5A 1P1QA 4QFOA 4IGRA 2B3FA 4JWXA 2HXWA 1VR5A 5H8QA 5I56B 2I49A 2Y7RA 4XIGQ 3CFXA 2R9JA 2O6AA 1XOCA 1Y3PA 2NWJA 2I48A 3O9PA 1A99A 3KGCA 3RGYA 4DXCA 4DLDA 3KJ7A 4H5FA 1LAXA 4FIMA 3E3KA 4C0RA 1POY1 3EHSA 1IIWA 4GXSB 3MBPA 1SI1A 4KQPA 1QVSA 2Q89A 3K1PA 5FHNA 1IEJA 5H8NA 2XXYA 3TTNA 3ZS6A 1B3GA 1II5A 5FTHA 4ZEBA 5TPAB 2THIA 4OWDA 3KEIA 5JEIA 3UIFA 2E1SA 5A5XA 2DP8A 2D5WA 1UIUA 1Y3NA 1A8EA 2NOOA 3VV5A 3H6VA 3G3HA 4H8JA 5DEXB 4OERA 4DCYA 3IAZA 5I2KB 1US4A 2Y7KA 4OXVA 3IORA 5EYFA 2GH9A 3S9MC 1JW4A 1AH5A 3O29A 1IXGA 2ONSA 1ZLQA 1EZ9A 3LSLA 4IO7A 4EXLA 2XXUA 1GR2A 2D3IA 4OVJA 4R72A 3LSFB 1CB6A 2O69A 1IXCA 1S9TA 4R9FA 2DWAA 4PFWA 1MPCA 1MXUA 4F29A 4U1ZA 1R1NA 4YZZA 1B5IA 2QPQA 3N26A 3MP6A 4XXUA 3PUVE 5I59A 3ZKKA 3FXQA 1RKMA 3K6VA 3IB1A 2ZYNA 1B3FA 4ZEKA 3QIMA 3SEVA 3K6UA 4LZ8A 3U1OA 1USYH 1BP5A 4QFNA 3H6WA 1H76A 4EXKA 2V3TA 3EF7A 1N0TA 4ELPA 3A3UA 1S7YA 4RYAA 1SW2A 3ODBA 4G77A 3LC8A 1MH4A 3TUSA 1USYE 2PBWA 2ZMBA 5DVJA 1GTKA 2RCAA 3K1MA 1DOTA 2DWIA 1PBPA 3HHGA 1TFDA 4ELRA 3ZSFA 2HAUA 4U22A 1A55A 3DP4A 2F7CA 5TP9B 4IO4A 1B4HA 3UGWA 3TTMA 1OLCA 2QRYA 2DQVA 3TTRA 5I2NB 4NF4B 3TELA 1MRPA 5AA2A 1N04A 5CMCA 4NWDA 3FGSA 1OVTA 2Q9TA 3GLBA 1B32A 5L9MA 2XXRA 4OMBA 4WEDA 1AMFA 3O28A 1MQGA 3QAXA 3V83A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VPOA 2YLNA 3G3IA 3VXBA 5CI5A 4RJZA 2QJEA 1FTLA 1LFHA 1XS5A 4MBPA 1SW5A 1QULA 2QS4A 5H8HB 3N94A 4I3YA 1SYIA 3W9VA 2I0BA 4WXJA 3MYUA 1QKBA 5T3JA 5L9SA 4POXA 3E79A 2YPNA 1K9YA 2F35A 3QMFA 1O63A 3B8BA 4MNIA 5AA4A 1NFTA 1OMPA 3I3VA 3TQWA 3MVWA 3W9WA 2UVHA 1MDP1 1POTA 4KFQA 4X48A 4EQ9A 2DSFA 1NL5A 4MHFA 2H25A 1ZKBA 1L5TA 1DPPA 4XTCQ 3FVOA 4R9GA 3O97A 1I6BA 2UVIA 3MZ1A 1MY1A 4G68B 4N6DA 3G3KA 4FECA 5IZ1A 2RCBA 1PB8A 4Q5TA 4GWXA 3BFTA 2HZKA 2AL5A 1LCTA 4O3BA 1OIBA 4X1BA 2WYKA 1A54A 1Y1MA 2XX8A 4KXPA 3LR1A 1EH3A 2QMWA 4PAKA 4MCOA 3KSXA 2OK2A 1SQYA 1A7LA 3M3FA 4EQBA 1BIYA 5H8NB 3OO9A 2O1MA 3B6TA 3BKIB 1HSJA 2WKYA 1QUIA 4WEPA 5CC2A 1NI9A 5FHMA 1SPIA 4JXIA 1H44A 3T9VA 2KR0A 1B3HA 2WBDA 2GRVA 4KI0E 4P9KA 4KD5A 1LAHE 5CMKA 3FUZA 3SKPA 1MG1A 5DEXA 3U65A 2AIXA 3FXUA 5I2KA 3IO6A 4C1TA 5EYHA 2FIXA 3QUJA 5F24A 3S9EA 4RK2A 1Q35A 2CZIA 4IB2A 3LV0A 4BDOA 1NV0A 1PC3A 2DXYA 1IMCA 3PPOA 3BFUA 2PMSA 3QUFA 4P1LA 2RINA 1AOVA 3THIA 4LVQA 3K6WA 4F1UA 1SW1A 4EQ7A 4FJPA 1YPNA 3Q25A 4U1OA 2O68A 2OBGA 4I8CA 3RY3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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