3A3CA

Crystal structure of tim40/mia40 fusing mbp, c296s and c298s mutant
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
451
structure length
451
Chain Sequence
EEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNSSSVPGRGSIEGRPEFAYNPDTGEINWDSPSLGGMAHGPCGEEFKSAFSCFVYSEAEPKGIDCVEKFQHMQDCFRKYPEHYAEQLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of yeast Tim40/Mia40 as an oxidative translocator in the mitochondrial intermembrane space.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, LINKER, Mitochondrial i
molecule tags Protein transport
source organism Escherichia coli (strain k12)
total genus 122
structure length 451
sequence length 451
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF06747 CHCH CHCH domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3a3cA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3a3cA01
2O6AA 1B40A 2RCBA 3A3CA 3IOVA 1A55A 4XKNA 1LAHE 3LUYA 1KWHA 1LCFA 3QUFA 2R9JA 1JQFA 4GQOA 2XX9A 3K1MA 4FEBA 1IIWA 1ZLQA 1IZ1A 2CZLA 4DXBA 3IORA 3Q28A 4U1ZA 5CC2A 1B32A 1IQ7A 1Y9UA 3K4UA 3KJ7A 5CMKA 2QRYA 1FQAA 4U4SA 1MY3A 3MC2A 2VHAA 1MXZA 4AB6A 1FQBA 4FEDA 2Z23A 3CFXA 4BLAA 3U72A 3B6WA 3FUZA 2YLNA 3S9MC 2XXUA 3OXNA 4HTGA 1B7HA 3UP9A 5IKBA 1FTJA 2XX7A 3GBBA 1S50A 3O29A 1Y3QA 2ZNTA 3U1OA 1XVYA 3B7DA 3RPWA 1QULA 2H9BA 2XXYA 3PPRA 5I56A 3PMVA 1NL5A 3DP6A 3FV2A 3G3HA 3MPLA 4F1YA 4GD5A 3CFLA 4JXIA 4QSCA 3CG1A 4O3BA 4KYSA 3KFMA 3VVEA 3VVDA 2O68A 2D5WA 3PD8A 3ILUB 1FQDA 3O6HA 1H3DA 1OVBA 3KJTA 3ZS6A 3HHFA 2GH9A 4F3PA 2B3FA 5H8HB 4N6PA 1MXXA 3O97A 2DWAA 4G68C 4NMYA 5B70A 5TPAB 3KOSA 2XHDA 1SBPA 1GGGA 2F6GA 3QIMA 2I49A 4O3CA 3GBAA 2XXVA 4ECFA 4ZECA 1B9JA 4THIA 1MH4A 3H3GA 4ZS9A 4IO5A 4WEDA 5BUUA 3MUQA 2V3QA 4F2QA 4POWA 5EHMA 4LZ7A 1LAFE 3EHTA 1POTA 1XC1A 4P0GA 4FATA 4OENA 1FQEA 1SDXA 4G8MA 1P1QA 1JVYA 3LSWA 2FA7A 1LBCA 2P2AA 4PFUA 4M1VA 1M5DA 3PV0E 3O2AA 1B46A 5ICQA 4EQBA 1N0TA 3G3GA 1JNFA 4R73A 4MLVA 3FVOA 5L9MA 4RYAA 4BDOA 3S4UA 1EZ9A 4JDFA 3N6UA 4L17A 2KLFA 4NWCA 2DE2A 2DQVA 3MBPA 5F7VA 5FTIA 5BWJA 1B0HA 2NOOA 3T9UA 4IGTA 4EF1A 1B05A 4OFLA 1NH8A 2DWHA 5KCJB 5H8HA 4LVQA 4ZZEA 3UA8A 3TKDA 4Z0IA 4G8HA 2RINA 1LB9A 2QMXA 5AA1A 4F2OA 3T9VA 3UGWA 2VD2A 1JEUA 1Y4TA 2AIXA 3BFTA 3C9HA 1N84A 4ZE8A 3H7MA 4NF5B 2BJJX 4XKPA 4NF6B 4RY1A 4R6HA 1URSA 1NNPA 3SEVA 4ONYA 2ZYOA 2X26A 3K2DA 2OK2A 1B7ZA 4QSEA 3MQ9A 1MPBA 4U22A 2F8DA 1LCTA 3WAFA 3W9VA 4NE4A 3H06B 1WVJA 2GFEA 1PB9A 3UORA 3PUVE 2DS9A 1EZOA 3IO6A 3EF7A 4DZ1A 3W9WA 2PX1A 2DP8A 4EQ7A 4GIZA 4ELOA 1XVXA 3E13X 3TTKA 2FNCA 1UQWA 1JW1A 1BTJA 3RGYA 3U93A 1A8EA 3N94A 4IY5A 3OSQA 1XS5A 4JBZA 3S9LC 1MPCA 4HS7A 5FTHA 4R2BA 1VSOA 1JEVA 3TAJA 1M5BA 4C1TA 3SESA 3VXBA 4F29A 3N6TA 1CB6A 1TXFA 1DTZA 4GOTA 2NXOA 5I2NB 3HHGA 1VFEA 2QS2A 2VGQA 2G93A 3K6WA 3FATA 4WEPA 4LA9A 1M5FA 4QFOA 1BIYA 4DE8A 2H5YA 5KDTB 4GXAA 1MRPA 5TU0A 3PPQA 2HAUA 2HZLA 4KQPA 3KGCA 4LONB 4DCXA 4OQOA 3EHUA 1HSJA 3RT8A 1Y3NA 1TWYA 3A09A 2H98A 4KYDA 5L9SA 1URGA 3E4RA 3VV5A 4IO6A 2A5TB 3WAEA 2OZZA 5I84A 2UYFA 3G7WA 3I3VA 3K1NA 1Y3PA 1BLFA 2V93A 1SVXB 5H8QB 4YZZA 1ZBMA 1USYH 3CFZA 5ICTA 1P1UA 3LC8A 3HV1A 3KSJA 2YPNA 2ZXTA 2F7BA 1HSLA 3IOUA 1Z7ME 2M8CA 2P0SA 2CMOA 4H8IA 3PGFA 2LAOA 3E3KA 3LBSA 3W15C 4ZEIA 3BFUA 2I58A 4UACA 4IB2A 4X9TA 1PBQA 4FAJA 3O6GA 2ALUA 5LOMA 2P1SA 3M8UA 1QUKA 1OVTA 4YMBA 5I2NA 1MY1A 3ILTB 2DSFA 5ITPA 1SI1A 2D21A 2XXPA 2PYYA 1A7LA 4LP2B 1A40A 3C35A 1NKXA 3CG3A 1SW5A 5I57B 5KDTA 2I4CA 4F18A 4OMBA 4QSDA 1IUDA 4GXSB 3PU5A 1MY2A 1JW4A 3T22A 4BDLA 5DYHA 2A5SA 3FASA 3TMGA 4H0WA 3MVWA 1B3GA 2OJTA 4O3AA 1MM7A 2QJEA 5DVJA 1OMPA 4R74A 2ESNA 3ODBA 2RC8A 3ZSFA 2Q2AA 3A3UA 2RCAA 4IO3A 5H8QA 4ZE9A 1IXCA 3MP8A 1MQDA 3UN6A 1D4NA 3I6VA 4ELRA 4RK2A 3DP4A 1SW4A 3O6IA 1QKAA 2Y7PA 3SKPA 4QFKA 1PDAA 1FW0A 1O64A 5HPQA 2RF1A 4MF3A 3PPOA 3MJNA 3K02A 3O9PA 1PC3A 3MZBA 2OCUA 3ZKLA 1SW2A 2ZYKA 2RKMA 1NH7A 1II5A 1MG1A 4YKIA 1FTLA 5H8FB 1XHYA 1R6ZA 4I8CA 1MQJA 3TELA 3ZKKA 2F97A 4Q5TA 4WXJA 1IXIA 1ELJA 1YTVA 3CR9A 5DEXA 1PBPA 3PUXE 5AA4B 1UIVA 3SDFA 4P11A 3T66A 4OXVA 3MW0A 4LATA 4ESWA 4IO7A 5M2VA 1P1WA 1OLAA 2GHBA 1ZU0A 4H8JA 4XKQA 3K01A 1A54A 4IO2A 3PMWA 4UA8A 4MFIA 1ZIUA 2OBGA 2H99A 1MQIA 2GHAA 3JZJA 1MQHA 4R6KA 1A8FA 4RPNA 3KBRA 3IOTA 3GLBA 4AB5A 3V83A 3SEWA 1ZJLA 2DXRA 4F39A 1D9VA 5CRYA 4XTCQ 1EH3A 1RYOA 3GXAA 3M3KA 4OWDA 3VVFA 2Q89A 2DYXA 4PFWA 1VE4A 4OYVA 3RTFB 2VP1A 1Z7NE 3TCGA 3LSXA 1QVSA 1CE2A 1FQCA 2UVHA 1MDP1 5AA2B 5H8FA 3FVKA 2F34A 1WODA 1FTMA 3TQLA 1D9YA 2FYIA 1US5A 1Y1MA 1SI0A 5AA2D 4NF4B 3TTMA 5AA4A 3VFJA 1TFDA 4IY6A 3HCQA 3FJMA 4H67A 1LFGA 4OEUA 1Y4CA 4MH5A 4Q0CA 4YICA 1L5TA 3IB2A 1MH3A 3FJ7A 2ONRA 3VE1B 3IOWA 4BDQA 1QJMA 3SERA 2REJA 1YPNA 4R75A 2H4IA 4EXKA 4JB7A 3VLUA 4ZEBA 1GV8A 1MDQA 2THIA 1EU8A 1GR2A 5B7DA 4MBPA 1SYIA 2UVGA 2DE4A 3OSRA 4DXCA 3IJOB 4GRKA 3D4CA 1Y20A 1T0KA 4U1OA 4PE5B 3HN0A 4YB7A 5TPAA 4F19A 5CMCA 3OOAA 1R9LA 2REGA 3QSLA 3FZVA 3M3FA 1FTOA 2X7PA 4EUOA 4JWOA 3DLNA 5EYFA 3U8QA 4EF2A 1AMFA 2UVIA 4DLDA 4RPOA 3OENA 2F7AA 4EXLA 2HXWA 2O51A 4E0XA 1ZMGA 1USYE 3V5AA 2X7QA 3MP6A 4QFNA 1N7WA 2HEUA 3O66A 4OZ9A 4NF8B 1UIUA 3L6HA 1JVXA 4PETA 3OD7A 1B2HA 1SQYA 4XXUA 3C4MA 4NF4A 5CMMA 2HFBA 5FHNA 1B58A 2DVZA 1LSTA 2DWIA 4GFRA 1B5IA 2ANJA 3FXUA 1I6AA 3S9NC 2HCAA 3DP8A 3H6TA 1ATGA 5L8DA 4M4GA 2XXRA 3PMXA 1N3WA 4BDRA 1MQGA 1MXVA 2V84A 3OEKA 5ELVA 1B52A 3JV9A 3DM0A 2UVJA 2I0BA 1MXYA 4GWOA 1H43A 4LQ2A 5KCJA 3C34A 3C33A 4OETA 2XXXA 3FXQA 3UK4A 3MVZA 4H5GA 3DELB 4KCDA 4DIGA 2QS4A 4PFYA 1B3EA 3AXFA 4DXUA 3VLWA 4POXA 2I6EA 3QUJA 3U94A 1H44A 3OELA 3H6VA 4NF5A 4F22A 2ONSA 4IO4A 1NNKA 4NF6A 1Y1ZA 4GLIA 4ELPA 3L6GA 3THIA 2I3VA 5J1DA 3EPEA 3CI8A 1O7TA 3QXMA 4YKJA 4FORA 3VXCA 3KN3A 1B0LA 1NNFA 3USDA 2Q9TA 4F3GA 2H25A 1QUIA 3R26A 1XT8A 1DTGA 1POY1 5CBRA 4DDDA 4NF8A 3LSLA 4YB5A 4TQUQ 5HM4B 4TLMB 2AL4A 5JK4A 2I0CA 2Q8JA 1BKAA 3PUWE 3RNNA 1B3LA 2PMSA 1J1NA 3TPAA 3RY3A 3KEIA 1OIBA 1B4ZA 1IEJA 3K6XA 1LFHA 2NVUB 2V25A 2XXHA 2Z8FA 4ZEFA 4ZZAA 2QS1A 3Q29A 2PT1A 1DPEA 3HPIA 1DOTA 3SEUA 2QS3A 1QUJA 4U2RA 1MM6A 2B65A 2IA4A 4IGRA 4EDPA 4FJPA 2VOZA 4HCWA 1IXHA 2E0SA 2WKYA 3RQTA 3PPNA 4Z7EA 4QF9A 3EQ1A 5F1QA 2O1MA 1OQHA 3FV1A 1AH5A 1MY4A 1R9QA 4OVJA 3IAZA 3IJXB 3KOTA 2Z8DA 3Q26A 4QRZA 5FHOA 3ECRA 1N7XA 2Q88A 3N26A 4YAHX 2AL5A 4XIGQ 2R6GE 3TTRA 3G3IA 5ITOA 3SEXA 1B3HA 3ONMA 1YAEA 2A5TA 1N3XA 5EHSA 4TOZA 1R1NA 1OLCA 4HCYA 4YKPA 4H5FA 1ZKBA 1MY0A 5I59B 1P1NA 4EQ9A 4KHZE 1NNTA 1B4HA 2F35A 1BP5A 4QFPA 3F11A 1M5CA 4F1UA 4RK9A 4LUBA 3RUMA 1YCJA 3PUZE 3T93B 4JWYA 4K3FA 2OLBA 1JETA 2Z22A 4G8NA 4RNSA 3IR1A 3T9HB 3T96B 5K2XA 1AIVA 1ANFA 1O63A 3GZGA 4E0WA 4F3BA 2RC7A 1B5JA 1UTBB 2O84X 2D3IA 1US4A 3MPKA 1URDA 1B51A 5I57A 2Y7KA 3TYHA 4NWDA 2G29A 4YB6A 4N07A 5DVIA 3C32A 4HW8A 3MP1A 3QK6A 4ISUA 3EN3A 1JW5A 3TCFA 1PB8A 4Q8RA 3OO7A 3IO4A 4R9GA 4ZEKA 2Y84A 3TDJA 1NMUA 3CSBA 4H6DA 5FHMA 4OFOA 1B5HA 3FGSA 3TTNA 4DCYA 2V3UA 3OO9A 1N04A 4YKKA 2XXQA 1LLSA 1N76A 3MWBA 5I59A 5I2KB 3TTLA 5AA3A 2Y7IA 3KN8A 3CVGA 3FXRA 1WDNA 5K2YA 3M3LA 1IITA 5I58B 3RLFE 1MXWA 4QHQA 2IEEA 2ONKE 3H03A 2HQ0A 1MPDA 1AL3A 5HBCA 4LZ5A 5DT6A 1GTKA 1A99A 2RC9A 1XOCA 4RXLA 2O69A 1DMBA 2PBWA 5CBSA 1LGBC 1UTBA 3KSXA 1LAXA 3TCHA 3Q25A 3TQWA 2O7UA 3B6QA 2R71A 2ABHA 2E1SA 3MZ9A 4BDMA 2B3BA 1MS7A 4ZDMA 3K0VA 4LQ5A 3H6UA 3PUYE 5ISUA 3KN7A 2XXTA 3PPPA 4OFJA 3QYTA 2Q2CA 1DPPA 4PP0A 3KG2A 4U23A 2F6PA 2DVCA 1UTHB 3BKIB 5JEIA 3FVNA 2XD2A 4I1DA 1VFDA 4U4XA 1QKBA 2YJPA 3N5LA 3QAXA 5CI5A 3PD9A 1Q35A 1ZTYA 1H45A 2DOJA 1P1OA 2XXIA 4OESA 2F5XA 2HZKA 4ELQA 1B6HA 5L9OA 1SD3A 4QFLA 3T9XB 3K6VA 2DE3A 1TFAA 4GL0A 5I2KA 4R6YA 4G68B 4JSOA 5TP9B 3FIRA 2XD3A 2Y7RA 5IAIA 5I58A 4C1UA 5CMBA 4OHNA 2Z8EA 3IB1A 4RA1A 1SYHA 2O1LA 4X1BA 4YU0A 5H8NB 4F1VA 4I62A 4R2FA 3OMBA 1I69A 1B1XA 4R9FA 5AA2A 2OWSA 2QL3A 2W7YA 2UXAA 3CSGA 1Q1KA 3SEYA 3U92A 3LR1A 4G4PA 3IL1B 4YMAA 3HSTA 3VDFA 4KPTA 4TLLB 2ZYMA 1MXUA 4KD5A 2DXYA 2HAVA 1M5EA 1H76A 1TT1A 3RN8A 4GF8A 2NUVA 4G77A 2ZNUA 1DSNA 1F9BA 3Q27A 4FIMA 3SETA 4H1XA 1UTHA 4ND9A 3R6UA 3KZGA 3G3KA 2V3TA 4AQ4A 4X48A 5A5XB 4KYEA 1B7UA 2I48A 4N13A 5JTYB 1I6QA 1VR5A 4NTLA 3VLVA 4F31B 4FE8A 4I9DA 4X1DA 4G68A 4KCCA 3IB0A 3EHSA 2PVUA 5TP9A 3K00A 3S2VA 1LBBA 2OWTA 1FTKA 4Q30B 2Y7WA 3CIJA 1LB8A 4PFTA 4U21A 5H8NA 1PB7A 4PQJA 4JSDA 3K1PA 3RTWB 1LAGE 3G3FA 2PT2A 1S7YA 4BDNA 3OO8A 3V89B 4F3SA 3C36A 2DWJA 3S9EA 2XX8A 2QMWA 3FD3A 1EZPA 3I5OA 3TZAA 4C0RA 1OQGA 1FCKA 4G2ZA 5CM6A 5KZTA 2O7IA 4OTEA 2ZNSA 2GRVA 4JWXA 2F7CA 3MAMA 2UYEA 4GVOA 1P99A 4XKRA 4OERA 4R72A 5AE4A 1IXGA 4WKMA 3LSFB 1B3FA 3K6UA 5H8SA 1D3KA 1AOVA 2AYSA 4KFQA 3TUSA 2VD3A 3IK6B 3R7XA 3FVGA 2F78A 1FQFA 5A5XA 1NFTA 3V8XB 4KI0E 3H4ZA 3TEPA 3H6WA 3BBRA 5JTYA 1SW1A 3MVYA 3E9XA 5DTBA 1PEBA 3O28A 3OO6A 4LZ8A 1S9TA 5DVFA 4MLQA 1GVCA 3CRBA 3RT6B 1RYXA 3G3JA 2QSXA 3IX1A 1RKMA 1I6BA 3C31A 4RJZA 3MZ1A 2ZMBA 4GL8A 4OEVA 3JYRA 3B6TA 3HO7A 3P7IA 4FECA 4NEDA 2QPQA 4ZEDA 2I4BA 1LFIA 5DEXB 5I56B 4KR5A 3OEMA 2I3WA 2F36A 3TODA 2ZYNA 3MVXA 3TFLA 1QW0A 2XXWA 3D4GA 1HSEA 4H65A 2NWJA 3FJGA 4P0IA 1B1HA 4ESXA 3UIFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O6AA 1B40A 4N6KA 2RCBA 3A3CA 3IOVA 1A55A 4XKNA 1LAHE 4NG7A 3LUYA 1KWHA 1LCFA 3QUFA 2R9JA 1JQFA 4GQOA 2XX9A 3K1MA 4FEBA 1IIWA 5IM2A 1ZLQA 4MHFA 1IZ1A 2CZLA 4GWXA 4DXBA 3IORA 3Q28A 4U1ZA 5CC2A 1B32A 1IQ7A 1Y9UA 2F3BA 4MEVA 3K4UA 3KJ7A 1NI9A 5CMKA 2QRYA 1FQAA 4U4SA 1MY3A 3MC2A 2VHAA 1MXZA 1FBCA 4AB6A 1FQBA 2FIEA 4P1EA 4FEDA 2V4CA 2Z23A 3CFXA 4BLAA 1FBGA 3U72A 3B6WA 3FUZA 2YLNA 3S9MC 2ZZXA 2XXUA 3OXNA 4HTGA 1B7HA 4QBAA 3UP9A 5IKBA 1FTJA 4JVCA 2XX7A 3GBBA 1S50A 3O29A 1Y3QA 2ZNTA 3U1OA 1XVYA 3B7DA 3RPWA 1QULA 2H9BA 2XXYA 3PPRA 5I56A 3PMVA 1NL5A 3DP6A 4GWUA 3FV2A 3G3HA 3MPLA 4F1YA 4GD5A 4GWWA 3KC0A 3CFLA 4JXIA 4QSCA 2QVUA 3CG1A 4O3BA 1FPEA 4KYSA 3KFMA 3VVEA 1FRPA 3GYYA 3VVDA 2O68A 2D5WA 3PD8A 3ILUB 1FQDA 1FPIA 3O6HA 1H3DA 1OVBA 3KJTA 3ZS6A 3HHFA 2GH9A 2ZZVA 4F3PA 2B3FA 5H8HB 4N6PA 1MXXA 3O97A 2DWAA 2PFZA 1LEVA 1IMEA 4G68C 4NMYA 1FBEA 5B70A 1FPBA 2HPGA 5TPAB 3KOSA 2XHDA 1SBPA 1GGGA 2F6GA 3QIMA 1FPJA 2I49A 4O3CA 3GBAA 2XXVA 4ECFA 4I3EA 4ZECA 1B9JA 4THIA 1MH4A 3H3GA 4ZS9A 4X04A 4IO5A 4WEDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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