3B6QA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) mutant t686a in complex with glutamate at 2.0 resolution
Total Genus 82

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTAAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural and single-channel results indicate that the rates of ligand binding domain closing and opening directly impact AMPA receptor gating.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b6qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b6qA02
1S50A 1MQIA 4PFWA 2XXQA 3M3KA 3MUQA 5K2YA 3KFMA 3I6VA 1HSJA 4FORA 5FTHA 4IGTA 4WEPA 2Q88A 2HQ0A 1B52A 3O28A 4QHQA 4NF4B 4JSDA 4R74A 3EHUA 2ZXTA 2XXXA 2XXWA 1Y4TA 4JXIA 1PBQA 1US4A 2QRYA 4UA8A 4JWXA 4OEUA 2QS1A 3IAZA 5I2KA 5TP9B 3PMVA 1SBPA 4NTLA 2H99A 4IGRA 1DPEA 1IITA 5CI5A 2UVIA 3VVFA 3OSQA 4LA9A 4NE4A 4OFLA 2ONSA 2Z8FA 1LB8A 3SESA 4U4XA 3CR9A 1AMFA 3B6WA 5HPQA 3RGYA 1QUKA 3THIA 4QFLA 3CI8A 4QF9A 3KJ7A 1JVYA 2DS9A 2BJJX 1TFAA 1I6AA 1LFHA 4AB6A 4G8MA 3I5OA 3R7XA 5L8DA 3K01A 3VXCA 3GZGA 2HZKA 4HTGA 4IO2A 2DQVA 3MVYA 2F6PA 1VE4A 2PYYA 4F29A 3ZKKA 2UVJA 1MM7A 3B7DA 4EQBA 4OWDA 3IK6B 1N3WA 3TQWA 1H45A 5I56B 3TTMA 3RNNA 5I59B 4R6YA 4RJZA 1SI0A 4F18A 2I4BA 3FXRA 4L17A 3C35A 2YJPA 4QFNA 3Q28A 3RT6B 1ZTYA 3TCGA 4BDOA 1QW0A 3U93A 1SVXB 4M1VA 1NFTA 2H98A 1ZIUA 5FHOA 3ECRA 4ELQA 4IY6A 4YKJA 4OEVA 1XVYA 4QSEA 4KFQA 5ICQA 3FVKA 2W7YA 4E0XA 5BUUA 1XHYA 2DYXA 5JTYB 5CMKA 2VP1A 3K2DA 4NWDA 3IOUA 4HW8A 2RC7A 4YKPA 3RTWB 3S9EA 4KYSA 4H0WA 4R9GA 5TP9A 1I6QA 2QS4A 2P2AA 3LSLA 1EZPA 4G8HA 4OQOA 5JEIA 4I1DA 4DCXA 3PPOA 2ZYMA 4DXCA 3VLWA 3TMGA 1ZBMA 3S2VA 3MZ9A 3K02A 2XXIA 5EHSA 4BDQA 3PMWA 3EQ1A 4U2RA 1B3EA 5H8FA 2F7AA 2QSXA 3QK6A 3DP4A 5DVFA 1GTKA 1YAEA 3HN0A 5I57A 4G68B 2R6GE 2PMSA 4OETA 2GHBA 1L5TA 3K00A 1PDAA 3H7MA 4F3BA 1LBBA 1LGBC 2E0SA 4OMBA 4KHZE 3TTRA 1D9YA 3FIRA 4NF8A 3IL1B 2PX1A 2HXWA 3OELA 5I59A 4GXAA 3TTNA 4TLLB 2RC9A 2NVUB 1IXCA 1VFEA 1H3DA 1N7XA 1LBCA 4C1TA 3MP1A 3TZAA 3U8QA 3FATA 4BDNA 4Q8RA 1EU8A 1MXVA 1N3XA 1O63A 1M5EA 4R2BA 1FCKA 1DTGA 3OOAA 4U4SA 1LAGE 4HCYA 5HM4B 5AA2B 2ALUA 3MZ1A 3GBAA 4OESA 1DSNA 3C32A 2OWSA 3SDFA 4Q0CA 4JB7A 3ILTB 4PP0A 3PPNA 1JQFA 3VV5A 5A5XB 5B7DA 4MBPA 4BDMA 2DSFA 2ZNSA 2O51A 4GRKA 3RQTA 2FA7A 4H65A 4BLAA 4LATA 3KN3A 2D3IA 2XX7A 3Q26A 3RUMA 3MPKA 1DTZA 1NL5A 1USYE 4XXUA 3O6GA 3QIMA 3A3CA 1CB6A 1TT1A 2XD2A 3K1MA 2Q2CA 4KYDA 4ZS9A 3V8XB 3MBPA 1VFDA 2Q2AA 2ZYOA 2I0CA 1UTHB 2DE2A 4DLDA 2Z22A 3G3FA 4IO5A 3KSJA 3FASA 1B3GA 4G4PA 3PD8A 3T96B 2H9BA 3IB1A 2RC8A 4KQPA 3TTKA 3ONMA 4G68A 1PB7A 3D4CA 4R9FA 3TQLA 3IX1A 2H25A 2VHAA 2A5SA 5TPAB 1JETA 3EPEA 1SI1A 4K3FA 5H8SA 3IJXB 3OO7A 4JWYA 3PD9A 2XXTA 4PETA 4TQUQ 2GFEA 3QXMA 4RY1A 3RLFE 3TODA 5DYHA 4G68C 2VGQA 2G93A 2WKYA 4R2FA 3T66A 5CRYA 3W9VA 3S9MC 2AL5A 3H6UA 5M2VA 5H8NB 4F1YA 1JNFA 3UGWA 3MVXA 1OIBA 1OQGA 2OWTA 3FD3A 3UORA 5AA2A 4NF5A 2XX8A 4FECA 4FEDA 3MP6A 2HAUA 3Q27A 1ZJLA 2X26A 1MY2A 1SYHA 4YAHX 3EN3A 1MH4A 1JEVA 5AA1A 1QULA 3HPIA 4THIA 3VVEA 3HV1A 4ZDMA 3CFLA 4MF3A 3ZS6A 5ITOA 3RT8A 2XXHA 4X9TA 3S4UA 1B1HA 4P11A 4WXJA 1A7LA 3OEMA 4EF1A 1AOVA 1S7YA 5KDTB 3MC2A 3G3JA 4GQOA 1LAXA 3PPQA 3KZGA 1H44A 3H06B 2O7IA 3M8UA 3TELA 4FE8A 1UTHA 4X1DA 3DP8A 1R9LA 3G3IA 3BKIB 1MXWA 1JW1A 1P1UA 1F9BA 3R6UA 1IXHA 4WKMA 3TPAA 3PGFA 1ATGA 3N94A 2M8CA 1II5A 1T0KA 2HZLA 4ZEDA 4LVQA 3H03A 3P7IA 1DMBA 4ISUA 4F19A 1QKBA 1Z7ME 3BFUA 4YKKA 1QUJA 2PT2A 3JZJA 1AH5A 3TEPA 5L9SA 3O97A 4KD5A 3T22A 2OZZA 1MS7A 1SW2A 1TWYA 3TYHA 4I8CA 1Y4CA 3O6IA 3MVZA 1M5FA 2B3FA 3PPRA 4C0RA 3KG2A 2ABHA 5CMCA 2HFBA 3UIFA 5F7VA 4F3SA 4HS7A 4I9DA 4H5GA 2XHDA 3PPPA 5L9MA 1GV8A 1B5IA 1M5CA 2QL3A 5CC2A 3CG3A 1Q1KA 2THIA 1ZKBA 4RK9A 3MVWA 3MP8A 4ZEIA 1B0HA 4N6PA 4EDPA 4ELRA 3SKPA 2NUVA 4IO7A 1NNFA 1BKAA 2RINA 1I6BA 1PC3A 3LSFB 1RKMA 4MH5A 4ESXA 4F22A 3QUJA 1TFDA 1H43A 5KDTA 1JVXA 3FVOA 1O64A 2F8DA 1B1XA 4R75A 1MQDA 3WAFA 3VFJA 3U72A 4GF8A 4LZ8A 4M4GA 3EHTA 4EXLA 4MFIA 1FQBA 3LUYA 5DVJA 1Y1ZA 1VR5A 3E4RA 4QSDA 5I2NA 4ZE9A 2I48A 4Q30B 1CE2A 1MM6A 3U1OA 3IOVA 3EF7A 3AXFA 1D9VA 4QFOA 4MLQA 3SEYA 4UACA 3Q25A 2QMWA 5H8QB 1MY3A 4ZZAA 1P99A 3LC8A 3PUZE 1EZ9A 3TCFA 2OLBA 1LAFE 1GVCA 3KEIA 3VLUA 3M3FA 1MXYA 3V5AA 2O1LA 3KOSA 4YMBA 4XIGQ 3KSXA 4NF4A 1FTKA 2P1SA 3OO6A 3TFLA 4P0GA 2YLNA 4KYEA 4U21A 2HAVA 3F11A 1JW5A 3JYRA 5L9OA 1MRPA 4JDFA 3T9XB 1B46A 3IR1A 5B70A 4F2OA 3SEVA 4PFTA 1P1QA 2LAOA 2F78A 1BLFA 3A3UA 1Y1MA 1I69A 2IEEA 3WAEA 2F5XA 4H67A 4WEDA 5ICTA 4DDDA 4X48A 4GFRA 4OERA 1N7WA 4F3GA 3MAMA 1SW5A 1N04A 1MQGA 1LFIA 3HHGA 4XKPA 1B7ZA 3Q29A 1FTOA 2V93A 1NNTA 4G77A 2O1MA 4NMYA 3T93B 5KCJB 4PE5B 4XKRA 1MDQA 4KPTA 4QSCA 1MXXA 2V3TA 1B3HA 4OYVA 3TTLA 1WDNA 3T9VA 2UYEA 3N6TA 4E0WA 1OVBA 1WODA 1ZU0A 1MG1A 5I56A 4XKNA 4GL8A 4ECFA 1Y9UA 1FTJA 2Y7KA 1KWHA 4IY5A 1B9JA 3ODBA 1AL3A 2G29A 3B6QA 3BFTA 1Y3PA 3CVGA 4RNSA 4O3CA 5I58B 4PQJA 3T9UA 4ESWA 5CMMA 3KOTA 3IOTA 1MPBA 3DP6A 1SQYA 1LAHE 4YKIA 1R1NA 2DP8A 3H3GA 3FJMA 3SETA 5JTYA 4IB2A 2QJEA 2AYSA 4F1VA 4ZEFA 3HCQA 1B05A 4EQ9A 4BDRA 1MY0A 2A5TB 4U22A 4G2ZA 4ZECA 2F7CA 3RN8A 5CBSA 1MXUA 1SW4A 1B7UA 4U1ZA 4NF6B 1P1NA 4ND9A 1MPCA 4GOTA 4F31B 2Q89A 1Z7NE 2DVZA 2XD3A 5ITPA 2XXYA 1PB9A 4JSOA 3MPLA 2ZMBA 1B58A 1YCJA 4TOZA 1IEJA 2DWAA 2AIXA 4OFJA 3UN6A 3PUWE 3IB2A 5FTIA 5AA4B 3IO4A 3VE1B 4OENA 4DXUA 1A8FA 3QYTA 4DXBA 3O29A 3FJ7A 3CG1A 3QAXA 2Z23A 4H8JA 3KN7A 1B4ZA 1B2HA 3K0VA 3SEXA 2OCUA 3K6VA 2H4IA 1POY1 3MQ9A 3CSBA 2O84X 2REGA 4EQ7A 5FHNA 3FUZA 3SEWA 2ESNA 3HHFA 2UXAA 2ZNUA 1LFGA 1WVJA 3MWBA 2Z8EA 2F97A 5I58A 1USYH 1B0LA 4POXA 5DT6A 3FGSA 3OXNA 4ELPA 1NH7A 2CZLA 3TAJA 2DVCA 1LCFA 3N6UA 1IZ1A 2XXPA 1EZOA 3LSXA 4ONYA 2PT1A 3FVGA 5A5XA 1DOTA 4LZ5A 1POTA 5I2KB 5DEXB 3H6VA 4PFUA 2RKMA 4GD5A 3DELB 3G3KA 1A99A 1PEBA 4YB6A 1OLCA 5LOMA 2I0BA 5AA2D 1B4HA 1P1OA 3KN8A 1ELJA 3O6HA 3HO7A 1PBPA 2DWJA 3IJOB 4DE8A 3O66A 2R71A 2XXUA 3U94A 4OVJA 4DIGA 2Y7IA 4YU0A 2IA4A 3E13X 1TXFA 4F3PA 1RYOA 3MJNA 3HSTA 4RYAA 5TPAA 2B65A 3OD7A 1MXZA 2HEUA 5ISUA 3IB0A 2X7QA 3JV9A 1BIYA 4RK2A 3UA8A 1OQHA 1HSLA 1MH3A 3IOWA 2Z8DA 3OMBA 1LLSA 1NNPA 1EH3A 4NWCA 1FQAA 2ZYKA 4QFKA 4LZ7A 2VD2A 2O6AA 3U92A 3G7WA 1FQEA 5H8NA 4YZZA 3C4MA 3VVDA 3K6WA 2ONRA 4LQ2A 2VD3A 3FJGA 2Q9TA 3UK4A 2OJTA 2PVUA 2AL4A 4R72A 1Y20A 4F39A 4GIZA 3IO6A 2O7UA 3O9PA 2V25A 2DWHA 5IKBA 4G8NA 5DEXA 2OK2A 3FXQA 5J1DA 1US5A 2DE3A 3C33A 3W15C 1UIUA 4OTEA 3GLBA 1A40A 4GWOA 2P0SA 4RXLA 1BTJA 2I3WA 1OLAA 3OSRA 1PB8A 5AA3A 3PUXE 3R26A 5DTBA 5H8FB 4U1OA 3RTFB 3PMXA 1QKAA 3S9NC 3ILUB 5F1QA 4X1BA 5EYFA 3TDJA 1AIVA 5EHMA 5I57B 4OZ9A 3FV2A 5CBRA 3OO9A 1LSTA 2GH9A 1A54A 2E1SA 4PFYA 1Q35A 1RYXA 4RPNA 4NF8B 3QUFA 3SERA 2VOZA 1QVSA 3PV0E 3K6UA 1FQDA 4OHNA 3T9HB 3OENA 5IAIA 2DWIA 1SYIA 4FIMA 3FZVA 1GR2A 2H5YA 4KI0E 1BP5A 1N76A 5KZTA 3H4ZA 2O68A 4H6DA 1OVTA 4H5FA 5HBCA 2D5WA 2B3BA 3A09A 3EHSA 5K2XA 2F6GA 3H6TA 3C36A 1XVXA 2UVGA 3IORA 3OEKA 2D21A 4QRZA 3DM0A 4XKQA 1M5BA 3PUVE 1A55A 5FHMA 3L6GA 2DE4A 1B7HA 1B5HA 4ZE8A 2FYIA 3PUYE 3FV1A 4GXSB 3UP9A 4IO6A 1M5DA 4O3AA 2QS2A 3ZKLA 2R9JA 1QUIA 1URGA 2O69A 2ZNTA 1SW1A 4POWA 4FATA 1IXGA 2DOJA 4RA1A 2DXRA 3M3LA 3DLNA 4QFPA 2GHAA 4ZEKA 1UTBB 1D4NA 4JBZA 1IIWA 1MQJA 1Y3NA 2NWJA 4DCYA 1N0TA 4IO4A 2F35A 4GVOA 2QMXA 1O7TA 1MY1A 1FQFA 2RCAA 3N5LA 4N07A 3OO8A 3V83A 2FNCA 1B5JA 4U23A 4RPOA 5H8QA 4ZEBA 2I3VA 3QSLA 3LSWA 3C34A 1NNKA 3O2AA 4EF2A 3FVNA 4Q5TA 2V84A 2F7BA 4GL0A 1MQHA 4YB7A 1JEUA 2UVHA 3CRBA 3K1PA 4MLVA 4R6HA 4DZ1A 3ZSFA 4KCDA 1NKXA 1H76A 1FTLA 1URDA 1SD3A 2Q8JA 1NH8A 1ZLQA 2XXVA 3GBBA 4ZZEA 1IQ7A 1Y3QA 1XS5A 4FJPA 4NF5B 1IXIA 4GLIA 2CMOA 2I6EA 2F36A 1YTVA 2Y7WA 4H1XA 1QJMA 1HSEA 3I3VA 2V3QA 1B3LA 2XXRA 1UIVA 4OXVA 3CFXA 4F1UA 4HCWA 4JWOA 2ZYNA 3FXUA 3MZBA 5BWJA 4IO3A 4XTCQ 4Z7EA 3USDA 1R6ZA 1P1WA 4O3BA 1MPDA 3K1NA 1UQWA 3LR1A 1N84A 3D4GA 3L6HA 3GXAA 4ELOA 2I58A 4N13A 1R9QA 2RF1A 5KCJA 4Z0IA 2QS3A 1MY4A 3RPWA 1B32A 1UTBA 1XOCA 3CIJA 3W9WA 4F2QA 2PBWA 1FW0A 5H8HB 1FQCA 2ANJA 3KGCA 4KCCA 5CM6A 2DXYA 1LCTA 4YB5A 3RY3A 1DPPA 2GRVA 4LUBA 3S9LC 4AB5A 4YMAA 1SDXA 3B6TA 3H6WA 2OBGA 3PU5A 3LBSA 1S9TA 1NMUA 1ZMGA 1FTMA 2ONKE 1A8EA 1ANFA 3VDFA 4EUOA 2HCAA 1D3KA 3TUSA 3E3KA 2V3UA 3CFZA 4R6KA 1B3FA 5DVIA 5AE4A 1J1NA 2A5TA 3KJTA 2F34A 4EXKA 2RCBA 5TU0A 2I4CA 2YPNA 1YPNA 2X7PA 4NF6A 1OMPA 2Y7RA 4R73A 5I84A 5CMBA 4P0IA 3V89B 3KBRA 3MW0A 4C1UA 4TLMB 1GGGA 1IUDA 1B40A 2NOOA 1URSA 4I62A 3C9HA 1LB9A 3VLVA 5JK4A 2Y84A 5AA4A 3K4UA 1MDP1 3K6XA 3G3GA 2UYFA 2Y7PA 4LP2B 4LQ5A 1JW4A 3G3HA 4FAJA 4FEBA 3TCHA 4NEDA 4BDLA 4AQ4A 3C31A 5ELVA 3VXBA 1B51A 1XC1A 4LONB 2KLFA 2I49A 3E9XA 1B6HA 2QPQA 3CSGA 2REJA 3BBRA 5I2NB 4H8IA 1XT8A 4YICA 4OFOA 2XX9A 3TKDA 4KR5A 3SEUA 1VSOA 3N26A 5H8HA 2NXOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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