3B7DA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (hs1s2j) in complex with cnqx at 2.5 a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title TARP auxiliary subunits switch AMPA receptor antagonists into partial agonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b7dA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b7dA02
2AIXA 2F78A 1TFDA 4PE5B 1H44A 3HO7A 3S9EA 4F29A 5TPAA 3OSQA 3O29A 3TZAA 5KCJB 2LAOA 2R9JA 4OENA 1USYE 4I1DA 5BUUA 5DEXB 1LFGA 4ZECA 3SKPA 4U1OA 1MQIA 4FEDA 3KN7A 1MPDA 2V93A 4JB7A 2DYXA 4G68B 4HS7A 4F3BA 3M3FA 3RT8A 4NF4A 2ZYKA 2GFEA 4I8CA 3QK6A 3BFUA 5I2KA 5L8DA 3E4RA 4N6PA 3FV2A 2ANJA 2PBWA 4NE4A 4MFIA 2W7YA 1MXUA 3T9HB 5ITPA 3LC8A 1NFTA 4YKPA 1B7HA 4QFLA 1NNKA 3SETA 4YB6A 3I6VA 1NNTA 1FTKA 2XHDA 4KQPA 1JQFA 4POXA 4EDPA 3PUXE 1URGA 2VGQA 1FQFA 1FQEA 1IIWA 4WKMA 3TCFA 2F34A 2B3FA 3C9HA 5H8HB 1PC3A 1OIBA 4DCXA 1MG1A 1S7YA 4F3GA 2HXWA 3HCQA 2H25A 1WVJA 2QMXA 3E13X 5FHMA 2I48A 4F3PA 2DVCA 2ZMBA 3C31A 4QF9A 4R6HA 1P99A 3MP1A 5EHMA 4IY6A 4R74A 4EF2A 3FATA 4EXKA 3FD3A 1ZU0A 4ND9A 5FHOA 3RN8A 4NF8A 3THIA 1NH8A 3CVGA 3QXMA 2DXRA 1GVCA 2A5TA 4U1ZA 3CG3A 1A54A 1POY1 2XX8A 4MH5A 1A99A 4F31B 3HSTA 3G3JA 2QPQA 2I3WA 2Z8DA 1MRPA 1SYHA 3MVYA 1LB8A 1N84A 2V3QA 1Y3QA 4JWOA 1B1XA 3OO9A 3H4ZA 4PP0A 3PUZE 3U1OA 1M5BA 1XOCA 4XTCQ 2FNCA 3GLBA 2XXWA 4GLIA 1SI0A 3PV0E 4GRKA 2DQVA 3RLFE 4OQOA 2XXQA 1LAXA 3ZKLA 3UIFA 2VOZA 2WKYA 1JW1A 1OLCA 2ONKE 1NL5A 3S9NC 1N0TA 3ZS6A 1B2HA 5TU0A 3MVXA 2OJTA 2O7UA 1LFIA 3PPQA 2HCAA 2QL3A 1B1HA 5I2NB 3T9XB 1PBPA 5TP9B 5AA2A 3CFZA 3T9VA 5M2VA 3R7XA 3RPWA 1ZIUA 4N07A 3IR1A 1I69A 3SEVA 2XX9A 3K02A 3FVGA 4AB6A 3MPLA 4YMAA 1PB7A 3HHFA 3M8UA 5I56B 4X1DA 2QS3A 1XC1A 2I4BA 5IAIA 4N13A 1UIUA 4HW8A 1SD3A 2DWHA 2A5SA 4RK2A 3I3VA 3U94A 2Q89A 1N3XA 1GV8A 2GH9A 2XXVA 3S9MC 2KLFA 3FXRA 3KSJA 1VSOA 3TTKA 4BDQA 3VXCA 1QVSA 1D9VA 3H6TA 3TUSA 1ANFA 4ELPA 4F1UA 1Y3PA 4TQUQ 2RKMA 5A5XB 1VR5A 3OSRA 4EQ9A 1MQJA 3OEKA 4H1XA 5I58A 3D4GA 1MPBA 2I58A 3FIRA 5K2XA 3W9WA 4C1UA 1SYIA 3MW0A 4FE8A 5IKBA 4IO7A 4IGTA 2VP1A 4RXLA 2HEUA 2F7CA 3G3GA 3PPRA 3U93A 2ONRA 1IXCA 4ZEDA 1S50A 3JZJA 4EQ7A 1O63A 1B5HA 3TCHA 1XVYA 2PVUA 1JEVA 1JNFA 5CMMA 2QS2A 2DWJA 4F1YA 3RTWB 3SDFA 3SEXA 4G8HA 4MLVA 5H8NB 3L6GA 4WEDA 1FTLA 3IOTA 3B6QA 2OCUA 4LVQA 4OFLA 1LBBA 2E0SA 4QFNA 2H9BA 4IGRA 3CSGA 5FHNA 2ALUA 5JEIA 3DELB 4C0RA 5CC2A 5K2YA 4R6KA 1LCFA 3RT6B 4E0XA 4RA1A 3C36A 1TXFA 1QUJA 3PPOA 3DP6A 4RJZA 4P11A 5DEXA 1FQBA 4F19A 4H6DA 2FYIA 1P1WA 3IK6B 3G3HA 1O64A 4EXLA 2HQ0A 4G68A 4OZ9A 3QIMA 1URSA 1EH3A 4THIA 5HBCA 1LAGE 1SW4A 2HFBA 4U21A 4G8MA 5I57B 3PMVA 3K1NA 1ATGA 4Q0CA 3CRBA 2ESNA 5CBRA 1P1OA 1EZPA 3LUYA 3ILTB 1BP5A 4DXBA 4NF6B 3FVNA 3H06B 3G7WA 3B7DA 2I4CA 4Z7EA 1ZTYA 1TFAA 5CMCA 1FTMA 4LA9A 3Q28A 1FTOA 3PUYE 3ECRA 4R9GA 3TODA 2DSFA 5BWJA 4OVJA 4KD5A 4DDDA 4QSDA 2H99A 2O69A 3MPKA 5ELVA 1LFHA 1AL3A 3KOSA 5H8HA 1J1NA 4BDOA 5B70A 3B6WA 3K01A 4OFJA 3S2VA 5AE4A 2ZNSA 3OO6A 4QHQA 4H0WA 5LOMA 2ZYNA 3EF7A 3V8XB 2NVUB 1JEUA 3MP8A 1N7WA 4LATA 1B3EA 5DVFA 2F6PA 2ZYOA 3TQWA 2GHAA 1LGBC 4O3AA 3KFMA 1AH5A 3OMBA 2YPNA 4GOTA 4MBPA 4GWOA 1LSTA 4GIZA 1JVYA 3ILUB 1PB9A 1Y9UA 2QS4A 4ESXA 1RYOA 2XD2A 3JV9A 3TQLA 5H8FA 5DVJA 3O6GA 1EZ9A 2FA7A 1POTA 4GFRA 4QFOA 4ZS9A 3U72A 4R73A 3WAFA 1MH4A 2UVGA 1WODA 3K6WA 2I6EA 4MF3A 2DVZA 5DT6A 1B40A 3A09A 3R6UA 1VFDA 1AOVA 4JSDA 1OQGA 2H5YA 3ONMA 1B46A 4NWDA 3IOVA 1MQDA 3IO6A 4U4SA 3C35A 1R9LA 3MWBA 4ELOA 1Y1ZA 3CFLA 4JSOA 2I0CA 5I2NA 4ECFA 4PFTA 1DOTA 5TP9A 4NWCA 2THIA 1MM7A 3T96B 4U23A 4FATA 3VVEA 5AA4B 5F1QA 2PT2A 1IITA 3S9LC 1ZLQA 4O3BA 3V5AA 3C34A 1DPPA 5ICQA 5I56A 4KI0E 1D4NA 3KN8A 1YCJA 4ZE9A 1XVXA 3D4CA 4YKKA 3QYTA 4NMYA 2F7AA 1MXWA 4H67A 4DCYA 1B3GA 2Y84A 1N76A 2RC8A 1D3KA 3TTMA 3C33A 1N7XA 3VVFA 2IEEA 3KEIA 1LAHE 1H43A 5CI5A 4G4PA 4EF1A 1XHYA 3T66A 2XXTA 4X1BA 2DXYA 2V3UA 4HCWA 1ZMGA 5DVIA 1H76A 4LQ5A 2ZYMA 2GRVA 1B9JA 3MVWA 1SDXA 2ONSA 4M4GA 2Q88A 4GL8A 4RNSA 1DTGA 3Q25A 5H8SA 3H7MA 1MQHA 3RQTA 1SBPA 4Z0IA 3OENA 5I2KB 3FJGA 3PD8A 1EU8A 3PU5A 1HSLA 1URDA 5H8QA 5JTYA 4NEDA 4PQJA 4RPOA 3KN3A 3FJ7A 4FAJA 3UORA 3I5OA 3ODBA 1QKAA 2XXPA 1QKBA 2QS1A 1LLSA 1UTHB 4R6YA 1USYH 3W15C 1B7UA 1P1UA 3N6TA 1B4HA 2Y7IA 3KZGA 2O7IA 4YMBA 4LZ8A 2HZLA 1JETA 4NTLA 3IO4A 1LCTA 1TT1A 3BBRA 1M5DA 2RF1A 1N3WA 5DYHA 3E9XA 4PFWA 5DTBA 4FEBA 1TWYA 2NWJA 1UTBB 3OO8A 2AYSA 3N6UA 1GGGA 4F2QA 3O28A 2OZZA 3SESA 1B5IA 2F97A 1VE4A 4QSCA 5L9MA 3KJ7A 4L17A 2QMWA 4O3CA 3TYHA 4Q5TA 2VD3A 4I9DA 4QFPA 4G68C 1B3LA 4ZZEA 2ABHA 4OESA 2UVIA 4H5GA 3ZKKA 4AB5A 3IAZA 3IJXB 4IO2A 3CG1A 1B7ZA 2V3TA 3MZ1A 4GL0A 1Y20A 4GD5A 3TTLA 2NUVA 2XXHA 5I57A 3O66A 3BKIB 1B3HA 3Q29A 4K3FA 1H3DA 1IXGA 3DP4A 4HCYA 3MZBA 1BTJA 1I6BA 1Y4CA 5KDTB 4NF6A 2YLNA 3GZGA 2P2AA 3JYRA 4GQOA 4H8IA 2OBGA 2REGA 1Z7ME 5EYFA 2Y7PA 4Q8RA 2OWSA 5CRYA 3OELA 3L6HA 3VLVA 3K6UA 1MDP1 1D9YA 3LSWA 2UYEA 3GBAA 3V83A 3GBBA 4IY5A 3LSFB 3A3CA 3N26A 4OTEA 3VV5A 1B52A 4UACA 1B6HA 1PEBA 1CE2A 1M5FA 2HZKA 4ZEIA 3PMWA 4GF8A 4TLMB 2R6GE 2O1MA 4QSEA 2D21A 2E1SA 1Z7NE 4DXCA 3R26A 2VD2A 4JXIA 2PYYA 1I6AA 3UN6A 4BLAA 1US4A 4PFYA 1DSNA 2BJJX 4OXVA 3K1MA 1A8EA 4H8JA 5KCJA 3Q27A 1R6ZA 1NH7A 2XX7A 2Z8EA 1MY3A 3QUFA 4E0WA 4KPTA 1LBCA 4YB7A 4R72A 1MY2A 4RYAA 3B6TA 1OQHA 4OYVA 4R9FA 2IA4A 3IL1B 4IO4A 4WXJA 4ISUA 4I62A 3T93B 3DM0A 2DP8A 1M5EA 3M3LA 3IB2A 4KCCA 3CFXA 1WDNA 1PDAA 4H5FA 1I6QA 3TAJA 3SEYA 4GXAA 2ZNTA 3MUQA 2D3IA 4G2ZA 5I58B 4P0IA 2UVHA 2B65A 1JW5A 2R71A 1FCKA 1B32A 4RPNA 3VXBA 3K0VA 4BDRA 4ESWA 1T0KA 3ZSFA 1B05A 2PMSA 4AQ4A 1MDQA 4LQ2A 1ZKBA 1N04A 3O2AA 4XXUA 2RINA 1S9TA 3EHUA 2AL4A 2PX1A 4F3SA 1IZ1A 4H65A 2H4IA 4QRZA 4BDLA 5AA4A 1QULA 4XKPA 5FTIA 2F6GA 4U22A 3BFTA 4FECA 3H6UA 3VE1B 3KSXA 3FVKA 1BLFA 3MAMA 2XXUA 2M8CA 2V84A 3HN0A 4JDFA 1JVXA 4EQBA 3RY3A 1SW2A 1AIVA 3G3IA 2QRYA 3P7IA 3KG2A 1NKXA 4RY1A 4TOZA 3PMXA 5AA2D 4DLDA 4QFKA 3K6XA 4YB5A 2REJA 2DS9A 4DIGA 3VDFA 3H3GA 3LSXA 2OK2A 4NF5B 3OEMA 1HSEA 1UIVA 4FORA 3FXUA 3PD9A 1MXZA 1IEJA 2Q2AA 2V25A 1R1NA 3RGYA 3OXNA 3EHTA 3VFJA 5AA1A 2GHBA 1QUKA 4F39A 2UYFA 4R2FA 3FUZA 4WEPA 3K2DA 4YKJA 4ZZAA 4ONYA 3QAXA 3TKDA 1ZBMA 1UQWA 4JBZA 3W9VA 3K1PA 1YAEA 2P0SA 1IQ7A 4XIGQ 4JWXA 1SVXB 3VLWA 2I3VA 4G8NA 4MLQA 2Y7RA 3KGCA 3KOTA 4F18A 1YPNA 1ZJLA 5FTHA 3G3FA 3TTRA 3RUMA 1UTHA 2UVJA 1QW0A 3DP8A 4PFUA 1US5A 3HPIA 3RNNA 4LP2B 5CBSA 1JW4A 3SERA 1B4ZA 2VHAA 2X7PA 2DWAA 2Y7KA 1MPCA 2PT1A 4ZEBA 3TEPA 1RYXA 1UTBA 3K4UA 1VFEA 1MXYA 3H6WA 3TDJA 2RCBA 1OVBA 5I59B 2DE4A 3C4MA 2UXAA 1SW5A 4OERA 5ITOA 3N5LA 2F8DA 5I84A 1GTKA 3TFLA 3IOUA 5TPAB 2HAUA 1QUIA 1Q35A 2O6AA 1EZOA 4YU0A 4LZ5A 2CZLA 3PGFA 2CMOA 4DZ1A 1MY0A 2RCAA 1NNFA 3OD7A 3IJOB 1B51A 1P1NA 5H8FB 5A5XA 2XXXA 1MS7A 4JWYA 2G93A 3UA8A 3TCGA 3KJTA 3FV1A 3H6VA 1B3FA 4LZ7A 4NF4B 1RKMA 1B0LA 4BDNA 3EN3A 2DE3A 2XXIA 3OO7A 4XKNA 3UGWA 3K6VA 5KDTA 1DPEA 3LR1A 2DOJA 3FXQA 5J1DA 1FW0A 1MXXA 2F36A 2Y7WA 2Z23A 4BDMA 2ZNUA 4IB2A 2QSXA 5ICTA 4X48A 3TELA 3CI8A 3OOAA 2QJEA 3Q26A 3SEUA 4U4XA 2X26A 5H8NA 1GR2A 3FGSA 2DE2A 1Q1KA 3RTFB 1OMPA 1MM6A 1SQYA 2H98A 3LSLA 4OWDA 2O84X 4F2OA 4KYEA 2XXYA 2NOOA 1NNPA 1MXVA 3FZVA 2NXOA 3SEWA 1FQCA 3MVZA 1MY4A 3TPAA 1B0HA 4HTGA 4NF8B 4RK9A 3O6IA 3E3KA 2OLBA 2ZXTA 3G3KA 2A5TB 1HSJA 1MQGA 2Z22A 3VLUA 4F22A 2OWTA 2AL5A 4KHZE 2XXRA 4DXUA 2O68A 3MZ9A 1A55A 3TMGA 4ZEFA 4XKQA 4YKIA 1PBQA 5EHSA 3PPNA 3K00A 3FVOA 3O6HA 4UA8A 3A3UA 1SI1A 5B7DA 4OETA 1A8FA 3MBPA 4ELRA 1LAFE 4X9TA 4R75A 4LONB 4KFQA 3U8QA 3IB0A 1DMBA 1ELJA 1BKAA 4F1VA 1YTVA 2O1LA 4IO5A 3PUWE 3PUVE 5H8QB 5JTYB 4OFOA 5KZTA 4G77A 4ZE8A 3FASA 3LBSA 1P1QA 3H03A 1MY1A 4IO6A 1IXHA 3FJMA 1DTZA 1H45A 2G29A 1B5JA 3AXFA 5AA2B 2RC9A 3O97A 5ISUA 4C1TA 4FIMA 2F35A 4TLLB 4YICA 4M1VA 4OEVA 3MJNA 1NMUA 3CIJA 2RC7A 2Q9TA 1CB6A 3VVDA 4OMBA 3IB1A 5CMKA 3CR9A 2B3BA 5L9SA 3CSBA 3PPPA 1XT8A 5CM6A 1FQAA 1FTJA 3TTNA 3N94A 1MH3A 1KWHA 1O7TA 4KYSA 4DE8A 2I49A 3C32A 1QJMA 1R9QA 1M5CA 4EUOA 1PB8A 3EPEA 5CMBA 4NF5A 2DWIA 2YJPA 4YAHX 1OVTA 4KCDA 3MP6A 3V89B 5HPQA 1Y3NA 3T9UA 1BIYA 4GVOA 3U92A 1A40A 4U2RA 4IO3A 2Q8JA 4XKRA 4KR5A 3QUJA 2I0BA 2F5XA 1XS5A 3HV1A 4KYDA 5L9OA 5JK4A 3IX1A 3USDA 4ZEKA 3T22A 2F7BA 2X7QA 3UP9A 2Q2CA 3EHSA 2Z8FA 4OEUA 3O9PA 2XD3A 1II5A 4LUBA 1FQDA 3IOWA 2O51A 3EQ1A 3MQ9A 4Q30B 4ELQA 2HAVA 1IUDA 3GXAA 4FJPA 3WAEA 5HM4B 1AMFA 4OHNA 5AA3A 1F9BA 1OLAA 1Y4TA 4R2BA 3UK4A 1B58A 4GXSB 2P1SA 3F11A 4P0GA 3KBRA 4ZDMA 1Y1MA 1LB9A 3S4UA 3IORA 5F7VA 3M3KA 1SW1A 1A7LA 3HHGA 3QSLA 4PETA 2D5WA 4YZZA 5I59A 3DLNA 1L5TA 1IXIA 3MC2A 4POWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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