3B7DA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (hs1s2j) in complex with cnqx at 2.5 a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title TARP auxiliary subunits switch AMPA receptor antagonists into partial agonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b7dA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3b7dA02
5TP9A 3RY3A 2OCUA 1H44A 1Q1KA 1MQDA 1WVJA 3FZVA 4ZZEA 4ESXA 4U23A 5I58B 2D5WA 3K1MA 3PUZE 1AL3A 1DPEA 4GQOA 1ATGA 1JEVA 2GH9A 3T9XB 3HHFA 3LSFB 1A40A 4OTEA 4LVQA 1T0KA 1MPBA 3JYRA 3W15C 3MP8A 3TKDA 2DXYA 3MPKA 2QMXA 4FATA 1LFHA 4GOTA 1MM7A 2DXRA 4KYSA 5L9SA 3H03A 4G77A 1CE2A 4EXLA 1OMPA 4R9GA 1OVTA 4ELPA 2Q8JA 2O7IA 1JVXA 2H4IA 2Z8DA 1YPNA 4H67A 4YB5A 2HZKA 2I4CA 4H0WA 3U72A 4RY1A 2RKMA 4WKMA 5A5XA 2OLBA 3V89B 4BDMA 3MJNA 5K2YA 3SEUA 1B46A 4F31B 2XXQA 3FJMA 3KEIA 4EQBA 3C33A 4PFYA 4H8IA 1B0HA 1NNKA 2O84X 4GXAA 1TWYA 1DTZA 2QSXA 1B58A 5JEIA 1M5DA 4OWDA 4U1ZA 1MXVA 3HPIA 2REJA 4FJPA 2ONRA 3EQ1A 2VD2A 3PPQA 3B6WA 3N5LA 2X26A 3MVWA 3S9NC 5H8FB 2ZNTA 3IB1A 3TZAA 3EPEA 4NF6A 3E4RA 3FV1A 3ODBA 1RKMA 2I3VA 3M8UA 4YZZA 4M1VA 3IOUA 5KCJA 4QSCA 1SW1A 3OD7A 4F19A 3SERA 3FUZA 1LCTA 1B1XA 2XD2A 1UTBB 1VFDA 4PETA 2GFEA 3VXBA 1N3XA 2PX1A 3N26A 1O64A 2QPQA 3KOSA 3K1NA 1MQIA 5A5XB 4KI0E 1MM6A 2UYEA 1VSOA 3SDFA 1I6BA 1JW5A 3C31A 4XTCQ 2HFBA 2DWAA 1LBBA 1WDNA 4I9DA 1JEUA 1N3WA 4G68B 1B4ZA 3OEKA 1IXGA 3MPLA 1Z7ME 4DXBA 3M3FA 2RCAA 3TCHA 3MP6A 2DOJA 4UA8A 3KN8A 3SKPA 1EH3A 4IB2A 1D4NA 3KJ7A 4XKPA 1I6AA 3UK4A 3D4CA 3RT8A 3MC2A 5KDTB 4GF8A 4O3BA 3T9UA 3KOTA 1B3EA 1PC3A 2ONKE 4JXIA 3K00A 2YLNA 3PUXE 4RPNA 3KFMA 1TFDA 3PGFA 3IOVA 2A5SA 3KJTA 2E0SA 4NF6B 1P1NA 1FTMA 2PMSA 4G8HA 3HN0A 3RLFE 2XXTA 2QS1A 1D9YA 3MZ9A 1ZKBA 4BLAA 3EHUA 3PPPA 4KR5A 3QXMA 3R6UA 3U92A 3RN8A 2ZNSA 1B51A 2NVUB 4YKPA 2DWHA 4HS7A 3VLWA 4H8JA 4U22A 1Y9UA 3Q29A 5L9MA 5B70A 3IO6A 4ZE8A 4LATA 2I4BA 4F3PA 5JTYA 1MDP1 3AXFA 3CIJA 1MS7A 4OFOA 5ICTA 2PBWA 1AOVA 3RNNA 1IIWA 4XKQA 4OZ9A 3PPOA 4FIMA 3OOAA 2XHDA 1XT8A 3G3GA 1LAXA 3BFUA 3CFXA 1ZMGA 1SI1A 1GR2A 1QW0A 2ZXTA 1NL5A 4NF5A 4XIGQ 4ELRA 4YMAA 4BDNA 5AA4B 1M5EA 3W9VA 4DCYA 1QULA 2XXRA 3IOTA 1LB8A 2IEEA 4HCYA 5ICQA 1VFEA 5BUUA 3CG1A 4X1DA 2AIXA 5H8HA 1P1UA 1SYHA 4NMYA 3R7XA 4GL0A 1MXXA 3FGSA 3FV2A 3G7WA 3BFTA 1OQGA 4C1TA 4OHNA 1PBPA 1SBPA 1IEJA 3HHGA 2ZYOA 2Y7IA 3HSTA 1YCJA 4KPTA 3TQWA 5I59A 3IOWA 5HM4B 2V84A 1AIVA 2O51A 3K6WA 3VFJA 3I3VA 2OK2A 1US4A 4EUOA 2DSFA 5HPQA 5ITOA 5CBSA 1TXFA 5KZTA 1OLCA 4GWOA 5EHSA 2ZNUA 3IL1B 3PD8A 1USYH 3FVGA 2Z8EA 3CG3A 3PV0E 3T66A 2AYSA 4KHZE 4F2QA 1IUDA 3P7IA 5H8QA 1BTJA 4ZEIA 3UGWA 2UYFA 1YAEA 3OSRA 3FIRA 1DPPA 1B7HA 4M4GA 4F1UA 3GZGA 1P1WA 4HTGA 4LQ2A 2HAUA 4I1DA 3LC8A 1LFIA 4QRZA 4H1XA 3EN3A 2H9BA 3CSGA 4RYAA 4C1UA 1ANFA 4IO5A 1RYOA 3MP1A 4OXVA 3MZBA 2ESNA 2XXVA 1ZJLA 4AB5A 4G8NA 3B7DA 1R9LA 5EHMA 5I58A 4N13A 4FAJA 3H6TA 3H3GA 4EF2A 3N94A 4NE4A 2QMWA 4EF1A 4RJZA 3H6UA 3FVNA 2HAVA 5I57B 3TTLA 1MPDA 4WXJA 3H6VA 2QL3A 3VV5A 1MH4A 2UVHA 5L9OA 2VOZA 4U21A 4YAHX 3E9XA 4DZ1A 4EXKA 3C9HA 3TPAA 4IO3A 1GTKA 4O3CA 1BLFA 2ZYKA 4DXCA 1LAGE 4QF9A 4BDQA 1PB8A 2ANJA 3MVYA 1MDQA 5AA3A 5DT6A 5CMKA 4ND9A 1M5CA 2NOOA 4F1VA 1B3LA 1QUJA 1RYXA 4JSDA 3QYTA 3QUFA 2DE3A 3TTMA 2QS4A 2I3WA 1NKXA 3TMGA 1CB6A 4H6DA 3RQTA 4GRKA 3FXRA 1IZ1A 2VGQA 1MY1A 2E1SA 4ELQA 1B5HA 3SEWA 1US5A 1I6QA 4GLIA 4RK9A 5FHOA 3I5OA 1LB9A 3THIA 3T9VA 2H99A 3RGYA 5K2XA 4F2OA 5H8FA 4IO4A 4NF4B 4XKRA 3IK6B 2D21A 1LFGA 3Q26A 4TLMB 2F6PA 4R74A 4GVOA 3H7MA 4MFIA 3HO7A 4G4PA 4X48A 3O29A 1MY3A 1UTBA 4ZDMA 3K6UA 5DYHA 3TQLA 4FEDA 2DWIA 5AA2B 2F7BA 5DVFA 4JDFA 2F97A 5ELVA 5TPAB 4R75A 3U93A 1Q35A 1WODA 4OYVA 4H5GA 1HSLA 4G68A 3TUSA 4PFWA 4NWCA 3N6TA 3A09A 5KDTA 5H8NB 2XXXA 4POWA 4OFJA 3QIMA 4KCDA 1IXCA 1O7TA 1VE4A 2OWTA 3V8XB 2GRVA 1IXIA 5CM6A 4ZS9A 1MXUA 1LGBC 3PUVE 3EF7A 2B3BA 2F5XA 4YB7A 4F3SA 4XXUA 2OWSA 3IB0A 1B3FA 1LAFE 1UTHB 4Z7EA 2P0SA 4P0GA 2OBGA 3PMWA 4JWXA 3TELA 4NWDA 2Y7KA 1OLAA 3E13X 2PYYA 3Q25A 3WAEA 3TFLA 1P1QA 2ZYMA 3TCGA 1Z7NE 4HW8A 5J1DA 3N6UA 1II5A 4FORA 5I2NB 1POTA 1EZOA 4G68C 4U2RA 1FTLA 4ZEFA 3GXAA 4DIGA 1B5IA 1SDXA 3W9WA 3SETA 1B3GA 2F35A 3T96B 1JETA 4R6HA 4ONYA 2F36A 3MUQA 1OQHA 3MQ9A 1Y4TA 5AA4A 2F78A 1SI0A 2UXAA 5CI5A 1JW1A 4YKKA 2XXUA 4THIA 3PUWE 4Q5TA 1Y1MA 4G8MA 3JV9A 1URGA 4JBZA 1IQ7A 2QS2A 3Q28A 3O2AA 5H8SA 1Y20A 4O3AA 4U4XA 4OVJA 3PD9A 3MW0A 4P0IA 1N76A 4OEUA 2VD3A 2XD3A 3MVXA 5FTIA 3QSLA 3FATA 1GV8A 3QUJA 4ELOA 2F7AA 1MQHA 5JK4A 2I0BA 2XXPA 4IY5A 2Q9TA 1FTOA 4WEPA 3VE1B 1A99A 4QHQA 1MRPA 3USDA 2LAOA 1XVYA 1MXWA 2HQ0A 4GFRA 4RA1A 2O69A 4HCWA 1MH3A 3PMXA 3QK6A 4IY6A 3HV1A 3B6TA 3HCQA 4QFLA 1JQFA 5I2KB 3L6GA 1AMFA 3MBPA 4LUBA 4RPOA 4R6YA 2F34A 1NNPA 4IGTA 4DDDA 4KFQA 1QKAA 2HCAA 2O68A 3OO8A 3K2DA 1DMBA 2F6GA 2DVCA 4N6PA 1R9QA 1FCKA 1Y1ZA 3EHTA 4RNSA 1NH7A 1ZTYA 5IKBA 5I84A 3LSLA 1SQYA 4YKIA 3A3CA 3FVKA 5I56B 2A5TB 1XC1A 4JSOA 2NXOA 4ZEBA 2PT1A 4YMBA 2QRYA 3V83A 2X7PA 3Q27A 4LONB 1PB9A 3RT6B 3VXCA 1MQJA 3C32A 5I57A 2FA7A 1B1HA 3ZS6A 2RF1A 4R9FA 1N04A 4R2BA 3OSQA 4TOZA 2HEUA 4R6KA 2GHAA 4PQJA 1UQWA 5DTBA 4YU0A 3OMBA 4NF8A 1EZ9A 3QAXA 4UACA 4LQ5A 3B6QA 4KCCA 4YICA 1GGGA 3TYHA 1GVCA 2DP8A 3UORA 4RK2A 3T9HB 4FEBA 3IJOB 4OEVA 4POXA 2RINA 5AE4A 4I8CA 5AA2D 4F39A 2PVUA 1URSA 4C0RA 3CVGA 3BBRA 2DE2A 3PUYE 2XXHA 3DP4A 2B65A 3WAFA 3T22A 3G3JA 4IO6A 2O6AA 2UVGA 4H65A 4R2FA 2H5YA 1R1NA 2I6EA 1BKAA 1B05A 1FQDA 4GIZA 4N07A 4FE8A 3M3LA 1D9VA 5AA1A 3LSXA 2QS3A 4BDOA 3TCFA 1MQGA 2XX9A 3O66A 2QJEA 1HSJA 4F18A 3IX1A 3O97A 4NF4A 4KYDA 3TDJA 4ZE9A 5ITPA 2O7UA 3V5AA 3FXUA 2DQVA 3O6GA 3PPRA 3R26A 3VVFA 4NF8B 1MY4A 3EHSA 1DTGA 1SW4A 5EYFA 5AA2A 4Z0IA 1B4HA 1IXHA 3ILTB 4X9TA 5TPAA 1SYIA 1SD3A 5FHMA 1S9TA 1FTJA 3GLBA 1B6HA 1QUKA 3FASA 4TQUQ 2V93A 1D3KA 2OZZA 4XKNA 1FQCA 4OFLA 1DOTA 3O28A 2OJTA 3VLVA 3OELA 1PDAA 4BDRA 3CFLA 1SW2A 5FHNA 3SEVA 5H8NA 3UP9A 2WKYA 1VR5A 3DM0A 4MF3A 4QFOA 1L5TA 3MZ1A 2Q2CA 3GBBA 1TT1A 4LZ5A 4KQPA 1OIBA 2XX7A 3PPNA 4JWYA 1R6ZA 3H6WA 3KZGA 2F7CA 3OEMA 1XVXA 2V3QA 2Y7RA 3T93B 5DEXB 2I58A 1NFTA 2DE4A 1UTHA 1FQEA 4IO2A 3CR9A 3G3HA 2RC8A 4BDLA 3KN7A 1ZIUA 3TEPA 1B7UA 1HSEA 3O6HA 3FVOA 4OMBA 3S9EA 3CFZA 3U8QA 1A8FA 1QVSA 5I2NA 2Y7PA 1IITA 2FNCA 3D4GA 4F3BA 3OO6A 4ZECA 4PFUA 2V3TA 5FTHA 4LZ8A 3LBSA 3K02A 4L17A 4LA9A 2YJPA 4MBPA 3U94A 3G3FA 1I69A 1B7ZA 1URDA 3IO4A 3PMVA 5TP9B 5F1QA 3RUMA 3UA8A 4KYEA 1B9JA 4EDPA 3U1OA 1B2HA 4PE5B 4U1OA 4JWOA 1UIVA 1QUIA 3VDFA 2DYXA 2ZYNA 3MVZA 4P11A 3FJGA 3CRBA 4YB6A 1ZBMA 3FJ7A 1PB7A 5CMBA 4F1YA 3KN3A 1Y3PA 5B7DA 1NNFA 3L6HA 3F11A 2AL5A 3K1PA 4RXLA 4QSDA 1Y3NA 2G93A 2Q2AA 1H3DA 2V25A 4GL8A 4ZEDA 5ISUA 1P1OA 3RTFB 4DXUA 1MXZA 4H5FA 1MY0A 2ONSA 4K3FA 3CI8A 2UVJA 3RPWA 5IAIA 3K01A 1AH5A 3VVEA 1QKBA 2Y7WA 3ECRA 1N7WA 3RTWB 2R71A 1NNTA 3H4ZA 2Z23A 3UIFA 2CZLA 1MPCA 1MG1A 3CSBA 3C35A 4JB7A 1B32A 4R73A 5LOMA 2O1LA 2XXYA 1KWHA 4IGRA 1QJMA 2FYIA 1A7LA 5I2KA 1A54A 1MY2A 2D3IA 5DVJA 1TFAA 3TTNA 5CMCA 3JZJA 3OO9A 3LR1A 1FQBA 2R9JA 1O63A 4MLQA 3KBRA 3S9LC 1LBCA 4QFNA 3C36A 2F8DA 2P2AA 2DVZA 2H25A 2RCBA 2O1MA 4F3GA 5KCJB 1BIYA 1P99A 1F9BA 2ABHA 3IR1A 3E3KA 2IA4A 4QFKA 2CMOA 1XS5A 4E0WA 3ZKKA 4I62A 4GD5A 2I49A 5I56A 2B3FA 3DP6A 2A5TA 3K0VA 3TTKA 3SEYA 2Q88A 1MXYA 1N7XA 4ZZAA 1B0LA 5CC2A 2GHBA 1Y3QA 3IJXB 1ZLQA 3OO7A 1EU8A 4IO7A 4YKJA 2YPNA 1B52A 1M5FA 3MWBA 3BKIB 3VLUA 3MAMA 4AB6A 1J1NA 4Q30B 2BJJX 3C4MA 3TAJA 5L8DA 4MH5A 1SVXB 4EQ9A 4TLLB 5HBCA 3KG2A 1NMUA 3LUYA 4E0XA 1BP5A 4ISUA 4ESWA 1NH8A 2Q89A 1JW4A 2G29A 3FXQA 4ECFA 3VVDA 3ONMA 4PP0A 4F22A 2H98A 3IAZA 2KLFA 3G3KA 4NEDA 4QSEA 4Q0CA 1FTKA 2XXWA 1POY1 3K4UA 2XXIA 3SESA 1FQFA 1LSTA 1B5JA 1USYE 5JTYB 5CRYA 2RC9A 4AQ4A 4OENA 3FD3A 4PFTA 4OERA 4Q8RA 4FECA 2PT2A 4R72A 5CBRA 3S2VA 3I6VA 2Z22A 3C34A 3PU5A 3H06B 3S4UA 2NWJA 4NF5B 1SW5A 3M3KA 3KGCA 3UN6A 4F29A 2I0CA 1PBQA 4OETA 4DLDA 2AL4A 3GBAA 2THIA 2VP1A 4MLVA 2UVIA 3ZKLA 3A3UA 3IB2A 5H8HB 1N84A 3KSXA 2DS9A 2M8CA 2NUVA 1PEBA 1FQAA 3DP8A 2V3UA 1B40A 1LAHE 1ELJA 2ZMBA 1M5BA 5BWJA 3G3IA 2X7QA 4OESA 2I48A 1FW0A 3O6IA 1JNFA 4LP2B 3SEXA 3ILUB 2Z8FA 2R6GE 1B3HA 5I59B 3TODA 5CMMA 5F7VA 1A8EA 3S9MC 2XX8A 4U4SA 2Y84A 1H45A 3KSJA 4GXSB 3DELB 1H43A 4DCXA 4G2ZA 1YTVA 3LSWA 4X1BA 4EQ7A 5DEXA 1H76A 5TU0A 3K6XA 1JVYA 5M2VA 2RC7A 3IORA 2HXWA 1DSNA 4ZEKA 4KD5A 1XOCA 5H8QB 1A55A 1N0TA 3OXNA 1S50A 3O9PA 3OENA 5DVIA 2VHAA 1XHYA 1LCFA 1UIUA 4OQOA 3TTRA 1EZPA 2W7YA 3ZSFA 3DLNA 4QFPA 4LZ7A 4NTLA 1LLSA 1OVBA 1S7YA 4WEDA 2ALUA 2DWJA 3K6VA 2HZLA 1Y4CA 2P1SA 2REGA 4DE8A 1ZU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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