3BKIB

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with fqx at 1.87 angstroms
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title 6-Azido-7-nitro-1,4-dihydroquinoxaline-2,3-dione (ANQX) forms an irreversible bond to the active site of the GluR2 AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence C, D, P
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB02
1Y1MA 2XX8A 5LOMA 3EHSA 4G4PA 4N6PA 1MY1A 4FECA 5A5XB 3ODBA 4DCYA 3T9UA 3K6WA 3EHTA 3EQ1A 3CG3A 4IO2A 1UTBA 4OXVA 1LBCA 4X9TA 4MLQA 1AIVA 1XVYA 3O6IA 3U93A 3VXCA 3C9HA 1P1UA 2P1SA 3W15C 2F6PA 1ATGA 3FVOA 4Q8RA 2WKYA 1UTHB 2DVZA 1ZU0A 5FTIA 1S9TA 4RJZA 4EXKA 2O7UA 1QW0A 2ZYOA 3G3FA 1NKXA 3RNNA 4YZZA 4YMBA 3VVFA 2BJJX 1QUIA 2PVUA 2OZZA 1N84A 3HHGA 4OESA 2O1MA 4KCDA 3TUSA 1H45A 3TODA 3VVEA 2DOJA 5TP9A 4GFRA 3VXBA 3H3GA 1MPDA 1M5CA 1IEJA 3I6VA 4JWOA 3H03A 3UORA 5I56A 3K4UA 4IO3A 3TCFA 1AMFA 1B52A 1SVXB 3DP6A 3MZBA 2F35A 2Q2AA 2H9BA 3S9EA 1QJMA 3HO7A 3C36A 4QFPA 2OLBA 4F3SA 3WAFA 4ZEDA 3ZSFA 5DTBA 2ZXTA 4H1XA 4O3CA 1FW0A 3IJXB 1TFDA 4OEUA 4PFWA 1KWHA 4QFNA 2HZKA 1MM6A 1ZKBA 5KZTA 1JEUA 1DPEA 1B46A 2REGA 3LUYA 3PGFA 4NF8A 4WEPA 4F18A 3OO6A 3R6UA 2ZYMA 1HSJA 3FJGA 1URGA 4C1TA 2P0SA 3RPWA 3FVGA 5TPAA 3SEUA 3B6TA 3CFZA 4ESWA 3KN3A 1MQGA 5ICTA 4PQJA 1UIVA 5CMBA 5EHMA 4JDFA 4ZEIA 2X7QA 3HPIA 3BFUA 4TOZA 4WKMA 4ELQA 2XXYA 1B7ZA 2ZNUA 1YCJA 2D5WA 2QS3A 3PUXE 2ZNTA 4FIMA 3S9LC 3P7IA 3SESA 2IEEA 2B65A 1NFTA 3R7XA 3ILTB 3PPQA 3MBPA 5ICQA 1NMUA 4YICA 4G68A 1TFAA 1NNKA 1CE2A 1SW1A 1WODA 4UA8A 4DE8A 2GHBA 4BDMA 2H25A 3IR1A 2ABHA 3D4CA 3N26A 3U92A 2Y7RA 2XXWA 2O68A 3Q28A 4H65A 3IK6B 1MDQA 3T9XB 2DWIA 2XD3A 2OWTA 2Y7IA 3SKPA 3M8UA 2UYFA 3PMVA 3IX1A 3KG2A 2FNCA 2NXOA 1SD3A 4G8MA 2NOOA 2A5SA 1IQ7A 5AA4A 2DS9A 1TT1A 2R6GE 4POXA 4GD5A 1ZBMA 3OO8A 1JW1A 3U8QA 1IXCA 2LAOA 1PB8A 3GBAA 3M3KA 4KD5A 3FATA 3PUVE 4G2ZA 5DVFA 3GZGA 5I84A 1POY1 5HBCA 3C4MA 3FUZA 1BLFA 1IXHA 3IB1A 2ONSA 4ISUA 4RNSA 5IKBA 4LATA 1D9YA 4TQUQ 1FQCA 5TU0A 4MFIA 1B58A 4X1DA 2QS1A 4KYDA 4R74A 2YLNA 3BBRA 3DP4A 1GV8A 4JB7A 3TTKA 4KHZE 4NWCA 1B2HA 1A8FA 5BWJA 4THIA 4IGTA 3QIMA 5I2NB 5H8SA 3IJOB 3TKDA 1LAHE 1R9LA 4NF5B 5DYHA 4GL8A 1OQHA 1MQHA 4LZ7A 4WXJA 3QUJA 1I69A 2RKMA 4RPNA 2V3TA 1OLCA 3B6WA 4P0GA 1N76A 1B32A 3K0VA 3H6UA 4R6YA 4BDNA 5L9OA 1DPPA 3QXMA 1MY3A 4R73A 1B3LA 3E4RA 3HSTA 2F78A 1N7WA 2VP1A 4KYSA 1US5A 2HZLA 1FTLA 3O28A 3CSBA 4XKPA 1EZ9A 3K1NA 1N3WA 4HCYA 2F7CA 3PUWE 4E0XA 3MJNA 1IIWA 3MP8A 4EUOA 3KN7A 3L6HA 3G3GA 3SEYA 1VFEA 4Q0CA 4R9FA 3VVDA 5ISUA 1B3FA 3FVNA 3KOSA 4XXUA 2V84A 2G29A 3B7DA 2ANJA 4OETA 3TTRA 1B4HA 3KEIA 4OHNA 2A5TB 2XXUA 2H5YA 4EXLA 1Q1KA 3JYRA 5CMMA 1A99A 3M3FA 4DXCA 5IAIA 1LBBA 4NF6A 2Q2CA 3V8XB 2YJPA 3LBSA 4IO5A 1LCFA 3RGYA 3THIA 2RC7A 2KLFA 4ONYA 1PBQA 1NH8A 1VSOA 3N94A 4LZ8A 2Y7PA 2HAVA 3MC2A 3MQ9A 3LSLA 3K01A 4YMAA 4YB7A 1FTKA 1LB8A 4YKJA 1B3EA 4LUBA 1B40A 4N07A 3KN8A 4I9DA 4YAHX 1QKBA 3H6VA 1LFIA 1B5IA 5AA2D 4EQ9A 4FEDA 1FQBA 3MVWA 1FTJA 3O6GA 4HS7A 5I57A 3UGWA 5AA1A 2Q88A 4X48A 5DEXA 3DM0A 4OFLA 3V89B 3QK6A 3OO9A 4HCWA 4RY1A 1IITA 1BTJA 1LAXA 2V25A 4KCCA 3I5OA 1FQEA 1NNFA 2OK2A 3UK4A 2O84X 4KR5A 1ELJA 3VE1B 4QSEA 3RLFE 4H5FA 2VD3A 4L17A 2QSXA 4MF3A 3KSJA 4OYVA 2O51A 1FQDA 1OIBA 1H43A 1GR2A 3V5AA 1MRPA 4OFJA 5CBRA 1A54A 2QL3A 3ONMA 2UXAA 4MLVA 2M8CA 4IB2A 2IA4A 2HFBA 4Q30B 2THIA 3FZVA 1SDXA 1UTBB 3K6VA 4EF1A 4MBPA 2VOZA 5HM4B 3G7WA 1SW2A 2RCBA 3CFLA 3K00A 4ZDMA 3E13X 4ZEKA 4P0IA 3TTNA 1SW4A 1WDNA 3SETA 1D3KA 3TELA 4RXLA 3W9WA 1USYE 5KCJB 1B6HA 5I59B 4XKRA 1I6BA 2H4IA 4G8HA 5CMCA 3DP8A 1FQAA 2Z23A 3CIJA 4BDQA 1Y3PA 3C31A 1PC3A 1BKAA 4TLMB 2DWJA 3IO6A 3IAZA 4U1OA 5I56B 5KDTA 1BP5A 5CM6A 2O1LA 4C1UA 1JQFA 2UYEA 4XIGQ 2Q9TA 2I0CA 1AL3A 4AB5A 4GQOA 4NWDA 3EPEA 1PB7A 3ZKLA 5FHMA 4YKKA 4PFYA 1ZJLA 3TYHA 1EZPA 5M2VA 4PE5B 3FXRA 1MH3A 4Z7EA 2OCUA 3FVKA 1UIUA 3VDFA 3A3UA 3TTMA 1MXYA 3SDFA 1OVTA 4ZE9A 2G93A 4DZ1A 4LZ5A 2Q89A 4NF8B 3FGSA 4RPOA 1N3XA 2I3VA 1S50A 4R75A 1O64A 3PV0E 3KBRA 3T96B 4QFLA 1TWYA 1YPNA 1O63A 1P1QA 2ZYNA 1JNFA 5TPAB 1VFDA 2E0SA 2QJEA 4MH5A 3ECRA 4EQBA 3UIFA 1Y3QA 1WVJA 3MPKA 5JTYA 3QAXA 1CB6A 2FA7A 3EF7A 3EHUA 3L6GA 1B05A 2PT1A 5H8FA 2QS2A 3T93B 4R2FA 3H4ZA 3QUFA 3SEVA 5FTHA 3A09A 3TFLA 4KYEA 3CVGA 1GTKA 3EN3A 5I2KA 3CR9A 4NTLA 4PFTA 3OSQA 4EF2A 2D21A 1D4NA 5CMKA 4G68B 4QFKA 1OQGA 3PPNA 4H5GA 4NF4B 4JBZA 4E0WA 1QULA 2F34A 1IXIA 2I6EA 3C35A 4JSOA 4KPTA 4KQPA 3B6QA 1LAGE 3MVZA 4P11A 2QRYA 2XXHA 4GRKA 3C32A 1B5JA 1SI0A 3K1PA 3MZ9A 2XD2A 1MXWA 3H6WA 2VHAA 3RT8A 5L9SA 5H8HA 5AA2A 1MDP1 2DE2A 4U21A 3IORA 4DLDA 2DE4A 3LSXA 1B5HA 3FXQA 5AA4B 1NNTA 3PMXA 4LQ2A 3PPPA 4R6KA 1OVBA 1OMPA 3Q25A 1M5DA 1B3HA 4IO6A 1B1HA 3CRBA 4F3BA 1BIYA 1GGGA 3TAJA 4GLIA 4GVOA 1PDAA 3G3KA 4F31B 1XVXA 1MQDA 4QSDA 1ZIUA 1XC1A 1TXFA 2CMOA 2XXTA 3KFMA 2ALUA 4JWYA 4U1ZA 2W7YA 5B7DA 2OBGA 2AL5A 1LFHA 4XTCQ 2F7AA 1US4A 1AOVA 4NMYA 1PB9A 4YB6A 3GBBA 2REJA 4AB6A 4GXSB 1DSNA 3FD3A 3OELA 1A55A 3TDJA 2H98A 4YB5A 3OSRA 2D3IA 1B0HA 4OERA 4BDLA 3H06B 3TZAA 3Q27A 2R71A 4F19A 3TEPA 1QVSA 2DWAA 3SERA 4G8NA 3T9HB 3USDA 2Y7WA 5DVIA 2PBWA 4OVJA 2F6GA 2HCAA 1Y4TA 3W9VA 3CFXA 4U4SA 3O29A 4EQ7A 1LFGA 1PEBA 5EYFA 4ZEBA 1YAEA 1II5A 4G68C 4F39A 3MP1A 2UVIA 4ELOA 1SBPA 2CZLA 5L9MA 4IY5A 2F7BA 3MW0A 1JW4A 3K1MA 3LSWA 3MZ1A 1DTGA 1M5FA 3KOTA 3H6TA 1DMBA 4ELPA 4GXAA 2I4CA 4I62A 4R6HA 4LP2B 4M4GA 4YKPA 1ZMGA 4OZ9A 2AIXA 1XT8A 3A3CA 2XHDA 3SEWA 3PU5A 3UA8A 1L5TA 2R9JA 3O9PA 4F3PA 1MY2A 1URDA 3PPRA 3DELB 2QMXA 1JVYA 2DVCA 2GHAA 2HQ0A 3IOWA 3PD8A 5H8QA 4RYAA 4ZEFA 4R72A 3T66A 3RY3A 3FJ7A 4U22A 3TPAA 1EU8A 2QS4A 1MY0A 2I49A 2FYIA 4KFQA 4LVQA 3LSFB 4FATA 4ZZEA 3S4UA 1UQWA 3IOTA 2Z22A 2DXRA 3G3IA 3UP9A 2ZMBA 3RTWB 2Y7KA 4FE8A 1AH5A 5A5XA 1R9QA 3F11A 4PFUA 4U23A 3KZGA 4PETA 4NF6B 5DT6A 3Q29A 3VLUA 2V3QA 3OMBA 3K02A 4ELRA 3S2VA 4JWXA 4H8IA 5DVJA 3N6UA 3RN8A 5I58B 2PX1A 4U4XA 5K2YA 2XXXA 1RYXA 3VLWA 1UTHA 2I0BA 3K6UA 2XXRA 3O2AA 3S9NC 3IO4A 1IZ1A 4ZZAA 3T9VA 4F2OA 2RINA 3MPLA 5H8NB 2OWSA 2UVGA 4FAJA 1A8EA 2RC9A 5HPQA 4WEDA 4IO7A 1YTVA 4TLLB 4C0RA 2OJTA 3JZJA 1XS5A 5CBSA 2RF1A 4QSCA 5I57B 3ILUB 4O3AA 5DEXB 1F9BA 1MY4A 2XXIA 3K6XA 1HSLA 3OXNA 4H6DA 3MWBA 5KCJA 5I59A 1B7HA 2XXPA 4JXIA 4ESXA 1B7UA 4BDOA 1EZOA 3FJMA 3OO7A 1B51A 1LGBC 3U94A 1FCKA 4ECFA 1H76A 1MXZA 4DIGA 1SQYA 3FV1A 2Y84A 2V3UA 3GLBA 1SI1A 1ZLQA 1VR5A 2NVUB 4ZECA 4OENA 1Z7NE 3HN0A 1DOTA 1QUJA 4OWDA 3S9MC 2AL4A 1B1XA 1LB9A 5TP9B 4JSDA 1H3DA 4IGRA 1I6QA 4X1BA 2VD2A 5CC2A 5B70A 4LA9A 2O6AA 3MUQA 1FTOA 3U1OA 1XOCA 1J1NA 2YPNA 5ITPA 4F2QA 4HW8A 2X26A 1B9JA 4ND9A 5BUUA 4GWOA 1QKAA 2V93A 1Y1ZA 2XX9A 2XXVA 3FV2A 3ZKKA 5JK4A 3RTFB 1EH3A 3IL1B 2Z8EA 3TMGA 2UVHA 4F22A 4H8JA 5F1QA 5CRYA 1M5EA 1N7XA 2HXWA 3MVXA 5KDTB 3D4GA 3G3JA 4R2BA 2ONRA 3PMWA 1A40A 4I8CA 4AQ4A 2AYSA 1FTMA 4GF8A 3OD7A 2NUVA 5CI5A 3KJ7A 3TCHA 3JV9A 3IB2A 1FQFA 3KSXA 4F3GA 3I3VA 3G3HA 1SYHA 4BDRA 3LR1A 5ELVA 1H44A 3ZS6A 4NF4A 1T0KA 3PUYE 1P99A 1IUDA 4OTEA 4DXBA 3AXFA 3OOAA 4IY6A 4LONB 3HHFA 2B3BA 3TTLA 1RKMA 5F7VA 2DSFA 1LLSA 4DXUA 1LSTA 4F1VA 3QSLA 5JTYB 4OEVA 2PT2A 5H8FB 4ZE8A 4RA1A 4OFOA 4GOTA 2ESNA 1B4ZA 4GL0A 4BLAA 5FHOA 3GXAA 4ZS9A 1Y4CA 3O6HA 1POTA 3KGCA 1MPBA 2E1SA 5I2KB 5AA3A 1ZTYA 2ONKE 2ZYKA 1URSA 3SEXA 3FXUA 1VE4A 1Y20A 1MH4A 1NL5A 2QMWA 1Y9UA 3VLVA 3RQTA 3E9XA 2DWHA 2DQVA 1MXUA 2P2AA 4EDPA 3C33A 5I2NA 4F1YA 1M5BA 4PP0A 3CG1A 4FEBA 4NF5A 3HCQA 4G77A 3OEKA 1P1NA 5H8HB 5K2XA 1B3GA 3OENA 1IXGA 2RCAA 5AA2B 1RYOA 4QFOA 4YU0A 4IO4A 3Q26A 3FASA 1JW5A 5FHNA 3MAMA 1D9VA 3T22A 3C34A 2O7IA 4FJPA 1MG1A 2DE3A 2H99A 2PMSA 2DXYA 3U72A 1JEVA 3UN6A 1DTZA 4UACA 3IB0A 3CI8A 4XKNA 4U2RA 3V83A 2Z8FA 2GRVA 3KJTA 1Z7ME 1HSEA 2F97A 1P1WA 3RUMA 3PUZE 5L8DA 4Q5TA 2Z8DA 4XKQA 5ITOA 1MQIA 2F36A 1Q35A 4DDDA 4DCXA 4I1DA 1MM7A 1QUKA 1MXXA 2QPQA 1USYH 1OLAA 2VGQA 3LC8A 4QF9A 3TCGA 1N04A 2HAUA 3OEMA 1GVCA 1N0TA 3HV1A 4QHQA 3O66A 1SYIA 3TQWA 1R1NA 4NE4A 2A5TA 3QYTA 1Y3NA 4Z0IA 1A7LA 4HTGA 1XHYA 3MP6A 3E3KA 2I58A 2O69A 1O7TA 1P1OA 2B3FA 3VFJA 1JVXA 4F1UA 4O3BA 4H67A 3TQLA 1NNPA 2X7PA 4LQ5A 1LAFE 4RK9A 3N5LA 1MQJA 4F29A 1JETA 2UVJA 4KI0E 4POWA 4K3FA 4OQOA 3R26A 3WAEA 2PYYA 2DYXA 3PD9A 2RC8A 3PPOA 1LCTA 3IOUA 5J1DA 1NH7A 2ZNSA 3M3LA 1PBPA 1I6AA 1MPCA 2DP8A 2F8DA 5EHSA 3VV5A 2GFEA 1R6ZA 4QRZA 1B0LA 4M1VA 3O97A 4YKIA 1SW5A 2Q8JA 3BKIB 3K2DA 3H7MA 3BFTA 2HEUA 3IOVA 2XX7A 4FORA 2F5XA 5I58A 5JEIA 4R9GA 4NEDA 3MVYA 4RK2A 2NWJA 5H8QB 3CSGA 4GIZA 3DLNA 4OMBA 2XXQA 3RT6B 1MXVA 1ANFA 2I4BA 4N13A 1S7YA 3FIRA 4H0WA 2I3WA 5H8NA 3N6TA 2I48A 5AE4A 1MS7A 2GH9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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