3C32A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with sodium at 1.72 angstrom resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A02
4I1DA 3HSTA 3T9XB 4G77A 3LSWA 3IJOB 3CSGA 3W9WA 4LONB 4OEUA 1R9QA 2F5XA 3MP8A 3AXFA 3MVZA 1SDXA 5L8DA 3O28A 1MQJA 4MLVA 1USYH 4PFTA 2XX8A 5EHMA 5K2XA 1IEJA 4XKRA 1PB9A 1MPDA 3MP1A 4P0IA 3CVGA 2D21A 1A8EA 4LATA 2GRVA 3UA8A 2XXTA 1IXGA 1LCFA 4EF1A 1FW0A 3FATA 4H5FA 2GH9A 3KOSA 4H5GA 5H8HA 2OLBA 2GFEA 4G68A 5H8QA 2YPNA 3IR1A 2QS3A 4OFLA 1O7TA 2H5YA 3L6GA 5CI5A 3U1OA 3S9EA 2H25A 5CBSA 4F2OA 3HHGA 4ISUA 3VLUA 4AQ4A 2F8DA 4F1YA 5H8FB 3OO8A 5TP9B 1A99A 1IZ1A 2B65A 5AE4A 1POTA 3UK4A 1MDQA 1PBQA 4QF9A 4N07A 1LFHA 5I57B 2XX7A 2ONSA 4IO4A 3V83A 3OO6A 1NMUA 4AB6A 3IB1A 2PVUA 1B46A 3TTRA 2ZYOA 1US4A 4G4PA 3MVYA 1LAHE 1SBPA 3SEWA 1B4HA 3KOTA 4LZ7A 1H45A 3A3CA 3DM0A 3OSRA 3QUJA 3MZ9A 3TTMA 1VR5A 4BDRA 2DXRA 2Q2AA 1D9VA 3JYRA 5L9SA 2Q89A 3MPLA 4EQBA 5FTHA 1QUIA 1MH3A 2F36A 2BJJX 3MWBA 2HCAA 4ELQA 3FJ7A 4TQUQ 3VE1B 4HTGA 4KR5A 3BFUA 3MZ1A 5I59B 4ESWA 2XXWA 1MY1A 1MH4A 3FXQA 2V3UA 3C36A 3CFXA 2V93A 1SW2A 4NF8A 2G93A 4YU0A 1B52A 3KN8A 3RN8A 1QKAA 2PX1A 1UTHB 3CIJA 3KEIA 3H7MA 5KDTA 1A40A 1H3DA 4I9DA 4RA1A 1FTJA 1A54A 2ZYNA 3FXRA 1P1NA 4FEDA 3FXUA 3T96B 2P2AA 3FZVA 3K6UA 3HHFA 2HAUA 1Z7ME 3LSLA 5CMCA 4HCYA 3K02A 3G3GA 3IB0A 4ZECA 3GLBA 1TWYA 3UN6A 3TFLA 4OYVA 4QFNA 4KI0E 3QYTA 2DWJA 2PMSA 2VD2A 2OWSA 1MXXA 4C0RA 1Q35A 3E3KA 2O68A 1XC1A 1BLFA 2Y7RA 3H4ZA 2O6AA 4GRKA 2IA4A 3FVOA 1PBPA 5CMBA 3Q26A 1N04A 3VVFA 4IO3A 3TZAA 1JVYA 1SYIA 4U1ZA 5ELVA 2F7BA 4WXJA 1LBCA 2XD3A 1A7LA 3SKPA 3T9UA 4OQOA 2XD2A 1OVTA 3D4CA 3CG1A 2RKMA 1IITA 1GTKA 5JEIA 1R9LA 2AL4A 1WDNA 4FJPA 3TCHA 1PB7A 2QRYA 2Q9TA 3DP6A 3OD7A 4NF6B 4F3SA 4H6DA 2DE2A 4RY1A 1WVJA 1Y1MA 5B7DA 5A5XA 2NVUB 4JB7A 3ECRA 4LQ5A 5IAIA 4NF5A 1QULA 2DWAA 1N7WA 3FV1A 3SDFA 2R6GE 3A09A 2ZNSA 1RKMA 4K3FA 4X1BA 5H8SA 1B0HA 4YAHX 4GLIA 1UQWA 3TQLA 4ZEKA 3MBPA 4QFKA 2Z8DA 4QFOA 4JSOA 3M8UA 2P0SA 5KCJA 3C4MA 5AA4B 3SESA 4U21A 3TKDA 4GL0A 1UTBB 2PT2A 1O64A 3R26A 1MM6A 1R6ZA 3EF7A 1DOTA 4F3GA 3B6WA 3MAMA 3Q29A 3S2VA 1QKBA 1YAEA 4F29A 3OENA 1OVBA 4G2ZA 2H99A 1MXVA 3VLWA 2QJEA 4P0GA 1M5BA 5I56B 1QUKA 3FVKA 4DLDA 4Q5TA 2THIA 3SEVA 4YICA 3K4UA 3IB2A 2XX9A 3S4UA 3EHTA 1B5JA 4QSDA 3SEUA 1B58A 2V84A 1XVXA 3THIA 4IB2A 3IO4A 5HBCA 3ILUB 2RCBA 3O9PA 1MXUA 4TLMB 3MZBA 4U23A 4JWOA 4QFLA 1FTOA 1MXYA 1D4NA 1NNKA 2V3QA 5TU0A 4U22A 3RLFE 5ICQA 3OMBA 4DZ1A 1FQBA 4EUOA 4Q8RA 1FTMA 2YJPA 3VXBA 3E13X 3MUQA 4F3BA 5J1DA 1Y20A 3G3HA 4ELOA 3UGWA 1LB9A 2HFBA 3RUMA 4YMBA 1PB8A 1NKXA 4OXVA 2NOOA 3I5OA 2X26A 3IO6A 4LVQA 1OLCA 1Y1ZA 1VFDA 3KN3A 3O97A 3L6HA 2CMOA 2XXQA 1MPCA 4QSCA 4R9FA 4OMBA 3MW0A 3T22A 5I58B 4X48A 2RC7A 1B9JA 2XXXA 3UP9A 3TUSA 3KBRA 3O6GA 2O51A 1I6QA 4ZEIA 5TPAB 3S9LC 2UVJA 1JNFA 1B3HA 2XXVA 1P1WA 2XXYA 4YMAA 4G68C 2NXOA 4NWDA 4NWCA 5I2NB 1Q1KA 3PGFA 2X7QA 4BLAA 4RJZA 3T93B 5FHOA 3TTKA 1RYOA 3C33A 1LB8A 2Y7PA 4HW8A 3R7XA 4DCYA 3MVXA 5AA2B 2G29A 3PPNA 2DVZA 4ZEFA 3FJGA 2HAVA 3LSXA 3O29A 3RT6B 5LOMA 5DVJA 3IOTA 3EHSA 1N3WA 4G8NA 3HN0A 1SVXB 1DTZA 1OQGA 1UIUA 1Y4TA 4R2FA 3TODA 4H65A 1FQEA 1S9TA 2QMWA 4PFWA 2H98A 4XXUA 1M5CA 4YKPA 2A5TB 4LA9A 4OHNA 3GZGA 4RK2A 5I2KA 1SW1A 3VLVA 5HPQA 1N0TA 5DEXB 4C1TA 1GGGA 3IL1B 1ZLQA 3M3LA 5B70A 1NL5A 1FQDA 3C32A 3V8XB 5AA2D 4I8CA 1VFEA 5KZTA 1LGBC 3PV0E 1DTGA 1S50A 2QS2A 3KSXA 4NF4A 1D9YA 2REGA 5BWJA 2I0CA 4NF6A 4ZZAA 3P7IA 4KD5A 2E1SA 1URGA 5L9OA 1ZMGA 3IOVA 3H6TA 3TCGA 2F97A 4DDDA 4H0WA 1BIYA 1SD3A 3DP8A 4H67A 2I3WA 4X1DA 1NFTA 2ZYKA 3K1NA 4RPNA 4HS7A 2OJTA 3CRBA 4F3PA 4OZ9A 2O7IA 1LLSA 2I4CA 1MY0A 3LR1A 5CM6A 2DWHA 5EHSA 1EU8A 2DVCA 2QPQA 3HV1A 3BBRA 4IO2A 3UIFA 1ANFA 4R73A 4O3AA 3MVWA 1ELJA 4GXAA 4RXLA 3TPAA 1PC3A 3EN3A 4PQJA 4XKQA 4DXUA 4EQ9A 3IOUA 2PBWA 3FIRA 1IIWA 4OFJA 3S9NC 3Q25A 4OTEA 1CB6A 2VGQA 5I56A 4XTCQ 3N94A 1HSJA 3H6UA 3IX1A 1MPBA 1A55A 5K2YA 4BDNA 4N13A 1EH3A 4G8MA 3K00A 1LAFE 1L5TA 1LFIA 1B6HA 5FHNA 1BTJA 3PD9A 3C31A 2DOJA 1SQYA 1B5IA 1TXFA 3UORA 1H43A 1D3KA 2RC8A 3HCQA 5JTYA 3KFMA 1AMFA 2QSXA 5DTBA 1P99A 2XXPA 1II5A 5AA3A 5H8NA 5H8HB 4YKIA 4L17A 4IGRA 3DELB 4G68B 5H8QB 5CMKA 1B0LA 2R71A 5ISUA 4KQPA 1TT1A 2RCAA 1LBBA 1SW4A 2DP8A 2ZXTA 3IJXB 1DMBA 1F9BA 4OWDA 2ANJA 1B1HA 2OBGA 3BKIB 3TELA 3PUVE 3G7WA 4XKNA 1MY4A 1MXZA 2D3IA 1B32A 1LAGE 4HCWA 2O84X 4GOTA 1ZJLA 2OWTA 1XHYA 4R9GA 2O1MA 3JZJA 3ODBA 1GR2A 2E0SA 3SEYA 1AIVA 3OEMA 3CI8A 4EXKA 2PYYA 3CSBA 2ONRA 3RNNA 3TMGA 1MQGA 3ZSFA 4EF2A 3K0VA 3WAFA 1SI0A 2F35A 1JW5A 5HM4B 3MP6A 1AH5A 4MH5A 3U8QA 1TFDA 3K2DA 4YKJA 4F31B 2I4BA 3QAXA 2UYEA 3TYHA 3C9HA 4KPTA 4H8IA 4BDOA 4EDPA 5CRYA 4Q30B 5L9MA 3H03A 4MF3A 3PMXA 2ALUA 1DSNA 2I48A 4GFRA 2FNCA 2RC9A 4JWYA 1R1NA 2XHDA 2OCUA 2XXRA 1JW4A 4WEPA 2H4IA 3OEKA 2AIXA 2ZNTA 3I6VA 1B40A 2QS4A 4FORA 1YCJA 3TDJA 2VHAA 3KG2A 1B05A 4O3BA 4F18A 2F7AA 3M3KA 4NF8B 4RYAA 2HZLA 5H8FA 2QS1A 1MDP1 5TP9A 3A3UA 1T0KA 4POXA 4KCCA 1MY3A 3GBAA 3U93A 1TFAA 5KDTB 5CC2A 3W9VA 2DWIA 2HZKA 5I57A 4IO5A 2B3BA 4FIMA 3RGYA 3QIMA 3M3FA 2NWJA 3ZKKA 2Y84A 2Z8EA 4MLQA 4QHQA 3VXCA 1P1UA 2LAOA 4RPOA 1ATGA 1JEVA 1UIVA 1URDA 3RT8A 3PPRA 4FECA 5F1QA 4DIGA 3B6QA 1FQCA 3CFLA 2F78A 3SERA 4H1XA 4ZS9A 2OK2A 4DCXA 3U94A 2VP1A 3EQ1A 1MG1A 3VVEA 3PPQA 1XOCA 4KYEA 4E0WA 3K1PA 2Y7IA 5M2VA 2FYIA 4THIA 3RY3A 1SW5A 1B4ZA 4GIZA 4DE8A 3MJNA 3PPPA 2UXAA 2Z22A 4JXIA 4E0XA 4OETA 3C35A 1FCKA 5FHMA 3IOWA 2F7CA 3Q27A 1AOVA 3W15C 5I59A 2O69A 4N6PA 2HQ0A 3LSFB 4EQ7A 4LQ2A 1NNPA 1BP5A 3K6VA 1PEBA 2GHBA 4PFYA 3TAJA 2DQVA 4DXCA 1UTHA 2V3TA 1VE4A 3E4RA 2Q88A 1ZBMA 2O7UA 3ONMA 4I62A 4YB6A 3PD8A 3HPIA 2A5SA 1N76A 5CBRA 3MQ9A 1O63A 3OOAA 2D5WA 1VSOA 2Q8JA 4C1UA 1B7HA 3RQTA 2Z23A 5A5XB 4IGTA 3V5AA 3MC2A 4QSEA 3FVNA 3BFTA 1EZ9A 4OERA 4FE8A 4ZZEA 4BDQA 4NF5B 3U92A 4IO6A 1N84A 1Y3NA 4AB5A 1NH8A 3I3VA 3KJ7A 4F1UA 4OEVA 4FEBA 2KLFA 1SYHA 2X7PA 3ZS6A 4IO7A 3ILTB 4TLLB 4WEDA 4X9TA 3C34A 4POWA 1MM7A 1QUJA 3G3IA 3FV2A 4ND9A 2ZMBA 4XKPA 5KCJB 1IUDA 2ESNA 3O6HA 2XXHA 4JWXA 3U72A 1ZIUA 3VFJA 4U1OA 2AL5A 4YKKA 1WODA 3PMWA 3D4GA 4MBPA 4M4GA 2I49A 3OXNA 1Z7NE 4KCDA 1JW1A 2XXUA 4YB7A 1FQFA 4FATA 3O2AA 3QXMA 2DSFA 3TEPA 2M8CA 1MQIA 1ZU0A 1DPEA 1I6AA 1B5HA 4OENA 3K1MA 1MXWA 2I0BA 5BUUA 2HEUA 3PUZE 3Q28A 3VV5A 3OSQA 2F6PA 2DE3A 2UVGA 1MS7A 3KJTA 1JEUA 4GF8A 3DP4A 1B3FA 1Y3QA 4G8HA 1FQAA 3GBBA 2PT1A 3B6TA 1USYE 3KGCA 2ZNUA 1JQFA 4ELRA 2UYFA 4UA8A 3H6VA 3B7DA 1KWHA 1MQDA 2O1LA 1B3LA 3G3JA 1NNTA 1PDAA 3FVGA 4KYSA 4P11A 3EHUA 1B3EA 3H3GA 5ICTA 3G3KA 4JSDA 4PE5B 5AA4A 1M5EA 4OESA 4Q0CA 1QJMA 3HO7A 3N5LA 2REJA 2Z8FA 1FTLA 1UTBA 3OO9A 3VDFA 5DYHA 3USDA 1S7YA 1XS5A 4QRZA 4QFPA 1ZTYA 4GWOA 4U4SA 3H06B 4YB5A 4MFIA 4UACA 4ELPA 5I84A 4JDFA 3VVDA 2CZLA 1H76A 4LUBA 2F34A 4F2QA 4R6YA 1HSLA 1QW0A 3LUYA 5ITPA 1J1NA 2B3FA 4R6KA 3FUZA 3H6WA 1XT8A 3QUFA 2V25A 1B1XA 4BDMA 3MPKA 4BDLA 4PP0A 2YLNA 4GQOA 2DE4A 4R2BA 5DVFA 4F1VA 1Y9UA 1JVXA 2VOZA 5IKBA 1P1QA 3FJMA 2I6EA 1P1OA 1LSTA 4ZEBA 5JK4A 1GVCA 1CE2A 2Y7WA 3FD3A 3T9HB 1OQHA 1QVSA 1IQ7A 4PETA 2FA7A 4O3CA 1EZPA 4IY6A 5DVIA 1MY2A 4DXBA 1DPPA 5CMMA 3R6UA 4ZEDA 4F39A 1OIBA 3E9XA 4ECFA 2W7YA 1LFGA 2XXIA 4R72A 1YPNA 2DXYA 1JETA 5I2KB 3ZKLA 3K6XA 2F6GA 1I69A 2VD3A 2IEEA 5I58A 5EYFA 4ZE8A 4NMYA 4U4XA 1FTKA 3T9VA 4LZ8A 1B2HA 1B7ZA 5TPAA 1LAXA 2QMXA 4NF4B 4ZDMA 2OZZA 3CFZA 1YTVA 3CG3A 3N26A 2Q2CA 2RF1A 1MRPA 2I58A 1HSEA 3RTWB 5I2NA 4U2RA 1BKAA 2P1SA 3O6IA 3PPOA 2ZYMA 3FGSA 3V89B 2ABHA 4RK9A 1XVYA 1NNFA 4TOZA 5AA2A 3G3FA 3PU5A 1I6BA 1M5FA 4F19A 3TTNA 4LP2B 4GVOA 4GXSB 3SETA 1B7UA 1ZKBA 3PUYE 1Y4CA 3FASA 4WKMA 4XIGQ 2WKYA 4KFQA 3KSJA 3PUWE 3RTFB 2I3VA 2RINA 4NTLA 4R6HA 5ITOA 4Z7EA 3WAEA 2A5TA 4IY5A 5FTIA 3DLNA 3O66A 3OELA 5AA1A 1URSA 1M5DA 3F11A 4LZ5A 1POY1 4OFOA 1Y3PA 3TTLA 5DEXA 1N3XA 4R74A 4FAJA 4Z0IA 3OO7A 3K01A 2Y7KA 2ONKE 1SI1A 4M1VA 4KHZE 5F7VA 2UVIA 1EZOA 4GD5A 3TCFA 3PMVA 2QL3A 1AL3A 1A8FA 3GXAA 2NUVA 2DS9A 1N7XA 1OMPA 1H44A 2R9JA 1IXHA 3QK6A 3LC8A 1RYXA 1IXCA 1GV8A 4EXLA 5JTYB 1NH7A 4YZZA 4PFUA 4NEDA 3EPEA 4ESXA 3TQWA 4R75A 4RNSA 1LCTA 3KN7A 3N6UA 1B3GA 5H8NB 2H9BA 3SEXA 4F22A 3LBSA 1B51A 5DT6A 3RPWA 4KYDA 2DYXA 4ONYA 2UVHA 1MQHA 3S9MC 3IK6B 1OLAA 3CR9A 3IAZA 3JV9A 3IORA 3KZGA 2AYSA 4GL8A 2GHAA 4JBZA 3QSLA 3T66A 2HXWA 4OVJA 4ZE9A 4H8JA 3K6WA 4NE4A 1IXIA 3N6TA 3PUXE 1US5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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