3C33A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with potassium at 1.78 angstrom resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c33A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c33A02
4NMYA 1BLFA 1MPBA 1LAHE 2I4BA 3C33A 3HCQA 4EDPA 3ZSFA 3FV2A 3JV9A 3KN8A 2UYFA 3IO4A 5HBCA 2IEEA 4POXA 5L9OA 2DWJA 3M3LA 3VVDA 1FQFA 1OLAA 1D9YA 1OLCA 2QSXA 2ALUA 2Q8JA 4QF9A 4OFLA 3TPAA 4KD5A 4I9DA 4YKIA 4R9GA 1YCJA 1N0TA 1S9TA 4GQOA 1QW0A 1SVXB 1VR5A 4QFOA 3W15C 5AA2D 1OQGA 2DYXA 3TYHA 4U23A 1H43A 1ZTYA 2O69A 4U4SA 4C1UA 5KZTA 1ZJLA 3PUWE 4GF8A 3W9VA 1JEUA 4H65A 4EQBA 4OENA 4QSEA 1B5JA 2R6GE 3G3IA 4BDRA 3U8QA 1XC1A 1BKAA 5CMBA 4ZE9A 4QSCA 3CR9A 3N6TA 2RC8A 1DTZA 4GFRA 1UTBA 3TFLA 1ZKBA 5FTIA 1H76A 5B7DA 1GV8A 2Q2CA 4KI0E 2P2AA 3U1OA 1HSEA 1EZOA 3KBRA 5JTYB 1SYIA 4F29A 4NF5B 1MQIA 2XXUA 2I4CA 1SW4A 4IB2A 4I62A 3U92A 1FCKA 3V83A 2F5XA 4XXUA 3T93B 3MW0A 2P0SA 1JNFA 1B7ZA 4DLDA 1R6ZA 4R6HA 1LFIA 1US4A 1YPNA 4I1DA 4ONYA 3OO8A 1MS7A 1B4ZA 4FAJA 1NH7A 1EZPA 4ND9A 1O63A 3SEUA 3C9HA 3MVXA 1B51A 1IXCA 1EZ9A 4LZ8A 1EH3A 4GXSB 2Y7RA 1M5EA 3K6UA 4C0RA 4N07A 4P11A 2V3QA 3CRBA 5ICQA 4ZEIA 3MWBA 3DP6A 2HQ0A 1QJMA 4R9FA 4R74A 2XX7A 3GLBA 3Q28A 4H8JA 1RYXA 1J1NA 3MQ9A 4NF6A 4OHNA 1B52A 4HTGA 5HPQA 3G3HA 1B2HA 3K02A 4NTLA 3RQTA 3E13X 2V93A 4E0WA 2Q89A 3ILTB 3TTNA 5AA4A 5H8FB 2NXOA 5DEXB 1MY2A 3O6HA 1YAEA 2B3FA 2YLNA 3C36A 3PMVA 3DP8A 4KQPA 1POTA 4F2OA 2XXVA 1LB9A 2V3UA 4L17A 1B3HA 3PGFA 1N84A 1PB8A 1A99A 2HCAA 1FQBA 2O7UA 3FD3A 4ZEDA 2X26A 3LUYA 1B1XA 2ONRA 3EQ1A 5M2VA 4YZZA 1FTKA 1URGA 4P0GA 4ESXA 1P1UA 1LAFE 4PFWA 1PBQA 2Y7IA 4IY5A 5CMMA 3THIA 4BLAA 1B58A 4WEDA 2UVJA 1QUJA 2UVHA 4TLMB 3MP8A 4R2FA 3OEKA 4PP0A 4GL8A 5CBRA 2VOZA 3SEYA 4OWDA 2XXWA 2XXRA 2D21A 1M5DA 1MY3A 4N13A 1FQAA 4QHQA 2GFEA 4PFYA 2O1MA 1CB6A 1MXVA 1UIVA 1AIVA 3PPOA 4R2BA 4O3BA 5CM6A 5I2NA 3QUJA 2QMWA 3IB2A 2I58A 2REJA 1VSOA 2A5SA 4F22A 5DVFA 3FVOA 4UACA 4OZ9A 2F34A 5TPAA 3MZ9A 3CI8A 5I57B 4YMBA 3VVFA 1YTVA 1TFAA 1S7YA 3PPNA 3HV1A 1ZBMA 3KSJA 4JBZA 3CVGA 2DE2A 3B6QA 2I3WA 4ELQA 3PPRA 4GD5A 4IY6A 1POY1 3IAZA 3H6TA 1Y4CA 2QPQA 4R6YA 1USYE 4Q8RA 5H8QB 5I57A 2O68A 1JW4A 3GBAA 3MVZA 3FJMA 1MQJA 1SYHA 3OOAA 3A09A 1N3WA 3E3KA 2DSFA 3CIJA 1DTGA 1XVXA 1ZMGA 4F1VA 3KSXA 2D3IA 3WAFA 2VD2A 4GVOA 4Q30B 3V5AA 3MC2A 1H3DA 4OFJA 3HN0A 4O3CA 2ZNTA 4XIGQ 3KZGA 5TU0A 2PT2A 5LOMA 3TODA 2F35A 3HHFA 4DZ1A 5DTBA 1NNPA 4MLVA 4M4GA 1O7TA 1IXGA 2RCBA 3UP9A 2CZLA 4H5FA 4QFKA 3U94A 4IO6A 3N26A 1MQGA 4ZS9A 1MPDA 2QL3A 4PE5B 4MFIA 2XXIA 1GGGA 1MY0A 3C32A 2UXAA 2F8DA 3CFXA 1LBBA 3VLVA 5EHMA 4KHZE 4IO4A 4R75A 3BFUA 3C35A 3Q29A 1AL3A 4Q5TA 1MM6A 1ZU0A 3SERA 4FJPA 2QS4A 3K00A 1Y1MA 3F11A 3H03A 2G93A 3O2AA 2LAOA 1Y3QA 3TUSA 1O64A 5JTYA 3EHUA 3D4CA 1USYH 1B5IA 2Y7WA 3I5OA 4NF5A 4ZEFA 5H8NB 4U4XA 2ZYKA 2FA7A 4EF2A 2OJTA 5F7VA 2Y84A 4Q0CA 3MPKA 1LAXA 3N6UA 1B3GA 4N6PA 3H3GA 3U72A 4MBPA 2QS3A 3FJGA 3G3KA 5J1DA 2QS2A 3UA8A 3FVGA 4EXKA 3QIMA 1B40A 5DYHA 3C31A 4H6DA 3MVWA 1XOCA 4X1BA 3H7MA 2ONKE 3K01A 1IQ7A 2ONSA 2PYYA 2H25A 1LB8A 1BIYA 1QUIA 1HSLA 4U1ZA 1MH4A 1LCTA 1B32A 4ESWA 2PT1A 3TAJA 4XKNA 3TCFA 1FTLA 1SBPA 5KDTB 3M3KA 4F1YA 3E4RA 2O84X 2ZYMA 2V84A 2X7PA 3IOWA 5H8FA 3H6UA 5DEXA 3R7XA 3T9UA 1US5A 3OSRA 1Y1ZA 4U1OA 5AE4A 1URDA 3ZKKA 3VVEA 4UA8A 1H44A 1JEVA 3QXMA 1TT1A 1B0HA 1PEBA 1LAGE 4DCYA 1N76A 2XD3A 4F39A 1DOTA 4DXUA 3IJXB 2GRVA 4EUOA 3KJTA 4Z0IA 4G68B 3RGYA 1ATGA 3TELA 2DVCA 4F2QA 3ILUB 3O29A 3KFMA 4RYAA 3I3VA 3U93A 3VDFA 4ZZAA 3CFLA 3OMBA 1AOVA 3TZAA 1QKAA 3K1NA 4FEDA 3SKPA 2RINA 4OXVA 1P1NA 4ZDMA 4QFPA 3N94A 1UIUA 2RF1A 3CG3A 3PU5A 2IA4A 4HCYA 1JQFA 3ZS6A 1MPCA 2OLBA 4JSOA 4AQ4A 4FE8A 2HZKA 1D4NA 1PB7A 3O97A 3Q26A 4F19A 1WDNA 3O66A 2NUVA 4GOTA 4PFUA 3UGWA 1M5BA 4FECA 3PUZE 4LZ5A 4BDQA 1IIWA 5H8SA 5I56B 1MQHA 3PPQA 4LATA 3RTFB 1MDQA 1XT8A 2I0CA 4YKKA 4DE8A 3EHTA 4O3AA 4OQOA 1FQEA 2VD3A 2HAVA 1B5HA 1DPEA 4RA1A 1MXXA 2AYSA 3GZGA 2DXYA 2XD2A 4LA9A 1SQYA 3KEIA 4EQ9A 1MRPA 4P0IA 4F3BA 5CC2A 5FHOA 1F9BA 3K2DA 3IB1A 2XX8A 3UIFA 2HFBA 3S9EA 2OWTA 2O51A 4YAHX 2Z8FA 1NL5A 3USDA 3TTKA 2H5YA 5F1QA 1MH3A 4F3GA 4THIA 3PD9A 4OEVA 2Z8DA 3H06B 3IK6B 3HHGA 4NF4B 5I2KB 1AMFA 3SEVA 4NE4A 4OTEA 3D4GA 3EN3A 4MH5A 5H8QA 3TDJA 1UTBB 5EYFA 4M1VA 1RYOA 1MDP1 2F97A 4LUBA 1VE4A 4G68C 2Q2AA 2Y7KA 3MAMA 4RY1A 3IOVA 3P7IA 1II5A 2KLFA 4GXAA 3ODBA 4NWCA 3RUMA 3TCGA 5BUUA 4QFNA 4GRKA 1P99A 1LFHA 4LZ7A 1A40A 1MM7A 2PMSA 1D9VA 2I48A 1FQCA 3K1MA 3IR1A 1UTHA 1ELJA 3K1PA 3C4MA 1ANFA 3SESA 1D3KA 4ZE8A 2O7IA 3WAEA 3RTWB 3S9MC 1TWYA 1SW5A 4OFOA 4XKRA 4DIGA 3T96B 1MXZA 1PBPA 2ZNSA 2Q9TA 4XTCQ 2XXYA 5H8HA 3LSWA 3T22A 1ZLQA 4JB7A 1MQDA 4G77A 4KFQA 1QULA 1JW1A 1SDXA 5TP9B 1Z7ME 5AA1A 1SW2A 3PUVE 4PQJA 3BBRA 3O9PA 1CE2A 2Y7PA 4NF6B 1B05A 3LR1A 4G2ZA 3MP1A 3IL1B 1LCFA 1N7WA 4RXLA 1R9QA 4HS7A 2H4IA 3CFZA 5ELVA 4R72A 1MXUA 1TXFA 4Z7EA 3FIRA 5AA4B 1IXHA 3MBPA 1GR2A 2P1SA 1EU8A 4EF1A 5IKBA 2PVUA 1B4HA 5BWJA 1OVTA 5I58B 4QRZA 1LGBC 3B6TA 1URSA 3GXAA 4G8HA 1R9LA 1MXYA 2G29A 4U2RA 2OBGA 2CMOA 2VP1A 2Z22A 3S4UA 4LQ5A 2ESNA 1I6BA 3N5LA 3KJ7A 3GBBA 3EHSA 3RY3A 2NOOA 4U21A 3G3GA 4DXCA 3OD7A 3OENA 4ELRA 3VXCA 3HSTA 3H4ZA 4RPOA 1B0LA 3E9XA 2DWAA 1Z7NE 5ICTA 3RLFE 2GH9A 5L9MA 2ZNUA 2A5TB 3QUFA 1QUKA 4F18A 3DELB 4R73A 2XHDA 1Q35A 5JEIA 3MP6A 1M5FA 4DDDA 4KCCA 3PMWA 3IJOB 1LSTA 3AXFA 3MJNA 5KDTA 4JXIA 4K3FA 2THIA 1MY4A 5AA3A 3OO7A 1IUDA 4ELPA 1NH8A 3O28A 5AA2B 3FASA 3RNNA 2GHAA 3KOSA 4G4PA 4GLIA 2ZXTA 4KPTA 3VE1B 4I8CA 1NNTA 5A5XB 3TMGA 5ITPA 4G68A 2M8CA 4YU0A 5K2XA 4EXLA 2QS1A 2XX9A 4YKJA 3IO6A 1OMPA 2RCAA 3R26A 3FXRA 2UVIA 4MLQA 3FV1A 1FTOA 3TQWA 4XKQA 5HM4B 2Z23A 1RKMA 2F78A 2XXXA 3FUZA 3OO9A 3B6WA 2O1LA 4EQ7A 4WKMA 2RC9A 1P1WA 3G7WA 5ITOA 1XHYA 2PX1A 1A8EA 1I69A 4IO3A 1KWHA 1Y3PA 4TOZA 4YB7A 1IZ1A 4NF8B 3HPIA 3FVKA 2ZMBA 5FTHA 4YICA 3VLWA 2REGA 3FXQA 5I56A 5EHSA 2V25A 4GWOA 1GTKA 4FORA 3L6GA 4BDMA 3LSFB 2DVZA 3TTRA 1B7UA 3ONMA 3LC8A 3DP4A 1N3XA 4HCWA 2DXRA 1H45A 1PC3A 4WEPA 2ABHA 1MG1A 5I59B 3MUQA 3SDFA 2I3VA 4OETA 3FATA 1WODA 4IGTA 1I6AA 1A8FA 2XXTA 2ZYNA 2FNCA 2QJEA 2F6PA 1FW0A 4HW8A 4OVJA 1B9JA 1FTMA 3CSGA 1FQDA 3VFJA 3VLUA 3RN8A 3SETA 3CSBA 2F6GA 4QSDA 4ZEBA 3VV5A 1SW1A 3S9NC 4NF4A 5I2KA 4IO7A 1DSNA 3K6XA 4ISUA 2R9JA 1WVJA 2UVGA 2DE3A 5KCJB 5CRYA 2XXHA 3IORA 3MVYA 4AB5A 2ZYOA 3FZVA 4OESA 3CG1A 3QAXA 3JYRA 4ZZEA 2DE4A 5I84A 3PUYE 1VFDA 3IOTA 5IAIA 2Z8EA 1SI1A 3ZKLA 1B1HA 3O6IA 2AIXA 3K6WA 4KR5A 4DCXA 4ZEKA 2D5WA 3Q25A 5L9SA 1JVYA 4H1XA 3TQLA 3I6VA 4JSDA 3K6VA 5DVJA 4GL0A 2OCUA 3KOTA 5ISUA 4H8IA 5B70A 3KGCA 3PPPA 2QMXA 1LBCA 3A3UA 3LSLA 3M8UA 2GHBA 1P1QA 3DM0A 4F3PA 4F31B 4C1TA 4ECFA 3L6HA 3TTMA 3PMXA 1AH5A 5JK4A 1SI0A 4BDOA 3MZBA 5TP9A 3RT6B 2DQVA 3Q27A 4U22A 2AL4A 3G3JA 3SEXA 3V89B 2HXWA 2UYEA 1IEJA 2I49A 4YMAA 3OXNA 3OEMA 3S2VA 3MPLA 2B65A 3UK4A 2H99A 4R6KA 4TLLB 3PD8A 3FJ7A 2NVUB 4PFTA 1JVXA 4LVQA 5I58A 4KYEA 1ZIUA 1A7LA 2XXPA 3V8XB 4KCDA 4IO2A 1NNFA 3EPEA 4LONB 5CBSA 2DS9A 1R1NA 4BDNA 3QSLA 3OO6A 2WKYA 4F1UA 4QFLA 4RPNA 4TQUQ 3M3FA 2HZLA 3T66A 4WXJA 1M5CA 4JWOA 3IX1A 4X9TA 3JZJA 4BDLA 2AL5A 3T9HB 4FATA 2A5TA 1GVCA 3TCHA 4OEUA 1Y9UA 3S9LC 3O6GA 1NFTA 2W7YA 4JWYA 5L8DA 4X48A 5DVIA 5CI5A 1XS5A 1I6QA 1UQWA 1QVSA 3B7DA 1JW5A 1B3EA 3BFTA 2RC7A 2FYIA 1IXIA 1MXWA 2Q88A 2XXQA 1B3FA 2NWJA 3EF7A 2I6EA 4XKPA 2DWHA 3IOUA 4H0WA 1NKXA 3OSQA 5AA2A 5CMKA 4H5GA 4POWA 4H67A 4YKPA 1MY1A 2B3BA 4KYDA 1B7HA 3ECRA 1OIBA 4F3SA 4YB5A 5A5XA 2HEUA 4NEDA 5FHNA 1IITA 1T0KA 2F7AA 3W9WA 4OYVA 3T9VA 1LFGA 1BP5A 4YB6A 4G8NA 3G3FA 1OVBA 4PETA 4NWDA 2YPNA 5H8NA 3PV0E 1P1OA 3TTLA 1HSJA 3R6UA 4G8MA 1Y20A 2V3TA 4LQ2A 2ANJA 1PB9A 4ZECA 3K4UA 4OERA 1Y3NA 3HO7A 3H6WA 3LSXA 1B3LA 3LBSA 1Y4TA 3QK6A 4JWXA 1SD3A 4IO5A 2VGQA 3TKDA 2HAUA 5FHMA 1B46A 2OK2A 1LLSA 4DXBA 4RK2A 3IB0A 3TEPA 4NF8A 4MF3A 3RPWA 2E1SA 1OQHA 4E0XA 1FTJA 2PBWA 4LP2B 3UORA 2H98A 2F7CA 4ELOA 4FEBA 2E0SA 4KYSA 4IGRA 2RKMA 3MZ1A 2DP8A 3KG2A 1UTHB 2F7BA 3OELA 1B6HA 4FIMA 2BJJX 2O6AA 2VHAA 2X7QA 2H9BA 4AB6A 1DMBA 5I59A 3A3CA 1DPPA 1PDAA 1S50A 1N04A 1N7XA 3KN3A 1Q1KA 5I2NB 5H8HB 3PUXE 4RJZA 3RT8A 3QYTA 5DT6A 1XVYA 4X1DA 2YJPA 1JETA 1NNKA 1L5TA 4JDFA 2QRYA 4OMBA 1TFDA 5CMCA 5TPAB 3DLNA 4RK9A 2R71A 2OWSA 3SEWA 3K0VA 3FGSA 3BKIB 1A54A 1VFEA 3VXBA 5KCJA 2F36A 3C34A 3FVNA 1QKBA 3H6VA 4GIZA 1A55A 1BTJA 3FXUA 3KN7A 3T9XB 1NMUA 2DWIA 5K2YA 4RNSA 2OZZA 2I0BA 2DOJA 3UN6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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