3CFLA

Crystal structure of the complex formed between c-lobe of bovine lactoferrin and 5-chloro-6'-methyl-3-[4-(methylsulfonyl)phenyl]-2,3'-bipyridine at 2.25 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex formed between C-lobe of bovine lactoferrin and 5-chloro-6'-methyl-3-[4-(methylsulfonyl)phenyl]-2,3'-bipyridine at 2.25 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 116
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2008-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cflA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cflA02
1USYE 3B6QA 2I4BA 5FHMA 2FA7A 1B40A 3UA8A 3PUZE 2HAUA 3PUXE 1GR2A 3O9PA 4IB2A 3PMVA 3QK6A 3UORA 3VV5A 2WKYA 3CSGA 2XXYA 3D4GA 2YPNA 1XVXA 1UIUA 3CR9A 5A5XA 1GVCA 3FASA 4F1UA 2ANJA 2Y7PA 2DS9A 1OLAA 4X1BA 4RK2A 4F3GA 3EF7A 1VSOA 3C33A 4PE5B 1B51A 3O28A 4HTGA 2OBGA 3K1NA 4KYSA 2UYEA 2ONKE 1MXZA 3C35A 3KN3A 1XC1A 1D9YA 1QKBA 2DXYA 3A3UA 1Y20A 3VLWA 2R71A 1DMBA 2XX8A 3MVZA 3LUYA 4GWOA 3IOTA 2O1LA 1FQEA 3QUJA 4R74A 2E0SA 3KFMA 3KEIA 1IXGA 2REJA 4QSEA 4UA8A 3G3KA 1PC3A 1R6ZA 4OETA 4AQ4A 3CFLA 1WVJA 1MQDA 1LGBC 1BTJA 2DE3A 1SVXB 2XXPA 1MXXA 1MS7A 2F8DA 2X26A 3KOTA 2QMWA 1TFDA 1QVSA 2Q2CA 3MW0A 2RC8A 3OSRA 1Y3PA 1LBBA 3DELB 2Q2AA 1IUDA 3CRBA 1MM7A 1PB8A 5JEIA 4BDMA 3K6VA 4ELPA 3FXQA 5F7VA 4C1TA 3M3KA 5EHMA 4NF4B 4Q30B 4XKQA 5KZTA 4OEVA 1KWHA 2H5YA 2F34A 5I59A 1NKXA 5TPAA 3SEUA 2F36A 1PDAA 4U23A 4OQOA 4H1XA 1Y3QA 1B4ZA 4Q5TA 2R6GE 1DSNA 3LSXA 1ZBMA 1MRPA 4NTLA 2F6GA 1I6BA 4HCWA 3K0VA 1IQ7A 2UXAA 4IO5A 4OHNA 2QS1A 1BKAA 3E3KA 3TZAA 4MF3A 5I2NB 5I58B 3IK6B 4U4SA 3BKIB 1NNTA 3V5AA 5I2KA 3IORA 4LQ5A 1S7YA 1B3EA 1JVYA 5ITPA 3C31A 4Z7EA 4BDNA 1XS5A 4I62A 4Q0CA 1O63A 4Q8RA 2AIXA 3OO6A 3K6UA 3IL1B 5ICTA 3MP8A 1Y9UA 2PX1A 2RC7A 2I3VA 4G8MA 3LC8A 2VOZA 1B0LA 2VD3A 3GBAA 2P1SA 2V84A 3MJNA 1EU8A 4N07A 4G68C 4WKMA 2NUVA 1PBQA 4OZ9A 3O97A 4PETA 3W9VA 1B3LA 3TUSA 1FTLA 4KD5A 3N94A 3LSLA 4FECA 2LAOA 1RYOA 3TPAA 4JBZA 1NNPA 1B5JA 4YKJA 1VR5A 3MP1A 1URDA 4XKNA 3LSWA 4G77A 1FW0A 4F29A 1IEJA 4P0GA 5CI5A 2O6AA 3K4UA 3Q29A 3KJ7A 3KSJA 2O69A 1A8FA 3UIFA 3N6TA 2I3WA 4PFWA 3VVFA 3RNNA 2AL4A 3VLVA 2DWAA 3TFLA 3VXBA 4RXLA 4GXAA 2DYXA 5CMCA 2ZYKA 1UIVA 4OVJA 4R2FA 2ONRA 2Y7WA 3CFXA 3FGSA 3TAJA 3DLNA 5FTIA 2Q88A 2XXHA 3VVDA 4FATA 3H3GA 1B1HA 3HHFA 3UN6A 3CFZA 3FXRA 1OQGA 3HV1A 4LVQA 3SDFA 4YB6A 4QFKA 4MLQA 1SQYA 5H8QB 3GBBA 5I84A 3CI8A 1SD3A 3C34A 2F35A 3RUMA 2ZNSA 4R6YA 4AB6A 4F19A 1UTBB 3Q27A 4OWDA 3H03A 3THIA 3LR1A 1ELJA 3G3HA 4KYEA 5H8FA 4Z0IA 2X7PA 1OMPA 2RF1A 3FD3A 1QKAA 3FJGA 3ZKKA 3E4RA 2RCAA 4G68B 5JTYB 1MDQA 1NL5A 2VGQA 2F7CA 4OFOA 2RC9A 1B7HA 2B3BA 4WXJA 5H8HA 4WEDA 4H67A 2HCAA 2DVCA 4ZZAA 3N6UA 4PFTA 2PT1A 3TMGA 3FVKA 4NF6B 4L17A 4PFUA 3H6WA 2VP1A 1Y4TA 3OSQA 1GTKA 3RLFE 4EQ9A 1OVTA 4YMAA 1N3XA 3USDA 4R9GA 1FQDA 2PYYA 3KOSA 4KCCA 2ZMBA 4R75A 5AA4A 4JSOA 1J1NA 4OESA 3MZ1A 4EQBA 5BUUA 3MVXA 1UTHA 4BDLA 4ND9A 4KFQA 3TEPA 1SW1A 5CMMA 2XX7A 4POWA 4ISUA 4JXIA 1LCFA 2H99A 2CZLA 1IXCA 3IO6A 4U21A 1FTMA 4IGTA 3H4ZA 4DXBA 3PU5A 3OEMA 1XT8A 2I58A 1LSTA 2XXWA 3N5LA 1MPDA 1QJMA 1O64A 3TKDA 2XD3A 3OD7A 4JWOA 4MLVA 4JDFA 2THIA 1MY0A 3O6IA 1MXWA 3ZSFA 2QS4A 2Y7RA 5KDTA 1IITA 1SW2A 3GZGA 1ZU0A 4EXKA 1D3KA 3S9LC 3PPQA 2O7UA 1TXFA 3FVNA 2QMXA 4ELRA 4F3SA 3QAXA 2AYSA 4YU0A 5TU0A 3U72A 3TDJA 3O6HA 1GGGA 2V25A 1B32A 4QSDA 3EHSA 4KQPA 3U1OA 4ZEBA 1XHYA 2HXWA 3I3VA 1B3HA 1S50A 3BFUA 1I69A 4BDOA 3FVGA 4TLMB 3T9HB 4OXVA 3RN8A 1IZ1A 1A7LA 1CB6A 3CG3A 5LOMA 3UGWA 1SW4A 5H8NB 1POY1 3DP4A 2W7YA 3OOAA 5J1DA 3HHGA 1PEBA 1R9LA 1B5IA 2ZYOA 3A09A 4ESWA 3LSFB 3TTLA 1H76A 1HSJA 1TT1A 3G3IA 3PGFA 3G3FA 3W9WA 4F18A 3S2VA 4IY6A 1OLCA 4EF2A 4HS7A 4O3CA 4C0RA 3F11A 3MVWA 4KCDA 3H06B 4ZEFA 1PB7A 2HAVA 5CBRA 1FQCA 4QF9A 2GRVA 1Y3NA 3EHTA 4ELOA 3C9HA 4H5FA 2DXRA 2FYIA 1DTZA 4F1VA 5CMKA 3VDFA 1NNKA 1NH8A 3KJTA 1UQWA 2NOOA 4F1YA 2YJPA 4IO7A 2O68A 3ZS6A 4ZDMA 5AA2B 2I49A 4G8NA 1Y1ZA 1B7UA 4LA9A 3TTNA 2Z8FA 4XKRA 2I0BA 5ELVA 1LBCA 3T9VA 3R7XA 3UP9A 3MVYA 5JK4A 2ZNTA 4QSCA 4DCXA 1H45A 1N76A 3IOUA 4PQJA 4F39A 1LAGE 2UVHA 4FE8A 5EHSA 1LFGA 2DOJA 1JVXA 3ONMA 4GF8A 1FTOA 1FQAA 1B1XA 2CMOA 1MM6A 4THIA 4ZEKA 1AMFA 3B6TA 3K6WA 1RYXA 2Q8JA 3MUQA 4MH5A 2Z8DA 4NF4A 1VE4A 1DOTA 5ITOA 3RQTA 5L9OA 4DXUA 5DT6A 1P1OA 2F5XA 4EF1A 2PMSA 2PVUA 2XX9A 4LZ5A 3V8XB 4DZ1A 3MQ9A 5CRYA 2H4IA 1MXYA 4JWYA 3WAFA 4NE4A 2HZLA 4NF5B 5KCJB 4QFPA 1USYH 1SI0A 3HCQA 3RT8A 4M4GA 1WODA 3S9MC 4YAHX 4JB7A 5DEXB 4DXCA 3KG2A 5I2NA 5I58A 4MBPA 3TELA 1B3FA 3RPWA 5HM4B 1B52A 1URGA 3IB2A 1PB9A 2HQ0A 1AL3A 2D5WA 1SBPA 3SESA 3ECRA 3PUYE 5M2VA 3SERA 2DSFA 3RTWB 4NWCA 1FTKA 4I8CA 5B70A 2UVGA 4IO6A 1MQHA 1ZLQA 3P7IA 4X9TA 4EUOA 2H98A 4F22A 2AL5A 1WDNA 2A5TB 1Z7ME 2BJJX 3SEYA 2O7IA 1Z7NE 4O3BA 1LFIA 2QSXA 1N04A 4IGRA 4U4XA 1F9BA 1O7TA 1GV8A 1M5DA 1POTA 1R1NA 3OMBA 4XIGQ 4RNSA 3TYHA 4DCYA 3ZKLA 3T96B 2OZZA 3K2DA 3B6WA 3S9NC 3IJXB 4TLLB 3GLBA 3FVOA 1Q1KA 4G8HA 4R2BA 3TTMA 4ESXA 2Y7IA 3ODBA 1M5EA 4OFJA 2R9JA 3Q25A 2O1MA 1LAFE 1N0TA 4NF8B 3U93A 2IEEA 2G93A 5H8HB 4HW8A 1NNFA 1QUKA 2I48A 1II5A 3KGCA 3PPRA 1P1UA 2F7BA 5DYHA 1MXVA 1YAEA 4GL0A 3CIJA 3G3GA 1EZPA 2XXIA 5I56B 4HCYA 2OCUA 3IOVA 4AB5A 1N84A 3T66A 5H8SA 2RINA 1B05A 2QS3A 1N3WA 1D9VA 5F1QA 5EYFA 4RY1A 3K1PA 4YMBA 2Q89A 4X48A 1BIYA 4BDQA 3N26A 4YICA 5H8QA 1I6AA 1HSEA 4RA1A 3TCHA 2XXUA 3BBRA 1ZKBA 4GOTA 3HN0A 1RKMA 1DTGA 1UTBA 1S9TA 1EH3A 1LB8A 3R6UA 2D21A 1JQFA 5I57B 4E0WA 3JV9A 3U92A 1LLSA 2HFBA 3KZGA 5FHOA 1LAHE 1HSLA 2VD2A 1SYIA 4ELQA 1MPCA 1JW1A 2QPQA 5BWJA 1US4A 3DM0A 4G68A 3MWBA 1MQJA 3PMWA 3UK4A 1ANFA 2DVZA 4P11A 3RTFB 4ZZEA 3O29A 1A40A 4FAJA 2VHAA 4NF6A 1H43A 4G2ZA 4R73A 4G4PA 5TP9B 1ZJLA 2DWJA 4GLIA 3CSBA 3FXUA 4KR5A 3MP6A 1B6HA 1T0KA 5HPQA 4QRZA 3ILTB 1P1NA 3ILUB 4OMBA 1AOVA 5CC2A 1MH4A 1N7XA 2D3IA 1EZ9A 4OENA 1ATGA 2I4CA 2REGA 1JEVA 1B46A 4GXSB 1M5CA 3OXNA 3PUVE 2GFEA 5A5XB 1H3DA 4XTCQ 1LB9A 3IX1A 3I6VA 4ECFA 4RYAA 1B58A 4YB7A 1FQFA 5L9SA 5ISUA 1ZIUA 4R9FA 4GD5A 2O84X 1MQIA 1B4HA 4ZEDA 4FJPA 3FJ7A 5CM6A 3T9UA 1JEUA 1MY4A 5IAIA 3TTKA 3TQLA 3U94A 2UVJA 3KSXA 1IXHA 4E0XA 5CMBA 2DE4A 3MAMA 3QYTA 2DP8A 4C1UA 5AA2D 1LAXA 1YPNA 4U2RA 3RGYA 1FCKA 5K2YA 4XXUA 1XVYA 3OO9A 3FUZA 1MPBA 4R72A 3DP8A 1A55A 3DP6A 1YTVA 1MG1A 4ZECA 3CG1A 4H5GA 3A3CA 1QUJA 3K02A 4H65A 4OYVA 4GFRA 2RCBA 4ONYA 4N13A 4LZ7A 1Y1MA 1JW4A 3MBPA 4OEUA 4PFYA 1IIWA 3MZBA 3V83A 4TQUQ 3T93B 4WEPA 1URSA 3PUWE 5I59B 5TPAB 4UACA 5H8NA 3VXCA 3S4UA 4LONB 3U8QA 4KYDA 3PV0E 3TCGA 4KI0E 4ZEIA 3E9XA 2ESNA 2ZYNA 1M5FA 1MY3A 3FJMA 3FZVA 1M5BA 4GQOA 2KLFA 3H7MA 4OTEA 4JWXA 5DVIA 1CE2A 3IOWA 2QS2A 2ZNUA 3I5OA 4ZS9A 5K2XA 2OWTA 3BFTA 3PMXA 2QL3A 2B3FA 3IB0A 4OERA 1AH5A 5I2KB 2P2AA 2UYFA 4NMYA 1Q35A 4DE8A 2ALUA 1B0HA 2QRYA 4ZE9A 2NXOA 4QFOA 2NVUB 3HO7A 4FEDA 3FATA 1IXIA 3IJOB 2I0CA 4I1DA 3OO8A 4H8IA 3K1MA 4LZ8A 4X1DA 2P0SA 4JSDA 1SI1A 3M3FA 2OK2A 3C32A 5CBSA 2E1SA 1OVBA 2F78A 3L6GA 3JYRA 1JETA 3PD8A 3PPPA 4O3AA 2XXQA 5AA2A 3QUFA 2Z22A 3M8UA 4K3FA 1MDP1 1MY2A 3KBRA 1I6QA 1NH7A 2ZYMA 3Q26A 2X7QA 1B9JA 4RPNA 3W15C 3OO7A 1JNFA 2IA4A 2Y7KA 3MZ9A 2DWHA 4GVOA 4BLAA 3VFJA 2GHBA 3KN7A 3MPLA 4LATA 4GL8A 4GIZA 2G29A 2GH9A 1YCJA 3C4MA 1N7WA 1PBPA 3SEWA 1EZOA 3TODA 2OLBA 3G3JA 4YKKA 1D4NA 1MY1A 4FIMA 1B5HA 3H6VA 3SEVA 3FIRA 2XHDA 3K6XA 2Q9TA 2HZKA 4TOZA 2F7AA 3HSTA 1DPEA 1QW0A 4ZE8A 5B7DA 1ZTYA 4F3BA 3SEXA 3TQWA 4EQ7A 4NF5A 5KCJA 4R6KA 4XKPA 2F6PA 4RPOA 1R9QA 5L8DA 4RK9A 4U1ZA 3QXMA 3EHUA 3EN3A 5DEXA 4DLDA 1OIBA 1JW5A 4LUBA 2RKMA 5H8FB 4U22A 3QIMA 3L6HA 3OELA 1P1WA 3O6GA 4DDDA 1QUIA 4F3PA 1B2HA 4YZZA 3OEKA 3IB1A 2M8CA 3VVEA 1QULA 2GHAA 2V3TA 2QJEA 4F31B 5DVJA 2Z8EA 3QSLA 4F2QA 1A99A 1L5TA 3R26A 3EQ1A 4P0IA 3GXAA 4OFLA 2ZXTA 2A5TA 2OJTA 3IAZA 1B7ZA 1SDXA 1VFEA 1A8EA 3KN8A 1TFAA 3S9EA 1BLFA 5AA1A 5AA3A 4YKPA 2Y84A 3VE1B 3PPNA 3RT6B 4RJZA 4YKIA 2DQVA 5DVFA 2HEUA 5AA4B 3IR1A 1NMUA 5FHNA 4FEBA 2Z23A 2FNCA 1P1QA 4POXA 2H9BA 1OQHA 4NF8A 2V3UA 1UTHB 4IO3A 3K01A 3Q28A 4EXLA 1LCTA 1FQBA 5FTHA 3T22A 5HBCA 1LFHA 1B3GA 3C36A 1XOCA 4IO4A 1SYHA 2NWJA 3MPKA 2I6EA 5I56A 3D4CA 1MQGA 1MXUA 3EPEA 2XD2A 4LP2B 4LQ2A 2XXVA 4R6HA 3TCFA 2DE2A 1DPPA 4FORA 4DIGA 3O66A 2V93A 1BP5A 5JTYA 3JZJA 5L9MA 5DTBA 3G7WA 2H25A 3T9XB 4KHZE 5ICQA 4IO2A 4H0WA 2XXRA 4EDPA 5KDTB 3OENA 2O51A 3SETA 1TWYA 4H6DA 3HPIA 1VFDA 4I9DA 5IKBA 3PD9A 2OWSA 3O2AA 3V89B 3CVGA 5I57A 1ZMGA 4PP0A 3E13X 4QFNA 4QFLA 3M3LA 2DWIA 1P99A 4U1OA 2PBWA 4YB5A 3SKPA 3FV2A 2ONSA 2PT2A 3WAEA 4NWDA 2XXTA 3LBSA 3K00A 4KPTA 4MFIA 2UVIA 3VLUA 3TTRA 2XXXA 3IO4A 2ABHA 2F97A 5AE4A 1Y4CA 1H44A 4IY5A 3B7DA 4BDRA 3RY3A 1SW5A 2B65A 4H8JA 4M1VA 3H6TA 4F2OA 3MC2A 2A5SA 5TP9A 2YLNA 1US5A 4NEDA 1A54A 1MH3A 4QHQA 4GRKA 1NFTA 3FV1A 2V3QA 3PPOA 3AXFA 1AIVA 4N6PA 3H6UA 1FTJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1USYE 3B6QA 1G0IA 4N6DA 1NUWA 4PF6A 2I4BA 5FHMA 2FA7A 1B40A 3UA8A 3PUZE 2HAUA 3PUXE 1FBHA 1GR2A 1RDYA 3O9PA 4IB2A 3PMVA 3QK6A 3UORA 3VV5A 2WKYA 3CSGA 2XXYA 3D4GA 2YPNA 1XVXA 1UIUA 3CR9A 5A5XA 1GVCA 3FASA 4F1UA 2ANJA 2Y7PA 2DS9A 1OLAA 4X1BA 4RK2A 4F3GA 3EF7A 1VSOA 3C33A 4PE5B 4N8YA 1B51A 3O28A 4HTGA 2OBGA 3K1NA 4MEVA 4KYSA 2UYEA 2ONKE 1MXZA 3C35A 3KN3A 3IFCA 4NX1A 1XC1A 1D9YA 1QKBA 2DXYA 3SZPA 3A3UA 1Y20A 3VLWA 2R71A 1DMBA 2XX8A 3MVZA 3LUYA 4GWOA 4NN3A 3IOTA 2O1LA 1FQEA 1LEVA 4UABA 3QUJA 4R74A 2E0SA 3KFMA 4N15A 3KEIA 1IXGA 2REJA 4QSEA 4UA8A 3G3KA 1PC3A 5EQ8A 1R6ZA 2VPNA 4OETA 4AQ4A 3CFLA 1WVJA 1MQDA 4MNIA 1LGBC 1BTJA 2DE3A 1SVXB 2XXPA 4LN5A 4I40A 1MXXA 1MS7A 2F8DA 2X26A 4H46A 3KOTA 2QMWA 1TFDA 1QVSA 2Q2CA 3MW0A 2RC8A 2XWOA 3OSRA 1Y3PA 1LBBA 3DELB 2Q2AA 1IUDA 3CRBA 1MM7A 1PB8A 5JEIA 4BDMA 3K6VA 4ELPA 3FXQA 5F7VA 4C1TA 3M3KA 5EHMA 1NV0A 4NF4B 4Q30B 4XKQA 5KZTA 4OEVA 1K9ZA 3RPLA 1KWHA 2H5YA 3LUZA 2F34A 5I59A 1NKXA 4HE2A 5TPAA 5ET7A 3SEUA 2F36A 1PDAA 4U23A 4OQOA 4H1XA 1Y3QA 1B4ZA 4Q5TA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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