3CG1A

Crystal structure of p. furiosus periplasmic binding protein moda/wtpa with bound tungstate
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
EVTLIVFHAGSLSVPFQEVEKEFSEYAERNLGIKVSFQDEASGSVMAVRKVTDLGRKADVIGVADYTLIPQLLIPNYTDFYVLFATNEIVIAFTDKSRYVEEMKSNPDKWYEILAREDVRFGFSDPNQDPCGYRSLMVIKLADLYYGKEIFKELIEENTNIYSNGTQIYAPKEITVNPGKIVIRPKETDLLGLVESGSIDYIFIYKSVAKQHNLSYITLPSEINLGDFSKEKFYGQISITLGSTGKTIKAKPIVYGVTVLKDAPNREVAIEFLRYLLSENGKRIFEKNHQDFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Distorted octahedral coordination of tungstate in a subfamily of specific binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UPF0100 protein PF0080
molecule tags Transport protein
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 105
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cg1A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cg1A01
1MQHA 4OTEA 1MY3A 1PB9A 1D3KA 3V89B 3LSWA 1IXHA 4G8MA 5CBRA 1UTHA 1MS7A 4H1XA 3CSGA 1MH4A 5JEIA 2ZYKA 1JW4A 1NNPA 2H5YA 4F3BA 4IO2A 2Y84A 2GH9A 4FJPA 5ITPA 1Y1ZA 3LUYA 1B32A 2YLNA 1OVTA 3HV1A 3GBAA 4DXBA 4G8NA 4N07A 2THIA 3MPLA 4GF8A 4H8IA 1LCTA 5A5XA 1MQJA 5FTHA 1YAEA 1GR2A 3TFLA 1M5EA 4U1ZA 1MXWA 2DSFA 2Z8DA 3ZS6A 1POY1 3EN3A 3H06B 3W9WA 4C1TA 1DTZA 2QS2A 4QFOA 4DCXA 4HTGA 5H8HB 1PEBA 5DEXA 1EZOA 4FE8A 3THIA 3G3GA 3H6VA 3Q28A 3HO7A 1OIBA 5I57B 1QW0A 2I4CA 4KR5A 1A8EA 3EHSA 4RYAA 4RPNA 1M5CA 1EU8A 3UGWA 4JXIA 4OERA 3S2VA 2ZNUA 4H6DA 3TDJA 1MM6A 3O9PA 5TU0A 2O1MA 4JWOA 3JYRA 1Q35A 2GFEA 3MVWA 1SI1A 3K1NA 3SEWA 2F6GA 1MY2A 4ZEBA 1ZIUA 4P0GA 5KDTA 3IR1A 4H0WA 2VP1A 3GXAA 4I1DA 4GD5A 1P1QA 4JBZA 4JWYA 4ZEIA 2DWHA 4R9FA 1JVXA 3RN8A 4OVJA 2NWJA 1VR5A 2UXAA 2B3FA 3MZBA 4RK9A 2QL3A 4P0IA 3EHTA 4OZ9A 4G68A 4QSDA 2ABHA 5ELVA 3T93B 3E4RA 3GBBA 3MZ1A 1USYH 1A54A 1PDAA 4KHZE 1SBPA 4GXSB 4LZ7A 2V3QA 3PMXA 2XXVA 2DYXA 4R9GA 2DXRA 1VSOA 1ELJA 3B6TA 3MJNA 4QSCA 1A55A 1O63A 3FV1A 4ZEKA 2F7AA 2Z8EA 1CE2A 3VV5A 1BTJA 4R6HA 2Z8FA 2F5XA 4F1VA 3W9VA 3EPEA 1SVXB 2XHDA 3VE1B 1H3DA 3IAZA 4MH5A 4JB7A 1PB8A 3VXBA 4YICA 2P0SA 1N3WA 5EHSA 2DP8A 1LCFA 1MDQA 4R2BA 3O2AA 1ZTYA 4U4XA 4NF4A 2DS9A 3SESA 4AB6A 5L9MA 1B3EA 3RLFE 4U1OA 1Q1KA 5HPQA 1YPNA 2PBWA 3EF7A 3FJ7A 3MPKA 1MPDA 5DTBA 3RY3A 2O6AA 3R6UA 2F34A 4EQ7A 3VFJA 1D9VA 3SERA 4I9DA 1FTLA 3DM0A 3FXQA 4EF1A 1LB8A 1MQGA 1B05A 4OFOA 1AMFA 3G3FA 3TCGA 3FVGA 1Y3QA 2XXHA 1H45A 2Y7WA 2R71A 5KCJA 3TEPA 4ESXA 2UVJA 2GRVA 1WDNA 2V93A 5AA2A 4H8JA 3U94A 1B2HA 1SI0A 4U21A 3IOUA 4TLMB 4HW8A 1B0HA 1LGBC 3TMGA 1Z7ME 2OWTA 2HQ0A 2DVZA 4IO4A 3M3FA 1GV8A 5DT6A 1SW5A 1B7HA 5I56A 1N84A 1QULA 4EF2A 3MVYA 1XVXA 3MP6A 3PU5A 4POWA 3U8QA 1MY1A 2REGA 1FQEA 2ALUA 1UQWA 1Y4CA 2P1SA 3D4CA 4U22A 3HSTA 1NFTA 4IB2A 4O3AA 4XKQA 4DLDA 3PGFA 3G3IA 1XHYA 4F1YA 4ELRA 3EQ1A 1ZLQA 1FTOA 1LB9A 1RYXA 4F2OA 4QFKA 4FECA 1BKAA 3DP4A 4LP2B 3K6XA 5AA4B 1JVYA 4F31B 2B65A 2X7QA 3I3VA 1N0TA 2REJA 4IGTA 4FORA 3PUZE 5CMKA 3N5LA 3VDFA 1BIYA 2V3TA 1NNTA 1NH7A 4MLQA 3VVEA 2A5TB 5I2KB 3VVDA 2UVIA 5H8FA 2DE3A 1NNKA 4G4PA 5H8SA 4HCYA 3E9XA 5AA2D 3V8XB 1US5A 3N6UA 1MH3A 1TT1A 2R6GE 1JEUA 4NF6B 3KGCA 4P11A 1LAHE 3MZ9A 4FATA 1LFIA 4NF8B 3IK6B 1PC3A 2HAUA 2D21A 1MXZA 4H5GA 1JW1A 3HCQA 3SEXA 3O28A 3FVNA 1Y3PA 1PB7A 4X48A 4F19A 4Z7EA 3K0VA 2RKMA 5H8QB 1XOCA 4I8CA 4YKPA 1QKBA 1SYIA 1YTVA 3Q25A 5DYHA 3JV9A 2O51A 4OFLA 4OEUA 2FNCA 3TCFA 1LAXA 3VXCA 4G8HA 2HAVA 5TPAA 3PUVE 3QYTA 4IO7A 1ATGA 3LSXA 1S9TA 2Q8JA 2G93A 3FATA 1P1OA 3OEMA 4DCYA 4C0RA 1HSLA 1IITA 4LATA 1CB6A 4YB7A 4F1UA 1VFEA 3S9EA 4FEBA 2ONKE 3H03A 2XXPA 2OBGA 4QHQA 5H8NB 1II5A 3M3LA 4MLVA 3H3GA 4EDPA 2OWSA 3LSFB 3IB0A 5L9OA 3K00A 2ONSA 3G3KA 3CFXA 4OYVA 1DPEA 2FYIA 2HZKA 1B5JA 4JDFA 1Y4TA 4TOZA 3QAXA 4GFRA 1URSA 2D3IA 1R9LA 2E1SA 3MVZA 5ISUA 3K1MA 1MQIA 4YZZA 4LQ5A 4QF9A 1SDXA 3SETA 5CBSA 2I0BA 3U72A 3PV0E 1B4HA 3OMBA 4OETA 3GZGA 2GHAA 2Q9TA 5CMBA 4GLIA 3IOWA 4G77A 3MP1A 1LAGE 1QKAA 4EXKA 3IJXB 4NF5A 1NKXA 2VHAA 3FD3A 4Q0CA 4ZZAA 2I49A 2F7BA 2XXTA 2Q89A 4YKKA 2RINA 2XXWA 4WEDA 5LOMA 1LBCA 4DDDA 2PYYA 1B3GA 3BFTA 3FUZA 3C32A 3R26A 1M5DA 4F39A 3TELA 4OEVA 4ZEDA 1IIWA 3BBRA 3ILTB 1QJMA 3ZSFA 4L17A 3VLWA 1SD3A 1XVYA 3OD7A 2LAOA 5CI5A 3O6IA 1T0KA 1AL3A 1MPCA 3PUYE 4GXAA 4F29A 4MF3A 3FXRA 4FIMA 4KD5A 4NMYA 1LSTA 3CR9A 3BFUA 3G3JA 3IB2A 4N13A 4ELQA 2OCUA 5M2VA 4BDNA 1RKMA 5BWJA 1ZU0A 4KYDA 5CRYA 1B7UA 3DP8A 4KQPA 1N76A 4LA9A 3N6TA 5L8DA 3TCHA 2QS4A 1IZ1A 3IOVA 1VE4A 3RT6B 4Q5TA 5I59B 2NOOA 1TFDA 5AE4A 1P1UA 4YU0A 3OENA 1Y20A 1A40A 2XD3A 3CRBA 5HM4B 3T9VA 1JQFA 1P99A 3A3UA 3OELA 1BP5A 3H4ZA 2Q2CA 2M8CA 1IXIA 4OESA 4R72A 4IY5A 4DE8A 5JTYB 3DELB 1ZJLA 4Q30B 1IQ7A 2OZZA 3LR1A 2V84A 2Y7IA 1FQCA 1OQGA 4KPTA 3KG2A 2RC7A 1MY4A 1POTA 3K01A 3TYHA 3L6GA 3HN0A 3SEVA 1S7YA 5I2NA 1GVCA 4H65A 3K1PA 5J1DA 5I58B 2ZNSA 5B70A 4O3BA 2D5WA 3RPWA 3CFZA 3PUXE 3K6WA 4PFUA 1JETA 3K4UA 5DVFA 3MBPA 4GRKA 1B1HA 2F35A 3V83A 5B7DA 5HBCA 5K2YA 3RTWB 1H76A 1JNFA 2FA7A 3C33A 4NEDA 3FVOA 1B4ZA 1R9QA 3KOTA 3HHFA 4ELOA 1O64A 4MBPA 1RYOA 2I3WA 2DWIA 2NUVA 3C31A 5H8HA 2H99A 1DPPA 1M5BA 3O66A 1H44A 1NNFA 5KZTA 2I58A 4KYSA 3RGYA 5K2XA 5FHOA 5I57A 4PFWA 4AQ4A 1SW2A 2HZLA 4GL8A 3MQ9A 5ICTA 2PX1A 2ONRA 1AIVA 1NL5A 5DVJA 5F7VA 3CFLA 1B51A 1AOVA 3IO4A 4ZS9A 3FIRA 5EYFA 2ZNTA 5AA1A 3FGSA 4PP0A 4POXA 5F1QA 2XX9A 1DSNA 4Z0IA 3MWBA 1QUIA 1R1NA 3HHGA 3KOSA 1ZBMA 1B1XA 1JW5A 4LZ5A 1UTBB 5TP9B 2VGQA 3B6QA 3RTFB 4H67A 4U23A 4ESWA 5ITOA 3SEUA 3TODA 1UTHB 3Q26A 2I4BA 3OO9A 2QMXA 4JWXA 3KFMA 2QSXA 3TTMA 3KEIA 3SEYA 2XXYA 3JZJA 2XD2A 1J1NA 3W15C 1NH8A 3UA8A 1ANFA 4M1VA 2IEEA 4GL0A 3SDFA 3I6VA 2Q88A 1SYHA 3OXNA 1JEVA 5A5XB 1WODA 2ZXTA 4F18A 3RQTA 4NWCA 4QFPA 1FTKA 4R6YA 4XKRA 3DLNA 2DE2A 1IXCA 4X9TA 3T22A 2H4IA 3CSBA 2Z22A 3WAEA 2UVGA 2HFBA 4NTLA 1TFAA 4NF5B 4GWOA 3RUMA 3MUQA 4YB5A 4PE5B 2I0CA 3B7DA 3N26A 4R74A 2R9JA 1A7LA 1B3LA 4KYEA 3T9XB 2QMWA 2DOJA 4YMBA 4OFJA 4X1DA 1HSEA 4KCCA 1N7XA 4JSDA 3TTRA 4OMBA 5DEXB 3PPNA 5L9SA 2ZYMA 4JSOA 2RCBA 4KI0E 2O84X 4GOTA 3O6HA 1B46A 1DTGA 4NWDA 1OLAA 3C4MA 4M4GA 1IEJA 1MXUA 4GVOA 4E0XA 4YAHX 4FAJA 1P1WA 4R6KA 4PFYA 2XXUA 4ZE9A 4XIGQ 1S50A 2F78A 3TQLA 2UYFA 4OXVA 5KDTB 3AXFA 1QUKA 3PPRA 3KN7A 1DMBA 3Q27A 3FZVA 1R6ZA 1B58A 4FEDA 1ZKBA 1IUDA 1NMUA 2PT2A 2VOZA 3H7MA 1US4A 1Y9UA 2O7UA 3KSXA 3PPQA 2PVUA 4G68B 1LFGA 3DP6A 1SQYA 1XC1A 2O68A 3UP9A 4OHNA 4RY1A 2RF1A 2DWAA 2QS1A 3A3CA 3A09A 4EUOA 2KLFA 4ELPA 3KJ7A 1B5IA 4KFQA 5IKBA 5BUUA 4ONYA 1D9YA 3TQWA 3CIJA 2DXYA 1A8FA 2RCAA 3S4UA 4PFTA 1LFHA 2DVCA 4YKIA 3ECRA 4BDQA 1OVBA 5FHNA 2I6EA 3OEKA 3QIMA 2X26A 2DWJA 5AA4A 3QXMA 3IX1A 4ECFA 4RPOA 3T9UA 3G3HA 1Z7NE 4WEPA 3UK4A 1EH3A 1MRPA 3ODBA 5I2NB 4RNSA 2BJJX 4DXCA 4RK2A 5ICQA 3K6UA 4LUBA 1H43A 2A5TA 5I2KA 3PPPA 2H98A 4IO6A 4NF4B 4AB5A 2Z23A 3TTLA 3CG3A 2DE4A 1BLFA 2QS3A 2VD3A 4BDLA 2HXWA 3MAMA 2IA4A 2DQVA 4NF6A 4NF8A 3SKPA 4BDRA 3ZKLA 1LLSA 2UYEA 3CG1A 1XS5A 3OO8A 2F97A 1UIVA 3D4GA 1OLCA 4OWDA 2CZLA 1VFDA 3P7IA 4E0WA 1HSJA 1N3XA 1WVJA 5H8QA 2NXOA 1PBQA 1SW4A 4ISUA 4ZDMA 4RJZA 4F2QA 2B3BA 1I6BA 5KCJB 3L6HA 3K02A 1EZPA 1MXVA 2AYSA 2VD2A 5AA2B 4QFLA 1M5FA 3OSRA 5I84A 2P2AA 3KSJA 2V25A 2AIXA 3CI8A 5CMCA 3LSLA 4R73A 3OOAA 3KJTA 3O29A 1QVSA 1PBPA 3N94A 3U1OA 5EHMA 1IXGA 5IAIA 4H5FA 3TPAA 4C1UA 1B6HA 1B52A 5I56B 4X1BA 1FCKA 1SW1A 4KCDA 3T66A 4BDOA 1A99A 4IO5A 3IOTA 3OSQA 5H8NA 1FQBA 5AA3A 4ND9A 5JK4A 4QFNA 1LBBA 3PD8A 2ZMBA 3S9LC 3M8UA 1FQDA 2QJEA 4YB6A 1MQDA 4EQ9A 2WKYA 3CVGA 3USDA 1AH5A 3UORA 2YPNA 2CMOA 4EQBA 3FASA 1OQHA 4U4SA 1MG1A 2XX7A 4XKPA 1N7WA 2ANJA 3RT8A 3TAJA 2X7PA 1MPBA 3KN8A 1B3FA 3I5OA 3RNNA 1TXFA 3IO6A 3M3KA 4U2RA 4WXJA 3V5AA 4IGRA 3R7XA 2XXQA 2OLBA 3ZKKA 3LBSA 4XTCQ 2V3UA 4DXUA 1FTMA 4NE4A 1B7ZA 1B40A 3Q29A 4R75A 2QPQA 5H8FB 2OK2A 4F3SA 1Y3NA 1MY0A 2Q2AA 2E0SA 2O1LA 2PMSA 3HPIA 2I3VA 2XXXA 2F6PA 3C34A 1FTJA 5CC2A 3FXUA 3QUJA 1I69A 2ESNA 3OO6A 4F3PA 1B9JA 1MXXA 1GTKA 3U93A 3C35A 3GLBA 1L5TA 3G7WA 1ZMGA 4F3GA 4PETA 2XXIA 3E13X 3FJGA 4YMAA 4ZECA 4HCWA 1URGA 4TLLB 3UIFA 2HEUA 1KWHA 1QUJA 4QRZA 3PMVA 1YCJA 1B0LA 3EHUA 3H6UA 3OO7A 2HCAA 3QSLA 2AL5A 1N04A 3K6VA 3TUSA 2A5SA 4O3CA 3MP8A 5TPAB 4DZ1A 2G29A 3ILUB 2F36A 5I59A 3WAFA 4EXLA 3MC2A 3O6GA 5FHMA 3TTNA 1B5HA 2ZYNA 5DVIA 3F11A 4K3FA 4PQJA 4ZEFA 1P1NA 4N6PA 2Y7RA 4XXUA 5FTIA 2F8DA 3ONMA 3UN6A 1O7TA 5JTYA 3FV2A 2UVHA 4XKNA 2PT1A 1F9BA 3TTKA 4IO3A 1TWYA 3C36A 4YKJA 3U92A 3VLVA 1FW0A 4GIZA 4WKMA 3VLUA 3H6TA 1DOTA 3QK6A 2Y7PA 3IB1A 1MDP1 4BDMA 3S9NC 4OENA 4LONB 5I58A 4G68C 3FVKA 2H9BA 4RA1A 2NVUB 3E3KA 3IJOB 4R2FA 3QUFA 2AL4A 3BKIB 4ZZEA 4F22A 1XT8A 4TQUQ 2RC9A 3S9MC 1USYE 4LQ2A 1URDA 4LVQA 3PPOA 3MW0A 2F7CA 4LZ8A 2XXRA 1MM7A 1UIUA 2W7YA 2XX8A 3FJMA 4MFIA 1Y1MA 4G2ZA 1MXYA 1I6QA 4IY6A 2GHBA 3H6WA 3PUWE 3MVXA 4THIA 2H25A 4HS7A 3TKDA 3C9HA 2YJPA 3KZGA 3PD9A 3IL1B 3VVFA 3T9HB 2Y7KA 4Q8RA 3O97A 1FQAA 1FQFA 4DIGA 4RXLA 4BLAA 3PMWA 3KN3A 4OQOA 4ZE8A 1EZ9A 4GQOA 5CM6A 1GGGA 5CMMA 3KBRA 2QRYA 4UA8A 2I48A 4UACA 3B6WA 3TZAA 2O69A 1LAFE 2O7IA 3LC8A 1UTBA 5TP9A 2RC8A 2OJTA 4QSEA 1D4NA 1I6AA 1OMPA 3T96B 3IORA 3K2DA 1B3HA 2ZYOA 4I62A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MQHA 2FBPA 4OTEA 1MY3A 1PB9A 4G61A 1D3KA 3V89B 3LSWA 1IXHA 3U65A 4G8MA 5CBRA 1UTHA 1DBZA 1MS7A 2WX9A 1LBXA 4H1XA 3CSGA 1MH4A 5JEIA 4XEQA 2ZYKA 1JW4A 1NNPA 2H5YA 4F3BA 4IO2A 2Y84A 2GH9A 4FJPA 5A5LA 5ITPA 1Y1ZA 3ROJA 4OVPA 3LUYA 1B32A 2YLNA 1OVTA 2XWVA 3HV1A 4NHBA 3GBAA 4DXBA 4G8NA 4N07A 2THIA 3MPLA 4GF8A 4H8IA 1LCTA 5A5XA 1MQJA 1NV2A 5FTHA 1FPBA 1YAEA 4O7IA 1GR2A 3TFLA 1M5EA 4U1ZA 1MXWA 2DSFA 2Z8DA 3ZS6A 1POY1 1DCUA 3KC0A 3EN3A 3H06B 3W9WA 4C1TA 3T1BA 1FBDA 4N4UA 1DTZA 2QS2A 4P1LA 4QFOA 4DCXA 4HTGA 2QFLA 5H8HB 1PEBA 5DEXA 1EZOA 4FE8A 3THIA 3G3GA 3H6VA 3Q28A 2XA5A 3HO7A 1OIBA 5I57B 1QW0A 2I4CA 4KR5A 1A8EA 3EHSA 4RYAA 4RPNA 1M5CA 1EU8A 3UGWA 4JXIA 4OERA 3S2VA 2ZNUA 4PGPA 4H6DA 3TDJA 1MM6A 3O9PA 5TU0A 2O1MA 1FPIA 2PFZA 4JWOA 3JYRA 1Q35A 2GFEA 3MVWA 1SI1A 3EKIA 1LEVA 3K1NA 4P3LA 3SEWA 2F6GA 1MY2A 4ZEBA 1ZIUA 4P0GA 5KDTA 3IR1A 4H0WA 2VP1A 3GXAA 4I1DA 4GD5A 1P1QA 4JBZA 4JWYA 4ZEIA 2DWHA 4R9FA 1JVXA 4OVJA 2NWJA 3RN8A 1VR5A 2UXAA 2B3FA 3MZBA 4RK9A 2QL3A 4P0IA 3EHTA 4OZ9A 4G68A 4QSDA 2ABHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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