3CG1A

Crystal structure of p. furiosus periplasmic binding protein moda/wtpa with bound tungstate
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
EVTLIVFHAGSLSVPFQEVEKEFSEYAERNLGIKVSFQDEASGSVMAVRKVTDLGRKADVIGVADYTLIPQLLIPNYTDFYVLFATNEIVIAFTDKSRYVEEMKSNPDKWYEILAREDVRFGFSDPNQDPCGYRSLMVIKLADLYYGKEIFKELIEENTNIYSNGTQIYAPKEITVNPGKIVIRPKETDLLGLVESGSIDYIFIYKSVAKQHNLSYITLPSEINLGDFSKEKFYGQISITLGSTGKTIKAKPIVYGVTVLKDAPNREVAIEFLRYLLSENGKRIFEKNHQDFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Pyrococcus furiosus
publication title Distorted octahedral coordination of tungstate in a subfamily of specific binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UPF0100 protein PF0080
total genus 105
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cg1A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cg1A01
3ZKLA 1A7LA 3CVGA 1Y20A 3K1PA 3WAFA 2Q88A 2XXQA 4R74A 4RK2A 1JNFA 4PE5B 3IL1B 4ZEFA 3T9HB 3D4CA 1PBPA 2GHAA 4K3FA 1SD3A 2DWIA 2DWJA 4BDLA 1UTHB 2XX7A 4H8IA 3FVNA 1LB9A 4OFJA 5BUUA 1ZU0A 1IEJA 1IIWA 1GGGA 1IXCA 1AIVA 1YAEA 1H43A 3VVEA 2QJEA 5ICTA 4LZ8A 4OXVA 5K2YA 3FVOA 4F31B 3CG1A 1SW1A 3OO6A 2R9JA 3IOWA 3PUXE 1XC1A 1SI1A 1HSJA 1B51A 1ZLQA 4R75A 3G3HA 1MRPA 1AH5A 3CFLA 4WEDA 1NNPA 5H8FA 4P11A 1P1QA 2M8CA 3PGFA 4XKQA 1LFHA 2PVUA 3KG2A 3U94A 4OVJA 4H65A 1DOTA 4NMYA 2NUVA 4F22A 1ANFA 3IOUA 2XXIA 2ZYKA 1MY4A 4DXCA 1EZ9A 5CC2A 1B4HA 3Q26A 5DYHA 1L5TA 1FQAA 2H25A 1URSA 3SEUA 5CMMA 3K01A 3PPQA 1QVSA 4U22A 4FIMA 1JW4A 4U21A 3V83A 3KN3A 2Z23A 1Y4TA 3TELA 2Q2CA 2XXUA 2GHBA 2X7QA 1MY0A 1NNFA 3KZGA 4F18A 3C32A 3B6QA 3Q27A 4M4GA 5CM6A 5M2VA 3T9VA 2XXPA 5BWJA 3IO6A 2Y84A 2I4CA 1SW5A 3FZVA 2THIA 2ESNA 2DWHA 4DLDA 4NEDA 4HS7A 2YLNA 3KN8A 2D5WA 3PUVE 1CB6A 2XD3A 2QSXA 3RQTA 5H8HA 3FGSA 3PV0E 4QFLA 3UK4A 1DSNA 2Z8EA 1QULA 3UGWA 3V8XB 2VD3A 2VP1A 1BTJA 2H4IA 4G77A 2X26A 4IO2A 1ELJA 3E3KA 3RGYA 1AMFA 1USYH 2DWAA 5TP9B 3C34A 4RYAA 3KSJA 5FHNA 1O63A 4F29A 5H8NB 2CMOA 4H5FA 5I2NB 3IX1A 1A40A 4WXJA 3OOAA 4KI0E 2RC8A 1UQWA 3G7WA 3JZJA 3MWBA 2P2AA 4ELPA 1WODA 3R26A 3E4RA 5F7VA 3TCFA 1JW5A 1H76A 3MVWA 3LSFB 1UIVA 1VE4A 5B70A 1Y3PA 1N7XA 4PFWA 3S9MC 5DEXA 1B05A 4OEUA 4QRZA 3HHGA 3IB2A 2O1MA 4MLQA 3RPWA 1QKAA 1M5CA 1FTOA 4ZEBA 3FJ7A 4R2BA 4U1OA 1NKXA 3FXQA 1T0KA 2Y7RA 4IO5A 4OTEA 3W15C 3K6VA 1I6AA 4AB5A 3QK6A 3G3GA 1XVXA 1XOCA 4JB7A 3O2AA 3B7DA 2XX9A 1FTKA 1MPBA 4ZZAA 1EU8A 4KQPA 3RN8A 1GR2A 2XXHA 3EPEA 1TWYA 3VLWA 1OQGA 2O7IA 4QFPA 4R72A 5DTBA 3RT8A 3U72A 3HN0A 3A3CA 1BKAA 4PQJA 3ZKKA 1OQHA 2OWTA 5I2KB 3K2DA 3OO9A 5A5XA 4F1UA 1B58A 1ATGA 2HAUA 1R9LA 4E0XA 2UYEA 5KCJB 5K2XA 5AA2A 3SEXA 3U8QA 2NVUB 4GRKA 2ZNTA 3T9XB 2UVIA 1B6HA 4GL8A 4BDMA 4NF8B 5I58A 2F34A 1B3LA 2OCUA 3K0VA 3SKPA 2NOOA 1JQFA 1VFDA 3SERA 1F9BA 1SQYA 3ODBA 1DMBA 1QUIA 3O29A 4ONYA 3A3UA 2ZXTA 4KYDA 1A8EA 3VLVA 2ONRA 1MPCA 3N6UA 4YKKA 1DTZA 4F2QA 2HXWA 3LBSA 1I6QA 1HSEA 4OHNA 3AXFA 3EHTA 3OEKA 3K4UA 2QL3A 1MH4A 3MBPA 2F7BA 1UTBA 4RNSA 4YKPA 3TUSA 2PYYA 1B2HA 3MVYA 4QHQA 1B5JA 4TQUQ 4OWDA 1DPEA 1II5A 2DVCA 2F7CA 4LONB 5KDTA 4ZEDA 3PU5A 1URGA 2F35A 1SBPA 1B7ZA 4EF2A 4GXAA 1IXIA 3VVDA 3O97A 1B9JA 3D4GA 1A8FA 1YCJA 1MQJA 1GTKA 1TT1A 1YTVA 3TTRA 1BLFA 2ALUA 4YMBA 2P0SA 3RTFB 3QSLA 5I59A 3TCGA 2G93A 5L9OA 4OERA 4H67A 1M5EA 1B0HA 1OLAA 5ITOA 5CBRA 2NXOA 2HFBA 1IZ1A 5L8DA 1KWHA 1VSOA 2VOZA 3MVXA 4H5GA 1QUJA 4Q30B 4HW8A 3KJTA 5TPAB 5JTYB 3QAXA 4EQ9A 3DLNA 4IGTA 3C9HA 4GD5A 2HCAA 4R9GA 3V5AA 3UIFA 3H6TA 3U93A 3O6HA 2O1LA 1DPPA 1LCTA 2PBWA 4G68B 1B5HA 4KHZE 4F2OA 3G3IA 3FXUA 4F3PA 2F36A 3CIJA 2HZLA 2V25A 2HQ0A 3TZAA 1LCFA 1TFDA 2H5YA 1FTMA 2H98A 3N26A 5I57A 4IO7A 5H8QA 4BDQA 2X7PA 3UORA 2ZNUA 2I0BA 2DOJA 4E0WA 1MY3A 4JBZA 5AA4B 4JXIA 4MBPA 2HEUA 4PETA 4BDNA 2QPQA 4DXUA 1ZIUA 3DELB 1S9TA 4F3SA 1R1NA 1NNKA 4U1ZA 5HM4B 4YKIA 3C33A 4ZE9A 3K6XA 3RT6B 1JETA 3ECRA 2O68A 3QYTA 1LAHE 2A5TA 2Q2AA 1TXFA 4BDRA 1ZBMA 4EQ7A 1NH8A 4U4XA 3CI8A 2DXRA 3B6WA 5CMBA 1SW2A 2XXXA 2OJTA 1M5DA 1XVYA 1FTJA 1B46A 3LSWA 3TAJA 1PBQA 3OO7A 4THIA 4R6KA 4WEPA 3K00A 3MZ9A 1JVYA 1MQHA 2B3BA 4ZS9A 4DXBA 3C31A 1QW0A 4OENA 2RC7A 3DP6A 5CBSA 3FUZA 1Y1MA 3GXAA 3L6HA 3HO7A 3HCQA 3LSXA 3SEVA 4FEDA 3EQ1A 2AL4A 2XD2A 2H99A 3TEPA 4PP0A 3C35A 1ZKBA 4YB5A 4EXLA 1POTA 2XHDA 5FHOA 2O51A 3FJGA 1NL5A 2OZZA 2RINA 1B3FA 3T66A 4RY1A 4R9FA 1MH3A 2ANJA 4XIGQ 4POXA 5I84A 2ZYMA 3M3LA 1Y3NA 2Q8JA 2GRVA 4MLVA 4FEBA 3OO8A 3TODA 1MM6A 2OWSA 3PMXA 1B5IA 2FA7A 5TU0A 2E0SA 1GVCA 3PPRA 2DE4A 3KJ7A 4I9DA 3SETA 2Y7PA 4PFUA 2ABHA 1J1NA 3OSRA 1LLSA 1S50A 4HCWA 1DTGA 5KZTA 3U92A 2XX8A 4IY6A 3O28A 2UVJA 4AB6A 3LR1A 1BP5A 3GBAA 2PX1A 4PFTA 2IEEA 4IO3A 2XXRA 3GZGA 3MZ1A 1QUKA 3F11A 1B32A 3PUZE 1P1OA 4IY5A 4GVOA 1UTHA 3B6TA 1SYHA 1O64A 3R6UA 1N3WA 3MP1A 3IJOB 3RY3A 4OESA 2DP8A 4YKJA 4Q0CA 1H3DA 5FHMA 3MJNA 4X48A 4YU0A 5B7DA 4G4PA 2Z8DA 2QS2A 2RCAA 4OZ9A 4F3BA 1HSLA 4JDFA 2Y7IA 1Q1KA 4KCDA 3JYRA 1IQ7A 1PDAA 3KOTA 3BFTA 4H8JA 4C1TA 3ZSFA 3PMWA 1LB8A 3TDJA 2O69A 3Q25A 4AQ4A 1LSTA 2PMSA 5AA1A 4FJPA 3E13X 1PB7A 5JK4A 4QFNA 4F39A 5L9SA 4MH5A 2D21A 2D3IA 4C0RA 4YAHX 5CRYA 4JSDA 4O3BA 2V3UA 1N76A 4NF4B 4OYVA 5I56B 2I3VA 3T93B 4GWOA 2DYXA 3TCHA 3L6GA 4KCCA 1ZMGA 2Y7KA 5EHMA 1LBCA 3PUWE 1WVJA 3N5LA 4XKNA 3R7XA 4N13A 4RK9A 3IORA 4NF6B 4LATA 4Q5TA 4GLIA 4U2RA 1PC3A 2F7AA 1LBBA 4O3CA 1N04A 1NFTA 2I3WA 2RCBA 1H45A 2DS9A 3FV2A 4PFYA 4X1DA 3QUJA 1NMUA 3ZS6A 1POY1 5L9MA 3O66A 3OSQA 4GQOA 2PT1A 3P7IA 4X9TA 4HCYA 4QSDA 3GLBA 3VVFA 3KN7A 4YMAA 3W9VA 4HTGA 3VDFA 2LAOA 5ISUA 3TFLA 3M3FA 3C4MA 2I58A 1P1UA 1IXGA 5AA2D 1A99A 4U23A 1ZTYA 2F5XA 2UVGA 4G2ZA 4ECFA 2I0CA 1BIYA 3A09A 3Q29A 4R2FA 1OMPA 3RUMA 1B1HA 3MP8A 4NWDA 4JWOA 5ICQA 2AIXA 2F6GA 1LAXA 2VGQA 1A55A 4H6DA 5H8FB 5TP9A 4POWA 3S9NC 3KGCA 4TOZA 4LZ5A 5H8NA 3USDA 1GV8A 5I2NA 5CMKA 2QMXA 1ZJLA 4IB2A 3QXMA 3HHFA 2A5SA 3TYHA 2B3FA 2I48A 5JEIA 2ZNSA 2KLFA 4RPOA 3G3KA 3CRBA 4LQ2A 3OMBA 5IKBA 1MXYA 3VV5A 4F1YA 4OEVA 4FECA 3IAZA 4F19A 2V3QA 3WAEA 3N6TA 4G68C 4G8MA 3C36A 2DQVA 1MQGA 4YZZA 2OBGA 2Q9TA 2VD2A 3MPKA 3PUYE 4NWCA 2YPNA 2W7YA 3MVZA 4WKMA 4L17A 2RC9A 2R71A 4OMBA 1FQDA 2E1SA 1MM7A 1NNTA 1R9QA 3HPIA 1EZOA 1AOVA 1PB9A 3IJXB 2RF1A 4KYSA 3CG3A 4I1DA 1B0LA 4QSCA 2VHAA 4EQBA 5LOMA 2Q89A 4GXSB 5AE4A 4OFLA 5HPQA 3TPAA 4OQOA 2Z22A 3H3GA 5H8HB 5AA3A 2I49A 4QF9A 1D9YA 3ONMA 2O84X 5I2KA 4KD5A 2R6GE 3KFMA 1N3XA 3S4UA 1FQFA 1MQIA 1LAGE 1AL3A 3DP4A 1LAFE 5KCJA 4KYEA 4P0IA 3MQ9A 3VFJA 1D4NA 3I5OA 3N94A 3LSLA 4NF8A 4IO4A 2DE2A 3EN3A 2FNCA 2OK2A 4RJZA 4ELRA 3M3KA 3VXBA 1OLCA 2WKYA 3CSBA 4JWYA 3OXNA 1IITA 1Z7ME 1MY1A 1IXHA 4LA9A 3I3VA 2V84A 3HV1A 3IB0A 2DE3A 3RTWB 4R6HA 4P0GA 3G3JA 3KOSA 2XXWA 1US5A 1SW4A 1OVBA 3FJMA 1SYIA 3U1OA 5FTHA 5DEXB 3O6GA 1N0TA 3TTLA 2PT2A 4UACA 5FTIA 4Z7EA 3TTKA 1FTLA 4C1UA 1P1NA 4KPTA 1B52A 4XKPA 5DVJA 3HSTA 3T9UA 4KFQA 3QIMA 3H06B 1MS7A 3MZBA 3W9WA 1YPNA 5DT6A 3TMGA 1FCKA 2YJPA 1EZPA 4OETA 4DIGA 3KBRA 3LC8A 2UVHA 1FW0A 3OELA 1MQDA 1EH3A 2IA4A 3EHUA 4QFOA 3G3FA 4GF8A 3O6IA 4GFRA 1Y4CA 3GBBA 3SEYA 1SI0A 2AYSA 1LGBC 3H4ZA 5A5XB 3MPLA 4UA8A 3DM0A 4QSEA 3FASA 4XXUA 3S2VA 1JEVA 3EF7A 3ILUB 3PPPA 2ONKE 5AA2B 3MUQA 2Y7WA 2REJA 3EHSA 3QUFA 3MP6A 3UP9A 1NH7A 2FYIA 5TPAA 5I58B 2F78A 5JTYA 3H6WA 2DXYA 3K1NA 3IOTA 1RYOA 3FXRA 3CSGA 4ZECA 4OFOA 1MDP1 3FIRA 4RXLA 2OLBA 5DVIA 4G68A 1CE2A 4F1VA 3RNNA 3UA8A 4G8NA 4EDPA 1FQBA 1SDXA 1B3GA 3IO4A 4DCXA 3Q28A 1B1XA 3SDFA 3BBRA 3TTMA 1S7YA 1OVTA 1WDNA 3PPOA 3H03A 1UTBB 2ONSA 1JW1A 4NTLA 4ZDMA 3FV1A 5AA4A 5HBCA 3IOVA 5KDTB 4ELQA 1US4A 3RLFE 1VFEA 5EHSA 3THIA 4ND9A 4YB6A 2ZMBA 2CZLA 1FQCA 1Z7NE 4LQ5A 3MW0A 5CMCA 1B4ZA 3MC2A 4MF3A 3CFXA 2XXVA 3VE1B 1XS5A 1JVXA 1OIBA 4ELOA 5I59B 1N84A 4ESWA 2XXTA 3PD8A 2P1SA 4FE8A 4JSOA 5F1QA 3BFUA 3SESA 4BDOA 1I69A 4DDDA 3PD9A 4KR5A 4DZ1A 3H6VA 4I62A 4TLLB 4QFKA 3JV9A 1D9VA 2O6AA 1B40A 1LFGA 4JWXA 1MDQA 2O7UA 5IAIA 1USYE 1N7WA 4MFIA 3TKDA 4NF5B 5ELVA 2RKMA 2GH9A 3S9LC 1QKBA 4Z0IA 2UXAA 1VR5A 3M8UA 2F8DA 5ITPA 4TLMB 1MXVA 3OEMA 4M1VA 4G8HA 3I6VA 4R6YA 4YB7A 3IK6B 3T22A 4XKRA 2AL5A 3K02A 1JEUA 3IR1A 3KSXA 4DCYA 2QS4A 2F6PA 2HAVA 2F97A 1M5BA 3TQWA 4ZZEA 1MXXA 5I57B 5H8QB 3DP8A 1IUDA 3TTNA 4DE8A 1MXZA 4U4SA 2B65A 3LUYA 4ESXA 4YICA 2UYFA 2NWJA 4EF1A 2H9BA 3UN6A 1UIUA 2GFEA 1P1WA 1PB8A 1A54A 2DSFA 2A5TB 5CI5A 2V3TA 4FORA 4ISUA 1Q35A 1MXUA 1MY2A 4LZ7A 1RKMA 4I8CA 1TFAA 4N6PA 4LUBA 3BKIB 3KEIA 3MAMA 1SVXB 1MG1A 1LFIA 2QMWA 3FD3A 4IO6A 3IB1A 1B7HA 3PPNA 1PEBA 4X1BA 1QJMA 3VXCA 2QS3A 3T96B 2BJJX 4ZE8A 4ZEIA 1FQEA 3V89B 4RA1A 5J1DA 2HZKA 4NE4A 2I6EA 4H0WA 1XHYA 1I6BA 1B3HA 1R6ZA 4F3GA 1M5FA 3FATA 4H1XA 2I4BA 1RYXA 1H44A 3ILTB 3CR9A 4GIZA 3K6WA 1O7TA 2DVZA 3K1MA 5H8SA 1P99A 4EUOA 1MPDA 2XXYA 2QRYA 1Y3QA 1XT8A 3SEWA 3O9PA 3VLUA 4BLAA 4XTCQ 4ZEKA 1URDA 4EXKA 2REGA 2Z8FA 3FVGA 3OD7A 3E9XA 3S9EA 3CFZA 2G29A 1Y1ZA 4GL0A 3K6UA 4IGRA 3H7MA 4RPNA 5EYFA 4NF4A 3H6UA 5I56A 3OENA 1MXWA 4R73A 2ZYOA 4N07A 4O3AA 4NF5A 2ZYNA 1B7UA 2V93A 1D3KA 4Q8RA 3PMVA 4LP2B 3TQLA 4NF6A 4GOTA 2QS1A 4FAJA 1Y9UA 1B3EA 3FVKA 4LVQA 4FATA 5DVFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZKLA 1A7LA 3CVGA 1Y20A 3K1PA 3WAFA 2Q88A 4MNCA 4N81A 2XXQA 3A29A 4R74A 4RK2A 4OA4A 1JNFA 4PE5B 3IL1B 1NV3A 4ZEFA 3T9HB 3D4CA 1PBPA 2GHAA 4K3FA 1SD3A 2DWIA 2DWJA 1UTHB 2XX7A 4BDLA 4H8IA 3FVNA 1LB9A 4OFJA 5BUUA 1ZU0A 1IEJA 1IIWA 1GGGA 1IXCA 1AIVA 1YAEA 1H43A 3VVEA 2QJEA 5ICTA 4LZ8A 4OXVA 5K2YA 3FVOA 4F31B 3CG1A 4N4UA 1SW1A 3OO6A 5EQAA 2R9JA 1IMFA 3IOWA 3PUXE 1XC1A 1SI1A 1HSJA 2CEYA 1B51A 1ZLQA 4R75A 3G3HA 1MRPA 1AH5A 2HPGA 3CFLA 4WEDA 1NNPA 5H8FA 4P11A 4HE0A 1P1QA 2M8CA 3PGFA 4XKQA 1LFHA 2PVUA 3KG2A 3U94A 4OVJA 4H65A 1DOTA 5EQ9A 4NMYA 2NUVA 4F22A 3LUZA 1ANFA 3IOUA 2XXIA 2ZYKA 1MY4A 4DXCA 4OVSA 1EZ9A 5CC2A 1B4HA 3HFUA 3Q26A 4UABA 4PFBA 5DYHA 1L5TA 1FQAA 2H25A 1URSA 3SEUA 5CMMA 3K01A 3PPQA 1QVSA 3GYYA 4U22A 4FIMA 1JW4A 4U21A 3V83A 3KN3A 2Z23A 1Y4TA 3TELA 2Q2CA 2XXUA 4PDHA 2GHBA 2X7QA 2WYKA 1MY0A 1NNFA 3KZGA 4F18A 3C32A 3B6QA 3Q27A 4M4GA 5CM6A 4PAKA 5M2VA 3T9VA 3E79A 2XXPA 5BWJA 3IO6A 2Y84A 2I4CA 1SW5A 4NGUA 3FZVA 2THIA 2ESNA 2DWHA 4DLDA 4NEDA 4HS7A 2YLNA 3KN8A 2D5WA 3PUVE 5LTCA 2ZZWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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