3CRBA

Crystal structure of the complex of c-lobe of lactoferrin with 2-chromenone at 2.6 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex of C-lobe of lactoferrin with 2-chromenone at 2.6 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2008-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3crbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3crbA02
3ONMA 4ESXA 4LQ2A 4TLMB 2F97A 5AE4A 2WKYA 5A5XB 2Q9TA 2HZKA 1EH3A 3IO4A 2HEUA 1P1UA 5I84A 3O2AA 1GV8A 4R2FA 4ZZEA 4U22A 3WAFA 2PBWA 3SESA 1IQ7A 2ZNTA 4G8NA 3U1OA 3H6TA 5AA4B 3TQWA 3CSGA 4OMBA 2ANJA 4G77A 1B3EA 1Y4CA 3FASA 3H3GA 1B6HA 4HS7A 3K4UA 4OEUA 1FQDA 4KYSA 4KD5A 1I69A 1SYHA 3FVOA 5CMMA 5DEXB 2DOJA 3OELA 3T22A 5B7DA 4EQ9A 3HCQA 2H25A 3UGWA 1B4ZA 2VHAA 1IITA 4FATA 3D4GA 3KFMA 3PUYE 1Y20A 4NF4A 4O3BA 4LZ5A 4I9DA 2RINA 3LBSA 5L8DA 4JB7A 1TFDA 3RGYA 5JK4A 3EPEA 2F6GA 3O6GA 1IEJA 3IB1A 1XOCA 4IGRA 3SEVA 3PPNA 3OMBA 3R6UA 4ZEIA 3DP4A 5H8QA 4ELOA 4FAJA 4NF5B 1PDAA 3TMGA 4U1OA 4UACA 4UA8A 3VE1B 1LCFA 1ATGA 2ALUA 3A09A 4YZZA 1PB7A 3ZSFA 4U4SA 3TDJA 3TYHA 2OCUA 1SI0A 4JWYA 1MPCA 3PMVA 2X7PA 3I5OA 4KI0E 2IA4A 2QMXA 4Q8RA 4F2QA 2ONKE 4NTLA 2ONSA 5H8FA 3USDA 3LSFB 4H6DA 5JTYB 3TKDA 3OSRA 5EHSA 4R73A 3OO8A 3OXNA 1A54A 3DP6A 3MC2A 3K6WA 2DS9A 3ECRA 2AIXA 4I62A 3HV1A 5BUUA 1N84A 1AIVA 3MJNA 3H6UA 4Q5TA 3O29A 4OVJA 2Y7PA 4ELQA 5DT6A 3E13X 3MVYA 1SW4A 4RXLA 1II5A 2FNCA 4H8JA 2XXPA 1NH7A 5I58A 3TQLA 4U2RA 1SW5A 2I4CA 2NOOA 3M3KA 4G2ZA 1MQDA 4POWA 2XHDA 5FHNA 2XXRA 2UVGA 4OQOA 2P2AA 3C36A 3A3CA 2O6AA 3VXBA 5M2VA 1JW1A 2RC8A 3N26A 4I8CA 3PPRA 4G68C 4IGTA 3MPLA 5IKBA 3CG3A 1MDQA 4QFOA 4YU0A 1M5FA 1QVSA 3KBRA 3MBPA 4KPTA 4IO5A 3TAJA 3QXMA 4YMBA 4DXUA 1QKAA 3PGFA 4KCDA 1MY4A 4IY5A 2XXWA 4GF8A 5I57A 2REJA 5HBCA 3M3LA 2DE3A 2X7QA 1XHYA 2XXYA 3FZVA 4F3BA 4NF8B 4ZE9A 3TTMA 4H65A 1OVBA 1Y9UA 3VVDA 2QS4A 1WODA 3FJMA 4EXKA 3IAZA 5I59B 1B3HA 1H3DA 1H43A 1B1HA 1A8EA 1Y3NA 4G68B 4F3SA 1XS5A 5FTHA 5ICTA 2QSXA 1BP5A 2OJTA 1SBPA 1UTHB 4WKMA 2NUVA 1ANFA 1LAHE 5I2KA 1IXCA 5ICQA 2VD3A 4X1DA 3HO7A 2Z23A 3IL1B 5KZTA 2V93A 1P99A 4QFKA 3E3KA 3PD9A 2GHBA 2XXVA 3JZJA 2XXHA 4GVOA 3CG1A 4OZ9A 4C1TA 4QFPA 3ILUB 3PPOA 3C4MA 1B40A 1DTGA 1SW1A 4JWXA 1FQCA 3FVNA 1A99A 3MPKA 2HXWA 3GXAA 4PFYA 2F36A 3ILTB 3K6UA 1Y1ZA 1VFEA 3HN0A 1RKMA 1HSJA 3KN8A 2Z22A 1S50A 1NNPA 2H5YA 1IXIA 1JEUA 3TTLA 1H76A 3UP9A 1H45A 2UXAA 4ZE8A 3MQ9A 2RCBA 3K1NA 3U92A 2H4IA 2F6PA 4OEVA 1XT8A 2DVZA 1I6AA 3C35A 3VV5A 4H8IA 3V83A 3K1MA 5I2NB 3KOTA 4O3CA 3UN6A 3T9UA 5CC2A 2ZNUA 1JEVA 2OZZA 4BDOA 3K00A 4F19A 1MQGA 3I3VA 3FIRA 3SEWA 3TFLA 3FGSA 1ZJLA 2H99A 4NMYA 2F7AA 5KDTB 2UYEA 2DWIA 3TCHA 3P7IA 3PMWA 3O97A 3Q27A 1URGA 1QULA 3IO6A 3Q29A 2AL5A 2VP1A 3K02A 3ODBA 3QUJA 4BDMA 1DOTA 1UQWA 1J1NA 1PC3A 4NF6A 2E1SA 4GXSB 3MAMA 3PUWE 2E0SA 3Q26A 1PB9A 4GRKA 3B6TA 5I56B 5AA3A 4ZEDA 2RC9A 2H9BA 3DM0A 1D3KA 4IO2A 3U72A 4LATA 2F7CA 4OENA 3E4RA 2DE4A 2NVUB 2DE2A 4G8HA 5J1DA 2REGA 4FEBA 4H0WA 4YKJA 4BDLA 5H8HB 4GL8A 2D5WA 3K6VA 1AOVA 4ZDMA 4HCWA 2ZYKA 4R9FA 3GZGA 5AA1A 3UORA 4F3GA 2I6EA 3ZS6A 3LUYA 3LSLA 5KCJA 3UK4A 4X9TA 2Q2AA 2I4BA 2O51A 3RTFB 1N7WA 1MY2A 2HZLA 4ONYA 4XTCQ 3ZKKA 1JNFA 1YAEA 4N13A 4OESA 4KCCA 3MP1A 3KSXA 5CI5A 1TWYA 1VR5A 3CIJA 4QFLA 1O64A 4F22A 4LQ5A 1EZ9A 1N76A 4GWOA 1AH5A 1B9JA 1D9VA 4RK9A 4JDFA 5ELVA 3GLBA 3G3KA 4YB7A 3RY3A 1B1XA 2ABHA 1GTKA 2HAUA 2ZYOA 4QRZA 1ZBMA 5FHOA 4YB6A 2I49A 1B5JA 4ND9A 3PUZE 5L9MA 2OLBA 3IB0A 4NF4B 1POY1 1OMPA 3FXQA 1GVCA 3G3JA 3MP6A 5DYHA 3QAXA 1DMBA 3S2VA 1LB9A 3MVXA 4KHZE 2Z8FA 3MW0A 4JSDA 4OERA 4IO7A 4H5GA 4MF3A 4O3AA 1B7UA 5H8QB 3SDFA 3G7WA 1IUDA 5ITPA 3K2DA 2Q2CA 1AMFA 1NMUA 4DCXA 3DLNA 2UYFA 1UIUA 3B7DA 4QSDA 1N3WA 3O6HA 4PFTA 2BJJX 1QUKA 1OLCA 4LP2B 1ZTYA 2ESNA 3SKPA 4F3PA 4H1XA 1B3FA 2HQ0A 3PPQA 3KOSA 1N04A 2QS2A 1FTJA 3MP8A 4EDPA 2AL4A 5H8FB 3TCGA 5H8SA 4Z0IA 4P11A 2Y7WA 5ITOA 4R2BA 1Q1KA 3QUFA 2V3TA 1VE4A 4FORA 2QRYA 4G4PA 1SYIA 3RQTA 3PUVE 3K01A 4F2OA 3R26A 1SW2A 1MDP1 5HM4B 3H6VA 5I58B 4RK2A 1VSOA 3EN3A 2ZXTA 3RT6B 1YTVA 3W9VA 3G3FA 4YKKA 2XXIA 1M5DA 4MFIA 3RUMA 1XVXA 1AL3A 1UIVA 2R71A 2VOZA 3TTKA 4FE8A 5K2XA 4DXCA 3TTNA 3F11A 4DDDA 1FQFA 3KSJA 5FHMA 1B52A 3CRBA 1LAGE 1MQHA 2XD3A 4KQPA 1OQGA 3RTWB 2YLNA 3B6QA 1ZMGA 3CVGA 1LFGA 5I57B 1MS7A 1P1NA 4F1VA 3EF7A 3T66A 3TCFA 4LZ7A 5DVJA 3IOUA 4XXUA 2O7UA 4GD5A 4U23A 4K3FA 4AB5A 3SEXA 2B3BA 1UTBA 3I6VA 1M5CA 2A5SA 3V8XB 2QS3A 5H8NA 4R6YA 3FV2A 4TQUQ 3TPAA 4R6KA 3S9LC 2ONRA 1MXYA 3SETA 5AA2A 2PT1A 1I6QA 2G93A 2B65A 3LR1A 2O1LA 4XIGQ 5I2KB 1PBPA 2CMOA 3KZGA 3O6IA 3U93A 4GIZA 1LLSA 3PU5A 1YPNA 2DWAA 2FYIA 4F18A 3T93B 4DE8A 3IORA 1IXHA 4XKNA 4E0XA 2UVIA 4FJPA 3IJXB 4NWDA 1DTZA 1OIBA 3K6XA 4C0RA 4IO4A 2Y84A 1A40A 3OEMA 4F1UA 2Y7IA 1PB8A 2I58A 5LOMA 1FTMA 2PT2A 4DIGA 2B3FA 3HSTA 3Q28A 1LAFE 3R7XA 3WAEA 4HCYA 4R9GA 5DVFA 1MQIA 4RNSA 3SEUA 3OEKA 1GR2A 1Z7NE 4PP0A 4LVQA 2ZNSA 4IB2A 4YKPA 4LA9A 3OENA 1IZ1A 1NNKA 4BDQA 3T96B 3KEIA 4R72A 2P1SA 1I6BA 4ZECA 1MXZA 1MY3A 4QFNA 3MWBA 2GRVA 1FCKA 2OWTA 1B05A 3FJGA 2G29A 3C9HA 4YICA 3IJOB 5EHMA 1ELJA 4NWCA 2F34A 3Q25A 3FATA 3IOVA 1HSLA 3FJ7A 4NE4A 4ELPA 3AXFA 1LB8A 4R74A 4IY6A 2Y7KA 5K2YA 1O7TA 1B58A 2A5TA 2UVJA 4P0IA 2HCAA 3N6UA 3VFJA 1D9YA 5TP9A 4OWDA 2OK2A 4NF6B 3FUZA 1LAXA 3MVWA 1R6ZA 4IO6A 1SDXA 4C1UA 1YCJA 3U8QA 2F35A 1QUIA 1URDA 2F78A 2XXTA 3RT8A 4JXIA 2QJEA 4OHNA 4GXAA 1MXXA 4DZ1A 4FIMA 2GFEA 1FQBA 4OTEA 4BDRA 1DPEA 1Z7ME 3HHFA 3TELA 2O69A 1Y4TA 5L9SA 2CZLA 1BLFA 5HPQA 1S9TA 2O7IA 4PETA 1EU8A 1JVYA 1Y3QA 4N07A 5F7VA 1OLAA 4HTGA 3GBBA 4WEDA 2UVHA 2AYSA 2V84A 3FVGA 1LSTA 1QJMA 3O9PA 5KCJB 2KLFA 4ISUA 1B0HA 4MLVA 1H44A 2V25A 3JYRA 1MQJA 1MM7A 3G3HA 5CBSA 3GBAA 3EQ1A 1NFTA 3W15C 1MPBA 1R1NA 1B7HA 2F5XA 3A3UA 1XC1A 4YB5A 3W9WA 4JWOA 5TPAA 1B46A 1L5TA 2LAOA 3FXUA 1XVYA 2I48A 3K0VA 3V5AA 1Y3PA 1MXWA 1CE2A 2NWJA 2YJPA 3LSXA 2HAVA 1MY1A 4QSCA 4RPNA 1BTJA 4OYVA 3KJTA 4OFLA 1IXGA 4JSOA 3MZ1A 3DELB 1TFAA 1HSEA 3EHSA 4OFJA 1FTKA 2R9JA 2OBGA 1WDNA 5A5XA 1Q35A 3RNNA 4EQ7A 1N3XA 4ZZAA 1S7YA 3ZKLA 4MBPA 2XX7A 4KYDA 1ZIUA 3T9XB 3VLVA 1A8FA 2I0CA 3MUQA 2XX9A 4H5FA 1NNFA 5IAIA 5AA4A 3QIMA 1P1WA 2DYXA 2Y7RA 4I1DA 1JW4A 2QMWA 4NEDA 5CMCA 2XX8A 5TU0A 3VDFA 2O84X 1B2HA 2DQVA 1BKAA 3G3IA 5DEXA 2THIA 1LBCA 3FXRA 1OVTA 1VFDA 3FV1A 4OFOA 1ZU0A 3QYTA 4AQ4A 1N0TA 3H6WA 2DP8A 1NKXA 1JVXA 1JQFA 4RY1A 1LFHA 4EUOA 4OETA 3C34A 5FTIA 2QL3A 1JETA 1NH8A 3PUXE 2I3VA 4MH5A 4L17A 3S4UA 4QSEA 3VLWA 3KG2A 3V89B 1F9BA 2M8CA 4GOTA 5B70A 3TTRA 4H67A 3RLFE 1Y1MA 4NF5A 2ZMBA 4Z7EA 3BKIB 4GQOA 3VVEA 2OWSA 1T0KA 5CBRA 5L9OA 2VD2A 3CFXA 3C33A 3CFZA 2QPQA 4F1YA 3N6TA 3G3GA 3UIFA 3VLUA 3EHTA 2P0SA 2DXYA 1POTA 4Q30B 3VVFA 4XKRA 5ISUA 2Z8DA 2RF1A 1NNTA 5JTYA 4RPOA 1P1QA 4QF9A 4HW8A 5BWJA 1ZLQA 4ZEBA 3IOWA 1FQAA 2Z8EA 3L6HA 2FA7A 2RCAA 3D4CA 3KN3A 3M3FA 3LSWA 1MPDA 3BFTA 4M1VA 1PBQA 2R6GE 3OSQA 4XKPA 1OQHA 3IX1A 4YMAA 3HHGA 4X1BA 4GFRA 3RPWA 5DVIA 4X48A 2PYYA 1MY0A 3M8UA 4E0WA 3O28A 3H06B 4QHQA 1DPPA 1UTBB 1NL5A 2YPNA 5H8NB 1LGBC 3UA8A 3VXCA 3HPIA 3L6GA 5AA2B 2Q88A 3OO6A 1US4A 4POXA 4OXVA 1QW0A 4RYAA 4ZS9A 1FTLA 3THIA 3MZBA 2GH9A 3K1PA 2DVCA 3U94A 1JW5A 1MH4A 1LCTA 1TT1A 4N6PA 4U4XA 3S9EA 3SEYA 3T9VA 1USYE 1MRPA 4F31B 2DWJA 5EYFA 2F8DA 4EQBA 1LBBA 2O68A 4BLAA 3S9MC 3KGCA 3PPPA 4U1ZA 1B3GA 2PMSA 1A7LA 4NF8A 1MXVA 1MM6A 4XKQA 1KWHA 3QSLA 2PVUA 1P1OA 1FW0A 3EHUA 5DTBA 5I59A 4EF1A 4FEDA 2VGQA 1LFIA 4G68A 4WEPA 5CMBA 4F39A 2W7YA 1UTHA 1GGGA 3O66A 2Q89A 5F1QA 3PD8A 2XXUA 2O1MA 3BFUA 1RYOA 3IK6B 4PE5B 2RC7A 1ZKBA 4R6HA 4THIA 1SVXB 1RYXA 1BIYA 1TXFA 1PEBA 4DLDA 4GLIA 5AA2D 3N5LA 4IO3A 3OO7A 3JV9A 3CSBA 4Q0CA 2PX1A 3FVKA 4GL0A 3OO9A 4JBZA 2H98A 3IR1A 4LZ8A 1MH3A 2DSFA 5CRYA 3LC8A 4LONB 4TOZA 2NXOA 4KR5A 3C32A 3PMXA 4P0GA 3N94A 4G8MA 1A55A 1USYH 2D3IA 2QS1A 3TZAA 2A5TB 4R75A 1B51A 2IEEA 1O63A 2V3QA 2Q8JA 5TP9B 4PFWA 1M5BA 1CB6A 3KN7A 1URSA 1MG1A 1FTOA 4ZEKA 4YKIA 2XXXA 5I2NA 1SD3A 1B32A 4DCYA 2ZYMA 3IB2A 5CMKA 3BBRA 3PV0E 1B4HA 2F7BA 1D4NA 1QKBA 3IOTA 2GHAA 4TLLB 3OD7A 4PQJA 4ECFA 4RA1A 2RKMA 2X26A 4BDNA 1N7XA 3C31A 2DWHA 1M5EA 4ESWA 2I0BA 3MZ9A 4ELRA 3TODA 3FD3A 2XXQA 5KDTA 1SI1A 3H7MA 4EXLA 4WXJA 2I3WA 3CFLA 4YAHX 1B0LA 3S9NC 3DP8A 1FQEA 3T9HB 4RJZA 4U21A 3B6WA 4ZEFA 1US5A 2V3UA 3QK6A 3H4ZA 4DXBA 1SQYA 1EZOA 4LUBA 4FECA 3CI8A 2HFBA 3CR9A 3KJ7A 4AB6A 5I56A 1IIWA 3SERA 1B5HA 1WVJA 3RN8A 1R9QA 2ZYNA 4PFUA 3E9XA 4M4GA 3MVZA 2DXRA 3TEPA 1B5IA 1MXUA 4EF2A 5TPAB 5H8HA 2XD2A 4F29A 4KYEA 3OOAA 1QUJA 1R9LA 4KFQA 5CM6A 1B7ZA 1DSNA 3H03A 2D21A 5JEIA 1EZPA 1B3LA 3TUSA 4MLQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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