3E13X

Iron reconstituted ferric binding protein from campylobacter jejuni
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
SELNIYSARHYNADFEIIKKFEEKTGIKVNHTQAKASELIKRLSLEGSNSPADIFITADISNLTEAKNLGLLSPVSSKYLEEFIPAHLRDKDKEWFAITKRARIIAYNKNTNIDISKMKNYEDLAKAEFKGEIVMRSATAPYSKTLLASIIANDGNKEAKAWAKGVLENLATNPKGGDRDQARQVFAGEAKFAVMNTYYIGLLKNSKNPKDVEVGNSLGIIFPNQDNRGTHINISGIAMTKSSKNQDAAKKFMEFMLSPEIQKILTDSNYEFPIRNDVELSQTVKDFGTFKEDQIPVSKIAENIKEAVKIYDEVGFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Small hinge motion by the anion-independent ferric binding protein from Campylobacter jejuni
rcsb
molecule keywords Putative iron-uptake ABC transport system,periplasmic iron-b
molecule tags Metal binding protein
source organism Campylobacter jejuni
total genus 122
structure length 317
sequence length 317
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e13X01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e13X02
4KCCA 4F1UA 1WDNA 1ZKBA 2QS3A 4QHQA 3PUWE 4QFNA 1US4A 5ELVA 3TCGA 2Q89A 3N5LA 3SEWA 4JWOA 3LC8A 2O7UA 4LZ5A 2F35A 2O84X 5I58B 4O3CA 3VDFA 1A99A 2V93A 4N07A 4U21A 2XXQA 1GR2A 3FZVA 5B7DA 4H6DA 3OENA 4DZ1A 4XXUA 1B3EA 5M2VA 2FA7A 5H8HB 3IORA 4JSDA 4POWA 3KSJA 1UTHB 1USYH 1LCTA 1P1QA 1PB7A 3OO6A 4YB5A 4BLAA 3RUMA 4U23A 1H43A 1LAXA 3SDFA 4C1TA 4NF6A 2Z8DA 2XXXA 1AIVA 1GTKA 3MVXA 3DP4A 3ZSFA 3H4ZA 3O29A 3FVOA 1GVCA 5A5XA 4XIGQ 1Y4CA 3PUXE 1IQ7A 1S7YA 2QJEA 4UACA 2UVJA 5HBCA 5FHMA 2GRVA 4ELQA 3FVKA 4KPTA 3MWBA 4F39A 4X9TA 1AOVA 4GVOA 5CMCA 5JTYA 3A09A 3GZGA 3DP6A 1QUKA 4XKNA 3KGCA 1B3FA 3H6UA 2P2AA 5HPQA 1MXZA 1LAGE 4GXSB 2VD3A 2DOJA 5FHOA 4H8JA 3ZKLA 1LB8A 2FYIA 5AA2D 4BDLA 1FTMA 4G8NA 4I9DA 4JWYA 3IOVA 1B05A 3FVGA 5B70A 2UVIA 1UQWA 1FW0A 3KSXA 3HCQA 5I59A 2PX1A 2H5YA 4LZ8A 1Z7ME 2Q8JA 2GH9A 1M5DA 1SW5A 3CFZA 1D3KA 1QVSA 3IB1A 5I84A 1I6QA 1SW1A 2I3WA 3IOWA 1A55A 4M4GA 1VE4A 1JQFA 2PYYA 1NNTA 3RLFE 3LR1A 2REJA 1I6BA 3M3FA 4DCYA 3IJOB 4H1XA 4G4PA 2XXUA 2F78A 3K1MA 3FGSA 3TELA 3SESA 1B1HA 3RY3A 3RQTA 1RYOA 1P1OA 1B5HA 4F18A 3TTMA 3VXCA 1EZ9A 4FIMA 4LATA 1LGBC 2Y7KA 1LSTA 4DDDA 2G29A 1DPEA 2A5TA 4MLQA 4LQ5A 3TDJA 2AIXA 3RN8A 4BDRA 1D4NA 4H5FA 3SEYA 5H8NB 4DCXA 3IK6B 5CM6A 5IAIA 2CZLA 4RPNA 1MQJA 4LVQA 3C33A 2WKYA 3RT8A 3E13X 2YPNA 3ODBA 2XD2A 3RNNA 3VVEA 1OLAA 5KZTA 4YKPA 4F1YA 2Y84A 3V89B 1MQDA 2DXYA 1HSLA 4RNSA 3VFJA 5CBSA 4FATA 4KYSA 1OQGA 2E0SA 5DYHA 4EXLA 2DWIA 1YPNA 1SYHA 4YAHX 1MM7A 2VP1A 4GL8A 3H7MA 4G77A 4ZS9A 1XC1A 1Z7NE 1NH8A 1N7WA 1TT1A 3T9XB 1B58A 4PE5B 2XX8A 1Y4TA 4LQ2A 3RTWB 2LAOA 4R9GA 1SD3A 4DXBA 4MF3A 4QRZA 3LSLA 2DVCA 5EYFA 4EF1A 2Z8EA 3MP1A 4R6KA 5JEIA 3P7IA 1B3HA 3PGFA 2NXOA 1VFEA 3IR1A 3SETA 4BDQA 3RTFB 1MH4A 4ZEIA 3IAZA 2Q2CA 4TLMB 1PC3A 3N26A 5I56B 1XS5A 4PQJA 3MPKA 3IOTA 4AB6A 3T9HB 2PT2A 4H0WA 3CSBA 1MXXA 5FHNA 5ISUA 1USYE 5AA2A 4NMYA 1FQDA 5F1QA 3C9HA 1WODA 1MDQA 4OYVA 1MXVA 1B40A 1VSOA 1P1WA 5TU0A 4ZECA 4YKJA 5KDTB 5I2KB 4ELRA 1LB9A 3A3CA 1WVJA 2R6GE 4YKKA 1MS7A 3M8UA 2QMWA 5KCJB 3G3IA 3VLVA 4KQPA 1DPPA 1EH3A 4K3FA 1QUIA 2I6EA 1BLFA 1MG1A 4FEBA 2Y7WA 4ECFA 4BDOA 4ISUA 3OMBA 3HHFA 3O6IA 3O66A 4RA1A 3B6WA 5DVIA 2QS2A 3MC2A 4NF4A 4UA8A 1BTJA 2I4CA 5I56A 4U1ZA 2OWSA 3FJMA 3CSGA 3G3JA 4IGRA 4ND9A 3TTKA 4H67A 2O6AA 1MH3A 1B4HA 3ONMA 2ZYKA 4I1DA 4JDFA 3KJTA 2Q2AA 3IO6A 1Y20A 5AA4A 3U94A 4F2QA 1H3DA 5BWJA 3TQWA 4U4XA 1M5EA 4NF6B 2REGA 2H98A 1XOCA 3RPWA 1NNPA 2RCAA 4EUOA 4WKMA 2Z22A 4F3BA 2GHAA 2QS4A 1B52A 2XD3A 4QFOA 3IO4A 5KCJA 2XXPA 5J1DA 1OIBA 4F22A 2V3UA 3PUYE 3Q28A 2IEEA 4G2ZA 3GLBA 5A5XB 3MAMA 3BBRA 1UTBB 2UYFA 2ZYOA 4HS7A 3GXAA 3VLWA 4AQ4A 4R74A 4R6HA 1LAFE 1NKXA 3TCFA 3C4MA 1N04A 1B9JA 3ECRA 3QUJA 3KN8A 4HW8A 3TZAA 2OK2A 5JTYB 5I2NB 5CI5A 3K6XA 3KN7A 4GD5A 1O7TA 4OETA 5ITPA 4P0GA 5IKBA 1EZOA 3A3UA 1VFDA 1S50A 2W7YA 1KWHA 4XKQA 1DTZA 2QPQA 2NWJA 1I6AA 1NFTA 4R75A 1TFDA 3IL1B 1B2HA 3MVYA 2F7BA 4ELOA 3S9LC 3UP9A 4DE8A 1MM6A 4YB7A 3M3LA 5L9MA 5I59B 4EQBA 4C1UA 4R9FA 4IGTA 4E0XA 4XKRA 2UYEA 1N3XA 5L9OA 2F7CA 3O28A 5I57A 4GXAA 1QUJA 1MQHA 4X48A 5DVFA 2I0CA 2QSXA 1P99A 2ABHA 3OD7A 1R9LA 1UTBA 1LAHE 1JEVA 2DWAA 3OO9A 4QF9A 1LFGA 3OO8A 1MPDA 1B51A 2OCUA 3ZKKA 1SW4A 3LSXA 4F31B 4IY5A 4ZEFA 4TQUQ 5H8QA 4R2FA 2UVGA 3H3GA 4P0IA 5FTIA 3PUZE 1Q35A 3K2DA 5I2NA 3N6UA 2O7IA 4FE8A 4I8CA 5L8DA 3OSQA 1FTKA 1NNFA 3SKPA 3TPAA 1IXCA 2GHBA 3KN3A 1Y3PA 2AYSA 3B6QA 4GL0A 3WAFA 4Q8RA 1B0LA 3FASA 2F97A 2A5TB 1SQYA 4F3PA 5ICTA 5L9SA 1M5CA 1NL5A 1SBPA 2HCAA 2NVUB 1H44A 4GOTA 2Y7IA 3EQ1A 4R6YA 3H6VA 3FD3A 5LOMA 3TTNA 2X26A 2I0BA 4OEUA 3PPRA 2O51A 3DM0A 1BP5A 1SI0A 1A8EA 3JV9A 1FQFA 4H8IA 3K1NA 4OVJA 3I6VA 4QFKA 3DP8A 3HV1A 3EHUA 4F3SA 1YAEA 2HZLA 1O63A 2I48A 2IA4A 3MVWA 3PPQA 3U8QA 2XXRA 2Y7PA 4DXUA 3QIMA 3F11A 3KOTA 4DIGA 3S9NC 1MXWA 4IO4A 3BKIB 4KYDA 1D9YA 3HSTA 1FTLA 3CG3A 5ITOA 3S2VA 2DXRA 4POXA 2ESNA 2R71A 3FXQA 2M8CA 1P1NA 1A8FA 1MY2A 1P1UA 3QYTA 2UVHA 4QSDA 2VHAA 4ZEBA 2RINA 2RKMA 4G68A 3G3GA 4GF8A 5BUUA 4PETA 4F1VA 4G8MA 4ZEDA 2ONSA 2UXAA 3CVGA 2F6GA 3H6WA 1M5FA 2Y7RA 4AB5A 3CIJA 2F6PA 3KG2A 5ICQA 2XXTA 4JBZA 1ZMGA 2I3VA 3FXRA 1Y9UA 4U4SA 1FQBA 3MZBA 5DEXA 4PFWA 3T93B 1AMFA 4PFYA 3BFUA 4L17A 3K02A 4U22A 2P1SA 1ATGA 1PB9A 4O3AA 1AL3A 2ZNSA 3C32A 1QKBA 3FV1A 3MPLA 1Y3NA 3PPNA 3HN0A 5CMMA 4RK9A 3K6UA 5AA2B 2V3QA 4R73A 4EF2A 1Y1ZA 2VOZA 1GV8A 3TUSA 4OENA 4F19A 1II5A 3D4CA 1QJMA 2BJJX 3PMVA 4LZ7A 2XXWA 3BFTA 4C0RA 4KR5A 4WXJA 3SERA 3VVDA 4FORA 4F3GA 3HO7A 3FJGA 3CR9A 1N84A 4QFPA 4RK2A 2PBWA 4ZZAA 1MQIA 2YJPA 3V8XB 1PB8A 3C35A 1LCFA 4LUBA 1N7XA 1MY4A 5AA1A 4Q30B 4NWDA 2PVUA 1B1XA 2X7PA 2X7QA 3TTRA 1ZLQA 3OO7A 1AH5A 4NF4B 3K6WA 4IO5A 1PEBA 3IJXB 1IITA 2G93A 4EXKA 2PT1A 3TYHA 4Q5TA 3K6VA 4FAJA 2NOOA 3KOSA 4PFUA 3Q26A 1LBBA 3USDA 4OTEA 2DVZA 2QRYA 5AA4B 1YCJA 4MLVA 3FV2A 5CC2A 2XXIA 3W9VA 2H25A 3OXNA 3HHGA 3PD8A 4GQOA 2ONKE 2AL4A 2F8DA 2Z8FA 1NH7A 4OFOA 2DE3A 3OELA 1LFHA 3M3KA 3O6GA 3CG1A 2DS9A 3MBPA 3OEKA 4Z7EA 1JETA 4LP2B 1DOTA 1J1NA 1I69A 4KHZE 4ZZEA 4JXIA 5HM4B 2I58A 4IO2A 3B6TA 3L6HA 1T0KA 3H6TA 1XVYA 2Z23A 1IUDA 3G3HA 3TAJA 3U92A 3R6UA 1SYIA 2HAUA 4OESA 2RC8A 5CRYA 1A7LA 4TOZA 5CMKA 3FIRA 4O3BA 3OSRA 4MBPA 3MQ9A 1XHYA 1B6HA 3E9XA 3FATA 2ZMBA 1YTVA 4OMBA 3G3FA 4HCWA 1IZ1A 2I49A 3K0VA 4NF5A 4IO6A 3GBBA 5TPAA 3SEXA 4KI0E 3EHTA 3LBSA 3ILUB 3DLNA 3MJNA 4TLLB 4QFLA 4ZEKA 3EF7A 3HPIA 1OMPA 4YKIA 1LFIA 1UIUA 1HSEA 3KFMA 3EN3A 3TFLA 3U1OA 3MW0A 5I57B 3K00A 4DXCA 4LA9A 4Q0CA 4OFLA 5H8SA 1R9QA 2DQVA 4RPOA 1IXHA 2F34A 1BKAA 3TMGA 4HTGA 2H9BA 1URGA 1XVXA 2O68A 3H06B 2NUVA 2P0SA 3B7DA 1EU8A 3UA8A 5H8QB 2O1LA 3CRBA 3K1PA 1S9TA 5TP9A 3IX1A 3PMWA 2B3FA 4YU0A 4FJPA 4RY1A 3MVZA 1MPCA 1D9VA 1CB6A 2DWHA 4P11A 2YLNA 4QSEA 1LBCA 2DE4A 3FJ7A 4KCDA 2OBGA 5EHSA 1FQCA 3S9EA 2HXWA 4ZE9A 4PFTA 4GWOA 1B7UA 1XT8A 2GFEA 2V3TA 1JVXA 3H03A 1MY1A 1M5BA 1MDP1 1URDA 3LSFB 4F2OA 3T9UA 2CMOA 3RT6B 5EHMA 1B0HA 3PPOA 4BDNA 4OERA 4GFRA 4GIZA 1POY1 3T9VA 1CE2A 4N6PA 1JW5A 1F9BA 2THIA 3QUFA 1B5IA 2HEUA 2XX7A 1ZU0A 4KYEA 1ZTYA 2ALUA 3KZGA 1B3GA 4U2RA 3I3VA 3PU5A 3C36A 3LUYA 1RKMA 1JEUA 3TEPA 1MY0A 4NE4A 3N6TA 2FNCA 3FXUA 4QSCA 4YICA 5DVJA 5I58A 1NMUA 2ZYNA 3GBAA 4EDPA 5CBRA 4JWXA 4R72A 3U93A 1TFAA 2B65A 3QK6A 4RJZA 5JK4A 1MXYA 4X1DA 1QKAA 5H8HA 1RYXA 3LSWA 1FCKA 4G68B 2Q88A 1PBPA 1UTHA 1OLCA 3V83A 2VGQA 1SI1A 4OQOA 1ZBMA 2F7AA 2H99A 4KD5A 1B5JA 3VXBA 3MP6A 5FTHA 1MY3A 3QAXA 3PV0E 1URSA 5K2YA 5DEXB 3IB0A 4RXLA 3T22A 3TTLA 3N94A 1TWYA 1FTJA 3SEVA 2XHDA 3EHSA 1H76A 4EQ7A 4H65A 1IXIA 3TODA 4IO3A 2VD2A 3VLUA 2F36A 1MQGA 4ONYA 3R7XA 2Q9TA 3JZJA 4NTLA 3UIFA 5H8FB 2QMXA 2ZXTA 1MPBA 2DP8A 3O6HA 4OHNA 3W15C 2HQ0A 3PMXA 2B3BA 1O64A 2QL3A 3DELB 4OZ9A 4G8HA 3CFLA 4YZZA 1GGGA 1N0TA 2R9JA 4LONB 3VVFA 4GLIA 3E4RA 3I5OA 1MXUA 1ZIUA 1DTGA 3AXFA 2XXVA 2OLBA 1JNFA 3G3KA 3QXMA 1JW1A 4JSOA 4XTCQ 5DTBA 2RCBA 1JVYA 4XKPA 1B7HA 3CFXA 1SW2A 2ONRA 3EPEA 3MZ1A 3K01A 5CMBA 4OWDA 4G68C 4FEDA 3R26A 4X1BA 1L5TA 3PD9A 3C31A 2RC9A 3CI8A 3KBRA 2V84A 1Q1KA 2HZKA 1ZJLA 2O69A 3VV5A 1US5A 3S4UA 1PBQA 4THIA 1JW4A 1FTOA 3QSLA 3ILTB 1POTA 4BDMA 2H4IA 3FVNA 1B7ZA 4YMAA 4WEPA 5AA3A 5H8FA 3UORA 3UN6A 1B3LA 4IY6A 3PPPA 2ZYMA 4Z0IA 3PUVE 2E1SA 3G7WA 1DMBA 5K2XA 3Q27A 2HAVA 2F5XA 3JYRA 1OVTA 3IOUA 3W9WA 3FUZA 3OOAA 4ZDMA 4ESWA 4F29A 2PMSA 3D4GA 4JB7A 1QULA 2D21A 1VR5A 2ZNTA 4NWCA 2RF1A 4MH5A 4R2BA 4IB2A 5H8NA 1UIVA 4OFJA 3THIA 2DE2A 2OJTA 1IXGA 2HFBA 3KJ7A 4NEDA 2DWJA 1A54A 2DSFA 1DSNA 3OEMA 2ANJA 3ZS6A 4NF5B 5TPAB 2XX9A 2XXYA 4GRKA 4PP0A 4MFIA 1ANFA 3K4UA 3SEUA 4KFQA 1NNKA 3IB2A 1B32A 2AL5A 3MP8A 1FQEA 1HSJA 1OVBA 3MUQA 3TCHA 4NF8B 3C34A 2XXHA 1OQHA 3UK4A 2ZNUA 1SVXB 1A40A 3MZ9A 2O1MA 3UGWA 2OZZA 4HCYA 2D3IA 3Q29A 2A5SA 1R6ZA 2RC7A 2V25A 4DLDA 1Y3QA 1Y1MA 3O2AA 1B46A 4U1OA 1FQAA 4FECA 2D5WA 5TP9B 3U72A 4YMBA 3KEIA 1EZPA 4ESXA 3O9PA 1ELJA 4ELPA 1IEJA 3Q25A 4ZE8A 1QW0A 5DT6A 2OWTA 3T96B 1H45A 3VE1B 1SDXA 4H5GA 1N76A 1BIYA 4M1VA 1N3WA 3TQLA 4OXVA 4N13A 3TKDA 4OEVA 3RGYA 2KLFA 4I62A 5F7VA 2QS1A 3L6GA 1TXFA 4IO7A 4RYAA 1R1NA 4NF8A 3T66A 3O97A 1LLSA 2DYXA 5KDTA 3WAEA 4EQ9A 3S9MC 5I2KA 4E0WA 4WEDA 5AE4A 4YB6A 2I4BA 1B4ZA 1IIWA 1MRPA 3V5AA 1PDAA 3E3KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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