3E9XA

Crystal structure of the complex of c-lobe of lactoferrin with nimesulide at 2.7 a resolution
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of the Complex of C-lobe of Lactoferrin with Nimesulide at 2.7 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin'
molecule tags Metal binding protein
total genus 110
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2008-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e9xA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e9xA02
1MY4A 2REGA 4P0GA 1LCFA 2ONKE 1B7ZA 4N13A 4KYSA 5CMKA 1PBQA 4E0XA 2GHBA 3RGYA 1MXYA 3T96B 1ZMGA 1NNPA 2DVZA 4XKNA 3IOVA 4YKJA 3H7MA 4MFIA 4M1VA 4H5GA 4XTCQ 4Q8RA 2YJPA 3MVXA 4ZE9A 1JW1A 5A5XA 2YPNA 2HAUA 3TCFA 4G8MA 3IORA 4G68A 3VVFA 1JEUA 2F6PA 4G77A 1N0TA 2UVGA 4QF9A 3FVGA 3ZKLA 2P1SA 4GLIA 3FV1A 4U1ZA 4IO5A 3O66A 4GL8A 2HFBA 2RKMA 2HCAA 3VV5A 3ONMA 3BKIB 4BDRA 2RF1A 4GIZA 2RCAA 4E0WA 3PUWE 2DS9A 2Y7KA 1GVCA 4N6PA 5CRYA 2QS4A 3CR9A 3PPPA 5HPQA 4O3CA 1N84A 2QPQA 3T9HB 3MC2A 2Y84A 5ELVA 4ZZAA 3IJOB 4IY5A 3H06B 3CG3A 4RNSA 5TU0A 1FTKA 2D3IA 4GD5A 3VFJA 3K0VA 4GWOA 1SW2A 4NF8B 5DYHA 2DE3A 4HCYA 3N94A 4Z7EA 2QMXA 2DP8A 1AL3A 1H43A 4ZDMA 2Y7IA 4YKIA 1DSNA 4BDQA 1SQYA 1SD3A 3FVKA 5AA4A 4LATA 3MWBA 4TLLB 2ZXTA 4ND9A 3RUMA 2I58A 2RC8A 3KBRA 5CMMA 2DE4A 1QJMA 3IB2A 3SDFA 2F97A 3K1PA 2A5TB 4NE4A 3S9NC 4BDNA 4POWA 2B3BA 1NKXA 4C0RA 1QVSA 3OXNA 1FQEA 1XVYA 3H6VA 4R75A 1B3EA 1SVXB 3LBSA 4KFQA 4OTEA 2QS3A 2F6GA 4YMBA 1R6ZA 2R71A 4UACA 3IOWA 3LUYA 4ZZEA 4HW8A 3OD7A 2Q2CA 4OVJA 2XD2A 3KFMA 4F29A 4ZEDA 3KN8A 1PBPA 3PUVE 1B1XA 1B0LA 4NF4B 1LAHE 2DYXA 5K2XA 3IL1B 3IAZA 5I59B 4DCYA 5DEXB 2UVIA 2X7QA 3SEXA 4QSCA 4YZZA 5KDTA 4ZEIA 4H65A 2V3TA 4P0IA 3FXQA 4Q0CA 5DTBA 3USDA 3HSTA 3R6UA 3MAMA 1ZTYA 1SBPA 5CMBA 4POXA 2Q2AA 5FTIA 1B0HA 3U93A 1T0KA 1FCKA 2ZYOA 1OMPA 2H4IA 3FXRA 1MY3A 3AXFA 1OLCA 4NEDA 3CIJA 4GXAA 2PX1A 3R26A 4RPNA 3QYTA 4KHZE 3I3VA 1AIVA 3C36A 2ANJA 5BUUA 4THIA 3MZBA 3U72A 4PFYA 2GH9A 3EHUA 2F36A 3B6TA 4U21A 1O7TA 4WEDA 1N76A 5IAIA 5KCJB 3OSRA 4JDFA 2DWHA 1D3KA 2F7CA 4R73A 4ESWA 2G29A 2XD3A 1Y20A 3S4UA 1IXIA 1R9QA 2R9JA 1UTHB 1KWHA 4ELQA 4DE8A 4DCXA 1RYXA 2DSFA 3PUZE 1IXCA 3OO6A 3JV9A 3PPOA 4AQ4A 3IOUA 3P7IA 1MH3A 4OYVA 1MY2A 4NMYA 4KI0E 4BDMA 4KYDA 3S2VA 1N3WA 3MPKA 5TPAB 1ANFA 3BFTA 3C4MA 3U1OA 4EQBA 3MJNA 4AB6A 1XVXA 2OWSA 1NNKA 5HM4B 5I59A 2E1SA 3M3FA 4MF3A 3MVYA 4R2FA 1IZ1A 3TQWA 2VD3A 1MY1A 4LONB 2XX9A 1MS7A 3TTKA 3W9WA 1ELJA 4OENA 3BBRA 3OO8A 3T22A 3EPEA 3KOTA 1J1NA 3MVWA 4U1OA 4Z0IA 3VLUA 2VOZA 1NFTA 4OXVA 3QUFA 3HO7A 2I4CA 2ZNUA 2Y7PA 3K6WA 1B4HA 1SW1A 1B6HA 1B5HA 3TELA 5FTHA 1LB8A 1URDA 1I6QA 2XXPA 4YKKA 3H6UA 1MXZA 2E0SA 3ODBA 5JTYB 5A5XB 3L6GA 3TMGA 3O2AA 4YB7A 3ZKKA 2O7IA 4G8NA 5H8HA 1MG1A 1MM6A 5KCJA 2DWIA 4Q30B 2XXHA 2XX8A 3H03A 3TKDA 1MXUA 3HCQA 3S9LC 3KG2A 2RC9A 3IJXB 3UORA 1JQFA 1B32A 1BIYA 1B5JA 1UTHA 2R6GE 2NXOA 4I1DA 3A09A 1B4ZA 4QSEA 4DLDA 4DDDA 1TT1A 1VSOA 3F11A 3IR1A 4IO7A 2HXWA 5CM6A 4KYEA 1FW0A 1WDNA 3C9HA 3OEKA 3SESA 4JB7A 4ZEKA 4YB6A 3K6XA 3SERA 3G3HA 2F8DA 2F5XA 4K3FA 2QJEA 3Q25A 5ITPA 1XOCA 3V83A 4NWCA 4F22A 3LSLA 3RTFB 3CFZA 3K1NA 3G3IA 3B7DA 1O64A 1DPEA 3KZGA 5I58A 1Y4TA 3C32A 5CBRA 2ZNSA 4WEPA 4YICA 3PPQA 3FV2A 4U4SA 3UGWA 3V5AA 3E4RA 1PB7A 3IK6B 3O97A 1B2HA 1IXHA 3IB0A 1USYH 3OOAA 5M2VA 4JXIA 4KCCA 1VFDA 4ESXA 4JSDA 5L8DA 3TUSA 3RNNA 1NNFA 3KEIA 1ZIUA 2REJA 1LGBC 1H44A 4QSDA 4ISUA 2QS2A 1MH4A 1A8FA 3UK4A 4GRKA 2GHAA 1XHYA 4YMAA 5JTYA 2X26A 3PU5A 3FASA 2NWJA 4R2BA 4H5FA 1FTMA 1TWYA 1FQDA 3PPNA 4R6YA 1PB9A 3MZ9A 3TFLA 3K2DA 3TAJA 2OJTA 1A7LA 1LSTA 1USYE 4ZEFA 1S9TA 1DMBA 4MH5A 2RC7A 3TTRA 1O63A 4OESA 4AB5A 3MW0A 1IEJA 1QUJA 1EZOA 3IOTA 1ATGA 5KDTB 4RK2A 1MQDA 4UA8A 2V84A 3GXAA 3E3KA 3CSGA 4IO3A 2I0BA 4IY6A 3VE1B 3PD8A 4QFOA 3RY3A 4IO2A 1F9BA 5EHSA 5AA2B 3O29A 4MLVA 4JWYA 4GL0A 3IX1A 2O1LA 3O9PA 4DXUA 1URGA 3TYHA 1MDQA 2QS1A 4NTLA 4LUBA 1DOTA 4BDLA 3A3CA 1ZJLA 2OZZA 2THIA 3E13X 3SKPA 1LFGA 4F19A 4IGTA 4IO6A 2DOJA 4QHQA 5I57A 3T9UA 1Y1ZA 2XXRA 1A54A 3C33A 3G3JA 3SEYA 3U92A 2DQVA 3OO7A 1M5CA 2ZYKA 1N7WA 2QSXA 3KN3A 1LB9A 2WKYA 4ZE8A 2QRYA 2P2AA 4DIGA 4GQOA 2V3QA 3EHSA 5EHMA 4YKPA 3FD3A 5TP9A 1MXWA 2AYSA 3QUJA 4WKMA 1B7HA 4LP2B 5H8NA 1PDAA 3FJMA 2DE2A 2OBGA 2Q8JA 3T9XB 3BFUA 3N26A 4ZS9A 4FECA 4OEVA 3OMBA 2ESNA 1JEVA 2IA4A 2O51A 3VLVA 3PMWA 3T93B 1JVXA 1LBBA 1B40A 1HSJA 3HN0A 2GRVA 4DXCA 4XKRA 4FATA 5I2KA 3ECRA 1CB6A 3RQTA 1LCTA 2CZLA 2I4BA 3Q27A 2NVUB 1Z7NE 3H6WA 3DLNA 1B3LA 4U4XA 5AA2A 2OCUA 4GFRA 4G4PA 4YB5A 4X9TA 4KR5A 3PGFA 1VE4A 2VHAA 2H99A 1NNTA 3R7XA 4LQ2A 1YTVA 1L5TA 2NUVA 1S7YA 1UIVA 2RCBA 3Q28A 3KJTA 1MXXA 3LR1A 3FUZA 1LAGE 1HSEA 4IO4A 3CRBA 2HZKA 2DXYA 4FEDA 5CI5A 4F3GA 5IKBA 5H8HB 1GTKA 1DTGA 4HTGA 3CVGA 4EDPA 4OFJA 2OLBA 3G7WA 3M3KA 3D4GA 5AA2D 1VR5A 4I9DA 1MPDA 3H6TA 5I56A 1GR2A 1OVBA 4ELRA 4IB2A 4OETA 2CMOA 2ZYMA 3KSXA 4BLAA 3KOSA 2H98A 4JWXA 1SYHA 4OQOA 3V89B 3Q26A 2D21A 3H4ZA 1QKAA 4FJPA 4OWDA 1WVJA 2YLNA 1MDP1 1PC3A 4PQJA 2FYIA 2ONSA 3E9XA 4ELOA 3K02A 3EQ1A 4HS7A 2I3WA 3RPWA 1SI0A 5I58B 1UQWA 3GBAA 4GF8A 1P1NA 2QMWA 4U22A 2Z23A 1II5A 1B5IA 3M3LA 4H6DA 5L9OA 2QL3A 5LOMA 2VP1A 1MQJA 1PB8A 3IO6A 3QXMA 5CBSA 2Q88A 3K1MA 2PYYA 4H67A 5JK4A 3OENA 2ABHA 2F7BA 2O69A 1M5DA 1DTZA 2XXVA 3LSWA 3GBBA 3KJ7A 4H8JA 2KLFA 5AA1A 1EH3A 2F35A 2DVCA 2B3FA 2Y7RA 3PMVA 1UTBB 3PUXE 4BDOA 4ZECA 5AA3A 5ICQA 3VDFA 1SDXA 3MP8A 4TOZA 5DVJA 2Q9TA 1BLFA 2Z8EA 4R6KA 2PT1A 4ZEBA 2HZLA 4LQ5A 3K4UA 1FTOA 1P99A 3GZGA 2PMSA 3UN6A 2V25A 2XXXA 5ITOA 1Z7ME 3PUYE 4YU0A 3TPAA 4EXLA 5DVFA 4PFTA 5I2NA 4JSOA 4KPTA 4OHNA 4IGRA 1ZU0A 4PE5B 4I62A 4X1DA 2XXWA 3T9VA 3TODA 3VVEA 3VXCA 5AE4A 3PMXA 4DXBA 1M5FA 5FHOA 3G3GA 4F3SA 2PBWA 3RN8A 3UIFA 4WXJA 1XC1A 1MQHA 1FQAA 4N07A 4O3BA 1SW4A 4F2OA 4FEBA 1EZ9A 3WAEA 1YAEA 1N04A 1IUDA 3UP9A 4R9FA 3O28A 1Y1MA 3DP6A 4NF6A 4M4GA 5I57B 5I84A 2OK2A 1M5BA 3CSBA 3O6HA 3K00A 4EXKA 2XXYA 1MPCA 2V3UA 4KD5A 4EF2A 4NWDA 2V93A 1OIBA 1UTBA 2UXAA 1B3FA 1MXVA 2I3VA 3OEMA 3V8XB 5CMCA 5F1QA 5TP9B 4U2RA 3CFXA 3THIA 4TQUQ 5H8NB 1H45A 1B9JA 2B65A 1N7XA 4PFUA 4QFKA 4ELPA 1A99A 4FAJA 1D9YA 1FTJA 3DP8A 2AL4A 1LAXA 1QULA 2LAOA 3W15C 4EUOA 1H3DA 4GOTA 2FNCA 3ILTB 1MQGA 2ONRA 3I6VA 1ZLQA 4H0WA 3TTNA 5L9MA 2Z8FA 1SI1A 4C1UA 4P11A 5I2KB 1M5EA 3FZVA 1MRPA 1YCJA 4JBZA 3W9VA 2ZYNA 3VVDA 2F78A 1US4A 3S9MC 2PT2A 1LBCA 4EF1A 3VLWA 3KGCA 1R9LA 4RK9A 4MBPA 3ZS6A 1P1UA 1I69A 2I48A 4G8HA 3TZAA 1MQIA 1OQGA 2O68A 3WAFA 4QRZA 5B7DA 3U8QA 3TCHA 3K01A 3FJ7A 2RINA 1P1QA 4ECFA 2UYFA 4FIMA 4GXSB 3TEPA 3B6QA 1FTLA 4XXUA 4QFPA 1QUIA 1I6BA 4LZ5A 3K6VA 1B1HA 4JWOA 5H8FB 5H8QA 3SEWA 2BJJX 4GVOA 4KQPA 5I56B 1WODA 1NH8A 4X48A 2Z8DA 3LC8A 1B51A 3DM0A 3FGSA 2Q89A 4TLMB 2XXIA 4H1XA 5EYFA 3PPRA 1VFEA 2H9BA 1JNFA 4OEUA 3HPIA 1RKMA 5ICTA 2W7YA 1DPPA 2XHDA 3ILUB 3JZJA 4ONYA 4C1TA 3RT8A 4U23A 1H76A 3DELB 3QAXA 3ZSFA 1BKAA 3MUQA 4F3PA 3OELA 1CE2A 5BWJA 3QSLA 4MLQA 2X7PA 4G2ZA 1IIWA 2HAVA 1P1OA 3N6TA 1B52A 3TCGA 2F7AA 1MM7A 1B7UA 1XS5A 3EN3A 2NOOA 5FHNA 1GGGA 1OVTA 5DT6A 2VGQA 3CI8A 2H25A 4RY1A 1JVYA 4NF8A 4F1YA 1NMUA 2DWAA 1POTA 4O3AA 4YAHX 1BP5A 1QUKA 3SEVA 1FQFA 3MQ9A 4FORA 1A40A 1Y3PA 2ZMBA 3VXBA 1UIUA 2O7UA 1S50A 1HSLA 3OSQA 1EU8A 3FJGA 3PD9A 1BTJA 5JEIA 3MZ1A 4OFOA 5H8FA 3D4CA 4NF5B 3RT6B 4OZ9A 3OO9A 1LLSA 3FIRA 1ZKBA 1B46A 4F31B 3Q29A 2XXTA 4H8IA 1QW0A 3DP4A 2I6EA 3TTLA 5I2NB 2GFEA 5DVIA 4DZ1A 2XXQA 2DWJA 2UVHA 2A5TA 5L9SA 3QK6A 3FVNA 1TFDA 3A3UA 3MP6A 3QIMA 4F1VA 2AIXA 2F34A 3FVOA 4RPOA 4FE8A 2H5YA 4Q5TA 1Q1KA 4R6HA 2P0SA 1PEBA 3RTWB 2ZNTA 4XKPA 4LZ8A 3SEUA 1IITA 2IEEA 1B3HA 3G3KA 4F2QA 2Z22A 3IO4A 3KN7A 1NH7A 4G68C 1LFHA 5F7VA 1D4NA 3RLFE 4F3BA 3S9EA 3MP1A 1Y3QA 4XIGQ 4EQ9A 1Y4CA 1B3GA 4PP0A 1JETA 3FXUA 1US5A 4NF6B 4NF4A 2D5WA 4OERA 1Y3NA 1JW4A 2AL5A 3B6WA 5DEXA 4XKQA 4RYAA 1NL5A 1AH5A 3SETA 5K2YA 4OFLA 4X1BA 3UA8A 4KCDA 5FHMA 3HHFA 2O84X 4F1UA 5B70A 2PVUA 3O6GA 2UVJA 5CC2A 3T66A 1IXGA 3I5OA 4LZ7A 2Y7WA 4OMBA 1RYOA 3JYRA 3K6UA 3LSFB 4QFLA 4EQ7A 1AMFA 3LSXA 3C34A 1Q35A 4PETA 1N3XA 3G3FA 3MBPA 2I49A 5H8SA 4F18A 2HEUA 4RA1A 4RXLA 2I0CA 1B05A 1POY1 3MVZA 4F39A 4NF5A 2ALUA 2FA7A 3CFLA 4G68B 1TFAA 5KZTA 1MPBA 3IB1A 3M8UA 1OQHA 2XX7A 4R74A 1LAFE 1I6AA 1SW5A 1TXFA 4QFNA 4L17A 4RJZA 1P1WA 1AOVA 3O6IA 2G93A 3EF7A 1IQ7A 1JW5A 1Y9UA 3CG1A 3N6UA 3C35A 2XXUA 4R9GA 1A8EA 3N5LA 1GV8A 2A5SA 1YPNA 1MY0A 1OLAA 3PV0E 1EZPA 4PFWA 1A55A 3EHTA 4LVQA 1URSA 4I8CA 3HV1A 4LA9A 3MPLA 1FQCA 1FQBA 1B58A 2O1MA 1ZBMA 5TPAA 3L6HA 1SYIA 3GLBA 3TQLA 4R72A 1R1NA 3U94A 2DXRA 2OWTA 3H3GA 3C31A 3HHGA 2O6AA 2VD2A 3FATA 5ISUA 2UYEA 5HBCA 1LFIA 4HCWA 5J1DA 1XT8A 3TDJA 5AA4B 1D9VA 2HQ0A 1QKBA 3KSJA 2M8CA 5H8QB 3TTMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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