3EN3A

Crystal structure of the glur4 ligand-binding domain in complex with kainate
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYTEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Correlating AMPA receptor activation and cleft closure across subunits: crystal structures of the GluR4 ligand-binding domain in complex with full and partial agonists
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 4,Glutamate receptor
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3en3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3en3A02
3RTFB 1FTKA 3R26A 2XX7A 5H8QB 3KOTA 5BWJA 5ITPA 4TQUQ 1GGGA 1GV8A 4QFNA 2OWTA 1B3FA 3P7IA 4O3BA 1FTMA 5DVIA 2GHBA 2AIXA 4R2BA 4OFOA 3T9XB 3JV9A 1NH7A 2ZNUA 1TFAA 4LVQA 4EQ9A 4GWOA 4JWYA 1UTBA 4EXKA 5CMKA 4PFTA 2QRYA 2CZLA 2WKYA 4F1VA 4F2QA 3O6GA 1D3KA 1WVJA 2OZZA 3JYRA 4U4SA 5CMBA 1QUKA 4PFUA 3M3FA 1B1HA 2FNCA 4R75A 2QS2A 1NNTA 3O6HA 2UXAA 4ESWA 1FQEA 4H6DA 5DTBA 2I48A 5M2VA 3T9UA 3MVYA 3K0VA 3B6QA 2Q2CA 1SD3A 4ZEKA 2CMOA 4BDOA 3KJ7A 3TCGA 4R6KA 4GVOA 4OEUA 1MY0A 1FQBA 1QULA 3EHUA 2RCBA 1MQGA 1LFGA 4RYAA 3KZGA 4NF4B 2F7BA 1H45A 4H0WA 2DE2A 1TFDA 4C1UA 2O7UA 2H98A 3LUYA 4JWOA 3Q26A 2B65A 3HO7A 1LAFE 4I1DA 2ANJA 4GOTA 3ILTB 2D3IA 2NOOA 1SW5A 4WEPA 3M3LA 1RYXA 1MM6A 3SESA 3FXUA 2O1MA 1DTGA 1MXYA 4EUOA 2O6AA 4OFJA 2V3QA 1F9BA 1MH3A 4UA8A 2XXIA 3O29A 1URSA 1MXWA 1JW5A 3IL1B 3CVGA 4U1OA 5KCJB 5FHOA 3HCQA 3N94A 2HZKA 2DQVA 1JNFA 4X9TA 3PMXA 2NUVA 3IOUA 1RKMA 5ICTA 4Z7EA 3OELA 4DCXA 2O1LA 2G29A 1RYOA 2XHDA 3JZJA 1Y3PA 2P1SA 4ELQA 4G8NA 4ZE8A 1Y1MA 3H4ZA 3G3GA 5AA2B 1USYH 4WKMA 4NWCA 2PT2A 3KSJA 3BKIB 2FA7A 1D9YA 1B7UA 2ZYMA 4R9GA 2R71A 1MXZA 1DSNA 5I56B 3VLUA 5ICQA 1R9LA 1B1XA 1FQDA 1R9QA 3FIRA 3GLBA 2YJPA 3MJNA 3K00A 1XS5A 4NF5A 3H6WA 4R6YA 4YKPA 3THIA 3FZVA 2RF1A 4HS7A 3KG2A 1SI1A 3O9PA 4R2FA 3ZKKA 3D4CA 1N76A 3QXMA 2UVHA 2DWHA 1MS7A 4RK2A 1MDQA 1XT8A 5CBSA 4QRZA 1FQAA 3OOAA 3SEUA 2Q8JA 4ZS9A 1NKXA 2QSXA 3MWBA 4KCDA 3WAFA 4DDDA 1PBPA 1SW1A 1P1UA 3SERA 4WXJA 3UA8A 1B05A 4ISUA 1UTBB 4FEDA 1URDA 1MY4A 3A3CA 5F1QA 5DEXA 3V5AA 4OMBA 4ZEDA 5TPAB 1IIWA 1JW4A 3FXQA 4C0RA 4MH5A 2AL5A 3TDJA 3DELB 1M5FA 2ZNTA 2XXXA 5I58B 1B32A 3S4UA 4NE4A 3LBSA 1ZKBA 2UVJA 2PX1A 4OTEA 3CFLA 4QFLA 4ZEIA 4EXLA 4NF4A 5HPQA 2F97A 4P11A 3ZS6A 4DLDA 3FATA 4QSEA 2I3WA 1SI0A 2XXPA 4U4XA 4IGTA 4XKQA 2X26A 4GLIA 1MXUA 3KSXA 1P1NA 5JTYA 3PPOA 5ISUA 1PB9A 4E0WA 3MVXA 1LFHA 2RKMA 2XX8A 2UVGA 1P1OA 4HW8A 4H8JA 4U2RA 4F3GA 1EH3A 1UIUA 1LAHE 3RGYA 3TTMA 5H8SA 1YPNA 2Q2AA 4MLVA 3CG3A 4LONB 4IO3A 2R6GE 5L9OA 4IO6A 1SW4A 3RTWB 3T9VA 2O69A 2QL3A 3RQTA 3TQLA 1N3XA 3W15C 2ZXTA 1T0KA 1ZBMA 2VGQA 1ZLQA 4IGRA 4F3BA 3SDFA 1DOTA 5L9SA 1MY1A 2F5XA 3BFUA 1P1WA 2D21A 2HQ0A 1PB8A 1LB8A 2QMWA 4XIGQ 2F34A 5H8FB 4ZEBA 1R6ZA 2THIA 4MBPA 1A40A 4PFWA 5AA2D 2A5SA 4GL0A 3VXBA 3FV1A 1QUIA 3PMWA 1URGA 2R9JA 1P1QA 2XD3A 3FUZA 4BDLA 4RXLA 4F2OA 3Q25A 3KN3A 2XXUA 3EF7A 3RY3A 3PU5A 3ILUB 1H3DA 1SVXB 3W9WA 4AB6A 2H99A 1B2HA 1OQGA 1A54A 4HCWA 1POY1 1N04A 1II5A 1B3GA 3PPQA 5TU0A 5CMMA 4N6PA 1LCTA 2ESNA 3CI8A 4EDPA 3BBRA 4QFPA 1TWYA 1AH5A 3IO6A 4OESA 1Y3NA 2RCAA 2Z22A 3RUMA 1OLCA 4LP2B 1A8EA 2ZYNA 3TCFA 2V3UA 4X1DA 4JBZA 2REGA 3OENA 2OK2A 1SQYA 3SKPA 4NF5B 3V83A 3TCHA 3DLNA 4IY6A 3TPAA 4O3AA 3VFJA 3VV5A 4BDMA 1NMUA 4I9DA 3FJ7A 1FTOA 3FASA 4XKPA 1NNKA 3PUWE 5IAIA 5CC2A 1Y1ZA 3T66A 1JVXA 3QUFA 5TPAA 3KGCA 5FTIA 3VVDA 3MVWA 4F22A 4GIZA 4YICA 1CE2A 2X7QA 5DVFA 3IB2A 3MQ9A 5I58A 4POWA 3IK6B 2ALUA 2I49A 1Y4CA 4KYSA 1A7LA 3LSLA 3OSRA 4DE8A 4ZE9A 1HSEA 3TQWA 2QPQA 1B7HA 4KI0E 5DEXB 3O66A 1IQ7A 1Y3QA 2DWIA 5I84A 4YMAA 1LLSA 1FQCA 1AIVA 1YAEA 5JK4A 1B0HA 3FVGA 5ITOA 4ZZEA 3PPNA 2H5YA 2W7YA 3GBAA 2ZNSA 3ECRA 3LC8A 1XVYA 3SEWA 1ZTYA 1YTVA 1OMPA 3PMVA 3FVKA 2QMXA 1WODA 3IO4A 4P0GA 4RA1A 4YAHX 3EHSA 3E4RA 3TODA 3R7XA 5K2YA 3C4MA 3CIJA 3D4GA 3CSGA 2Z8FA 4AB5A 1LFIA 3N5LA 2ZYOA 5JTYB 3OSQA 4FATA 4R74A 4XKRA 1I6BA 3VXCA 3IX1A 3QUJA 2DP8A 5B70A 1AOVA 3MW0A 5EHSA 4RPNA 4LZ5A 4U21A 2XX9A 5H8FA 3TTKA 3UP9A 4OZ9A 3U93A 3PV0E 3GBBA 1DMBA 4G8HA 2DS9A 3K6VA 3CFZA 3QYTA 3DP6A 2F6PA 3M3KA 4U22A 1LBBA 3K6WA 4F31B 4ONYA 1NNFA 3K4UA 2I4BA 1PC3A 1B58A 5CMCA 4PFYA 4F29A 3G3IA 3RN8A 1MG1A 3IJXB 2YLNA 4FJPA 2O84X 2AL4A 1H76A 4YZZA 1MPBA 1N3WA 3PUZE 2DE4A 1VR5A 3VLWA 1IXHA 4U1ZA 3SEXA 1LAXA 1JW1A 3VVFA 5B7DA 4KQPA 4LQ5A 1S9TA 1MQHA 1B52A 2ZYKA 4OXVA 4MLQA 2B3BA 1QVSA 5H8NB 2NVUB 1SBPA 4JSDA 4KHZE 4ELOA 4JB7A 3LSWA 4KYDA 4Q30B 1EU8A 1MQIA 1SW2A 2PVUA 1HSJA 2GH9A 2HEUA 2ABHA 3ODBA 4ELPA 3PUXE 4X1BA 2XXRA 2PBWA 4RK9A 1B4HA 1VFDA 3FVNA 2H25A 1KWHA 3LSFB 3MZBA 1I69A 4JDFA 4OFLA 4QFKA 4YB5A 3VDFA 2H4IA 3O97A 1AMFA 3S9NC 4F18A 3UORA 1QW0A 1Y20A 4IO5A 2BJJX 4MFIA 5I2NB 3U1OA 3Q28A 1WDNA 1H44A 3FV2A 1B5IA 3TTRA 4IO2A 1MXXA 4QSDA 1FW0A 3O6IA 2RINA 3LSXA 1B3LA 1M5BA 2E1SA 4R73A 2GRVA 3MVZA 5FTHA 1Q1KA 2QS3A 2VHAA 4OQOA 2F78A 4F39A 4FEBA 1N0TA 5F7VA 4OETA 3K02A 4ECFA 3SEVA 4YKKA 3K1MA 2Z8EA 2HAUA 4KYEA 5KDTA 3I6VA 4GF8A 3H03A 3DM0A 2RC9A 5BUUA 2VD2A 1Y9UA 3MBPA 1ZIUA 3RLFE 3UN6A 3OEMA 4NF8A 3F11A 3T22A 3H06B 1LB9A 2V3TA 3C9HA 1M5EA 2F8DA 1Z7ME 5LOMA 4HTGA 1SYHA 5EHMA 1S7YA 4LZ7A 2DOJA 3L6GA 4JWXA 2X7PA 1MQDA 3C34A 1BLFA 1OLAA 2G93A 4RPOA 3H6TA 2Y7IA 4H65A 3T96B 2UYFA 1EZOA 5JEIA 4IO4A 5AA3A 4E0XA 5I2KA 2ONKE 3TZAA 2D5WA 3E13X 1ELJA 5I59A 4G68B 4IB2A 1QKAA 4RNSA 5A5XB 4DIGA 2YPNA 4PE5B 4G8MA 2F35A 3C31A 1DPPA 1Z7NE 3G7WA 2VOZA 4YKIA 2OWSA 4GL8A 2DWJA 3PD9A 2I3VA 2XXQA 3FJGA 1VE4A 2DWAA 4DXBA 3TUSA 1NH8A 3R6UA 2AYSA 1JQFA 4DCYA 1A8FA 4F3SA 4M1VA 1ZMGA 2Y7PA 3C32A 2HCAA 2NWJA 3AXFA 5I57A 3FXRA 2PT1A 1POTA 4Q5TA 3GXAA 4XTCQ 3UGWA 3HSTA 4PQJA 1B9JA 2HZLA 5TP9B 3FVOA 4OVJA 3HV1A 2VD3A 1NFTA 3ONMA 3QK6A 2ONSA 3OO9A 2DVZA 3IOWA 3TMGA 3MZ9A 4FAJA 5H8NA 4OYVA 3FGSA 2ZMBA 4DXUA 3I5OA 1Y4TA 3KOSA 4KD5A 4NF6B 3C33A 4OHNA 3OO7A 3CG1A 2M8CA 3KFMA 3IB1A 4BDNA 1BP5A 1ZU0A 3UK4A 3GZGA 2QS4A 3TTLA 1TT1A 4O3CA 1MH4A 4OENA 4EF1A 3EQ1A 5HBCA 2DE3A 3H6VA 5L9MA 3K2DA 1LGBC 3E3KA 2PMSA 3EHTA 4XXUA 1OVTA 3KN8A 4G68C 3CRBA 1JEVA 5I2NA 3MP8A 2F7AA 3CR9A 3HHGA 4HCYA 4JSOA 3RNNA 4YMBA 4L17A 2UVIA 4F1YA 1B46A 4U23A 1LCFA 4ESXA 1JETA 2HFBA 5DT6A 2O7IA 3U72A 4DZ1A 1MPDA 4POXA 4YB6A 2A5TA 3IJOB 1QUJA 3OD7A 4X48A 1TXFA 1O7TA 3S9MC 5CI5A 5AA4A 5H8HA 5HM4B 5CBRA 3O2AA 2XD2A 4KFQA 1SDXA 2QS1A 1S50A 4QHQA 3BFTA 2P0SA 3IAZA 3TAJA 1I6QA 4LATA 1H43A 3SETA 5DVJA 4ND9A 2RC7A 4ZZAA 3EPEA 4GXAA 1NL5A 3WAEA 3S9LC 5ELVA 2I0BA 2Y7WA 3U8QA 3H6UA 3K01A 1A55A 1OQHA 1A99A 4AQ4A 2F7CA 1LAGE 2IA4A 2VP1A 2V93A 5DYHA 4KCCA 3OO8A 1P99A 5KDTB 4H1XA 4PETA 3Q27A 2Z8DA 2O68A 4BLAA 4NF8B 1MM7A 5KZTA 4TOZA 1B51A 3N6UA 3IORA 4G68A 4RY1A 3O28A 3T9HB 5A5XA 4FORA 1DPEA 3MPLA 4R9FA 1SYIA 3TEPA 3RPWA 1CB6A 1UTHA 4IY5A 2NXOA 2LAOA 3IOTA 4F3PA 2H9BA 3HN0A 4G2ZA 2DSFA 3OMBA 3B6TA 2O51A 3KEIA 1YCJA 5I2KB 3I3VA 5I59B 1BKAA 2HXWA 2B3FA 3VE1B 1ANFA 3K6UA 3M8UA 2GHAA 2RC8A 1Q35A 2DVCA 3V8XB 4YU0A 3C36A 1MDP1 4C1TA 4OWDA 1XC1A 1IXCA 1ZJLA 5TP9A 3RT8A 3PGFA 4G4PA 2Z23A 3A3UA 4IO7A 3E9XA 4XKNA 3S9EA 3TYHA 5AA1A 4NF6A 3IB0A 4GFRA 2OJTA 5I57B 3MC2A 4OEVA 4FECA 1J1NA 1QJMA 4LQ2A 1MY2A 3PUYE 1NNPA 4UACA 3U94A 1BIYA 4G77A 1L5TA 3TTNA 2IEEA 1EZ9A 1PEBA 2Q88A 4I62A 5L8DA 1OVBA 4EQBA 1D9VA 1VSOA 3KJTA 2F36A 2OCUA 3ZSFA 2Q9TA 3G3KA 1DTZA 3DP8A 1D4NA 1VFEA 4I8CA 1BTJA 3Q29A 1FCKA 1PB7A 4F19A 1MRPA 3PPRA 3OO6A 1B0LA 2V84A 4TLMB 1B7ZA 3MP6A 1MQJA 4RJZA 1B5HA 3C35A 1O64A 2XXHA 5H8QA 3A09A 1UIVA 3KN7A 1O63A 4QF9A 1B6HA 3PUVE 2HAVA 3IR1A 2P2AA 1GR2A 1B5JA 4GD5A 2PYYA 3G3HA 3CSBA 4LZ8A 3K1PA 2FYIA 1FTLA 2I4CA 1FTJA 1UQWA 1IZ1A 3UIFA 2OLBA 4EQ7A 4NWDA 4N07A 2A5TB 4QSCA 4YKJA 1MY3A 3FJMA 3MZ1A 3SEYA 5AA4B 2XXWA 5H8HB 4ELRA 3PPPA 1IXGA 1LBCA 1PBQA 3TFLA 1XHYA 4FIMA 4R6HA 1FQFA 4H8IA 4ZDMA 1B4ZA 4PP0A 1US5A 2XXVA 2QJEA 3MAMA 1IXIA 4EF2A 1JEUA 3VVEA 1LSTA 1N7WA 2F6GA 2I6EA 1US4A 1HSLA 4Q0CA 4QFOA 1GTKA 3N26A 3T93B 3CFXA 4GQOA 4BDRA 4NEDA 3HPIA 4GRKA 2XXYA 3K1NA 1IUDA 3QAXA 4DXCA 4ZECA 1MPCA 3HHFA 3OXNA 2E0SA 4FE8A 4NTLA 3RT6B 4BDQA 4H5FA 2DXRA 1XOCA 1B40A 1PDAA 3W9VA 1JVYA 2Q89A 4YB7A 3TELA 1OIBA 4H67A 2OBGA 3U92A 1B3EA 3OEKA 3MUQA 3KBRA 2Y7KA 3VLVA 1XVXA 4Q8RA 3H3GA 3IOVA 4GXSB 3PD8A 3ZKLA 4KPTA 1UTHB 3B7DA 4NMYA 3EN3A 1R1NA 1AL3A 2KLFA 1N84A 1IEJA 3LR1A 1GVCA 4R72A 2Y84A 5KCJA 4Z0IA 4MF3A 3MP1A 3G3JA 5J1DA 3B6WA 2I0CA 4P0IA 1USYE 1M5DA 4THIA 5K2XA 3G3FA 4OERA 5AE4A 1IITA 3DP4A 4WEDA 3QSLA 4KR5A 2GFEA 4LUBA 2V25A 1MXVA 5EYFA 2UYEA 5AA2A 3MPKA 1N7XA 5IKBA 1EZPA 2Y7RA 2ONRA 3N6TA 3K6XA 3QIMA 3FD3A 2DYXA 4H5GA 2REJA 1QKBA 1M5CA 5I56A 3L6HA 4M4GA 3S2VA 4LA9A 4TLLB 5FHNA 3TKDA 3USDA 3H7MA 4K3FA 2I58A 5CRYA 4JXIA 5CM6A 3V89B 2DXYA 5FHMA 1B3HA 4ZEFA 4N13A 1I6AA 1ATGA 2XXTA 4F1UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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