3EN3A

Crystal structure of the glur4 ligand-binding domain in complex with kainate
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYTEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Correlating AMPA receptor activation and cleft closure across subunits: crystal structures of the GluR4 ligand-binding domain in complex with full and partial agonists
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 4,Glutamate receptor
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3en3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3en3A02
3C34A 4WKMA 4FIMA 1H45A 1LAGE 4OVJA 4MF3A 3KEIA 3SETA 4ESXA 3MVXA 3EHUA 4OETA 1MY4A 4E0XA 4DXCA 4ZECA 4HCYA 5AE4A 2GHBA 3S9LC 1BKAA 4IO6A 1ZMGA 4GRKA 4AQ4A 1MXWA 1LSTA 4ELQA 3JZJA 1TT1A 3MP8A 4LZ8A 2F7CA 4R6KA 2A5TA 4OQOA 4XKRA 2QPQA 3H3GA 1MDP1 5L9SA 4OWDA 1FQCA 5EHMA 1N7XA 3DP6A 1KWHA 3H6UA 3KN7A 3TAJA 2A5TB 5CRYA 2P1SA 2XXXA 3Q26A 1UIVA 3PUXE 3UK4A 1ZTYA 2UYEA 1H43A 3MZ1A 4IO4A 4QSEA 5FHMA 4ZEIA 1B5HA 3IOUA 1IIWA 4RY1A 2O84X 3TODA 4FJPA 1USYE 4POWA 4OFJA 1A8EA 3TPAA 1YTVA 4Z7EA 4KCDA 1N3XA 1ZJLA 1Z7ME 2DE2A 5BUUA 1OIBA 1S9TA 5DEXA 3KSXA 3K2DA 2AL4A 4BDQA 2G29A 3QUJA 1MXUA 3ZKLA 4ZEKA 2QS2A 2E0SA 5DEXB 3G3IA 2GRVA 2H4IA 1PDAA 1PEBA 3MWBA 4F19A 1B3FA 3HCQA 4N6PA 1B52A 5I2NA 3CFXA 5ELVA 4FE8A 1XOCA 1NNTA 1FCKA 1P1WA 3KJ7A 1S50A 5BWJA 1NH8A 2XXUA 3KBRA 3T22A 4LQ5A 1A99A 4GL0A 2IEEA 1MXVA 1T0KA 1GGGA 3HN0A 3M8UA 4KQPA 3OOAA 3CI8A 4LVQA 3HHGA 1LFIA 1MQJA 2O69A 2Q88A 1PB9A 3MJNA 3C36A 1HSLA 3GZGA 4H1XA 4ZEBA 4PFYA 5K2XA 1QJMA 2F6GA 1ANFA 1J1NA 3K4UA 1SVXB 3MBPA 4BDRA 2UYFA 5FTIA 2XX7A 5TPAB 3TMGA 2I4CA 3MVZA 3VLVA 2RC9A 1ELJA 1VFEA 1JETA 1B7ZA 2D5WA 4H67A 2XXTA 3FXQA 4FECA 2HZLA 5J1DA 1MXXA 4OFLA 3FV2A 5L9MA 4IGRA 3H6WA 4PFTA 5M2VA 4GIZA 5CMKA 3TCGA 1B32A 3MVYA 3QAXA 3USDA 1UTBB 3IAZA 3VXCA 1OQGA 2VP1A 2ALUA 1D9VA 2Q2CA 1SW2A 1RYOA 3LR1A 4LA9A 1SW1A 5IAIA 4RA1A 3CSBA 2Y84A 3W9VA 4H8IA 1MY3A 2DS9A 2X26A 3OD7A 2RF1A 3V83A 3M3LA 4THIA 2R71A 4WXJA 4Q30B 3IOWA 3R6UA 1US5A 3PUYE 5DVFA 5H8HA 2XXQA 2ZMBA 3IB1A 4OERA 2Q2AA 3N26A 3IJOB 4F2OA 1LCFA 4U23A 1MXZA 3CG3A 1MQHA 2OBGA 2QMXA 4ELPA 5H8HB 4OEVA 1B4ZA 4EF2A 3C4MA 5FHOA 3RY3A 1P99A 2F7BA 4KD5A 4KYSA 1ZU0A 1EH3A 4ZE9A 3A3CA 3S9NC 1MY2A 2IA4A 3S2VA 1MQIA 2H98A 3H6TA 2PX1A 3SESA 2V3TA 4NWCA 4Q0CA 4L17A 2I6EA 1N04A 3I3VA 5I58A 1I6BA 4MBPA 4R2FA 1B7UA 3O6HA 3VDFA 4NTLA 2VD2A 4GXSB 5F7VA 1JEUA 2Y7WA 2F97A 3GBBA 4OESA 5AA4A 4GWOA 1AL3A 2R6GE 4IO2A 3MW0A 4XXUA 2DVCA 4NEDA 2DVZA 3RNNA 1EZOA 3C35A 5CMBA 1MQGA 5JTYB 4Z0IA 5AA4B 1QKBA 2HAUA 2XXWA 4PQJA 2UVGA 1VR5A 4EQ9A 3K0VA 1FQDA 4O3CA 4ZE8A 4YKJA 4G8NA 3H03A 4U1OA 2NOOA 2UVIA 1OVBA 2I48A 1H76A 4NWDA 3RTFB 2RKMA 3S4UA 3PD9A 4GQOA 3VVFA 2DOJA 3CSGA 1B6HA 4N07A 3SEYA 3O6GA 1B1HA 1PB8A 1B7HA 5CMCA 1GR2A 3TTLA 3ECRA 4U4SA 4X9TA 2O7UA 4EDPA 3LBSA 1ATGA 2ONKE 3EN3A 1R9QA 2REJA 2REGA 3IORA 4X1BA 3FJMA 3K00A 3M3KA 3JYRA 1B5IA 3G3GA 4XKPA 2ABHA 3OO6A 1R6ZA 1Y4TA 5CBSA 3G3FA 3OENA 3RPWA 1A54A 2NXOA 3T9HB 3FIRA 1FTOA 4P0IA 4GFRA 1LBBA 3BFTA 2ZYOA 2M8CA 2ZYKA 4MLQA 3H6VA 1NFTA 3L6HA 1JW5A 1B0LA 5AA1A 3U94A 3QYTA 5I59A 5H8QB 4QRZA 2VGQA 3LC8A 3PPPA 5ICTA 2B65A 4OENA 4QFKA 4ONYA 5AA3A 2D3IA 3TYHA 1SBPA 3KN8A 2H25A 3GLBA 4F18A 3CG1A 3O2AA 5IKBA 4GF8A 5DVIA 1QUKA 4R75A 1IXIA 4OMBA 2PT2A 3BKIB 4K3FA 1R9LA 3K1NA 3V8XB 4DXBA 1UIUA 2OJTA 4BDOA 3FXRA 3EQ1A 2DWHA 3R7XA 1JVXA 3PU5A 2XD2A 3Q25A 5EHSA 3UN6A 3WAEA 1ZBMA 4XIGQ 5DYHA 1POTA 2FNCA 3D4GA 2ZNSA 1RYXA 3FVKA 3RT6B 2RCAA 4HS7A 1IXHA 1B3LA 4F3PA 1S7YA 1Y4CA 2ZNUA 5B70A 1NNFA 4LATA 3OSRA 4RYAA 3Q28A 4IO7A 2DQVA 1MPDA 2Q89A 4ESWA 1YCJA 2F7AA 2Z8FA 1QKAA 2Q8JA 1MDQA 1MQDA 3MVWA 3K02A 1MH3A 4U2RA 3ZS6A 5I84A 3T96B 1UQWA 3MP1A 2RINA 3OELA 1UTHA 2AIXA 2ONRA 3BFUA 3TFLA 1H3DA 1HSEA 3CVGA 3N6TA 4DXUA 2ZYMA 1FQAA 4KYEA 2OZZA 3TEPA 3FVNA 4G8MA 2F36A 4YAHX 1UTHB 4G8HA 3VXBA 2P0SA 2I3VA 4YZZA 2O68A 3KJTA 2DWJA 4ZEFA 3UGWA 4JWOA 4F31B 3PD8A 1II5A 4R74A 1Y3NA 4R6YA 1B51A 1A40A 2PT1A 4RPNA 1JEVA 1QULA 1SI1A 3KOSA 3HSTA 1IEJA 4OFOA 3IK6B 2BJJX 2V3UA 2O7IA 1A7LA 4G68A 4U21A 1VE4A 3N94A 4QSDA 5CMMA 1QUIA 4TQUQ 4GVOA 1OMPA 2ZXTA 1GTKA 1YPNA 2OK2A 2E1SA 3TELA 3IB2A 4BLAA 4KCCA 4NF5A 4EXLA 4RXLA 5AA2B 4G68B 3LUYA 2ANJA 1HSJA 3IR1A 1ZIUA 3E3KA 2GH9A 3KZGA 1SD3A 3MPLA 3G3JA 3KSJA 1M5DA 2QL3A 4NF5B 4I9DA 4OEUA 1LB8A 1SQYA 3QIMA 4NF8B 4GOTA 2X7PA 4U22A 4I1DA 2QS3A 4R9FA 1CE2A 5TPAA 5L9OA 1FW0A 2HEUA 1Y9UA 1VSOA 3MP6A 3B6TA 2F78A 2DSFA 4NF6B 1DSNA 1JNFA 4G68C 1DPEA 2XD3A 3FD3A 4WEPA 3Q29A 1PBQA 2LAOA 1M5EA 4POXA 2THIA 1UTBA 1M5FA 1CB6A 4H65A 4H5FA 1SW5A 1EZ9A 3O66A 4C1UA 4LZ5A 4KHZE 4YKPA 1D9YA 4HW8A 4XKQA 3FXUA 3R26A 4LZ7A 1A8FA 3IL1B 3PPRA 1B05A 1Q1KA 5JEIA 5KDTA 5A5XB 3D4CA 3O9PA 2H9BA 3ILUB 3DP4A 3B6QA 4ZZEA 3VV5A 2DYXA 2HAVA 1O63A 2ONSA 4F3GA 3EPEA 4BDNA 1B9JA 1XVXA 3OEMA 1M5CA 4X48A 5KDTB 1URSA 5CC2A 2RCBA 3G3HA 3M3FA 2FYIA 2KLFA 2I58A 3FVGA 2Y7KA 1BIYA 1SYHA 1LCTA 3CRBA 1XS5A 4UACA 4JBZA 4O3BA 4U4XA 4EQ7A 2I0CA 3MZ9A 1F9BA 4JSDA 2DE4A 1PB7A 3MZBA 4G4PA 4JWXA 1YAEA 3EHTA 3FVOA 4XKNA 3VVDA 1WODA 3HPIA 4ZDMA 4F22A 4GD5A 2XX8A 5TP9B 3PPOA 1FQEA 3VLWA 1JW4A 4PE5B 3H06B 1MH4A 1R1NA 2B3BA 1I69A 4YKKA 3K6UA 3O28A 3HO7A 5CI5A 2QS4A 2I49A 5KZTA 5JTYA 3N6UA 4YB6A 4XTCQ 3MAMA 2AYSA 3IOTA 1SYIA 3PPNA 2V25A 2X7QA 2H5YA 3CFLA 2RC7A 4F1YA 2HQ0A 4EUOA 1US4A 4E0WA 2QJEA 4F39A 3C9HA 4MFIA 3TKDA 2ZNTA 4P11A 3I5OA 2NVUB 4H5GA 2I0BA 1OQHA 5ISUA 4JDFA 1DTZA 1DTGA 4DDDA 4I62A 4FORA 1NNPA 1Y1ZA 4JSOA 4QF9A 3S9MC 3FZVA 2Z23A 4NMYA 2DXRA 3MUQA 1I6AA 4ZS9A 4RPOA 3SEVA 3H7MA 2Y7PA 2F34A 3FV1A 4ELOA 3UORA 3TTNA 3FASA 1LFGA 1B46A 2HXWA 3A09A 1O64A 4QFOA 3GBAA 1A55A 3K1MA 5ITOA 4H6DA 3PGFA 4AB5A 1FTLA 2QS1A 2G93A 2Y7RA 3SKPA 3IO6A 4R6HA 3VVEA 3CFZA 3C32A 5H8QA 3T9VA 1PC3A 3ZKKA 3IX1A 1LGBC 3DM0A 3KG2A 2F35A 4PP0A 1LAFE 3ILTB 4DCYA 1EZPA 3SERA 1XHYA 5H8NB 1IXGA 1SW4A 1P1UA 3RUMA 1MY0A 4YKIA 3E9XA 5DTBA 5CBRA 5DT6A 1RKMA 2UVJA 1Z7NE 3RGYA 3LSFB 1DMBA 4MH5A 1M5BA 3RQTA 4R2BA 1XC1A 1IQ7A 4LQ2A 3CR9A 1XT8A 4LUBA 3PMXA 3PUWE 3B6WA 1MPBA 4HCWA 4OZ9A 1Y1MA 5FHNA 2CMOA 4KI0E 4N13A 1N7WA 4ECFA 4Q8RA 3LSLA 1WVJA 3PV0E 5F1QA 3V89B 2W7YA 2YLNA 4KPTA 2OWTA 4HTGA 1JQFA 1URGA 1IZ1A 3IO4A 1EU8A 4LP2B 3OEKA 3UP9A 1N3WA 3U93A 2UVHA 2XXYA 1B3GA 3PMWA 1QUJA 3ONMA 3K01A 1DPPA 1OLAA 4YB5A 3VFJA 3T9XB 2XXHA 3S9EA 3T93B 3RLFE 1MY1A 4F3BA 3O97A 1JVYA 4KR5A 3W15C 3CIJA 2VD3A 3B7DA 4YU0A 1IITA 2ESNA 4GL8A 4F29A 3DLNA 3O29A 1B3EA 5H8FA 3G7WA 2XX9A 4RK2A 5EYFA 3DELB 2A5SA 1MXYA 2O6AA 1QW0A 3U72A 4YMBA 5H8FB 2XHDA 3MC2A 4DE8A 4DCXA 4QFLA 4ND9A 1TWYA 3UIFA 3SEXA 1XVYA 4ELRA 2VHAA 4DZ1A 4BDLA 1FTMA 2DWAA 3OXNA 3ZSFA 3GXAA 4G2ZA 3FATA 4EXKA 3FJGA 3UA8A 5AA2A 3TQLA 3U92A 1N0TA 1O7TA 3IJXB 2PYYA 2GFEA 4QSCA 4QFPA 4H8JA 4TLLB 1IXCA 2NWJA 1L5TA 4DIGA 3T66A 3SEUA 2DE3A 4IO5A 4NF8A 1NNKA 3PUZE 3EF7A 1MS7A 3HV1A 5AA2D 4G77A 3N5LA 2F6PA 2UXAA 2XXVA 5I2NB 1MRPA 5ICQA 4NF6A 3I6VA 5HBCA 5JK4A 1GV8A 3W9WA 2F8DA 3MPKA 3HHFA 4KFQA 3FUZA 1Y20A 1USYH 2O1LA 4FAJA 3F11A 5HM4B 1NMUA 4I8CA 4DLDA 4AB6A 4WEDA 3KGCA 3A3UA 4FEBA 1BLFA 2O51A 1LFHA 1FTKA 3O6IA 4IY6A 2V3QA 4TLMB 1NL5A 2FA7A 1MG1A 3VLUA 2ZYNA 1MM7A 2O1MA 3TTMA 5A5XA 4JB7A 3K6XA 1QVSA 1AMFA 2DWIA 3G3KA 3SEWA 4OTEA 3P7IA 1IUDA 2QSXA 1D3KA 2XXPA 3QUFA 4PFUA 4FATA 3U8QA 4JXIA 1D4NA 3QSLA 3SDFA 4M1VA 2QMWA 1WDNA 2GHAA 1TXFA 2DXYA 4R73A 2R9JA 4BDMA 3IB0A 2P2AA 3PUVE 3E13X 3KN3A 3OO8A 1B58A 1SDXA 2YJPA 3OMBA 3TQWA 2HFBA 1ZKBA 1N84A 3T9UA 3THIA 5H8SA 3E4RA 4EQBA 1GVCA 3U1OA 3QXMA 1DOTA 1P1QA 2B3FA 1POY1 3VE1B 1LLSA 5TP9A 3ODBA 4FEDA 2WKYA 3OSQA 4EF1A 3FGSA 1AIVA 4C0RA 4IO3A 1LB9A 4PFWA 4F2QA 4H0WA 3K6VA 4R9GA 2V93A 3MQ9A 1I6QA 4F1VA 2OLBA 1JW1A 1B0HA 3TDJA 4RJZA 2XXIA 3C31A 1P1NA 1MPCA 2D21A 3JV9A 1B5JA 4LONB 2OWSA 1B4HA 5KCJA 1ZLQA 4UA8A 2HZKA 1TFDA 3OO7A 3PMVA 5FTHA 1H44A 2Z8DA 1P1OA 3C33A 4NF4A 5I57A 1B3HA 3TTKA 2XXRA 2Q9TA 2NUVA 4OXVA 5KCJB 4QFNA 3QK6A 3L6GA 1OVTA 2Y7IA 3RN8A 4MLVA 4NF4B 5I57B 1LBCA 4ZEDA 3LSWA 4YMAA 2Z8EA 1FTJA 3TCHA 1SI0A 5I58B 4RK9A 1URDA 4RNSA 1AH5A 3H4ZA 5I56A 3K1PA 1B1XA 2OCUA 4M4GA 3WAFA 3RTWB 1TFAA 3TZAA 4OHNA 1LAXA 4PETA 3Q27A 4IB2A 1Q35A 3KOTA 4Q5TA 1BTJA 5I56B 3V5AA 2HCAA 2DP8A 1FQBA 1NH7A 5CM6A 4O3AA 4TOZA 1B2HA 4U1ZA 1FQFA 4R72A 2I3WA 2YPNA 4JWYA 4IGTA 1B40A 4KYDA 1BP5A 5I2KA 2VOZA 3K6WA 3TTRA 5TU0A 3FJ7A 3TUSA 1Y3QA 2Z22A 2AL5A 3DP8A 1AOVA 5K2YA 4OYVA 3EHSA 4P0GA 5HPQA 5H8NA 5I2KB 1VFDA 2F5XA 4QHQA 1Y3PA 4X1DA 3TCFA 5B7DA 5L8DA 5DVJA 4NE4A 2I4BA 4GLIA 4GXAA 1MM6A 4YICA 3AXFA 2RC8A 4ISUA 1PBPA 4F3SA 5ITPA 2V84A 3KFMA 1NKXA 4IY5A 3RT8A 2PVUA 2CZLA 1N76A 2PBWA 3OO9A 4YB7A 1LAHE 4ZZAA 3LSXA 3BBRA 2PMSA 3PPQA 5I59B 1OLCA 2H99A 2QRYA 4F1UA 5LOMA 4C1TA 3IOVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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