The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
85
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sequence length |
199
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structure length |
195
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Chain Sequence |
EQHSQLNQTKIAYEQRLLNDLEDMDDPLDLFLDYMIWISTSYIEVDSESGQEVLRSTMERCLIYIQDMETYRNDPRFLKIWIWYINLFLSNNFHESENTFKYMFNKGIGTKLSLFYEEFSKLLENAQFFLEAKVLLELGAENNCRPYNRLLRSLSNYEDRLREMNIVENPDSRERLKGRLIYRTAPFFIRKFLTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
The Crystal Structure of the N-Terminal Region of BUB1 Provides Insight into the Mechanism of BUB1 Recruitment to Kinetochores.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Cell cycle
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source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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molecule keywords |
Checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
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total genus |
85
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structure length |
195
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sequence length |
199
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chains with identical sequence |
B
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2008-10-06 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
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A | PF08311 | Mad3_BUB1_I | Mad3/BUB1 homology region 1 |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | ||
Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3ESL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3C3R A; 1PAQ A; 4ZI3 D; 3FU0 A; 3HYM B; 1TJF A; 3Q9N C; 5A1L A; 4YSY A; 3ANW A; 4U8Y D; 4ZZB A; 2J07 A; 4IN3 B; 4IDN A; 3CVL A; 3C98 B; 2LM2 A; 5BMV E; 3V5S A; 1IHG A; 4BX8 A; 1PC2 A; 2XQ0 A; 2WDQ A; 4RSY A; 3CHR A; 4A5X A; 3FTS A; 3HDX A; 4K5B A; 4ACK A; 1UK5 A; 3G2T A; 4O2A E; 3PJA J; 1AP7 A; 2WQY A; 2DZO A; 2L9B A; 4IDP A; 4JLE A; 4Y6C A; 1B7T A; 2XAG B; 3I9Y A; 1UX4 A; 3UU8 A; 2RP4 A; 2J4G A; 3O1J A; 3CVU A; 3SF4 A; 4GYW A; 4H9S E; 2A3D A; 2NC9 A; 4JD2 G; 4LMJ A; 3EAM A; 1UCU A; 2UWJ G; 1M62 A; 3RSE G; 3MCX A; 2NW7 A; 5D0O D; 4A1S A; 3FZF B; 3TWR A; 3PNT B; 4DX2 A; 2AJA A; 2BKP A; 3TLU A; 4QQI A; 1EZ3 A; 5DAB A; 3QAR A; 4YTN A; 5HXS A; 2QY7 A; 3N9P A; 4UI9 K; 3CVX A; 2XCB A; 4HEA A; 3FEX A; 3ZYM A; 1Z0P A; 4H9Q C; 2Y4T A; 3CIA A; 2LSY A; 4X1K E; 1G3N B; 1FEW A; 3FU5 A; 2HHH T; 2R02 A; 2A72 A; 3CPZ A; 2VQF T; 5L3F B; 4ILI A; 2VB6 A; 3UUX B; 2Q9Q D; 4P1N A; 2VGY A; 3MX3 A; 1YQ3 A; 2VSN A; 3TWV A; 3UKU G; 1YCS B; 4J7W A; 1KNR A; 1FCH A; 3C50 A; 2ILR A; 3CHS A; 3KD7 A; 4C0E A; 3T8M A; 4L23 A; 4PW8 A; 3TXN A; 3WAK A; 1BR2 A; 5A23 A; 3PUR A; 1LF8 A; 2RD0 A; 3CKB A; 1MHQ A; 4ME2 A; 2XTL A; 3ULE G; 1IJ5 A; 2DNX A; 3CK7 A; 4GTM A; 3RYI E; 4TV8 E; 4E7S A; 3PV0 F; 3EU5 A; 5DIZ A; 2OVF A; 2Y3A A; 1M7K A; 1WR0 A; 5AQN B; 1HH8 A; 3UIN C; 4HE8 A; 3I1A A; 5B1B E; 3EJN A; 2DCP A; 4KP3 C; 5IUX A; 3APC A; 3QC9 A; 2OEV A; 3ASF A; 3JXJ A; 2CCQ A; 4U72 A; 3C3O A; 3AXJ A; 3GN5 B; 4PDX A; 3HG0 D; 3QWV A; 4JI6 T; 1YYH A; 4MKT A; 2XQ9 A; 1UN8 A; 3EDV A; 2LXL A; 2A5U A; 2LRL A; 2X66 A; 3FUK A; 2XUE A; 3DSX A; 4KBM B; 4JI4 T; 1HE8 A; 3UT4 A; 4QFV A; 4CYM D; 2MOZ A; 2MRI A; 2LEH A; 2BVM A; 4YFS A; 5LG4 A; 3CVV A; 2FJA A; 4UV9 B; 1J5W A; 1Z8U A; 3DBS A; 4ANJ A; 4LFC T; 2F37 A; 3BK9 A; 1YD8 G; 3AEA A; 2H6F A; 5L47 A; 1KEY A; 4GIW A; 2H6H A; 5LP6 E; 3MV3 B; 4FP7 A; 4BT8 A; 4MLK A; 2WXR A; 5CA0 E; 4JVS A; 3V79 K; 1ZKE A; 2XSB A; 4EB6 E; 2XEV A; 3QJZ A; 2XAF B; 2I2O A; 2IO2 C; 3AA7 B; 2LLY A; 3MZK B; 2Y69 E; 3GZS A; 2GW1 A; 4DV5 T; 5KCM A; 5AQJ B; 2EIL E; 4I6J A; 1NA3 A; 3V2O A; 4O1O A; 5DQV A; 3P1U A; 2J4D A; 2C0L A; 3U4T A; 3ZW3 A; 2IC9 A; 5EZY E; 1KT0 A; 3PE0 A; 4FJO A; 5FZR A; 2KT9 A; 3ZNG A; 4KZC A; 3MKQ A; 1VDY A; 4YVO A; 4CT4 A; 2ZM8 A; 2PBI A; 4NAC A; 4YT0 A; 3CGH A; 1MNE A; 3QDN A; 3K9I A; 4PFP A; 2Q9Q A; 1N34 T; 4AM9 A; 2LSV A; 4ANW A; 3X2Q E; 2EQX A; 2NOX A; 2XGM A; 2WXH A; 4DJA A; 3ULQ A; 1IQU A; 2FUP A; 1W09 A; 4JI1 T; 3GW4 A; 4GYR A; 4G8L A; 4BWR A; 4CCA A; 4ADZ A; 2KCK A; 2IAK A; 3O48 A; 1D0Z A; 3PZD A; 1H2V C; 1IBK T; 4TWF A; 2VTB A; 3J7Y q; 4YDE A; 4IST A; 3HA4 A; 4UWH A; 3TXM A; 2JAB A; 2RG8 A; 4U7Y A; 1SUM B; 3ZN3 A; 4LCT A; 4L1B A; 2NWB A; 3ML9 A; 3ZIM A; 2UXX B; 1TNU A; 5HEU A; 3HKD E; 3RLF F; 2LSU A; 3R7Q A; 3PE3 A; 2B6C A; 2ION A; 3RC8 A; 1OY3 D; 4YJ3 E; 3P4P A; 2X67 A; 2WZH A; 2LM9 A; 2WCA A; 2LUH A; 3H3M A; 3HVE B; 4I1A A; 2CXL A; 4O4H E; 4EEC A; 2VAS A; 3IHV A; 4BES A; 4J6I A; 3ZHE B; 3NKZ A; 4DX5 D; 5HEG A; 4EOZ B; 2JRK A; 3SOL A; 2XAH B; 5IYZ E; 1AJ3 A; 4AKH A; 1ELR A; 2KWI B; 2Y8D A; 3AEE A; 5M4Y A; 3AE6 A; 3KV6 A; 4JI7 T; 3AG2 E; 3LJ3 A; 5AAR A; 4GK5 E; 2W66 A; 2VKO A; 5L4H A; 1XNR T; 4NXM T; 4GZC A; 4HWD A; 4DV7 T; 3TLV A; 4GCN A; 4G11 A; 5CED B; 3RIU C; 5FY7 A; 4ABN A; 3TJP A; 3MKD A; 2JQ9 A; 3OBV E; 4K0U A; 3AAA B; 3FBL A; 3K3N A; 3KVB A; 5EK3 A; 4I9E A; 2C5J A; 5FXX A; 4EEB A; 3LK2 B; 3EHZ A; 3DPY A; 4G1T A; 3F57 A; 4CN1 A; 2K3W A; 3V30 A; 3JAD A; 3LVQ E; 2R2L A; 1A5E A; 1QQE A; 3B13 A; 5FXZ A; 4IRE A; 5DQW A; 3NQP A; 5HWX A; 1OED E; 3IA3 A; 4IRU A; 1SZ9 A; 3KS2 A; 4JI3 T; 2J08 A; 4PK4 A; 5KDM C; 4KBQ A; 2XJ7 A; 2IY0 C; 3FZK B; 5FXV A; 4QHO A; 2YHE A; 3V31 A; 4AEZ C; 1TR4 A; 4CEM A; 3NWI A; 4XKB A; 3KDS E; 3I5P A; 4TUU A; 1NEN A; 3T9K A; 5KNG A; 1UX5 A; 4DV3 T; 2V5D A; 2JMK A; 3BQL A; 3UU5 A; 3QWW A; 3ASD A; 3S7D A; 3ZVV A; 1N4P A; 3QOF A; 3LEW A; 4X1Y E; 3OTO T; 2UY1 A; 3FTV A; 4TUM A; 3W15 B; 3D9H A; 3FUD A; 4JHR A; 2WQ7 A; 2BZB A; 2H89 A; 4MLP A; 3P2B A; 4COF A; 3RIF A; 3ZMZ B; 5LCW J; 4GU5 A; 4HWH A; 3OJA A; 4PJL A; 5CEC B; 4YY3 T; 4IDO A; 3T1Y T; 2DZN A; 1RZ4 A; 3SBT B; 3RGL A; 5ARG A; 4PFO A; 4I55 E; 3S7F A; 2IOS A; 5L3E B; 3AAA C; 3ZN0 B; 4HOR A; 1CHU A; 3RYF E; 2ZXW E; 3NAW A; 3WXX A; 3KFW X; 2X9Y A; 1WYB A; 2V4L A; 3ZST A; 4DX6 D; 1DCE A; 4OX9 T; 3HXC A; 5GON E; 2ZMA A; 2SPC A; 4DUI A; 5LHH B; 2YQ8 A; 4DV0 T; 3E32 A; 4U0U A; 1KFY A; 5BXU A; 2D2S A; 3M3Z B; 4PJN A; 4TV3 A; 1HZ4 A; 1JPL A; 3TGO A; 3WI3 A; 3HKB E; 1N32 T; 5L2L A; 2IOL A; 2V5C A; 4MRU A; 3JQ0 A; 4C90 A; 2CG3 A; 3FFL A; 4EPZ A; 2MBG A; 4RG6 A; 3NRX A; 4DR2 T; 3CHO A; 3KV4 A; 3PTR B; 3B95 A; 3AU4 A; 2JQK A; 4OYJ A; 3AXJ B; 2KBX A; 4G2V A; 3UFG A; 4W9R A; 5H6Q B; 1XNF A; 3PZ1 A; 5CRU A; 2DL1 A; 2IFU A; 3C51 A; 2DIW A; 4AY5 A; 4DBQ A; 4URK A; 2MAW A; 2XHE A; 2CA5 A; 4Q69 A; 2KSR A; 4RLY A; 2C5I T; 3HXD A; 4HTE A; 4C91 A; 4U2Z A; 5JJ6 A; 4XAX B; 1OWL A; 2J62 A; 3F31 A; 5HEH A; 2WPV A; 1ZB1 A; 5AAO A; 3IV0 A; 4ZFH A; 3Q5M A; 3D3M A; 4DVD A; 3DTO A; 2IEJ A; 2PTF A; 1VOM A; 3CX8 B; 2W4X A; 1DCQ A; 3MJX A; 1MYO A; 4JBW F; 1JWG A; 5CA1 E; 5BNW A; 1VCT A; 2WXG A; 2RFM A; 4L2Y A; 5CMW A; 3Q5W A; 4AJW A; 2BG9 E; 4J8D A; 3T5X A; 3AG3 E; 4GKK T; 5J90 A; 2G0U A; 2W62 A; 4IE7 A; 1N4Q A; 4I50 E; 4YJ2 E; 3ONK A; 4UIG A; 1MMA A; 2VGE A; 2DHR A; 3RKG A; 3DSS A; 4OYK A; 4QX8 B; 4BX9 A; 4N2Q A; 2VSY A; 1V54 E; 5FZQ A; 2XRZ A; 3IHR A; 4WNE A; 4CI2 B; 3LK4 2; 2ETC A; 4ILH B; 1WDY A; 3NRY A; 1MMD A; 3ZYL A; 5KX5 E; 4GKJ T; 3CVQ A; 4GYY A; 2ETB A; 4WZX A; 5AN8 A; 2J09 A; 5LCW C; 2ZLY A; 3APF A; 4QXB B; 2ZGD A; 3AU5 A; 2YNQ A; 1HFA A; 3N9O A; 1UN9 A; 3K3Q C; 1OWA A; 2XM1 A; 5CFB A; 4X66 T; 4ZI3 C; 1JWF A; 2P9L G; 3M65 A; 4BJN A; 4YSZ A; 4ISS A; 3A7M A; 4QWN B; 2XQ6 A; 2DBA A; 4YLH A; 3PDY A; 2LO6 A; 3DXK G; 4FU3 A; 3SFD A; 4LNB A; 4ZI2 D; 3P4W A; 3DP7 A; 2UUA T; 3NBN B; 2BS3 A; 3DXM G; 3UXG A; 1K1B A; 3KVA A; 3PRZ A; 2WU2 A; 4EQF A; 2XM2 A; 3ONJ A; 4GA2 A; 2CHX A; 2GRN B; 4LRZ A; 3CK8 A; 3D9J A; 2P9P G; 4YHH T; 3FHE A; 3ZYQ A; 3RRC A; 5AQ9 A; 4L0R A; 2BKK B; 4GYO A; 2GRP B; 1O1S A; 2CHN A; 2ES0 A; 1US7 B; 2P9N G; 3MZL B; 4ZOL E; 3Q4A B; 3IEG A; 4HFV A; 1OCR E; 2XEH A; 4U7I A; 3DSU A; 4PJM A; 4BA9 A; 2CG2 A; 1HNX T; 2UUC T; 4WBO A; 5JDH A; 2WXP A; 2DI4 A; 2D5U A; 1D0X A; 5H6R B; 1DNP A; 4HOQ A; 2FJB A; 3G2U A; 3P4S A; 2CWY A; 2XEE A; 3MA5 A; 4YDO A; 3RJV A; 4TXQ A; 2BKG A; 2B0O E; 5FL1 A; 5DBK A; 5FY1 A; 3VRA A; 3R6N A; 2HPL A; 5LGU B; 3RAU A; 3R7R A; 4NPP A; 2VKJ A; 2EHO B; 2YKS A; 3ZMV B; 3ZXS A; 3LG7 A; 2BKO A; 2V4H C; 1AWC B; 1LKX A; 4JEH A; 4AQY T; 4UQY A; 1BR0 A; 1FIO A; 1UJJ A; 2N2N A; 3NOG D; 4Z8X A; 3CKC A; 3CHM A; 5LOV E; 4F6R D; 3SZ7 A; 3T8K A; 2GK9 A; 5CBN A; 5J08 A; 3AA1 B; 3L6A A; 4TZ4 C; 4UQX A; 1TEZ A; 1MMG A; 5AQG B; 3P4R A; 1XNQ T; 4U04 A; 4DLQ A; 2LXM A; 2QC9 A; 5AQL B; 2HPJ A; 4YDY A; 4UQZ A; 3PRE A; 3RK6 A; 1D9S A; 3PZ3 A; 2LSI A; 3FBZ A; 4QX7 B; 3EUH A; 5ABG A; 3T8O A; 1V55 E; 4AKG A; 4N5Q A; 1R8I A; 4JW1 A; 5HYA A; 2V7J A; 2WXJ A; 2ZGG A; 1N94 A; 3ISM C; 2LAH A; 3LY8 A; 3FU6 A; 2KLQ A; 2IJG X; 3A8Y C; 4X5T A; 3OXL A; 3KEA A; 4MHC A; 5FL0 A; 4JZY A; 3I4G A; 3JC6 C; 5AQU B; 2V7I A; 3AED A; 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