3FATA

X-ray structure of iglur4 flip ligand-binding core (s1s2) in complex with (s)-ampa at 1.90a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
GRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of agonist recognition by the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor 4
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 4
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 88
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fatA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fatA02
4YKIA 4POXA 5ICQA 1MH4A 3CRBA 4FECA 1M5FA 4C0RA 4AB6A 2OK2A 3DP6A 5DVFA 1N7WA 2O7IA 3GBAA 3BFTA 4HCWA 4LVQA 2XXUA 4RYAA 3TTKA 3C35A 4HW8A 4R74A 1POY1 3TTRA 4NE4A 1B51A 3TDJA 1FW0A 3K01A 2Z8DA 4HS7A 3VXCA 4BDQA 4ZZEA 1DOTA 3CFLA 4DXCA 3T96B 4YKJA 4ESWA 2Z8FA 2FNCA 3RT8A 3KEIA 1OMPA 2D3IA 5DEXB 3EHSA 4DXBA 1S7YA 2Q2AA 1NL5A 1ZJLA 1OQGA 4ELQA 3O2AA 1B5IA 3N5LA 1R1NA 4GL8A 4KFQA 4NF5B 4OEUA 4ECFA 3IR1A 5I2NB 3DP4A 3KGCA 3T22A 1M5EA 4IGTA 4ZE9A 3RLFE 3JYRA 3IL1B 4OFJA 3PMXA 1H43A 1LB9A 3PD9A 2HQ0A 2DWIA 4GD5A 1XOCA 1MQJA 3USDA 3QAXA 4WEDA 3N26A 3G3IA 1I6QA 3PPRA 3G3FA 2XXYA 4H65A 2UVHA 2DSFA 3C33A 3RGYA 1YCJA 3A09A 3TCFA 3HPIA 3O6IA 4EQBA 1URDA 4K3FA 4G68C 3B6WA 3TTLA 3CFZA 4R2FA 4RA1A 3DELB 4YB7A 3C9HA 3FVNA 3G3HA 2VP1A 2XXXA 2HZLA 3G3KA 1PBQA 3H3GA 2I0BA 3G3JA 1FQBA 2A5TA 1I6AA 1CE2A 3FD3A 3PPQA 4QSEA 3I5OA 3UA8A 1B4ZA 1B5HA 5BUUA 1MY3A 2HFBA 1P1OA 4F3PA 3PUWE 1PC3A 3VDFA 3PV0E 2GFEA 2M8CA 5H8HA 5H8SA 1FTMA 4OHNA 4G8HA 4QFKA 4E0XA 3VXBA 2PX1A 4YB6A 2HEUA 2I58A 3W15C 5AA4A 1HSJA 3PU5A 2W7YA 3A3CA 2RCBA 1FQFA 4F22A 1SD3A 1SW2A 5HPQA 1GVCA 3TODA 4ESXA 4FIMA 3PUYE 4EQ7A 3M3KA 5F7VA 5H8FB 1N0TA 2H4IA 3MP1A 4F2QA 3CG1A 3IB0A 1H44A 3RTFB 2F35A 1BLFA 2QSXA 4POWA 5B70A 4U1ZA 1FQCA 3VFJA 2O1MA 4R9FA 2F7BA 1B3HA 4JWYA 4ZZAA 1B3LA 3UORA 2Z22A 4N13A 5K2XA 5JK4A 2D5WA 4U4XA 5CM6A 1F9BA 4H5GA 2UVIA 1A8FA 1A40A 3ZSFA 1AOVA 4QRZA 1Y1ZA 3TCHA 4GFRA 1JVYA 4C1TA 4IO4A 3PPPA 4Z0IA 4AB5A 2XX9A 4QFOA 2QPQA 5DEXA 3VV5A 1LGBC 1NMUA 4G8MA 3D4GA 3DLNA 2Y7PA 4NF5A 4OVJA 4F1VA 5I2NA 4KR5A 3RNNA 3CSGA 1TXFA 2HAVA 2DOJA 3BFUA 5I57A 2GHBA 3O28A 2QMWA 3PUXE 3L6HA 5L9OA 1N76A 3LSFB 1MQHA 3OSQA 3OO7A 4BDOA 4R6HA 2NWJA 4MF3A 4MH5A 3MBPA 5KDTB 4RK9A 3U94A 1SW4A 3OEMA 1MY2A 4GVOA 1LBCA 2H5YA 2NXOA 1Z7NE 2XXPA 1URGA 5CBRA 1P1QA 3T93B 2QMXA 3GXAA 1IXIA 1HSLA 4X1DA 3BBRA 1QUIA 4U1OA 4ZE8A 5CI5A 4XXUA 3EN3A 2D21A 1MM7A 2RF1A 1AL3A 3SERA 3K6UA 1L5TA 1D3KA 4H1XA 5ITPA 1WDNA 1Q1KA 1O63A 4OENA 3MP6A 4LUBA 5AE4A 4F29A 4TLMB 1N84A 3R6UA 3U8QA 1FTLA 5FHNA 1RKMA 4FEBA 1SQYA 3IAZA 5FHOA 3I6VA 3H03A 3QIMA 3F11A 3V83A 5CBSA 3FV1A 1EZOA 5TPAB 4TOZA 1OIBA 5H8NB 4QSDA 2YLNA 1QULA 1LBBA 1ZIUA 3EQ1A 5DT6A 4HCYA 3Q28A 3ONMA 3QUFA 1ZTYA 3FVOA 5EYFA 4Q30B 2X7PA 1AH5A 5I2KB 4QF9A 2OZZA 3BKIB 4LA9A 1R9QA 4JWXA 3RY3A 4QFLA 1A99A 1QUJA 1GTKA 3FGSA 1WVJA 2REGA 4NF6B 4DXUA 4F1UA 2GRVA 2QS1A 3KG2A 5IKBA 4GQOA 2ONSA 3PPNA 4TQUQ 1JW1A 3QXMA 3KSXA 3IB2A 1Y20A 4I1DA 4JSDA 5FHMA 3KOSA 5H8FA 1VFEA 4G68B 3K1MA 2F6PA 4U22A 2XXVA 2Z8EA 4F2OA 2RKMA 2DVZA 2UYFA 1H76A 4M1VA 1OVTA 4Q5TA 2G93A 3MAMA 4YKKA 1YTVA 3S9NC 1IITA 4IO7A 1KWHA 4YZZA 1UTHB 3GZGA 3PUVE 2RC8A 3IX1A 1EH3A 4QSCA 3TMGA 2HZKA 3K02A 1NNTA 3H6VA 3K4UA 1FTJA 1PB7A 3HV1A 3N94A 5L9SA 1GR2A 5H8QB 5I58B 1B0HA 1MS7A 1TFAA 4DLDA 2Y84A 4GXSB 2PT1A 1M5DA 4JBZA 1UIUA 3FXRA 2ZYNA 2KLFA 2HCAA 4R2BA 3SESA 2O51A 3Q27A 4FORA 2F7AA 4KCCA 1IUDA 3IOTA 3HHGA 2YJPA 4MLQA 3S9MC 2V25A 2NVUB 2H98A 3JV9A 3FZVA 3E4RA 1B5JA 4U4SA 5DVJA 3VVDA 4EDPA 4PQJA 3TKDA 1M5CA 3FVGA 3FIRA 3MQ9A 4BDMA 1SVXB 4X48A 5TU0A 1MPDA 4F18A 3PPOA 4OWDA 3P7IA 3K0VA 2I3WA 3S9EA 4OEVA 1USYE 4FAJA 5KDTA 3OSRA 2UVGA 3SEXA 4GRKA 4ELPA 4RY1A 4FE8A 1B7ZA 4F3SA 1D9VA 3ILUB 4OFLA 2DYXA 1EU8A 2HAUA 3IO6A 2E0SA 3IOUA 2R9JA 3OXNA 1II5A 3Q26A 2OCUA 1B05A 3H6TA 4ELOA 3SETA 3HCQA 3OOAA 2QRYA 1IXCA 2AIXA 4KHZE 3CFXA 3U93A 2REJA 3TTNA 5FTHA 1MM6A 3FXUA 4XIGQ 3U92A 3SEVA 4GXAA 1MXWA 1B32A 4OTEA 3OD7A 1SDXA 2PYYA 4EF2A 3KZGA 4O3AA 4XKRA 2F34A 4EXLA 3MVXA 2Q2CA 5TPAA 2QS3A 3EHUA 3HN0A 2IEEA 1VE4A 4ND9A 4O3BA 5H8NA 3KSJA 1MRPA 3KBRA 3TPAA 1B6HA 5KZTA 1J1NA 4OFOA 2R71A 1D9YA 3DM0A 1FQDA 3FUZA 1JQFA 2VOZA 1PB8A 2DE3A 2CMOA 3VVFA 4YAHX 5I2KA 1DPEA 3SEYA 2PMSA 2Y7IA 2RC7A 3OO6A 4ZDMA 1MDQA 1ZU0A 1OQHA 4NEDA 1Y4TA 4R6YA 3SEWA 4O3CA 4M4GA 4IY6A 3R26A 1B3EA 1GV8A 3MWBA 5EHMA 2QS2A 2RCAA 1PBPA 5M2VA 4I9DA 4G68A 4G2ZA 4GF8A 4JDFA 2ZNTA 3HSTA 2G29A 2P0SA 4LONB 4JSOA 4UACA 1N04A 1MQDA 1UTHA 5JTYA 3M3FA 1P1UA 2QS4A 1LFHA 3WAEA 3IORA 2DQVA 1SYHA 1DPPA 1YPNA 2XX8A 2I4BA 3I3VA 1B40A 2B65A 1TWYA 4YKPA 3PD8A 3O97A 1QW0A 2F97A 5H8QA 5I58A 1UQWA 5K2YA 3U72A 2DWJA 3VE1B 1NNKA 2Q89A 4I8CA 2VGQA 1IXHA 4PFWA 4RPOA 4OMBA 1SW1A 3SDFA 3TFLA 1JW4A 3MVWA 3V5AA 2DP8A 3Q25A 3TELA 3TZAA 4NF4B 2ABHA 4YB5A 1DSNA 4PFTA 4N6PA 3LSXA 1LB8A 3S2VA 1IEJA 4PETA 4I62A 4RJZA 5DVIA 3O6HA 2OLBA 4IO6A 1A55A 4GOTA 4WKMA 1PDAA 1D4NA 4ZS9A 4HTGA 1MXZA 3CI8A 4PFYA 1IZ1A 2XD3A 4G8NA 4DCYA 4RXLA 3PUZE 3AXFA 4IB2A 3FJ7A 3ZKLA 3THIA 3E9XA 2V3TA 1B2HA 3OO9A 2OJTA 4IO2A 4U2RA 4R6KA 3IK6B 4OZ9A 2OWSA 3IB1A 5ITOA 2NUVA 1FQEA 4MFIA 2ANJA 5DYHA 3G3GA 3N6UA 1TT1A 2XXTA 3CR9A 3ECRA 1P1NA 3PMVA 2YPNA 3UN6A 3RT6B 4ISUA 2H99A 5I84A 2QJEA 1Y1MA 3HO7A 4WEPA 2ONKE 4H8JA 1ATGA 1XVYA 5CMMA 3KOTA 2B3FA 2AL5A 3D4CA 3S4UA 4NTLA 1JW5A 3K2DA 5JEIA 1MXUA 1FCKA 1MPCA 2V3UA 5TP9B 3UIFA 3FASA 2V93A 3L6GA 4KYDA 1B9JA 1XVXA 3W9WA 2O84X 3ODBA 3MPKA 3O66A 3C32A 4R72A 4EXKA 3N6TA 2UVJA 1QUKA 5B7DA 2XX7A 1UTBB 3PGFA 4RPNA 2DXRA 3KN3A 1A54A 1SYIA 3GBBA 4N07A 2ZMBA 3T9VA 1WODA 4DDDA 3A3UA 1BTJA 1NH8A 3M3LA 4FEDA 1LFIA 4KD5A 3E3KA 4ZECA 3FV2A 1T0KA 1FTOA 4Q8RA 1MY1A 1LFGA 1LAXA 1Z7ME 5F1QA 3K1NA 2ONRA 1NKXA 4DIGA 1B58A 3H7MA 1B7UA 4EUOA 4NWCA 1B3GA 1MH3A 1VFDA 2B3BA 4OESA 1EZPA 2XXRA 3VLVA 5AA2D 4OETA 3RTWB 2ZNUA 3PMWA 1IQ7A 1MY4A 1AMFA 2ZXTA 4NMYA 2DE4A 4PFUA 3R7XA 5AA2B 5L9MA 3VLWA 4H5FA 1FTKA 1FQAA 2E1SA 4DCXA 1Y3PA 3UGWA 3K6XA 4BDRA 1B4HA 3QUJA 4KYSA 4XKPA 2Q8JA 3FJMA 4XKNA 4NF4A 4XKQA 1HSEA 4TLLB 2XXQA 1LAGE 3O9PA 1B7HA 2Z23A 3OMBA 5KCJB 3KN7A 3VLUA 4ELRA 1S9TA 5J1DA 3T66A 5HM4B 3CSBA 4R75A 4U23A 1QVSA 1USYH 3Q29A 4U21A 4X1BA 1XT8A 3T9XB 2THIA 2F6GA 1DTZA 1P1WA 3C4MA 1SI1A 2GH9A 1SW5A 1CB6A 3RN8A 1R6ZA 2DXYA 2ZYOA 1MY0A 3W9VA 5CC2A 2I4CA 2XXHA 1VSOA 1I69A 2FYIA 5ELVA 2WKYA 3TYHA 2RC9A 3JZJA 4KYEA 4EF1A 4H8IA 2LAOA 1URSA 4IY5A 5I56B 3TUSA 3TQWA 1A8EA 1US5A 1Y4CA 3OENA 2OWTA 4WXJA 2PT2A 5AA1A 5FTIA 4BDNA 1JNFA 4C1UA 1B1HA 2VD3A 1POTA 2VD2A 1Y3QA 4KQPA 3DP8A 4F31B 4PE5B 4QFPA 1XC1A 4PP0A 2VHAA 1XHYA 2CZLA 3KJTA 1XS5A 5HBCA 3WAFA 2ZNSA 2I3VA 4OYVA 1Y3NA 2RINA 5I57B 2AL4A 4G77A 1I6BA 1S50A 2F5XA 1SI0A 1MXXA 3TQLA 1LCFA 5TP9A 4YMAA 1QJMA 2DVCA 3S9LC 3ILTB 3MJNA 1US4A 4OXVA 3MZ9A 1B52A 3TEPA 4QHQA 1UTBA 4YICA 4L17A 2XD2A 3H6UA 4P0GA 2FA7A 4EQ9A 3IOWA 3OO8A 2IA4A 3MC2A 3CIJA 1MXYA 3LUYA 5AA3A 1B1XA 2DS9A 4QFNA 3SKPA 3EF7A 4JWOA 1IIWA 1NFTA 1PB9A 3M8UA 3EPEA 1OLCA 1QKBA 3GLBA 1A7LA 3RUMA 4E0WA 1LLSA 3MW0A 2XXIA 4NF6A 4THIA 1JVXA 2A5SA 4FJPA 1TFDA 2HXWA 1N3XA 4JB7A 5ICTA 4ZEIA 2ZYMA 1H45A 2UYEA 3C31A 2XHDA 5I59B 2UXAA 1ZLQA 1H3DA 2ALUA 5AA2A 1YAEA 4GIZA 3IJXB 1M5BA 3H4ZA 5CMBA 3IJOB 4DE8A 3K1PA 3QYTA 3G7WA 1O64A 4F19A 3U1OA 4IO3A 4F3GA 3MPLA 2GHAA 5CMCA 3V8XB 4IO5A 3TCGA 5L8DA 1BP5A 3CG3A 3K6VA 4OERA 3O29A 3MUQA 5KCJA 4Z7EA 1RYOA 2H25A 2BJJX 5CMKA 2V3QA 2X26A 2ZYKA 3KFMA 5LOMA 1ZMGA 2V84A 4GLIA 2Y7KA 4F3BA 3QSLA 4JXIA 2P1SA 2PBWA 4RK2A 1NH7A 4NF8B 4RNSA 2F36A 3O6GA 1GGGA 1OLAA 3TAJA 4YU0A 5A5XB 2QL3A 4GWOA 1N7XA 2X7QA 4ONYA 4LP2B 4KI0E 5I56A 4OQOA 4AQ4A 4F1YA 4BLAA 3K6WA 4KPTA 2DWHA 2DE2A 5CRYA 4LZ5A 4LZ8A 2O69A 1MG1A 1NNFA 3FJGA 2O7UA 4H0WA 2NOOA 4F39A 3V89B 2AYSA 4MLVA 4UA8A 4BDLA 2F7CA 4LZ7A 3FATA 2I6EA 2P2AA 1EZ9A 1MXVA 3RQTA 3TTMA 4ZEBA 3OEKA 4IGRA 3MP8A 1MQIA 3T9UA 2PVUA 1R9LA 5EHSA 1LAHE 2I0CA 3MZBA 4P0IA 3MZ1A 3B6TA 2O6AA 3B7DA 2R6GE 1MQGA 4ZEDA 4GL0A 3C34A 2O1LA 3MVZA 4Q0CA 3LC8A 4XTCQ 4NWDA 1OVBA 3IOVA 3H6WA 5IAIA 3KJ7A 5DTBA 4YMBA 3VVEA 1B46A 3B6QA 3HHFA 3T9HB 1P99A 1LCTA 4G4PA 4DZ1A 1IXGA 1AIVA 1NNPA 2O68A 1B0LA 1QKAA 3C36A 1MPBA 1DMBA 3FVKA 2Q88A 2F8DA 1LAFE 2F78A 4LQ2A 5I59A 4ZEFA 4MBPA 2OBGA 4FATA 1JETA 4LATA 2I48A 1Q35A 3UP9A 4X9TA 2ESNA 4R73A 3E13X 3K00A 3MVYA 1ZKBA 3ZKKA 4H6DA 2Y7RA 5ISUA 2XXWA 1VR5A 1BKAA 3UK4A 1JEUA 1ZBMA 3KN8A 3LSLA 1RYXA 2A5TB 1LSTA 3SEUA 3OELA 1UIVA 1ELJA 1SBPA 4H67A 3FXQA 2I49A 1O7TA 3LSWA 5H8HB 3LR1A 2Y7WA 4ZEKA 2H9BA 3RPWA 2Q9TA 5BWJA 1N3WA 1BIYA 3LBSA 1B3FA 1PEBA 1MDP1 3IO4A 4LQ5A 4KCDA 5AA4B 3ZS6A 1JEVA 4NF8A 4P11A 3H06B 3EHTA 5JTYB 2DWAA 3CVGA 1Y9UA 1DTGA 3QK6A 1ANFA 4R9GA 5A5XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IZZA 4YKIA 4POXA 5ICQA 1MH4A 3CRBA 4FECA 1M5FA 1RDXA 4C0RA 4AB6A 2OK2A 3DP6A 5DVFA 1N7WA 2O7IA 3GBAA 3BFTA 4HCWA 4LVQA 1FTAA 2XXUA 4RYAA 5IZ3A 3TTKA 1NV5A 2PFYA 3C35A 4HW8A 4R74A 1POY1 3TTRA 4NE4A 1B51A 3TDJA 1FW0A 3K01A 2Z8DA 4HS7A 4O94A 3VXCA 1NI9A 4BDQA 4ZZEA 1DOTA 3CFLA 4DXCA 3T96B 4YKJA 4ESWA 2Z8FA 2FNCA 3RT8A 3KEIA 1OMPA 2D3IA 1YXIA 5DEXB 3EHSA 5DW8A 4DXBA 4MCOA 1S7YA 2Q2AA 1NL5A 1ZJLA 1OQGA 4ELQA 3O2AA 1B5IA 3N5LA 1R1NA 4GL8A 4KFQA 4NF5B 4OEUA 4ECFA 3IR1A 5I2NB 3DP4A 3KGCA 2WBDA 3T22A 1M5EA 4IGTA 4ZE9A 3RLFE 3JYRA 3IL1B 4OFJA 3PMXA 1H43A 1LB9A 3PD9A 2HQ0A 2DWIA 4GD5A 1XOCA 2XWKA 1MQJA 3KC0A 3USDA 3QAXA 4WEDA 3N26A 3G3IA 1I6QA 3FBPA 3G3FA 3ISPA 3PPRA 2XXYA 4H65A 2UVHA 2DSFA 1IMDA 3C33A 3RGYA 2WX9A 1K9ZA 1YCJA 3A09A 3TCFA 3HPIA 4PDHA 3O6IA 4EQBA 1URDA 5ET6A 4K3FA 4G68C 3B6WA 3TTLA 3CFZA 1NV1A 4R2FA 4RA1A 3DELB 1FPFA 4YB7A 3C9HA 3FVNA 4P3LA 3G3HA 2VP1A 4MAGA 3B8BA 3NOHA 2XXXA 2HZLA 1YZ0A 3G3KA 1PBQA 3H3GA 1FPGA 2I0BA 3G3JA 1FQBA 2A5TA 1I6AA 1CE2A 3FD3A 3PPQA 4QSEA 3I5OA 3UA8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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