3FATA

X-ray structure of iglur4 flip ligand-binding core (s1s2) in complex with (s)-ampa at 1.90a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
GRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of agonist recognition by the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor 4
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 4
total genus 88
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fatA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fatA02
1JQFA 4G8MA 3BFUA 3RY3A 1B0HA 3OEMA 1LAGE 1QUKA 5K2XA 4U2RA 1I6AA 1ZU0A 4N07A 2I49A 3PPPA 3K1PA 1ELJA 4F2OA 5CRYA 3O6HA 2ONSA 1QUIA 5TU0A 1LSTA 1FTOA 4U22A 4LUBA 4MF3A 3FIRA 3HN0A 5EHSA 2VOZA 3ILUB 1H76A 4NF4B 1B4ZA 1MM7A 2GRVA 1SDXA 3PD8A 1PBPA 2XD2A 3O97A 5AA1A 3W9VA 2O1MA 3V8XB 4G77A 1FTMA 1DOTA 1OQGA 2VHAA 4R2BA 5DEXA 1US5A 1B05A 2VD2A 3RLFE 5I56B 3PUVE 3FGSA 4MH5A 2O7IA 3TTMA 3QSLA 1DTZA 4H8JA 4QFLA 4IGTA 1B5IA 2Q9TA 3FJMA 3TCHA 4G4PA 3IB1A 3C35A 4IO4A 1URDA 4R75A 5TP9A 4HW8A 2PYYA 3Q26A 3T66A 3VVEA 2OBGA 1B40A 1JNFA 3QIMA 3TTRA 3O2AA 5KDTB 4KYDA 4H5GA 2XXVA 3UORA 2UVIA 1RYOA 2H25A 4YAHX 4F31B 3CRBA 3CSGA 3GZGA 2F7AA 2Z8DA 4DZ1A 3SEYA 4TOZA 2HXWA 1XS5A 4U21A 3IOWA 5H8HB 2I58A 1JETA 5CC2A 1UTHA 4LZ8A 1D4NA 1WDNA 5AA4B 3A3UA 4I1DA 5FTHA 4R2FA 1OVTA 4I8CA 4POXA 5JK4A 1N3WA 3LR1A 4P11A 2RC9A 3TCFA 2ABHA 1B6HA 1IXGA 3VVFA 4TLLB 1SI1A 2F35A 2E0SA 3K00A 2D3IA 1B58A 4IO5A 5K2YA 4QF9A 1UTBA 1JEUA 4R72A 3TDJA 1ANFA 5KZTA 2PBWA 1S7YA 4QRZA 2PT1A 1A55A 4PP0A 2QMXA 5I58A 1GTKA 2Y84A 2GHBA 5DTBA 4BDRA 2UVGA 1URGA 2RF1A 4RJZA 3K2DA 3PPNA 2ONRA 2OWSA 3M3KA 4OZ9A 2X7QA 4ZE9A 2B3BA 4C1UA 2I0BA 3K0VA 4ESWA 1LCFA 5AE4A 4OFOA 3UN6A 4FEBA 1BKAA 2OLBA 3OENA 3HO7A 2DWJA 2XXQA 4X9TA 3TTKA 4IO6A 1LAHE 2H5YA 4NF6B 3K1MA 1QULA 1FTKA 4NEDA 1VFEA 4MFIA 5BUUA 4G68A 3TYHA 2DSFA 4E0WA 2DVZA 4PFTA 4M4GA 1QKBA 4IO7A 5IKBA 1B3HA 1AOVA 2CMOA 4GRKA 1SQYA 1YTVA 3RNNA 3QUJA 5TPAA 4QFPA 1MS7A 3S4UA 5ISUA 1B7HA 4XKQA 5BWJA 2O51A 3OSRA 3FVNA 4ZZEA 2FYIA 4FJPA 3S2VA 4F3SA 1UTHB 5I2KB 2I4CA 1MQHA 4F22A 4E0XA 3UA8A 4ESXA 1NNPA 3ZSFA 2NUVA 1IXIA 4U1ZA 4YB7A 2ZYOA 4IY6A 3KFMA 4DE8A 3EN3A 2QPQA 3PPQA 3KJTA 5I2NA 3OD7A 3E4RA 4KPTA 4JDFA 5JTYB 1ZJLA 4QSEA 2XXIA 2A5TA 1FQAA 4F3PA 2DWHA 1D9YA 3PU5A 4QFOA 3N26A 4PE5B 5B7DA 4KD5A 4DLDA 5H8NA 4OFLA 1B7ZA 1UTBB 2ZNUA 2YPNA 1PB9A 3IO6A 1GV8A 1EU8A 1I69A 5J1DA 2OJTA 1A7LA 3ZKKA 3R7XA 2I0CA 3EPEA 4JBZA 1Y4CA 1MXYA 4DXBA 4R6HA 1H44A 3F11A 3FVGA 4Q0CA 4F39A 4NF8B 3PMWA 3H6TA 3IB2A 3ONMA 1AH5A 4IY5A 3OOAA 3CR9A 2O84X 3OMBA 4MLVA 3FVKA 3M8UA 3T9UA 2R6GE 5CMCA 4ZEIA 4NF5B 2F8DA 3TELA 3JYRA 3MVWA 1R1NA 2WKYA 3PPRA 4ELRA 5CMKA 2F6GA 3OO6A 3D4CA 1LB8A 2A5SA 1JEVA 4I9DA 4X1DA 4OEVA 3OELA 3VV5A 1N76A 1P1WA 3ODBA 3IX1A 4ELQA 4IO2A 2DQVA 2ZXTA 1BP5A 1B32A 3UGWA 1II5A 2VGQA 1DPEA 2F34A 3RTFB 2ZYMA 3PMVA 2XD3A 1B9JA 5I59A 4R73A 5M2VA 4F19A 4M1VA 2DWAA 4C0RA 2XXPA 4OTEA 3DELB 4XXUA 3VFJA 2R9JA 4OETA 5ITOA 1MXUA 3RPWA 4LQ5A 4KI0E 3MW0A 1S50A 5A5XA 1Y20A 1USYH 3CIJA 2HAUA 1QVSA 3MZ9A 3H6WA 4KCDA 1ZTYA 4EXKA 3T93B 1NMUA 1SVXB 4P0GA 3H7MA 2I4BA 3FV1A 4Q8RA 3TKDA 2F6PA 3RT6B 4MBPA 1NNTA 4ZE8A 5H8QB 1FCKA 3LSWA 3KG2A 5H8NB 3VDFA 4JSDA 4HCYA 3B6TA 5AA2A 4BDQA 4AQ4A 1LBBA 1D3KA 3WAEA 4KHZE 1IXHA 1ZBMA 4DCYA 5CBRA 2REJA 4ZEKA 4TQUQ 5JEIA 1Q35A 1MG1A 1MQJA 2HEUA 2OCUA 3A3CA 4QFNA 4XKPA 3PUXE 4H8IA 3IAZA 3RUMA 1MY1A 3TTNA 1EH3A 1LBCA 1MQDA 2THIA 2D5WA 3S9MC 1NH8A 1SBPA 1I6QA 3CFLA 1UIVA 3SEXA 3V89B 4THIA 3IR1A 1B0LA 3EHSA 3FJ7A 3CSBA 4R6KA 1O64A 1H45A 1AMFA 4GVOA 1SYIA 4UACA 1DPPA 2QMWA 3FVOA 3S9NC 1M5DA 2Y7RA 4XIGQ 3QK6A 3MPLA 1Y3NA 2ZYKA 5HM4B 1MY0A 3QAXA 2HQ0A 4JB7A 4KFQA 1R9QA 5L9MA 3FXUA 3TQWA 2BJJX 4NE4A 4BDMA 2QL3A 5H8FB 1MPDA 4X48A 3PV0E 5A5XB 4WEDA 4DIGA 3R6UA 3C4MA 2DE3A 3HV1A 5CBSA 4RNSA 3OO8A 3VLWA 4F18A 2GFEA 4WXJA 5CMBA 1Y9UA 3SESA 3MP6A 5ITPA 4RK9A 1MM6A 2AYSA 3SETA 1MDP1 2H9BA 4YMAA 3D4GA 4RPNA 5AA2B 5DVFA 3I5OA 4FE8A 1J1NA 2QS1A 3G7WA 1N0TA 4O3AA 5DVJA 3IJOB 1LFHA 2ONKE 1OVBA 3I3VA 2G93A 4PETA 2I3VA 2Q2CA 4YKIA 1FTLA 3USDA 3U93A 1P1QA 3S9EA 4NWDA 3Q27A 2Q8JA 1ZKBA 4XKRA 3H6VA 4R74A 4ELPA 3S9LC 3U1OA 1USYE 1LAXA 4KR5A 3C34A 4LP2B 3FXRA 4JWOA 3RQTA 3IO4A 5I57A 3CG3A 1PDAA 3KJ7A 3MVXA 4OYVA 3IORA 3HPIA 5L9OA 3G3FA 3KOSA 2ZNTA 1HSJA 3FUZA 4GL0A 3H4ZA 4QSCA 4RY1A 3OEKA 2DP8A 4RA1A 4H65A 3QYTA 3RT8A 2Y7KA 4OWDA 5DEXB 2Z8FA 4EDPA 1CB6A 3TEPA 1OLAA 2I48A 4XTCQ 5B70A 2Q89A 1ZLQA 2REGA 4P0IA 4KCCA 4LZ5A 1MH4A 1MXXA 1B3FA 1D9VA 3EQ1A 3JV9A 3MZBA 5TP9B 1IUDA 1QUJA 1B46A 1P1NA 3VE1B 1UIUA 3CVGA 1IXCA 4DXCA 4GL8A 5L9SA 4GIZA 1POTA 3DM0A 3N5LA 2Y7WA 2CZLA 3VXBA 1QKAA 3U94A 1PB8A 1DTGA 3HCQA 3TZAA 4Q5TA 3EF7A 2XX9A 1JVYA 5FTIA 2YLNA 1RYXA 4GXSB 2O68A 4RK2A 1TWYA 1MRPA 2UVJA 1B3LA 1FTJA 3T9HB 2AL5A 3BKIB 1FQEA 1EZOA 2VP1A 1B51A 2RKMA 4FORA 1SW1A 3QXMA 3I6VA 1PC3A 2UYEA 2E1SA 1TFDA 1FQCA 4GXAA 3O29A 4OHNA 1T0KA 4OXVA 3T9XB 2F5XA 3MJNA 4UA8A 1A40A 1GVCA 2XXTA 3TMGA 4EXLA 1JW1A 4HTGA 2DOJA 3CI8A 1B1XA 5ELVA 3K01A 1IITA 4OERA 4KQPA 5I58B 3W9WA 2F7BA 5I57B 1LLSA 2G29A 4RXLA 2Q88A 3N6TA 3O6IA 4Z0IA 1YAEA 2X7PA 4EUOA 1F9BA 3A09A 2F78A 4GF8A 3SEWA 3L6GA 2O69A 4HS7A 1B2HA 3N6UA 3DP8A 1Y1ZA 3MBPA 1IEJA 2HFBA 2O6AA 2P0SA 3TPAA 2PX1A 1EZ9A 2I6EA 5LOMA 2RCAA 3THIA 5AA2D 4O3BA 2P2AA 2ESNA 3DP4A 3H03A 3HHFA 3ZS6A 4G68B 3T9VA 3DLNA 1MY2A 3E9XA 1QJMA 3B6QA 4BDOA 1OLCA 3E13X 5EYFA 2B65A 1B3GA 3IK6B 2DXRA 1M5CA 1FQFA 4FIMA 3K6UA 2F7CA 1SI0A 3LSXA 1B3EA 2I3WA 3CG1A 5TPAB 1LB9A 1MQGA 3AXFA 3O66A 4OEUA 1VFDA 1XC1A 1A8FA 4ELOA 3K6VA 1IIWA 1R6ZA 4MLQA 3KBRA 3TFLA 2PVUA 4FEDA 1UQWA 3ECRA 4XKNA 3C33A 2Z23A 3SKPA 1SYHA 3H6UA 4YB5A 4GFRA 3CFZA 5I2NB 1N3XA 2D21A 5KDTA 3M3FA 1M5FA 3W15C 4H6DA 3H06B 4PQJA 2A5TB 4U4SA 4LA9A 4EF2A 3KSXA 2DS9A 2RC8A 3PUZE 4ND9A 3G3GA 2R71A 5CI5A 4O3CA 3TUSA 4YICA 1P1OA 5H8HA 3IB0A 3KSJA 4IGRA 5I84A 3IJXB 1NKXA 1ZMGA 1JW5A 1O7TA 2YJPA 5AA4A 1RKMA 1AIVA 4X1BA 4QFKA 1M5BA 2B3FA 1NFTA 4PFWA 2UVHA 3MVYA 1BTJA 3MVZA 3O9PA 1MY3A 1Y4TA 3T96B 3LSLA 3LBSA 2OK2A 3OO9A 3G3KA 2NVUB 4WEPA 3FXQA 4PFYA 1N84A 3T22A 4BDLA 4NWCA 1PB7A 5F7VA 1YCJA 2H4IA 1SW4A 5DVIA 1Q1KA 4ZEDA 1Y3PA 3R26A 2Z8EA 3MAMA 1N7WA 1XVXA 2XXYA 3WAFA 4OVJA 2W7YA 3E3KA 1FQDA 1B5JA 3SEUA 4GQOA 3TCGA 3MZ1A 4RPOA 2V25A 3B7DA 4QHQA 5I59B 2NWJA 2XXUA 4ONYA 1OIBA 1MPBA 1XVYA 2V84A 1DMBA 1P1UA 1CE2A 1Z7NE 4TLMB 1LGBC 2QSXA 3UP9A 3GBBA 3IL1B 4NF6A 3TAJA 3K6XA 1BIYA 3U8QA 1B7UA 4H5FA 1L5TA 5CMMA 2XXHA 1A54A 4H1XA 2QS3A 4FECA 4F2QA 3C32A 2VD3A 4C1TA 5HBCA 5CM6A 1O63A 4Q30B 1M5EA 1TFAA 2V3TA 4YB6A 5I2KA 1YPNA 3BBRA 2DE2A 5KCJA 2XXWA 1PEBA 3TODA 1WODA 5EHMA 3EHTA 4U23A 2V3QA 4HCWA 1MQIA 4ZDMA 3O28A 4LVQA 1IQ7A 3G3HA 3KN7A 3LSFB 1MXVA 5JTYA 3GXAA 3C9HA 1XHYA 2HZLA 3K6WA 3GLBA 4Z7EA 1HSLA 4L17A 3VVDA 3P7IA 2IA4A 4DCXA 5L8DA 2H99A 4YZZA 3MP1A 4R6YA 2LAOA 3JZJA 3N94A 2AIXA 1NH7A 4AB5A 2QS4A 3KN3A 2O7UA 1MH3A 2KLFA 2FA7A 4OMBA 1Y1MA 2ANJA 1ATGA 1OQHA 4IB2A 4NF8A 2ZNSA 3EHUA 3G3IA 5FHOA 4LONB 3U72A 4OQOA 4YKKA 2HCAA 1EZPA 4GWOA 3VXCA 4QSDA 4N13A 4NF5A 2XHDA 4ZECA 3MUQA 4F3BA 3G3JA 3KEIA 1N04A 2DYXA 4BLAA 5AA3A 4BDNA 4AB6A 2ZMBA 4LZ7A 3C36A 1DSNA 1QW0A 2QJEA 2NOOA 2UXAA 2O1LA 5HPQA 3KOTA 1H3DA 1VR5A 2Q2AA 3RN8A 1LFGA 3FV2A 4YKPA 1NL5A 3PGFA 4YU0A 1NNFA 5ICTA 3QUFA 1P99A 1US4A 3Q25A 2XXRA 3PMXA 4RYAA 2P1SA 2F97A 1AL3A 2GH9A 1MY4A 3OSQA 2XX7A 3MWBA 1LCTA 4H0WA 2ALUA 3GBAA 3FD3A 1VSOA 3LC8A 4NTLA 2DXYA 1R9LA 3BFTA 3PD9A 1FW0A 1XT8A 5KCJB 3MPKA 2Z22A 3PUWE 3SDFA 4I62A 4F29A 1A99A 1JW4A 5IAIA 3B6WA 1TT1A 2OWTA 3FJGA 2XX8A 3UIFA 5DT6A 5H8QA 1NNKA 1SW2A 3MQ9A 4FAJA 2AL4A 3PPOA 4YKJA 1GR2A 3M3LA 3OXNA 3MC2A 4DDDA 3ZKLA 4U4XA 4R9GA 5F1QA 1ZIUA 3MP8A 1Y3QA 3O6GA 3C31A 2RCBA 2ZYNA 3IOVA 4YMBA 1MPCA 2PT2A 2PMSA 2IEEA 2V93A 1N7XA 1IZ1A 2GHAA 2UYFA 5FHMA 1MXZA 4H67A 4IO3A 3ILTB 3U92A 4KYEA 4ISUA 3SERA 2HAVA 1PBQA 3IOTA 2Y7PA 4FATA 1JVXA 2M8CA 3Q29A 4EQ9A 4GD5A 3K02A 2Y7IA 1LAFE 4NF4A 4F1VA 1GGGA 4U1OA 2OZZA 1SW5A 4EQBA 3VLUA 3CFXA 4EQ7A 2F36A 3H3GA 4R9FA 1KWHA 3FATA 1B1HA 2QRYA 3LUYA 3UK4A 2XXXA 2RC7A 4DXUA 1S9TA 1A8EA 5I56A 3HSTA 1MXWA 2V3UA 4JXIA 1VE4A 5H8SA 1SD3A 4GOTA 1B5HA 3IOUA 1I6BA 4ZEFA 3RGYA 2DVCA 4KYSA 1OMPA 3K4UA 2QS2A 4N6PA 3OO7A 3SEVA 1URSA 4K3FA 4PFUA 4NMYA 1WVJA 5H8FA 3V5AA 1HSEA 1POY1 3RTWB 3HHGA 4G8HA 3KZGA 4OFJA 4OENA 2DE4A 4F1UA 2RINA 4ZS9A 3KGCA 3VLVA 4POWA 3KN8A 1TXFA 2FNCA 2HZKA 4F3GA 5ICQA 4LATA 4ECFA 2X26A 3TQLA 4WKMA 4ZEBA 4JWXA 4G68C 4ZZAA 3TTLA 4EF1A 1B52A 1BLFA 2DWIA 1XOCA 5DYHA 1LFIA 4F1YA 2NXOA 1Z7ME 4G2ZA 4OESA 3L6HA 5FHNA 3FZVA 4G8NA 1MDQA 4GLIA 3K1NA 4JWYA 1FQBA 3PUYE 3FASA 1H43A 4JSOA 2H98A 3Q28A 3DP6A 1B4HA 4LQ2A 3V83A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JQFA 4G8MA 3BFUA 3RY3A 3KC0A 1B0HA 4HXVA 1G0HA 3OEMA 1LAGE 1QUKA 5K2XA 4U2RA 1I6AA 1ZU0A 5I7IA 4N07A 2I49A 3PPPA 3K1PA 1ELJA 4F2OA 5CRYA 3O6HA 2ONSA 1QUIA 4GBWA 3PTYA 5TU0A 1LSTA 1FTOA 4U22A 4LUBA 4MF3A 3FIRA 3HN0A 5EHSA 2VOZA 3ILUB 1H76A 4NF4B 4I3YA 1B4ZA 1FPEA 1MM7A 2GRVA 1SDXA 3PD8A 1PBPA 2XD2A 1LBXA 3O97A 5AA1A 3W9VA 2O1MA 3V8XB 4G77A 1FTMA 4NAPA 1DOTA 1OQGA 2VHAA 4NQ8A 4R2BA 5DEXA 1US5A 5I5PA 1B05A 2VD2A 3RLFE 5I56B 3PUVE 1DK4A 3FGSA 4MH5A 2O7IA 3TTMA 3QSLA 1IMDA 1DTZA 4H8JA 4QFLA 4IGTA 1VDWA 1B5IA 2Q9TA 3FJMA 3TCHA 4G4PA 3IB1A 3C35A 4IO4A 1URDA 4R75A 5TP9A 5EQ7A 3GYYA 2PYYA 3Q26A 4HW8A 3T66A 3VVEA 2OBGA 2V4CA 1B40A 3LV0A 4NG7A 1JNFA 3QIMA 3TTRA 3O2AA 5KDTB 4KYDA 4H5GA 2XXVA 4P8BA 4GX4A 3UORA 2UVIA 4I40A 1RYOA 2H25A 2MKZA 4YAHX 4F31B 3CRBA 4MX6A 3CSGA 3GZGA 2F7AA 2Z8DA 4DZ1A 3SEYA 4TOZA 2HXWA 1XS5A 3NOHA 4U21A 3IOWA 5H8HB 2I58A 1JETA 3BIHA 5CC2A 1UTHA 3T1BA 4LZ8A 1D4NA 1WDNA 5AA4B 3A3UA 4I1DA 3HFUA 5FTHA 4R2FA 1OVTA 4I8CA 4POXA 5JK4A 1N3WA 3LR1A 4P11A 2RC9A 3TCFA 2ABHA 1B6HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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