3FD3A

Structure of the c-terminal domains of a lysr family protein from agrobacterium tumefaciens str. c58.
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
207
structure length
207
Chain Sequence
RVTLNIATNADSLGTWFLDAVSKFTGGSDYLVNIAVDDQDHTVEWLRGGRVLAAVTAHDKPVQGCRVTPLGVLRYHATASPDFMARHFADGVTPAALARAPGLTFNQKDRLQASWIRTALGEDVSYPTHWLPSTDGFVKASLAGMGWGLNPVQLVAEHLAAGRLVELMPGTPLDIPLYWQVNRLAAERLAGLTANMVGTARVVLMPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the C-terminal domains of a LysR family protein from Agrobacterium tumefaciens str. C58.
rcsb
molecule keywords chromosome replication initiation inhibitor protein
molecule tags Transcription regulator
source organism Agrobacterium tumefaciens str.
total genus 61
structure length 207
sequence length 207
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fd3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fd3A02
1RYXA 4R9FA 1MY4A 3QSLA 1PEBA 2H98A 2YPNA 4RNSA 1ZMGA 2HCAA 4QFOA 3UGWA 1QJMA 4MFIA 1MY2A 4NF5A 1B2HA 5KDTA 3D4GA 5F1QA 2OWTA 3U8QA 3LR1A 1B4ZA 1MXUA 3ILUB 3M3FA 3OXNA 1Q35A 5A5XA 2DXYA 2E1SA 2FYIA 1SDXA 1GVCA 4OQOA 4M1VA 3MPKA 5CRYA 2PT1A 3QIMA 3RQTA 2A5SA 2QSXA 1TFDA 3G3FA 4JSOA 4HTGA 3TELA 3KSJA 2Y7RA 5CMCA 4OXVA 3HN0A 3KOSA 2G93A 2XXQA 5I56B 1MM6A 4FJPA 1DTGA 4DCYA 3FASA 4KYSA 4IO5A 1MPCA 1MQIA 4U1OA 4MBPA 3T9XB 1VE4A 4EQ9A 2PT2A 4C0RA 4LZ8A 1OQGA 3MVZA 2X7QA 3PUVE 1Y1MA 4F18A 2XX8A 5IKBA 4DCXA 1IUDA 1BIYA 1N0TA 3C9HA 1XOCA 3FXRA 3LC8A 1OQHA 2RC8A 4U23A 5AA1A 3CFLA 3I5OA 1RKMA 2F5XA 3RN8A 3LBSA 4NF6B 2A5TA 3VVFA 3IJXB 2WKYA 4RK9A 1UTBA 4ZZEA 4YMAA 1M5CA 3UK4A 2ZYOA 2I4CA 3FVOA 3T9HB 3V8XB 5L9MA 3O6IA 3PPOA 3OMBA 1LFIA 2QRYA 3TCGA 3TFLA 2RCAA 4LUBA 4QRZA 2Z23A 5EHSA 1LAXA 4G68B 4RXLA 3PMVA 3H6WA 2OJTA 3C31A 3N26A 2D3IA 3K0VA 2XX7A 4BDOA 2XXXA 2V84A 5LOMA 3OO8A 1B3LA 5CBRA 1XS5A 2QS4A 1NH8A 1NKXA 1B5IA 3U93A 3JV9A 5DYHA 2O68A 1SI0A 5H8HB 3QUJA 3QAXA 1MQJA 3IAZA 3KJ7A 2DOJA 1FW0A 4NF4B 4L17A 3PD8A 3B6QA 5DTBA 1I69A 2DQVA 3VLWA 2BJJX 4XIGQ 2ZYNA 1DOTA 4POXA 1NNFA 3HHFA 1Y3QA 1JVXA 2R71A 3B7DA 1QUKA 2H4IA 2THIA 4F3GA 3BFTA 1T0KA 3TTKA 5I58B 2HEUA 4IO3A 1S50A 3OELA 4IO2A 1H76A 5TP9B 3B6WA 1MS7A 2P0SA 3O29A 1P1QA 4F31B 3SEYA 1R1NA 2YJPA 1AMFA 1L5TA 3M8UA 5FTIA 1R9QA 3Q28A 4U4SA 2RF1A 3K01A 4X1BA 4Z0IA 4UA8A 1NNTA 2Q9TA 4GD5A 4POWA 1UIVA 3K1PA 3QYTA 1GR2A 4PFWA 4MLVA 2UVHA 5I59A 2V3QA 2UVJA 4G4PA 4EQBA 5AA4A 2D21A 1PC3A 4GXAA 3EN3A 3VE1B 4U2RA 4YU0A 3IL1B 1MPDA 1P1UA 1MXZA 1FQDA 1WODA 3OENA 3DP6A 3HPIA 1LLSA 4EQ7A 2FA7A 2Z8DA 3H6VA 2XXRA 3S9NC 1D9YA 1MXVA 1MRPA 5ISUA 1VFDA 1LFHA 4E0XA 3KZGA 5KCJB 3C34A 1LBCA 2I6EA 2NWJA 3S9EA 3BKIB 2AL4A 3W9WA 3U1OA 5H8FA 4AB5A 4YMBA 3OO9A 2M8CA 4WXJA 1MH4A 3TKDA 3TTMA 1PDAA 4QF9A 3VFJA 2QMWA 3PPPA 2DVCA 5L9OA 4H67A 3CR9A 4JSDA 5TU0A 2G29A 3FD3A 1NFTA 4U1ZA 3KN7A 4GRKA 1B52A 5ITPA 3UN6A 1DSNA 3PUYE 5J1DA 3KFMA 1OLAA 3K6WA 1Y3NA 4OFJA 2ZMBA 1N76A 2LAOA 4HW8A 4PFTA 1JW1A 3PV0E 1B05A 1VFEA 4WEPA 5I2KB 4XKNA 3S9LC 3S9MC 1DPEA 2Y7IA 1J1NA 4LVQA 3VLUA 1SW2A 2OWSA 1XHYA 2V25A 1HSLA 3CI8A 5FHOA 3JYRA 1URGA 5BUUA 4PP0A 1PB9A 1Y1ZA 4RK2A 5F7VA 4G77A 3O2AA 2F7AA 3TMGA 4PFUA 5HBCA 3SEWA 4FEDA 1Z7NE 4IB2A 2PX1A 3HHGA 4LQ5A 3H4ZA 4ZEIA 3EHUA 1P99A 3VV5A 3SETA 1MY3A 1KWHA 1Y4CA 2Z8EA 2F35A 1LSTA 3IJOB 2DP8A 4E0WA 4OFOA 2UVGA 1NMUA 1A54A 2CMOA 1FQFA 2H9BA 1LFGA 3MVXA 4R73A 4YKKA 4P0IA 3CFZA 3RUMA 3F11A 1XVYA 1ZBMA 3N5LA 1B4HA 2FNCA 4F1VA 1FQCA 1MM7A 3U92A 3KG2A 4BLAA 2QPQA 4O3BA 1BP5A 1B46A 1MDP1 1FTMA 5I2NB 2NUVA 1O7TA 1P1NA 3GBAA 4ELPA 1M5DA 4GIZA 1URSA 3M3LA 3HO7A 1FTLA 3PPNA 2ZYKA 5H8NB 4JBZA 3G3GA 3DM0A 3KN8A 1QUJA 2ZNUA 1AOVA 1XC1A 2P2AA 1A7LA 4KD5A 2Y7KA 3K6XA 1R9LA 1QVSA 1ZJLA 2Z22A 4OEUA 1USYE 2XXVA 4PQJA 2PBWA 3FJ7A 4FE8A 5EYFA 3S2VA 2ABHA 4NMYA 3MVYA 1N3XA 3PU5A 2RINA 3CG1A 3H03A 1SW1A 2E0SA 4EDPA 1S7YA 2REGA 4I8CA 2ZNSA 3HV1A 4X1DA 5ELVA 2HFBA 2IEEA 3E13X 3TDJA 1FCKA 3KEIA 4LATA 3FGSA 4NF5B 1B3EA 1USYH 4R6KA 5KDTB 4AB6A 3V89B 2UYEA 4XTCQ 2Y7PA 2O1MA 1SVXB 1ELJA 4NWCA 3MP6A 3FV2A 3SEXA 1P1WA 3QK6A 3RT6B 4YB7A 1JVYA 4OENA 3MW0A 5I57A 3AXFA 2DE4A 1OMPA 3C35A 3R26A 3FVKA 2I49A 4EXKA 1LAHE 4PE5B 3C36A 1GTKA 3BBRA 3TTLA 3T93B 1MQHA 4OVJA 5TPAA 4I9DA 2VHAA 4G8HA 4G8MA 3FZVA 2ESNA 4KCCA 2H5YA 4ZEKA 1QKAA 4ZEBA 2V3UA 4C1UA 2ONKE 3GBBA 1FQBA 3KBRA 4TLLB 1Y9UA 4Q5TA 1MH3A 1D3KA 2W7YA 4RY1A 3MZ9A 4ZZAA 3EHTA 3H06B 4DE8A 5CMKA 4OFLA 1M5EA 4MF3A 2A5TB 1OLCA 3ILTB 3MP8A 1JW4A 2B3BA 1D9VA 1B7HA 1UTBB 1A55A 1M5BA 5EHMA 1VR5A 1P1OA 2Q8JA 3K6VA 2HAUA 1LCFA 3PPRA 1EU8A 3O97A 1YTVA 1Z7ME 4FORA 2O1LA 4KI0E 4WKMA 1GGGA 4R2BA 3C32A 1UTHA 4NF8B 4ZEDA 4NE4A 2VOZA 1O63A 3L6HA 4ELRA 1PB7A 4WEDA 5DVFA 3MWBA 1US5A 3VVEA 3FUZA 4OWDA 2I3VA 1MY0A 3K6UA 4UACA 3HCQA 1JETA 5ICQA 4IGRA 1M5FA 2DWJA 2RC7A 3FATA 4OEVA 3UIFA 4KYDA 3TODA 1N7WA 4LZ5A 4H5FA 5AE4A 1MDQA 4H8IA 1N84A 3K2DA 2V93A 3T96B 4NEDA 4ZECA 4Z7EA 5AA2A 4F1YA 3G3HA 4BDQA 4U22A 3QXMA 4ELQA 3BFUA 4OESA 3ZS6A 3C33A 1DTZA 1I6AA 4FAJA 1I6QA 2AL5A 3C4MA 3A3CA 4DIGA 3PGFA 3RY3A 2I0BA 3RNNA 2PYYA 2DXRA 2X26A 3LSFB 4YZZA 1B58A 1SQYA 3O6GA 5I59B 3G3KA 4N6PA 5AA4B 3TQWA 3H3GA 5FHMA 1ZU0A 2PMSA 1IITA 4Q30B 3MZBA 1A8EA 4QHQA 2RCBA 1UQWA 5H8QB 4OETA 4EXLA 2Q89A 4R6YA 5AA2D 2VP1A 3IX1A 5KCJA 3T66A 2Q2CA 3EPEA 1QUIA 1QW0A 2O7IA 2GRVA 1YCJA 4ZE8A 1IZ1A 4LONB 4IGTA 2I4BA 1XT8A 2UYFA 4GXSB 5H8FB 3T9VA 3MQ9A 1Y3PA 3K1MA 2XX9A 3TCHA 1TT1A 3PD9A 1H3DA 2CZLA 2I58A 5DVJA 5BWJA 3PUZE 3IOVA 4ELOA 4YICA 2F6GA 1IEJA 3TCFA 4GVOA 5IAIA 5B70A 2GFEA 4F19A 3OD7A 3VLVA 4KHZE 4LP2B 3FXQA 2ANJA 1JW5A 3IOTA 3E9XA 4EUOA 1SW4A 1TXFA 3PPQA 1Y20A 1CE2A 2O84X 4O3CA 3UA8A 3LSWA 4THIA 3RGYA 4QFLA 3ZKKA 2DSFA 4DLDA 3I6VA 4R75A 2V3TA 4LZ7A 3VXCA 3DELB 5JK4A 1HSEA 4N13A 4I1DA 1F9BA 3CSGA 4PFYA 3RLFE 4OZ9A 2VD2A 3S4UA 2ZXTA 1IXIA 4QSDA 4YAHX 5L8DA 1A99A 1B0HA 1FQAA 1DPPA 2ALUA 3TTNA 2Q88A 2Y7WA 4YKPA 1B3FA 2GH9A 4AQ4A 3E4RA 1WVJA 4ND9A 1MXXA 4JWYA 4RA1A 2XXPA 3K02A 4P0GA 4QFNA 4H5GA 2F78A 4F29A 3KN3A 3SEUA 2O69A 3TTRA 4DXCA 3A09A 4EF2A 1A40A 1NNKA 1SYIA 2XXHA 1EZ9A 4M4GA 1IQ7A 2AYSA 5M2VA 5L9SA 1MXYA 1Q1KA 1ANFA 4F3PA 1RYOA 4OTEA 5JTYA 4DXBA 1NL5A 5ITOA 2H25A 1II5A 4YB5A 4F39A 2HZKA 3FV1A 3MPLA 3TYHA 1EH3A 2AIXA 5DEXB 1B1XA 3OSRA 2XD2A 3WAEA 3KSXA 4KR5A 3O66A 1B0LA 4ISUA 4NTLA 3FVNA 3IOWA 4O3AA 1LB9A 2RKMA 2ZYMA 1SYHA 2XXIA 1BLFA 4DZ1A 1XVXA 5CM6A 1EZPA 3PMWA 2QS1A 1PBQA 4EF1A 3EF7A 4G8NA 1UIUA 2F8DA 2HQ0A 3MVWA 3IB1A 1O64A 3PMXA 1MXWA 2OBGA 3SERA 1NH7A 4OHNA 2DVZA 3IB0A 3KGCA 4F2QA 4JDFA 5A5XB 3OOAA 1Y4TA 2XHDA 2O6AA 5I84A 1TWYA 2KLFA 1HSJA 4QFPA 2DYXA 5ICTA 1AIVA 3N94A 4QSCA 1B32A 4DXUA 2QS3A 3U72A 1US4A 3O9PA 1POTA 4G2ZA 5FTHA 5I57B 3PUXE 3ZSFA 4XKRA 2R6GE 2Y84A 4GOTA 5B7DA 4X9TA 1WDNA 3R6UA 5FHNA 5I56A 2NOOA 1OIBA 3LSLA 1SBPA 5TPAB 2P1SA 3FVGA 4MH5A 4K3FA 4IY5A 3FIRA 3IR1A 2F7CA 2UXAA 3ZKLA 3MAMA 3E3KA 2H99A 3FXUA 1OVBA 5JEIA 4IO7A 2R9JA 1ZTYA 4NF6A 3MP1A 4YKIA 2IA4A 2ZNTA 3RTFB 4XXUA 1DMBA 4KCDA 3LSXA 4N07A 3ECRA 3ODBA 2DS9A 4GLIA 2XXTA 4BDLA 4PETA 5CMMA 3QUFA 1D4NA 4G68A 1JNFA 3JZJA 4TQUQ 1FQEA 4H0WA 1GV8A 2F7BA 3Q27A 3LUYA 5H8SA 3PUWE 1H43A 3EQ1A 1SW5A 2DWHA 1A8FA 4RPNA 4YKJA 1JQFA 3IK6B 5K2XA 2O51A 5H8HA 3IO6A 1IXCA 1ZIUA 4H1XA 4NF8A 2XD3A 1UTHB 4FEBA 2REJA 4NF4A 3USDA 3P7IA 3O28A 5K2YA 1ZLQA 1QKBA 1H45A 3EHSA 3MZ1A 4LA9A 3SESA 1I6BA 2NXOA 5HPQA 3VDFA 2I3WA 4TLMB 5CC2A 3CRBA 3SEVA 5DVIA 3L6GA 1B6HA 4ZE9A 4H65A 3THIA 4F1UA 4DDDA 3CIJA 5I58A 2D5WA 3G3JA 4Q8RA 4IO4A 5TP9A 4XKQA 4GFRA 5CI5A 3M3KA 1B1HA 2OK2A 2HXWA 4GL0A 1POY1 5AA2B 2B3FA 4P11A 2ONRA 3O6HA 4JWOA 4RJZA 4C1TA 3CG3A 5AA3A 3CVGA 2QL3A 3N6UA 4R2FA 1CB6A 3TEPA 4NWDA 1MY1A 2XXWA 4LQ2A 4RYAA 3RT8A 2B65A 1B3GA 4OERA 2DE3A 1FTKA 3K00A 1FTOA 1H44A 3R7XA 4QSEA 1LAGE 4R6HA 1B9JA 1AH5A 1PB8A 4F22A 1YAEA 3UORA 1JEVA 1FTJA 4U21A 4H8JA 4HS7A 3WAFA 2XXUA 1R6ZA 2Z8FA 3VXBA 4JXIA 4IO6A 5H8QA 3TZAA 2NVUB 3D4CA 3OEKA 1URDA 3TQLA 3RTWB 2PVUA 4BDRA 1IXHA 1SI1A 3MC2A 3KOTA 2HAVA 2VGQA 4GL8A 3SDFA 1LAFE 3ONMA 4RPOA 1B5HA 3T9UA 1MQGA 1N3WA 3W9VA 3SKPA 3KJTA 2OLBA 3MJNA 3I3VA 1N04A 1NNPA 1B51A 4JWXA 3GZGA 4IY6A 3V83A 4MLQA 1IIWA 3DP8A 2YLNA 1B40A 1MQDA 4KYEA 3T22A 4G68C 1VSOA 2F97A 4Q0CA 1ZKBA 3IB2A 3H6UA 2OCUA 1BKAA 3H7MA 3DP4A 4TOZA 1MG1A 3GLBA 3N6TA 4QFKA 4I62A 2Q2AA 5I2KA 4GWOA 1LCTA 3FJGA 1QULA 3Q25A 1YPNA 3OO6A 3UP9A 2XXYA 3IOUA 4R72A 4XKPA 3B6TA 4KQPA 2F34A 3GXAA 1SD3A 4R74A 3TUSA 2ONSA 3TPAA 1OVTA 4ONYA 1LB8A 1IXGA 3OEMA 4GQOA 3A3UA 2F36A 4JB7A 4FECA 4ZDMA 1B7ZA 2DWAA 4H6DA 4FIMA 1JEUA 5CMBA 2QJEA 3Q29A 2QS2A 2RC9A 2UVIA 4OMBA 4HCWA 3IO4A 4FATA 2GHAA 4F3SA 3HSTA 2GHBA 4OYVA 1B5JA 4BDNA 4BDMA 2HZLA 3G7WA 2OZZA 4ECFA 2I0CA 5DT6A 4X48A 4ESWA 4R9GA 5HM4B 4HCYA 5I2NA 3CSBA 1MPBA 1TFAA 3VVDA 1N7XA 1S9TA 2I48A 5H8NA 3W15C 3FJMA 4U4XA 3OSQA 4ZEFA 3MUQA 1LGBC 3K4UA 1EZOA 3CFXA 3RPWA 1AL3A 2QMXA 4KFQA 3Q26A 5JTYB 4GF8A 3K1NA 3V5AA 2DWIA 2VD3A 3U94A 1BTJA 3TAJA 4F2OA 3DLNA 3IORA 4KPTA 4YB6A 4ZS9A 5CBSA 1B7UA 5DEXA 3G3IA 4ESXA 3MBPA 1ATGA 1B3HA 3H6TA 4F3BA 2F6PA 2X7PA 2DE2A 1LBBA 3OO7A 1PBPA 2O7UA 5KZTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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