3FJ7A

Crystal structure of l-phospholactate bound peb3
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DVNLYGPGGPHTALKDIANKYSEKTGVKVNVNFGPQATWFEKAKKDADILFGASDQSALAIASDFGKDFNVSKIKPLYFREAIILTQKGNPLKIKGLKDLANKKVRIVVPEGAGKSNTSGTGVWEDMIGRTQDIKTIQNFRNNIVAFVPNSGSARKLFAQDQADAWITWIDWSKSNPDIGTAVAIEKDLVVYRTFNVIAKEGASKETQDFIAYLSSKEAKEIFKKYGWREH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Specificity of Campylobacter jejuni adhesin PEB3 for phosphates and structural differences among its ligand complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major antigenic peptide PEB3
molecule tags Protein binding
source organism Campylobacter jejuni
total genus 85
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fj7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fj7A02
2F35A 4F29A 2VOZA 5I84A 1SI1A 2V3UA 4ND9A 4F22A 3FGSA 1L5TA 4LP2B 3N6TA 1SDXA 3C9HA 5B7DA 4R72A 2H9BA 2UVGA 3G3JA 3SEVA 5I2KB 1OVBA 5A5XA 3SESA 4QRZA 2XXTA 5KDTB 3L6HA 4POWA 1LFGA 3GBBA 3O6GA 2THIA 2O68A 4NF4A 3CFLA 1BP5A 4U1ZA 1P1OA 1B05A 1GVCA 1A8FA 3OSRA 5HPQA 2Z8EA 3LUYA 2O1LA 2HCAA 1N7XA 3F11A 3WAFA 2W7YA 1BTJA 1JVXA 4ESXA 3O6IA 2REJA 3M3LA 2E1SA 3FJ7A 1IZ1A 4NF8A 1LLSA 1QKAA 3ECRA 2O6AA 2HEUA 3FIRA 3D4GA 1MH4A 3T93B 3VVEA 3KJTA 4ZEDA 4FECA 2ESNA 2PVUA 4DDDA 3USDA 5I56A 3RTFB 2ZNSA 4UACA 1B1XA 1LAFE 3IB2A 1F9BA 4EDPA 5CI5A 5AA2A 4ZE8A 5J1DA 4H6DA 4P0IA 4NF5A 1LCTA 1ZLQA 4AB6A 2ZNTA 1DOTA 4BLAA 4HTGA 2DE3A 2XX9A 3O66A 3MPKA 3A09A 4ISUA 3G3GA 1Y3NA 2Y7KA 3V5AA 1Y9UA 4H5GA 4KPTA 3K1PA 4QSEA 3MZ1A 4YMBA 2ZYKA 4TLLB 4F1UA 4WEDA 1B7ZA 1QUIA 1A40A 1DSNA 2Z23A 4KHZE 2YJPA 3IJOB 1FQFA 4NEDA 3CSBA 3TQWA 2VD3A 1PB9A 1TFAA 1P1NA 3TKDA 4BDOA 3O28A 2R9JA 2Q2AA 3H7MA 1JVYA 1WODA 3RNNA 4F3BA 3LC8A 3EQ1A 5FTIA 2R71A 4AB5A 3QYTA 3TZAA 2XXIA 3Q25A 4NF6B 4RK2A 1TFDA 1B3HA 2F36A 1DMBA 3U92A 2ZXTA 5I57A 1JETA 3RQTA 3CRBA 2ZMBA 4R2BA 4WEPA 2ZYOA 1QKBA 4FORA 3PPPA 2NWJA 3EHTA 3G3FA 3OELA 1ZIUA 3K02A 2RCBA 3ONMA 5AA2D 4YB5A 1FTOA 3K6XA 4H65A 3W9WA 2F6PA 3V89B 3SKPA 3M8UA 3MWBA 2PT2A 4YU0A 1IEJA 2DWAA 4DIGA 4PETA 1Y1MA 4JWOA 3TUSA 2Q8JA 3PUWE 3EHUA 4OXVA 4KFQA 5IKBA 1N0TA 4Z0IA 5F1QA 1FQAA 4N13A 1M5FA 3TTKA 2KLFA 3IJXB 3OO9A 1TXFA 2DWIA 5TP9B 2AL5A 5H8SA 3G3IA 1PEBA 4PFTA 2P0SA 3VVFA 4M1VA 3H3GA 4Q30B 3C35A 1UIUA 1AIVA 4PFYA 4JWYA 3FATA 1OVTA 4OETA 1H43A 1VR5A 3PMVA 5ISUA 3EHSA 3FUZA 5JTYA 4JB7A 3CFXA 2V3TA 3H4ZA 4GVOA 1LSTA 1NKXA 1MPBA 1IXCA 5I2NA 2F78A 2Q2CA 1GR2A 3N94A 4G77A 1MXWA 1N04A 3OXNA 3K1MA 2RF1A 3W9VA 2P2AA 2DVCA 1MXYA 2I3VA 3Q27A 3TAJA 1Y4CA 2HAUA 2O84X 4PP0A 2XXHA 4H5FA 2UVJA 1IXIA 4OESA 3FXUA 4NE4A 3GLBA 3K2DA 4RYAA 1UTHB 2LAOA 3B7DA 1XVXA 3S4UA 4BDRA 4RPNA 2NOOA 1MY1A 3TPAA 1OQHA 2XXQA 3OEKA 5JEIA 3FXRA 4KYDA 2DOJA 1LAGE 3HV1A 5ICQA 1SD3A 4FEDA 4JWXA 4JSOA 2QRYA 1IXGA 4XIGQ 4C0RA 3TTMA 1ANFA 5L9SA 3TFLA 1D4NA 4XKQA 1FQEA 5I59A 5EHSA 2ANJA 2NVUB 4F39A 3G3HA 1ELJA 2PX1A 4IO6A 4FIMA 4YKIA 5AA4B 1DPPA 2GHAA 5DYHA 3HN0A 1CB6A 4I8CA 1IITA 4LZ5A 2RKMA 1ZMGA 2XHDA 3MAMA 1QVSA 2XD3A 1ZJLA 3SEUA 4YKKA 4GL8A 2OWTA 4GFRA 4ELRA 1NH7A 2XXVA 1N3WA 2I58A 1HSLA 4NF4B 4K3FA 3ZKKA 2QS4A 1Y3QA 3O29A 4IY6A 4MLVA 2I48A 4YMAA 3MVWA 4EF2A 1B2HA 2DE2A 4YB6A 3DM0A 3RGYA 1I6QA 4MF3A 5DT6A 4DCXA 4L17A 2O7UA 3MVZA 4ZEIA 3EF7A 2GRVA 2QS2A 4GXSB 4THIA 2B65A 2DXRA 3H6TA 4JBZA 4E0XA 2ZYMA 1NNKA 4KD5A 4LQ2A 1I6AA 1AH5A 3IX1A 5AA2B 1JW5A 4ZEKA 3PUVE 3BKIB 1R1NA 3U94A 3UGWA 1RYOA 5KCJB 3U93A 1B3GA 1IIWA 1LB9A 3IOTA 1XS5A 3JYRA 1URSA 1MM6A 5FHOA 1Y20A 2QPQA 1LBCA 4OVJA 5CMCA 2UYFA 3CI8A 2DS9A 2Y7IA 1S7YA 1MY0A 4U23A 4ZS9A 4F2QA 2QSXA 1OQGA 1OLAA 1A54A 3QSLA 5H8NB 3FXQA 4EXKA 1Z7NE 3PU5A 5CMBA 5DVFA 2D5WA 1LAHE 1CE2A 2RC7A 4QFNA 4Z7EA 4GIZA 3OOAA 1BLFA 4H1XA 4JSDA 2IA4A 1XOCA 4F2OA 3VLWA 3P7IA 1XVYA 5IAIA 5DEXA 2HZLA 2ABHA 3K6WA 1UTBB 4LZ8A 3VLVA 5HM4B 3HPIA 4OZ9A 1H45A 3I5OA 3S9EA 4LVQA 2F34A 3UA8A 2QS1A 1ATGA 3D4CA 3C33A 3QK6A 4X48A 1HSEA 2X26A 3DP4A 1Y4TA 4U1OA 4F31B 4ELQA 1B3EA 1NH8A 4KYSA 1B4ZA 1AMFA 4NTLA 1USYE 1VFDA 3FV2A 4R74A 4I1DA 1VSOA 3Q28A 2VP1A 3B6QA 3CIJA 4ECFA 1B3FA 2HFBA 2ONKE 3TMGA 2XXRA 3PUXE 5H8HA 2XXUA 4TLMB 4UA8A 2H99A 1VE4A 1EH3A 2Y84A 4F18A 1D3KA 5L9OA 1OIBA 3PUYE 3LSLA 4MBPA 3G7WA 3R26A 1MXXA 4WXJA 4F3PA 2XX7A 2F7AA 1B46A 4TQUQ 3UIFA 4U2RA 3HHGA 1MXVA 3N26A 1R9LA 2AYSA 4HCYA 4R6KA 5I2KA 3VXBA 2A5TB 4YKPA 5F7VA 4YB7A 3HHFA 2ALUA 3PD9A 3ILUB 1SYHA 3MJNA 4N07A 3VXCA 4IO4A 3RT8A 3PMWA 5JK4A 1N84A 1FTJA 5CMKA 3KJ7A 3T66A 1MDQA 2QMXA 2GH9A 4U22A 1EU8A 1YCJA 2OCUA 3FVOA 3OO7A 2Q9TA 4ZZEA 2VD2A 4JDFA 4ESWA 5AE4A 4IO7A 1Y1ZA 4FE8A 3ZSFA 1MY3A 4DCYA 4PE5B 5AA3A 3DLNA 3I6VA 3JZJA 2Q89A 3KN8A 3LSXA 1A7LA 1S9TA 1SQYA 1SW1A 3KGCA 4X1DA 4TOZA 4WKMA 2OWSA 4POXA 5DVJA 2PMSA 4QF9A 4NWDA 5TPAB 3SEWA 4G68B 1GGGA 1B5JA 2V3QA 3OENA 1MM7A 4IB2A 3FV1A 3MBPA 4Q5TA 2HXWA 3CR9A 2FYIA 4BDNA 4OWDA 1URDA 4LATA 3BBRA 3VVDA 2F97A 4GD5A 4ZZAA 5I59B 3K0VA 1PB7A 4U4SA 3T9XB 3Q26A 5K2YA 5L9MA 3QAXA 4DE8A 4F19A 3E4RA 5H8QA 1QUJA 1EZ9A 4FEBA 1XT8A 1DTZA 1B32A 3PMXA 2UXAA 3S9NC 1B0LA 1URGA 1PC3A 1H3DA 1SW2A 3FVGA 1MPCA 5ITPA 1FQBA 3UP9A 4EUOA 4XKRA 2DQVA 4ZECA 3OD7A 2X7PA 3QUFA 2UYEA 1R6ZA 2QMWA 4XTCQ 4FATA 5I58B 1P1QA 1S50A 4QFLA 3TTLA 1JNFA 3SEXA 4OFLA 3GXAA 2V84A 3MPLA 4QFKA 3SETA 2VGQA 2NXOA 4IGRA 1MDP1 1MG1A 1FTMA 2ZYNA 4YKJA 4IO5A 2XD2A 4ZE9A 2RCAA 4Q0CA 4RY1A 5FHMA 3T22A 2QL3A 2I6EA 2R6GE 4G8MA 1AOVA 1B5IA 1OLCA 3ZKLA 2UVIA 1A99A 3A3UA 1ZU0A 3HCQA 4YZZA 3AXFA 1B9JA 3C34A 3ZS6A 1B6HA 4GXAA 2Q88A 1ZBMA 3T9UA 1IUDA 1T0KA 1RYXA 1QUKA 3PV0E 2UVHA 1D9VA 4PFWA 3MZ9A 3VE1B 1WDNA 1FTKA 3FJMA 5ELVA 4I9DA 4ZEFA 2XXYA 4GLIA 3QUJA 4EQ9A 1B52A 1Q1KA 4ZDMA 3TELA 5B70A 1R9QA 2X7QA 2D21A 4MFIA 4OENA 2DVZA 5CRYA 3C36A 1US5A 4HW8A 4F1VA 1LFIA 4ZEBA 4YICA 5KZTA 1POY1 1JQFA 2RC9A 1MY4A 3LSWA 1SBPA 5A5XB 1MQIA 5BWJA 3C32A 1M5DA 5K2XA 4MLQA 5TP9A 4DXCA 1Q35A 3PPQA 1BKAA 3O97A 3U8QA 3VV5A 2OBGA 1LBBA 4R75A 3PGFA 3RY3A 1N76A 3BFUA 3TCGA 2DXYA 2DWJA 5DVIA 3FVNA 3PD8A 4EQBA 3O9PA 3MP6A 3MZBA 1P1UA 5DEXB 2DE4A 3H6WA 4NF8B 4PQJA 4QFPA 3VFJA 4R6YA 2OK2A 3O6HA 1MY2A 4KYEA 3JV9A 3KOSA 1AL3A 1MPDA 3CVGA 4LZ7A 3M3FA 5I56B 1YPNA 4MH5A 4XKPA 4P0GA 3RT6B 1UTHA 2E0SA 1B40A 5FTHA 2RC8A 3IOVA 1B5HA 5H8FA 3H6VA 4O3BA 1M5BA 4NF5B 1QW0A 4G68C 4DXBA 1O63A 5BUUA 2DSFA 2H4IA 1ZKBA 3SDFA 4M4GA 4G4PA 2XXXA 4NMYA 2PBWA 2OJTA 3EN3A 5FHNA 3OO6A 4X1BA 2I49A 4DXUA 2HZKA 2M8CA 2V25A 1H44A 3R7XA 1MXZA 4RXLA 3SERA 4RJZA 3VDFA 4C1TA 3CG1A 2FA7A 5AA4A 3L6GA 4ELOA 3TODA 1MS7A 3H6UA 4IY5A 3KOTA 3HSTA 3OO8A 3B6TA 3U1OA 4GWOA 3MP8A 1LFHA 3EPEA 2Y7PA 2DWHA 4ELPA 3PPRA 2V93A 3IO4A 4IO3A 1FQCA 4H8IA 3PPOA 3ILTB 1II5A 2XXWA 4OQOA 3ODBA 2QJEA 4R73A 4EQ7A 4QHQA 5I57B 2NUVA 1XC1A 5ITOA 2F5XA 4QFOA 2B3FA 4OMBA 1UQWA 2Y7WA 4E0WA 3KZGA 2ONSA 3O2AA 4RPOA 1N7WA 3TQLA 4BDLA 3C31A 3UORA 2I4CA 1B0HA 3PPNA 1P99A 3TYHA 3W15C 3FVKA 1JEUA 3Q29A 3KG2A 2IEEA 1B1HA 4OERA 3S9LC 1QULA 3FZVA 5KCJA 1Z7ME 1FCKA 4IO2A 2BJJX 4GF8A 1LAXA 3PUZE 4OFJA 1RKMA 3K00A 2F7CA 1O64A 1H76A 3HO7A 5H8QB 1FQDA 1B51A 1GV8A 3SEYA 3IOUA 5CMMA 4KCCA 1JEVA 1EZOA 1KWHA 5KDTA 1TT1A 2G29A 5DTBA 1SYIA 3GBAA 5JTYB 3IOWA 3IAZA 1JW4A 4OEVA 4RK9A 5H8NA 5I2NB 1LCFA 3IR1A 1NNTA 3OSQA 3MUQA 2YLNA 3S2VA 1POTA 1I6BA 1NNPA 3B6WA 1NFTA 3CSGA 4LA9A 3E13X 4R9FA 3LR1A 3RUMA 2P1SA 4G8HA 2O7IA 1A55A 4ONYA 4G8NA 2DP8A 3K1NA 1UTBA 1LB8A 4OHNA 3K6VA 3MQ9A 3BFTA 4PFUA 3TDJA 4BDMA 3OMBA 4O3CA 4GQOA 3UK4A 3N6UA 1PBPA 2F7BA 2O1MA 3OEMA 1PBQA 1DTGA 2A5SA 4X9TA 3DP8A 3FD3A 2HAVA 4OFOA 4RNSA 3MW0A 1MRPA 1SI0A 1YAEA 1NMUA 3WAEA 5M2VA 1IXHA 1WVJA 2Z22A 3LBSA 4GL0A 3MVXA 3T9HB 1B4HA 3K6UA 1M5CA 1NL5A 1B7HA 2AIXA 1BIYA 4KCDA 3RTWB 2H5YA 3THIA 4F3GA 2I3WA 1DPEA 4YAHX 2WKYA 3IB0A 3UN6A 1MH3A 1OMPA 3G3KA 3KFMA 4EF1A 3I3VA 2OLBA 5TU0A 1US4A 2CZLA 3V8XB 2FNCA 4DZ1A 4XKNA 2A5TA 3MP1A 3IK6B 1P1WA 3FJGA 3KN3A 2YPNA 3RLFE 1MQGA 1A8EA 4O3AA 1SW4A 2HQ0A 1FTLA 1D9YA 4RA1A 4KR5A 4P11A 2B3BA 4H67A 3KN7A 3GZGA 3IB1A 4AQ4A 1M5EA 3H03A 4NF6A 1YTVA 3T9VA 3KSJA 5AA1A 4GOTA 4H8JA 1NNFA 2GFEA 1UIVA 4C1UA 5HBCA 3S9MC 3M3KA 2D3IA 3CG3A 1HSJA 2Z8DA 3K01A 3R6UA 1SVXB 3K4UA 4KQPA 3MVYA 2F6GA 4KI0E 1MXUA 4N6PA 1N3XA 1QJMA 3N5LA 3RN8A 3QXMA 4OTEA 1PDAA 5CBSA 3H06B 1MQJA 5H8FB 2PYYA 1SW5A 4XXUA 1O7TA 5L8DA 4NWCA 3MC2A 2F8DA 5TPAA 4IGTA 4G68A 3E9XA 2ZNUA 1MQDA 1XHYA 1PB8A 2RINA 5CM6A 1GTKA 3TCFA 1I69A 5CBRA 2VHAA 1USYH 3KSXA 2AL4A 5ICTA 3TTNA 2REGA 2I4BA 4LQ5A 5LOMA 3FASA 2O69A 3IO6A 2H25A 1VFEA 2XX8A 4OYVA 4R9GA 4R2FA 4OEUA 4H0WA 5EYFA 1LGBC 3IL1B 4FAJA 2PT1A 4I62A 4U21A 3LSFB 3IORA 4R6HA 4F3SA 2GHBA 4JXIA 4FJPA 3DELB 4QSCA 1TWYA 3E3KA 2Z8FA 4LUBA 3T96B 5I58A 3TEPA 2CMOA 2DYXA 4LONB 3C4MA 4U4XA 4HS7A 2O51A 2OZZA 5CC2A 2XXPA 2I0BA 3TTRA 4EXLA 1B3LA 2ONRA 3KBRA 2Y7RA 4GRKA 4DLDA 2I0CA 3VLUA 3DP6A 3U72A 1B58A 3TCHA 4BDQA 2H98A 1EZPA 3V83A 4QSDA 1IQ7A 1J1NA 1Y3PA 3QIMA 4Q8RA 1B7UA 2G93A 1JW1A 1FW0A 3CFZA 2QS3A 5EHMA 1ZTYA 1MQHA 4G2ZA 4F1YA 3A3CA 3RPWA 5H8HB 3KEIA 4HCWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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