3FJ7A

Crystal structure of l-phospholactate bound peb3
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DVNLYGPGGPHTALKDIANKYSEKTGVKVNVNFGPQATWFEKAKKDADILFGASDQSALAIASDFGKDFNVSKIKPLYFREAIILTQKGNPLKIKGLKDLANKKVRIVVPEGAGKSNTSGTGVWEDMIGRTQDIKTIQNFRNNIVAFVPNSGSARKLFAQDQADAWITWIDWSKSNPDIGTAVAIEKDLVVYRTFNVIAKEGASKETQDFIAYLSSKEAKEIFKKYGWREH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Protein binding
source organism Campylobacter jejuni
publication title Specificity of Campylobacter jejuni adhesin PEB3 for phosphates and structural differences among its ligand complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major antigenic peptide PEB3
total genus 85
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fj7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fj7A02
2X7QA 4YB6A 3KEIA 4UACA 3EHUA 1AIVA 4WEPA 3HHGA 3PUVE 3SDFA 4FAJA 1LAHE 4YZZA 3SEWA 4DXBA 2RCBA 4KI0E 1S7YA 4EQ9A 4MFIA 5I2KA 1QKAA 1SW2A 3KN7A 1Y4CA 3K6WA 3CRBA 3DP6A 3LBSA 3PPOA 1UQWA 3CSBA 1FQBA 4O3AA 1ZLQA 1A55A 1MRPA 1UIVA 3VXCA 1PB7A 1A54A 3PPPA 3MP1A 1VFDA 1ZIUA 2UVIA 4LONB 2ZXTA 3KGCA 2XXWA 1TWYA 3DM0A 3LR1A 4OVJA 4QF9A 3W9VA 1SW5A 1VSOA 3PPNA 3IJXB 1QUKA 5H8HB 1SW4A 4HCWA 3H6TA 1ZU0A 5J1DA 3RUMA 5KDTA 1Y4TA 3M3FA 1AH5A 5I58A 2UYEA 1N0TA 4XKPA 3RTWB 3MPKA 3T96B 1EZOA 1SQYA 2A5TB 1PC3A 3C34A 5AA2B 4F3SA 3VLWA 3KN8A 4ISUA 2X26A 4OXVA 2PBWA 2I0CA 3E4RA 1N3XA 2Y7RA 1MXYA 4LQ5A 3IOWA 4G4PA 4OFJA 2E1SA 1H44A 3ECRA 1MY3A 1LBBA 1MM7A 5F1QA 1LFGA 2QPQA 4N07A 2Q89A 4ZEFA 3O66A 5CC2A 2HZLA 3DLNA 3ILTB 3TQWA 3MVZA 4YKKA 2DOJA 1Y20A 4LQ2A 1BIYA 3S9MC 2XXXA 4OYVA 1TXFA 2O7UA 1IXIA 2H5YA 5ICQA 3D4GA 3IB2A 4JWXA 4AB6A 3KOSA 4FEBA 3KZGA 4E0WA 1H43A 3V83A 4FEDA 4BDOA 4Z7EA 1LB9A 4L17A 2F7BA 2YPNA 2A5SA 1POY1 2RINA 3WAFA 4XKNA 4KFQA 2HAUA 5A5XB 2XXRA 4LUBA 5H8QB 1TFDA 4KCDA 3FGSA 5AA4B 5IAIA 4ELRA 3FIRA 1YCJA 4FE8A 1WODA 4RA1A 5ISUA 3RGYA 4G68C 2Q2AA 3K6VA 1IZ1A 3SESA 1OQHA 2FYIA 1JQFA 2GHAA 4KD5A 1B7HA 3OD7A 4IB2A 2ALUA 3U8QA 3G3GA 1MPBA 1LBCA 5TU0A 1LSTA 3G3FA 3WAEA 4C0RA 5H8HA 3ONMA 4GIZA 3ZKLA 4MH5A 4GRKA 3N94A 5JEIA 2ZYNA 4M4GA 3UN6A 4POWA 4BDNA 1B58A 2Z8EA 1D9VA 2UYFA 3FVNA 3C35A 4ESWA 4DCYA 3SEYA 1EZ9A 4FECA 4O3CA 3PGFA 2QMXA 4Q0CA 3VE1B 3IX1A 4NF6A 2F7AA 2A5TA 2QMWA 4K3FA 2B65A 4IO2A 4XXUA 4GFRA 1FCKA 4Q8RA 2NUVA 3CR9A 5FHMA 3T93B 1L5TA 4JWYA 1QUIA 3R7XA 5FHNA 3B6WA 3FVKA 2QRYA 1FTMA 1FTLA 2NWJA 3UIFA 5H8FB 5K2XA 4OESA 4F31B 3OO6A 4IO6A 1JNFA 2XXPA 2XXTA 3C32A 2F6GA 2O69A 3K02A 3GZGA 4YICA 4F29A 2HEUA 5FHOA 1OMPA 5KZTA 5JK4A 2XXYA 4U2RA 3USDA 1KWHA 2Q8JA 2F34A 4OFLA 1FTKA 2YJPA 5ICTA 2F5XA 3MZ9A 4YKIA 3O97A 4GWOA 1XHYA 4NMYA 3ODBA 3CVGA 3PUWE 2DQVA 2AYSA 4QFNA 2I3VA 1O64A 1PB9A 4F2QA 4O3BA 1SVXB 1RYXA 3VLUA 1URSA 1SD3A 1MXUA 2OBGA 1QULA 3BFUA 4ELQA 4ZDMA 2DVZA 2HCAA 5AA1A 1UIUA 3PMWA 2ZYKA 5AA4A 3IORA 4E0XA 3TPAA 4NF5B 3SETA 4TQUQ 3HCQA 4R2FA 1MPDA 3LSFB 2PMSA 4EDPA 1Q35A 2X7PA 3MUQA 3G3JA 3I5OA 2XXQA 4JSOA 4OERA 4GF8A 3SEVA 4KQPA 3VVDA 3MPLA 2O84X 3HO7A 3SERA 3Q27A 3EF7A 2O1LA 3M3KA 3Q28A 2F97A 1H3DA 3TTNA 3JV9A 1YPNA 1RKMA 4GD5A 4RNSA 4OWDA 2B3BA 1Y3QA 3IB1A 2XX7A 4G8HA 1I69A 4PFUA 2DVCA 3MVWA 4GQOA 2ANJA 4EQ7A 3P7IA 2O7IA 4ND9A 1MS7A 4RY1A 3HV1A 1N7XA 4KPTA 1YTVA 5H8SA 3OO9A 3TUSA 3T22A 1PDAA 5EHMA 3TTLA 1B6HA 3TTMA 1LB8A 3PUZE 3TELA 1MM6A 4N13A 1B46A 4NF4A 3N26A 2VD2A 4JDFA 3VV5A 5H8FA 2PYYA 4BLAA 4GXAA 1Y1MA 2Y7KA 1LLSA 1BKAA 3EPEA 3OMBA 3T9VA 4U1ZA 2ZNUA 3TODA 1OLAA 4U4SA 1MY4A 1DTGA 4OTEA 1JW5A 5EYFA 4RJZA 3SEUA 2DWJA 5CMKA 4DDDA 3TDJA 1LFHA 1MPCA 4OENA 3AXFA 1IXHA 4ZE9A 3VDFA 4G2ZA 4H8JA 3MJNA 3DELB 4PQJA 4C1UA 2QS3A 1NFTA 5ITOA 3BKIB 3TCHA 3BBRA 4QSDA 2RKMA 2XXHA 1SBPA 4NF5A 5FTIA 1OIBA 3CG1A 1BP5A 1OQGA 1A99A 5JTYB 1JVXA 3MP8A 2CMOA 1NH7A 3IOUA 2XD2A 1B4ZA 1FQAA 4NEDA 4R6YA 1NMUA 4AQ4A 3VVEA 4QFKA 2Q2CA 5CBRA 5DT6A 3MZBA 5K2YA 5I84A 1NNKA 3G3HA 1Y1ZA 5HM4B 1ZMGA 2V3UA 3K6XA 4I1DA 4IO3A 4ZEBA 3MP6A 3GBBA 4H1XA 3TCGA 1B9JA 2ZYOA 3TMGA 4ZEDA 3G7WA 4JXIA 2GH9A 1SW1A 2XXUA 4Q30B 4HTGA 3U72A 2Y84A 3FV1A 3V89B 1SDXA 4OEVA 1VR5A 3CG3A 2IA4A 3QK6A 4H6DA 2D5WA 3U94A 3FXRA 4U4XA 3OEMA 1UTHB 1B7ZA 1P1NA 1Y9UA 1DOTA 3CSGA 4HW8A 3IOVA 2REJA 2PT2A 3KN3A 4QHQA 1B5JA 2V93A 1M5FA 3Q29A 4YMBA 3E3KA 4DIGA 4HS7A 3M8UA 2DWAA 3A3CA 3O6GA 2UVGA 4LVQA 3EHTA 2ABHA 1POTA 4BDLA 4RXLA 3K6UA 3UA8A 1FTJA 3IOTA 1B2HA 3U1OA 2WKYA 4XKQA 1B05A 4NF8B 1MQIA 2HFBA 3T9HB 4QFLA 2OJTA 3OOAA 1D9YA 1MXZA 4ZEIA 4ECFA 4IO5A 3RPWA 5B7DA 3B7DA 5I2NB 3Q25A 3OENA 1IXCA 4F19A 3JZJA 3TQLA 3EQ1A 1S50A 5DYHA 2DP8A 1I6BA 4LZ8A 5CI5A 2ZMBA 1US5A 1MY1A 2O68A 4X1DA 4F3BA 4G8NA 4ZZEA 2I4CA 5M2VA 1MDQA 2DWIA 4YB7A 1O7TA 1OVTA 4EXLA 3PMXA 4F22A 1PB8A 4X9TA 1LGBC 1FQEA 1M5CA 1SI1A 3FUZA 4P11A 3HHFA 3Q26A 2GHBA 3CIJA 1P99A 5AA2A 3G3KA 1B52A 3B6TA 2DXYA 4MLQA 3RNNA 1S9TA 4DCXA 2Y7IA 4JB7A 3RQTA 4KR5A 1A7LA 4KCCA 5I57B 3RT6B 3QAXA 3CFLA 1AOVA 1PBQA 2ONKE 3N5LA 4PE5B 3FXQA 3OSRA 3DP4A 2RF1A 1UTBB 2V3QA 1B7UA 4IO4A 5H8NB 3K4UA 4OEUA 3R26A 2ZYMA 1NL5A 4C1TA 1B5IA 5TPAB 1ZKBA 3TCFA 2ZNSA 4UA8A 1YAEA 3N6TA 1PEBA 4R74A 2HQ0A 1T0KA 1XC1A 5CBSA 1FQCA 1AL3A 4YKJA 2DSFA 2DE3A 3ILUB 4RK2A 2HAVA 3W15C 2AIXA 2ZNTA 4H0WA 5KCJB 1LAGE 4ZZAA 4RYAA 1XVYA 2UVJA 4WKMA 2DXRA 5DEXB 4I9DA 4YMAA 2GRVA 1MQHA 3H6WA 3MW0A 3PD8A 4TLLB 5A5XA 2P1SA 1LAFE 3S2VA 1B0LA 5H8QA 5AA3A 4QSCA 4RPNA 2DE4A 1IEJA 3VVFA 4DE8A 4KYEA 4GVOA 4F18A 1P1QA 1SYIA 5EHSA 1BLFA 1JEUA 1DSNA 2XX9A 4G8MA 4Q5TA 3VFJA 4R6KA 2VOZA 4DZ1A 3S9NC 4IY6A 3H6UA 5ITPA 4P0IA 1SYHA 1PBPA 2QL3A 3IR1A 4GOTA 2DS9A 1J1NA 4YAHX 1JW4A 1TFAA 1USYH 1EU8A 1P1UA 3H4ZA 4BDQA 2OWSA 3PUYE 4QFOA 4RK9A 3GXAA 3FZVA 2H25A 1XOCA 1OLCA 1Y3PA 4QSEA 3RY3A 4PETA 4ELOA 4OETA 1O63A 5BWJA 1URDA 3A09A 3K01A 3UGWA 1ELJA 3O6HA 3QXMA 1MH4A 5I56B 4GL0A 2IEEA 1SI0A 3H03A 3T66A 1IIWA 2RCAA 2B3FA 3PMVA 1GR2A 4F39A 2OLBA 2Y7WA 3M3LA 2QS4A 4PP0A 1UTBA 2VD3A 3KSXA 4FORA 5H8NA 4BDRA 2Y7PA 2V84A 1Z7NE 4QFPA 3FASA 4ZE8A 2AL4A 1P1WA 2R6GE 1H45A 1LFIA 2QS2A 3KJ7A 4EF1A 1QKBA 1US4A 1DMBA 3O2AA 4QRZA 1B5HA 3T9UA 1A8FA 2VHAA 1WDNA 3QUFA 1XT8A 3OELA 3OEKA 1NKXA 2H99A 4YB5A 4PFTA 4R2BA 3E13X 4NE4A 1GV8A 4GL8A 3PPRA 2XX8A 5KCJA 2P0SA 4IGRA 4P0GA 1USYE 4H5FA 2RC8A 5DEXA 1N7WA 2F8DA 3OXNA 5AE4A 4I8CA 1R6ZA 5DVIA 2THIA 4FATA 2PX1A 1HSJA 1VFEA 3OO8A 2NOOA 4THIA 3HSTA 3QIMA 2E0SA 1EZPA 4R72A 3A3UA 1LCFA 4R73A 2G29A 3W9WA 2V3TA 2Q88A 5CMMA 3KFMA 1A40A 5DTBA 2Z23A 4OHNA 3ZS6A 1GGGA 1M5EA 3HPIA 1XVXA 3O28A 1IXGA 3TFLA 3O29A 3KG2A 1N84A 1DPPA 1XS5A 1R9QA 2DE2A 1AMFA 4X48A 2W7YA 4LATA 1GVCA 1M5DA 2V25A 4KYDA 3I6VA 4NF6B 3KSJA 1ZBMA 1MY0A 3MVXA 4EQBA 4MBPA 5HPQA 5B70A 3RLFE 3V8XB 2D3IA 1QW0A 2O51A 4JBZA 4LP2B 3PD9A 3FJMA 3K2DA 2HZKA 4ELPA 4EXKA 2OCUA 4F1YA 1EH3A 1ZTYA 3H3GA 1IUDA 5I56A 5LOMA 5TP9B 4EUOA 1DPEA 1JEVA 3TKDA 2REGA 4KYSA 3TTRA 3MBPA 1NNFA 1ZJLA 4ONYA 3QUJA 2I58A 2I6EA 3IO4A 3S9EA 3IL1B 3IAZA 4RPOA 3C33A 2VGQA 1DTZA 3E9XA 3PPQA 1B3HA 3MZ1A 3DP8A 4JSDA 2LAOA 3MQ9A 4H67A 2Z8DA 5CMCA 3GBAA 1I6AA 1URGA 4U21A 2G93A 3MC2A 4H65A 3L6GA 4LA9A 3PV0E 2KLFA 1MH3A 3ZSFA 5BUUA 1M5BA 3B6QA 4IGTA 1R1NA 3R6UA 3OO7A 3U92A 1Z7ME 3FVOA 4POXA 4NWCA 5AA2D 3PUXE 1RYOA 4F1UA 3K1PA 3MWBA 2RC7A 3IJOB 1JW1A 3UORA 3VLVA 1F9BA 3FV2A 1MQGA 1A8EA 1H76A 3TEPA 1CB6A 4IO7A 2RC9A 2VP1A 4YKPA 3F11A 2R71A 3C31A 2GFEA 2Z8FA 5HBCA 1QUJA 2I48A 3PU5A 4R9FA 1FQDA 2O6AA 1D4NA 1MQJA 4OFOA 2O1MA 3LSLA 2FNCA 3FXUA 3ZKKA 5JTYA 4DLDA 5L9OA 1B1HA 1N3WA 2NVUB 4G68B 4Z0IA 1MDP1 5CMBA 2OK2A 3FATA 3KOTA 4G77A 2I0BA 4ZEKA 1B1XA 2XHDA 1IQ7A 1CE2A 3K1MA 3TYHA 4F3PA 3IO6A 1IITA 3SKPA 1II5A 2Q9TA 4ZECA 3RTFB 3CI8A 2CZLA 4OQOA 5F7VA 4FIMA 3CFZA 3N6UA 3TTKA 3TAJA 3O9PA 1QVSA 4NTLA 4WEDA 4H8IA 3KJTA 1B3LA 3FD3A 2DWHA 3LUYA 2OZZA 5TP9A 3U93A 2I49A 2QSXA 4NF4B 1N76A 5I59B 2YLNA 2Z22A 1B4HA 4AB5A 4ZS9A 1LAXA 3K1NA 1MG1A 2ONRA 1WVJA 1UTHA 4DXUA 3GLBA 1BTJA 2QS1A 4PFWA 4F2OA 2I4BA 3FVGA 1B3FA 5CM6A 3LSWA 5L9MA 2QJEA 2D21A 2NXOA 2XXIA 3LSXA 4MF3A 1HSLA 4N6PA 4IY5A 2F78A 1TT1A 3I3VA 3H06B 3SEXA 4R6HA 2UXAA 4TOZA 1MXXA 4ESXA 5I2KB 4XTCQ 2H98A 3FJGA 3VXBA 3QYTA 1I6QA 4MLVA 4NF8A 1B0HA 2AL5A 1NNTA 5L8DA 1MXWA 1LCTA 3EN3A 4KHZE 1JETA 2M8CA 1B51A 3EHSA 1B3EA 4OZ9A 2UVHA 2F7CA 4F3GA 3C9HA 2F6PA 5I2NA 3S9LC 3MAMA 3UK4A 4M1VA 3IK6B 3RT8A 3CFXA 3V5AA 4EF2A 2H4IA 3LC8A 3L6HA 4U23A 1D3KA 4LZ5A 4JWOA 4DXCA 5KDTB 1ATGA 1B40A 1NNPA 3K0VA 4HCYA 3T9XB 3UP9A 4XIGQ 5I58B 4G68A 1P1OA 2DYXA 4R75A 3H7MA 4U1OA 2PVUA 4XKRA 3KBRA 4YU0A 4PFYA 5IKBA 4OMBA 1NH8A 2F36A 2ONSA 1FTOA 4WXJA 4GLIA 4X1BA 1Y3NA 2P2AA 3FJ7A 3O6IA 2H9BA 2HXWA 1MY2A 3IB0A 1JVYA 3G3IA 2XD3A 1R9LA 4H5GA 2ESNA 4R9GA 4NWDA 4TLMB 4LZ7A 1QJMA 4F1VA 5L9SA 2PT1A 5DVJA 1MQDA 3S4UA 5I57A 1VE4A 2OWTA 3MVYA 3QSLA 1HSEA 1ANFA 4U22A 2I3WA 2BJJX 4GXSB 4I62A 1FW0A 3JYRA 1B32A 3TZAA 5I59A 3RN8A 3BFTA 4BDMA 3C4MA 3H6VA 1Q1KA 5DVFA 5TPAA 1OVBA 3D4CA 5FTHA 1MXVA 5CRYA 2XXVA 3K00A 3THIA 1N04A 5ELVA 3C36A 1FQFA 1B3GA 3HN0A 1GTKA 2R9JA 3OSQA 4FJPA 2FA7A 2F35A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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