3FJ7A

Crystal structure of l-phospholactate bound peb3
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DVNLYGPGGPHTALKDIANKYSEKTGVKVNVNFGPQATWFEKAKKDADILFGASDQSALAIASDFGKDFNVSKIKPLYFREAIILTQKGNPLKIKGLKDLANKKVRIVVPEGAGKSNTSGTGVWEDMIGRTQDIKTIQNFRNNIVAFVPNSGSARKLFAQDQADAWITWIDWSKSNPDIGTAVAIEKDLVVYRTFNVIAKEGASKETQDFIAYLSSKEAKEIFKKYGWREH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Specificity of Campylobacter jejuni adhesin PEB3 for phosphates and structural differences among its ligand complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major antigenic peptide PEB3
molecule tags Protein binding
source organism Campylobacter jejuni
total genus 85
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fj7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fj7A02
3RTWB 1LFHA 3IORA 5I57A 2NWJA 2ANJA 1N0TA 3RNNA 3K1PA 4H67A 1NMUA 1IQ7A 4OHNA 2Y7KA 3T9VA 4XKRA 1FQAA 2G93A 4E0WA 3N6TA 2O6AA 5CBSA 1A55A 3UK4A 1H3DA 1MH4A 1I6QA 4UACA 1B05A 1LAGE 1LB9A 3N5LA 3FXRA 1QUIA 2THIA 3TPAA 3FVKA 1BTJA 1TFAA 5K2YA 2DP8A 2H99A 4IO6A 5HBCA 3PMVA 1FQFA 2XXHA 4RY1A 4QFKA 5CI5A 1PB9A 3KJTA 1B5IA 2RC9A 2Y7IA 3ODBA 4RXLA 2I58A 1MQHA 5L9OA 4R75A 3DP6A 5K2XA 2OCUA 1LAFE 1P1OA 1B0LA 4EXKA 5KDTB 3KN3A 3P7IA 3VXCA 1M5FA 3LC8A 3W9VA 2RF1A 3TZAA 1BIYA 2H25A 4DXCA 1Y3PA 4HW8A 5HM4B 2O68A 1IIWA 1US4A 1RKMA 4KD5A 2Q9TA 2F35A 2RC8A 3N6UA 3TQLA 2PMSA 4OERA 2R6GE 2O7UA 5DVJA 1LCTA 1H44A 4LONB 1T0KA 3USDA 2V25A 5I84A 2OK2A 1QULA 4FORA 1US5A 3H06B 1A7LA 3GBBA 1Z7ME 4IO5A 4R9FA 3B6TA 4R74A 5DTBA 3OXNA 2ZXTA 3OEKA 1XC1A 1P99A 2DWIA 2D3IA 3S2VA 5JTYB 2F97A 4ONYA 1MH3A 3I6VA 4N13A 1NNFA 3Q26A 2HEUA 5BWJA 2B3BA 4F3GA 3RN8A 4NF4A 4G2ZA 1N7XA 2HAUA 3V83A 2QS2A 3L6HA 2RKMA 3C9HA 3TCGA 2XX8A 5I2KA 4GL8A 2V3TA 1AL3A 3EHSA 3KGCA 3IOWA 3CSBA 3SEXA 2ZYMA 3PUWE 1IUDA 1B3EA 1UTHA 2XXPA 1B1HA 3OO8A 1UTBA 3CI8A 3PGFA 2XXWA 2PX1A 4WEDA 1P1UA 1YCJA 3MZ1A 2NXOA 2XD3A 4F1VA 1L5TA 5AA2A 1AH5A 2PT2A 1B58A 4BDQA 1MQJA 3PPQA 3TQWA 5L8DA 2ALUA 1RYOA 2AL4A 4JSDA 2ZMBA 2I49A 1I6AA 2O69A 1D9YA 1MS7A 1RYXA 3G3JA 5TP9B 1B3LA 3FVGA 4EQ9A 3C32A 4I8CA 1B1XA 4NF5A 1S50A 1Z7NE 1B0HA 1MDQA 2OBGA 3JV9A 5EYFA 1JNFA 4MBPA 3D4CA 2M8CA 2DXYA 2H9BA 3H6VA 4OXVA 3TAJA 3O29A 3VE1B 1HSJA 1P1WA 2ZNSA 2I6EA 4AB6A 3VLUA 2I4BA 1EZOA 1A99A 4WXJA 1M5EA 2DYXA 3O9PA 3OENA 1FQCA 3IR1A 3A3CA 3KFMA 3MZ9A 3SDFA 4QFLA 3VVEA 4P11A 5H8FB 5H8SA 3E4RA 1MM6A 3K6UA 4YKKA 3HHGA 4GIZA 3ZSFA 4U1ZA 1JVXA 2XX9A 3LBSA 4GOTA 3TYHA 1OVTA 2DWJA 1XVYA 4GL0A 3LSLA 2CMOA 3B6WA 1UQWA 2REJA 3VXBA 3Q29A 2F7CA 4POWA 4ESWA 3DP8A 1MQGA 4G4PA 4C1UA 1TXFA 1PDAA 5DYHA 5H8HA 3T9HB 1AOVA 5DVFA 4LUBA 3VLVA 4F18A 4OEVA 1FTOA 1DMBA 5ISUA 3R6UA 4N6PA 2E0SA 1PBQA 4KI0E 1XHYA 4R2BA 4H5FA 2QS4A 4YICA 1A8FA 1ZIUA 4OESA 2LAOA 1JQFA 5EHMA 4EUOA 2VHAA 1MY3A 1USYH 3EN3A 4OQOA 3C4MA 3VFJA 4NF4B 4OYVA 1QW0A 4LQ5A 2AL5A 2I3WA 2PVUA 3S4UA 3E13X 2NVUB 3H4ZA 3TCHA 4F1UA 4ELOA 1N3XA 4MLVA 3G3FA 4NE4A 5I2KB 1UIUA 5H8QB 1SI0A 3OOAA 2ONKE 3RQTA 4ZECA 2QMWA 3K1MA 4TOZA 3T22A 1N7WA 1FCKA 3KBRA 4JDFA 4GQOA 4P0GA 3VVDA 3O6HA 3VLWA 4PETA 2F34A 3SERA 1UTBB 5ITPA 2Q2CA 3HPIA 1D3KA 4H65A 3ECRA 4YMAA 3M3FA 3QUJA 3C36A 1SW4A 1LFGA 1MXXA 3OO9A 3MBPA 2QJEA 3PMXA 4RK2A 1LBCA 4O3CA 3KOSA 1H43A 4OTEA 1N84A 5FTHA 3KZGA 4M4GA 3BKIB 1B3GA 1MRPA 2OWTA 3MVYA 3MP1A 1A40A 1BLFA 1PEBA 4LZ5A 4NF8A 1R9QA 3ZKKA 3HCQA 2DWHA 4EQ7A 5TU0A 3TEPA 4KYSA 4ESXA 2FYIA 1ZJLA 4IB2A 1MXVA 3B6QA 4FATA 5M2VA 4G8HA 1XT8A 2Q89A 1XVXA 1ZU0A 5L9MA 4OFLA 1B7HA 4ZE8A 1LLSA 3MAMA 1LB8A 3H6UA 1QVSA 4RA1A 1URDA 2KLFA 2HFBA 2Z22A 2XXVA 4RJZA 1OLAA 1R1NA 1II5A 5B70A 4F3PA 3IOTA 4XKNA 4QF9A 4FECA 3IX1A 3K2DA 1EZ9A 3A3UA 2F36A 5CMBA 3TUSA 3K6WA 3OSRA 4HCYA 5I2NA 4OWDA 2PT1A 3O2AA 1MPBA 2WKYA 1N76A 3C34A 4KR5A 3TTRA 4XKQA 2Y7PA 2CZLA 4GRKA 1SYHA 2XXYA 1SW2A 1O7TA 1EU8A 1H76A 3OO6A 1LAXA 4F39A 4MF3A 1LFIA 2VOZA 4GF8A 3G3GA 3ZKLA 5DVIA 2XXQA 5KZTA 1FQEA 3OMBA 2XX7A 4PFTA 3B7DA 1TWYA 3UP9A 1FW0A 4FJPA 2GHBA 4LZ8A 2DOJA 3DLNA 3C35A 1SVXB 4XKPA 1PB7A 4IY5A 3Q25A 4R72A 1Y20A 5B7DA 2Z23A 4KHZE 4KYEA 2QL3A 2VD2A 4LATA 3VVFA 5BUUA 3IL1B 4HCWA 3UIFA 3G3HA 1MXZA 4NWDA 5FHOA 2F6PA 1AMFA 4FIMA 3OD7A 3MUQA 4POXA 3IO6A 4I62A 3SKPA 4QRZA 1J1NA 5H8NA 3MW0A 3IAZA 1NKXA 3M3KA 1JEUA 2Y84A 3VV5A 3PMWA 2Y7WA 3V89B 1PB8A 2XD2A 1VFEA 3G7WA 2RC7A 3IJOB 4X48A 4PE5B 3ZS6A 2QMXA 3S9EA 2O51A 3LUYA 4R73A 5CMCA 1MY1A 1SD3A 4JWYA 2XHDA 1JW4A 1B3FA 5CMKA 3Q27A 2UYEA 3QK6A 1NNPA 1MY2A 1POTA 4U4XA 1QUKA 1R6ZA 4H6DA 4GXAA 3WAEA 2O1LA 4ZEBA 2UVHA 2Z8DA 1IXCA 2IEEA 3C33A 4LVQA 3LR1A 4IO7A 2DE2A 2UVJA 3D4GA 4EQBA 3RY3A 4R6KA 3TDJA 4GFRA 3K01A 4LA9A 1JVYA 4TLLB 2F5XA 2R9JA 1Y3QA 3FJGA 4HS7A 1SYIA 5A5XB 4YKJA 3MVXA 3G3IA 5ITOA 2HAVA 4PFUA 4IO4A 4JB7A 3CVGA 4HTGA 1OMPA 5I57B 1URSA 3OELA 3Q28A 4THIA 4FAJA 2D21A 4NF6A 1B4ZA 5KCJA 1S9TA 2UYFA 4ECFA 3CFZA 1BP5A 3H7MA 1YAEA 3CG3A 4ZEKA 2UVGA 4DIGA 2GH9A 1H45A 4H0WA 3PPNA 5AA3A 1B6HA 4DDDA 1DTZA 5I2NB 3U1OA 4MLQA 2Q88A 3RGYA 4Z7EA 2Q2AA 1B3HA 4OVJA 1JW5A 5I59A 1IITA 3PUXE 4FEBA 3U92A 4X1DA 4U21A 4K3FA 3TTNA 4LP2B 5TPAA 5I56A 2OLBA 2QPQA 3MQ9A 1OVBA 3S9MC 4OFJA 5AA1A 1JETA 1B46A 4ZEIA 4NEDA 3O6GA 4WEPA 1FTLA 2V3QA 3K0VA 1D9VA 1O63A 3G3KA 5I58A 1Y4TA 4N07A 1DSNA 1WODA 3TTLA 1AIVA 3FV2A 1B4HA 2XXIA 1B7ZA 4C0RA 1Y4CA 1B7UA 1B2HA 3H6WA 4DXBA 3W9WA 5FHNA 3UORA 3RPWA 2E1SA 1Y3NA 1KWHA 2X26A 4Q30B 3FD3A 3FXQA 4F22A 4MFIA 5L9SA 4IGRA 1MPCA 1LSTA 3JZJA 1HSLA 1VFDA 4YKIA 1EH3A 3OSQA 3KEIA 1MXWA 4C1TA 2DVZA 2BJJX 3RLFE 1CE2A 2XXRA 2A5TA 1B5HA 1MQIA 3F11A 2OJTA 1B40A 5KDTA 4ZEFA 3UN6A 4YB7A 2I0BA 3V5AA 2AYSA 2V93A 3FXUA 2NUVA 1P1QA 2XXUA 1I6BA 3N26A 3BBRA 4H8JA 5ICTA 1A54A 3EHTA 5CM6A 4QSEA 3MC2A 4GLIA 2P2AA 4YAHX 5DEXA 4KYDA 2DXRA 5LOMA 2F6GA 1QJMA 3R7XA 1DPEA 3S9LC 1VR5A 3K4UA 1UTHB 1D4NA 4U1OA 1IZ1A 3R26A 1B5JA 2X7QA 4ZEDA 3KN7A 3HSTA 5F7VA 1WVJA 5AA2D 5JTYA 1B9JA 4G8MA 3RT6B 4DXUA 1ZBMA 1NL5A 3QYTA 1IXGA 1ZTYA 2UVIA 1PBPA 3PD8A 4YB6A 3SEVA 5AA2B 4EDPA 4QFOA 1LGBC 4NF6B 5KCJB 3EHUA 2XXXA 3ILUB 3L6GA 5ICQA 2I0CA 3AXFA 3MWBA 5J1DA 1XOCA 1M5DA 4F29A 4QHQA 2A5SA 3UGWA 1MY0A 2ZNUA 3U94A 3SEUA 3E3KA 2R71A 2ZYNA 3IOVA 3O66A 3EF7A 4PQJA 4BDLA 4LZ7A 2P1SA 2AIXA 4JWXA 4U23A 4NMYA 2O1MA 2B3FA 4NF5B 4PFWA 5I59B 1Y1ZA 4R6HA 4KFQA 2PYYA 1SW1A 2I4CA 4MH5A 2HQ0A 2Z8FA 1MPDA 1MG1A 2F8DA 2Z8EA 5TPAB 5I56B 3O6IA 4DCXA 4OFOA 3OO7A 3JYRA 3KSJA 2HXWA 2GHAA 4DLDA 3HN0A 3MP6A 2I3VA 2V3UA 3BFTA 1M5CA 3I3VA 2REGA 4KQPA 5I58B 3MPKA 1MQDA 4IGTA 2RINA 3PPPA 1FTMA 4IO2A 1MM7A 1GTKA 4YB5A 3IB1A 3T93B 1B32A 1MY4A 5TP9A 3CRBA 3LSFB 3IK6B 2X7PA 5IKBA 2QRYA 3TELA 2GRVA 4AB5A 4JXIA 3QXMA 1LAHE 3A09A 5CC2A 2F7AA 4O3BA 5H8HB 2G29A 3I5OA 1JW1A 2HZKA 1ELJA 1Q1KA 3K02A 1B51A 3QIMA 2O7IA 4P0IA 1O64A 1IXHA 1WDNA 2A5TB 4H1XA 1ZLQA 1SW5A 3KG2A 5IAIA 3FGSA 3RUMA 4FE8A 2VP1A 4ELRA 3O28A 2YJPA 4E0XA 1LCFA 1FQBA 3O97A 3U93A 2I48A 3TTMA 4RPNA 3FVNA 2DS9A 5FTIA 5H8FA 3IJXB 4U2RA 1URGA 4F31B 4I1DA 4G77A 4G68C 2FNCA 2DQVA 4Q8RA 4RNSA 3TFLA 3PD9A 5DEXB 2ESNA 3E9XA 2W7YA 3KN8A 4DZ1A 4F2QA 4X1BA 3K00A 4XIGQ 4YMBA 1ATGA 4R9GA 2OZZA 3GZGA 3PUVE 3CR9A 3DP4A 1OQHA 3QAXA 1NFTA 1NH8A 3CFXA 4H8IA 4BLAA 1IEJA 2NOOA 3CG1A 1QUJA 1DTGA 4PFYA 3M8UA 4G68A 3ONMA 3V8XB 5JK4A 4GWOA 4TQUQ 5F1QA 3FVOA 3OEMA 4BDMA 3SEYA 4X9TA 5AA4A 1XS5A 1YPNA 3IB0A 1POY1 1I69A 3MVZA 4NF8B 3C31A 4BDNA 4KCCA 3PPOA 2Y7RA 4EF2A 1DOTA 3W15C 3SESA 5H8QA 2ZYOA 5HPQA 3TMGA 5DT6A 4IY6A 2DVCA 1N04A 4BDRA 2QS3A 3FJ7A 3BFUA 4O3AA 1SI1A 2IA4A 2ABHA 2F7BA 4OENA 4TLMB 1HSEA 4M1VA 1PC3A 3FUZA 4EXLA 3PUZE 3FATA 3GLBA 1EZPA 4H5GA 3IOUA 5CMMA 3T9XB 2H98A 1BKAA 1Y9UA 3KSXA 4U4SA 1UIVA 4R2FA 3WAFA 1SBPA 3RT8A 4QFPA 3H03A 3KOTA 3HHFA 1Y1MA 3DELB 1CB6A 1MXUA 1FTJA 4YU0A 2PBWA 3LSXA 3MPLA 4G8NA 3CFLA 2GFEA 4F19A 3PU5A 3KJ7A 4JSOA 3DM0A 4GVOA 4Z0IA 3K1NA 1GGGA 2P0SA 4UA8A 3ILTB 2V84A 3FIRA 4U22A 3TODA 1P1NA 2XXTA 4F3SA 4IO3A 5EHSA 4RPOA 4AQ4A 4XTCQ 4YKPA 2OWSA 3HV1A 4ZZEA 1FQDA 2H4IA 4NWCA 3CIJA 4OMBA 4L17A 2O84X 2FA7A 3PV0E 1F9BA 1NNKA 5FHMA 2DE4A 1NNTA 3VDFA 2F78A 4ZDMA 3S9NC 1QKBA 4KCDA 3T96B 1VE4A 3FZVA 4BDOA 4YZZA 4F3BA 1ZKBA 4FEDA 3SETA 1TT1A 3T9UA 2VD3A 1QKAA 3FASA 5H8NB 3TKDA 3THIA 4QFNA 1MDP1 3MJNA 2ONRA 3FJMA 2UXAA 5JEIA 5CBRA 3LSWA 4WKMA 2DE3A 2DSFA 3K6VA 5ELVA 2QSXA 1N3WA 1Q35A 4OZ9A 1OQGA 1S7YA 3RTFB 1TFDA 2QS1A 2ZYKA 1R9LA 3TCFA 2B65A 1SQYA 4LQ2A 4ZS9A 3IB2A 4Q5TA 4ISUA 2HCAA 4GXSB 1YTVA 4F1YA 4G68B 4KPTA 3N94A 2RCBA 1OIBA 1A8EA 2HZLA 1JEVA 1FTKA 1OLCA 4OETA 2ZNTA 1MXYA 4DCYA 1IXIA 2VGQA 4RK9A 5AA4B 1M5BA 1GV8A 3U72A 4EF1A 4R6YA 3IO4A 3CSGA 3SEWA 3FV1A 1B52A 3PPRA 3MZBA 3MVWA 4DE8A 4OEUA 4JWOA 2YLNA 4RYAA 4ND9A 4ZE9A 4PP0A 4QSCA 3EPEA 3GBAA 3EQ1A 4NTLA 1DPPA 4ELPA 2Q8JA 3H3GA 1GVCA 1USYE 4F2OA 3QUFA 1GR2A 4ZZAA 4XXUA 2DWAA 4QSDA 3T66A 5AE4A 3K6XA 2D5WA 3MP8A 3GXAA 3TTKA 4JBZA 4ELQA 2H5YA 4Q0CA 1VSOA 3M3LA 3QSLA 1SDXA 3UA8A 3U8QA 5CRYA 2RCAA 4GD5A 1ZMGA 1LBBA 1ANFA 5A5XA 2ONSA 3PUYE 1NH7A 4I9DA 3H6TA 3HO7A 2YPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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