3FV1A

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with dysiherbaine in space group p1
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv1A02
1POY1 4JXIA 2GHAA 1Y9UA 1A8FA 2P1SA 1SW2A 4K3FA 5ITOA 1SI1A 2IEEA 5L9SA 1N3XA 4PQJA 1S7YA 3IO6A 4C1TA 4KYEA 1NNPA 1N76A 1OQGA 4OTEA 2FA7A 2V3QA 3MUQA 3QIMA 3OO9A 1GGGA 4GOTA 4GXAA 4YKIA 4AB5A 4FEBA 3PUZE 3VDFA 1IXHA 2PT1A 3TUSA 4R6KA 2DYXA 1R9LA 2XXIA 3SEWA 2O68A 3R6UA 4H5GA 1NMUA 1VSOA 3UGWA 1B32A 2F34A 2NUVA 2OWTA 2FNCA 4I1DA 3B6TA 5TP9B 4E0XA 2DE4A 2XXWA 1MXZA 3PUXE 1MXXA 2XXPA 5BWJA 3CIJA 4H67A 5H8NB 4AQ4A 2HCAA 2QL3A 5K2YA 4KR5A 2ANJA 1WDNA 2QRYA 1RYOA 1ANFA 3A09A 1Q35A 2XX7A 3E13X 1NKXA 3CVGA 2Z23A 1N7XA 3VFJA 4R2BA 4RPOA 3UK4A 2DWHA 5CI5A 3MVZA 3K1PA 4DLDA 4IGRA 1WVJA 1ZLQA 5AE4A 2LAOA 1B5JA 2I0CA 2F7BA 3HN0A 2Y84A 3FXUA 3HPIA 3IO4A 4ISUA 5I57B 3VLWA 1O7TA 3QUJA 4R2FA 5M2VA 1N0TA 3G3FA 3OMBA 4JBZA 4OEVA 1Y4CA 2QPQA 3IB1A 1A8EA 3S9MC 4GFRA 3LSWA 1HSEA 2RINA 3C32A 3SEVA 3H6VA 5I2NB 1IQ7A 2UVIA 2ABHA 3IAZA 4YAHX 2UXAA 4ECFA 2DVZA 3U8QA 1MQIA 4FE8A 4FATA 3FGSA 2DWJA 3EPEA 1B9JA 4XIGQ 1B7HA 4UACA 3HHFA 3FVOA 2Z22A 1H43A 5ITPA 2HXWA 2F97A 1Q1KA 3MAMA 3PU5A 3PPRA 4IO5A 1TFDA 1ZKBA 1A40A 1TFAA 1MDQA 3TODA 3KN7A 1SW5A 3SEYA 5AA4B 4EUOA 3BFTA 5CMKA 2XXRA 4BDMA 4NTLA 2O1LA 3UN6A 1DTGA 1JW5A 1YTVA 4G2ZA 3TQWA 2DP8A 4GL8A 4ZZEA 2XXYA 2OJTA 3W15C 3SKPA 3Q25A 1B6HA 4N07A 4RK2A 1TXFA 2AIXA 3V5AA 4NF5B 1MRPA 2I58A 5CM6A 4F2OA 1VFDA 5KDTA 2G93A 3ODBA 1M5EA 4I8CA 1GV8A 2F8DA 4H1XA 1FTJA 4Q0CA 2F78A 3V8XB 2F6PA 3MP8A 1MY2A 2Q8JA 1M5DA 4EF2A 5JEIA 3V89B 1FTOA 4NF8B 3FV1A 1B3EA 2PX1A 3RUMA 1TWYA 3DP8A 1SYHA 1J1NA 4XXUA 3T93B 3W9VA 2PBWA 4U1ZA 2NXOA 1IUDA 2XX8A 1CE2A 4IB2A 3Q27A 4LP2B 3O9PA 1B4HA 5I59B 2A5TB 3U1OA 1DPPA 4X1BA 4IGTA 2W7YA 3IR1A 4GIZA 1IXCA 2XXUA 1I6BA 3KBRA 2O7IA 2NOOA 4H8IA 4FIMA 5A5XB 2V93A 1IEJA 2P2AA 4ESXA 2H25A 4QFOA 1P1WA 3GZGA 1IXGA 4YKJA 2IA4A 1YPNA 5DEXB 1N84A 5H8QA 4DE8A 4ND9A 4Q5TA 3MQ9A 4EQ9A 2A5SA 2E1SA 3FJ7A 3L6GA 4LONB 4KFQA 5JTYA 3U72A 1QUKA 1JW1A 2PYYA 3R26A 1XOCA 1PDAA 1SQYA 3Q28A 1B7ZA 1EZ9A 1MXUA 4THIA 2QS4A 3CFLA 5B70A 2QMXA 4RK9A 2GHBA 3FVNA 3EN3A 4LUBA 4FAJA 4TQUQ 4P11A 3M3FA 1NH8A 4QSDA 4JSOA 1LBBA 2Q2CA 1PBQA 4NWCA 2OCUA 3T96B 3O6HA 2DS9A 2NWJA 2Y7RA 1US5A 3SEXA 3T9UA 1HSJA 1OQHA 3C4MA 1T0KA 3PMWA 1XVXA 4GVOA 1UTHA 4G8HA 3PPPA 4WEDA 3O66A 3LR1A 4TLLB 3H6WA 4F39A 1MH3A 3O2AA 3DELB 3K6UA 4F3BA 3S9EA 3KN8A 2Z8DA 4LA9A 4LATA 1II5A 2XHDA 3FIRA 4I62A 3G3IA 3RT8A 1CB6A 1LSTA 4MBPA 3VXCA 2XXQA 5HBCA 4F22A 4QF9A 3QXMA 1S9TA 2B3BA 4JDFA 3S2VA 3U93A 4LVQA 1ZIUA 4JWYA 2O69A 1MH4A 3PD9A 4QSCA 4NF6B 4NF4B 3U94A 4F1YA 4OESA 1XHYA 1EH3A 3SERA 3HV1A 3AXFA 5AA3A 1JQFA 5H8HB 1D9VA 3S4UA 3EHSA 5I2KA 1JNFA 3DP6A 3MZBA 3CRBA 2OK2A 4ESWA 1BLFA 3PMVA 3IL1B 4EDPA 2X26A 1JW4A 4MLQA 1LAFE 4ELRA 2R6GE 1MQHA 2DOJA 2V3TA 4FJPA 4TLMB 4GQOA 4GL0A 4RY1A 2Z8EA 3OO8A 4KD5A 4I9DA 1N3WA 4NEDA 1M5BA 3KOSA 1QUIA 4QFNA 3MPLA 3FVGA 2Y7KA 4JWXA 3M3LA 4RJZA 4G68B 4DXBA 1PB9A 4R73A 1EZPA 1UQWA 4EQBA 3E9XA 3G3HA 4YKKA 2ZNSA 1MM6A 1XS5A 1S50A 3LSLA 1IXIA 2ONSA 3GBBA 1LB9A 4ZE9A 1NFTA 3H3GA 5CRYA 1MPBA 5TPAA 1PC3A 1MXVA 5HPQA 5ISUA 3KEIA 3PUYE 3N94A 3TFLA 3TTLA 4OENA 1GTKA 2X7PA 1EU8A 3MWBA 4HW8A 1P1OA 2XXXA 1B46A 4PFUA 3OO6A 2G29A 2F35A 1SW4A 1D3KA 4JWOA 4IO3A 2Y7PA 3UIFA 5DYHA 3TCHA 2CZLA 3G3GA 3K1MA 4UA8A 3H06B 4R6YA 4PETA 2F7AA 3IOWA 3KJ7A 2VP1A 3MVWA 1LAHE 4KQPA 4POWA 1Y20A 1A54A 3FXRA 3OSQA 4OEUA 2DWIA 5DVJA 3R7XA 1JEUA 5H8FB 1I69A 1MQJA 1N04A 4RNSA 3HSTA 3DLNA 4YZZA 1LFHA 1UIUA 4ZE8A 3VVFA 4RPNA 1GR2A 3K0VA 3N26A 5AA2B 2DQVA 5AA1A 2QS2A 3KSJA 1QULA 2ONRA 3RGYA 1MPDA 1LCFA 1IITA 1NL5A 4FECA 1MY1A 5I58B 3TTRA 4MFIA 3IB0A 2O1MA 2O6AA 4U1OA 3RTWB 4F3PA 3T9XB 2O84X 3H7MA 3CI8A 4GF8A 4U22A 4EXLA 5I56B 4ZZAA 1FTLA 4KCCA 3TYHA 3IX1A 4OFOA 3E3KA 3C34A 2O51A 1B52A 3N6UA 2XD3A 3TZAA 1KWHA 1LCTA 2AL5A 3WAFA 3K00A 1MY0A 1JETA 1AOVA 4U4SA 4LZ5A 3I3VA 2GRVA 3JZJA 5L9MA 2OBGA 4QFPA 4G68C 1SI0A 2DXRA 3P7IA 3TMGA 2H4IA 4POXA 2ZXTA 3TTMA 4F3SA 3Q29A 5CMBA 1UTBB 1TT1A 1A7LA 2D3IA 4JB7A 1MY4A 2ESNA 4KYDA 1VE4A 2OZZA 1PEBA 3K6XA 4MF3A 3THIA 3FV2A 1AMFA 2QMWA 5ICTA 2VD3A 2VHAA 4BDNA 4GXSB 4U2RA 4AB6A 3CR9A 3RN8A 4BDOA 5KCJB 4WXJA 3MC2A 3C33A 4R75A 3RT6B 2I4BA 5TP9A 4IO2A 3TELA 1B3GA 1ELJA 3OEKA 4PE5B 1AH5A 4HCYA 3KZGA 3G3JA 5H8NA 4F18A 5CC2A 4M1VA 3OOAA 2I49A 5F7VA 1Y3NA 3IJXB 1I6QA 2ZYKA 3TPAA 5AA2D 4F3GA 3OEMA 3MBPA 1P99A 3PUWE 4ELQA 3CSBA 4R9GA 4IY5A 3OO7A 2UVJA 1B3HA 2H99A 5H8FA 2OWSA 3IORA 1PB7A 5L8DA 1D9YA 1O64A 1YAEA 5I57A 2UVHA 1H45A 2Q9TA 3MJNA 3O6IA 2HZLA 2VGQA 2ALUA 2DE2A 1Z7NE 5BUUA 4O3BA 3TTKA 4DDDA 4EF1A 5I2NA 1NNKA 1OLCA 3QK6A 3SESA 1HSLA 4ZEKA 4E0WA 5FTHA 3N6TA 3MZ9A 1DPEA 4R72A 3LSXA 4DCYA 4YB6A 4IO7A 1FQCA 3EQ1A 3ZS6A 3SEUA 3T22A 5EHMA 3MZ1A 3FJMA 3BFUA 4G8MA 4R6HA 5TU0A 3LSFB 1ZTYA 4H6DA 3GLBA 2ZNUA 3K4UA 1SD3A 4YU0A 1LBCA 1R9QA 3FATA 5AA4A 3MP1A 1MQDA 3M8UA 4H5FA 4IO6A 3I5OA 2R9JA 2KLFA 1ZMGA 1P1UA 3HCQA 1VFEA 1POTA 1EZOA 3MPKA 2M8CA 2YLNA 4H8JA 1M5CA 4YB5A 4DCXA 2HFBA 1LLSA 3A3CA 3FJGA 2UVGA 3RQTA 4X48A 2Y7WA 2XXVA 1Z7ME 4NF5A 1MXYA 4G8NA 3VVEA 3QSLA 1BKAA 1BIYA 3DM0A 2V25A 3KN3A 2F7CA 3FASA 3QAXA 4OETA 2DE3A 1Y4TA 3D4GA 3K2DA 2XD2A 3MVXA 4EQ7A 2HZKA 5CBSA 4OWDA 1USYH 4NF8A 3GBAA 2VD2A 1SVXB 2XXTA 5JK4A 4BDQA 1GVCA 5DT6A 1XT8A 1XC1A 4OHNA 3TQLA 4LQ2A 1L5TA 3ILUB 5I59A 2A5TA 3ILTB 2B3FA 2QS1A 1MDP1 4OMBA 5FHOA 2YPNA 4OFLA 3OENA 3OXNA 5A5XA 2ONKE 4TOZA 2YJPA 3IB2A 1AIVA 1MG1A 3TDJA 3IJOB 1B51A 1DTZA 3T9HB 3C36A 3FXQA 5DEXA 1B40A 2QS3A 4HCWA 2F5XA 4NWDA 4OQOA 3T66A 1PBPA 4NMYA 3WAEA 4QFLA 2HAUA 3KOTA 4DXCA 4ELOA 4IO4A 2GH9A 1R1NA 4QRZA 1B5HA 5IAIA 1QVSA 1P1NA 1FW0A 3HHGA 1B3LA 4QFKA 2RC9A 5DTBA 4OFJA 5KZTA 2O7UA 3H6TA 4G77A 4WEPA 4RYAA 3CFZA 2RCAA 5B7DA 3PPOA 2REGA 2ZYOA 2RCBA 3ZSFA 1SBPA 1JVXA 4U21A 5KDTB 3CFXA 5I84A 3A3UA 3V83A 5H8SA 3D4CA 4IY6A 3TAJA 4FORA 2UYFA 4C1UA 3MVYA 3JYRA 4RA1A 2H9BA 2UYEA 1MY3A 3VVDA 3VXBA 1B3FA 4QHQA 1JEVA 1OMPA 5FHMA 1URGA 2ZYMA 1IZ1A 2I0BA 3OELA 4BDRA 2F6GA 2X7QA 2FYIA 4Q8RA 3B6QA 3OSRA 3C35A 3O29A 1YCJA 2RKMA 2P0SA 2DXYA 2HEUA 4PFWA 1NNTA 4XKPA 4H65A 3O28A 4EXKA 4GWOA 4N6PA 5ELVA 3UA8A 3IOUA 4NF6A 4NF4A 4DIGA 1LAGE 5H8QB 5DVFA 2AL4A 1B0HA 1Y3PA 5H8HA 1QKAA 4M4GA 2QSXA 2I4CA 4GD5A 4R9FA 3KSXA 1DSNA 4X9TA 3FD3A 5DVIA 4F1VA 5JTYB 5FTIA 1B7UA 1B1XA 3KFMA 3LC8A 1QJMA 5L9OA 3DP4A 2NVUB 1PB8A 1URDA 3PPQA 2RC8A 1UIVA 1FQBA 1NH7A 4KI0E 1DMBA 1BP5A 4O3AA 4Q30B 4U23A 3K02A 4R74A 4ELPA 4ZS9A 2AYSA 4BDLA 2ZYNA 4F29A 2DVCA 4NE4A 4X1DA 3KGCA 1SYIA 3JV9A 4C0RA 4ZDMA 3Q26A 4G68A 3OD7A 4DZ1A 3H03A 2VOZA 4RXLA 4P0IA 1FQDA 2CMOA 1UTHB 5ICQA 4F1UA 3RTFB 1R6ZA 3PUVE 3K6WA 3PPNA 1FCKA 5EHSA 5HM4B 4YKPA 4YMAA 1FQEA 4GLIA 3BBRA 3L6HA 4KYSA 2HAVA 2D21A 1I6AA 2XXHA 3G3KA 4DXUA 3PGFA 1URSA 1USYE 1H44A 2REJA 2PMSA 1RKMA 3IOTA 3QUFA 4YMBA 1A55A 4PP0A 3VV5A 1US4A 4GRKA 4ZECA 3TCGA 3SETA 4Z0IA 3T9VA 2Q89A 1FQAA 4FEDA 3O6GA 4OYVA 4LZ7A 3TTNA 3EHUA 1SDXA 2DWAA 5I2KB 3EF7A 4OXVA 5LOMA 2B65A 3K6VA 1ZU0A 3QYTA 1DOTA 5IKBA 4F31B 2Q88A 3F11A 1B2HA 2Q2AA 3ZKLA 1FTKA 4YICA 3VLVA 5F1QA 2THIA 3RNNA 3E4RA 5AA2A 2OLBA 4KCDA 1MQGA 3BKIB 3MW0A 3PD8A 3USDA 3S9NC 4ZEIA 3KG2A 1LFIA 1LGBC 3CG1A 5I58A 4ONYA 4MH5A 3FUZA 3GXAA 4JSDA 3HO7A 3PMXA 3C9HA 5I56A 2I3WA 1LAXA 3FZVA 1ZBMA 3K1NA 1O63A 4QSEA 1MM7A 3MP6A 2R71A 4P0GA 3I6VA 1N7WA 1ZJLA 2PVUA 3LBSA 2DSFA 1Y3QA 3S9LC 4HTGA 3W9WA 5TPAB 3UORA 4OVJA 1BTJA 1FQFA 2I6EA 4OZ9A 3H4ZA 1MS7A 1WODA 1Y1MA 2Y7IA 4OERA 4F19A 1QW0A 3IOVA 4YB7A 3ZKKA 1NNFA 1OIBA 5FHNA 3TEPA 1QUJA 3CG3A 3VE1B 2RC7A 2WKYA 3LUYA 4H0WA 2XX9A 2V3UA 3K01A 1OVTA 1AL3A 5CMCA 4KHZE 1B58A 4BLAA 2Z8FA 3IK6B 2GFEA 2V84A 3H6UA 1UTBA 1B1HA 1LFGA 1XVYA 2F36A 5J1DA 1FTMA 1VR5A 2HQ0A 1OVBA 3ONMA 1Y1ZA 1P1QA 4LZ8A 3VLUA 4KPTA 4MLVA 2PT2A 3EHTA 3N5LA 1RYXA 1H3DA 3U92A 3FVKA 4XKRA 5KCJA 2ZNTA 1B05A 4WKMA 3B7DA 4O3CA 1MPCA 1F9BA 4U4XA 1SW1A 3CSGA 4ZEDA 5EYFA 1D4NA 3PV0E 2RF1A 2E0SA 4XKQA 1M5FA 3O97A 2BJJX 4G4PA 1ATGA 4Z7EA 5CBRA 4L17A 2H5YA 3SDFA 4N13A 3C31A 1B0LA 4PFYA 5CMMA 4LQ5A 4F2QA 2ZMBA 4XTCQ 1QKBA 1LB8A 1A99A 3ECRA 3TCFA 3G7WA 1MXWA 2QJEA 4ZEBA 3KJTA 2H98A 1IIWA 4PFTA 1H76A 3RPWA 1B5IA 3M3KA 3B6WA 1B4ZA 4ZEFA 2I48A 3RY3A 4HS7A 3RLFE 3TKDA 5K2XA 1JVYA 3UP9A 2D5WA 2I3VA 4XKNA 1OLAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3IAZA 4YAHX 2UXAA 4ECFA 2DVZA 3U8QA 1FJ6A 1MQIA 4NF0A 4FE8A 5ET8A 4FATA 1NV7A 4GWXA 3FGSA 2DWJA 3EPEA 4PGNA 1B9JA 2P3NA 4XIGQ 1B7HA 4UACA 3HHFA 3FVOA 3BIGA 2Z22A 1H43A 5ITPA 2HXWA 2F97A 1Q1KA 3MAMA 3PU5A 3PPRA 4IO5A 1TFDA 1ZKBA 1A40A 1TFAA 1MDQA 3TODA 3KN7A 1SW5A 4P1LA 4PF6A 4AS5A 3SEYA 5AA4B 2XWVA 4EUOA 3BFTA 5CMKA 2XXRA 4BDMA 4NG7A 4NTLA 1SPIA 2O1LA 3UN6A 3ISPA 1DTGA 1JW5A 1YTVA 4G2ZA 3TQWA 2DP8A 4GL8A 4ZZEA 2XXYA 2OJTA 3W15C 2CZKA 3SKPA 4PAIA 1FJ9A 3Q25A 1B6HA 4N07A 4RK2A 1TXFA 2AIXA 3V5AA 4NF5B 1MRPA 1BK4A 2I58A 5CM6A 4F2OA 1VFDA 2WBBA 5KDTA 2G93A 3ODBA 1M5EA 4I8CA 1GV8A 2F8DA 4H1XA 1FTJA 4Q0CA 2F78A 4P3LA 3V8XB 2F6PA 3MP8A 1MY2A 2Q8JA 1M5DA 4EF2A 4PC9A 3SZPA 5JEIA 3V89B 1FTOA 4NF8B 3FV1A 1B3EA 2PX1A 3B50A 3RUMA 1TWYA 3DP8A 1SYHA 1J1NA 4XXUA 3T93B 3W9VA 2PBWA 4U1ZA 2NXOA 1IUDA 5IZZA 2XX8A 1CE2A 4IB2A 3Q27A 4LP2B 3O9PA 1B4HA 3EKIA 5I59B 2A5TB 3U1OA 1DPPA 4X1BA 4IGTA 4GWYA 2W7YA 3IR1A 4GIZA 1IXCA 2XXUA 1K9YA 1I6BA 3KBRA 2O7IA 2B4MA 2NOOA 4H8IA 1FPGA 2QFLA 4FIMA 5A5XB 2V93A 1IEJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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