3FV2A

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv2A02
4IY6A 4ELPA 2RF1A 3IOUA 1B52A 1MXZA 4R72A 3OELA 3VFJA 4OFJA 3KZGA 2XHDA 3TAJA 2ZYMA 1A8FA 4NF8B 1MXWA 1BLFA 4IY5A 3RTWB 2QPQA 1URGA 3TTNA 4ZE8A 1MXXA 4N13A 3MPLA 5H8NB 1B51A 4R74A 5KDTB 1FQAA 1US5A 4QSDA 2AL4A 2ZNUA 3FVNA 2VGQA 4YKPA 4H0WA 5H8QA 3KEIA 4OZ9A 3O6GA 3KN7A 4FAJA 4ZEDA 3U92A 2I58A 2H5YA 1H44A 1MS7A 3UP9A 3T9UA 3D4CA 5H8FB 4NF6A 4G68C 2OLBA 2VP1A 5K2YA 3FATA 2ONRA 4G68B 4G77A 2H98A 3OXNA 2AL5A 2F35A 3PUVE 1SD3A 4Q30B 4QFOA 3O2AA 1OQHA 1IXIA 3TCHA 4KR5A 3W9VA 5DVIA 3VLWA 4R2BA 3TMGA 4GXAA 3TPAA 1NNFA 1LGBC 2DXYA 4H8JA 4ELOA 4THIA 1B3LA 3O66A 3PUYE 3B6WA 3KGCA 3G7WA 3D4GA 3IR1A 3K02A 5I2NA 3BBRA 4ZEIA 1LSTA 2O69A 3EHSA 1BP5A 2H9BA 1POTA 3ZS6A 3A09A 2ZYOA 2O1MA 3EPEA 1B58A 1UIUA 3ZKKA 2QL3A 2DP8A 2F97A 1GTKA 1FW0A 4MLVA 3RLFE 2P0SA 1MM6A 1IXGA 2DSFA 3ZSFA 2ESNA 3C36A 4NF4B 3I3VA 1HSJA 3PPOA 4QFLA 2RC9A 1PDAA 1LAHE 1I6AA 3OSRA 2DWJA 2V25A 4ZEFA 4RXLA 5AA3A 1LBCA 3SERA 4U1ZA 4YZZA 1CB6A 1BIYA 1FTLA 1CE2A 3O28A 3KJ7A 1B32A 1ZMGA 4ZECA 1EZPA 3IJXB 3MP6A 4FORA 4K3FA 4P11A 1URSA 4LUBA 2CMOA 2YJPA 4ND9A 3N6UA 4EDPA 1RYOA 1NL5A 3PMXA 2XXPA 4F1UA 5F7VA 1POY1 2ZMBA 3QUFA 1O64A 2O84X 4NF5B 1B9JA 1KWHA 3PPPA 3TTRA 4LZ7A 1F9BA 3C35A 5ELVA 3KSJA 4YMBA 3THIA 5LOMA 1GVCA 3K1MA 3SEUA 2RC7A 1PB7A 1GGGA 4RYAA 3T9XB 2I0BA 2XXUA 3UGWA 4FEDA 3VDFA 3VLUA 3L6HA 2PT2A 4E0WA 3QSLA 4F29A 1JETA 3EQ1A 4MF3A 1MQJA 1JVXA 3FVGA 1B7ZA 3TQWA 3MJNA 2DS9A 2XXIA 1ZIUA 1Z7NE 2QS4A 1MPDA 3MW0A 5B70A 1IEJA 4IGRA 2W7YA 4DZ1A 3VVDA 5I59A 2Y7WA 1B7HA 4H5GA 1A99A 1OMPA 3Q28A 1EH3A 3TDJA 1B5HA 3HV1A 3PUXE 2F6PA 1BTJA 1LLSA 1B0LA 4FIMA 1S9TA 4WEDA 3TUSA 2Q2AA 3RY3A 2LAOA 3IOWA 1Y3QA 1RYXA 4OFOA 4KFQA 4BDMA 4C1UA 5B7DA 3Q25A 3TFLA 2Y7KA 1B1XA 4EQ9A 3G3GA 3V83A 1II5A 4F1YA 5HPQA 5EHSA 1YCJA 1HSLA 1FQEA 3RPWA 4AB5A 3E3KA 1NNPA 3B6TA 3E13X 2GH9A 3MP1A 3FUZA 1QW0A 4G2ZA 2H4IA 1FTJA 4ELRA 5I57A 3VXBA 4KCDA 4G4PA 1B0HA 2ZYKA 1N84A 3LR1A 3PUZE 5JTYA 1NFTA 5DTBA 1FCKA 2XXYA 1B7UA 4OEUA 2FNCA 4BDLA 3M3LA 3M3KA 3CFZA 4OENA 3IJOB 4QHQA 1S50A 3MVXA 3CR9A 4JWYA 4OETA 5A5XB 1AMFA 2RKMA 2Z22A 4G8MA 1FQFA 1B05A 5I2KB 1VE4A 1R1NA 4I8CA 3TODA 4H5FA 2DQVA 4EXLA 2D3IA 4EF2A 1B3GA 1URDA 3R7XA 2BJJX 4EUOA 4F31B 1PEBA 2G93A 1ELJA 1PB8A 3MP8A 4FE8A 3QXMA 2G29A 1NNKA 4F18A 3T66A 1NNTA 3KN3A 1P1OA 4BLAA 4ZDMA 1FQBA 4DE8A 1VFEA 4H65A 3MZ1A 3QYTA 4GF8A 4GXSB 3O9PA 2OJTA 5BWJA 2OZZA 1SQYA 1ZJLA 1SW1A 3K6VA 3MUQA 2Y7IA 1Y3NA 2V84A 2PX1A 1J1NA 1B46A 2P1SA 3WAFA 4KCCA 5FHOA 4GRKA 1QKAA 2XD2A 3HHFA 4NEDA 4XKQA 4GQOA 5HBCA 4O3CA 4DLDA 3S4UA 2YLNA 4G8NA 3VVEA 2XXXA 3KFMA 2AYSA 3H3GA 5AA2D 4PFUA 1MH4A 4P0GA 1GV8A 2Z8DA 4YB6A 2UVGA 3K00A 2GHAA 4OESA 2A5TA 3K2DA 5CC2A 1N3XA 4QFPA 4F3GA 1MQDA 4R9GA 2UVHA 3K6WA 4FATA 3MVZA 2HFBA 3TKDA 2GHBA 4QRZA 1P1UA 4TOZA 2O7UA 2ALUA 4E0XA 1Q35A 3JZJA 4JSDA 4BDNA 2AIXA 4JB7A 1Y20A 3KBRA 3I5OA 1AOVA 3LSWA 1TXFA 1IIWA 3OO8A 4OTEA 3ONMA 4RA1A 1IZ1A 1ZU0A 3Q26A 1SYIA 5AA1A 1FTKA 4C0RA 3PPQA 4PFWA 2I49A 2THIA 5CBRA 3LSLA 2R6GE 4RK2A 4QFKA 4RJZA 3PMVA 4M1VA 4POXA 3MZ9A 4C1TA 5AA4B 3O29A 5DEXB 2A5SA 2NXOA 2UYFA 1TWYA 1SI1A 3H6WA 2UYEA 4X1BA 2HAVA 1FTMA 1YAEA 5F1QA 4GFRA 3FVKA 2O68A 1R9LA 1XOCA 1R9QA 4XKPA 1A40A 4I62A 3FVOA 3OOAA 1B4HA 3MQ9A 1UIVA 2PYYA 1O7TA 4HS7A 3ILUB 3K6UA 5I84A 2X7PA 1M5BA 3TTLA 4XKRA 1UTHB 1ZKBA 2QS1A 2RCAA 4NF8A 5TP9B 1MRPA 2B3BA 3EHUA 4YICA 3O6HA 3TYHA 2DWAA 3EN3A 4ZS9A 5H8NA 2QRYA 1QUIA 5KDTA 2XXWA 5TU0A 5L8DA 2F36A 1LAGE 3RUMA 3HPIA 1MPBA 4X1DA 1SW4A 3DP4A 1Z7ME 2OCUA 4LZ5A 4F1VA 2I0CA 3T9HB 1FQDA 1DOTA 4WEPA 1LB8A 3FV1A 3A3UA 1MDP1 5H8FA 3TCGA 5H8HB 4RK9A 3OENA 3JYRA 4G68A 4KPTA 2ONKE 3HO7A 1B3FA 2XXHA 3BKIB 5IKBA 5K2XA 1P1QA 4RNSA 5AE4A 4PP0A 1JEUA 4PE5B 4F2OA 2IEEA 1NH7A 4DIGA 3H03A 2KLFA 4DXBA 2DOJA 5I58B 2DE4A 4OFLA 1AH5A 3GXAA 4NMYA 1D9YA 4GWOA 3B7DA 4FECA 3K0VA 3ECRA 3CSGA 3UA8A 4WKMA 3HSTA 3C33A 2I4BA 1B3EA 4KI0E 1LFHA 4NE4A 2RINA 2UVIA 4ESWA 4LQ2A 2XXQA 1D3KA 4PETA 2FYIA 5EHMA 4L17A 2Q8JA 3VXCA 4AQ4A 4ESXA 2Q89A 3K6XA 3RT8A 1DTGA 3G3FA 1DPPA 1LCTA 1P1WA 4R6KA 4R2FA 3S9LC 2HXWA 3O97A 4NF4A 4JXIA 4I9DA 1O63A 4IO6A 1USYE 4U23A 4IO3A 4LQ5A 1UTBB 3GBBA 1SI0A 3FASA 3K4UA 4GOTA 1HSEA 2H99A 1NMUA 3IORA 3MZBA 3FJ7A 1MXUA 4G8HA 3G3HA 1B5IA 3H6TA 4F3SA 3VE1B 2V3QA 2DE3A 3C9HA 2QMWA 3IX1A 2I3WA 3SESA 4POWA 1MQIA 1MY2A 4LZ8A 5I56B 1N7WA 4Q8RA 3FJMA 5AA2B 5L9SA 4BDQA 1TFDA 1N76A 4YKKA 2I4CA 1LB9A 1MXYA 3H06B 2F5XA 2F7AA 2I6EA 1MDQA 4BDOA 1VR5A 3H7MA 4IB2A 1MXVA 4O3AA 4NWDA 1XT8A 4ONYA 5ISUA 3QAXA 4IO4A 4JWXA 4NF5A 5KCJB 4GLIA 3IK6B 4EF1A 4PQJA 3S9NC 2DXRA 1WDNA 1SW2A 2Z8FA 2ONSA 1I69A 1QKBA 3K1PA 1LAXA 4F39A 5J1DA 3C32A 3OO9A 4YKJA 4MH5A 3QK6A 4U21A 4IGTA 4M4GA 1OLCA 3IO6A 1USYH 2XX9A 3FXUA 2QS3A 4U2RA 2HZLA 1DPEA 3VLVA 2OK2A 4MBPA 3TELA 3S9EA 3PGFA 4OMBA 5BUUA 3E4RA 1QUJA 2B65A 1IITA 3TQLA 1JW5A 3OO6A 4ELQA 2FA7A 1JEVA 3MAMA 2CZLA 3T9VA 4ECFA 4P0IA 1JW4A 3KJTA 1PBPA 5H8SA 2XX8A 1A8EA 1Y9UA 1QJMA 1XHYA 5H8QB 2O51A 5JK4A 3KOTA 1ZBMA 3ZKLA 4FEBA 3CI8A 4KYDA 4HCYA 3K1NA 4TQUQ 1SDXA 3MBPA 1VSOA 2QSXA 3N94A 1DMBA 4U4SA 2Y7PA 4NF6B 1PB9A 3H4ZA 3OEKA 4JDFA 1US4A 5HM4B 2X26A 3USDA 4F3PA 4R9FA 1B2HA 5L9MA 3IOTA 1B1HA 3IB1A 5FTHA 4ZZAA 2REJA 1IXHA 2DVZA 4U4XA 3WAEA 3IOVA 1BKAA 4Q5TA 1Y4CA 5FHNA 4EQ7A 2VOZA 2XXTA 4RY1A 1OVBA 4JWOA 1MY1A 3M8UA 1JQFA 3O6IA 4QSEA 1LAFE 3CRBA 3I6VA 3UIFA 3PV0E 2XXRA 5I2NB 2PT1A 4JBZA 3G3KA 3SEVA 4ZEBA 1R6ZA 1L5TA 4OEVA 2HCAA 2QS2A 4LATA 3CVGA 1EU8A 3R26A 4BDRA 1LFGA 3FD3A 1ANFA 2Y7RA 2V93A 4IO5A 3DP8A 3DLNA 4KHZE 2OWTA 2F8DA 3S9MC 4TLLB 5A5XA 1B5JA 3EHTA 3N5LA 5I2KA 4TLMB 4GIZA 3U72A 3P7IA 3TTKA 3RN8A 3C4MA 3OD7A 2B3FA 4U22A 3ILTB 1IXCA 4X48A 4F22A 3GBAA 1NKXA 1LFIA 3V5AA 2V3UA 2HEUA 3PU5A 3EF7A 3MPKA 3CSBA 1M5FA 4RPNA 3GLBA 3H6UA 4U1OA 2O7IA 1I6BA 2XXVA 1SBPA 1IUDA 1NH8A 2PVUA 3SEWA 3V8XB 4LVQA 1XVXA 5ITOA 3OEMA 4OWDA 3RGYA 3L6GA 2RC8A 2F7CA 1UQWA 3MC2A 5TPAB 1FTOA 1M5CA 1MPCA 5IAIA 2DWIA 3B6QA 3QIMA 1YTVA 1Y3PA 3S2VA 2I3VA 4HCWA 2VD2A 3FJGA 4F19A 1MY4A 2F6GA 3SEXA 3HN0A 4PFYA 4YMAA 5ITPA 3RQTA 1P1NA 3LUYA 1N04A 2NWJA 4XKNA 1OQGA 3N6TA 3LBSA 1JNFA 1H45A 5DT6A 5FTIA 4NTLA 5CMCA 3TZAA 5CMKA 1M5EA 4YKIA 2HZKA 3E9XA 1OVTA 3KN8A 4KQPA 4ZE9A 2V3TA 1Y4TA 2YPNA 2HAUA 1MY3A 2F34A 2QMXA 1D4NA 3MWBA 4DCYA 1XC1A 2ANJA 1WVJA 4XTCQ 5DVFA 5ICTA 3FZVA 4IO7A 2ZNSA 4YU0A 3SKPA 1B6HA 1ZTYA 2Z8EA 5I59B 1AL3A 3HCQA 1N3WA 1H3DA 4O3BA 4Z7EA 1MQGA 3H6VA 2DVCA 2IA4A 2HQ0A 3UK4A 4MFIA 2X7QA 3KSXA 4UACA 3VV5A 4H8IA 2F78A 2O6AA 2VHAA 1FQCA 2ZYNA 5CM6A 2UVJA 3IL1B 3UORA 2R9JA 4NWCA 1YPNA 3DELB 5AA4A 5DEXA 3TEPA 4N6PA 3FGSA 4YAHX 1MM7A 5FHMA 1MQHA 3G3JA 2M8CA 5CMBA 3MVYA 5TPAA 4EXKA 3ODBA 2WKYA 3SDFA 1Q1KA 1PC3A 2I48A 2NOOA 2ZXTA 1AIVA 4OHNA 1XVYA 5I57B 1SVXB 1JVYA 1B4ZA 3LSFB 3U93A 1UTHA 2ZNTA 3PMWA 3TCFA 4Z0IA 4H6DA 5JTYB 2OBGA 3SETA 5TP9A 4FJPA 3LSXA 3FXQA 4XXUA 1MG1A 3C31A 3G3IA 3F11A 4MLQA 3OSQA 1A55A 2QJEA 3SEYA 1P99A 4GL0A 4OERA 1RKMA 1N0TA 2D21A 2D5WA 3IAZA 3CFLA 2PMSA 3VVFA 1VFDA 3OO7A 3CG3A 2PBWA 4EQBA 4Q0CA 1SW5A 2Q2CA 3HHGA 2NVUB 3PPNA 3Q27A 3RNNA 4YB5A 1S7YA 3U1OA 3FXRA 2Q88A 4YB7A 5H8HA 4DXUA 4R6YA 4R75A 3PUWE 3K01A 3UN6A 2H25A 4LP2B 1QULA 4GL8A 4R6HA 4GVOA 4QFNA 1DTZA 3BFUA 4QF9A 5JEIA 4DCXA 1OIBA 2RCBA 4KYEA 1B3HA 2GFEA 4GD5A 4UA8A 4H1XA 5DYHA 2NUVA 4LA9A 4HTGA 5I58A 2UXAA 3BFTA 3CIJA 2O1LA 2DE2A 2DWHA 3V89B 4HW8A 3Q29A 4PFTA 2OWSA 2E0SA 1I6QA 3N26A 3A3CA 3U8QA 1IQ7A 4H67A 3T22A 1EZOA 4I1DA 4ZZEA 1PBQA 3KOSA 4N07A 4DDDA 4ISUA 4DXCA 4AB6A 1ATGA 5CRYA 2XD3A 3AXFA 1TT1A 3IB2A 3MVWA 4KYSA 2VD3A 3T96B 5CBSA 5ICQA 3PPRA 5CI5A 3CG1A 3CFXA 1N7XA 4ZEKA 3RTFB 2A5TB 4OXVA 1OLAA 3OMBA 3PD8A 5DVJA 2Y84A 1Y1ZA 1XS5A 4LONB 1EZ9A 3TTMA 4WXJA 2F7BA 1MH3A 3LC8A 1UTBA 3M3FA 2Z23A 3GZGA 4JSOA 1ZLQA 1B40A 3IO4A 3JV9A 4IO2A 4XIGQ 4RPOA 3DM0A 5L9OA 3DP6A 2GRVA 1TFAA 5CMMA 5KZTA 1JW1A 3QUJA 1GR2A 1MY0A 1A54A 4OVJA 2ABHA 3FV2A 4OQOA 5I56A 3U94A 4F2QA 5EYFA 2REGA 2P2AA 2XX7A 1DSNA 5AA2A 2E1SA 3KG2A 1H76A 2Q9TA 1H43A 3W9WA 3C34A 1WODA 2DYXA 1A7LA 3RT6B 4OYVA 1LBBA 1LCFA 4QSCA 1SYHA 4X9TA 4KD5A 4R73A 3R6UA 1D9VA 3W15C 1QVSA 3IB0A 3T93B 5KCJA 3FIRA 1Y1MA 3PD9A 1M5DA 4F3BA 1QUKA 1T0KA 5M2VA 2R71A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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