3FVKA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with 8-deoxy-neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvkA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvkA02
4KI0E 4OTEA 3IOVA 3C4MA 3SDFA 1OMPA 1DTGA 3FUZA 2QMXA 1MM6A 1XOCA 5I59B 4ZEIA 4Q0CA 5AA4B 5HM4B 3TQLA 4DLDA 2VD2A 3K1PA 1SD3A 5JTYA 1EU8A 2DS9A 3QXMA 5CMCA 3M3KA 4GF8A 4ELRA 4MH5A 1O63A 3VVFA 2Q9TA 1LFIA 3JYRA 1B46A 4GIZA 1FW0A 3UA8A 4BDMA 2Y7KA 3JZJA 3CRBA 4U21A 1IZ1A 4P0GA 1VR5A 4Z0IA 1N0TA 3IR1A 5ITPA 2V3TA 3PUZE 2VOZA 4BLAA 4OESA 1T0KA 4Q8RA 3FJ7A 2F36A 1B9JA 3KJ7A 4OVJA 5KDTB 4Q5TA 3G3JA 3R26A 2REJA 2Z8EA 1IEJA 4LONB 2HAVA 4F1YA 4H65A 3QK6A 4NF5B 3HN0A 3UK4A 3H6TA 1QJMA 1EZOA 4NF8A 1B3HA 3TDJA 5DT6A 3ZKLA 1RYXA 1URSA 2Q89A 1N76A 4GL0A 2QS1A 1RKMA 3QUJA 1B05A 1J1NA 3FV1A 3HHFA 3EF7A 2ABHA 1TFDA 1SYIA 1QULA 1B3GA 1AMFA 3KZGA 2RC9A 3L6GA 5I2KA 4ECFA 3TUSA 3IJOB 4H8JA 1SW2A 4H6DA 2B3FA 4G8HA 2XX8A 1RYOA 5I58B 3OOAA 1UQWA 4JXIA 2Q2AA 3OSRA 3SEWA 4BDLA 1MY2A 1JEUA 4QHQA 2OZZA 1MDP1 4IO6A 4NMYA 1MXUA 1URDA 1P1NA 3IX1A 1PDAA 1D9YA 3PV0E 4EF2A 2R9JA 4R73A 1I69A 3KFMA 2PBWA 2B3BA 4U4SA 1ZLQA 5EYFA 1A7LA 3MJNA 2DE3A 4I62A 4FJPA 3UORA 2O84X 2H4IA 1JETA 2GHBA 2XXQA 1KWHA 2G29A 3SEYA 3CVGA 1MPBA 3CG1A 4R6YA 1UTHA 1Y4TA 3MVZA 5KCJA 3VLUA 4DXBA 5BWJA 3EN3A 5CBRA 4JWXA 3D4CA 1LSTA 2E1SA 3T96B 4F29A 3GBBA 1US4A 5ELVA 3MP6A 4TLMB 2F7CA 1MQJA 3VLWA 4IO7A 5H8HA 2NOOA 2DWHA 5EHSA 4E0XA 3I5OA 3TTLA 4FE8A 1QW0A 5I2NB 4U1ZA 1QUJA 2QJEA 4ESXA 2OCUA 4YU0A 1LFGA 3MP8A 4QFLA 5K2XA 4GD5A 1P1UA 2GHAA 2QS4A 2Z23A 1AOVA 1MM7A 2XHDA 4HS7A 3MPLA 3CR9A 2CMOA 2FYIA 1MXZA 1SYHA 1PEBA 1MPDA 3IO6A 3RT8A 1B6HA 4I1DA 4OENA 4QF9A 2ZXTA 3EQ1A 1MRPA 3B6TA 4YKIA 3TTKA 2GFEA 2LAOA 2XXHA 4EF1A 4EQ9A 3VV5A 2I48A 3RUMA 3FD3A 4QFPA 3Q27A 4I9DA 5L8DA 1NNPA 4X48A 4GQOA 4F1VA 1CE2A 3FASA 3N6TA 2ZNUA 1FQBA 1DPPA 4LVQA 2QPQA 3KN8A 3PMVA 2XXTA 1FQCA 1FTKA 3PUXE 3U94A 3Q28A 4EQBA 4H0WA 3IAZA 3IB0A 2OBGA 2X26A 2PYYA 1YAEA 1F9BA 4FEDA 1JW5A 4XKNA 1NNKA 4IO4A 3TYHA 4IO2A 3TAJA 2I49A 4OWDA 3IOUA 3SEVA 2O6AA 4PFWA 3ECRA 2UYEA 4QRZA 5K2YA 3TMGA 5I2KB 1NFTA 3E9XA 3ODBA 4ZZEA 2F97A 3OMBA 3QUFA 1UIUA 2ZYMA 4DE8A 4WXJA 1S7YA 2XX7A 1QUIA 1A99A 4IB2A 3Q25A 4DCYA 3PGFA 4R9GA 4YB5A 3USDA 3I3VA 4F1UA 1B5HA 1EZPA 4NWCA 3V89B 4AB6A 4TQUQ 1H44A 1HSLA 3OENA 1PB7A 1A55A 3MW0A 4RY1A 1B7UA 2DSFA 2F6PA 5CMMA 3SERA 4ELOA 2M8CA 2O68A 3PUWE 1YTVA 3UGWA 4THIA 5H8QA 3H6UA 4ZEDA 1SDXA 3C35A 2XXUA 4OYVA 4ZE9A 2F35A 2XD2A 1JQFA 3DLNA 3VXCA 4LUBA 2O51A 3PPOA 5DYHA 2F34A 4G68C 1SI0A 5B70A 2QRYA 4NWDA 1UIVA 3TCHA 2HEUA 3WAEA 1UTHB 1DSNA 3A09A 3LSFB 1MXWA 4EQ7A 3IO4A 3TTNA 1YPNA 3M3LA 1MY0A 4FIMA 3H3GA 1B4ZA 4GL8A 2ZYNA 1Y3QA 2I4BA 3FJMA 4DZ1A 5H8HB 1SBPA 4G8NA 3N6UA 3MP1A 4G8MA 3D4GA 4KQPA 5DEXA 4EXLA 4BDQA 5ICTA 2FA7A 3SEXA 4KCCA 4HTGA 4PETA 3FXRA 1MPCA 1Q1KA 2H99A 5CBSA 3R7XA 3MZBA 3CSGA 3FJGA 3MVWA 2DYXA 3RTWB 3MWBA 2X7PA 2A5TA 5L9OA 1FTOA 1XT8A 2O1LA 4MFIA 2GH9A 4MF3A 2AIXA 3PPRA 1WDNA 1AH5A 2Y7RA 4KD5A 4JWYA 3LR1A 5A5XA 4XKQA 1ATGA 3HSTA 2DOJA 2I58A 3K0VA 4YZZA 3PD9A 3OXNA 2AL5A 2HZLA 2VHAA 3P7IA 2ANJA 1S9TA 3O6GA 3PPQA 4PE5B 5TPAB 4PFTA 2NWJA 2F6GA 1LLSA 2PT1A 4O3AA 3W9VA 3IJXB 3MUQA 3FVKA 3B6QA 4ONYA 4YICA 3UN6A 3S9LC 1ZMGA 4G2ZA 4DDDA 4DXCA 4DIGA 1USYE 3UIFA 4C1UA 4KFQA 4OFOA 1MY1A 3V5AA 3EPEA 1TWYA 3OO8A 2HXWA 4YB7A 3MQ9A 3H7MA 1BP5A 3E3KA 4E0WA 2PVUA 1VFDA 3O28A 5FHNA 3O9PA 3LUYA 4EUOA 2RF1A 3CI8A 4LQ5A 1TFAA 3TELA 4OEUA 2NVUB 4YMBA 4YMAA 4F2OA 3TKDA 2F7BA 1R9QA 4F22A 1H3DA 4GLIA 1LBBA 3MZ1A 1QKBA 4P0IA 4G4PA 4Q30B 5DTBA 2R71A 4RK2A 3RTFB 1B5IA 4NF6A 3CFLA 1XVYA 4BDOA 1D9VA 4UACA 1GTKA 4YKPA 2ONRA 3DM0A 3B7DA 4F3SA 4F39A 1P99A 3DELB 4JBZA 5I57A 3RT6B 2DP8A 4OZ9A 3BKIB 2AYSA 1I6BA 3K02A 3IOTA 4G77A 4R2FA 3TPAA 2I4CA 4P11A 1B7HA 4YAHX 3RN8A 5FTHA 1AL3A 3KBRA 3IB2A 3VLVA 2UVIA 3FVOA 3TCGA 2D3IA 3EHSA 4ZS9A 4R74A 5H8QB 4HCWA 3PPNA 4M4GA 5IAIA 3HCQA 5TP9A 1XVXA 3O6IA 2VD3A 4ZEKA 4QFOA 4H1XA 3THIA 1QKAA 3K4UA 1O7TA 3CFXA 3VDFA 1XC1A 4U2RA 1N7XA 2Z22A 3MPKA 4QSEA 5L9SA 1DOTA 4G68B 4ZEFA 4GOTA 2REGA 3SKPA 2ZYOA 2Y7WA 5BUUA 3BFTA 4OFJA 2QSXA 3MBPA 2UVGA 1L5TA 5AA3A 5IKBA 1JW1A 3AXFA 4RYAA 4Z7EA 4NEDA 3OSQA 1B51A 3TTRA 4ZEBA 2QMWA 4H8IA 2XD3A 3IB1A 5L9MA 4OEVA 1ZBMA 3LC8A 1MG1A 4R2BA 4R72A 1YCJA 1HSJA 4R9FA 1CB6A 4ELQA 2F5XA 4F18A 2R6GE 1SVXB 4IY6A 1MQGA 1B0HA 4R6KA 3H6WA 3N5LA 1MH3A 1MXXA 3OELA 5JTYB 1B3LA 3VVEA 1PBQA 3C32A 5HBCA 5DVIA 3KOSA 3HHGA 2A5TB 3MVXA 2XXYA 4X9TA 2Z8FA 3U93A 2DVZA 3V8XB 3G3GA 4U23A 4N6PA 1OVBA 2ONSA 1XHYA 3G3KA 4LZ5A 4QFKA 3H06B 4DXUA 4KYSA 1B5JA 5CC2A 3K1MA 1WVJA 3UP9A 4QSDA 3C34A 3O2AA 3K01A 2I3VA 4KYEA 3H6VA 4L17A 5DVFA 4MLQA 2AL4A 3FGSA 1XS5A 4GXAA 3PUVE 2ZMBA 1N3WA 4YB6A 3TEPA 4PFUA 1PB8A 4TOZA 1AIVA 4WEPA 4NF8B 3K6UA 3FVNA 1MQHA 4HCYA 4AQ4A 3ZKKA 2HZKA 2H98A 1Y9UA 3RGYA 1Q35A 5CI5A 1PC3A 4GVOA 2DWIA 4H67A 2RC8A 1MXVA 4O3CA 1URGA 2RCAA 4IGRA 1DTZA 1D3KA 2BJJX 1PB9A 4YKKA 4OFLA 1EH3A 1BKAA 2YLNA 3K6VA 3KN3A 1Y1ZA 2FNCA 3DP4A 1MDQA 1GVCA 3KSJA 2QS3A 5H8NA 3OD7A 4NTLA 1US5A 2DQVA 3T9XB 4PQJA 2Y84A 2OK2A 3ZSFA 4NF6B 1JEVA 3S4UA 2X7QA 3TQWA 3CIJA 3KEIA 1N04A 5CMBA 2ZNTA 4K3FA 5I57B 2D5WA 1ZIUA 2HFBA 3T66A 2WKYA 3S2VA 3O6HA 1DMBA 5KZTA 3QYTA 4FORA 4U4XA 3CFZA 3K6WA 4LATA 3K1NA 1QVSA 4F3BA 4YKJA 1Z7NE 3G3FA 3ONMA 3N94A 1OLAA 2Q8JA 5CRYA 3O29A 1B2HA 1H76A 1B40A 1B0LA 4O3BA 1Y1MA 3W9WA 1B52A 2DWJA 2ESNA 3I6VA 5TP9B 4IO5A 1Z7ME 4ZDMA 5H8FA 5M2VA 4IGTA 4POXA 1UTBA 1B1HA 4XKPA 1FTMA 1JNFA 2DXYA 4LZ8A 3TTMA 5KCJB 1LB8A 4R6HA 5ISUA 3KJTA 3PUYE 3T9HB 1M5CA 1MY3A 2RCBA 3TCFA 4ZZAA 4C0RA 3IORA 3C33A 4QFNA 4XTCQ 2XXRA 1FCKA 2V93A 1LCTA 3EHTA 3BBRA 2Q88A 3LSLA 4MBPA 1IQ7A 5J1DA 2V25A 4GWOA 2A5SA 3PPPA 4OXVA 2P0SA 5FHOA 3JV9A 3O66A 4PFYA 3IL1B 2XX9A 4PP0A 4F19A 1VFEA 4KHZE 4FEBA 5AE4A 4EDPA 3SESA 3ILUB 3RNNA 4FATA 2OLBA 2ZYKA 2CZLA 4GRKA 4RK9A 1MQIA 4ELPA 1Y3NA 3M8UA 4H5GA 1NKXA 1D4NA 4EXKA 1A8EA 1IXIA 1P1WA 1TT1A 4ESWA 1H45A 3TZAA 1VE4A 2DWAA 4KYDA 4WKMA 3KG2A 3A3CA 5F1QA 3E13X 4JDFA 5ICQA 5H8SA 1I6QA 4BDNA 4KPTA 1FQDA 1BTJA 4JSOA 3T9UA 1LBCA 3KOTA 1POTA 3A3UA 3IK6B 1GGGA 2V3UA 1A40A 3H03A 3K00A 1FTLA 3FIRA 3T93B 5CM6A 1JVYA 3RY3A 4JWOA 2OJTA 2UYFA 2HCAA 3VFJA 3K2DA 1BIYA 1LB9A 1QUKA 1OLCA 3G3HA 2OWTA 4JB7A 4LP2B 3OO9A 4R75A 2NUVA 3Q29A 4OMBA 4KR5A 3QIMA 5H8NB 1WODA 4C1TA 2I0BA 3Q26A 3ILTB 5FHMA 2IA4A 1SI1A 4F31B 1FQEA 3RLFE 1M5BA 4XXUA 5I84A 4ZE8A 3OO7A 4QSCA 1GR2A 3FVGA 2KLFA 5JEIA 1VSOA 2XXPA 2RC7A 3O97A 5F7VA 1USYH 3VVDA 5DVJA 4UA8A 1LAGE 4H5FA 4OERA 2D21A 3SETA 4GXSB 3GZGA 3PMXA 3ZS6A 4RXLA 4WEDA 3RPWA 3KSXA 4NF4A 5I56A 2RINA 2I6EA 4RA1A 5H8FB 3T9VA 3SEUA 1FQAA 3KGCA 1B3EA 3MAMA 2Y7PA 2W7YA 3PU5A 4N07A 4POWA 2O1MA 2DVCA 1UTBB 3GLBA 1NH7A 3B6WA 3CSBA 3TFLA 4X1BA 2E0SA 2ALUA 2F78A 3S9EA 2XXVA 1ANFA 4N13A 1R6ZA 3S9MC 1P1QA 1M5FA 4KCDA 3MC2A 4HW8A 1R1NA 4NE4A 3HV1A 2O7IA 3MVYA 4U1OA 5EHMA 1ELJA 5AA2A 1LAFE 1FTJA 5JK4A 1TXFA 3C31A 5DEXB 2DE2A 1MXYA 3GXAA 1SW1A 1ZJLA 2V84A 3C36A 1IXCA 3U8QA 5HPQA 1MQDA 4RNSA 1B3FA 1IUDA 1P1OA 4RPNA 5FTIA 2HAUA 1EZ9A 1GV8A 2XXWA 1N84A 2UVJA 3VXBA 1R9LA 1B58A 1Y3PA 3S9NC 1N7WA 1BLFA 3MZ9A 3TODA 4TLLB 5I59A 5AA4A 1B32A 1B1XA 2H25A 3U72A 2XXIA 2NXOA 1MY4A 1B4HA 1MH4A 3T22A 5A5XB 4XIGQ 3DP8A 3PMWA 2VGQA 4FAJA 3FXQA 4GFRA 4ND9A 2P1SA 1H43A 1PBPA 3FATA 1I6AA 1OIBA 3G3IA 2QS2A 1ZTYA 4OHNA 3LBSA 5AA1A 1A54A 2O69A 4OETA 2PT2A 1OVTA 1NNTA 2F8DA 5B7DA 5TPAA 4JSDA 5KDTA 2UVHA 1SQYA 4MLVA 1JVXA 2H5YA 3OO6A 2G93A 1LCFA 4NF5A 1POY1 1M5DA 2B65A 2H9BA 1FQFA 3C9HA 3EHUA 3R6UA 1SW5A 5ITOA 2I0CA 4IY5A 4M1VA 1NH8A 1S50A 1NL5A 3N26A 3WAFA 3U1OA 3FXUA 1OQHA 2PX1A 3K6XA 4RPOA 1IXHA 3V83A 2OWSA 1LFHA 4ZECA 1JW4A 4F3GA 4AB5A 5CMKA 1LGBC 1LAXA 2YJPA 1LAHE 4ISUA 2Q2CA 3PD8A 2ZNSA 3DP6A 1Y20A 2GRVA 1IXGA 1SW4A 5I58A 3VE1B 4F3PA 4LA9A 3HPIA 3L6HA 3F11A 3IOWA 4OQOA 5AA2D 3G7WA 2XXXA 1O64A 2THIA 4NF4B 5LOMA 4DCXA 5I56B 3H4ZA 1NNFA 4IO3A 3FZVA 4LZ7A 3BFUA 2PMSA 1M5EA 3OEKA 4I8CA 1HSEA 3LSXA 4XKRA 3OEMA 2HQ0A 3E4RA 1OQGA 2YPNA 3HO7A 1B7ZA 1ZKBA 5TU0A 1A8FA 4BDRA 3KN7A 4RJZA 1NMUA 2QL3A 4FECA 1II5A 2UXAA 3GBAA 3LSWA 1IITA 4G68A 1Y4CA 4LQ2A 5AA2B 2I3WA 3QSLA 2ONKE 2P2AA 2Z8DA 3CG3A 4F2QA 1MS7A 2DE4A 3U92A 4X1DA 2O7UA 2DXRA 3RQTA 2V3QA 3M3FA 2RKMA 1IIWA 2VP1A 1DPEA 3QAXA 2IEEA 1N3XA 3FV2A 3W15C 1ZU0A 4U22A 2F7AA 2Y7IA 5I2NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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