3G3GA

Crystal structure of the glur6 ligand binding domain dimer k665r mutant with glutamate and nacl at 1.3 angstrom resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
256
structure length
253
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKRSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Stability of ligand-binding domain dimer assembly controls kainate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 253
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3gA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3gA02
3JV9A 5DVFA 4NWDA 5KDTA 1MDQA 2F6PA 4DXBA 4ZZAA 1JVYA 4QFLA 1H44A 1SW5A 1I6QA 2G93A 2DQVA 4X1BA 3IR1A 1MY1A 4R72A 5L8DA 4OXVA 3E9XA 3FVOA 3L6HA 4G8HA 4GXAA 4FEDA 4OENA 3SEXA 3TELA 4GF8A 4TLLB 3TPAA 2H98A 1JW5A 5ITOA 2QS1A 3MUQA 3U92A 4RNSA 4EQBA 1P1QA 5ELVA 2QMXA 1FQFA 2O51A 1NFTA 3K1MA 2UVHA 5CBRA 3IO6A 5B7DA 1IQ7A 5H8FA 4KPTA 2ONKE 2UVIA 3IX1A 3O6GA 1RYOA 2PVUA 3IOVA 4THIA 5CM6A 1O7TA 2F97A 2HEUA 1TWYA 2QS4A 3FJGA 5CRYA 4XKPA 3C33A 5M2VA 4XTCQ 1PDAA 4AB5A 2PYYA 1MQGA 4WKMA 3OEMA 1I6AA 4BDRA 1B51A 3FVNA 3EN3A 1XVXA 1OLAA 5H8QB 4AB6A 3TQLA 1BKAA 2PMSA 4GLIA 5AE4A 5KCJA 2R9JA 4OYVA 2OZZA 3CSBA 3EQ1A 3OELA 4H8JA 4NF4A 2IA4A 4U22A 1B3EA 4X9TA 5DTBA 1IXHA 4OFOA 4KHZE 4TLMB 4ZEIA 2Z22A 3KBRA 4LZ8A 2V84A 3TTNA 1HSJA 1VR5A 3KJTA 4NWCA 4JDFA 5AA1A 2XHDA 2HFBA 1CE2A 1LFGA 4GL8A 3CI8A 4DDDA 3L6GA 1B0LA 1M5CA 1SD3A 2Q2CA 3QUJA 4LQ5A 2RC8A 4QSDA 3LBSA 3RT6B 2XXWA 5AA4A 4O3BA 4BDNA 2GHAA 4QRZA 5I2KB 3FVKA 3E4RA 4N13A 1ELJA 1H45A 4C0RA 4ESWA 3S9NC 1N7WA 2OK2A 3PPPA 4FATA 4OFJA 3SERA 5LOMA 1B2HA 1GV8A 5BWJA 3OO9A 3THIA 4C1TA 3SKPA 5H8NB 3AXFA 3ZKKA 4TOZA 4H0WA 2NXOA 3Q27A 4LZ7A 1MPDA 1LBCA 1LCTA 4XKNA 1A55A 3S2VA 3KSJA 4PFUA 2OWSA 2M8CA 4TQUQ 4DZ1A 1MY3A 5F1QA 1NL5A 1N0TA 1SQYA 4H8IA 1XT8A 4KCDA 3PPQA 1NH8A 2Y7PA 5BUUA 5FHOA 2H4IA 2HXWA 4GQOA 1DMBA 2Q2AA 5ICTA 2Y7RA 2DSFA 1N04A 1HSEA 1Q1KA 3VLVA 4QFKA 3M3FA 3T66A 5CC2A 4R9FA 1N7XA 3CRBA 1P1UA 4KR5A 2PX1A 2Y84A 2AIXA 2VOZA 3KZGA 3TTKA 3CVGA 4ZDMA 2Q8JA 4OEUA 1RYXA 5FHMA 4Q0CA 2R71A 4HCWA 1AMFA 5JK4A 4YKKA 1QUKA 1R1NA 2I4CA 2DP8A 5I57B 1URGA 1XOCA 1M5FA 3SEWA 1LAXA 1O63A 3UN6A 1FCKA 4OERA 1R9QA 4YMBA 1D9VA 3KJ7A 5HM4B 4ND9A 1PB7A 5EHMA 1JW4A 2VD3A 2ZNSA 2D21A 2I4BA 4F3BA 4PFYA 1MXXA 3TTRA 3M3KA 3CFXA 4U21A 3KGCA 4F3GA 4FAJA 3G3HA 3HSTA 3UA8A 1B05A 3OENA 3FVGA 4DCXA 3ZS6A 2PT2A 1FTJA 4LONB 4P11A 3OO6A 2RINA 4ZE8A 3T9HB 4YKPA 3KN3A 3MQ9A 5CMMA 3GZGA 4EXKA 4KFQA 3VXCA 4F2QA 3IAZA 3ZKLA 2REGA 3MP1A 5I58A 4WXJA 2DVZA 3H7MA 3MVZA 1OVBA 2V3TA 5A5XB 1JVXA 1IXGA 1US5A 1TFAA 4FIMA 1P1WA 5DEXB 2Z8DA 2YLNA 4PE5B 1MM6A 2F5XA 3FJMA 1LSTA 2A5SA 1Q35A 4IO2A 3MVXA 4U2RA 5KCJB 4LQ2A 1M5EA 2F36A 4JXIA 2F7CA 1SYHA 1JQFA 1S9TA 4ISUA 1BIYA 3PD9A 1MXVA 2Y7WA 1O64A 1AL3A 1H3DA 4RXLA 3SESA 5TP9A 5DYHA 2W7YA 4ELRA 3T96B 4OETA 2XXXA 1B7HA 4U4XA 3JZJA 5H8SA 3RPWA 2XX9A 3IB0A 4LA9A 3O6HA 2DWIA 3H6WA 1ZTYA 4OEVA 4IO3A 1R9LA 3ECRA 3FXRA 3VE1B 1MQDA 4Q30B 1US4A 3FGSA 3OOAA 1NNTA 3ILUB 2O69A 3O6IA 1MH3A 3QSLA 3OO8A 2OLBA 1NNKA 2ZYMA 2HAVA 1MY4A 1AH5A 1EZ9A 1CB6A 4FECA 1Y1MA 4EF1A 1B1HA 4GL0A 4KYSA 3TCHA 3I3VA 3OSRA 3N6UA 3TEPA 1UTHA 2B65A 2O7UA 4WEDA 3N26A 1VFEA 3TAJA 3QXMA 1ZJLA 4N07A 3IB2A 2O84X 5K2XA 1B9JA 3HO7A 2H9BA 2DXRA 3S9LC 2QSXA 4RA1A 1Y3PA 3M3LA 2ZNUA 4JBZA 2VD2A 4ESXA 3QK6A 1SYIA 2G29A 4QSCA 2ZYKA 3T22A 1QUJA 5H8HA 5I2NB 1SW2A 1URSA 1M5DA 3IJOB 1B0HA 1FQEA 4F3PA 3O9PA 3RQTA 2I58A 3Q29A 4YB5A 2ZXTA 3U8QA 1DOTA 3RNNA 1EH3A 4DLDA 1S50A 3H4ZA 2UVJA 4WEPA 4UA8A 3VFJA 5DVIA 5CMBA 1SDXA 5ICQA 1ZIUA 3DELB 1SW1A 2D5WA 4R6HA 3IORA 4G68B 4IO4A 4NTLA 3JYRA 3TODA 1DTZA 3K02A 4RYAA 3UGWA 4UACA 4R6YA 1ZLQA 1XVYA 1LAFE 3K1NA 4YKIA 3G7WA 2UYFA 2UYEA 2XD3A 4IY5A 3FV1A 2Z8EA 3G3GA 1ZU0A 3DLNA 2F78A 4ONYA 2DVCA 3OEKA 1M5BA 1FQCA 1Y1ZA 3WAFA 4MF3A 4JWYA 1PBQA 1MM7A 4P0GA 4RPNA 2DE2A 3GBAA 2Q89A 1IITA 2I48A 1Y4TA 4NF6A 3PUYE 3V89B 3CSGA 4MLVA 3SDFA 3WAEA 3S9MC 4HW8A 2AYSA 1LFHA 2V3UA 4LVQA 4IO5A 3TQWA 2HAUA 4R9GA 4JWXA 1AOVA 3O28A 3BFUA 1SVXB 2F7AA 3C32A 1Z7ME 1YTVA 4I1DA 1VSOA 5I58B 3MBPA 1Z7NE 1S7YA 1N3WA 4Z7EA 3VLWA 3W9WA 3IK6B 2ALUA 1B5IA 3D4GA 3IO4A 4KYDA 1JNFA 3B6WA 1IEJA 3K6VA 3PU5A 1SBPA 2LAOA 4F39A 3LUYA 2I6EA 3T9UA 2V3QA 3RLFE 3U94A 3F11A 4EF2A 1B46A 3KEIA 3K1PA 3TKDA 4YMAA 3GLBA 2RCBA 2Q88A 2H5YA 4DIGA 3G3FA 4KYEA 4I9DA 3TMGA 1B5JA 5CMKA 2A5TA 5TP9B 3QYTA 1FW0A 3C31A 1ANFA 1BP5A 2YPNA 1Y4CA 1FTOA 4H67A 3TFLA 1POTA 3H3GA 2NVUB 5TPAB 2WKYA 3CFZA 4U1ZA 2IEEA 5L9SA 5JTYA 2NUVA 1UTBA 3T9VA 4NF8A 2QMWA 1P1NA 4GVOA 3ODBA 3MC2A 1USYE 4PP0A 4RK9A 1GGGA 1Y3NA 1ZKBA 5B70A 3R6UA 4OTEA 3K6XA 3MP8A 4FE8A 2B3FA 1I69A 3RY3A 3TCFA 2ZNTA 3VVEA 3ONMA 3RGYA 1XS5A 2UVGA 2RKMA 4AQ4A 4K3FA 3V8XB 1WVJA 3V5AA 1B5HA 4YB7A 1OIBA 3LC8A 1RKMA 1UTHB 3USDA 1IZ1A 2XXUA 3IOTA 5KDTB 4H65A 3HPIA 2PBWA 2ANJA 2NWJA 4LATA 4QFNA 3G3KA 1QKBA 1QULA 5AA2A 1IXIA 5H8QA 4R75A 3PMXA 2RC9A 4G68C 4F31B 1MRPA 4YB6A 3PMWA 4OVJA 3R26A 3HHFA 5J1DA 4HTGA 1OQHA 1J1NA 3C4MA 4DXCA 4BDOA 5I84A 4X48A 3A3CA 2V25A 4OMBA 5L9OA 2I0BA 5AA3A 3RTFB 3FJ7A 5H8FB 3FUZA 3HV1A 4H6DA 2F7BA 3LSWA 2OJTA 4YAHX 2XXRA 1MH4A 4O3AA 5IKBA 1FTKA 5AA2D 4BLAA 2HZKA 4IB2A 2ONSA 3QAXA 2ZYOA 1EZOA 3K6UA 4I62A 1VFDA 3W15C 2I3WA 3TTMA 4EQ7A 3RTWB 3BKIB 3FV2A 4U23A 1OVTA 2GRVA 3C35A 3E3KA 4F19A 2X26A 3FASA 4R74A 2QS2A 3CG3A 3C34A 5I2KA 4F29A 3EF7A 1I6BA 3O2AA 4YKJA 3GBBA 3UIFA 1N3XA 3R7XA 4GXSB 1KWHA 4OZ9A 5I59A 3PD8A 1TXFA 1D4NA 2V93A 3ILTB 5CBSA 3I5OA 2X7QA 2E1SA 4NF4B 4EXLA 1LLSA 3MPLA 3TDJA 1B3FA 4OESA 2Y7KA 1II5A 3QUFA 3HCQA 4U4SA 1NNFA 3RT8A 5I56A 3K6WA 3VV5A 4F3SA 3MW0A 3RN8A 2DE3A 2R6GE 4NF6B 1B6HA 3GXAA 1TT1A 4YZZA 4R2FA 5ITPA 5DT6A 1UIUA 4R6KA 1FQDA 4YICA 3N6TA 1MS7A 5K2YA 1AIVA 4Q5TA 1B3LA 3ZSFA 3CFLA 1BTJA 3PGFA 2P0SA 1B3GA 5AA4B 3MP6A 4JSOA 4ZECA 1B52A 2ZMBA 5CMCA 1B4HA 2QPQA 4GFRA 2DWHA 4OHNA 5EYFA 2XXPA 1DPPA 4G77A 1MXWA 1NNPA 3A09A 3MVYA 4POXA 3O97A 4POWA 4G8NA 1Y3QA 1MG1A 3Q26A 4F2OA 1XHYA 3SEVA 4QFPA 1USYH 5EHSA 1PB8A 1B58A 3UP9A 2A5TB 2XD2A 1P1OA 1YCJA 4H5FA 2GFEA 5I57A 1EZPA 3TCGA 3IJXB 4N6PA 4ZEDA 1SW4A 3H6TA 3EHUA 4ECFA 4G2ZA 3G3JA 3EHTA 4GOTA 4MFIA 2O1MA 3UORA 5JTYB 4ZS9A 4M1VA 1UTBB 1A54A 3O29A 4NF8B 4DCYA 1MXUA 3PPOA 1SI1A 2THIA 2F6GA 1POY1 4GWOA 3RUMA 4RY1A 3PPRA 4IY6A 3FZVA 3KOSA 1H43A 1NMUA 2ONRA 3IL1B 4E0WA 3DM0A 3T9XB 2RF1A 2OWTA 2XXHA 3K00A 1T0KA 5HBCA 3MPKA 3PMVA 2F35A 5ISUA 2QRYA 2RCAA 4R73A 3H6VA 2FYIA 4L17A 2DWJA 3PUWE 2OCUA 4LZ5A 2DS9A 1URDA 3FATA 3MZBA 4QHQA 1B7UA 3BFTA 4F18A 5A5XA 5KZTA 3H03A 4MH5A 3S4UA 5AA2B 5IAIA 5DEXA 4KI0E 2I49A 4Z0IA 3DP4A 1NH7A 2O1LA 4EQ9A 1OLCA 4HS7A 4QSEA 1LAGE 1OQGA 5DVJA 3C9HA 4LP2B 5L9MA 2HZLA 4RJZA 4O3CA 2XX7A 2XXTA 1FQBA 1WDNA 4NE4A 4IO6A 1MPBA 4FJPA 4GRKA 4PQJA 3KSXA 1R6ZA 4MBPA 4ZEBA 1HSLA 1L5TA 1NKXA 1LGBC 2H99A 1LCFA 2I3VA 1LFIA 3FXQA 2GH9A 3BBRA 3MZ9A 1B40A 3HN0A 3H06B 4ZE9A 2ABHA 1QUIA 4GD5A 3M8UA 3TYHA 1MY0A 4PFTA 3LSLA 3O66A 1MPCA 3LR1A 1B7ZA 3TUSA 3VXBA 3DP8A 4IGTA 4M4GA 2DWAA 4YU0A 2F8DA 3SETA 1B4ZA 1PB9A 2I0CA 4KD5A 4NF5A 1D9YA 2AL4A 4OQOA 3IOUA 3K0VA 2HCAA 2Q9TA 4OFLA 3C36A 4E0XA 2FA7A 3OO7A 4KQPA 5I59B 3A3UA 4BDQA 2VGQA 4X1DA 4DE8A 3KN8A 1MY2A 3B7DA 3CR9A 1MQIA 4JWOA 3B6TA 4ELPA 4MLQA 2P1SA 1IUDA 1ATGA 2QJEA 3OXNA 1PC3A 1FTLA 2AL5A 5I56B 5FHNA 4NEDA 1MXZA 4RPOA 2O7IA 3PPNA 2QL3A 4XKQA 2XXVA 2B3BA 2DYXA 2ZYNA 3OD7A 3E13X 3K2DA 1YPNA 4IO7A 5I2NA 2O6AA 3TTLA 3MZ1A 3LSFB 4HCYA 3T93B 4NMYA 3TZAA 1H76A 2CMOA 1MQJA 1MQHA 3MWBA 3U93A 2RC7A 3VDFA 4Q8RA 5JEIA 3D4CA 2OBGA 1OMPA 4C1UA 3KG2A 3N94A 3PUVE 4KCCA 3FXUA 1PEBA 1JW1A 4EUOA 2QS3A 4XIGQ 1YAEA 5CI5A 3B6QA 2X7PA 2DE4A 4OWDA 3PV0E 1F9BA 2VP1A 3PUXE 1P99A 4ZZEA 2DXYA 3DP6A 4G68A 3U72A 2D3IA 4DXUA 1LB9A 1MDP1 4ELQA 3FD3A 3LSXA 2NOOA 2XXQA 3MAMA 1N76A 1Y20A 4I8CA 1LBBA 3FIRA 1IIWA 1JEVA 5H8HB 1B32A 1N84A 4H1XA 3OSQA 4P0IA 2BJJX 3K4UA 3VVDA 3CG1A 1QW0A 3UK4A 1A8FA 2KLFA 4ZEFA 1UIVA 4ZEKA 5TU0A 3MJNA 3SEUA 4BDLA 4JSDA 3SEYA 1DSNA 4R2BA 1DTGA 3MVWA 2XXYA 1GR2A 1ZBMA 2DOJA 3CIJA 4U1OA 3H6UA 4JB7A 4BDMA 2GHBA 2E0SA 3PUZE 2Y7IA 1LAHE 4XXUA 1FTMA 1VE4A 1A8EA 1EU8A 3I6VA 1QKAA 2Z23A 3KN7A 1Y9UA 1LB8A 1GVCA 1QVSA 3V83A 1MXYA 2VHAA 4H5GA 4GIZA 3Q28A 2CZLA 1SI0A 1A99A 1PBPA 3W9VA 2XX8A 5FTIA 2O68A 2UXAA 2Z8FA 5H8NA 5HPQA 1DPEA 2ESNA 3IOWA 3P7IA 4F1UA 1XC1A 5FTHA 4FEBA 1WODA 1IXCA 2FNCA 3IB1A 1UQWA 3KOTA 2YJPA 3N5LA 3K01A 3VVFA 1ZMGA 2HQ0A 4G4PA 4EDPA 1B1XA 1A40A 1JEUA 2PT1A 2P2AA 3EHSA 1BLFA 3QIMA 4QFOA 3VLUA 3HHGA 1GTKA 1TFDA 5TPAA 3S9EA 4F1YA 4F1VA 2F34A 4FORA 4F22A 1FQAA 3U1OA 1A7LA 3EPEA 2H25A 3KFMA 3OMBA 4RK2A 5F7VA 3G3IA 2REJA 4XKRA 4ELOA 1D3KA 4PETA 4LUBA 2XXIA 4NF5B 3Q25A 4IGRA 4PFWA 1B3HA 4G8MA 1JETA 4QF9A 1QJMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JV9A 5DVFA 1LBZA 4NWDA 5KDTA 1MDQA 2F6PA 4DXBA 4ZZAA 1JVYA 4X8RA 4QFLA 1H44A 1SW5A 4MJOA 1I6QA 1AWBA 2G93A 2DQVA 4X1BA 1INPA 3IR1A 1MY1A 4R72A 5L8DA 4OXVA 1K9ZA 3E9XA 3FVOA 3L6HA 4G8HA 4GXAA 4FEDA 4OENA 3SEXA 3TELA 4GF8A 4TLLB 3TPAA 2H98A 1JW5A 5ITOA 2QS1A 3MUQA 3U92A 4RNSA 4EQBA 1P1QA 5ELVA 2CEXA 2QMXA 1FQFA 2O51A 1NFTA 3K1MA 5IZ1A 2UVHA 5CBRA 3IO6A 5B7DA 1IQ7A 5H8FA 4KPTA 2ONKE 2UVIA 3IX1A 3O6GA 1RYOA 2QVRA 2PVUA 3IOVA 4THIA 5CM6A 1O7TA 2F97A 2HEUA 1TWYA 2QS4A 3FJGA 4P47A 2Y5KA 4PCDA 5FBPA 1NUYA 5CRYA 4XKPA 3C33A 5M2VA 4XTCQ 1PDAA 4NN3A 2PYYA 4AB5A 3SZPA 1MQGA 1EYKA 4WKMA 4PGNA 3OEMA 2XWVA 1I6AA 4N8YA 4BDRA 1B51A 3FVNA 3EN3A 3BIGA 1XVXA 1OLAA 5H8QB 4AB6A 3D1RA 1IMEA 3TQLA 1BKAA 2PMSA 4GLIA 5AE4A 5KCJA 2R9JA 4OYVA 2OZZA 1QGXA 3CSBA 3EQ1A 3OELA 4H8JA 4NF4A 2IA4A 4U22A 3MYUA 1B3EA 4X9TA 5DTBA 4UABA 1IXHA 4OFOA 4KHZE 4TLMB 4DI4B 4ZEIA 3QMFA 2Z22A 3KBRA 4JVIA 4LZ8A 2V84A 3TTNA 1HSJA 1VR5A 1FPEA 4I40A 3KJTA 4NWCA 4JDFA 3KBZA 5AA1A 2XHDA 2HFBA 5ESYA 1CE2A 1LFGA 4GL8A 3CI8A 4DDDA 3L6GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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