3G3HA

Crystal structure of the glur6 ligand binding domain dimer k665r i749l q753k mutant with glutamate and nacl at 1.5 angstrom resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
256
structure length
252
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKRSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITLAILKLQEEGKLHMMKEKWWCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Stability of ligand-binding domain dimer assembly controls kainate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 252
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3hA02
2X26A 4DZ1A 1LFIA 1H76A 5AA1A 3EHUA 1POY1 1IUDA 3IK6B 4R73A 5H8HA 2DSFA 1AMFA 1B1HA 4IY6A 4PETA 4HTGA 3UN6A 3BBRA 2PT1A 1RYXA 1MQIA 3OSQA 3V89B 3IORA 2V84A 3HHGA 1QVSA 4AQ4A 3D4CA 1SW2A 4ESWA 3RLFE 1NH8A 2DE2A 1LCTA 3THIA 5ITPA 3FASA 1OLCA 4N6PA 2ONKE 1TWYA 4E0WA 4Q0CA 3SEYA 1D4NA 1H3DA 1D9VA 2VD2A 5JK4A 1JW5A 3CI8A 5JTYB 1F9BA 3IOTA 2XD2A 5AA2A 4XKPA 5CM6A 3OMBA 1S9TA 4U4XA 1US4A 3HHFA 1IEJA 5EYFA 4G68B 4MLQA 2UVHA 2V3UA 4GXSB 5AE4A 2P0SA 3EF7A 3KG2A 4I62A 3T9VA 2YLNA 2F7AA 1LFGA 3I3VA 3SEVA 1XT8A 5A5XA 3O6HA 4NF4B 5L8DA 3CG1A 2DWHA 4OEVA 4U21A 2DE4A 5CMCA 4RK9A 4RA1A 1M5DA 4YAHX 3MP1A 3SEWA 4PFWA 3DP6A 3DP8A 3RNNA 4H8IA 1B58A 1NNFA 4F3SA 4R9GA 4QSDA 1SI0A 1B3FA 4DXCA 1B3LA 4H8JA 1B6HA 3K6WA 2DVZA 3FUZA 1LAFE 1JEUA 4OETA 2OLBA 3B6QA 3FJMA 5B70A 3GBBA 1N04A 3FXUA 3OO8A 1JNFA 4P0IA 2QMXA 4O3CA 3S2VA 4HW8A 2XXQA 2XXVA 4LVQA 1MPBA 3KOSA 1MPDA 3SESA 3RTFB 2Q88A 3M3FA 2IEEA 1MQHA 4GXAA 4F2QA 4U22A 4OERA 4F3BA 2A5SA 3BFUA 1D3KA 1Z7NE 4XKRA 2LAOA 1Y1ZA 3PPQA 1B3HA 1QUIA 2CMOA 4H65A 1B40A 1MQGA 2V3QA 1AH5A 1QUJA 1Y3QA 2FNCA 2XXHA 2O6AA 3QIMA 2B3FA 1UTHB 4PQJA 2DOJA 1FQCA 4DCYA 3O29A 2O1LA 2VD3A 3C34A 2RC7A 5L9MA 1USYE 3UA8A 4F31B 3HO7A 5I2KB 1ZKBA 2G29A 2Y84A 3MC2A 3VVFA 1NKXA 2NOOA 1FTKA 3H6TA 1OMPA 1SBPA 4LONB 1JW4A 3G3GA 2F5XA 5DVFA 5CMBA 5TP9B 3RY3A 4U1ZA 1A55A 3T22A 1O64A 3OOAA 1EH3A 3N6UA 4ELOA 1SW5A 1JW1A 1S7YA 5FHMA 3ODBA 1IXIA 4F18A 1SDXA 1MQJA 4GD5A 4HCWA 3K6XA 4X48A 4YICA 2AYSA 5BUUA 5F7VA 4ISUA 5EHSA 4XIGQ 3C33A 5ICTA 3RQTA 3PPPA 4PFYA 4MBPA 3N26A 2O7UA 1B7HA 1XVXA 2F34A 2GRVA 4YB5A 2ZYKA 4TLLB 1TFDA 1B5JA 4OMBA 2ONRA 3SERA 4QFNA 3LSFB 3KSJA 2XXIA 3MZBA 4KD5A 1IZ1A 2P2AA 2F35A 2OBGA 3M3KA 1JETA 4GL0A 3SKPA 3LSWA 2B65A 3OELA 4EUOA 4IO5A 1P99A 3K4UA 3UIFA 4R74A 5AA4B 1ZJLA 1O63A 4JSOA 1PBQA 2ESNA 5I2NA 4BDQA 4POXA 3H4ZA 4L17A 4F29A 1GR2A 3S9LC 1MQDA 2AL4A 1O7TA 1NH7A 3O28A 2HXWA 3IOUA 1H43A 3IO6A 3Q29A 1JQFA 3TAJA 1EZOA 4ZE8A 2HEUA 4RXLA 3C31A 4OZ9A 2I58A 1M5FA 2I48A 4I9DA 1ZBMA 2I4BA 4WEDA 3IB1A 1N0TA 1ELJA 4ZDMA 3LUYA 5H8FA 1OLAA 5I56B 1B52A 3WAFA 1MXVA 2Q8JA 2A5TB 4QFPA 4H5GA 2NXOA 2HAVA 3O97A 2QJEA 2OWSA 5I57A 2DE3A 1QKAA 4MFIA 3KN3A 3R26A 4NWDA 4R2BA 4EXLA 2Q9TA 3HV1A 3TODA 2D5WA 1B46A 3C9HA 1FQBA 3HPIA 4X1DA 3OD7A 4P11A 1B32A 1XC1A 2I0BA 2RKMA 5ISUA 4BDMA 5I59B 1DPEA 4F19A 1MXZA 4Q8RA 4HCYA 5B7DA 1ZTYA 3PMXA 1IQ7A 4OFLA 5ICQA 3EHTA 4R6HA 2NVUB 4LZ7A 4MF3A 4ZZEA 2HCAA 1ZLQA 1MS7A 1M5EA 4RY1A 2DP8A 3TZAA 2H99A 1HSEA 4C1UA 3T96B 3VXCA 2REJA 5DVJA 4EF1A 2ANJA 3FVOA 4C0RA 1Y3NA 1OVTA 5K2XA 3P7IA 4GL8A 2F6GA 1IXCA 1MXYA 2Y7PA 3FGSA 1FTLA 4OESA 4NF5B 1B9JA 2UYEA 3K00A 3O9PA 3C4MA 4QRZA 4NF8B 4H67A 5KDTB 4NMYA 3VLWA 1CB6A 2ZNUA 1DSNA 3MJNA 3K02A 4FEDA 3PD9A 1GV8A 4P0GA 3ZKLA 1PB9A 3LR1A 2ABHA 5KZTA 2HAUA 3TCGA 1H45A 3TKDA 3K2DA 3Q27A 4KCCA 1BTJA 2O51A 2UVJA 4OFJA 2I0CA 4AB5A 4U2RA 1LCFA 2Y7RA 2I49A 2QS2A 1Q35A 3OEKA 1QW0A 1BIYA 1OVBA 2GHAA 5CI5A 3BKIB 5JTYA 1VE4A 1B7ZA 1MY4A 2HQ0A 3SDFA 3H7MA 4LQ2A 2QS4A 1MDP1 3FZVA 2XX9A 4QSEA 1AOVA 4H0WA 4FJPA 3MQ9A 3IR1A 2I3WA 3AXFA 1XS5A 2Z8EA 4KI0E 5CMKA 4GFRA 3OO7A 4G68A 4BDOA 3L6GA 2QS3A 1FTJA 4QFOA 2OJTA 4C1TA 2XXYA 3FV2A 2Z8FA 5CMMA 3QUFA 4TLMB 4H5FA 2XXTA 5TU0A 2F7BA 1FQDA 2DWIA 3PPRA 1R9LA 2H5YA 3C36A 2DXYA 3PPOA 4NF4A 4IO3A 3OO9A 3GZGA 1PEBA 3TDJA 2QPQA 1LB9A 1SD3A 1MM7A 4RJZA 1TT1A 4FECA 4I8CA 4JBZA 1ZMGA 1B7UA 3W15C 3MPLA 3VLVA 1US5A 1JEVA 3N6TA 5F1QA 4GWOA 4Q5TA 1VFDA 3E4RA 4KQPA 4YZZA 1WODA 2ZXTA 4OEUA 4XTCQ 2O84X 1RYOA 3MVZA 4JXIA 3H06B 2Q89A 4G68C 3B6WA 1VFEA 1PB7A 4G8NA 4U23A 2FYIA 1Y4CA 5JEIA 3E9XA 4TOZA 3U8QA 2I3VA 4R75A 2YPNA 3V5AA 4FE8A 2PBWA 4E0XA 1MXXA 3TQWA 4FATA 1B3GA 3T9HB 3PUVE 4ZS9A 1B5HA 1A99A 3CSBA 2RCAA 2XXUA 3EN3A 1LFHA 1YPNA 1IIWA 3K1MA 4F1UA 3OENA 2HZLA 4IB2A 3VV5A 4NWCA 2W7YA 3K6VA 3U72A 3ILTB 3Q25A 1A7LA 1P1OA 5DVIA 4THIA 3UGWA 4R9FA 5DTBA 3VXBA 3HN0A 2XD3A 4LZ8A 4F3PA 4M4GA 3TEPA 4R72A 4G8MA 2IA4A 1P1NA 1EZ9A 1Y9UA 3Q26A 3MWBA 1UTHA 4NEDA 2DXRA 1B1XA 3FV1A 1GTKA 1QJMA 5M2VA 3CRBA 1N3XA 4OYVA 4YMAA 5I2KA 4N07A 4JSDA 5EHMA 3EPEA 4OQOA 4R6KA 3QUJA 1A40A 4DXUA 5TP9A 2Y7IA 2PT2A 1P1WA 3PUXE 4U1OA 1PB8A 3RUMA 4IO4A 4ZZAA 1IXGA 4LP2B 2ZYNA 2R9JA 1JVXA 1YTVA 2VHAA 1UIVA 4I1DA 3MUQA 3G3HA 4F1VA 3IOVA 4WEPA 3MPKA 5H8QB 2PVUA 1Y3PA 3CFXA 1MRPA 3O2AA 3PUZE 4NTLA 1FW0A 3LBSA 2UYFA 1SW1A 3QYTA 3TTRA 1N84A 4OHNA 3ZSFA 2AL5A 1XOCA 3LC8A 4QFKA 4ECFA 2UVGA 3JYRA 3PUWE 3OEMA 3TELA 2DVCA 1IXHA 5AA4A 1B05A 1MH3A 3C35A 5ITOA 1PBPA 3KN8A 3IAZA 4JB7A 1MDQA 3GLBA 1LAXA 3I6VA 1UIUA 4PFTA 2UXAA 3TTMA 3H6WA 3MVXA 3UK4A 3FXRA 4ZEBA 1GVCA 2BJJX 1NL5A 4QF9A 2D3IA 1NFTA 4ELPA 3A09A 1SYHA 3KZGA 5DEXB 1LB8A 4O3AA 3MVWA 2ALUA 3Q28A 4Q30B 5AA2D 3S4UA 3CR9A 4K3FA 3BFTA 5I56A 3V83A 4ZEIA 3MZ1A 3TQLA 4EXKA 1SQYA 2A5TA 4UA8A 4F3GA 5FHNA 5BWJA 5HM4B 3IO4A 4KR5A 3VVDA 4GQOA 3G3KA 3U92A 3TTLA 1B0HA 3K1NA 1RKMA 3K01A 3QAXA 1OIBA 3CG3A 2RC9A 3RT6B 5IAIA 4X1BA 2H98A 3S9NC 2XXXA 4OTEA 5HBCA 2M8CA 2QMWA 3PPNA 5I59A 1Y20A 2I6EA 3T9XB 1AL3A 1A8FA 2OCUA 4IGTA 3GBAA 1UTBB 4YKKA 1QULA 5TPAB 4BDLA 4RK2A 4FIMA 5H8NB 2AIXA 3C32A 1URSA 4NF6B 5DYHA 1AIVA 1URDA 3FVKA 1B3EA 5CBRA 5KCJB 3O66A 3U1OA 1ANFA 3IOWA 4M1VA 4YB6A 4KYEA 3TCFA 3PD8A 2R71A 1B51A 3ILUB 1MH4A 3FVGA 4KHZE 4ELQA 5DT6A 4DDDA 3FJGA 1A8EA 2Y7KA 3E3KA 3VDFA 3TTNA 2THIA 4NF5A 3CVGA 2OZZA 3TMGA 3RN8A 2DQVA 2O7IA 5L9SA 2QL3A 4XXUA 1P1UA 4NF8A 1NNPA 5KDTA 1MM6A 2H25A 1GGGA 1P1QA 2DYXA 3A3UA 1B0LA 3KOTA 1TFAA 3MW0A 4QSCA 1OQHA 5H8HB 5LOMA 2X7QA 3JZJA 3O6GA 1YAEA 4XKNA 3T93B 4KFQA 1FTOA 1I6QA 1MG1A 3KN7A 1EZPA 4UACA 3PGFA 3PV0E 2CZLA 1HSJA 3PUYE 2QRYA 2F36A 3S9EA 1BLFA 4YMBA 4XKQA 4QHQA 1FQEA 1EU8A 1J1NA 3U94A 4U4SA 4JWOA 3PU5A 3TFLA 4ONYA 2NUVA 3PMWA 3IL1B 4KPTA 3R7XA 4JDFA 1Y4TA 2HFBA 4DE8A 2F6PA 5I58B 5I58A 3FVNA 5AA2B 2GHBA 4GOTA 1FQAA 2DWAA 3FXQA 4AB6A 1KWHA 3VE1B 4YB7A 4EQBA 2FA7A 5CRYA 3I5OA 3G3JA 3N94A 1R6ZA 1T0KA 3TPAA 2Y7WA 4F2OA 3KJ7A 1I6BA 1II5A 3N5LA 4YU0A 2OWTA 4EQ9A 3L6HA 5CBSA 5AA3A 4Z7EA 4ZE9A 4YKPA 5A5XB 1LAGE 1I6AA 2DWJA 4GVOA 4FAJA 3KGCA 4PFUA 2RF1A 5ELVA 1MPCA 3KFMA 2V3TA 2Z8DA 1DMBA 4ZECA 1USYH 1SI1A 3MBPA 2HZKA 4ZEFA 2ONSA 4OXVA 3IB0A 3OSRA 1S50A 3O6IA 5K2YA 3W9VA 4GIZA 1H44A 1Q1KA 1B4ZA 4IGRA 2REGA 4NE4A 4LUBA 2XXWA 5H8SA 3MP6A 4TQUQ 4ESXA 4R2FA 3HSTA 1DTZA 2KLFA 3QXMA 4EF2A 1VSOA 3UP9A 1CE2A 4EQ7A 2XX8A 3A3CA 1B5IA 3HCQA 1PDAA 2P1SA 2QS1A 2F8DA 3M8UA 5I84A 1N76A 2O1MA 4YKIA 3TCHA 4KCDA 4OFOA 3KSXA 4DXBA 4H1XA 1XVYA 3E13X 4O3BA 3EHSA 2RC8A 4FEBA 4DLDA 1POTA 3W9WA 3IJOB 1SYIA 3T66A 4IO7A 1R1NA 1LBBA 1Z7ME 2QSXA 3M3LA 2Q2CA 4LA9A 3WAEA 2PX1A 3EQ1A 4JWYA 4OWDA 1YCJA 1WVJA 1L5TA 1M5CA 4MH5A 1UQWA 3V8XB 3K0VA 1DOTA 2PMSA 3H3GA 1MY0A 4BDNA 2PYYA 3KEIA 1LBCA 4N13A 3R6UA 3H6UA 1JVYA 3KBRA 2XXPA 3CSGA 2ZNTA 3SEXA 1N7WA 3K1PA 2F97A 1B2HA 1NMUA 4RPNA 4F1YA 4YKJA 2O69A 4ZEDA 3CFZA 2V93A 1MXWA 3RGYA 3QK6A 5FHOA 3F11A 1MY1A 3LSXA 1A54A 4H6DA 4LZ5A 4LQ5A 1URGA 4IY5A 3UORA 3ONMA 3CIJA 2H4IA 1MY3A 2E1SA 4IO6A 2ZYOA 4BLAA 1DPPA 3B6TA 1WDNA 5H8QA 4GLIA 3VFJA 4ELRA 4EDPA 3VLUA 3FJ7A 4FORA 4RPOA 2X7PA 1NNTA 2UVIA 1QUKA 3OXNA 2XX7A 5FTHA 2F7CA 4PE5B 2Z22A 1N3WA 1VR5A 2NWJA 4GF8A 3TUSA 2R6GE 1HSLA 2G93A 4GRKA 4G4PA 2ZNSA 4ND9A 3MVYA 3TTKA 1B4HA 3DELB 3S9MC 3JV9A 4POWA 4R6YA 1D9YA 3U93A 1LGBC 3H6VA 4G8HA 4F22A 1MY2A 4IO2A 5I2NB 2O68A 3RT8A 2Z23A 2VGQA 4QFLA 1IITA 3DLNA 4Z0IA 1R9QA 1LSTA 3MZ9A 2V25A 5DEXA 3RPWA 4RYAA 1LAHE 3B7DA 4X9TA 3ZKKA 3IB2A 2VOZA 1QKBA 1ZIUA 2Q2AA 4DCXA 3G3FA 3SEUA 1MXUA 1PC3A 2OK2A 3IJXB 3TYHA 1XHYA 2D21A 4F39A 4MLVA 5H8FB 4PP0A 4KYDA 3ZS6A 3SETA 1BP5A 4OENA 2XXRA 1NNKA 1FTMA 3FATA 4OVJA 3H03A 5I57B 5HPQA 1SVXB 4HS7A 3FIRA 3DM0A 1TXFA 5FTIA 2I4CA 1LLSA 3IX1A 5J1DA 3USDA 2YJPA 4DIGA 3T9UA 2H9BA 4WKMA 3VVEA 4LATA 3K6UA 1I69A 2RINA 3OO6A 5L9OA 1ZU0A 1Y1MA 4G77A 3MAMA 4G2ZA 1BKAA 4KYSA 3DP4A 2B3BA 1FQFA 1N7XA 1UTBA 3PMVA 5TPAA 4ZEKA 3GXAA 1M5BA 4RNSA 5H8NA 3G3IA 1SW4A 3KJTA 4NF6A 3MP8A 4JWXA 5KCJA 3QSLA 2WKYA 3FD3A 4BDRA 5IKBA 3D4GA 1ATGA 2ZMBA 4WXJA 2GH9A 3ECRA 3LSLA 1DTGA 2RCBA 2XHDA 2VP1A 1FCKA 1OQGA 2DS9A 3G7WA 2GFEA 5CC2A 2E0SA 3RTWB 3CFLA 2F78A 2ZYMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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