3G7WA

Islet amyloid polypeptide (iapp or amylin) residues 1 to 22 fused to maltose binding protein
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
393
structure length
393
Chain Sequence
MKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAKCNTATCATQRLANFLVHSSNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Sugar binding protein, hormone
source organism Escherichia coli
publication title Atomic structures of IAPP (amylin) fusions suggest a mechanism for fibrillation and the role of insulin in the process
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Islet amyloid polypepti
total genus 123
structure length 393
sequence length 393
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g7wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g7wA01
4I1DA 3FVGA 2Q2AA 1NL5A 3DM0A 1JEVA 1MXVA 2XX9A 3SKPA 3P7IA 5JK4A 1MQGA 2HAUA 4ZE9A 3ECRA 4P11A 4F29A 1S7YA 5ICQA 2Z23A 4YMAA 3MP8A 1B3LA 1L5TA 1QKAA 2O84X 3S4UA 3PPRA 2X7PA 1MXXA 4PP0A 1UTHA 4NF6B 2DE4A 2QS3A 1IUDA 1Q35A 3MC2A 3TMGA 4U1OA 1M5FA 2DSFA 4MBPA 2VP1A 4YKJA 5L9OA 5CMKA 1VE4A 2LAOA 4YICA 1FQFA 1MXYA 4ESWA 2DQVA 4KYSA 4OEUA 1PB9A 4KI0E 4U4XA 1ZJLA 4KD5A 1OVBA 1N04A 2F7CA 2V3UA 5I56B 4WEDA 1JW4A 1IZ1A 5DVJA 5H8FA 4F3SA 3K6VA 3CFZA 2R9JA 1BKAA 2Y7IA 3G7WA 2GHBA 3M3FA 2DOJA 1QW0A 5H8SA 2R6GE 2HXWA 3KZGA 3QUFA 5I58B 4OFOA 4C1TA 3L6GA 2DXRA 2Y7KA 3JV9A 1LGBC 2B3BA 5FHNA 5EHSA 4ZDMA 1B7UA 4DZ1A 1IITA 2D3IA 5DTBA 2DVCA 3O2AA 3C4MA 3VFJA 4POXA 1DOTA 1BTJA 3IX1A 3VLWA 1B3EA 2GHAA 2PVUA 1Z7NE 3CR9A 1WDNA 1I6BA 1DPEA 3T9VA 1A55A 3H6TA 1QVSA 1UIVA 2H99A 3GBBA 3MZ9A 2QPQA 4TQUQ 1SW2A 2RF1A 3IB1A 3KN8A 1B40A 4U1ZA 3KSXA 2F97A 2CZLA 1ZMGA 3LC8A 3GBAA 1UTBB 3FGSA 4H65A 5I59A 2O68A 2UVGA 3GLBA 3HSTA 4OXVA 4QHQA 4F3GA 1OLCA 3U93A 3RUMA 3PMXA 1LAGE 3R26A 3ZS6A 1QUJA 3OO9A 4QSCA 3THIA 3U1OA 1POTA 3S9MC 2YPNA 4GLIA 2AL4A 1N7XA 3I3VA 4EQBA 1US5A 4YB7A 1B1HA 4RPOA 4WXJA 4F1YA 2I48A 3TQWA 3PPNA 1AH5A 4ZEFA 1BIYA 2H25A 2HAVA 4POWA 4RXLA 3A3CA 4DXUA 1MPCA 2Q9TA 3LBSA 1JQFA 4N13A 4NF4A 3L6HA 2F34A 4YMBA 4O3AA 2QJEA 2HZLA 1B05A 2XXPA 3JYRA 3ILUB 4JB7A 4EXLA 1Z7ME 4R6KA 3C9HA 1P1NA 5H8NB 3ONMA 3K1PA 2Q8JA 1FQEA 5B7DA 4FEDA 4X48A 3RY3A 2I58A 1R6ZA 3O6HA 4ISUA 2RCBA 4TOZA 2A5TA 2DXYA 4O3CA 5KZTA 2XXVA 1LAHE 3T9UA 3CFLA 3LUYA 3MVYA 1HSJA 2F36A 4H8IA 1MY1A 5AA4A 1Y3PA 5ICTA 5HBCA 3HN0A 3O6IA 1OLAA 3K0VA 5H8HB 3OXNA 4OESA 4R9GA 1LCTA 3MJNA 4R6HA 4FAJA 4R73A 1MQDA 2VGQA 3IR1A 1US4A 1ZLQA 4PETA 3MPLA 2O1LA 2OWSA 3K6XA 4IY5A 2DE2A 4FORA 1II5A 5A5XA 5I2NA 5CBRA 2GH9A 3MVZA 4R6YA 3VVFA 2XHDA 4GXSB 1RYOA 4LVQA 3QYTA 1TT1A 4XTCQ 1SW1A 3WAEA 4F3PA 5CI5A 3HV1A 2XXRA 3C34A 3CVGA 3M3KA 4RPNA 3PU5A 4DXBA 4GIZA 3K00A 3G3KA 3O29A 3V8XB 2XD3A 2XX8A 4JXIA 4ZEBA 3RTWB 1A8FA 3MVXA 5I57A 4U23A 3T93B 3VXBA 2X7QA 1UTHB 1MY3A 1HSLA 2ANJA 4GF8A 2G93A 1IXIA 4M1VA 3V5AA 1Y3QA 4R9FA 3OENA 2M8CA 4K3FA 3FJMA 1B7HA 2QRYA 2P2AA 3W9VA 2OLBA 1MQHA 3PUYE 3N26A 4RNSA 1N84A 2XXWA 1POY1 4ZZEA 4ND9A 4EF1A 3K02A 5JTYB 3VDFA 1N7WA 4F1VA 2Z8DA 3SEXA 2ZMBA 4EXKA 1D3KA 1URSA 4EQ7A 2RINA 3QXMA 3HCQA 1N0TA 4IO4A 2XXXA 4FATA 3MP1A 2B3FA 1J1NA 3G3GA 4ZEDA 2F35A 4ELRA 4ZE8A 4NWCA 5ISUA 1A99A 1LFIA 3QIMA 4ZEIA 2V93A 2O6AA 3FV2A 3HHFA 2HFBA 1HSEA 1QJMA 1MXWA 1GVCA 1TWYA 3M3LA 2UVHA 3E4RA 3PPOA 1DSNA 2NXOA 3K2DA 4ELOA 1FW0A 2OK2A 1P1WA 4KR5A 4R72A 1PB7A 1URGA 2IEEA 1N3XA 3IB2A 3U72A 4QFPA 1USYH 2F78A 4N07A 4I62A 1MY0A 3CIJA 3D4GA 1JVYA 2O7UA 1NNTA 1AL3A 4X9TA 5F7VA 3KGCA 4KFQA 2ONKE 2QS4A 3TCGA 3H7MA 3FJ7A 1IIWA 2RC9A 1D4NA 2H98A 2QMXA 5I59B 1A54A 1VFEA 1EZ9A 4I9DA 2DS9A 4OHNA 1A7LA 4MH5A 5ITPA 4BLAA 4FECA 1QKBA 2O69A 3PGFA 1XT8A 4HTGA 1AIVA 3JZJA 1NMUA 2ZXTA 2ZYNA 2O51A 2UVJA 4GOTA 1PC3A 3SETA 3OMBA 1KWHA 4YKPA 2I0BA 4WKMA 4G68B 4OETA 4EDPA 2BJJX 2O7IA 1YAEA 1QUIA 2VHAA 3LSWA 1NNKA 3PD9A 4RJZA 1IQ7A 3LSFB 3C36A 2IA4A 2W7YA 1XHYA 4KCDA 4IO7A 4MLQA 1QULA 1LFHA 3ILTB 3PPQA 5TPAA 2FYIA 1OQHA 3W15C 1Y3NA 2VD3A 2B65A 2I0CA 3IO6A 4OYVA 1URDA 4OZ9A 2DWHA 3CFXA 5FHOA 4P0GA 3IB0A 1NFTA 2HCAA 3KOTA 1M5DA 3RT6B 2E1SA 2UYEA 1B0HA 3CG1A 1WODA 4OTEA 3EHSA 3N94A 1EH3A 4X1DA 2YJPA 3RLFE 3IOVA 4GRKA 3R7XA 3PUXE 5DEXA 2F5XA 3FXUA 3H03A 3KN3A 1UQWA 3O9PA 2F6PA 3OSQA 1Q1KA 3N5LA 4XKPA 2QS2A 3O66A 1F9BA 3FXRA 5I2KB 4EQ9A 4NF5B 1SD3A 5KDTA 3B6QA 3MBPA 1FTJA 1PBQA 2VOZA 4DIGA 3GXAA 1PEBA 1H43A 3S9LC 1SI1A 3K1MA 5KCJB 2AL5A 4EUOA 1ZU0A 2V84A 4OWDA 3ODBA 5TP9B 3H6UA 3TCHA 3VXCA 3A3UA 3FVNA 1P1QA 4DXCA 2GRVA 4ZZAA 4QFKA 1SI0A 1Y4CA 3BBRA 4FIMA 4TLMB 1B3FA 2X26A 1FQAA 3TODA 1QUKA 4RA1A 1UIUA 3DP6A 3R6UA 4HCWA 1FTLA 3EN3A 3IK6B 3FZVA 2F7BA 1Y1MA 3EPEA 3CRBA 2D21A 5M2VA 1OIBA 5CMBA 3FXQA 1VSOA 3KOSA 1B5HA 1H45A 4YAHX 4F22A 5DT6A 3W9WA 2I49A 3PMVA 1CB6A 3ZSFA 3C33A 3IOWA 3TELA 4F19A 4GVOA 4JSOA 2D5WA 3E13X 2NUVA 4PQJA 2R71A 2RC8A 4R2BA 4G68C 4OVJA 4U21A 5EHMA 3IL1B 4E0XA 3IJOB 1IXHA 2REGA 4G8MA 4F2OA 2DWIA 4NF8B 5HM4B 2XXTA 1SYIA 3IORA 1B1XA 4MFIA 1B58A 1MM7A 3OO6A 2DP8A 5BWJA 4ELQA 4LA9A 4DE8A 1IXCA 5AA2B 5BUUA 1EZOA 3LR1A 1I69A 1MY4A 5I56A 1FTKA 3AXFA 3TTMA 2HZKA 1A40A 2Q89A 2ZYKA 2XXYA 4LUBA 3RN8A 1DTZA 2QMWA 3TZAA 3H4ZA 1H3DA 5ITOA 2ZYMA 3GZGA 3QSLA 1MXUA 5TU0A 1NKXA 2FA7A 5I58A 3SEVA 3O97A 4XIGQ 4IY6A 1PB8A 2PYYA 4MF3A 4O3BA 1ZTYA 2I4CA 1B3HA 3TKDA 1TXFA 2H5YA 3E9XA 1H44A 3CI8A 2HQ0A 1IEJA 4L17A 1GR2A 1Y4TA 3A09A 1I6QA 2THIA 1MS7A 3TAJA 3TTLA 4YB5A 3F11A 4Z7EA 2Q88A 3VLVA 1B9JA 3MZ1A 3MZBA 3V89B 3BFUA 2QL3A 4JBZA 3FASA 3VVDA 1UTBA 3TFLA 2G29A 1LBCA 5K2XA 4BDNA 3BKIB 4JWOA 4JSDA 3WAFA 1XS5A 3VLUA 3MVWA 2V3QA 4YU0A 2XX7A 2Z8FA 1B51A 2UXAA 3OO7A 3UN6A 4LQ5A 1MRPA 3KJ7A 3B7DA 1PDAA 4QF9A 1GV8A 3RPWA 3U92A 5H8FB 2QS1A 1LFGA 1SVXB 3FUZA 4P0IA 1MH3A 4BDLA 1S9TA 1ZKBA 2DYXA 4QSDA 4RY1A 3SESA 1N3WA 4R75A 1RYXA 5CMMA 4H0WA 4IO6A 3FJGA 3OEMA 2CMOA 1B2HA 2Y7RA 1B52A 5DYHA 4QFNA 5H8NA 1LAFE 3G3HA 4QSEA 3DP4A 4IO5A 1YTVA 3M8UA 4IO2A 3OO8A 3KN7A 2V25A 4KHZE 2ZYOA 1ZIUA 3ZKLA 1AOVA 3N6UA 5AA3A 4X1BA 3LSLA 3C31A 3RT8A 1I6AA 1P1UA 1FQCA 5H8HA 4FJPA 5LOMA 5DVFA 4F1UA 3TYHA 2WKYA 3FVOA 1MDP1 3MW0A 3S2VA 3PUWE 4ONYA 3S9NC 3CSBA 4LZ7A 3N6TA 4DCYA 3K4UA 1O7TA 3H6VA 3V83A 1MPDA 1O64A 3RQTA 4Z0IA 4NE4A 4R74A 2A5SA 4E0WA 3TQLA 4ZEKA 3SEWA 2Y84A 2UVIA 4GQOA 4TLLB 4NF4B 3SDFA 4YKKA 2RKMA 4GL0A 1JVXA 3HPIA 3UP9A 3B6TA 3CG3A 3O6GA 1OMPA 3TPAA 4IO3A 1YPNA 4YZZA 3U8QA 1AMFA 4PE5B 5CBSA 1MQIA 2A5TB 1DTGA 2XXQA 3UIFA 2H4IA 4F39A 4OFJA 4HW8A 3U94A 5AA4B 3C35A 1B6HA 1A8EA 4OENA 3ZKKA 4U2RA 4IGTA 4ECFA 1R1NA 1R9LA 2Q2CA 3FD3A 2ZNTA 3IJXB 5JTYA 3QAXA 4AB6A 2O1MA 1P99A 4PFTA 1MH4A 1B5JA 1MPBA 3G3JA 4R2FA 1NNPA 2RCAA 2PBWA 4JWXA 4Q30B 5A5XB 1JW1A 1B46A 5I2NB 1DMBA 1TFDA 3OELA 2F6GA 1S50A 1WVJA 1B4HA 4Q8RA 3SEUA 4QFOA 3Q25A 1M5CA 4GL8A 3KBRA 1B0LA 3UK4A 3TTKA 3RNNA 1NNFA 5I84A 5L8DA 4LATA 4ZS9A 5DVIA 3IOTA 4LZ8A 1DPPA 4ESXA 1B3GA 2Z22A 2DE3A 3PMWA 2YLNA 1XC1A 2XXHA 1JETA 1TFAA 1SBPA 4AQ4A 4KCCA 4U4SA 5I57B 4LP2B 1FTOA 1FCKA 2ZNSA 4OEVA 4JWYA 3Q27A 1B4ZA 5AE4A 3PUVE 3TCFA 2I3WA 2NWJA 3RTFB 4OMBA 3MPKA 1XOCA 3O28A 1EU8A 1GTKA 4H6DA 3QK6A 4H5FA 1T0KA 3Q26A 3IAZA 4NMYA 4NWDA 1LLSA 4BDRA 2FNCA 3E3KA 2UYFA 4HS7A 1RKMA 4HCYA 1JW5A 5H8QA 4BDMA 4GXAA 4OQOA 1ZBMA 1SYHA 3SEYA 3LSXA 1SW4A 2E0SA 4JDFA 2OCUA 2P1SA 3DELB 3UA8A 1B32A 1VR5A 4G68A 1H76A 4F2QA 2XD2A 1VFDA 4XKRA 1SDXA 4RK9A 3H3GA 4G8HA 3EF7A 3T22A 3PV0E 5K2YA 3KJTA 3T96B 3TUSA 5L9SA 1SW5A 2NVUB 2PT2A 4GFRA 3PPPA 3TEPA 1MXZA 1XVXA 3MWBA 5FHMA 2P0SA 2AYSA 4IB2A 2Y7WA 4NF6A 2DWJA 4N6PA 4YB6A 1B5IA 2PT1A 1NH8A 5IAIA 3SERA 4OFLA 4NTLA 4IGRA 1BP5A 2Y7PA 1XVYA 2ZNUA 1USYE 4Q5TA 1Y9UA 1M5BA 2GFEA 4LONB 3K01A 3Q28A 4PFUA 1Y20A 3TTRA 4DDDA 2NOOA 1LB8A 3D4CA 3FVKA 4ZECA 2Z8EA 3IO4A 2OBGA 4G77A 3DP8A 3PUZE 1IXGA 1JNFA 1LSTA 3EHUA 1ELJA 2I4BA 3EHTA 4QRZA 2I6EA 2DWAA 2F7AA 3UORA 1M5EA 3K1NA 4GD5A 5B70A 3USDA 4WEPA 2ONRA 4BDOA 4MLVA 5I2KA 1LBBA 4NF5A 4F18A 3MUQA 4UACA 2OZZA 2KLFA 3BFTA 5AA1A 1FQDA 4QFLA 4PFYA 3VVEA 1GGGA 5KCJA 4AB5A 4BDQA 5FTHA 3I6VA 4PFWA 4THIA 4C1UA 4KYEA 4I8CA 2VD2A 4F3BA 1MM6A 4XXUA 5TP9A 5TPAB 4G4PA 4F31B 1OQGA 5AA2D 5CMCA 4H67A 4H5GA 3I5OA 3TTNA 4YKIA 1D9VA 1YCJA 3UGWA 5CRYA 2HEUA 3MP6A 2V3TA 3C32A 4H8JA 3RGYA 3FATA 1ANFA 5IKBA 1MQJA 1B7ZA 3DLNA 3KSJA 1D9YA 3T9HB 5EYFA 3HO7A 1NH7A 4KQPA 4G8NA 1FTMA 3OD7A 2I3VA 1R9QA 4NEDA 2XXIA 5DEXB 3TDJA 3OSRA 4LZ5A 1JEUA 4RYAA 4OERA 1SQYA 1LCFA 3KEIA 3KG2A 2REJA 2ALUA 3H6WA 4FE8A 3CSGA 1P1OA 1Y1ZA 1MG1A 2AIXA 3T9XB 4EF2A 5KDTB 1OVTA 5J1DA 2OJTA 2PX1A 5CC2A 2ONSA 3S9EA 3MAMA 3OOAA 3T66A 4UA8A 4XKQA 5CM6A 5L9MA 4XKNA 4FEBA 3G3IA 4ELPA 3K6UA 3H06B 1FQBA 3PD8A 3QUJA 3FIRA 4RK2A 5HPQA 4DLDA 1PBPA 2OWTA 1N76A 3G3FA 4U22A 4M4GA 3EQ1A 4LQ2A 4NF8A 5F1QA 1EZPA 1CE2A 2PMSA 3VE1B 4C0RA 1MDQA 4H1XA 3IOUA 4GWOA 2DVZA 2H9BA 2XXUA 5FTIA 3K6WA 5AA2A 1MY2A 3MQ9A 2RC7A 2ABHA 5ELVA 1BLFA 2QSXA 3Q29A 4G2ZA 3HHGA 5H8QB 3FV1A 2F8DA 3KFMA 1LB9A 4KYDA 2ESNA 1ATGA 5JEIA 3VV5A 1O63A 4Q0CA 4KPTA 4DCXA 3B6WA 3OEKA 1LAXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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