3GLBA

Crystal structure of the effector binding domain of a catm variant (r156h)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
SQTLRIGYVSSLLYGLLPEIIYLFRQQNPEIHIELIECGTKDQINALKQGKIDLGFGRLKITDPAIRHIVLHKEQLKLAIHKHHHLNQFAATGVHLSQIIDEPMLLYPVSQKPNFATFIQSLFTELGLVPSKLTEIREIQLALGLVAAGEGVCIVPASAMDIGVKNLLYIPILDDDAYSPISLAVRNMDHSNYIPKILACVQEVFATHHIRPLIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Inducer responses of BenM, a LysR-type transcriptional regulator from Acinetobacter baylyi ADP1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Acinetobacter sp.
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator catM
total genus 59
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3glbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3glbA02
1MH3A 3VXBA 1VFEA 1UTHB 1AH5A 3O97A 1A54A 5HPQA 1B3EA 4AQ4A 3RNNA 1BKAA 3VLVA 4KQPA 2Q89A 4IGTA 2RINA 5H8FA 4U4SA 3EHSA 3U92A 1TFDA 4BDRA 4G8HA 1XS5A 1GR2A 2HXWA 4THIA 5F7VA 5KDTB 3TTMA 3A09A 1LAHE 4RNSA 1UTBA 1B3HA 3TODA 1USYH 3FASA 4LZ8A 4R6KA 2HZLA 2Y7KA 1B1XA 2V25A 3IORA 2I4BA 3UGWA 1UIVA 1QUIA 2V3QA 3KBRA 3A3CA 1QVSA 3KSJA 4G8MA 3JYRA 4GLIA 1N84A 5I2KA 3TDJA 4WKMA 3O29A 3O2AA 5KCJB 3GBBA 1DTGA 1CB6A 3G3HA 3PUYE 1PB9A 4IO3A 2REJA 4XTCQ 4F1VA 2D3IA 2NWJA 4BDNA 1ZTYA 4ZS9A 1QULA 2IA4A 3HHFA 4NE4A 2ZMBA 4GD5A 2IEEA 3FVKA 3KN3A 1H76A 5CMMA 5FTHA 1MXYA 4TQUQ 3DLNA 1M5DA 1MY4A 3CI8A 1VE4A 2P0SA 3CR9A 3KSXA 3S9EA 4Q0CA 1XVXA 2Q2CA 4ELQA 4HS7A 5I59B 3SEVA 4KD5A 1SI0A 4H0WA 1SW2A 1CE2A 2Y7WA 2ZXTA 3EPEA 3H6TA 4KYDA 1B05A 1YAEA 1MQJA 3MP1A 1MDQA 2ZNTA 2DP8A 3MPKA 4KR5A 5FTIA 3O6IA 1FW0A 1N3WA 4O3CA 5HBCA 1PB7A 4OQOA 5DVIA 2Z8EA 3HV1A 5L8DA 5TU0A 1MY2A 3FGSA 1S50A 1TXFA 1UTHA 4LZ7A 4ZDMA 3PPNA 4OEUA 3IO6A 3RT6B 3LSXA 1N04A 1MDP1 4POXA 4JB7A 4Q5TA 4RYAA 4ZECA 3QK6A 4U23A 5FHMA 2PYYA 1AL3A 1WODA 3B7DA 4ZEKA 1JQFA 3IB2A 5KDTA 1FTLA 4RJZA 3CVGA 4OWDA 3I3VA 3QIMA 4XKRA 1NFTA 1RYXA 1MG1A 4OESA 3PD9A 3VLWA 4E0WA 4MH5A 5EYFA 3DM0A 2A5TB 3FUZA 1OQHA 1P1QA 1M5EA 3MW0A 2PT2A 2H5YA 2I49A 1XHYA 2Z8FA 3M8UA 3IOVA 4OMBA 4IY5A 3B6TA 1QKBA 5DEXB 3BFUA 4QHQA 4DXCA 4OYVA 4R9GA 4JBZA 4ZEFA 3MP8A 2AIXA 1GTKA 1A8EA 1JW4A 2I3WA 2GHBA 2VHAA 4KYSA 4YKJA 4FEDA 4M1VA 4U1OA 2DXYA 3HPIA 3AXFA 4H5FA 3K02A 4OFJA 5TP9B 3MPLA 2ONRA 1IUDA 3TCGA 3W9VA 2AL5A 2D21A 2Y84A 4OEVA 3IL1B 5I57A 2OJTA 4F1UA 3BBRA 5I59A 4LVQA 1GV8A 4R2BA 3S9MC 4YU0A 4XXUA 3R7XA 4DXBA 1SVXB 4RK2A 3PPOA 1OQGA 3I5OA 4FECA 2WKYA 4DDDA 2DVZA 3DELB 3FVGA 4HCYA 5DYHA 3OO8A 3JZJA 4Q8RA 3T93B 4EF1A 1LCTA 3TELA 4F2OA 5H8QA 3UP9A 4LQ2A 1LBBA 5BWJA 4FJPA 1ATGA 4DXUA 4KPTA 3UK4A 4G4PA 1Y4CA 1B4HA 3MZBA 2O1MA 1VSOA 2Y7IA 3D4GA 4F1YA 2OCUA 3D4CA 1B7HA 1NMUA 3T9XB 4LATA 2VD3A 3MZ1A 4NF5B 5I56B 4EQ7A 3PPPA 2RCBA 1LAFE 3T9HB 1ZJLA 1NNTA 1MY1A 4WEPA 5TPAB 1MXUA 3B6WA 1IXGA 4RPOA 3SERA 4HTGA 3RUMA 1B40A 3B6QA 3UN6A 1JVXA 2Z8DA 3O66A 3TYHA 1JNFA 3DP6A 2ZYNA 1O64A 1SYIA 3SDFA 4YZZA 4ESWA 3KN7A 5KZTA 1O7TA 2F78A 2QMXA 1JVYA 4IO7A 4H5GA 1TFAA 1Y1ZA 2H98A 3K1PA 3Q29A 5ISUA 2HQ0A 1LFHA 4RPNA 2F6PA 4LONB 5TP9A 1IITA 4NTLA 3BKIB 1FQDA 1LLSA 2OZZA 4BDQA 4NEDA 4LA9A 1P1UA 4FAJA 4EDPA 3V89B 4ESXA 1JW1A 2RKMA 1B7UA 1R9QA 2CZLA 2DYXA 4H67A 1MQDA 3OSQA 1AMFA 3Q28A 3KJTA 2ABHA 2DE2A 4ZEIA 2O7UA 3VV5A 4ZZEA 2I3VA 1OLAA 2XX7A 4PFYA 2VGQA 4F3BA 1MQGA 3MUQA 4QSCA 2RCAA 3H6UA 2QS3A 1MY3A 4G77A 1MRPA 3P7IA 5EHSA 3S9NC 4LP2B 2ZYMA 1O63A 4GVOA 5BUUA 3SEXA 1N7XA 2RF1A 4X9TA 3OSRA 4UA8A 2QJEA 3PPRA 1B2HA 3HSTA 3FD3A 4JDFA 3O28A 1POY1 1IXCA 3KOSA 1HSEA 4YMAA 4FATA 1N7WA 5AE4A 1EU8A 4KCDA 2PT1A 3KOTA 5AA2B 3PV0E 4GIZA 2DXRA 1MH4A 4WEDA 4MBPA 4NMYA 2PVUA 3MWBA 5I58B 4NF5A 5JEIA 1JETA 3TCHA 5I56A 4HW8A 1B58A 4UACA 3R26A 2DWJA 2XXWA 2ZYOA 2QMWA 3THIA 3KFMA 5LOMA 2OWSA 1QUKA 1OIBA 2W7YA 3QYTA 2NUVA 3TTRA 3H3GA 5M2VA 4ND9A 3VLUA 2I58A 3V8XB 4ELRA 2XXRA 3IOWA 4ZE8A 4N07A 5DT6A 4PFTA 4DZ1A 1H3DA 4H8JA 3CFLA 2F5XA 1MS7A 4RA1A 4NF8B 4U4XA 1SQYA 2DS9A 1DSNA 2THIA 3K2DA 1UIUA 4ISUA 5ICTA 2OK2A 3C34A 1MXZA 4KFQA 1GGGA 1NNPA 2Q9TA 2B3BA 1DMBA 1R6ZA 5IAIA 4R2FA 5AA1A 4I1DA 2UVJA 2XX8A 2Q2AA 2UYFA 4R74A 3FXRA 1IZ1A 4O3AA 3PMVA 4F31B 1YPNA 1IXHA 4GL8A 3TUSA 3N94A 4XKQA 4YAHX 4BDLA 1D3KA 1Z7NE 3E3KA 3PMXA 3BFTA 4AB6A 2OBGA 3GZGA 2I6EA 2DWHA 2FA7A 3PUVE 3G3KA 1I69A 2DVCA 4MFIA 3TTKA 3N5LA 1BLFA 2Y7PA 3LSFB 1B51A 3CFXA 3G3JA 1SI1A 1KWHA 1A99A 2ZYKA 3SETA 1PDAA 5CMKA 2E0SA 5AA2A 4ECFA 3F11A 4YB5A 2AL4A 3RLFE 3K6VA 4X48A 1QKAA 1SW4A 3QXMA 1IQ7A 1URGA 3ZSFA 1LBCA 3GXAA 3LC8A 4EXLA 3C4MA 4MLQA 4XKPA 3E4RA 4JWXA 1B5JA 3OELA 3RTWB 4FIMA 3ILTB 1B5IA 1MM6A 4TLMB 3RN8A 4U2RA 4EF2A 1USYE 2O7IA 2QL3A 4OTEA 4C0RA 4YKIA 4G68C 1P1WA 4PETA 1A7LA 3VE1B 1S9TA 1B1HA 3RGYA 1QJMA 2R71A 3KG2A 5CM6A 2YLNA 1SW1A 3S2VA 4YKPA 4FEBA 1FTKA 5DVJA 1Y4TA 2I0CA 1Y20A 4YICA 4NF8A 1FQFA 3ECRA 2DSFA 4OZ9A 2XXUA 3KGCA 3IK6B 5KCJA 1B32A 1Y3QA 3K00A 2QS2A 2HFBA 2XXIA 1MM7A 2OLBA 5CBRA 4F29A 3SKPA 3H03A 1JW5A 4Z7EA 2HAVA 4NWCA 3TZAA 3M3KA 2XD3A 4IO4A 3IJOB 4P11A 1ZIUA 1HSLA 3SEUA 3IO4A 4YMBA 4R72A 5B70A 5K2YA 1XT8A 3K01A 2UVHA 2DQVA 2E1SA 4EQBA 3G7WA 4PP0A 2OWTA 3ONMA 4EXKA 5F1QA 4I62A 2VD2A 2F35A 2O51A 4XKNA 3TMGA 2V93A 3CRBA 1DTZA 2H9BA 4H1XA 1NH7A 4GF8A 4PE5B 4JXIA 1ZBMA 3VXCA 3EN3A 3OXNA 3C36A 3MVYA 4KI0E 4PQJA 5JTYB 2P2AA 4TOZA 4QFOA 3IR1A 3K1NA 1US5A 1T0KA 4GRKA 4PFWA 1MPBA 2PBWA 2F97A 4R9FA 3SESA 3UA8A 4WXJA 2NXOA 3G3GA 3OMBA 1JEVA 2GRVA 1SBPA 4Q30B 1D9VA 2X7PA 1FQAA 2LAOA 1A40A 1FQCA 3K6XA 1IXIA 1US4A 5I2NB 4AB5A 2ALUA 2UVIA 4ELOA 2QPQA 4NF6B 1H45A 4H8IA 3CFZA 1LFIA 2ZNSA 4DE8A 1MXWA 3TCFA 4OFOA 4NF4B 4GL0A 1OVTA 1BIYA 4FORA 4QRZA 2A5TA 3MZ9A 3QUFA 1SD3A 3U94A 1D4NA 4QFKA 5H8FB 1LSTA 3MJNA 1M5CA 3IOUA 5DEXA 4X1DA 4EQ9A 2XXPA 1UTBB 2DWIA 3O6GA 3USDA 1LCFA 3ILUB 1B3FA 4JWOA 1PC3A 2F6GA 1NNFA 4M4GA 3W9WA 4GWOA 4OENA 3N26A 3FATA 2VP1A 4LZ5A 1BTJA 4OXVA 4U21A 1EZ9A 2XD2A 5I2KB 3ZKKA 3WAFA 4OHNA 2DE4A 4ONYA 2AYSA 1IEJA 1N3XA 1OVBA 1POTA 3H6VA 1AOVA 1BP5A 3VVDA 3VFJA 5CRYA 1ZLQA 3U8QA 1P1OA 4C1UA 3OO7A 1FTOA 3QUJA 4BDOA 3UIFA 1B3LA 4RY1A 1DPPA 1Y3NA 5JTYA 3RPWA 2ANJA 3Q27A 4C1TA 4MF3A 1LAGE 4R6HA 5JK4A 1B4ZA 3LUYA 3N6UA 1I6BA 3LSWA 1SW5A 2YPNA 4FE8A 3VVEA 2P1SA 3ODBA 2UVGA 1H44A 1LB9A 3U72A 3S9LC 2NOOA 2X7QA 5H8HB 4DCYA 3OEKA 2Y7RA 3ZKLA 2VOZA 2KLFA 3R6UA 4BLAA 3O9PA 2HEUA 1HSJA 4NF6A 3FJ7A 3FVOA 4MLVA 5TPAA 2R9JA 2NVUB 3EHTA 1RYOA 2ZNUA 3MQ9A 3KEIA 1P1NA 4NF4A 3C9HA 4TLLB 3MBPA 4PFUA 3RT8A 4LUBA 1S7YA 1LFGA 4OETA 1EH3A 4I8CA 3UORA 1MXXA 1ZMGA 4E0XA 3U93A 2HCAA 3TTLA 3H6WA 1N76A 3CG1A 3OO6A 2QS1A 2UXAA 3MC2A 1OLCA 3Q25A 4QSEA 3LR1A 4EUOA 4YB6A 1Y1MA 3V5AA 2O68A 5AA2D 3OOAA 1ELJA 3FV2A 4QFNA 1L5TA 3K1MA 3C31A 2Z22A 3IB0A 2FNCA 1LGBC 3MVXA 1Q1KA 3PUXE 1WDNA 4JSDA 3U1OA 3KJ7A 3DP8A 1OMPA 4KCCA 4G2ZA 3TKDA 1F9BA 4K3FA 4POWA 3W15C 2XXHA 4F22A 2XHDA 2QRYA 3G3FA 5CI5A 3SEWA 3MVWA 1P99A 1Y9UA 2CMOA 5I57B 4JSOA 3T66A 2V3TA 1PBQA 3HHGA 5L9OA 1LB8A 1TWYA 1DOTA 1SDXA 1WVJA 4P0GA 4O3BA 3OD7A 4R6YA 4DCXA 1FCKA 2A5SA 5AA3A 4ELPA 5H8HA 2V3UA 5HM4B 2Q88A 3K0VA 5I58A 1TT1A 3EF7A 4N6PA 1B7ZA 3WAEA 5ITOA 4L17A 1B9JA 2GFEA 5H8QB 4F2QA 1B3GA 4JWYA 2YJPA 1FTJA 4KHZE 2Z23A 2H25A 1Z7ME 2I48A 2G29A 5EHMA 1B52A 1ZU0A 2F36A 2UYEA 2XXVA 3TEPA 3PMWA 4X1BA 3JV9A 2Q8JA 2RC7A 4YKKA 2RC9A 3PU5A 3PUWE 3RTFB 1II5A 1PEBA 5L9MA 3M3LA 4F3GA 1ANFA 3HO7A 5ELVA 1MQIA 1XC1A 5FHNA 2XXTA 4GXAA 3O6HA 4GXSB 3K6UA 3VDFA 4ZE9A 4R75A 3RQTA 4OERA 5CMBA 3G3IA 3C35A 4DLDA 3HN0A 2F8DA 2QSXA 4F19A 1A8FA 2O69A 1NNKA 5B7DA 3C32A 5H8SA 3OENA 3CSBA 2B3FA 4U22A 3VVFA 3T96B 4F3SA 1URSA 3KN8A 1FQBA 5CC2A 1YCJA 2DWAA 1VR5A 3H4ZA 1PB8A 4DIGA 3N6TA 2XX9A 4IO6A 2G93A 4P0IA 3LBSA 4G68B 1MPDA 1RKMA 3IB1A 2REGA 5A5XB 3PD8A 4G8NA 4IO2A 4GOTA 4H65A 4U1ZA 3PPQA 2O84X 1YTVA 5FHOA 1A55A 4N13A 2RC8A 2F34A 4F39A 2ESNA 3FJGA 4IY6A 2O1LA 1QW0A 4Z0IA 3GBAA 5DVFA 4I9DA 3Q26A 3E9XA 3FXUA 3EQ1A 3CIJA 2DE3A 1NH8A 1NL5A 1LAXA 1GVCA 3FIRA 3FVNA 2H99A 2H4IA 5ITPA 4IO5A 2FYIA 1B5HA 3K6WA 2I4CA 3T22A 3DP4A 3TAJA 5AA4B 1PBPA 5H8NB 1B0HA 4RK9A 4YB7A 1UQWA 3MVZA 3PUZE 1MQHA 4H6DA 3GLBA 4F3PA 1Q35A 1XOCA 4KYEA 3OO9A 3IJXB 4ZZAA 5ICQA 2XXYA 1AIVA 1SYHA 3RY3A 3T9VA 1URDA 2F7AA 2HAUA 3FJMA 3HCQA 4QF9A 3QSLA 2XXQA 2HZKA 4GQOA 3OEMA 1J1NA 2X26A 1MPCA 2DOJA 1I6QA 4QSDA 3TPAA 1Y3PA 3TQWA 2BJJX 4LQ5A 5DTBA 2R6GE 3TQLA 1I6AA 1B0LA 1ZKBA 1R9LA 2GH9A 5J1DA 3QAXA 3FXQA 2ONSA 3PGFA 2F7CA 3FV1A 4IGRA 3C33A 3A3UA 3KZGA 2O6AA 1FTMA 1MXVA 2XXXA 5CMCA 5L9SA 3E13X 2M8CA 4HCWA 1EZPA 3MAMA 4G68A 4XIGQ 3M3FA 2I0BA 3L6GA 4IB2A 4BDMA 5A5XA 1IIWA 3T9UA 1H43A 3H06B 2D5WA 3H7MA 1EZOA 4RXLA 4R73A 5K2XA 5I84A 3EHUA 2GHAA 3ZS6A 1VFDA 1D9YA 2PMSA 3S4UA 1M5BA 4QFPA 3FZVA 4NWDA 4ZEBA 4OVJA 2V84A 3I6VA 1JEUA 1DPEA 3MP6A 3K4UA 5IKBA 1QUJA 3L6HA 3LSLA 1M5FA 2B65A 2PX1A 4QFLA 4OFLA 1R1NA 4F18A 2F7BA 3IAZA 5CBSA 1MY0A 5I2NA 2QS4A 1N0TA 1XVYA 3IOTA 3CG3A 3TFLA 1B46A 5AA4A 3CSGA 2ONKE 5H8NA 3SEYA 1B6HA 4GFRA 4ZEDA 3V83A 3TTNA 3IX1A 1NKXA 1FQEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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