3GZGA

Crystal structure of the xanthomonas axonopodis pv. citri molybdate-binding protein (moda) mutant (k127s)
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
TAPVTVFAAASLKESMDEAATAYEKATGTPVRVSYAASSALARQIEQGAPADVFLSADLEWMDYLQQHGLVLPAQRHNLLGNTLVLVAPASSKLRVDPRAPGAIAKALGENGRLAVGQTASVPAGSYAAAALRKLGQWDSVSNRLAESESVRAALMLVSRGEAPLGIVYGSDARADAKVRVVATFPDDSHDAIVYPVAALKNSNNPATAAFVSWLGSKPAKAIFARRGFSLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the Xanthomonas axonopodis pv. citri molybdate-binding protein (ModA) mutant (K127S)
rcsb
molecule keywords Molybdate-binding periplasmic protein; permease
molecule tags Metal binding protein
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
total genus 72
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3gzgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3gzgA02
5H8FA 3ONMA 1OLCA 1WODA 4X48A 4F1VA 2ESNA 3KBRA 3MQ9A 5I2KA 4WXJA 3TTMA 1TT1A 4F3SA 5CBRA 3S9NC 4E0WA 2VHAA 4EF2A 4IGRA 1ZTYA 3CFLA 2YPNA 2OCUA 2XXRA 2XXYA 4MLVA 3FZVA 3VVFA 5DYHA 2PT1A 3HV1A 4F31B 2O69A 1PBQA 1FTOA 1QKAA 2F8DA 3RUMA 1URGA 1USYE 1LB8A 4OYVA 2H99A 3MBPA 4YB7A 3DLNA 4LZ7A 1MY4A 4JSDA 4O3BA 3TTRA 4YB5A 4LUBA 3O28A 3D4GA 5EHMA 3B6WA 3MUQA 2Z8DA 5I2NA 3U1OA 3Q29A 1PB7A 5DT6A 3N94A 3E13X 3G3GA 1UTBB 1FTKA 4EDPA 4IO6A 4TLMB 2DWAA 3V83A 5H8FB 4GOTA 3S9LC 3PU5A 3PUVE 1M5FA 3K2DA 3C33A 2QJEA 1WVJA 4O3AA 5I2KB 3MJNA 1OQGA 2O7IA 4HW8A 1JW4A 3HN0A 3GBAA 2O7UA 2CMOA 4OETA 1B4HA 4TQUQ 1PBPA 1UQWA 2B3BA 3IOWA 3FXUA 3QYTA 3VLWA 3HCQA 2ZNUA 1LLSA 3RPWA 1XOCA 4I62A 2PX1A 4ISUA 3T96B 2DXYA 3EN3A 1OVTA 1IEJA 3IK6B 4YB6A 3PMVA 4U4XA 4AQ4A 3EHTA 3G7WA 2Z8FA 4JXIA 1NKXA 5FTIA 3DELB 4RPOA 3K1PA 2WKYA 4NF8A 3OXNA 4OXVA 5L9OA 2DWHA 3OELA 4BDQA 1Y1MA 3FXQA 4XIGQ 5ITOA 5F7VA 3IO4A 2F97A 5JEIA 5CBSA 3KN7A 1MY0A 2ONKE 4X1DA 1A8FA 3TQLA 4G68A 2XXTA 4IB2A 4ELQA 5I2NB 2O1MA 3KSXA 5AA4A 1LFHA 3QAXA 3PUZE 4LP2B 2X7PA 4UA8A 2ONRA 4OFJA 4GF8A 3BKIB 1IXIA 4HTGA 1RYXA 1MY2A 1ATGA 3RY3A 4H8JA 1AIVA 3VVDA 2I3WA 4QHQA 2F7BA 1B3FA 1EZOA 4NEDA 2X26A 2NUVA 1IXCA 5LOMA 2XXVA 3KJTA 4FAJA 2THIA 4C1TA 2ZMBA 1A99A 1MH4A 4PP0A 4QSEA 5I59A 3SEXA 4FECA 3MP1A 3USDA 1TWYA 1UTHA 5EYFA 2XXHA 2DWIA 1MPDA 4OEUA 2UVIA 1NMUA 1B51A 4BLAA 3TFLA 2RKMA 1QULA 1R9LA 2FYIA 1ZMGA 3IB1A 3G3JA 3MVYA 3TMGA 1NNPA 2HEUA 4JSOA 1QUKA 3O6HA 4OHNA 4F2OA 4NF8B 4KYSA 1B3LA 4R9GA 2PYYA 2NXOA 2GH9A 1EZPA 3A09A 2H5YA 3T9HB 4U22A 3OSRA 3G3FA 3IL1B 4IGTA 2F6GA 4QFNA 1FTJA 4PQJA 2XHDA 4G68B 3T22A 2REGA 4O3CA 1US5A 1GVCA 3PUWE 4C1UA 3RN8A 3RLFE 5KDTA 5AA4B 1LAHE 4GRKA 5A5XA 1POY1 2F35A 2GRVA 4IY5A 3IJXB 4DXBA 3S2VA 4G68C 5I58A 2YJPA 4ESWA 1I6AA 1D9YA 3MVXA 4IY6A 3TKDA 1B1XA 1II5A 3H6WA 4LZ8A 2AYSA 4XKQA 2LAOA 4GWOA 2BJJX 4HS7A 1A54A 3RQTA 3S9EA 3VXCA 4H5FA 4H0WA 1NNKA 1LSTA 1XVXA 5I59B 2XX8A 1UTHB 4WEPA 4QSDA 1SW4A 4ZEFA 3R26A 3QXMA 1T0KA 1MXVA 1B4ZA 3OO9A 2Y7WA 2V3UA 2I4CA 3HPIA 3M3LA 3A3CA 1FTLA 3CFZA 4YICA 1S9TA 2QS2A 5DVFA 2UVGA 3ECRA 1B7UA 2V84A 3LC8A 4WKMA 3VFJA 4IO7A 3O6GA 1HSJA 3UORA 4FEBA 4U2RA 1NH7A 4EUOA 5TPAA 1DPPA 1ZBMA 4N07A 3TCFA 4PE5B 5KDTB 3G3IA 3SEVA 2OWSA 5A5XB 3Q27A 2GFEA 2HQ0A 1NL5A 5I58B 4E0XA 1FQEA 4WEDA 1B5IA 3EF7A 4JWOA 5I56A 5FTHA 1P1NA 3SESA 3TAJA 3K6VA 2I49A 1VE4A 1DOTA 4X9TA 3DP8A 3O29A 2RC9A 2RCBA 2NVUB 3C4MA 2Q2AA 2RF1A 4RY1A 4KCDA 5DTBA 4BDLA 4QFPA 1O64A 3B6TA 4GQOA 1I69A 3K6UA 1XHYA 1US4A 5K2YA 3RT6B 1AMFA 1SYIA 2XXXA 4IO5A 3TPAA 1HSLA 3PUYE 3TODA 5CRYA 4LQ5A 3E4RA 4KYEA 4THIA 4GIZA 2I6EA 4OFOA 2F6PA 3DP4A 3MPLA 1AL3A 2AL4A 1MQJA 4ELRA 3K0VA 4IO3A 3HHGA 4QFKA 5L9SA 1PB8A 4R9FA 3TEPA 1SW1A 4H8IA 4Q5TA 4FJPA 3FATA 4JWXA 1LB9A 2XX9A 1M5DA 3A3UA 4BDOA 2H98A 2V93A 5TPAB 1F9BA 4YKKA 4QFLA 3H6UA 2Y84A 1LBBA 1D3KA 1TXFA 1VFDA 1CE2A 1H43A 1O7TA 4GL8A 4XKRA 3H6TA 2QS4A 3M3FA 2OZZA 3K1MA 3THIA 5F1QA 5I56B 3IR1A 1B52A 5H8HB 2DOJA 3C35A 3UK4A 3VE1B 4LA9A 1Y20A 4G8HA 1M5EA 3OEMA 1MDP1 1H44A 3U72A 4OTEA 4POXA 4AB5A 5ISUA 2F78A 4N6PA 4Z7EA 4F3BA 3OMBA 3B7DA 4NE4A 2B3FA 3O2AA 2Q8JA 1AOVA 4POWA 4YKJA 3ILUB 5H8NA 3QIMA 1VSOA 3HSTA 1B9JA 2Q9TA 4P0IA 1B3GA 3L6GA 2B65A 1GR2A 2VD3A 2P2AA 1N3WA 1P1UA 1GGGA 5B7DA 1URSA 2YLNA 4OENA 2Q2CA 4U1OA 4ZE8A 1BTJA 5CC2A 1XC1A 3G3KA 1Y9UA 1RKMA 5AA1A 3PPRA 1Y4CA 3EHSA 3MAMA 2PBWA 5KCJA 3N26A 4OESA 3MVWA 4OVJA 1B3HA 3KG2A 3FV2A 3FD3A 3H7MA 3BBRA 5ITPA 4G2ZA 3AXFA 1MXUA 2RC7A 4M4GA 2FNCA 2QL3A 4F2QA 3TUSA 4GFRA 3KOTA 1GV8A 3FXRA 3QUJA 2ZYMA 4ELOA 3T66A 4RXLA 5DVJA 4K3FA 3CVGA 4DIGA 1JVXA 3N6TA 1MM6A 4NWDA 1L5TA 4H65A 4RPNA 2Y7PA 1BLFA 3WAFA 5BWJA 3FIRA 3E3KA 4RJZA 3DM0A 2VGQA 1HSEA 4EF1A 4KFQA 1MY3A 2RCAA 4G8NA 1M5CA 4I8CA 1B0LA 1MXZA 3KZGA 5EHSA 5H8NB 1DTZA 3EHUA 3IOUA 2R6GE 4RK2A 3O66A 1A40A 3S9MC 3K6WA 3H4ZA 3CFXA 3W9VA 4R72A 1MY1A 3SEYA 3LBSA 2I48A 1QUJA 2ZNTA 5TP9A 4YAHX 4YMAA 2DE4A 2E0SA 3OD7A 4DCYA 2Q89A 3M3KA 3TELA 5KCJB 3PD9A 1YCJA 4KHZE 5HBCA 1DPEA 1XVYA 4EQBA 2P0SA 2Z8EA 3K00A 4OMBA 3MVZA 3TTNA 2VD2A 2XXUA 3O6IA 3FJ7A 4R6HA 3PPQA 3CR9A 3IORA 2G29A 4GD5A 1NNFA 4PFWA 1EH3A 3KN8A 3KFMA 3MPKA 4BDNA 1JQFA 3IJOB 4C0RA 4LVQA 2ONSA 4ELPA 4ZZAA 4Q8RA 4ND9A 3E9XA 1IITA 2D5WA 3OO8A 4IO2A 1D4NA 4RNSA 3LSLA 3GZGA 5K2XA 4NTLA 5CM6A 3GLBA 4NMYA 3K1NA 2UYFA 1EU8A 3MZ9A 2OK2A 3CIJA 2ZXTA 2R9JA 1JW5A 1VFEA 2V3QA 4H1XA 1Y4TA 5CMCA 4Q0CA 2GHAA 2VOZA 2QPQA 2H4IA 1MQGA 2QMXA 1P1QA 5TP9B 1QUIA 2O84X 4QFOA 3C34A 3PGFA 5ICTA 4LATA 1MQIA 4QRZA 1A8EA 3TTLA 2OLBA 3V5AA 3TYHA 4ZECA 2I0CA 1ZIUA 5HM4B 4F1YA 1MS7A 1UIUA 3HHFA 3ZKLA 4F18A 2G93A 4NF5A 3IO6A 3IX1A 2PVUA 4F19A 4HCYA 4ZE9A 1FCKA 3G3HA 3RNNA 1WDNA 4KD5A 1Q35A 5CMKA 4MBPA 4RYAA 3OSQA 1SQYA 3JYRA 3S4UA 1TFDA 4DXCA 4QF9A 3TTKA 4YZZA 5FHMA 2ANJA 5I57A 2DP8A 3FVOA 3QSLA 4GL0A 3LR1A 3VXBA 3KN3A 3T93B 2DVZA 3QK6A 1OIBA 2D3IA 1A7LA 1MXXA 2UYEA 1JNFA 4G8MA 3RTWB 1MQHA 2Y7IA 3BFUA 2PMSA 3I6VA 3UGWA 5FHOA 4F3GA 4PFUA 4MH5A 2D21A 1N3XA 2HFBA 1A55A 1O63A 3EPEA 1DTGA 3OENA 2XD3A 3SEUA 2Q88A 1P1WA 5H8HA 3GBBA 3W9WA 3CSBA 4RK9A 1UIVA 1URDA 1B58A 4U4SA 3Q26A 3W15C 5AA2B 4ONYA 3IB0A 2QS3A 3PPOA 1QJMA 1SI0A 2F36A 5IAIA 1B7ZA 3OEKA 4XTCQ 4DZ1A 3ILTB 1LAFE 1B7HA 3H06B 4R2BA 3FUZA 3R7XA 4YKIA 4KQPA 4H5GA 4OEVA 4F22A 1FQBA 1EZ9A 3FVNA 4NF5B 4ZEBA 3KJ7A 1MG1A 1YTVA 2NOOA 5CMMA 1Q1KA 1PEBA 4TOZA 1BKAA 2CZLA 2XXIA 3CI8A 4DXUA 4DCXA 5JTYA 1JEUA 2I58A 1SDXA 5I57B 4R6KA 1LAGE 4ZEKA 2F7CA 1B3EA 4HCWA 4OZ9A 3EQ1A 2OBGA 3DP6A 4GVOA 1R9QA 1J1NA 4M1VA 1M5BA 2Y7RA 1NFTA 3T9XB 4NF6A 2DVCA 3Q28A 1N7XA 4H67A 2VP1A 3C32A 2ZNSA 1PDAA 4PFYA 1ANFA 5FHNA 1LGBC 4Z0IA 1JW1A 4XKNA 3JV9A 3IAZA 3SEWA 1ZKBA 1SI1A 3GXAA 5H8QB 3SDFA 5ELVA 4Q30B 3RGYA 3I3VA 3IOVA 1LCFA 1USYH 3PD8A 4LZ5A 2XXQA 4MLQA 4KR5A 4XKPA 3SERA 2F7AA 4F1UA 5ICQA 1MM7A 2Z22A 1QKBA 4KCCA 2XX7A 1MDQA 1IXHA 2Y7KA 4OWDA 3UN6A 3ZKKA 3K01A 1B0HA 2NWJA 5AA2D 4BDMA 3K6XA 4JDFA 3RTFB 5BUUA 1IZ1A 5JTYB 3D4CA 2REJA 4KI0E 2XD2A 1R1NA 1XS5A 3K4UA 3LUYA 4N13A 2DS9A 3TCGA 2QMWA 3PV0E 4QSCA 3U93A 2A5TA 1B05A 3OOAA 2DSFA 4U21A 3CRBA 4NF6B 2Z23A 4DE8A 3B6QA 2HXWA 1OVBA 4JBZA 4EXKA 1N7WA 3VLUA 3H6VA 4LONB 1B5JA 1P1OA 1GTKA 3PMWA 4NWCA 2GHBA 4R6YA 5KZTA 1YPNA 2V3TA 3PMXA 1B1HA 4F3PA 5AA3A 3CG3A 3JZJA 3Q25A 3TQWA 3ZS6A 3KOSA 5HPQA 3U8QA 1IXGA 5DEXA 2H9BA 1SW5A 1LFGA 1XT8A 2I3VA 3FASA 4FE8A 4AB6A 4UACA 1JEVA 1RYOA 2DE3A 4KPTA 1ELJA 1NNTA 3KEIA 4ZEIA 4LQ2A 3FV1A 4R73A 2ZYNA 1B6HA 3I5OA 2IA4A 3TZAA 1B2HA 1MXWA 2RC8A 1MRPA 3MP6A 2V25A 3R6UA 2ABHA 4R2FA 3U92A 1Z7NE 1YAEA 2OJTA 3ODBA 1SYHA 4G4PA 1ZU0A 2OWTA 1Y3QA 3IB2A 3V89B 4DDDA 3P7IA 4OFLA 3TDJA 2A5TB 3LSWA 4PFTA 2DQVA 3BFTA 3KSJA 3UIFA 2A5SA 1S7YA 2HCAA 1Y3NA 5CMBA 1H3DA 4X1BA 3PUXE 3FJGA 1BP5A 4JB7A 2O68A 1IUDA 5L8DA 3CSGA 1MQDA 3F11A 4RA1A 3LSXA 4G77A 1MPCA 4ZDMA 2UVJA 1PB9A 2X7QA 2F34A 4GXAA 4MF3A 4OERA 2DWJA 1D9VA 4XXUA 3SKPA 1N76A 2HAUA 5DEXB 4P0GA 1FQCA 5B70A 4F39A 1VR5A 3VV5A 1IQ7A 2O51A 3FJMA 2W7YA 3QUFA 5J1DA 2M8CA 4FIMA 3CG1A 1POTA 5L9MA 4NF4A 1LFIA 2IEEA 1Y3PA 2I0BA 5CI5A 1Y1ZA 1IIWA 2QRYA 4FEDA 2O6AA 3H3GA 1FQDA 3O9PA 4H6DA 4ZS9A 3VLVA 4L17A 1FTMA 4FATA 2O1LA 2ZYKA 4R75A 5JK4A 4MFIA 1H45A 1OQHA 1H76A 1N04A 2UVHA 5DVIA 4JWYA 2DYXA 5H8SA 3MZ1A 3O97A 2I4BA 4ESXA 3FVGA 4F29A 5AA2A 3IOTA 2R71A 1SW2A 2DXRA 1DMBA 4YMBA 5AE4A 1MPBA 4P11A 1FQFA 3MZBA 1MH3A 2XXPA 4IO4A 1B46A 1OMPA 1QW0A 5TU0A 2E1SA 1FQAA 3UA8A 4KYDA 2P1SA 4TLLB 4EXLA 1PC3A 4GXSB 1B32A 2XXWA 3MP8A 1ZJLA 3C31A 3T9UA 1JETA 3MW0A 3L6HA 3ZSFA 2RINA 1TFAA 2ALUA 1QVSA 4ZEDA 4OQOA 3FGSA 4NF4B 1FW0A 2HZLA 1SD3A 4R74A 1SBPA 1ZLQA 1Z7ME 1R6ZA 2DE2A 2QSXA 2F5XA 5M2VA 1P99A 2UXAA 3C9HA 2H25A 3M8UA 1OLAA 3PPPA 3OO7A 4U23A 4BDRA 3FVKA 1I6QA 3H03A 3SETA 3WAEA 2PT2A 4GLIA 4I9DA 5H8QA 1SVXB 3N5LA 4U1ZA 3VVEA 3UP9A 1B5HA 3PPNA 3MWBA 1I6BA 1NH8A 5IKBA 1MXYA 3VDFA 3MC2A 2ZYOA 2KLFA 1KWHA 4ZZEA 2AL5A 3K02A 1N0TA 3LSFB 3C36A 3U94A 4YKPA 3TCHA 1LBCA 5I84A 4EQ7A 1JVYA 2HZKA 2QS1A 4DLDA 1AH5A 2AIXA 3HO7A 4I1DA 1LAXA 3OO6A 1B40A 1S50A 3KGCA 1BIYA 1CB6A 2HAVA 4YU0A 2FA7A 4PETA 4EQ9A 3T9VA 3RT8A 1LCTA 1N84A 4FORA 3N6UA 4ECFA 1DSNA 1UTBA 3V8XB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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