3H03A

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur2 bound to ubp277
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms of antagonism of the GluR2 AMPA receptor: structure and dynamics of the complex of two willardiine antagonists with the glutamate binding domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B, D, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h03A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h03A02
4G4PA 4F1UA 5A5XB 1AMFA 1B40A 5B7DA 3B6TA 3R7XA 4JXIA 4OWDA 5HM4B 4GXAA 3T9VA 1B4HA 4ZECA 4LATA 4UACA 3V8XB 2AIXA 4MH5A 3EHSA 3K01A 2PT2A 3TTMA 3TFLA 3BKIB 3HV1A 1JW1A 3A09A 3T66A 2OCUA 1A8EA 4X1BA 4DDDA 4H8JA 2REJA 2XD3A 3TYHA 4H5GA 2F7BA 3N26A 4ZEDA 3VVEA 3V89B 2Z8DA 4QFNA 3ONMA 2OWSA 5FHMA 3ZKKA 1B3HA 2DQVA 3GLBA 1XT8A 2VGQA 3UORA 2O6AA 3ZS6A 1Z7ME 3IAZA 5LOMA 1YAEA 2DS9A 4PETA 1F9BA 3DP4A 3CR9A 4QHQA 4H1XA 5I57B 4NTLA 4NF5B 4AB6A 3RQTA 2CMOA 4BDLA 5A5XA 5IKBA 1EZPA 3JV9A 2O7IA 2VD2A 1TWYA 4ZEKA 2X7QA 4I8CA 3SDFA 3M3LA 1EH3A 3R6UA 3CFZA 2IA4A 4G68B 3IORA 4WXJA 1XS5A 3W15C 4KPTA 3TUSA 3M3KA 4E0XA 3QIMA 5TU0A 2Y7IA 5ITOA 1H76A 3RTWB 3SEYA 1P1WA 2R9JA 1USYH 2NXOA 2THIA 2ZYOA 4U4XA 3G3IA 1SW2A 4GFRA 1NFTA 4ELQA 1S9TA 1A7LA 2H98A 4KYSA 1A55A 4F39A 4KI0E 3PPNA 2I4CA 1SI1A 4JDFA 1JETA 1ZLQA 1PBQA 4PQJA 3H6UA 4IY5A 3G3HA 1MDQA 1PB8A 4JB7A 4OQOA 4YICA 2PT1A 4R72A 1OMPA 5AA2A 1B7UA 4IY6A 4R9GA 4FIMA 4I1DA 4EXKA 4JSOA 1D9YA 3IB0A 4PFWA 3M8UA 1SW1A 5FTHA 1J1NA 2HFBA 3E4RA 4LQ5A 3FXQA 5JTYA 2RCBA 4GOTA 3IO4A 2UYEA 1URSA 4KD5A 1UIUA 2UVGA 3U92A 1MQJA 2H4IA 1IUDA 4M1VA 1PC3A 5AA1A 4ZZAA 4JBZA 4L17A 3N5LA 3O2AA 2H99A 5J1DA 3THIA 3C33A 3ECRA 2HAUA 3H7MA 1BLFA 1NL5A 1JEUA 5JEIA 1MPBA 5I2NB 2P1SA 3CSGA 4QF9A 3RN8A 2XHDA 4F1VA 3ZSFA 5TP9B 1LAXA 1DPPA 3MZ9A 3FXRA 5AA4A 3PV0E 3CIJA 3C36A 4KHZE 4R75A 1YPNA 2ZYKA 1US5A 1N0TA 5CM6A 2V3TA 1D4NA 4OERA 2PBWA 4EDPA 3H6TA 3C32A 4RJZA 4DIGA 5FHNA 3PUYE 2DOJA 4G8NA 2OLBA 3MAMA 4WEPA 4F22A 1MXUA 3EN3A 5AA2D 3UK4A 4IO4A 1N84A 3KN7A 2VD3A 4FORA 3FJGA 3MPKA 2Q8JA 1Y3QA 5I58B 3IX1A 5DEXA 5KDTB 3MVYA 4FECA 3OO7A 4Q5TA 3VFJA 5CMMA 1LLSA 3L6GA 4GIZA 5I2KB 2RINA 1B51A 4AB5A 1P1OA 4YKKA 1SBPA 1P1UA 4H8IA 1IXHA 4IO6A 1T0KA 3KZGA 2VHAA 3TTRA 5I2NA 3H6VA 4H67A 2R71A 4G8MA 5HPQA 4R2BA 4P11A 3FVKA 3TQWA 4QFPA 1MG1A 2QS2A 3QAXA 1M5FA 1LBBA 4R6YA 2HCAA 1UTBA 5HBCA 3TTKA 3LSWA 4EF1A 3G3KA 4UA8A 2UXAA 1P99A 4HW8A 1AH5A 3MVXA 4QFOA 3C34A 3N6TA 2RKMA 4RY1A 1JEVA 1LFGA 3PD8A 3CG3A 1LFHA 3KOSA 1TXFA 4OMBA 4QRZA 3IOUA 4DE8A 3UP9A 3PPOA 1IZ1A 2F78A 3ODBA 1XC1A 3HHFA 5I59B 2DWIA 3GBBA 2D3IA 1VSOA 2X26A 2OJTA 4PFYA 4ELRA 3A3CA 3HHGA 3PUWE 1QUKA 3LR1A 4YKJA 2Y7WA 3KSXA 1SD3A 3T9HB 2WKYA 2F5XA 3PUZE 2Y84A 1LCTA 3BBRA 3BFTA 3TEPA 4GWOA 2I49A 4LVQA 4GLIA 1Y20A 3WAEA 5BWJA 2Z8EA 3QYTA 3FJMA 4N6PA 4OEUA 4YB5A 4OENA 1NH7A 1ELJA 2GRVA 4RK9A 4R9FA 1M5DA 5KZTA 1I6QA 3MWBA 2ZNTA 3E9XA 3G3GA 2E1SA 1KWHA 1B7ZA 2O7UA 2F34A 1EZOA 3QUJA 4Q8RA 2XXUA 3IO6A 2RC8A 2O68A 3O29A 4U23A 2Q2CA 3Q27A 3TCHA 1DMBA 3IB2A 2R6GE 2I4BA 4EQBA 1B58A 1RYXA 1IIWA 5DVIA 3KFMA 1WDNA 2P0SA 3VE1B 3FV1A 5F1QA 2QMWA 1LCFA 2ANJA 4M4GA 4NF8A 5H8NA 3E13X 5M2VA 1QW0A 3U72A 1B5HA 1NMUA 3OXNA 1SVXB 4C0RA 3S9EA 3I6VA 2XXRA 2AL5A 1TT1A 5F7VA 4H0WA 3BFUA 3TQLA 2HZKA 4RA1A 1MQDA 1SDXA 2Q89A 2F35A 1B3LA 2ZNSA 4U4SA 4GL0A 3V5AA 4FEBA 3K1NA 4ELOA 4LQ2A 4G8HA 1FQEA 3PMXA 1MXXA 3VVFA 5ICTA 2AYSA 3FGSA 3EPEA 4JSDA 1NNKA 4YMAA 5K2XA 3M3FA 3PU5A 2DVZA 1MXVA 1LAHE 2DYXA 1II5A 5CMKA 3IOWA 2O1LA 2O1MA 1A8FA 1FQCA 3O6HA 1MRPA 3N6UA 2B3BA 1DTGA 1B3FA 3IOTA 2F97A 4ONYA 3MC2A 5AA2B 1YTVA 1GV8A 1MDP1 1FQAA 3MBPA 2QL3A 5H8FA 3CI8A 1P1NA 3ILTB 1B05A 5TPAA 5JTYB 3H06B 5CRYA 3U8QA 1B7HA 3KJ7A 2G29A 5AE4A 1N76A 1B5IA 2HQ0A 1PB9A 5CC2A 5FTIA 1ZU0A 3UGWA 1ZIUA 5JK4A 1NNPA 3CFXA 3Q29A 4GD5A 4KYDA 4EXLA 4RNSA 2B3FA 1Q1KA 5I84A 1FTLA 3FATA 1JW5A 1D9VA 5AA4B 1GR2A 2DSFA 2XX8A 1RKMA 2G93A 4RYAA 2HEUA 3MZ1A 3UN6A 3L6HA 3KN3A 3LUYA 1MM6A 3SEVA 1MPCA 1BP5A 3QSLA 5CI5A 1HSLA 2HXWA 1OVBA 4OFLA 2Z22A 3K1MA 1I6BA 2PX1A 4OXVA 3VVDA 3A3UA 5L9MA 2DXYA 1ANFA 1NNFA 4FATA 3O97A 5DEXB 2ZXTA 3MUQA 4K3FA 3W9WA 2X7PA 3AXFA 4R2FA 1XOCA 4U22A 3RY3A 4H65A 1URDA 4GL8A 3S4UA 5EHMA 3DP8A 3MVZA 3B6WA 2OWTA 2I0BA 4G2ZA 3IB1A 1MY0A 5L8DA 4XKQA 1JW4A 2A5TA 2XXPA 1H44A 1IXCA 1SI0A 2ZYNA 3U93A 4OVJA 4KQPA 5CMCA 3K02A 1I69A 4NEDA 4ZS9A 1HSEA 4GF8A 3HCQA 2OK2A 2Y7KA 1OVTA 1XHYA 1URGA 1UTBB 2UVIA 1LB8A 4MFIA 3Q25A 3SERA 2NOOA 4LZ5A 4DLDA 1P1QA 1Y3NA 2QJEA 3TZAA 3LSFB 4GRKA 1R6ZA 4PFTA 3FJ7A 3FXUA 1M5CA 4XTCQ 2FA7A 1OIBA 1IITA 4R73A 1QVSA 4POXA 1NNTA 3RGYA 4FJPA 4GXSB 3RNNA 1OQHA 3OOAA 1YCJA 2LAOA 2F36A 2RF1A 3O6GA 1LSTA 3TMGA 1B1XA 4ZDMA 2DWAA 1QUIA 4NWCA 4ESWA 1SW4A 1MH4A 4TLMB 3RTFB 1MQGA 4BDRA 1RYOA 1B5JA 4TLLB 4F31B 2QPQA 4H6DA 2PMSA 1FQFA 1FCKA 5CBRA 4YB6A 4JWOA 3TTNA 3TAJA 4O3BA 1MS7A 2H9BA 2ZNUA 1AOVA 1QJMA 4O3AA 4QFKA 3SEXA 1B0LA 1ZTYA 4F1YA 4FE8A 3U1OA 1MQHA 3ILUB 3OSRA 4YKIA 3C35A 4NE4A 4ZE8A 2XX7A 3H03A 3K4UA 2F8DA 2DVCA 4HCWA 3QXMA 3OELA 3KJTA 4AQ4A 1UQWA 5IAIA 2DE4A 3TPAA 2UVHA 3H3GA 4IO7A 3TTLA 4OFOA 4IGRA 2YJPA 3HO7A 4LUBA 1PDAA 3W9VA 1R9LA 1QULA 1Y1MA 4XKPA 1PB7A 2P2AA 3MP6A 4JWYA 1M5BA 4H5FA 2O84X 3HSTA 2XXHA 3OEMA 2M8CA 1JVYA 3K6UA 4P0IA 3CVGA 1JQFA 4XKNA 1FTMA 3VLWA 5CBSA 2OBGA 1IEJA 4YMBA 3LC8A 1LAGE 2I3VA 4NF8B 5H8HA 2XXTA 5H8NB 1QKAA 4LONB 4GVOA 3K2DA 3K6VA 1B0HA 2D21A 2UYFA 3RT8A 3FASA 4ESXA 3OO8A 1L5TA 5K2YA 4F18A 4QSDA 3RT6B 2O69A 4KYEA 1FQDA 1NH8A 3Q28A 3RLFE 3JYRA 3T22A 1Y1ZA 2XXYA 1MXZA 1LFIA 1OQGA 2XXXA 2I6EA 4OTEA 4WEDA 1MPDA 4LZ7A 2I48A 5EHSA 4F2QA 2A5SA 4EF2A 3FD3A 3TCGA 3Q26A 3MJNA 4NMYA 4POWA 5L9OA 2I3WA 3TCFA 3IL1B 3OMBA 2CZLA 4DZ1A 4YU0A 1TFAA 3FZVA 5KCJA 1EZ9A 2ONRA 4HS7A 4RXLA 4F3PA 1N04A 2QSXA 4P0GA 1VE4A 4OFJA 1USYE 4NWDA 2XXIA 1VFEA 1B6HA 2GHAA 3MPLA 5DTBA 2YLNA 1IXIA 3CSBA 4ISUA 3N94A 5H8FB 3K00A 1B32A 2VP1A 4ZE9A 2DE3A 3U94A 4XXUA 4TQUQ 5TPAB 4Z0IA 2ESNA 1GVCA 2KLFA 3T9XB 2V3QA 1Y3PA 1UTHA 3PPRA 4YZZA 4NF4A 3I3VA 2GH9A 3IJOB 4X48A 1O64A 3MW0A 4U1ZA 5DT6A 1WVJA 4PP0A 1VR5A 1JVXA 5DVJA 4EQ9A 3PPPA 1S7YA 4KCCA 4NF6A 3RUMA 1VFDA 3K6WA 5EYFA 1POTA 1DSNA 4X9TA 1LBCA 3T93B 3EQ1A 4QFLA 3EHUA 2H25A 2E0SA 2ZYMA 3S9NC 3G3FA 4RK2A 4G77A 1LAFE 2HZLA 3O6IA 1US4A 5H8QA 3R26A 3OSQA 2V84A 1OLCA 2Z8FA 2Q2AA 2VOZA 3SESA 4DXUA 4BLAA 3CG1A 3DELB 3CFLA 3KBRA 1A40A 3FVOA 1D3KA 2DWHA 1M5EA 3MVWA 3RPWA 3HPIA 3SKPA 1H43A 4ELPA 4LP2B 5H8SA 3USDA 2I58A 2HAVA 2RC7A 3OO6A 3IOVA 1SYIA 3DLNA 1SQYA 4ZZEA 3TDJA 4Q30B 4MLQA 3PGFA 1H45A 3VDFA 3O9PA 5FHOA 1DPEA 3O28A 2F7CA 5CMBA 1AL3A 1FTOA 2DP8A 4ND9A 3P7IA 2F6GA 4WKMA 3VXBA 1MY3A 4U2RA 5DYHA 2NVUB 4QSCA 3SETA 2A5TB 1MQIA 1IQ7A 3LSLA 4LA9A 3DM0A 4MLVA 4BDQA 1MH3A 2ABHA 3GZGA 3OEKA 3GBAA 2W7YA 2V93A 3JZJA 2Y7PA 3VV5A 2F7AA 4ZEIA 4G68C 3MP8A 3E3KA 3UIFA 1Q35A 3FVGA 2Z23A 1CE2A 3IR1A 3G3JA 1LB9A 5I57A 4NF5A 2DXRA 5ICQA 3DP6A 4OZ9A 3EF7A 1XVYA 4LZ8A 4QSEA 3S9MC 1Y4CA 2AL4A 3T96B 2ALUA 1B52A 4F3BA 1SYHA 4YKPA 2QS3A 3MP1A 1BTJA 1LGBC 4BDOA 4G68A 4IO5A 3PUXE 1DTZA 3UA8A 3FV2A 1MY2A 1ZJLA 4KFQA 1FTKA 2ONSA 2XXWA 3C31A 4ECFA 1O7TA 2I0CA 1B2HA 4R74A 1H3DA 5DVFA 2O51A 4PE5B 3VXCA 3TODA 4C1UA 1SW5A 3OD7A 1N3XA 1MY1A 3MZBA 2F6PA 4BDNA 3FUZA 3ZKLA 2REGA 4RPOA 4IGTA 4N07A 4F19A 2YPNA 4OYVA 3G7WA 1NKXA 4N13A 2XXQA 3SEWA 4I9DA 5ELVA 2B65A 1A99A 3PMWA 2QS4A 1GGGA 3B6QA 2V25A 4BDMA 3PPQA 4Q0CA 1N7WA 4XIGQ 4OESA 4YAHX 3D4CA 4F2OA 1R1NA 2FNCA 4MF3A 3IJXB 5AA3A 1A54A 4EQ7A 4F29A 4RPNA 4DXCA 1B46A 4PFUA 4MBPA 3I5OA 4IO3A 2QRYA 4IO2A 3MQ9A 3FIRA 3EHTA 2V3UA 3F11A 3T9UA 2XXVA 3VLVA 1B9JA 4YB7A 3KG2A 1O63A 4E0WA 2ONKE 3H4ZA 4I62A 5H8HB 3GXAA 4OETA 1WODA 4U1OA 3S9LC 2GHBA 1TFDA 1MM7A 1R9QA 4R6KA 5TP9A 3LSXA 3HN0A 4R6HA 3PD9A 5I56B 3VLUA 4EUOA 4OEVA 3LBSA 3SEUA 2BJJX 1IXGA 2ZMBA 4X1DA 1ZBMA 3K0VA 1PBPA 3H6WA 4C1TA 5BUUA 1B3EA 2Y7RA 3QUFA 3B7DA 3D4GA 2NWJA 4KR5A 1B3GA 2XD2A 1B1HA 3KEIA 1I6AA 2IEEA 3C4MA 3V83A 1QKBA 1JNFA 5I58A 3K1PA 5KDTA 5B70A 2PVUA 4U21A 1MY4A 5KCJB 3QK6A 4DXBA 3K6XA 5I2KA 4Z7EA 4IB2A 2QS1A 3KSJA 1PEBA 3OENA 2XX9A 1MXWA 1BKAA 5L9SA 3S2VA 3FVNA 3OO9A 1POY1 1ZMGA 3PUVE 4F3GA 4TOZA 2Q88A 3WAFA 1FW0A 1B4ZA 4DCYA 2DWJA 5I56A 3CRBA 1Y4TA 4GQOA 1UIVA 3TKDA 1UTHB 2RCAA 2Q9TA 4NF4B 2DE2A 1AIVA 2H5YA 4ZEBA 1HSJA 1ATGA 2D5WA 4FEDA 2NUVA 2RC9A 1N3WA 4NF6B 1BIYA 3PMVA 2PYYA 1N7XA 5ISUA 4DCXA 1MXYA 2FYIA 1S50A 1EU8A 1QUJA 1OLAA 2OZZA 5I59A 1Z7NE 1ZKBA 4JWXA 3O66A 3TELA 4ZEFA 3C9HA 5H8QB 3KN8A 1Y9UA 3IK6B 3KGCA 5ITPA 4XKRA 4THIA 4OHNA 4KCDA 4F3SA 2GFEA 2QMXA 4HTGA 1GTKA 1DOTA 1XVXA 3KOTA 2UVJA 1FQBA 4FAJA 4HCYA 1CB6A 1FTJA 4O3CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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