3H6VA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and ns5206 at 2.10 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 263
sequence length 263
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6vA02
1PBPA 4FEDA 4EQBA 1FQCA 4LQ2A 3M3LA 3OXNA 2H98A 1YCJA 1QJMA 4EXLA 4YB5A 1SW4A 1D3KA 3UIFA 3RT8A 2XXWA 2DWJA 1MQJA 2QS2A 1B5JA 1VE4A 3BFTA 3KSJA 3KOTA 1MS7A 4Q8RA 2F7CA 4OXVA 2RC7A 1FCKA 3MVYA 1FTLA 3UGWA 1MPDA 2ONSA 4C1TA 3O97A 3PPNA 4AB6A 1BTJA 4L17A 1SDXA 2F6PA 3SKPA 3O28A 3GLBA 2RC8A 2ZYOA 4QF9A 1MM7A 3KG2A 2Y7PA 5DTBA 5CMMA 4OTEA 4JXIA 1LB9A 4H5GA 2I0BA 1IXCA 4NF5A 3A09A 4E0XA 3S9NC 1ZMGA 2V3QA 3TTKA 1QUIA 3CI8A 1MQIA 4FEBA 1B5IA 3Q28A 2VP1A 2REGA 4NF5B 4G77A 4QSDA 1MPBA 4F3GA 2ABHA 3I6VA 1PDAA 4GQOA 2R71A 2Q2AA 2VHAA 4U2RA 2DYXA 3EF7A 1LLSA 1FTOA 4ELPA 3TTRA 1Y9UA 1B7HA 3GZGA 3TAJA 1LAFE 2Z8DA 3TODA 3N6TA 2UVHA 3C33A 4M4GA 4R9GA 2I4BA 3SEXA 1PB7A 4NF8A 1UTHA 3QIMA 4QFPA 5L9MA 5EYFA 3V8XB 4IGRA 3OSQA 1EZ9A 3RLFE 4H5FA 4NF8B 5ISUA 4H65A 3IJXB 3V5AA 2ZXTA 2XXHA 2ZNTA 2ZMBA 5A5XA 4OYVA 3O2AA 4EQ9A 3TTMA 1Y3NA 3T66A 1IXGA 2ZNSA 3U8QA 4BDMA 4ESXA 2XXQA 1EZOA 2H4IA 3PGFA 2AYSA 5J1DA 4ZDMA 3UORA 2Z22A 1II5A 1B3HA 3Q26A 1UIVA 2O69A 4NTLA 3PU5A 3PUWE 2DWAA 5H8QA 5FHOA 5H8FB 2LAOA 2D21A 5AE4A 3TELA 5FHMA 3U1OA 5TPAA 5L9SA 4GL8A 1EZPA 1LFHA 1US5A 4THIA 5EHSA 1PBQA 4LVQA 3K6WA 4TOZA 5BUUA 3W15C 2UVGA 2A5TA 2DP8A 4BDQA 1NNKA 2IEEA 3ONMA 1Y3QA 4IO2A 1FTJA 1A99A 2F97A 4G8HA 5TP9A 4GLIA 1QUJA 1RYXA 3U92A 2ONRA 3HHGA 4FORA 5ITPA 2NXOA 5TP9B 1POY1 3CIJA 1WODA 4F19A 1L5TA 4JDFA 3CG1A 3LR1A 3CFLA 4U1OA 3W9WA 3MUQA 3CR9A 2QMXA 2XD3A 2GH9A 1IXHA 3C35A 3TCGA 3UP9A 2VOZA 1EH3A 4PFTA 4F3PA 4I8CA 2ZYMA 4R73A 3BKIB 1SI1A 1XVYA 1F9BA 2ONKE 4IO3A 2F35A 1NFTA 3CSBA 2Q2CA 2QS3A 4IY6A 2XXRA 1XC1A 3WAEA 4LUBA 2QRYA 4Q5TA 1LFGA 1JW5A 1QKAA 1A40A 3FJ7A 4EF2A 4YKPA 1ZLQA 3OO9A 5I56A 4FECA 3KN7A 1NNFA 1XOCA 3VXCA 2RINA 5LOMA 4N07A 4ESWA 1Z7ME 1T0KA 5K2XA 3MVXA 5I56B 1B3GA 1SVXB 4ELQA 1ATGA 4R6KA 4OERA 2DQVA 1UQWA 4KR5A 4OZ9A 2Y7RA 3PD9A 1M5BA 1M5CA 5CMBA 3LSWA 3ILTB 2Q8JA 4OETA 3RT6B 3HCQA 4R6HA 1XHYA 3K6VA 3K1PA 1MPCA 2V25A 1GVCA 1URSA 3SDFA 1FQEA 4TQUQ 1P1QA 4YB7A 3IO4A 3R6UA 2O1LA 2M8CA 1MXXA 1S50A 2AL4A 4NEDA 5AA2B 2YPNA 3U72A 1Z7NE 4ZZEA 2F7BA 2DXRA 4F1YA 5DVFA 5AA3A 5AA1A 4O3CA 1IQ7A 4OHNA 2D3IA 1VFDA 3OO8A 3IORA 2RKMA 3SEUA 3B6QA 2UYFA 4U21A 3MP6A 3OOAA 5K2YA 3DM0A 1M5DA 3IR1A 1ZKBA 2DE4A 2F78A 3IOWA 4Z0IA 4ZEFA 3RTWB 4LP2B 3FATA 2FA7A 1N84A 4XIGQ 3G3HA 1N0TA 4POWA 4G68A 2HEUA 4IO5A 1H45A 2F7AA 1ZJLA 5IKBA 1B3LA 2ANJA 1US4A 2XXTA 3T9VA 2DE2A 1OVBA 4QFKA 3S9MC 3KJTA 4G8NA 2HAUA 1RYOA 2O6AA 1BP5A 2B3BA 2KLFA 3C31A 3THIA 1IEJA 4YU0A 3B6WA 1A8EA 2NWJA 3OO7A 3ZKLA 5L8DA 2D5WA 5I84A 2AIXA 4G2ZA 3FVOA 4DCYA 3FVGA 2E0SA 2HFBA 3MJNA 3O9PA 4RK2A 4PP0A 3RNNA 1IITA 3L6HA 4QSCA 3G3IA 1LSTA 2DXYA 5ICQA 4GVOA 3T9UA 3ZS6A 3VLWA 1Y20A 3M3KA 1GV8A 1MRPA 1B52A 3C32A 4WEPA 1TWYA 2V93A 4HW8A 4NWCA 4UACA 1B46A 4FIMA 3KEIA 1QULA 2UVJA 4GF8A 4MBPA 5ELVA 4ISUA 2UVIA 4QHQA 4ELOA 1B32A 1I6AA 1DSNA 4OESA 3K02A 4DIGA 4FATA 2PYYA 4RPNA 2GFEA 1VSOA 1AOVA 3MW0A 3MZBA 1MXZA 1QW0A 3FV1A 4I1DA 4ZEIA 4GL0A 1NMUA 4KPTA 4MLVA 2NUVA 3G7WA 2QSXA 2GRVA 1P1OA 3GXAA 2P1SA 1P99A 3QYTA 4ZS9A 4R74A 4K3FA 3TMGA 4ZE9A 1WVJA 3AXFA 4M1VA 2F34A 2A5SA 3O6HA 1MXYA 3I3VA 2CZLA 2F6GA 1URGA 2FNCA 3U94A 1DPPA 3KSXA 4ELRA 3FJGA 1OVTA 3CFXA 4P11A 1D9YA 5CC2A 1FW0A 4LQ5A 1B0HA 5CBRA 2HAVA 4I9DA 1I6BA 2X7PA 2XXUA 3VFJA 3HO7A 4BDRA 5CRYA 2PBWA 1UTHB 3VVFA 1VR5A 1PB8A 1B6HA 1HSLA 3JZJA 3HHFA 3TUSA 5JTYA 1QVSA 4F1VA 4GXAA 5H8NA 1JVXA 4FE8A 1B51A 5B7DA 4ZEDA 2OJTA 1H44A 5JTYB 5A5XB 3RPWA 3ILUB 4GIZA 4F22A 5H8NB 4PFUA 5KCJA 4OEVA 1ZU0A 3TCHA 2XX8A 4GRKA 4EDPA 1J1NA 3SESA 3FIRA 4PE5B 2E1SA 5KCJB 1SQYA 1Y4TA 3GBBA 3K6XA 4O3AA 1B2HA 2OCUA 1ZTYA 1LAGE 4OMBA 3RQTA 3TTLA 1B58A 2P2AA 3V83A 2PX1A 3OMBA 4HTGA 2AL5A 3QUJA 3PUZE 3IB2A 5H8QB 4IO7A 3PMWA 3IOTA 3B7DA 2G29A 1NH7A 5TPAB 4H8IA 1MQGA 2OWTA 1OQHA 3MPKA 3N94A 5DVIA 3QXMA 5HBCA 3QAXA 3T22A 2Y7IA 1NNPA 2XXVA 4XXUA 3R7XA 1P1WA 2A5TB 4NF4A 3GBAA 1Y1ZA 3T96B 1MY3A 3HPIA 1XT8A 5L9OA 2DVCA 2RF1A 1QUKA 3BFUA 4JSDA 3V89B 2RCBA 1LAHE 1R6ZA 3LBSA 3FVKA 4NF4B 3PPRA 4TLMB 1SW1A 2DS9A 4XKRA 4XKNA 3SEVA 3USDA 2XX9A 4G8MA 3CRBA 4WXJA 3Q25A 4KYDA 1SW5A 5ICTA 1YPNA 3EQ1A 4RY1A 1OIBA 1FQAA 4LZ7A 5DYHA 3RN8A 3LC8A 1HSEA 4MLQA 3ZSFA 1N76A 2HZKA 1XS5A 1JEUA 5B70A 1SYIA 3T9XB 3C4MA 1PC3A 2I48A 3DLNA 2NVUB 1Q1KA 2R9JA 4DDDA 4JBZA 3C9HA 3HSTA 3IB0A 3O29A 3OD7A 2DWIA 3DP6A 3IO6A 4LA9A 1JNFA 1TFAA 4R2BA 3N26A 1JQFA 2XXYA 3MZ1A 2WKYA 1R9LA 3Q27A 5H8SA 3G3FA 5AA4A 4Q0CA 5DEXA 2QPQA 4F2OA 1FQFA 5F1QA 5AA4B 4YMAA 4G68C 3DP4A 3UK4A 1WDNA 4U1ZA 3JYRA 3H6TA 3QK6A 4EQ7A 4R2FA 2W7YA 4YKJA 4OQOA 1SYHA 4GOTA 1B0LA 3H7MA 4NE4A 5I59A 2QJEA 2QL3A 3VV5A 4F1UA 3K1NA 4C0RA 2O1MA 1MY0A 2Z8FA 1A8FA 5I59B 3R26A 4RXLA 3FXUA 3HV1A 1S7YA 3SETA 1BLFA 3FZVA 3OELA 1IIWA 3G3GA 1UIUA 1LCFA 1NNTA 3OO6A 1B3FA 2QS4A 3PMXA 4UA8A 5EHMA 3FV2A 5I2NA 4OENA 1H3DA 4KHZE 4E0WA 2XXXA 4BDNA 4OFLA 1CB6A 1LB8A 3RUMA 5I2NB 4Q30B 4PQJA 2VD2A 4IO6A 4F3BA 4HS7A 2PT1A 3S9EA 3T9HB 2XD2A 3PPQA 1AL3A 4X1BA 1LAXA 1A55A 3VXBA 2CMOA 1H43A 4EXKA 3MBPA 3I5OA 1B1HA 1AMFA 1NKXA 2THIA 2H99A 3RGYA 2Z23A 4YKKA 1MG1A 1N3XA 3KN3A 4HCYA 4G68B 2H25A 3QUFA 2I6EA 4EUOA 2B3FA 1B9JA 5HM4B 4LZ8A 3UN6A 1YAEA 4ECFA 4R9FA 3KN8A 2I3VA 4H1XA 3TKDA 3MVWA 3D4CA 1MY2A 4PETA 4PFWA 1RKMA 1JETA 4XKPA 2PMSA 3IL1B 4U4XA 3N5LA 2GHBA 4RYAA 4F18A 2O7UA 3H6WA 1H76A 4POXA 5FTHA 3IOVA 4U23A 5I57A 1JEVA 4Z7EA 2I49A 4OFJA 2Q89A 3VVEA 5KZTA 4F3SA 2XXPA 4IGTA 1DTGA 1M5FA 3VLVA 3S9LC 3K4UA 1N04A 5I57B 2RCAA 1IXIA 2DSFA 2OZZA 3Q29A 4QFOA 3A3CA 4EF1A 3MP8A 2PVUA 4OEUA 3LSLA 4XKQA 4KD5A 4U4SA 1PEBA 3MP1A 1B4HA 2I58A 3TPAA 4R6YA 2PT2A 4AQ4A 2V84A 3FUZA 1M5EA 1MDQA 1TXFA 1OMPA 3U93A 4P0IA 3CSGA 5CI5A 1B3EA 4RJZA 1SI0A 1B4ZA 1D4NA 4KCCA 4MFIA 4X1DA 3KBRA 3IOUA 4BDOA 3EHTA 1ANFA 3MPLA 2XXIA 3FGSA 3MQ9A 1B1XA 1JW1A 4KYSA 2OLBA 4LATA 4ZZAA 2O7IA 4IB2A 2OWSA 1PB9A 3PPOA 3KZGA 3TZAA 1MDP1 2BJJX 3MAMA 3KGCA 3TFLA 2IA4A 3PUYE 1NH8A 1ZBMA 1D9VA 3EN3A 1HSJA 3VVDA 3K00A 4BLAA 1QKBA 1R9QA 3EHSA 4O3BA 2R6GE 1O7TA 3OENA 1MQHA 5M2VA 3K6UA 1SD3A 2HZLA 4N6PA 3S4UA 3IK6B 3OEKA 3UA8A 1O64A 1MH3A 3O66A 1JVYA 1LBCA 3MWBA 3IX1A 4X9TA 1O63A 1B40A 3LUYA 3VDFA 2UYEA 5CBSA 3TCFA 3A3UA 3LSXA 1AIVA 3KFMA 1LGBC 1TFDA 4DE8A 2HXWA 2OK2A 1DPEA 3ECRA 5CMKA 4P0GA 1USYH 1B7UA 2I4CA 5IAIA 5HPQA 1BIYA 5F7VA 3K0VA 1P1UA 1EU8A 5H8FA 1P1NA 2HCAA 3SEYA 2F8DA 3ODBA 4ZE8A 2I0CA 4KCDA 3M3FA 3PPPA 1LFIA 4GXSB 3KJ7A 4FJPA 4DXCA 1MQDA 4YICA 3TQWA 4BDLA 3VE1B 2Y7WA 2Q88A 3FXQA 4HCWA 3DP8A 2O68A 2ESNA 1JW4A 3F11A 4IO4A 5H8HA 3TQLA 2H5YA 4U22A 1IUDA 4DLDA 1DOTA 4H6DA 4ONYA 3MVZA 4ZEBA 3EHUA 4QFLA 5H8HB 3DELB 4GD5A 2HQ0A 1FQBA 3PV0E 4LZ5A 2O84X 1OLAA 1R1NA 4QSEA 1Y1MA 2XHDA 2ZYNA 3FJMA 3G3KA 3PUVE 1AH5A 2FYIA 3LSFB 3D4GA 3H3GA 4YKIA 1YTVA 1Q35A 3RTFB 1VFEA 4NWDA 3SERA 3S2VA 1MY1A 4DXUA 3G3JA 1S9TA 3CFZA 2Q9TA 1MM6A 3IB1A 1N7XA 3ZKKA 4F31B 1MXUA 3H4ZA 2V3UA 1LBBA 5ITOA 2QMWA 1B5HA 1IZ1A 1XVXA 1TT1A 3HN0A 4KI0E 4QRZA 3FVNA 4GFRA 3P7IA 2OBGA 1OLCA 4KFQA 3KOSA 3E4RA 2ZNUA 1Y3PA 3WAFA 1B7ZA 4DXBA 3OEMA 4YMBA 3H06B 4MF3A 1N3WA 4RPOA 3T93B 1MY4A 3W9VA 1A7LA 2F36A 5BWJA 1MXVA 3K1MA 3O6GA 4H0WA 5AA2D 3SEWA 1CE2A 1OQGA 2G93A 3TEPA 5DEXB 2RC9A 4OWDA 3B6TA 4F39A 4JWYA 3N6UA 4F29A 3CG3A 2F5XA 2DE3A 4I62A 4H8JA 3C36A 2P0SA 1DMBA 2Z8EA 3QSLA 4OVJA 4X48A 5CM6A 5KDTA 3FXRA 3TTNA 3E13X 2UXAA 4F2QA 3TDJA 1LCTA 3K2DA 4ZEKA 2REJA 4XTCQ 1MXWA 5KDTB 4IY5A 3E3KA 1FTKA 5CMCA 4ND9A 4RNSA 5AA2A 4QFNA 2YLNA 2VD3A 4H67A 4MH5A 5I58A 5JEIA 5DT6A 3E9XA 4WKMA 2B65A 4PFYA 5FHNA 2X7QA 2Y7KA 3CVGA 3PUXE 5I58B 3MZ9A 5JK4A 2Y84A 1FQDA 3FASA 2H9BA 1GGGA 4RA1A 3TYHA 1BKAA 1Y4CA 5DVJA 2O51A 4YAHX 4NMYA 4C1UA 4YZZA 4NF6A 3FD3A 2XX7A 1SBPA 4RK9A 1KWHA 2DWHA 4ZECA 1POTA 4OFOA 4YB6A 1GTKA 3M8UA 3O6IA 3L6GA 1URDA 4NF6B 1I69A 4JB7A 3PD8A 1DTZA 5I2KA 1SW2A 2YJPA 1A54A 3BBRA 3IAZA 1ELJA 4N13A 4TLLB 4JWOA 3VLUA 1B05A 2V3TA 4AB5A 3MC2A 4JSOA 2ZYKA 5I2KB 2VGQA 2DVZA 1I6QA 1FTMA 4JWXA 3H03A 4R72A 4LONB 1UTBA 4DZ1A 1N7WA 3JV9A 3OSRA 3IJOB 4GWOA 4G4PA 3PMVA 2QS1A 1GR2A 3C34A 1NL5A 1UTBB 4WEDA 4DCXA 4R75A 3H6VA 4FAJA 5FTIA 4KYEA 3K01A 3RY3A 1USYE 2GHAA 3H6UA 1ZIUA 3EPEA 4KQPA 2I3WA 1MH4A 2DOJA 2NOOA 2X26A 5TU0A 2ALUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2I0CA 4KCDA 3M3FA 3PPPA 1LFIA 4GXSB 3KJ7A 4FJPA 4DXCA 1MQDA 4YICA 3TQWA 4BDLA 3VE1B 2Y7WA 2Q88A 3FXQA 4HCWA 3DP8A 2O68A 2ESNA 1JW4A 3F11A 4IO4A 5H8HA 3TQLA 2H5YA 4U22A 1IUDA 4DLDA 1DOTA 4H6DA 4ONYA 3MVZA 4ZEBA 3EHUA 4QFLA 5H8HB 3DELB 4GD5A 2HQ0A 1FQBA 3PV0E 4LZ5A 2O84X 1OLAA 1R1NA 4QSEA 1Y1MA 2XHDA 2ZYNA 3FJMA 3G3KA 3PUVE 1AH5A 2FYIA 3LSFB 3D4GA 3H3GA 4YKIA 1YTVA 1Q35A 3RTFB 1VFEA 4NWDA 3SERA 3S2VA 1MY1A 4DXUA 3G3JA 1S9TA 3CFZA 2Q9TA 1MM6A 3IB1A 1N7XA 3ZKKA 4F31B 1MXUA 3H4ZA 2V3UA 1LBBA 5ITOA 2QMWA 1B5HA 1IZ1A 1XVXA 1TT1A 3HN0A 4KI0E 4QRZA 3FVNA 4GFRA 3P7IA 2OBGA 1OLCA 4KFQA 3KOSA 3E4RA 2ZNUA 1Y3PA 3WAFA 1B7ZA 4DXBA 3OEMA 4YMBA 3H06B 4MF3A 1N3WA 4RPOA 3T93B 1MY4A 3W9VA 1A7LA 2F36A 5BWJA 1MXVA 3K1MA 3O6GA 4H0WA 5AA2D 3SEWA 1CE2A 1OQGA 2G93A 3TEPA 5DEXB 2RC9A 4OWDA 3B6TA 4F39A 4JWYA 3N6UA 4F29A 3CG3A 2F5XA 2DE3A 4I62A 4H8JA 3C36A 2P0SA 1DMBA 2Z8EA 3QSLA 4OVJA 4X48A 5CM6A 5KDTA 3FXRA 3TTNA 3E13X 2UXAA 4F2QA 3TDJA 1LCTA 3K2DA 4ZEKA 2REJA 4XTCQ 1MXWA 5KDTB 4IY5A 3E3KA 1FTKA 5CMCA 4ND9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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