3H6VA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and ns5206 at 2.10 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 263
sequence length 263
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6vA02
1L5TA 4QFNA 4H6DA 3TTMA 1QULA 1QUJA 3C32A 4DXUA 2VD3A 4N07A 1BIYA 4M1VA 3PPNA 1XS5A 3CFXA 4ZZAA 1RYXA 2P2AA 2HEUA 3GLBA 3UIFA 1B0HA 5I57A 2HCAA 1UQWA 1LFGA 1N0TA 3IOWA 5CC2A 3T22A 3GBBA 2ONRA 4N6PA 1A7LA 3EHSA 3V5AA 1BLFA 1IXHA 1P99A 2QMWA 4KCCA 5TP9B 5H8QB 4I8CA 4NF5A 3IJXB 3VV5A 4K3FA 3FXUA 5KZTA 3T93B 3PPPA 5AE4A 4JWXA 5H8NA 2CZLA 2FNCA 3L6HA 1M5FA 3PUYE 3MBPA 3MP8A 3KG2A 5IKBA 3E3KA 3T9HB 4FIMA 3MP1A 2QJEA 2H9BA 3HSTA 2OWSA 2XXWA 4OQOA 4ZE8A 2XXIA 2NWJA 2DS9A 2XXQA 1BP5A 4BLAA 2HAVA 1JW1A 3EHUA 4O3CA 4FEBA 3HHFA 1B3LA 1B4ZA 3UP9A 1B3FA 4U21A 1LAFE 1EZOA 1OMPA 3TTNA 1XVXA 3T9UA 4MF3A 3T66A 4KFQA 1NMUA 3MPKA 2Y7RA 1PB9A 1S9TA 1QUIA 1B7HA 1O64A 3TCFA 4GXSB 3FZVA 1MPDA 4FE8A 3CSBA 3VVDA 5FHNA 4R2FA 3V89B 1Q1KA 2ZYNA 1LGBC 1URDA 4MBPA 3RPWA 3QXMA 4IY5A 1FTLA 3LBSA 2UVHA 1FTOA 4FECA 1B9JA 2RCBA 4YB6A 3MC2A 2FYIA 5TP9A 5H8QA 4GVOA 1Q35A 2O84X 3U93A 1SW4A 2XX8A 1DTZA 3Q27A 2I4CA 4RNSA 2XXRA 3VLWA 5I58A 1A8EA 4IB2A 5KDTA 4TQUQ 1H44A 3S9LC 1R9LA 2B3BA 2I49A 3TELA 2G29A 1USYE 1KWHA 4HCWA 2DE3A 3PUVE 3TAJA 4EDPA 2XXUA 2F34A 4KD5A 3VFJA 3LR1A 5HM4B 2RC7A 4LA9A 4L17A 3LSWA 1OIBA 3IO6A 5B70A 3TCHA 4DCYA 3IORA 2I0CA 3TTLA 2Y7KA 4LUBA 4OENA 3U8QA 3VLUA 1F9BA 2E0SA 5L9OA 1VE4A 3BBRA 3SETA 2ZNUA 4PFWA 1CE2A 1PEBA 1B7ZA 3CG1A 1PB7A 4AQ4A 2I4BA 4U1OA 1B1XA 4EQ7A 1MY0A 3N6TA 4PETA 4MLQA 1ZU0A 3H03A 3S9MC 3G3IA 2ZYKA 4GFRA 3ONMA 3K6WA 2QMXA 2Q2AA 1SVXB 4IO6A 4LQ5A 3A3CA 3RTFB 2Z8DA 1XC1A 3MVXA 1M5CA 1LBCA 1B40A 5AA2A 1PC3A 3FV1A 1B0LA 4TLMB 2NXOA 2F6GA 1MG1A 4OMBA 3MJNA 1SQYA 3FJGA 1SI1A 2DWIA 1XHYA 4GRKA 4RPNA 2E1SA 2VGQA 4XXUA 2O51A 3FV2A 1NL5A 2VP1A 1LAXA 3IOTA 3RNNA 2GRVA 2DWHA 2F35A 2I58A 3E4RA 4JSDA 1IXCA 3TMGA 3H6WA 4LQ2A 4G4PA 3I3VA 4O3BA 3ZS6A 3K00A 3CRBA 4R6YA 1S50A 1PDAA 3FD3A 4R9GA 4EXLA 1VFDA 3I6VA 3TEPA 4P11A 2DVZA 1EU8A 4X1DA 3KFMA 1D9VA 4GD5A 4R73A 1VR5A 3L6GA 3VXCA 4ELPA 3RUMA 1XVYA 2ZYOA 4OVJA 2F36A 4U4SA 4U1ZA 5CMMA 3A09A 4PQJA 3T9VA 4OETA 1FCKA 1QVSA 2F7AA 1FQBA 3E9XA 5IAIA 1ZTYA 4OWDA 3C31A 3PD9A 4ZECA 3CFZA 2VHAA 3TDJA 3LSFB 4ZEIA 3K01A 3P7IA 1SW2A 3OSRA 5DTBA 3OO7A 1US5A 2FA7A 1B32A 3V83A 2AL5A 4F31B 1O7TA 1JNFA 3OSQA 4F1UA 3BFUA 4KI0E 2XX9A 2PVUA 3IB2A 5EHMA 4XKNA 4R6HA 2YLNA 4C1UA 3O29A 3VXBA 5ICTA 3SEXA 3AXFA 1OVTA 4POWA 1PBPA 1B05A 1WODA 1MRPA 2GHAA 5LOMA 1TT1A 5AA1A 1B7UA 3FVGA 3V8XB 2UVGA 4BDRA 4I1DA 4F19A 3G3HA 2V93A 4QFKA 3EHTA 1FW0A 3FIRA 4MH5A 4RY1A 1R6ZA 5L9MA 2V3TA 1YPNA 1N84A 4GF8A 3DLNA 2XXHA 4IO3A 4QFOA 4H8IA 1LLSA 5DVJA 3N26A 4E0WA 4YB7A 3ZKLA 2F7CA 2NVUB 2DXYA 3OENA 2GHBA 3UA8A 2DYXA 3DP8A 4KCDA 1AL3A 4KYSA 2RKMA 1Y3PA 5CI5A 3ODBA 2O7UA 4PFYA 1T0KA 4LP2B 3TQLA 1JW5A 4IO7A 1DOTA 3G3KA 1P1UA 2NOOA 4EF1A 4Q30B 1FTKA 3LUYA 1CB6A 4KQPA 3QSLA 1OVBA 2RCAA 2ABHA 2H25A 1JEUA 3IR1A 4F18A 5ITOA 2HZLA 1R9QA 4YMAA 2DXRA 3BKIB 5CMCA 2X7PA 1Y3NA 2F5XA 1MQJA 5TPAB 3OOAA 3PU5A 1Z7ME 1MPBA 3S2VA 4XIGQ 2RF1A 5DEXB 1WVJA 1A99A 3A3UA 1US4A 1QKBA 4R9FA 1JQFA 3WAEA 1UTBB 2ZNTA 1MPCA 1IITA 4O3AA 4ZS9A 1I6BA 4LZ8A 3W15C 4LATA 3VDFA 2R9JA 2I3WA 3W9VA 5JTYB 4JWYA 1FQCA 4X9TA 4TLLB 3K6XA 2V84A 3OO8A 3RN8A 2Y7PA 1LFHA 4RA1A 3KSJA 5I84A 5I2NB 4HW8A 1N7WA 2O6AA 2Z8EA 4NF6B 5AA3A 1YAEA 3CG3A 1ZBMA 3MVZA 1Y4CA 1USYH 4N13A 1LFIA 3QIMA 4ECFA 1WDNA 3MP6A 4RJZA 4XKQA 2DWAA 1Y4TA 4DDDA 1D3KA 3OO6A 4DIGA 2V25A 3Q29A 3MAMA 5J1DA 3H6VA 1TFAA 3TPAA 1FTJA 1FQDA 2Z23A 3FATA 4DZ1A 4NF8B 2PBWA 4RK9A 1B46A 3C35A 4OYVA 3LC8A 3UGWA 4Z0IA 1JEVA 3PUZE 3RLFE 2H5YA 5ITPA 3MUQA 3OXNA 2A5TB 3R26A 3EF7A 1OLCA 1LAGE 2Y7IA 2XXYA 3TZAA 2OK2A 3JZJA 1M5DA 2PMSA 1B5HA 1N76A 1UTBA 3N5LA 2DE4A 3ILUB 4PP0A 2V3UA 1DPPA 1MXWA 3M3LA 5FHMA 3G3FA 5FTHA 1MY3A 3SDFA 5JTYA 4DCXA 5ISUA 5HBCA 1P1QA 1EH3A 3K4UA 3QK6A 1QJMA 3VVFA 1OQHA 2O1MA 4R2BA 5I2NA 2DP8A 1FQEA 3PPQA 1JVXA 1POTA 4OFOA 1VFEA 4ZE9A 3SEWA 4H5FA 4YU0A 1N3WA 2BJJX 1B6HA 2QS4A 2X7QA 4YAHX 3PMVA 3VVEA 4H8JA 1MQDA 3UK4A 3MWBA 4BDMA 3KJ7A 4R74A 3PUXE 3WAFA 3VE1B 2ZXTA 4H5GA 1LCFA 3FVOA 1IEJA 4NF8A 1B3HA 4QFPA 1B3EA 4WEPA 3LSLA 4NF4B 1FQFA 2A5SA 4EUOA 1B5IA 4EQBA 1P1NA 3EQ1A 1B51A 2H4IA 3IOVA 3QUFA 5FTIA 1MY1A 1NH8A 1LB8A 1H3DA 1R1NA 4YKIA 4NE4A 3OO9A 3RT6B 5CMBA 4ELQA 2WKYA 2I6EA 3PPRA 2QSXA 2HAUA 2ANJA 2G93A 3BFTA 3C36A 1HSJA 4JB7A 1S7YA 2ONKE 1M5BA 1BTJA 2XHDA 1I69A 3TODA 4H67A 2UYEA 3PMXA 1A8FA 1ZKBA 3O28A 4U2RA 2DWJA 3MW0A 4KR5A 3K6VA 3S4UA 3Q26A 4Q0CA 2X26A 1P1WA 4MLVA 4LONB 4R72A 3O97A 1Y1ZA 5M2VA 2LAOA 2PT1A 1SW1A 4IO4A 3SESA 5DYHA 2ALUA 4C0RA 3KBRA 2NUVA 2Y84A 4KHZE 4X1BA 4HCYA 3H3GA 2QS1A 3U1OA 4OFJA 2ESNA 3KZGA 4LVQA 1MXVA 3EPEA 3FJMA 3CI8A 3IAZA 4ZDMA 1H76A 2DE2A 1HSLA 3MPLA 3PMWA 4U22A 1JVYA 2HFBA 3KOTA 4IGTA 3I5OA 1MQIA 1SW5A 4NF4A 4G8HA 2F78A 5JEIA 4IGRA 3S9EA 1IXIA 2DVCA 3RQTA 1IQ7A 4G77A 1IXGA 1SBPA 3HHGA 1MXXA 3CR9A 1AOVA 1LB9A 1II5A 4JXIA 1URGA 2UXAA 2D21A 1UTHB 2OCUA 3U94A 3GXAA 3DM0A 4QSDA 4XTCQ 5KCJB 2XXTA 2HQ0A 1NNPA 2QL3A 3C34A 3CSGA 5I2KB 3K2DA 3LSXA 2AIXA 1D9YA 4QSCA 1O63A 4LZ7A 3QYTA 5DVIA 1GVCA 4OXVA 2O68A 5AA4B 1A40A 3HCQA 3D4CA 4NWCA 1B1HA 4KPTA 4EQ9A 3PUWE 1J1NA 1SI0A 3M3KA 3B6QA 4UA8A 2Z8FA 4G68C 5K2XA 3S9NC 3K1MA 3IK6B 1UIUA 2Q9TA 1LBBA 1SD3A 2Y7WA 5DVFA 2OZZA 3G3JA 3C9HA 4ND9A 4F1YA 3E13X 3Q28A 4OFLA 2D5WA 1TFDA 4DXBA 3QAXA 1N3XA 4IO5A 1MY2A 3HN0A 4TOZA 1LAHE 2QRYA 3RT8A 5H8NB 4YICA 4Z7EA 3ILTB 4RK2A 2AL4A 4QF9A 5EYFA 4F3SA 1SYHA 3FVNA 1RKMA 3KSXA 1MXUA 3OMBA 1MH3A 4ISUA 5B7DA 2M8CA 1QUKA 2HZKA 2PYYA 4EF2A 2ZMBA 2QS2A 1UTHA 4F2OA 2REJA 1DPEA 1AH5A 4C1TA 3C4MA 4JDFA 4YKJA 3R6UA 1POY1 4QHQA 5L8DA 1H43A 2OLBA 1QKAA 3DP6A 5CM6A 1NNFA 4BDQA 2REGA 1PB8A 4ZZEA 2RINA 4WEDA 4IY6A 4BDNA 4JSOA 2GFEA 2OBGA 1XOCA 2QPQA 2XX7A 3PPOA 4ESXA 1B52A 3N94A 3K02A 4GL8A 5AA4A 3H6UA 1I6QA 1ZJLA 4X48A 5BWJA 2DQVA 3B7DA 4BDOA 4OEVA 1N7XA 3FXQA 4JWOA 4F3GA 3FUZA 5CBRA 2UYFA 5H8FB 3SEUA 4F1VA 4R6KA 1TWYA 5HPQA 1NNKA 1JETA 3O66A 2F6PA 1MDQA 4RXLA 3HPIA 1GTKA 4PFTA 1NH7A 1A55A 2PX1A 4G2ZA 1AMFA 5CBSA 1ZLQA 3OEMA 1MQGA 4I9DA 3SEYA 5A5XB 5I58B 3KJTA 4GOTA 5KDTB 4FORA 1Y20A 2Q2CA 3UORA 2P0SA 1VSOA 5CMKA 1Y1MA 1P1OA 3JV9A 2CMOA 4GL0A 4OEUA 1DMBA 1TXFA 2I3VA 5BUUA 3QUJA 1BKAA 1MS7A 1JW4A 4WKMA 2DSFA 2IEEA 4AB6A 4NEDA 3KN8A 1EZPA 3KOSA 5H8HB 2XXPA 4ZEKA 4G68B 3O9PA 3H4ZA 4LZ5A 3K1NA 3KN3A 2XD2A 5TPAA 2RC8A 4PFUA 2HXWA 2B3FA 2XXVA 5DEXA 4DE8A 1Z7NE 4F3PA 3THIA 4I62A 4M4GA 3FXRA 2OWTA 1UIVA 3CIJA 1FQAA 1IZ1A 3RTWB 4P0GA 1NNTA 2VOZA 3O6HA 4GLIA 3G7WA 3FVKA 5AA2D 3TKDA 3IJOB 1IIWA 4R75A 5H8FA 1YTVA 3MZBA 4UACA 4G8MA 1URSA 4QFLA 3B6WA 4RYAA 5AA2B 4OTEA 3OEKA 4Q8RA 3MVYA 2QS3A 1Y3QA 2KLFA 3GBAA 4NF6A 4QRZA 2XXXA 2UVJA 3ZSFA 4KYEA 4RPOA 5ICQA 2OJTA 2AYSA 1OLAA 3SERA 5A5XA 1D4NA 4OERA 3K1PA 1MXZA 3MQ9A 4HTGA 4F29A 2GH9A 1DTGA 2RC9A 4QSEA 3JYRA 1HSEA 4PE5B 3VLVA 3SEVA 1H45A 5I56B 3K0VA 1QW0A 2B65A 3PD8A 1LSTA 1MM7A 3MVWA 3H6TA 4FAJA 3TCGA 3TFLA 1AIVA 5H8HA 2A5TA 4G68A 4H0WA 2IA4A 4OZ9A 4ESWA 1LCTA 3KEIA 4NTLA 2O1LA 4MFIA 3IL1B 2Q88A 4ONYA 1B5JA 1B2HA 1NKXA 5JK4A 1YCJA 4U4XA 3OELA 2ZYMA 3N6UA 2W7YA 4G8NA 1OQGA 1MH4A 2DOJA 4EXKA 1ANFA 3OD7A 3IX1A 1B3GA 3O6IA 2R6GE 3HO7A 2R71A 3H06B 4YZZA 1IUDA 4DLDA 3SKPA 3B6TA 4FJPA 4YKKA 4YKPA 3RY3A 1I6AA 1ZIUA 3R7XA 4JBZA 5L9SA 2ONSA 3W9WA 5F1QA 4FATA 3CVGA 4F2QA 3ECRA 2ZNSA 1ZMGA 3IO4A 3RGYA 3HV1A 3C33A 5FHOA 2V3QA 2F7BA 3GZGA 4ZEDA 4THIA 4DXCA 1B4HA 3IB1A 4XKRA 4HS7A 4GIZA 3USDA 2F8DA 3T96B 4F22A 5I56A 1NFTA 5I59B 1N04A 4XKPA 3U92A 5H8SA 3KGCA 2Z22A 3Q25A 1MY4A 4IO2A 2Q8JA 1Y9UA 2XD3A 3UN6A 3FASA 1SDXA 3U72A 1FTMA 2H98A 3KN7A 2O7IA 4YB5A 4ELRA 3TTRA 4E0XA 4KYDA 3MZ9A 4NWDA 1MQHA 4H1XA 3FJ7A 4ZEFA 3IB0A 4F3BA 3K6UA 1ATGA 1DSNA 4NMYA 3M3FA 2O69A 3TUSA 3ZKKA 3TQWA 4WXJA 2PT2A 1MDP1 4GXAA 3DELB 1GGGA 4Q5TA 5I57B 1ELJA 3O6GA 3TYHA 1A54A 4H65A 1RYOA 3G3GA 3D4GA 1GR2A 5DT6A 3DP4A 4FEDA 4ZEBA 2I0BA 5F7VA 3F11A 4GQOA 4POXA 1MM6A 4NF5B 3M8UA 4F39A 4AB5A 4OHNA 4YMBA 5TU0A 5K2YA 3FGSA 5I59A 5ELVA 3T9XB 2H99A 1M5EA 3PGFA 4ELOA 2Q89A 3EN3A 3H7MA 2YPNA 2YJPA 3MZ1A 1GV8A 1XT8A 2UVIA 3IOUA 4GWOA 1MXYA 1PBQA 2I48A 1B58A 1SYIA 4OESA 2P1SA 3PV0E 2F97A 5KCJA 5EHSA 4U23A 3O2AA 2VD2A 2D3IA 1EZ9A 4P0IA 3CFLA 2THIA 5CRYA 5I2KA 3TTKA 4BDLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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