3HN0A

Crystal structure of an abc transporter (bdi_1369) from parabacteroides distasonis at 1.75 a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
280
structure length
280
Chain Sequence
DTVIKVSVLRGPSVIAFADWLENPPIIDNKKVQVKVVDSPDLAQALLIKQETDIAVLPMINAANLYNKGIKIKLAGCPIWGTLYLVEKTPLKEPALYVFGNGTTPDILTRYYLGRQRLDYPLNYAFNTAGEITQGILAGKVNRAVLGEPFLSIALRKDSSLRITADLNHLTDNDTLGFAQTAVVYTPTMEKYRIAFEDALRASCQKAVRYPKETIHSLEEHGIFAQGALTPKSIERCKIYYLSAIEAKDAVMGFLRLIEQYEPKAVGGRLPDAGFIPEKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Parabacteroides distasonis
publication title Crystal structure of Nitrate transport protein (YP_001302749.1) from Parabacteroides distasonis ATCC 8503 at 1.75 A resolution
rcsb
molecule keywords Nitrate transport protein
total genus 87
structure length 280
sequence length 280
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hn0A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hn0A02
3HHFA 2Q2AA 2OZZA 1NH7A 4R9FA 3OEMA 1DTGA 5F1QA 3K2DA 4FJPA 1PB8A 5AA2D 1XS5A 4KI0E 4IO4A 4QFLA 4ZDMA 3TQWA 3V83A 3EHTA 1PC3A 1AH5A 3KZGA 1I6BA 3D4GA 3MVYA 2WKYA 2F35A 5I56A 1WVJA 1URGA 5K2YA 1MXZA 2DE2A 3G3FA 2Q9TA 4NF5A 4POWA 4O3CA 1B51A 1SD3A 4OEUA 2X26A 1MDP1 4R2FA 4NF6A 2E0SA 5TP9B 3KSJA 4EQ7A 1B58A 4NWDA 3USDA 3KFMA 3K02A 2XXVA 5M2VA 5L8DA 5H8FA 1SI1A 1JW4A 3OOAA 4ISUA 4NF4B 1B7UA 4OFOA 3Q27A 4L17A 2BJJX 4G2ZA 3HO7A 5J1DA 1PBQA 1MRPA 2I58A 2I3WA 4ZZEA 3IB0A 4LATA 4M1VA 3O6IA 1RYOA 2Y7RA 2H25A 3OENA 5FTHA 4G68B 4F2QA 4PP0A 2DXYA 3FV1A 1UTHB 5TU0A 4ZECA 2RINA 2NOOA 3LC8A 4NTLA 3C4MA 2I4CA 4IO6A 3UGWA 3C33A 2D3IA 1MPCA 3K6UA 3RT8A 1T0KA 4G4PA 5FHOA 3TZAA 4P11A 1KWHA 1N7WA 5BUUA 4GXSB 5HPQA 4H6DA 1MY1A 3PPOA 1UIUA 3MBPA 3MVWA 3VLUA 3BBRA 1BLFA 5L9SA 1LLSA 4YU0A 4RPNA 1Y1ZA 1B7ZA 3FXQA 2YLNA 1SVXB 3CSBA 3C31A 3T9VA 1AOVA 2GHAA 3PGFA 1S7YA 2V93A 2HAVA 2DWHA 3G3HA 5TPAA 1POY1 1NMUA 4NEDA 3TTNA 2XD3A 2DQVA 4DE8A 2XXUA 1ZMGA 1B0HA 3QIMA 3KSXA 4EUOA 5AA3A 4OESA 2UVIA 2H99A 4EXLA 4IGTA 1IUDA 4PFYA 3MPLA 4G68C 3GLBA 2AIXA 4O3AA 2HCAA 3U92A 5H8HB 4ZE9A 3MAMA 4QFOA 3DLNA 4YMBA 4R6HA 3VXBA 2A5SA 2O7UA 2XXRA 1NH8A 3MQ9A 3IR1A 4PFTA 3H06B 4QHQA 3T96B 2XX9A 2W7YA 4YB7A 3LSXA 3VV5A 1B5JA 3JV9A 3MZ9A 4OFJA 4RNSA 3H6UA 5K2XA 4H67A 2H4IA 4ESWA 4GWOA 5JTYA 4JB7A 1NKXA 1GGGA 4YKIA 4FATA 1QJMA 4R6KA 3ZKLA 1JW1A 1POTA 4NE4A 4ZEDA 4OMBA 3K1NA 5AE4A 1IXGA 4MLQA 1FTMA 4KYSA 4XKNA 4C0RA 4JWOA 4ELPA 2V25A 4TOZA 3ILTB 1A99A 3IOVA 1IIWA 3QK6A 3S9EA 2R9JA 1FQCA 3GBAA 1QKBA 5ICTA 5I57B 1B1XA 4X1DA 4RA1A 4U1OA 4GFRA 1F9BA 2OBGA 1OLAA 5AA4B 1AIVA 1B3LA 1MQIA 1SYHA 5EHMA 2NVUB 1DTZA 3E13X 1VFEA 5CM6A 3KN3A 4LUBA 4BDRA 3EHUA 1UIVA 2NWJA 3UP9A 1FTLA 4MF3A 2QS2A 1LGBC 2Q8JA 4LQ2A 1ZJLA 2F5XA 4R72A 1ZIUA 3N6TA 2F97A 3RQTA 1QVSA 4KYEA 5BWJA 4FORA 3LSFB 4U1ZA 3IAZA 4KCDA 3ECRA 4ELQA 3K6WA 1O63A 4GF8A 1JEUA 4H8JA 3IX1A 3OSQA 4MFIA 1OQHA 4BDQA 1B2HA 3C32A 3MPKA 3QXMA 2ESNA 1PBPA 2GRVA 1PDAA 3KOSA 1MPDA 2HZLA 1FQFA 4XIGQ 2X7PA 4X9TA 1FTJA 3CI8A 2Y7PA 1YCJA 3A3CA 3QAXA 4F29A 4DDDA 3PMVA 2V3TA 1NL5A 1H43A 4R6YA 2DE4A 1BIYA 3LSWA 2ZXTA 3OEKA 3LUYA 1NNPA 5B70A 5H8NB 5DVFA 1QUKA 4PFWA 3FVNA 2I3VA 3WAEA 5TP9A 5CRYA 4UACA 1FQBA 3T9UA 3OO6A 5DT6A 1B5HA 4NF4A 3U1OA 2Q88A 3EQ1A 4LZ8A 1IITA 1S9TA 3SKPA 2IA4A 4KHZE 1EH3A 3TTMA 3PUYE 4YKJA 1D9VA 1ZTYA 2AYSA 2DWJA 2ONKE 3QYTA 4G8HA 5JEIA 2VD3A 4G68A 2D21A 4NF8B 3P7IA 1UTHA 3PUWE 3MWBA 1SW2A 4LVQA 1P1UA 2UVGA 1MY4A 2I48A 4RK9A 1LCFA 2O6AA 3L6HA 3H03A 4JSOA 1A8EA 4BDOA 4NMYA 1N3XA 1O7TA 1NNTA 5IKBA 2F6GA 2GHBA 4JWXA 2UYEA 4P0GA 4BLAA 3O66A 4KFQA 4HS7A 1P99A 4F3GA 4KR5A 4ELRA 4F2OA 1FTOA 4ND9A 2OK2A 1GTKA 2QS4A 3I6VA 1XT8A 4IGRA 3MVZA 1M5BA 1QUIA 4OHNA 3K6XA 2RF1A 3CG3A 2XX7A 2CMOA 1SQYA 3R6UA 3CFXA 3S4UA 3A3UA 2V84A 3VVFA 1OVTA 3QUFA 5ISUA 4GIZA 2H5YA 5I84A 1URSA 4KD5A 5DYHA 3EHSA 3KEIA 1R9QA 2QSXA 3KJ7A 2F7BA 3HCQA 4QSEA 3HSTA 1JVYA 5H8HA 1B52A 2DYXA 4C1TA 3PPNA 1NFTA 4G8NA 3RLFE 1B4HA 1II5A 1MH4A 2DXRA 2ZNTA 4R74A 3FZVA 4EDPA 5CI5A 1MXVA 2RCBA 5IAIA 4NWCA 3SEUA 4EQBA 2M8CA 2I0BA 4IO2A 2QL3A 3SESA 3CRBA 2XXTA 3TTRA 2ABHA 4RXLA 3DP4A 3H4ZA 5I59B 1B40A 1FQDA 1A40A 2Y84A 3IOWA 3U94A 3R26A 1P1OA 4QSDA 1XVYA 1Z7ME 1JETA 1AL3A 2DE3A 4GOTA 3VE1B 4TLLB 2DSFA 3IK6B 4KQPA 3UA8A 3DELB 4WEPA 2RCAA 1N84A 2B65A 3FVOA 3B6TA 4GL8A 3W9WA 4HCYA 3FXRA 1MDQA 2O51A 5FHNA 3C35A 3TPAA 5I57A 1SI0A 5H8QB 4ECFA 2Z8EA 3C36A 4LP2B 1M5DA 1WODA 2F8DA 2I4BA 3O29A 1HSJA 3F11A 5AA4A 4X48A 4HW8A 3Q28A 2G93A 2OJTA 3R7XA 3DM0A 3AXFA 1HSLA 1SW4A 2F78A 3IL1B 3B6WA 4H5FA 1I69A 3O9PA 2YJPA 3MW0A 1BTJA 2G29A 2GFEA 3PUZE 3DP8A 3FASA 4OTEA 1USYH 3TKDA 4THIA 1SYIA 1N3WA 3K0VA 4YB6A 3IORA 5CMBA 3PD8A 4YAHX 1Y20A 1DSNA 1B0LA 5DTBA 4FECA 3IJXB 1QUJA 1GV8A 5KDTB 1D4NA 3OXNA 4XXUA 4JSDA 1VR5A 1N0TA 3A09A 4U23A 4O3BA 5AA2B 1US4A 2P1SA 2Z8DA 3TTLA 4XKQA 1BP5A 1H44A 2AL5A 3MVXA 1LBCA 1TFDA 4LONB 4I1DA 3VLWA 3KG2A 4F1VA 1NNKA 4IO3A 5H8NA 3ODBA 1R1NA 1SW1A 5FHMA 1B4ZA 2R71A 2V3QA 4DXBA 3FJMA 2OWTA 4E0WA 3FD3A 4GRKA 3OMBA 1PB9A 2VP1A 4IB2A 1Y4CA 1B9JA 3C9HA 2VHAA 2PBWA 1LB8A 3QSLA 3LSLA 2Z22A 4OWDA 2KLFA 2XXHA 2O7IA 1LCTA 3HPIA 3N5LA 4OXVA 3FVKA 4F19A 1YPNA 3TCGA 2CZLA 2HXWA 3T22A 2F6PA 3M8UA 4NF8A 4ZE8A 3DP6A 3W15C 3N94A 1Y4TA 3O97A 4XKPA 1I6QA 1LFHA 5I2NB 1RKMA 1A7LA 1TXFA 3TFLA 3FV2A 3IOUA 5HM4B 4IO5A 4N6PA 1LB9A 2B3BA 3S9MC 3VDFA 2XXXA 1MXUA 3TQLA 4GD5A 4GQOA 3K1PA 3G3JA 2ONRA 4ZEBA 3IB1A 4EF2A 3KN7A 4GXAA 2VGQA 1MY3A 4OVJA 2F7AA 2REGA 4GVOA 3S2VA 5DVJA 4FEDA 4QFPA 1MPBA 2PVUA 3MUQA 5L9OA 4F1YA 2ANJA 4WKMA 3RTFB 3B6QA 4EF1A 3LR1A 3OD7A 4JWYA 1H45A 1ZU0A 2I49A 2ZNSA 4EXKA 1J1NA 2XXYA 3ONMA 2XXQA 2Y7KA 3GZGA 2HFBA 3K00A 5KCJB 4KYDA 5F7VA 3ZSFA 2YPNA 3K6VA 4H8IA 1B6HA 1Z7NE 2OCUA 4I9DA 1MQJA 3ILUB 4KPTA 1P1WA 4Q30B 3THIA 4Q0CA 2IEEA 4BDMA 3HHGA 1Q1KA 1GVCA 2XXPA 3U72A 4GL0A 1YTVA 1AMFA 4F31B 5B7DA 3PPPA 1UTBB 2F7CA 1LAGE 4AQ4A 2UXAA 5I59A 4OERA 4H65A 3QUJA 3JZJA 3H3GA 2ZYKA 4DXUA 4YKPA 4K3FA 4Z7EA 3SERA 4XKRA 4DCYA 4MLVA 3UK4A 2AL4A 3UIFA 1LSTA 1MQGA 2FA7A 5L9MA 5DEXB 3FUZA 4ELOA 1B5IA 4P0IA 1A55A 1B46A 1ANFA 4F39A 4ZEKA 3CVGA 3SEVA 1QKAA 3BFUA 1B3FA 3LBSA 4HCWA 3JYRA 3L6GA 3KOTA 4G77A 4IY6A 2ZMBA 5H8QA 3U93A 4RK2A 1P1NA 3T9HB 4JXIA 3PUXE 1JEVA 5ITPA 1LFIA 3E4RA 3UN6A 4I62A 3SETA 3CR9A 4PE5B 5H8SA 4H0WA 3TYHA 1CB6A 3VVDA 2ZYNA 4WEDA 2O84X 2O69A 1SW5A 3Q26A 3FXUA 1FW0A 3BFTA 4YB5A 4F3BA 3RGYA 4G8MA 3CSGA 1MXYA 3KGCA 1Y9UA 1FCKA 4PQJA 1ZBMA 2Q89A 2FNCA 3RY3A 4Q5TA 1XC1A 3GBBA 3KBRA 2PMSA 3N6UA 1Y3NA 4LQ5A 3M3FA 3MP8A 5I2KB 4R75A 1MM6A 3E9XA 2QMWA 3VXCA 5KDTA 3RUMA 1ELJA 3TODA 4OQOA 3G3GA 4LZ5A 1ZLQA 1USYE 5AA2A 3UORA 3FVGA 1H76A 1R9LA 4IY5A 3U8QA 1ZKBA 1MY0A 1Q35A 2ZYOA 3FJGA 1LAFE 5CBSA 1MXXA 1B3GA 2QMXA 3IO6A 3PPQA 1US5A 3OO8A 1L5TA 3FIRA 1OIBA 3KJTA 2ZNUA 1QW0A 5CMMA 1MQHA 2QS3A 2RC7A 2A5TB 3SEYA 3TMGA 5CBRA 4OETA 4TQUQ 3S9NC 4EQ9A 3C34A 2QJEA 3D4CA 3IJOB 1LFGA 2ONSA 5CMCA 3CFZA 1TFAA 2HEUA 3W9VA 4YICA 1MG1A 1EZOA 4QF9A 3KN8A 3PD9A 4JBZA 3OSRA 3RTWB 4QFNA 2V3UA 3GXAA 1YAEA 4I8CA 5A5XB 3HV1A 5EHSA 1N76A 2QRYA 3H6VA 2O1LA 3Q25A 5I2NA 2UVHA 2Z8FA 2RKMA 1IZ1A 3ZKKA 4BDLA 5EYFA 3G3IA 4LZ7A 4U2RA 3RT6B 4U22A 2X7QA 1WDNA 3MP1A 3K4UA 1BKAA 3SDFA 2HAUA 4QSCA 3FATA 1IXIA 3O6GA 2QS1A 5ICQA 5I58B 4YKKA 2PX1A 1SDXA 1JW5A 3G7WA 4N13A 4ESXA 1UQWA 4DIGA 3MP6A 4U4XA 3VLVA 4OZ9A 1SBPA 3PPRA 3O28A 1B32A 3TCFA 3IO4A 4RJZA 3RN8A 5KCJA 3OO7A 4F3SA 1JVXA 3EN3A 5CMKA 1URDA 3V5AA 5I56B 2GH9A 4XTCQ 1FQEA 4FIMA 2PYYA 3IOTA 4R9GA 4R73A 4POXA 1B05A 2HQ0A 4ZS9A 4DLDA 1M5FA 4NF5B 2DOJA 1EZ9A 1IXCA 1ATGA 2OWSA 3CIJA 1VFDA 1UTBA 4NF6B 4ONYA 1B3EA 4BDNA 3RPWA 2HZKA 5H8FB 1GR2A 1B1HA 1MM7A 1Y3PA 2B3FA 3WAFA 3T66A 2ALUA 2DS9A 1TWYA 4OYVA 4HTGA 2Q2CA 1JQFA 5LOMA 2XXWA 1VSOA 4ZEFA 1IEJA 5DEXA 1IXHA 3N26A 1LAHE 3M3KA 1LAXA 2OLBA 2F34A 3S9LC 2XX8A 2FYIA 1D9YA 1N7XA 3MZBA 3SEXA 4QFKA 5HBCA 4YZZA 3T93B 3E3KA 1DOTA 2Z23A 3H6TA 4PETA 4RY1A 2THIA 2DP8A 2H9BA 3MC2A 1XVXA 2DVCA 5ITOA 1PB7A 2QPQA 1D3KA 3OELA 2XHDA 1DPEA 3ZS6A 2D5WA 2Y7WA 2DWIA 4Z0IA 2F36A 1HSEA 4GLIA 4ZZAA 3TCHA 1EU8A 3TELA 3TUSA 5FTIA 1MS7A 2UYFA 3I3VA 4DCXA 4Q8RA 1I6AA 3H6WA 2DWAA 2DVZA 2XD2A 1PEBA 4F1UA 1XHYA 5TPAB 3MJNA 3O6HA 4DZ1A 4H5GA 1EZPA 2R6GE 3CG1A 5KZTA 3EF7A 1P1QA 4E0XA 3TAJA 1LBBA 1QULA 3FJ7A 4RPOA 3B7DA 4MH5A 1R6ZA 3PU5A 4FE8A 1TT1A 1MH3A 4OEVA 1CE2A 5CC2A 4N07A 5I2KA 2NXOA 1MQDA 5DVIA 5AA1A 1OLCA 1N04A 1DMBA 2PT1A 4JDFA 3V8XB 3TDJA 2RC9A 4M4GA 2P2AA 3V89B 4FEBA 1XOCA 4LA9A 2VD2A 1VE4A 4U4SA 1B3HA 1IQ7A 4KCCA 3SEWA 4AB5A 1RYXA 1FTKA 1M5CA 4IO7A 5JTYB 2O68A 1H3DA 3H7MA 3VVEA 2Y7IA 3RNNA 1B7HA 1A8FA 1DPPA 3PV0E 2A5TA 2REJA 1Y3QA 1NNFA 1OVBA 3TEPA 2PT2A 2UVJA 4U21A 3I5OA 3T9XB 1FQAA 4RYAA 3PMXA 5JK4A 1S50A 2I6EA 4FAJA 4F3PA 2NUVA 2H98A 1OQGA 3BKIB 4H1XA 4TLMB 5A5XA 3CFLA 4DXCA 2E1SA 1M5EA 3EPEA 4AB6A 1Y1MA 4PFUA 3O2AA 3TTKA 3K1MA 1MY2A 1JNFA 3IB2A 4QRZA 2P0SA 4R2BA 2I0CA 4YMAA 3M3LA 3HN0A 4MBPA 4F18A 4ZEIA 3MZ1A 3PMWA 3K01A 1OMPA 4OFLA 3G3KA 2LAOA 2O1MA 4OENA 4X1BA 4F22A 4UA8A 4WXJA 2VOZA 3VFJA 3FGSA 2RC8A 1MXWA 3Q29A 4C1UA 5ELVA 3PUVE 5I58A 2XXIA 1A54A 2ZYMA 1O64A 3OO9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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