3IAZA

Structural basis of the prevention of nsaid-induced damage of the gastrointestinal tract by c-terminal half (c-lobe) of bovine colostrum protein lactoferrin: binding and structural studies of the c-lobe complex with aspirin
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The structural basis for the prevention of nonsteroidal antiinflammatory drug-induced gastrointestinal tract damage by the C-lobe of bovine colostrum lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 110
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2009-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iazA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iazA02
3R26A 4ZEKA 4OZ9A 4H8IA 3QAXA 5AA4A 2XXPA 1ZMGA 3QK6A 4KD5A 3V83A 1NH8A 1Z7ME 5CMBA 3VLVA 1GVCA 5AA4B 2DWIA 3TCHA 4KHZE 4FORA 2GH9A 5M2VA 2XXUA 3IB1A 2VD2A 4XTCQ 4TOZA 3VVEA 4FECA 3RUMA 1OQHA 1UTHB 1R6ZA 3RPWA 3GBBA 1Y1ZA 3OO9A 2F7CA 1LBBA 2QSXA 3BKIB 3TELA 2I48A 3RQTA 5DVIA 2D21A 3OENA 5H8FB 2Y84A 2ZYKA 2YPNA 3FVKA 1UTBA 2XX9A 4R6HA 4YMBA 4P11A 4R2FA 4U22A 4HTGA 1S9TA 2O7UA 4XKNA 2PVUA 3IOUA 1UTBB 3WAEA 1LBCA 1IXCA 4ESWA 2REJA 4QFKA 5ICQA 5I2KA 4F3BA 3PPQA 1JQFA 1MH4A 3ZS6A 2DXRA 3H4ZA 3CFXA 2O1LA 1OVTA 3QUFA 5I2KB 2DE2A 2V3UA 3K0VA 3UP9A 2OCUA 1BTJA 4JDFA 3FXUA 4EXKA 5DEXB 3JYRA 1VE4A 3VXCA 5EHSA 4UACA 4AQ4A 4OYVA 2I4BA 4YU0A 3K4UA 1N7XA 2VHAA 3S9LC 2Z8DA 1DOTA 3MZ9A 2GHAA 3HSTA 3TTKA 5A5XB 3PD9A 4PP0A 1QULA 1M5EA 4C0RA 1BKAA 1JVYA 1AOVA 1JW1A 2KLFA 2XXRA 4F22A 1D3KA 5KZTA 4IY6A 1ZTYA 2E1SA 2G93A 3EN3A 2ZYNA 2F36A 2H98A 1I6AA 3OSRA 4QFLA 5JTYB 2HZLA 4GD5A 3K6XA 2P0SA 1LB9A 1TWYA 4BDRA 3M3FA 4X48A 4U4XA 1P1OA 2XD3A 3BFTA 2O51A 4GVOA 4PFUA 4TLMB 1UQWA 1POY1 2YJPA 3PPRA 2PT1A 4QHQA 3CVGA 4G8NA 4MLVA 3T9VA 3MP1A 1D9VA 1GGGA 4I9DA 1B1XA 3SEYA 1IXIA 1PEBA 2R71A 4G8MA 2DOJA 1LCFA 2OLBA 4ZEDA 1FTOA 2RC7A 3IJXB 3B6TA 3LSLA 1Y3PA 2QL3A 1AMFA 4YMAA 4U1ZA 2Y7PA 4U2RA 2ANJA 3F11A 2QRYA 4XKPA 2ONSA 4H67A 2ZYMA 4DCYA 3LR1A 1EZ9A 4U23A 2F78A 1MDP1 3OELA 1VR5A 4L17A 1WODA 4Q5TA 3RNNA 3HHFA 1B05A 3MQ9A 1LFHA 3FVGA 2F97A 2DWHA 3SESA 3UORA 3PUVE 3N5LA 2F7BA 4HCWA 4HW8A 5BWJA 4KFQA 1FTMA 2HFBA 2P1SA 4OTEA 4WKMA 4BDLA 3CFZA 3Q29A 1MM7A 3EQ1A 1MH3A 4KCCA 2R6GE 4M1VA 1MY2A 1DTGA 3CSGA 2I49A 2V3QA 1FQCA 4EQ9A 2HAUA 1P1NA 3O6GA 1TT1A 1VFDA 1MXZA 3ZSFA 4KPTA 2RF1A 1TFDA 1B4HA 1OQGA 1US4A 5I58A 4ZZAA 3RT6B 4FEBA 1PBPA 2W7YA 3AXFA 3MWBA 3T96B 3SEVA 3TQWA 1FQAA 4EDPA 3KEIA 1MY1A 1OIBA 5TU0A 5I58B 3E3KA 1N76A 3OOAA 3IAZA 1B6HA 2DWJA 4H5GA 1Y4TA 4XKRA 3HCQA 5JEIA 4G2ZA 5I84A 2OWSA 3C35A 1B51A 4RJZA 1BP5A 2I58A 3T22A 3A3UA 4NWDA 4Q30B 1JW4A 1XHYA 3C4MA 4THIA 1FQBA 4EF1A 3MP6A 1DSNA 2DYXA 2R9JA 1Y20A 5BUUA 1P99A 3C32A 3MAMA 4R73A 3T9UA 3TTLA 4JWYA 4E0XA 1M5BA 2VOZA 1A40A 2VD3A 3T9HB 3KGCA 5KDTA 2THIA 3U1OA 1B3LA 3K2DA 1Y3NA 4KI0E 3CI8A 3TAJA 2O69A 5CC2A 5J1DA 4NWCA 2LAOA 3SKPA 4ELOA 3ECRA 5FTHA 3TODA 2B65A 1MQJA 3G3JA 2GRVA 3U8QA 5L9SA 3RY3A 2PBWA 3PPPA 4F19A 3IX1A 3O6HA 3SDFA 4YKPA 4QSDA 3FGSA 2A5TA 4X1BA 4QF9A 4U1OA 2FA7A 4KCDA 2VP1A 3GLBA 4OQOA 1NNFA 2QMXA 1B5IA 2A5TB 2BJJX 3KJ7A 4DCXA 3PU5A 4FAJA 3FASA 5LOMA 4RXLA 3TTRA 3S9MC 2I0BA 4ONYA 4GOTA 4DXCA 3MW0A 3K6WA 2HXWA 5CM6A 3DM0A 3IOWA 5ITPA 1OLCA 1B5HA 1BLFA 3E4RA 5DTBA 4NMYA 5TPAB 3KOSA 2H9BA 1XS5A 4C1TA 4GFRA 3KFMA 4Q0CA 4BDOA 1B3HA 1YCJA 4MBPA 4LVQA 1ZU0A 2XXVA 2XXYA 3KZGA 4GWOA 1Y4CA 2HEUA 3M3LA 1AH5A 4QRZA 1SI0A 3QUJA 4WXJA 3N94A 2ZXTA 2ABHA 4C1UA 3CG3A 1UTHA 2CMOA 4JB7A 3EHSA 1OLAA 2DWAA 4FIMA 1R9LA 4LP2B 1PBQA 4N13A 5I56A 3CIJA 2UVIA 5I2NB 3HV1A 4LZ5A 3IK6B 3RN8A 1B3FA 2QPQA 1Y3QA 2HAVA 2DSFA 1A8FA 5I56B 1R1NA 1NNKA 5H8FA 3MP8A 3UK4A 1MQGA 2REGA 3O2AA 4JWXA 2FYIA 2OJTA 1MXXA 3PV0E 5AA2A 4XIGQ 1SW1A 4ZEIA 3JV9A 4M4GA 5H8QB 2ZNSA 3IB0A 3LSFB 4O3CA 5AA2B 2QMWA 3TYHA 1P1QA 1SW4A 1B40A 3U94A 1EZOA 2AL4A 1B5JA 1SI1A 5FHMA 4FEDA 1SW2A 1IXHA 2XX7A 3USDA 1A7LA 3IOVA 2B3BA 3IO6A 5DEXA 1I6BA 3MPKA 3K00A 3PUYE 4F18A 4H8JA 1SVXB 3CRBA 2H5YA 5A5XA 1EH3A 2GHBA 4QSCA 3PD8A 4NF6B 4RA1A 1QUJA 3S4UA 3V5AA 3SERA 1QKBA 4ZECA 2P2AA 1LAXA 5JTYA 4IO4A 1N7WA 4ZEBA 4G77A 3HPIA 1Z7NE 3E13X 2Q2AA 4XXUA 4X1DA 4EQ7A 2F35A 1IZ1A 1WVJA 1IEJA 1ZKBA 1MQIA 3H7MA 3MJNA 5TP9A 4RYAA 5CMKA 4KR5A 3HHGA 3K6UA 3I5OA 5TP9B 4R72A 1EZPA 5H8NA 1FCKA 3KSJA 3K1NA 5AA2D 5H8NB 4NTLA 3RLFE 1M5FA 4HCYA 3CG1A 3N6TA 2O84X 3M8UA 2GFEA 1B3GA 4POWA 4DLDA 1DPEA 5ISUA 2Y7RA 4PE5B 1FTJA 3C33A 3OO7A 3TTMA 4OMBA 3VLUA 3TMGA 1FTLA 2F7AA 1I69A 1RYOA 4TQUQ 4KQPA 4IO7A 1XT8A 3I3VA 4KYSA 3FV2A 1UIVA 4EQBA 5AA3A 4QFOA 2DVCA 3G3HA 3ILTB 1NNTA 5HM4B 3MBPA 3T66A 2E0SA 5EYFA 4GL8A 1NH7A 4QFNA 4MF3A 1SYIA 3RTWB 4MH5A 4GRKA 4G68C 5FHOA 4DZ1A 1IXGA 4OFOA 4BDMA 2RCBA 3ONMA 3PMWA 1US5A 1MM6A 3BFUA 3EF7A 4OFJA 3BBRA 5EHMA 3A3CA 2Y7KA 4HS7A 1QUKA 3K02A 4H1XA 1IITA 4LQ2A 2RKMA 1MPCA 4NF8B 1N84A 3KG2A 4ECFA 3K1MA 5HPQA 4UA8A 4R6KA 3G3IA 4ZE8A 4G4PA 2AYSA 4R9GA 3H6WA 5H8SA 3T9XB 3KN3A 1XOCA 1ZIUA 4YAHX 4FE8A 4ESXA 2V3TA 4YZZA 5KCJA 3IR1A 5L9OA 5ITOA 2ZNUA 2UVHA 4G68B 1JNFA 5HBCA 2Q89A 1URSA 4U4SA 1P1WA 1H44A 1AIVA 5KCJB 3LBSA 4YB7A 2D5WA 1LAHE 2AL5A 4LQ5A 1RKMA 3TFLA 3S9EA 4F1YA 2F6GA 4F39A 1MG1A 1VFEA 2QS3A 4ZEFA 3PUZE 2ZMBA 1H76A 1FW0A 3TKDA 1H45A 4RNSA 3OMBA 3TEPA 1KWHA 1QKAA 4F29A 1CB6A 1LAGE 3K6VA 3KBRA 4F2QA 3M3KA 1ANFA 1IIWA 3GBAA 2DP8A 2X7PA 3O9PA 1YTVA 1ZJLA 4JXIA 1B32A 1JW5A 3Q26A 3MC2A 1MXVA 1B0HA 4P0IA 4BLAA 3UA8A 4ZZEA 3QYTA 2XXTA 3VLWA 1UIUA 1XVYA 4OVJA 1USYE 3IOTA 4ZS9A 1LB8A 3TDJA 2O7IA 4OERA 1A8EA 3WAFA 1Q35A 4KYDA 1MXWA 1MXUA 1ZBMA 3LSXA 3P7IA 4OWDA 3UIFA 5AA1A 1B58A 1DTZA 4IGRA 3CFLA 2RINA 3GXAA 3C36A 4OENA 5DYHA 5AE4A 1S7YA 4P0GA 2DVZA 4NEDA 2X7QA 3Q25A 4LZ7A 3H3GA 2IA4A 2XX8A 2F34A 4IO3A 1HSEA 3C31A 5F1QA 4IB2A 3B6QA 2IEEA 3TPAA 3W9VA 4ND9A 3SEUA 2Z22A 1SD3A 5TPAA 4WEDA 5JK4A 4DE8A 1A99A 1JVXA 4IO6A 1FQEA 2Y7IA 2F5XA 1A54A 1O64A 3DLNA 3H6UA 3KSXA 1F9BA 1GV8A 1B46A 1A55A 5CRYA 5IKBA 3L6HA 1PB9A 4F3SA 3K01A 1XVXA 2DE4A 3VE1B 3G3FA 2B3FA 2H4IA 1Q1KA 2ONKE 5CBRA 1O7TA 3UGWA 3OSQA 4QSEA 1N3XA 3OD7A 4XKQA 2Z8FA 4WEPA 5I59B 5FHNA 2O1MA 1MXYA 4KYEA 5FTIA 3G3GA 4Z7EA 4MLQA 2XXIA 4YKIA 5I2NA 4POXA 1LFIA 3G7WA 2YLNA 1GR2A 3EHUA 4DIGA 2H25A 3TQLA 1MY0A 3MUQA 3Q28A 1ELJA 1LLSA 3MVXA 3CR9A 1I6QA 1P1UA 2OWTA 3UN6A 2DQVA 4ISUA 1SBPA 5H8QA 1RYXA 1MRPA 4I1DA 2O68A 1NKXA 4YKKA 5I57A 4EXLA 3PGFA 4RPNA 3LC8A 1ZLQA 1URGA 4GL0A 1ATGA 1NL5A 2V25A 5I57B 3Q27A 1IQ7A 1M5DA 2DE3A 1B1HA 4N07A 4YB6A 4F3GA 1FQDA 1R9QA 3MVWA 1MQDA 2I4CA 4LATA 1S50A 2V84A 3C9HA 3W15C 2F6PA 3RGYA 1MPDA 3TCFA 2F8DA 4RK9A 4R9FA 4NF6A 1YPNA 2QS1A 2VGQA 3VVDA 4IY5A 5DT6A 3H03A 4N6PA 1JEVA 3L6GA 2I6EA 4OFLA 4JSDA 3EHTA 4OESA 4OEVA 5H8HA 4YKJA 1WDNA 4AB6A 3VV5A 4AB5A 4DDDA 2UVJA 1L5TA 1MY4A 4OHNA 4H6DA 1T0KA 5H8HB 2RCAA 1B7ZA 1Y1MA 2Z23A 3O97A 4DXUA 1QJMA 4TLLB 5CMCA 1NNPA 2XXWA 3K1PA 1PC3A 3U72A 1IUDA 2WKYA 1J1NA 4FJPA 3PUWE 3W9WA 4PQJA 1TFAA 3FUZA 4LA9A 1VSOA 2XXXA 3I6VA 3EPEA 2UXAA 4FATA 3H06B 3SETA 3B6WA 4F1VA 3LUYA 4G8HA 3FJMA 3QXMA 2NWJA 3OO6A 4X9TA 3KN8A 3IJOB 3OO8A 1O63A 2I3WA 2PYYA 2I3VA 1QW0A 4U21A 5L9MA 4EUOA 2NXOA 2HZKA 1OVBA 3PPOA 3G3KA 4PFWA 3S2VA 3OEKA 1PB7A 3DP8A 3DP6A 2HCAA 3D4CA 1LSTA 1B3EA 4GIZA 3IORA 1PDAA 1MPBA 1LCTA 3U93A 4O3BA 3KN7A 4ZDMA 3FD3A 3DELB 3IL1B 4RY1A 5B70A 2HQ0A 5K2XA 3VVFA 2XD2A 2Q8JA 4IO2A 4R74A 2FNCA 2UYFA 3N6UA 5F7VA 1BIYA 4NF5A 3C34A 4PFYA 1NFTA 3O66A 2UVGA 3U92A 3MVYA 4EF2A 1PB8A 1LGBC 3FXRA 1MQHA 2XHDA 2UYEA 4NF8A 2ONRA 4NF5B 3IO4A 4QFPA 3TZAA 2AIXA 3R7XA 2H99A 4ZE9A 2OZZA 1N0TA 4MFIA 3OEMA 4PFTA 4F3PA 3CSBA 4GXSB 2Q2CA 3B7DA 3RT8A 3ILUB 5ELVA 2QJEA 1B7UA 5K2YA 3VDFA 4ELPA 4LZ8A 3SEWA 2XXHA 3MZ1A 1MS7A 3FXQA 1FQFA 3H6TA 2Y7WA 4G68A 3FJ7A 3JZJA 4OETA 3A09A 1II5A 2A5SA 3IB2A 4R2BA 3FZVA 3PPNA 4DXBA 4H0WA 1DPPA 1CE2A 4GF8A 2XXQA 3T93B 3ZKKA 5DVFA 4OXVA 2NUVA 4NE4A 1N3WA 2QS2A 1SQYA 2PX1A 3O6IA 2DXYA 1B7HA 3FATA 3O28A 3PUXE 4ELQA 4GXAA 3FJGA 2Q9TA 4JBZA 5B7DA 5L8DA 3VFJA 3VXBA 4RPOA 3KOTA 4YICA 3PMXA 3MZBA 5DVJA 1LFGA 2G29A 1NMUA 3DP4A 5ICTA 3ZKLA 4E0WA 4OEUA 3LSWA 4H5FA 4BDNA 5CBSA 5IAIA 3GZGA 3OXNA 1EU8A 1USYH 3TCGA 2DS9A 2Z8EA 3R6UA 4Z0IA 1SYHA 5CMMA 3RTFB 4F2OA 4GLIA 1DMBA 2CZLA 2X26A 2D3IA 1MDQA 4O3AA 1B0LA 3HN0A 1B4ZA 2V93A 3FIRA 5KDTB 4IO5A 5CI5A 1SDXA 3QSLA 3D4GA 3E9XA 2RC8A 1B9JA 2NOOA 4F1UA 1D9YA 1D4NA 1B52A 2PT2A 1TXFA 4GQOA 2ALUA 4JWOA 1QVSA 1AL3A 3N26A 2I0CA 2PMSA 1N04A 4K3FA 4PETA 3THIA 2Q88A 3KJTA 1HSJA 1B2HA 1FTKA 1JETA 4LONB 2ZNTA 4F31B 3TTNA 1H3DA 1XC1A 1YAEA 1HSLA 4R75A 2RC9A 4NF4A 3FVNA 1JEUA 2QS4A 3TUSA 1URDA 1POTA 1MY3A 3MPLA 1QUIA 3V8XB 2M8CA 2OK2A 4RK2A 3H6VA 1SW5A 4NF4B 2OBGA 3MVZA 4JSOA 5I59A 4LUBA 4YB5A 3FV1A 3QIMA 3PMVA 4H65A 3S9NC 4BDQA 3FVOA 4Q8RA 2ZYOA 4I8CA 1Y9UA 3O29A 1LAFE 1OMPA 4I62A 1H43A 3ODBA 4R6YA 2ESNA 1GTKA 3V89B 4ELRA 3SEXA 4IGTA 3HO7A 1M5CA 2NVUB 2O6AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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