3IJOB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, althiazide
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB02
4LUBA 1P1WA 3OEMA 1H44A 2UXAA 3B6TA 3B6QA 1A40A 5I2NB 1DOTA 3U94A 3IO4A 3KZGA 1YCJA 2XXUA 2PMSA 1FQFA 3CR9A 2W7YA 2HZKA 1VE4A 3RPWA 3K1PA 4YMAA 4BDOA 2X7PA 1NH7A 4RNSA 4EDPA 1YAEA 2Q8JA 4Z7EA 3FXRA 2E0SA 5H8HA 4IGRA 2I4BA 1ZLQA 3N6UA 1B5IA 2VOZA 4KPTA 2V93A 4OVJA 2Q89A 3V8XB 2E1SA 1NL5A 3SERA 3K6XA 1M5BA 4F1VA 1SVXB 3K2DA 2GHBA 1Q35A 4GLIA 3I5OA 3FASA 5DEXA 4WEPA 3UGWA 3VLWA 2VD3A 1IXCA 3OEKA 2PT1A 1GGGA 4TQUQ 1OIBA 4DDDA 4DIGA 2ZNSA 1PDAA 4ELQA 2RC8A 2OZZA 5H8FB 3CSGA 4JSDA 3QAXA 1OVBA 2KLFA 5J1DA 4YB5A 1MDQA 3H6UA 3KOTA 4EQBA 4KD5A 3TTMA 4DXCA 3O28A 2M8CA 3RUMA 3CIJA 1WVJA 3JZJA 4H0WA 1NFTA 4EUOA 3K0VA 4U1OA 1Y20A 1NKXA 3PGFA 1M5EA 1MXWA 2H5YA 3FGSA 1JW1A 2UVJA 1IZ1A 3KOSA 5TU0A 3IR1A 3V89B 1B40A 1EZOA 1SW2A 3FJGA 2AYSA 4LA9A 1Y1ZA 3E13X 3H4ZA 3W15C 4NE4A 3EQ1A 3Q29A 3R6UA 4NF6B 4ZEDA 4I62A 5I57A 1I6AA 4G68C 2ZYMA 5IKBA 4H65A 3EN3A 3IOWA 4ELPA 3F11A 1OVTA 2OLBA 4IO6A 1P1NA 1SD3A 4KYEA 5H8QA 1UTBB 3L6GA 1H3DA 3QIMA 3VLUA 3N26A 4QSDA 1QUIA 2F7BA 3KFMA 3QYTA 3BFTA 4NF8B 1MXUA 3C32A 4ECFA 2F8DA 1FTLA 2HXWA 4N6PA 3I6VA 3MQ9A 2I0BA 3V83A 4OWDA 3K6VA 1Y4CA 4F19A 3O6HA 4F39A 1B6HA 2GFEA 2A5TA 3HN0A 4U1ZA 1H45A 3LSLA 2QS3A 2XXXA 1LGBC 3THIA 2Y7RA 1D9VA 3W9VA 3CRBA 1MY1A 3G3IA 5AA4B 2H9BA 2ESNA 1MS7A 4MFIA 4ZZEA 1A8FA 2DE2A 3H3GA 4H5GA 3T96B 5I59B 5CBSA 5AA1A 3ODBA 4RK9A 3O9PA 1SW4A 1MXXA 3OSQA 3O97A 2FYIA 3OO6A 1BTJA 1JETA 1A54A 3RTWB 2AL5A 4ZDMA 1B1XA 1HSLA 2GHAA 3OO7A 1KWHA 3FV1A 2F7AA 1MH4A 2ZMBA 3P7IA 4I8CA 3MW0A 5FHMA 1O64A 2FNCA 5I58A 2DE4A 2Z8EA 4ZE8A 5BWJA 1AIVA 2QL3A 3AXFA 4UACA 3QUFA 3MJNA 5H8HB 4GOTA 3RT8A 4POXA 1GVCA 2B3BA 3TODA 3G3JA 2ONSA 2DWIA 4OFOA 3D4CA 2REJA 1ZBMA 1URDA 4H8JA 1LB9A 3WAFA 1OMPA 4G77A 1Y3PA 1EH3A 4GF8A 5CC2A 2XXWA 1LFHA 4U23A 5HPQA 2F34A 4GXSB 2WKYA 2DXRA 5DEXB 1J1NA 2O7UA 2XXYA 4LONB 4R2BA 1QUKA 1FQEA 3MVXA 4OEVA 4YKIA 2G93A 3SEWA 2Z23A 4KI0E 1FCKA 4PFYA 1PB9A 4G68A 3Q26A 3H06B 1B2HA 3VVEA 4PE5B 4IO3A 4WEDA 3PUYE 1LBBA 2HCAA 2F6GA 4OMBA 1SQYA 3GXAA 1XC1A 1WODA 1B58A 4LZ8A 1NNTA 2XXHA 3PD8A 2V3QA 3MVYA 5ITPA 4Z0IA 3T22A 1SW1A 3RY3A 3OO8A 1ZKBA 4IO5A 3UK4A 1JVYA 1B5JA 4R6HA 1GR2A 5L9MA 3SEVA 2XXTA 3C33A 1B7UA 1VR5A 1NNFA 3S4UA 2PYYA 4GRKA 1MQIA 4NEDA 1PB7A 3CG1A 4LZ7A 3S2VA 3KJ7A 1XOCA 4AB5A 5JTYB 5I57B 3UP9A 4QFNA 3GLBA 1S50A 3MPLA 2OWTA 4IY6A 3TTLA 5CM6A 1B51A 1N3WA 3UORA 3RN8A 3B6WA 3PU5A 1NMUA 4GWOA 3S9NC 1DMBA 4FE8A 1Y3QA 4RYAA 3V5AA 1N7WA 1DPEA 4OQOA 3TTNA 2UVGA 3VVDA 2DXYA 2X7QA 3H6TA 1I6BA 5TPAA 3CG3A 2F5XA 2VP1A 2O84X 4OENA 4RPOA 4ELRA 4JXIA 3RT6B 3TCGA 2ZNUA 2ANJA 4LATA 3M8UA 4G8MA 3O29A 3H03A 4P11A 4GXAA 2DYXA 1MXYA 1LFIA 4U4SA 5I59A 3E9XA 3Q27A 2DVCA 1XVYA 2O1MA 4ZEBA 1B46A 1D9YA 1ATGA 1US5A 4BDQA 4POWA 4JWYA 3TTRA 4DE8A 3N6TA 1POY1 2DS9A 3A3CA 3UN6A 2OJTA 1B1HA 4PFWA 4HW8A 4KR5A 1Q1KA 4JDFA 3K6UA 1R9LA 3QSLA 3U92A 2OWSA 4R9FA 3LUYA 2HZLA 3TELA 2IEEA 1A7LA 3D4GA 2ONKE 1B3LA 1QJMA 5L8DA 3PMVA 5I58B 4QFOA 3M3FA 2PBWA 3SEXA 4FAJA 3A3UA 2VGQA 5AE4A 3DP6A 2DOJA 5HBCA 1CB6A 1GTKA 4OFLA 1LAXA 1EZ9A 3KJTA 1EU8A 3TYHA 4G8HA 5JK4A 1LSTA 3OO9A 1QVSA 3FATA 1DTGA 3T9XB 1B3FA 4F1UA 2RCAA 4R73A 4ZS9A 1TFAA 2CMOA 3MPKA 3RNNA 3VFJA 3VXBA 4MBPA 4QF9A 3MVWA 4RY1A 3MZBA 3KN8A 2REGA 4QFLA 3T9UA 1FTMA 1MQGA 2NUVA 4F22A 1O7TA 2F35A 1Y1MA 4G68B 4RJZA 4AQ4A 1P1QA 2DE3A 5FHOA 3MC2A 5JEIA 1FTKA 1LCTA 1B3GA 4IB2A 4E0XA 4GIZA 3DLNA 5IAIA 1JW5A 3MBPA 3PV0E 2H98A 5I2KA 1MXZA 4YB7A 4G4PA 3MZ9A 2I48A 2AIXA 4F2OA 2RKMA 4RPNA 2Y84A 3PMXA 3RGYA 1YTVA 4X1DA 4JSOA 4ZECA 4YICA 5CMMA 1LAGE 5JTYA 1QKAA 4P0IA 2DQVA 3DELB 3G7WA 1IITA 2V84A 5ICTA 3C9HA 1JVXA 1B0HA 4F2QA 3KSXA 1T0KA 4QSEA 3DM0A 2ALUA 1IXGA 3KEIA 1XT8A 1TT1A 4P0GA 5I84A 2I49A 1N76A 2Q2CA 1PBPA 1GV8A 4R6KA 1MQJA 2P0SA 4MH5A 1H43A 1TWYA 1I69A 2F6PA 2LAOA 1FTJA 2ZYNA 2F7CA 1PBQA 4BLAA 3TTKA 4C0RA 1Y3NA 5FTIA 3IX1A 3C34A 4TLMB 5B70A 3BBRA 5TPAB 3HHGA 4DCYA 4EQ7A 3U8QA 3HV1A 3C31A 4R6YA 2XX9A 4R74A 3SETA 4DXBA 2O69A 1B9JA 3ZS6A 3TCHA 2H4IA 5M2VA 1S9TA 1DTZA 3KGCA 3UA8A 1IXIA 3GBBA 1USYH 2Q2AA 2XD3A 4YKKA 3IJOB 3A09A 1ZIUA 3FXUA 1SI0A 2D5WA 2OCUA 4PFTA 3E4RA 3FV2A 3T9VA 4U4XA 4ZEKA 1MY2A 4R75A 1FQAA 4RK2A 2ONRA 4O3BA 3PUZE 4BDNA 4OERA 2R71A 3TPAA 1ZJLA 1LAFE 1A99A 2XXRA 3U93A 2XXIA 4HCWA 1AOVA 1LCFA 4GL0A 1B52A 2OBGA 2Z8DA 3Q25A 4U21A 3MP1A 5AA3A 5KCJA 3TUSA 3O6GA 1SYHA 3K4UA 4R2FA 4EXKA 3PUWE 4H5FA 4PP0A 4JBZA 4ELOA 3ECRA 4JWXA 2O68A 1SI1A 4RXLA 4OFJA 1JEUA 2IA4A 4NF5B 1MG1A 3DP4A 1M5FA 4N13A 5ISUA 4ND9A 5DTBA 3U1OA 4YMBA 1BLFA 3OELA 4HS7A 1FQCA 3EHUA 1B3HA 3CVGA 1MPBA 3C36A 3K00A 4Q0CA 3PPNA 3UIFA 2F78A 4YKJA 3IOVA 2VHAA 3TCFA 5H8NA 2YPNA 3TMGA 5KDTB 3LSWA 3SESA 1B32A 3MP6A 3KG2A 5EHSA 3OD7A 1QULA 3OSRA 4Q30B 4LQ2A 3QXMA 2VD2A 2I3VA 1B0LA 4XKNA 3PD9A 2O6AA 3IK6B 1URGA 5FHNA 4ZEFA 4GVOA 1P1OA 1ANFA 2XX8A 5LOMA 1S7YA 4C1TA 1SW5A 5I2KB 4IGTA 1MM6A 1N04A 2ZYOA 4FECA 4G8NA 3MUQA 3KBRA 4KHZE 3ZKLA 1JQFA 2RC7A 4U2RA 2HQ0A 3T9HB 4X1BA 4MF3A 3PPRA 3R26A 5EHMA 2I4CA 4F3PA 1IEJA 4IO4A 1FW0A 2O51A 1VSOA 3FJMA 2GRVA 1URSA 3O6IA 3OMBA 1PEBA 2Z8FA 4HTGA 1VFEA 2QS4A 5A5XA 3W9WA 3S9EA 1R9QA 3EHTA 3GBAA 1AMFA 1JW4A 5I56A 1MY3A 4M1VA 3EF7A 4K3FA 1IIWA 4G2ZA 3LSFB 3N94A 3PUVE 5TP9A 3SEUA 2DWAA 4GFRA 4O3AA 5DVFA 1B4ZA 2DWHA 3KSJA 2NOOA 2HEUA 1N7XA 2F36A 1O63A 3VDFA 2X26A 1ZU0A 3JYRA 2H25A 2PVUA 4EQ9A 4YZZA 3TQLA 3QK6A 4F3GA 4ZZAA 3B7DA 4GL8A 1D4NA 1H76A 1PB8A 3CFZA 2A5SA 5L9OA 5CRYA 3S9MC 4YU0A 3FZVA 4QFPA 4HCYA 1QW0A 1YPNA 5K2YA 5DVJA 1B5HA 4NF4A 5CMKA 3K1NA 4AB6A 2PT2A 1OLAA 4Q5TA 3CSBA 2HFBA 4WKMA 3T93B 3U72A 3FVNA 3IOTA 2XD2A 3TEPA 3DP8A 3HSTA 2V25A 3VV5A 5HM4B 5H8SA 5KCJB 3GZGA 2ZYKA 2NWJA 3LR1A 4NF5A 4ZEIA 2D21A 2ZNTA 3TZAA 3K01A 4JB7A 1Z7ME 4U22A 4DZ1A 2QS2A 3CI8A 2RCBA 4F3SA 4OZ9A 2FA7A 3FD3A 1D3KA 3PPOA 5DT6A 1AL3A 2QMXA 3H6WA 4O3CA 4FATA 5DVIA 1RYXA 4IY5A 5KDTA 3CFXA 2I0CA 4OETA 3ILUB 4H67A 4H8IA 5AA2A 2UVIA 3C35A 2R9JA 4ISUA 1US4A 5F7VA 4KFQA 4H1XA 2Y7KA 5H8NB 3G3GA 5L9SA 1A8EA 3IB2A 4JWOA 3RTFB 2ZXTA 3G3FA 1DPPA 1MXVA 3ZSFA 4XTCQ 2O1LA 3I3VA 4GD5A 1JEVA 4PFUA 1RKMA 3BKIB 1Z7NE 4NWDA 1MRPA 4YB6A 4DXUA 1BIYA 1F9BA 1MY4A 3K6WA 4X9TA 2QMWA 1P99A 2RF1A 1UIUA 4OYVA 1WDNA 2I58A 3IOUA 4F1YA 1LB8A 4R9GA 5CI5A 2V3TA 3TKDA 2XX7A 5CBRA 3ZKKA 1I6QA 1IUDA 5FTHA 4OEUA 2RINA 3IJXB 3VVFA 1UQWA 2V3UA 3LBSA 3SEYA 3C4MA 4RA1A 3HPIA 1B05A 1B3EA 4BDLA 3S9LC 1N84A 1XHYA 4F18A 5BUUA 3LC8A 4ZE9A 3MZ1A 2B3FA 5A5XB 1MDP1 1B4HA 3PUXE 1TXFA 3G3HA 4XXUA 5I56B 2DSFA 4KCCA 3TFLA 4KYDA 3FVOA 4OHNA 3SKPA 1UTHA 2QS1A 1ELJA 5TP9B 4F3BA 5CMBA 4Q8RA 4QRZA 4UA8A 5CMCA 4KQPA 1II5A 2QRYA 1MPCA 2QJEA 3M3LA 1DSNA 3TAJA 1MQHA 4GQOA 3ILTB 4LZ5A 3H6VA 2NXOA 1FQDA 3T66A 2HAUA 3FIRA 4IO7A 5I2NA 1N0TA 2CZLA 2DVZA 2P1SA 3QUJA 1EZPA 2AL4A 4NTLA 1MH3A 3HO7A 1NNPA 1NNKA 1AH5A 1MY0A 1FTOA 4EF1A 3IL1B 4FEBA 1M5CA 4OXVA 2XXQA 4I1DA 4XKPA 2H99A 4ESXA 1LLSA 1LAHE 1M5DA 4FEDA 4FORA 4NF4B 2DP8A 4WXJA 4BDRA 3FXQA 1JNFA 3E3KA 3M3KA 1POTA 4L17A 3IO6A 4NMYA 1SYIA 1B7ZA 4F29A 4TOZA 1OLCA 4XKRA 4X48A 2QSXA 3Q28A 2Z22A 3CFLA 2B65A 2DWJA 1QUJA 2BJJX 3K02A 3BFUA 1R1NA 5AA2D 4I9DA 3L6HA 1BKAA 1TFDA 4PQJA 5EYFA 4N07A 1FQBA 1R6ZA 2QPQA 3IAZA 2Y7WA 3IB0A 5H8FA 1P1UA 5ITOA 1MQDA 4LVQA 2Y7PA 1N3XA 3PPPA 4FIMA 1A55A 1MM7A 2Q88A 1ZTYA 5ELVA 2PX1A 1OQGA 4E0WA 3G3KA 4BDMA 4TLLB 3KN7A 5ICQA 2THIA 4MLQA 5AA2B 3OOAA 3TQWA 3JV9A 1OQHA 4QSCA 1UIVA 1XS5A 4ESWA 1HSJA 3FVGA 2R6GE 2D3IA 2GH9A 1CE2A 3RLFE 3FVKA 4DCXA 3N5LA 3VE1B 2XXVA 3LSXA 4KCDA 4R72A 3O2AA 1SDXA 4OTEA 2OK2A 2I3WA 3HHFA 2Y7IA 5B7DA 4YKPA 2YJPA 3USDA 3VXCA 4KYSA 3MAMA 3MWBA 3MVZA 4OESA 4NF6A 3TDJA 4M4GA 3KN3A 3PMWA 4FJPA 2P2AA 3EPEA 5DYHA 1SBPA 3FJ7A 3MP8A 3IORA 1UTBA 2ABHA 4THIA 1VFDA 2XHDA 5K2XA 2Q9TA 4DLDA 1QKBA 2UVHA 4EF2A 2I6EA 3O66A 3IB1A 5F1QA 3OXNA 5KZTA 4QFKA 4LP2B 5H8QB 4ONYA 2UYEA 1HSEA 4F31B 3K1MA 4EXLA 3PPQA 1USYE 1PC3A 4NF8A 2HAVA 3OENA 1ZMGA 4NWCA 3H7MA 4XIGQ 3HCQA 2UYFA 2G29A 3R7XA 1NH8A 3WAEA 3SDFA 1LFGA 4QHQA 2XXPA 1B7HA 2NVUB 1IXHA 4IO2A 3RQTA 1Y4TA 1BP5A 4XKQA 3ONMA 4LQ5A 1L5TA 4H6DA 1MPDA 4MLVA 5AA4A 1UTHB 3VLVA 1XVXA 2F97A 2YLNA 2A5TB 1LBCA 1IQ7A 2RC9A 4PETA 3FUZA 1Y9UA 4YAHX 1RYOA 4C1UA 2O7IA 3EHSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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