3IL1B

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, idra-21
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3il1B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3il1B02
2ZMBA 4NF4A 4GD5A 4LZ5A 1HSEA 3ZS6A 1EU8A 3VLWA 3R7XA 5A5XB 2DWHA 2XX9A 3RT6B 4QSCA 1B7UA 2V3QA 5FHMA 2UYFA 4DXBA 1SW2A 3FVKA 5DYHA 4LQ5A 1MQHA 3IL1B 3E3KA 5HM4B 3LR1A 4NF4B 4OFOA 1Q35A 1OLCA 4G8HA 4POWA 3IB2A 2W7YA 3CG3A 3IB0A 2DWAA 5ICTA 2G93A 4NF8A 3V83A 4LZ8A 2RF1A 1Y3QA 2Z8EA 4U1ZA 2F35A 2O7UA 1B4ZA 2F6GA 2RC7A 1VSOA 4YU0A 3C36A 3O28A 4G68A 3PD9A 1QJMA 3FATA 2FYIA 3ILTB 2QS3A 1IXHA 4OWDA 4NF8B 2IA4A 5EHMA 4OYVA 4R2BA 1P1QA 3MZBA 1M5FA 3PUXE 1AL3A 5FTIA 3UK4A 2B3BA 1M5EA 3KN8A 3MVYA 1OIBA 3T96B 4GL0A 4DCYA 3TZAA 3PPOA 4G68B 4I9DA 2I0CA 1MPBA 1Y4CA 2DWJA 2HFBA 2F78A 5CI5A 4H0WA 2XHDA 1P1UA 1MH3A 3OMBA 1ELJA 3VLVA 1TFAA 3E13X 4N13A 4O3BA 4WXJA 2DE3A 1I69A 1UIVA 2IEEA 4XXUA 1PB7A 4U1OA 3RNNA 4ZDMA 1VFEA 2I48A 3DP4A 1DTZA 2X26A 3C31A 2E0SA 4H5GA 2Z8DA 4H6DA 1B1HA 1UTBA 1B3HA 3RN8A 4KYEA 3FVGA 1VR5A 3P7IA 2Z22A 3PUYE 2P0SA 1SI0A 4OQOA 3JZJA 4IO7A 2OJTA 3S9LC 3MJNA 3DELB 3K1PA 1B52A 1UTBB 1QULA 3C35A 3CI8A 3SEYA 2NWJA 4DCXA 4U21A 4KR5A 3KGCA 1FQDA 2YLNA 2OWTA 3KOTA 4EUOA 1IXGA 2R6GE 4LUBA 3SEWA 3FGSA 1NNTA 3K6XA 4GVOA 1JVYA 5AA4A 1B9JA 1N04A 3FASA 4EQ9A 3BFTA 3PV0E 5K2XA 2QRYA 4UA8A 4QFLA 4OMBA 1B7HA 2RINA 3QIMA 3QSLA 4F3PA 1ATGA 4C1UA 4XIGQ 1B5IA 5AA4B 1Y3NA 1B1XA 3K00A 1NFTA 2REJA 1H45A 3K02A 3RPWA 2H25A 1XVXA 4R2FA 5F1QA 5CBRA 1A55A 2ABHA 4EDPA 1IITA 1N7WA 4PE5B 5TU0A 2GHBA 1PBPA 5JTYA 4GWOA 4PP0A 1P1WA 5ELVA 2RCBA 2DE4A 2HCAA 5KDTA 3W15C 1JVXA 4ZEFA 3WAFA 2YJPA 4R9GA 4O3AA 3OD7A 5BUUA 3FXUA 2V84A 1WDNA 4FORA 3SERA 4YMAA 3G3FA 5JTYB 4QF9A 1FQAA 4KCCA 1H3DA 1IIWA 4MBPA 1UQWA 3B6WA 4TOZA 4JSOA 2XXYA 1B58A 1RKMA 1YAEA 4YB6A 5KDTB 1LB8A 1NH8A 1LBBA 3K01A 3VDFA 1B3EA 4U2RA 3LSFB 5IKBA 1FQEA 2QMWA 3OEMA 4OTEA 4YKJA 4RK9A 2PX1A 2ZYOA 1FQBA 1ANFA 5I2NA 3FXQA 2Q2CA 2OZZA 2ZYKA 5CMMA 4LQ2A 2P1SA 3KEIA 4C1TA 3IO4A 1H44A 2I58A 1O7TA 1ZJLA 3SETA 3U8QA 3S9MC 3O2AA 4QFOA 3PPRA 1A7LA 3FUZA 4GLIA 3RT8A 2O1MA 3TCHA 4KI0E 3LC8A 5B7DA 5I2NB 3TTLA 5EYFA 3DM0A 1MDQA 4XTCQ 1AOVA 4F2OA 2UVIA 4MH5A 1FTJA 3SEUA 2AL5A 1ZMGA 3GLBA 2OLBA 3MZ1A 3T9XB 3FZVA 1MPDA 3MC2A 2PBWA 1H76A 2B65A 1MQJA 1ZIUA 1TWYA 4FATA 1Y4TA 1JW1A 2PVUA 1JETA 3PPQA 3I5OA 3RGYA 1S9TA 1LLSA 1B05A 3S4UA 3O6HA 1JW4A 4X1DA 4E0WA 3TDJA 3PU5A 4JWXA 5I2KA 3IOUA 4EQ7A 1YPNA 1QUJA 3EF7A 3TELA 4AB6A 3TTRA 3USDA 4RY1A 5I84A 1SW1A 3LBSA 1POTA 1QUKA 1MXVA 3OO9A 3BKIB 3OELA 4HW8A 5J1DA 3HHGA 1MDP1 4EQBA 3ODBA 3OSRA 4ZEIA 1SW5A 5I2KB 1BTJA 3FVNA 1FW0A 5H8SA 4U4SA 3HPIA 4BDOA 3Q27A 5AA2A 1VFDA 2NXOA 1URDA 3VVDA 5I59A 5EHSA 1OQHA 3V8XB 4ELQA 2Q9TA 3C9HA 2NOOA 4BDRA 2QMXA 3K1MA 4Z7EA 3H7MA 3SDFA 3OO7A 3Q26A 4DIGA 1CE2A 5AA2B 2XXXA 1NNFA 5FTHA 3WAEA 5I59B 3O97A 3OO8A 4BDMA 3M3FA 4NE4A 4KCDA 1DTGA 4XKPA 1I6QA 4JWOA 5F7VA 1URGA 2KLFA 4Q0CA 5H8QA 4NTLA 4BDLA 4EF1A 4THIA 4HCYA 4OXVA 4DXUA 1LAHE 3BBRA 3U94A 4X1BA 1FQCA 4FE8A 4F3BA 2XX8A 3MVWA 4LATA 3HHFA 2O7IA 5KZTA 1HSJA 3PUWE 4HS7A 4PFUA 1ZKBA 3GBAA 2Y84A 4R72A 5H8QB 1MY4A 4NF5A 1IQ7A 2QJEA 1A99A 3EHUA 4ZE8A 2PT1A 2HAUA 1SD3A 1POY1 2I49A 3E4RA 1A40A 4YKIA 2DWIA 2OWSA 2GHAA 5AA1A 3CFLA 1D9YA 4PFWA 2I4CA 3R26A 5I58A 4NF5B 4M4GA 4MLVA 3T9VA 4YICA 4JSDA 3S9EA 3G7WA 4OZ9A 1EZ9A 1FTKA 3N6TA 4OENA 4OFJA 3QXMA 3MWBA 3B6QA 1SYIA 4WEPA 2O69A 5CC2A 2UYEA 3UP9A 1QKBA 4IO4A 5B70A 5I58B 4F39A 5DVJA 4G8MA 3C32A 1AMFA 1LCTA 5FHNA 3EN3A 3MP1A 3DLNA 2H5YA 3MUQA 1MG1A 4MLQA 1Y1ZA 1II5A 4ZS9A 4ISUA 1ZTYA 4F19A 2DXYA 3RTFB 4FAJA 1LB9A 3GXAA 4G77A 1PB9A 4DXCA 1NH7A 2F97A 4LVQA 3U93A 3K6VA 1FTLA 3HCQA 1EZPA 3FV1A 2CZLA 4YKKA 5DVIA 1B3FA 4I1DA 3SKPA 5JEIA 1Y9UA 3Q28A 1LFIA 1LAGE 4AB5A 4JWYA 1MY3A 4F31B 1QW0A 1B4HA 3FXRA 1BIYA 2HXWA 3O66A 2XD3A 1DOTA 3FV2A 4Z0IA 1LAXA 2QPQA 3DP8A 4RXLA 2ZNTA 3IB1A 2ONKE 4Q8RA 1M5CA 3VVFA 2G29A 4XKNA 4PQJA 4QHQA 3THIA 3W9VA 3TQLA 4FECA 4H1XA 4TLMB 3IJOB 4XKRA 4OVJA 3HN0A 5M2VA 3N5LA 3EPEA 1F9BA 2Q89A 3QK6A 1B51A 4I8CA 1LFHA 3G3HA 2DVZA 2QS1A 3D4CA 3VVEA 1XOCA 2O84X 3EHSA 4GRKA 3A09A 3HSTA 3R6UA 2QS4A 4YKPA 3K4UA 1B2HA 1MS7A 1MRPA 3PUZE 5FHOA 5ITPA 1MM7A 4OETA 3OSQA 1AH5A 1UIUA 1JNFA 3U92A 5AA2D 3OXNA 1SW4A 1MQDA 5LOMA 4JDFA 2XXUA 2O6AA 4K3FA 2XD2A 4GQOA 5AA3A 3PD8A 1TXFA 2GRVA 4OESA 1MXYA 2H4IA 3UGWA 5L9SA 4R74A 4KD5A 4X9TA 3RY3A 4RYAA 3CR9A 4OERA 4NWCA 3SEVA 3RQTA 4GXAA 1PEBA 3MQ9A 1DSNA 2AL4A 4P11A 4ZZAA 4G4PA 1TFDA 5TPAA 3EQ1A 1R6ZA 4NMYA 2ZNUA 3TMGA 3IX1A 4PFYA 5CBSA 1XC1A 1XS5A 3CRBA 1Y3PA 2HEUA 1NMUA 5I57A 4M1VA 3L6HA 1B5HA 1MPCA 4GFRA 4IGRA 2V3UA 3QUJA 4IO5A 1WODA 3G3GA 2A5TA 1B46A 5TPAB 3H06B 3PMXA 3H6WA 1SVXB 2HAVA 5BWJA 3TTMA 3B6TA 5DEXA 5H8HA 3KSJA 3KOSA 2XXRA 2R9JA 3V89B 5DTBA 3IOTA 5ITOA 5I57B 1SQYA 3KBRA 1LSTA 2B3FA 3MPLA 1PDAA 2ZXTA 4ECFA 3TCFA 1P99A 2A5TB 1UTHA 3MP6A 4G68C 4KPTA 2DVCA 3VFJA 4QSDA 1YTVA 3LUYA 1BKAA 3G3IA 5DEXB 5H8HB 1N0TA 1A8EA 2VGQA 2GFEA 3TKDA 4QRZA 2I3WA 1SDXA 2HZLA 1AIVA 4L17A 1EH3A 2V3TA 3H03A 1T0KA 5CM6A 1R1NA 2VD2A 1UTHB 1QKAA 2VOZA 3VLUA 3A3CA 3K6UA 4RNSA 1MQGA 3KJTA 1VE4A 5I56A 4F29A 3N6UA 1DMBA 1QVSA 2Z8FA 2P2AA 3AXFA 1MXWA 1DPEA 2O51A 2ANJA 3PMWA 3K2DA 3I3VA 1IZ1A 1S50A 3FJ7A 1B7ZA 1CB6A 2DXRA 4JB7A 3K0VA 4XKQA 3PGFA 1M5BA 1PB8A 5K2YA 4IGTA 1IXIA 4DDDA 4IY5A 5I56B 3S2VA 5L9OA 4UACA 4ESWA 1Z7NE 3UIFA 5JK4A 3RUMA 1GVCA 4FIMA 3B7DA 3VE1B 2E1SA 2Y7IA 3IORA 3SESA 2Y7RA 4F1UA 1N76A 3O9PA 5CMCA 4R75A 3HV1A 1FQFA 3QAXA 2YPNA 4IO6A 3T9HB 1B3LA 1JEVA 4U22A 2QS2A 3O29A 2I0BA 1N7XA 3LSWA 1ZU0A 2D3IA 3ONMA 2ONSA 3KFMA 1MM6A 3TPAA 2UVJA 2H98A 3UORA 1O64A 4ELPA 4NF6A 4F1VA 4Q5TA 3F11A 1OQGA 2V93A 1WVJA 5TP9A 5HBCA 2ALUA 2GH9A 2DQVA 2I6EA 1SYHA 2XXQA 2HQ0A 1XT8A 4WKMA 3QUFA 3HO7A 1LAFE 4Q30B 4YB5A 3IO6A 4NF6B 3U72A 3G3JA 5CRYA 3M8UA 1P1OA 2F6PA 2H99A 5TP9B 3FJGA 2RC9A 4MFIA 1Y20A 4YAHX 2I3VA 4C0RA 3UA8A 3D4GA 2Y7WA 3GZGA 1OVBA 3TFLA 5H8FA 1FTMA 4NWDA 3C4MA 1FCKA 1GGGA 4HTGA 1PBQA 2F7AA 1MY0A 1URSA 2PT2A 4AQ4A 4QSEA 1YCJA 1LCFA 1RYOA 2VD3A 1USYE 2PYYA 2Q88A 2AIXA 4IO2A 4H5FA 3TTNA 4F2QA 4YMBA 2X7QA 4ZEKA 3O6GA 2XXTA 2A5SA 3TODA 2BJJX 5H8FB 2NUVA 3OEKA 1TT1A 1ZLQA 4BDQA 1GV8A 3JYRA 4KHZE 1BLFA 1JEUA 3QYTA 3CSGA 1JQFA 4F3SA 4RA1A 1I6BA 3O6IA 5CMBA 1MY2A 3VXBA 4EXKA 3PPPA 4R6HA 4DZ1A 1IEJA 2F36A 3LSLA 4U23A 4RPNA 1N84A 4DLDA 4H65A 1MXZA 2UVHA 3ZKKA 2D5WA 3C33A 4GXSB 4ELOA 4QFPA 1FTOA 2NVUB 4PETA 5L8DA 1D9VA 3TEPA 1D3KA 4RPOA 2O1LA 2THIA 4KYSA 3M3KA 4ZZEA 4BDNA 2F5XA 2XX7A 3PMVA 3MZ9A 4EXLA 3S9NC 1MXUA 4DE8A 3N94A 1NL5A 4YB7A 2Y7KA 2F34A 2I4BA 3TQWA 3ZKLA 4P0IA 1Z7ME 4FJPA 2DYXA 1GTKA 3LSXA 3KJ7A 3PUVE 3ZSFA 4GL8A 4YZZA 3OENA 4ND9A 3VXCA 3MP8A 4H8IA 1PC3A 3IAZA 4LONB 3FVOA 1IXCA 1MH4A 3H6TA 2ONRA 3RTWB 3IR1A 4FEDA 4LZ7A 1B6HA 1I6AA 4R73A 3MW0A 1OVTA 4F1YA 1B32A 3OOAA 2DP8A 3T66A 2Y7PA 2XXPA 3KN3A 3T22A 3MVZA 5DVFA 3H6UA 3GBBA 3N26A 3CFXA 1D4NA 1KWHA 4QFNA 5CMKA 1BP5A 5DT6A 3CSBA 3VV5A 3T93B 4TQUQ 2XXIA 2RKMA 4O3CA 1HSLA 3KZGA 3JV9A 2DOJA 4R6YA 3CIJA 3TAJA 3Q25A 2D21A 4JBZA 1S7YA 5HPQA 4BLAA 1NNPA 2Z23A 3K1NA 1LBCA 3KG2A 1DPPA 1RYXA 2XXWA 2O68A 1B5JA 4LA9A 1O63A 1L5TA 2FNCA 1LGBC 3TUSA 3EHTA 1J1NA 3PPNA 4HCWA 3FIRA 3MAMA 2QSXA 3MBPA 3Q29A 4WEDA 4OFLA 2Q2AA 1MQIA 4OHNA 3IK6B 1N3XA 1OLAA 4FEBA 1ZBMA 3KSXA 4NEDA 1N3WA 2RCAA 4LP2B 3FJMA 3I6VA 1B0HA 1XHYA 1M5DA 3ECRA 5KCJA 1OMPA 1US4A 2XXHA 4X48A 3H6VA 3IJXB 4F22A 1H43A 1P1NA 4N6PA 1R9LA 4IY6A 2Q8JA 2OBGA 3IOWA 3V5AA 4OEUA 2ESNA 4R6KA 1US5A 2RC8A 3K6WA 4EF2A 3M3LA 3CG1A 4PFTA 2HZKA 2OCUA 5KCJB 5IAIA 1MXXA 1XVYA 1Y1MA 2DSFA 2V25A 3H4ZA 2UXAA 4F18A 3TYHA 1NKXA 2AYSA 4H8JA 3RLFE 3TTKA 4P0GA 3MPKA 4GIZA 2OK2A 2DS9A 4RJZA 3CFZA 1SI1A 3G3KA 4G2ZA 2QL3A 4TLLB 3C34A 3UN6A 3CVGA 2LAOA 4IO3A 4ESXA 3BFUA 2F7CA 2PMSA 4ZEDA 3ILUB 3SEXA 2CMOA 4QFKA 1B40A 4JXIA 3FD3A 3OO6A 1A8FA 3L6GA 2VP1A 1GR2A 2XXVA 4G8NA 1B0LA 5ISUA 3MVXA 2REGA 5H8NA 4N07A 4GOTA 3KN7A 2VHAA 1SBPA 5L9MA 1Q1KA 2ZNSA 5AE4A 1MY1A 1A54A 2H9BA 3H3GA 3A3UA 4GF8A 4IB2A 1LFGA 1JW5A 2R71A 5H8NB 1QUIA 1EZOA 2ZYNA 3U1OA 2X7PA 3W9WA 1B3GA 2F8DA 4OEVA 4H67A 1IUDA 4POXA 4ONYA 4F3GA 3T9UA 4KQPA 1USYH 1NNKA 4I62A 3IOVA 4E0XA 1R9QA 4RK2A 5ICQA 2WKYA 4ELRA 4R9FA 4KYDA 4ZEBA 2FA7A 2UVGA 3DP6A 5A5XA 2F7BA 3TCGA 2M8CA 4ZE9A 3E9XA 2DE2A 4MF3A 4U4XA 4ZECA 4KFQA 2ZYMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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