3ILTB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, trichlormethiazide
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 89
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iltB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iltB02
2Q89A 2Z22A 2ONSA 2NWJA 3RUMA 3CFLA 4XTCQ 4ZEFA 3JV9A 1AH5A 3SDFA 1FQAA 2P1SA 4F3BA 1TWYA 4Q30B 4R73A 3G7WA 1JNFA 3CIJA 2Y7WA 2F6GA 1URGA 4F22A 4YZZA 2O69A 2HXWA 3IJOB 3DP4A 4QSEA 3FVOA 5AE4A 3IX1A 1Y4CA 2O7IA 4NF8A 5H8NB 3RY3A 1OLAA 1J1NA 4HCWA 4LONB 1ZMGA 5DT6A 2QPQA 3C9HA 3FVKA 3I5OA 3QXMA 1TFAA 3U92A 5B70A 3CR9A 2ESNA 4POWA 3FVGA 1MPDA 2HZKA 3B6WA 3QYTA 3FXRA 4IY6A 1LFIA 1XS5A 3GXAA 1FQDA 1ZU0A 5CMBA 2VGQA 2OLBA 1KWHA 2VP1A 2H98A 1UTHB 3MPLA 1MQHA 3D4GA 5TPAB 2ANJA 3RNNA 3CFXA 1I6BA 3W9VA 2Y7IA 3TCGA 2V3TA 2YLNA 3KJTA 4GXAA 2A5TA 4PFTA 5I2NA 2E0SA 2V93A 1R9LA 5FHNA 1QULA 4KCDA 4YU0A 1NMUA 1I6QA 5DEXB 1OMPA 3UN6A 3ZS6A 3N5LA 1SI0A 4MLQA 4HTGA 2F7CA 3HO7A 2ZMBA 1QKBA 3UGWA 4N13A 5IAIA 5HPQA 3MZ9A 5H8HA 3ZKKA 2LAOA 3CG3A 3SEYA 3T66A 3K1MA 3QAXA 3T9XB 2D3IA 1DPEA 2G29A 1UIUA 1QUKA 4ELQA 3LSLA 3EQ1A 1GTKA 3CSBA 4IB2A 2ONRA 1B3GA 4LUBA 1MDQA 1B05A 3OO9A 2F8DA 4ELOA 3E3KA 3H06B 1YCJA 1POTA 1XVYA 1Z7NE 1MM6A 3RN8A 3TQWA 4HW8A 1S9TA 1IIWA 1PDAA 5JEIA 2V3QA 1JW4A 1OVTA 2R6GE 2RC7A 2VOZA 2PX1A 4JSOA 1R6ZA 1B3LA 2XXTA 1OVBA 2H25A 3JZJA 1FTJA 3VLVA 3O6GA 3K02A 4OFLA 1FCKA 4ZEKA 2I4BA 2YPNA 2HAUA 1N84A 4POXA 1BKAA 4HS7A 3UORA 5I56A 1ZLQA 1D9VA 3KZGA 1LCFA 1OLCA 3T9HB 3RTFB 5JTYA 3H7MA 1MDP1 3N6UA 1HSEA 4R6HA 4YKKA 1QJMA 4NWDA 3RT6B 1TFDA 1MS7A 4MFIA 4EXKA 4Q8RA 4PP0A 3BKIB 4R6YA 5A5XB 4X48A 3TAJA 1D3KA 3TPAA 2I58A 1SW4A 2NOOA 4LVQA 1A99A 1LCTA 1R1NA 3DLNA 4OERA 3FD3A 3K6VA 2DWJA 5B7DA 1MQJA 1N7XA 2QS1A 1DSNA 4U4SA 3LR1A 3TTRA 1OQGA 1DTGA 3L6GA 1SW1A 5H8NA 2OCUA 4IGRA 5FTHA 3RLFE 4EQBA 4GRKA 1Y3QA 2HZLA 3FUZA 4ZECA 1URDA 2V3UA 4RPOA 1US5A 1UQWA 2CMOA 4RPNA 1II5A 1DPPA 5EHSA 5CBSA 3KEIA 1MG1A 2Q2CA 2DYXA 2RKMA 2GH9A 1MQDA 1LBBA 1UTHA 4OFOA 5TU0A 3H4ZA 4GWOA 4TLLB 4QHQA 2QRYA 5CMMA 3VXCA 1RYOA 4OTEA 5TPAA 1YPNA 1EH3A 4AB6A 1B58A 5ELVA 3GBBA 4LP2B 3V83A 3PD9A 5I84A 5DTBA 1WODA 4LQ2A 4F3GA 4KR5A 1MM7A 2XD3A 2I4CA 3VVFA 2F7AA 4ZZEA 1EZ9A 5DEXA 2O1LA 4IO7A 4G77A 2H9BA 3IOVA 3S4UA 4IO5A 4MH5A 3IB0A 4AQ4A 4U1ZA 3BBRA 4R2FA 1B4ZA 1JEUA 3KGCA 2XXRA 4GOTA 3SEVA 4MBPA 1XOCA 2DSFA 3OO6A 2F5XA 5I2KB 3O97A 3G3GA 1A55A 5H8QB 1B6HA 1P1OA 1SW2A 3LSFB 3IOTA 4OETA 4K3FA 2Q88A 4Q5TA 3DELB 1GR2A 4JXIA 4AB5A 3I3VA 2HCAA 5J1DA 5M2VA 3TFLA 4ONYA 3MP6A 2QMXA 4OWDA 3B6QA 1A7LA 2BJJX 1SW5A 4FAJA 3QSLA 4KD5A 3W9WA 2Z23A 3D4CA 4F1UA 3KOTA 4ESXA 2QS3A 4IGTA 1LB9A 3LC8A 4I8CA 3CRBA 3V89B 3O6HA 1S50A 3R26A 3G3HA 3OENA 3TELA 4DXBA 4QSCA 4H0WA 3UK4A 4R6KA 1ZJLA 2OWSA 4WKMA 1B3HA 1N3XA 3Q25A 4I9DA 4KYDA 3GBAA 4ND9A 4ZEBA 4GD5A 4F39A 4BDOA 2F6PA 1VFDA 1M5EA 2DVCA 3OXNA 4OMBA 3LSXA 1CB6A 3OSQA 1GGGA 3V5AA 3SKPA 1LGBC 2RF1A 3HSTA 3QIMA 1ZIUA 3KG2A 2Z8FA 4U2RA 1LSTA 4ECFA 3SEWA 4NF4B 4QFPA 3IORA 2Q9TA 2X26A 4XKNA 4QRZA 2RCAA 3L6HA 2F7BA 2DE2A 3IK6B 4P0GA 5CRYA 3E4RA 3IO4A 1T0KA 3OELA 4OZ9A 3RTWB 2H5YA 3PPNA 3MQ9A 2IEEA 2ABHA 1WVJA 2OWTA 5A5XA 1MXUA 3IJXB 2O7UA 5AA1A 4NEDA 3C33A 2UVGA 2THIA 4XKQA 3TODA 3T96B 1Y20A 4XIGQ 3K4UA 3M8UA 1M5FA 2XXYA 4RXLA 5CMCA 1SI1A 4RYAA 1JVYA 2O1MA 2GHBA 3IAZA 2F97A 4FE8A 3KSJA 1TXFA 4LATA 2DQVA 4DZ1A 4GF8A 3U72A 1OIBA 5BUUA 1OQHA 2VHAA 2D5WA 3WAFA 4EDPA 4GQOA 3N94A 5KCJB 2XXQA 1XVXA 4E0WA 1VE4A 4TLMB 1AL3A 4EUOA 3Q29A 1P99A 3PUWE 3FIRA 4LQ5A 2DWIA 1MRPA 3O2AA 1FTOA 1QUIA 2Q8JA 4H8IA 1FQCA 3SERA 2VD3A 4LA9A 4R72A 3ILUB 2X7PA 3O29A 1A54A 1ZKBA 5DYHA 2Y84A 5TP9B 1N3WA 2OBGA 3UP9A 2I3VA 3TTNA 2DE4A 4P11A 1YAEA 2Z8DA 2F36A 4FEBA 3O9PA 1Y9UA 3PU5A 5ICTA 1UTBB 4KFQA 3IO6A 3H03A 5HM4B 4KCCA 1IQ7A 3TDJA 4RNSA 4KYSA 3S9LC 2DWHA 5JK4A 2O51A 3MVZA 1DOTA 1F9BA 4G68B 3CI8A 5I2KA 4H5FA 3HN0A 4PFYA 4F3PA 3JYRA 2ZXTA 5H8QA 4WEDA 4Z0IA 1B4HA 4I62A 4IY5A 1IITA 4BDLA 1FQBA 3KOSA 3IR1A 1NKXA 2W7YA 3Q26A 1N7WA 1JQFA 1O64A 4MF3A 3MP8A 1B3FA 3IB1A 4H67A 1MY0A 3USDA 3AXFA 4OQOA 5CI5A 1YTVA 4G68C 3I6VA 3FZVA 5LOMA 3U8QA 1D9YA 1LBCA 1LB8A 1MY3A 3KBRA 3R6UA 3E9XA 2UVJA 4ISUA 4EQ9A 1JEVA 4JWOA 4LZ5A 3F11A 3C35A 4MLVA 4BLAA 2F35A 2XXVA 1Y3PA 3U1OA 3CSGA 4IO3A 4L17A 3PUXE 2AL5A 2DOJA 1JW1A 2G93A 4FJPA 3ODBA 4DLDA 1FQEA 1IXGA 2XX8A 3TCFA 2GHAA 1IZ1A 5F7VA 3B7DA 2IA4A 3FV1A 4NF4A 1R9QA 1SD3A 4R9GA 3MUQA 3M3FA 3CVGA 4O3CA 1IXHA 2DS9A 3EHSA 3PMXA 3C4MA 2DVZA 4FECA 5I58B 2FYIA 3DM0A 4U4XA 2XXPA 3PPPA 4F3SA 2I3WA 1PB7A 1MQGA 3TQLA 1B32A 1FTKA 4F1VA 3QK6A 4YKJA 3KN3A 2OJTA 2RC8A 4ZZAA 5K2YA 3O28A 4HCYA 4EQ7A 2XXWA 2Y7PA 3UA8A 3MC2A 3QUJA 2DXYA 3K0VA 2XXXA 4OESA 3IB2A 1H76A 1JW5A 1B0HA 4R74A 4UACA 4YICA 1MXYA 1I69A 1ZTYA 1L5TA 4F31B 2ZNTA 5KDTB 4M1VA 4KHZE 3G3IA 1VSOA 1SVXB 2QS2A 3RGYA 3FGSA 1MPBA 4THIA 3HHGA 2X7QA 2XXUA 3ECRA 4X1DA 1MQIA 1POY1 4R75A 5H8SA 5HBCA 2FNCA 3OSRA 4FIMA 4G4PA 3K01A 3U93A 3SEUA 1ZBMA 5H8FB 1PBPA 1NL5A 2ONKE 1MXZA 1US4A 3PPOA 4ZS9A 1B51A 3H3GA 3VLWA 3S2VA 4H5GA 4ZDMA 3TKDA 2PMSA 3TZAA 4JWYA 4F2QA 1P1UA 1ATGA 2B3BA 5H8HB 2QSXA 1SQYA 3THIA 1ANFA 4KYEA 3MVWA 2FA7A 2DXRA 3K1PA 4F1YA 2P2AA 4ELPA 3KSXA 4LZ7A 3OO8A 3ZSFA 2ZYMA 4H6DA 1P1QA 3HPIA 1EU8A 1UTBA 4E0XA 4U23A 4F29A 3FV2A 1B40A 4G68A 3VE1B 3PGFA 2H99A 3TUSA 4XXUA 4RY1A 2B65A 2HAVA 2Y7RA 3IOWA 1A40A 3PV0E 5CBRA 2F78A 3SEXA 3H6WA 1IXCA 2XHDA 4DDDA 1EZOA 3T22A 1BP5A 3S9EA 1Y3NA 4FORA 5FTIA 1MXVA 3MJNA 1PC3A 1NH8A 3SETA 3C36A 5EHMA 1XHYA 2HQ0A 4N6PA 3S9NC 1NNPA 4WEPA 3FJMA 2AYSA 3TTLA 2CZLA 1SDXA 4G8NA 1MH4A 2A5SA 1Y1MA 3B6TA 5JTYB 4BDRA 1CE2A 5FHMA 4ZEDA 2R9JA 4LZ8A 1B5HA 1FW0A 3VXBA 3G3FA 4QFOA 2YJPA 1XT8A 3N6TA 3T9UA 2RCBA 3H6UA 4JWXA 2O68A 3VVDA 3K00A 4YB7A 4C0RA 2QS4A 3TMGA 3IOUA 1HSLA 4PETA 1B52A 3E13X 1D4NA 5AA2B 3W15C 3MAMA 3R7XA 3PPQA 4JDFA 1GVCA 5DVJA 5I58A 4ZE8A 4FATA 2VD2A 4X9TA 4YMAA 5BWJA 1H3DA 1LAHE 3K6WA 3OO7A 4OVJA 4GLIA 1GV8A 2I0CA 4RK9A 4U21A 5KZTA 1LAXA 1QVSA 2NVUB 3OOAA 3K2DA 5FHOA 4Q0CA 3MWBA 3LBSA 2ZYNA 4JB7A 5AA2D 1B7ZA 3EHUA 4NE4A 3FASA 1SBPA 1VFEA 4C1TA 5KDTA 3BFUA 3H6VA 4H1XA 1N76A 1B1XA 1LAGE 4BDQA 5ITOA 3A3CA 4RA1A 4RJZA 1M5DA 3FXUA 3TTKA 4FEDA 4NF6B 2DP8A 4ESWA 3EN3A 1H44A 2I6EA 3TEPA 3G3KA 3OMBA 3P7IA 4EXLA 1JETA 4F18A 3HV1A 2HFBA 2B3FA 3PMVA 4NF5B 3N26A 5H8FA 2ZYKA 5I57B 3KN7A 2QMWA 4QSDA 5I59B 2RC9A 3DP6A 2UVHA 2Q2AA 1QW0A 4G8MA 4O3BA 2R71A 2UXAA 5AA4B 4IO4A 1NH7A 2XX9A 2AIXA 4WXJA 1BLFA 1MY1A 1B2HA 3C34A 2Z8EA 2I49A 2ZNUA 2XXIA 4DIGA 2V84A 3SESA 4GFRA 1N04A 1LLSA 1B7UA 5L9MA 3IL1B 1QUJA 2H4IA 1USYE 4YMBA 5F1QA 3PUYE 1FQFA 4G8HA 1IUDA 4UA8A 5L9SA 3A3UA 2OK2A 3LUYA 2XX7A 1LFHA 3FJGA 1B5IA 3H6TA 1P1NA 4F19A 2QL3A 3KN8A 2PBWA 1SYHA 3VVEA 3RT8A 2UYEA 1I6AA 2PVUA 3MZBA 4GXSB 3RQTA 2PT2A 1Z7ME 3KJ7A 3C31A 4P0IA 1BTJA 1MH3A 3PMWA 2P0SA 3FATA 1Y4TA 5DVIA 3GZGA 3OD7A 3EPEA 2RINA 3UIFA 2XXHA 1H45A 4BDMA 1A8FA 2I48A 2PT1A 4OEVA 1H43A 4IO2A 3PUVE 3QUFA 1LAFE 3TYHA 1NFTA 1DTZA 3FVNA 3KFMA 4YKPA 4R9FA 1QKAA 1O63A 3VLUA 4QF9A 1HSJA 4OHNA 3U94A 2AL4A 4KQPA 1B5JA 3BFTA 1PB8A 4NF8B 1SYIA 2I0BA 4R2BA 2PYYA 4NMYA 1PEBA 2D21A 2ZNSA 5AA2A 4GL8A 3PPRA 2ALUA 2O6AA 2UYFA 3GLBA 1Y1ZA 4H65A 3WAEA 1B9JA 4IO6A 3O6IA 5ITPA 4OFJA 4NTLA 4F2OA 3MBPA 3ONMA 1FTLA 1P1WA 2KLFA 4YAHX 3VDFA 2O84X 4PFUA 4OEUA 4EF1A 1Q35A 3TTMA 4JBZA 1B3EA 4N07A 4BDNA 3CG1A 1URSA 4Z7EA 3MZ1A 4TOZA 1ELJA 1TT1A 2M8CA 5CMKA 1FTMA 1A8EA 1MXWA 2A5TB 4ELRA 5I2NB 3FXQA 2OZZA 4PFWA 1MPCA 1NNFA 4X1BA 1USYH 1B46A 1B7HA 4GL0A 5L9OA 1IEJA 5KCJA 4QFNA 1MY2A 1LFGA 5EYFA 3MW0A 1RKMA 2GFEA 1M5BA 3CFZA 1PBQA 2GRVA 1BIYA 4EF2A 4DXCA 4NF6A 4QFKA 1VR5A 4OENA 3ILTB 3FJ7A 1B1HA 3O66A 1XC1A 2ZYOA 4GIZA 1NNTA 1Q1KA 2F34A 5TP9A 4NF5A 4U22A 2V25A 5CM6A 3Q27A 5I57A 2DWAA 3V8XB 4I1DA 5I59A 2UVIA 4TQUQ 3MP1A 3LSWA 4KI0E 3EHTA 5AA4A 1M5CA 3C32A 5K2XA 1MY4A 3M3KA 3K1NA 4C1UA 3DP8A 1RYXA 1IXIA 3MPKA 4DCXA 4O3AA 3T93B 3ZKLA 3MVXA 2E1SA 4ZEIA 1JVXA 1AIVA 3K6XA 4OXVA 4ZE9A 1AOVA 3HHFA 4PQJA 1N0TA 5IKBA 1B0LA 2REJA 2WKYA 1S7YA 4JSDA 4DCYA 4XKPA 5DVFA 3VV5A 1PB9A 1WDNA 3OEKA 4NWCA 3HCQA 4YKIA 2NUVA 1EZPA 4H8JA 2NXOA 3K6UA 3Q28A 4PE5B 3TCHA 4KPTA 5AA3A 2REGA 4DXUA 3VFJA 5I56B 3MVYA 2QJEA 4GVOA 4YB6A 2HEUA 3T9VA 3G3JA 4OYVA 4M4GA 1UIVA 1AMFA 1O7TA 1DMBA 4QFLA 3RPWA 1NNKA 3PD8A 2Y7KA 2XD2A 5L8DA 5ICQA 4DE8A 3S9MC 4YB5A 1MXXA 4RK2A 4G2ZA 2DE3A 3OEMA 3M3LA 5CC2A 4XKRA 3EF7A 5ISUA 3A09A 4U1OA 3PUZE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4ELQA 3LSLA 3EQ1A 1GTKA 3CSBA 4IB2A 2ONRA 1B3GA 4LUBA 2CEYA 1MDQA 1B05A 3MYUA 3OO9A 4NAPA 2F8DA 1FBHA 3IFCA 5ET6A 4ELOA 3E3KA 3H06B 1YCJA 1POTA 1XVYA 1Z7NE 1MM6A 4P56A 3RN8A 3TQWA 4HW8A 1S9TA 1IIWA 1PDAA 5JEIA 2GQ1A 1DBZA 2V3QA 1JW4A 1OVTA 3KBZA 2R6GE 2BJIA 2RC7A 2VOZA 2PX1A 4JSOA 2F3BA 1R6ZA 1B3LA 4N8GA 2XXTA 1OVBA 2H25A 3JZJA 1FTJA 3VLVA 3O6GA 3K02A 4OFLA 1FCKA 4MHFA 4ZEKA 2I4BA 2YPNA 2HAUA 1N84A 4POXA 1BKAA 4HS7A 3UORA 5I56A 1ZLQA 1D9VA 3KZGA 1LCFA 1OLCA 3T9HB 3RTFB 5JTYA 3H7MA 1MDP1 3N6UA 4R6HA 1HSEA 4YKKA 1QJMA 4NWDA 3RT6B 1TFDA 1MS7A 4MFIA 4EXKA 2JJKA 4Q8RA 4PP0A 3BKIB 4R6YA 5A5XB 4X48A 5EYGA 1SPIA 3TAJA 1D3KA 3TPAA 2I58A 1SW4A 2NOOA 2PCRA 4LVQA 4MEVA 1A99A 1LCTA 4P1EA 1R1NA 3DLNA 4OERA 1LBWA 3FD3A 3K6VA 4HE0A 4PGNA 2DWJA 3T1BA 5B7DA 1MQJA 1N7XA 2QS1A 1DSNA 4U4SA 3LR1A 1RDXA 3TTRA 1OQGA 1DTGA 3L6GA 1SW1A 5H8NA 2OCUA 4IGRA 5FTHA 4H46A 3RLFE 4GX6A 4EQBA 4GRKA 1Y3QA 2HZLA 3FUZA 4ZECA 1URDA 2V3UA 4RPOA 1US5A 1UQWA 2CMOA 2ZZWA 4RPNA 1II5A 1DPPA 5EHSA 5CBSA 3KEIA 1MG1A 2Q2CA 2DYXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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