3IOUA

Huntingtin amino-terminal region with 17 gln residues - crystal c94
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
416
structure length
402
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQPPPPPPPPPPPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Secondary structure of Huntingtin amino-terminal region.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
molecule tags Signaling protein
source organism Escherichia coli
total genus 102
structure length 402
sequence length 416
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iouA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iouA02
1MDQA 4G8MA 4X1DA 3K6UA 1H76A 1R1NA 1IUDA 3MP1A 2R9JA 1MDP1 2XXUA 3TTNA 1MXVA 5FHMA 3TPAA 2HZKA 2NVUB 2D3IA 2B3BA 2DVZA 4FE8A 4BDNA 2IEEA 3U94A 4LQ2A 1PB9A 3VLWA 1QULA 3RTFB 1USYE 5TPAB 1NNKA 1ZJLA 2XXYA 1EZ9A 4KD5A 4ELOA 2F8DA 1P1WA 3BFTA 3OO7A 2AL4A 1B46A 3FGSA 3M3FA 3KOTA 3LSWA 5KZTA 1D3KA 4GIZA 2HAUA 4JSDA 2Y7KA 1NNPA 2PT1A 3C32A 1LAXA 4ZE9A 5L9OA 4RYAA 4OEUA 1I6QA 3MBPA 3KOSA 4ZZAA 1LCTA 5K2XA 3TYHA 3V5AA 2GHAA 4HW8A 4KHZE 2I48A 4LATA 2XXWA 2O68A 2ONRA 2QSXA 4IO3A 2DYXA 4G68C 3PGFA 4F1UA 1CB6A 1MRPA 2DWIA 2F7AA 2XXHA 3O2AA 3FIRA 2GHBA 2R71A 3O28A 4JB7A 4U4XA 2F6GA 2THIA 1GTKA 3SEVA 3MVYA 2BJJX 3ZKLA 4KCCA 3KEIA 3TZAA 1POTA 1Z7NE 4RY1A 4BDOA 3PUVE 3N94A 3K6WA 3MPLA 1S50A 1LAGE 2I0CA 3TCGA 4H5GA 2QS2A 3EN3A 4OYVA 3A3CA 4GFRA 4Q0CA 4OVJA 3JZJA 3SKPA 4YKKA 3L6HA 1B1XA 1P99A 1P1OA 1PBQA 2RCBA 4Q5TA 2F5XA 5H8FA 4PQJA 5BUUA 1B5HA 1ANFA 4NF5A 2Z8FA 4HCWA 3G7WA 3RQTA 4NF8A 4TQUQ 4F3SA 3SEUA 3CVGA 4ZEBA 2KLFA 4IO2A 2UXAA 1OQGA 3IB0A 4MLQA 5K2YA 3TQWA 1NMUA 5FHNA 5CM6A 3A09A 3PMWA 3OD7A 5JTYA 2O69A 5HBCA 4JXIA 3P7IA 3OEMA 4LONB 3T9VA 4EQ7A 4EF1A 3GXAA 4N13A 2OWSA 3FVOA 3U1OA 2NXOA 5I58A 3V89B 4R2BA 4R9FA 1L5TA 2H5YA 1ZMGA 4OEVA 1CE2A 1JW4A 2W7YA 1XHYA 3LSLA 2OWTA 4JSOA 3PMVA 1TWYA 4DLDA 3HPIA 3KFMA 3UGWA 1YTVA 3H03A 4F1YA 1SW5A 3N26A 4ELQA 1FTOA 1B7UA 1MQDA 1QVSA 3FXQA 2XX8A 1O64A 3JV9A 1QUJA 1FQBA 2AIXA 4EQ9A 4DXCA 5F1QA 3RT8A 3QSLA 2V93A 3RLFE 1MPCA 4YB6A 1JW5A 4K3FA 4OETA 4YMAA 1PC3A 3CRBA 3MC2A 3KZGA 1D4NA 2Y7IA 3IK6B 1BP5A 4RPNA 4U4SA 1QJMA 2DXRA 2V3QA 4R6HA 5DYHA 5H8FB 5HM4B 2VOZA 1B51A 4NF5B 3Q29A 5ICQA 1Q1KA 3DM0A 3ODBA 2VD3A 4YB7A 4I9DA 1B58A 1MY3A 4LUBA 4XIGQ 4YKJA 2OLBA 4I62A 1XOCA 3OXNA 2Y84A 3USDA 1MQJA 3GZGA 3T66A 5IKBA 3FD3A 4RXLA 1Z7ME 2QS1A 1R6ZA 3FJ7A 1PB7A 1NL5A 4FEBA 4IY5A 4U22A 1ELJA 4N6PA 3BFUA 5EHMA 2YPNA 4ZEKA 4PFUA 5I58B 3OMBA 3G3GA 1A7LA 1MQHA 4RA1A 2RC7A 1Y4TA 2O1MA 3Q25A 3QIMA 3TFLA 4NEDA 1XT8A 4FAJA 2RC8A 5ELVA 2ALUA 3QXMA 2ESNA 1SYIA 1LFHA 1PEBA 4ND9A 4FEDA 2D21A 4IO5A 1IIWA 3FUZA 3W15C 3MWBA 3FJGA 5H8NA 5AA1A 5DTBA 2F35A 3MW0A 4NF4A 3V8XB 3B7DA 5AA4A 1JEUA 2VP1A 2Y7RA 4NE4A 4EDPA 1FTLA 4F18A 4R2FA 3FATA 2GRVA 3RN8A 2DS9A 4I8CA 1SW1A 2O7UA 1URSA 3M8UA 4HCYA 3OSRA 5DVIA 1MQIA 3G3KA 5L9SA 3RNNA 4G2ZA 3TEPA 2P0SA 2Q89A 1XVYA 3W9WA 4QFKA 3PUZE 1PBPA 1GGGA 1LSTA 1LFIA 4KFQA 2YLNA 1MS7A 4LA9A 3HN0A 3TQLA 2FNCA 4X48A 4GWOA 3C31A 3GBBA 4EXKA 1TXFA 5I57A 3G3JA 5M2VA 3EHTA 3MZ9A 4OXVA 3LUYA 2UVGA 3ONMA 3D4GA 3Q28A 3E3KA 4QFPA 5DEXA 4M1VA 2DQVA 1R9QA 4R74A 3SEYA 1B3GA 2B65A 5BWJA 4NF6A 3U92A 5FTHA 2P1SA 2PMSA 4KCDA 1AIVA 2OCUA 1JEVA 4RK2A 2F97A 4LP2B 3R7XA 1ATGA 2Z8EA 4FORA 1AMFA 1RYXA 2QJEA 2I0BA 3GBAA 3S2VA 3IL1B 4F3GA 3MAMA 3PUXE 2VD2A 5KCJA 4NF4B 3SERA 5AA4B 3K0VA 1MXWA 4F3PA 1JW1A 4FIMA 3M3KA 4DXBA 2XXXA 1NNFA 1Y1ZA 2DE3A 4F22A 3OELA 2QMXA 3SEXA 3QAXA 3VV5A 3K6XA 2DE2A 3MP8A 1MH4A 4POXA 2ZMBA 1UTHA 4BDLA 4JBZA 4ZEIA 1I6AA 5AA2D 1D9YA 3K2DA 4R6KA 3IORA 3O66A 3IJOB 4OFJA 3W9VA 1OLCA 3Q26A 1LBBA 1FQCA 4LQ5A 1LGBC 1MQGA 2HFBA 3BBRA 1I6BA 2DVCA 3U72A 3IX1A 1EZPA 5I59A 4IO7A 3VVFA 3DP8A 1SW2A 1URGA 1TFDA 3U8QA 5I57B 3PPQA 3IOWA 4KYDA 1DSNA 1HSEA 1N7WA 2QL3A 4C0RA 4GL0A 5DEXB 1I69A 3TODA 3S9MC 1ZLQA 3PUYE 3O6GA 4OFLA 2Y7PA 1M5CA 4NF6B 1B05A 1IXIA 4HS7A 3CFXA 1IZ1A 2I4CA 4GLIA 3B6TA 3LR1A 3PV0E 5I2KB 1EU8A 4Q30B 3T93B 2HEUA 3FZVA 2VHAA 1Y1MA 3EQ1A 2Q8JA 5KCJB 1TFAA 1YAEA 1JETA 4XXUA 4F2QA 3DELB 3QK6A 4ELPA 4F3BA 4ZEFA 1US5A 1VR5A 3AXFA 1JVYA 5CMCA 5CC2A 4QFNA 1IQ7A 3PPOA 4ONYA 4XKQA 5LOMA 3OO8A 1N04A 4G68A 3PPNA 4AB5A 1UTHB 1FTJA 2PYYA 3M3LA 1AH5A 4OWDA 5H8HA 5CBRA 2I3VA 2UYEA 4PETA 3K00A 2DP8A 4XTCQ 5B7DA 1JQFA 2ONKE 1P1NA 2FYIA 4GXSB 3RTWB 1SW4A 4E0WA 1OLAA 3KN8A 1VSOA 1HSJA 1B1HA 4TOZA 4X9TA 5I59B 1N76A 3H7MA 1FCKA 3VLUA 4QSDA 2QPQA 4ZS9A 4YZZA 1QUIA 1Q35A 1FTMA 1B3HA 4H8JA 3K4UA 1Y4CA 4UA8A 2CMOA 1WVJA 5CRYA 2XD2A 4PE5B 4QFLA 2PVUA 3H6TA 1WODA 1MG1A 2UVHA 2RC9A 3TCFA 4OZ9A 1URDA 1IXGA 2HXWA 2F78A 4U1OA 1N0TA 2R6GE 1EH3A 2UVIA 3DLNA 5DVJA 4GXAA 4L17A 3HO7A 2O51A 4EF2A 3FVGA 3HHGA 1MXZA 5EHSA 5A5XA 2Z8DA 1SD3A 4YKPA 2RKMA 3OSQA 1DPEA 4LVQA 3B6QA 3TCHA 4G68B 4QFOA 1B52A 1ZTYA 1O7TA 2HAVA 2XXQA 3IOVA 4RPOA 4IGRA 2V3UA 5H8HB 4NWCA 3T9XB 3IO4A 1M5EA 4R75A 1N84A 2LAOA 1YCJA 4ESWA 4F29A 3SEWA 3RT6B 3FASA 3KJTA 3OEKA 3UA8A 2GH9A 1ZU0A 3JYRA 4F1VA 3RUMA 1ZBMA 4BLAA 3N6UA 3PMXA 3GLBA 4O3AA 1QW0A 3O29A 2DWHA 2FA7A 1Y9UA 3KJ7A 1SQYA 2NWJA 2O84X 4ECFA 4R6YA 4OQOA 3TTLA 1TT1A 5DVFA 5AE4A 1UTBA 1SI0A 1B7HA 4P0IA 1SVXB 3PUWE 1QUKA 2PT2A 4QF9A 1BLFA 2DWAA 3K6VA 3FXUA 4ZECA 2XXVA 3VLVA 5I2NA 4O3BA 3IB2A 3CR9A 3EF7A 1SDXA 2H4IA 1XC1A 2F7BA 4EXLA 1Y3PA 1B5IA 3ECRA 2X7PA 2I4BA 3S9NC 1O63A 4U1ZA 2Y7WA 1N3WA 4U2RA 1FQAA 5F7VA 1QKAA 5A5XB 1J1NA 5H8SA 3KG2A 3H3GA 1F9BA 1DOTA 4ZZEA 3D4CA 4POWA 5CMBA 3SETA 1NH7A 3OO6A 4G8HA 3HV1A 3CI8A 3FJMA 1PDAA 1MM6A 3C36A 3UP9A 1B0LA 1M5DA 4R72A 3K01A 3QYTA 3ILUB 1MXYA 4H0WA 1RYOA 2ZNUA 4E0XA 2REGA 3UK4A 3HHFA 5AA2A 3VVDA 3LC8A 3ZS6A 1OIBA 1SBPA 3VXBA 3E9XA 2XX9A 1DTZA 2V25A 2F6PA 4AQ4A 3T96B 1II5A 3LSXA 1NH8A 3MP6A 1M5BA 1AOVA 2Q88A 2XXTA 1MH3A 4BDMA 5IAIA 4LZ7A 1A55A 5ISUA 3C9HA 4YMBA 4ESXA 1YPNA 4RNSA 5L8DA 1VE4A 1UTBB 4R73A 4XKPA 5I56A 4OERA 3VDFA 2VGQA 3S9LC 2I58A 2ABHA 3DP6A 5I2NB 4MH5A 1IXHA 2GFEA 3KN3A 3K02A 4OENA 4DIGA 1MPBA 4ELRA 4XKRA 2QRYA 3MVWA 1H43A 4KYSA 3PD8A 4TLMB 3OOAA 2AL5A 3DP4A 1FTKA 1B3FA 1S9TA 1IEJA 5KDTB 1LLSA 3H06B 1DPPA 4H67A 2G29A 4H1XA 5I2KA 4R9GA 4F2OA 4YB5A 4BDQA 4LZ8A 4GVOA 4Q8RA 2NOOA 4KPTA 4I1DA 3T9UA 1B9JA 5I84A 1FW0A 2O7IA 1A8EA 4M4GA 1Y3NA 2P2AA 5AA2B 4WEPA 3IO6A 3TAJA 3TKDA 3I3VA 2IA4A 3H6WA 3K1NA 3MUQA 3PPRA 4GOTA 3IB1A 1Y3QA 1LBCA 5HPQA 1VFDA 2RCAA 5TP9B 1BTJA 2AYSA 3BKIB 4JWOA 4OHNA 5FTIA 3ZSFA 5I56B 2M8CA 3QUJA 1RKMA 1FQFA 4OMBA 2QMWA 4IB2A 3UORA 4P11A 5TU0A 4WKMA 1R9LA 4N07A 4YKIA 3UN6A 4ZDMA 3N6TA 4IO4A 4NWDA 4UACA 3RY3A 3SDFA 1B5JA 3O6HA 4U21A 2RINA 3R6UA 2PBWA 2Q2CA 2A5TA 1LAFE 3IAZA 1LFGA 4PP0A 3VVEA 1USYH 1NFTA 3RPWA 4P0GA 3G3IA 2X7QA 3OENA 3CIJA 1MXXA 3S4UA 4FJPA 3HSTA 2XXIA 3CG3A 4QHQA 1BKAA 5JEIA 2F7CA 1WDNA 4FECA 4THIA 4ZEDA 1MY0A 3MVXA 3LBSA 3FV1A 1JNFA 4H8IA 3QUFA 1LB9A 4KI0E 4KQPA 2NUVA 2I3WA 3R26A 3C4MA 1OMPA 4Z7EA 1MY4A 2V84A 1DMBA 3B6WA 3FV2A 4IY6A 3MQ9A 4IO6A 3EHSA 3C33A 4MFIA 1OVBA 3I5OA 4EUOA 3CFLA 1M5FA 1GV8A 5H8QA 4U23A 4AB6A 2X26A 4WXJA 1AL3A 2F34A 1H45A 2REJA 3PU5A 2A5TB 1B6HA 1B4ZA 4G4PA 2WKYA 1NNTA 3IJXB 4QRZA 2ZYOA 1SI1A 2ZXTA 5CMMA 2ZNTA 3TDJA 2XX7A 1GR2A 2I49A 2ANJA 1A54A 1MPDA 3H6UA 3SESA 4X1BA 4YU0A 3MVZA 1MY2A 5FHOA 4TLLB 1OVTA 2E1SA 2D5WA 1HSLA 2E0SA 1MXUA 3S9EA 3RGYA 3PD9A 4JWXA 4C1UA 3KSXA 3G3FA 1B3LA 2OJTA 2A5SA 3KSJA 1IITA 5CMKA 3ZKKA 1JVXA 3KN7A 3V83A 5B70A 2YJPA 3CFZA 1Y20A 4GQOA 4RK9A 3OO9A 4DE8A 1T0KA 1N3XA 2XXRA 3T9HB 3WAFA 4O3CA 2H98A 3HCQA 3EHUA 5J1DA 2DSFA 2XHDA 4PFTA 3O97A 3VXCA 4C1TA 4JDFA 5H8QB 2OK2A 4NMYA 1P1QA 1QKBA 3IOTA 4ISUA 3T22A 5JK4A 1UIUA 3MPKA 1D9VA 4KR5A 2Z23A 3TUSA 1OQHA 3O6IA 1XVXA 1P1UA 2I6EA 2HZLA 4YAHX 3TELA 3UIFA 3PPPA 3F11A 3FVNA 4OESA 4RJZA 3TTKA 4XKNA 3O9PA 3I6VA 4GD5A 2OZZA 1H3DA 5CBSA 2ZYMA 4NF8B 3TMGA 2HCAA 2O6AA 1NKXA 3THIA 1US4A 4FATA 2HQ0A 5ITOA 4GF8A 1POY1 4H6DA 5JTYB 4MLVA 1KWHA 5CI5A 1BIYA 4PFWA 5EYFA 3E13X 2O1LA 3U93A 3MZBA 5KDTA 1UQWA 3WAEA 1A99A 1B7ZA 3EPEA 1B0HA 1B32A 2XD3A 2ZYKA 1PB8A 1DTGA 4DDDA 3KGCA 1B3EA 2RF1A 4JWYA 2DOJA 4KYEA 3C35A 4OTEA 1S7YA 4WEDA 4F19A 3FXRA 3IR1A 1B4HA 2XXPA 2Z22A 1EZOA 3CG1A 4H5FA 4QSCA 4F31B 3MJNA 5DT6A 2DE4A 2B3FA 2F36A 3H6VA 1MM7A 3G3HA 4OFOA 2UVJA 5ICTA 4G8NA 4GL8A 4EQBA 2ONSA 3K1MA 2ZNSA 3FVKA 1IXCA 5TP9A 1FQDA 2H99A 1LCFA 3A3UA 3MZ1A 3CSBA 3CSGA 1B40A 4QSEA 1GVCA 4BDRA 1SYHA 4G77A 2DWJA 4H65A 2UYFA 4GRKA 3KBRA 2QS4A 2PX1A 3TTRA 1VFEA 2DXYA 1MY1A 4DXUA 3VFJA 3LSFB 4Z0IA 5TPAA 2ZYNA 2Q2AA 4DCYA 5ITPA 1LAHE 2V3TA 2H25A 3E4RA 4MF3A 3L6GA 2Q9TA 3K1PA 1A8FA 3TTMA 3H4ZA 1UIVA 3Q27A 2OBGA 1N7XA 5L9MA 2G93A 3ILTB 4DCXA 1XS5A 4ZE8A 3N5LA 2QS3A 4IGTA 4F39A 1ZKBA 3VE1B 3C34A 3IOUA 2CZLA 1H44A 1A40A 4NTLA 4PFYA 4HTGA 1FQEA 5AA3A 4YICA 4MBPA 2H9BA 1LB8A 5H8NB 1ZIUA 4DZ1A 1B2HA 4LZ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MDQA 4G8MA 4X1DA 3K6UA 1H76A 1R1NA 1IUDA 3MP1A 3BIGA 1FRPA 3ISPA 2R9JA 1NV2A 1MDP1 2XXUA 3TTNA 1MXVA 5FHMA 3TPAA 2HZKA 2NVUB 2D3IA 2B3BA 4O7MA 2DVZA 5F24A 4FE8A 4NHBA 4BDNA 2IEEA 3U94A 4LQ2A 1PB9A 3VLWA 2P3NA 1QULA 3RTFB 5ESYA 1USYE 4PFIA 5TPAB 1NNKA 1ZJLA 2XXYA 1EZ9A 4KD5A 4ELOA 2F8DA 1P1WA 3BFTA 3OO7A 2AL4A 1B46A 3FGSA 3M3FA 3KOTA 3LSWA 5KZTA 1IMCA 1D3KA 4GIZA 2XXKA 2HAUA 4JSDA 2Y7KA 1NNPA 2PT1A 3C32A 1LAXA 4ZE9A 5L9OA 4RYAA 4OEUA 1I6QA 3MBPA 1FPLA 3KOSA 4ZZAA 1NUXA 1LCTA 5K2XA 3TYHA 3V5AA 2GHAA 4HW8A 4KHZE 2I48A 4LATA 2XXWA 2O68A 2ONRA 2QSXA 4IO3A 2DYXA 4G68C 3IFAA 3PGFA 4F1UA 1CB6A 1MRPA 2DWIA 2F7AA 2XXHA 3O2AA 3FIRA 2GHBA 2R71A 3T0JA 3O28A 4JB7A 3RYDA 4U4XA 2WYPA 2F6GA 2THIA 1GTKA 3SEVA 3MVYA 2BJJX 4XFEA 4PAKA 3ZKLA 4KCCA 3KEIA 1FBGA 3TZAA 1POTA 1Z7NE 4RY1A 4BDOA 3PUVE 3N94A 3K6WA 3MPLA 1S50A 1LAGE 2I0CA 3TCGA 4H5GA 2QS2A 3EN3A 4OYVA 3A3CA 4GFRA 4Q0CA 4OVJA 3JZJA 2QVRA 3SKPA 4YKKA 3L6HA 1B1XA 1P99A 1DBZA 1P1OA 5IZ1A 3ROJA 1PBQA 2RCBA 4Q5TA 2F5XA 5H8FA 4PQJA 5EQ8A 5BUUA 1B5HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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