3KEIA

Crystal structure of the glua4 ligand-binding domain l651v mutant in complex with glutamate
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTVDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYTEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Enhanced efficacy without further cleft closure: reevaluating twist as a source of agonist efficacy in AMPA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 4
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3keiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3keiA02
3M3FA 4NF5B 3RT6B 2LAOA 2Z23A 1QUJA 3GBAA 1SBPA 1B3FA 2P2AA 3DM0A 4R2FA 5DEXB 3B6QA 1US4A 1A7LA 1USYE 3VVEA 3T66A 4QFPA 4BDMA 3SESA 4PQJA 4JDFA 4U4SA 4EDPA 1LGBC 4JWOA 2Y7WA 3O9PA 3ONMA 5KZTA 3KBRA 4BLAA 5CMBA 2OWTA 4BDRA 5KDTA 5HBCA 5AA2B 1B1HA 1LCFA 3MC2A 2ZNUA 1T0KA 1A40A 4L17A 3PUXE 3JZJA 1SW4A 4LA9A 2DWAA 2AL4A 4G68B 2Y7KA 4AQ4A 4DXBA 3U94A 5L8DA 3T96B 4U2RA 3PD8A 4RYAA 4KYDA 2ALUA 3EN3A 1MPDA 1B4ZA 4YMAA 1LFHA 1XC1A 4GL8A 3THIA 1A55A 1WODA 1H44A 2DOJA 3EF7A 1NFTA 4TOZA 4KR5A 1DPEA 4RNSA 4ZEDA 4AB6A 5AA2D 3QYTA 1MXYA 2GFEA 3VXBA 4IO2A 4FIMA 1N04A 5CBRA 3RTFB 1RYOA 3FASA 1Y9UA 2UVHA 5AA1A 1UQWA 1FTMA 2O6AA 3QIMA 5I2NB 3MP8A 4TLMB 1SYHA 3FXQA 3K01A 3T9HB 4XTCQ 2RCBA 5KCJB 2ZYMA 1IXHA 3AXFA 4OZ9A 3TTMA 1ZLQA 5TPAA 4GD5A 3LUYA 4I1DA 3DP4A 5TU0A 1IXCA 4ZS9A 3U92A 1S50A 1ZIUA 3DLNA 4OHNA 4GRKA 3SKPA 1DTGA 2XX7A 4OFJA 5H8FB 1MY1A 1IQ7A 1B5JA 1M5EA 3C31A 3F11A 1UIVA 1P1UA 3H7MA 1B1XA 5M2VA 1HSLA 1VE4A 3MPKA 1TWYA 1R9LA 5JTYB 4FEBA 5ELVA 3RLFE 3EHTA 3PUVE 2RC9A 3OO7A 2H99A 2PMSA 4OEVA 1SDXA 4OENA 4YZZA 2X7PA 4UACA 5K2YA 4R75A 5CBSA 2Z8EA 3UN6A 1FQFA 5KDTB 2DE3A 3EPEA 4HW8A 2RC8A 1KWHA 3EHSA 3U93A 1B46A 3V8XB 2B3BA 3TCGA 5I57A 2ONRA 3V83A 2IEEA 1VR5A 4QSCA 3RPWA 4EQBA 5B7DA 1LSTA 2F8DA 3V5AA 1FW0A 4NF8A 1P1WA 4NWCA 5DYHA 4BDLA 5CI5A 3K6XA 2Q88A 3MP6A 3C35A 4LQ2A 1R6ZA 5IKBA 2Q2CA 3SETA 1JW5A 4R6KA 3LBSA 3MZBA 3OENA 3IR1A 4DDDA 3I5OA 4XIGQ 4ZEBA 3Q26A 2XXYA 2FYIA 4QF9A 4C1UA 1IXIA 4LVQA 2XXQA 1MM6A 3U8QA 3B7DA 5CC2A 3LSWA 2UYEA 3SEYA 1PDAA 4GXSB 3CG3A 5I84A 3FATA 4FATA 2QSXA 3N94A 2ZMBA 4Q30B 2HFBA 3IK6B 2NOOA 3CRBA 2DQVA 3ZKKA 5TPAB 2F78A 2QS3A 5CMMA 5BWJA 4ONYA 1TFAA 3I6VA 1US5A 3MQ9A 2DVZA 1LB8A 4XKQA 3B6TA 3WAEA 3KSJA 3FV2A 2AYSA 1OLAA 2XXVA 2XXTA 3ZKLA 1P1QA 3T9VA 1FTJA 2F34A 3O2AA 3K2DA 1FQCA 3RUMA 3MZ9A 3CFLA 1GTKA 1Y4CA 2X26A 1D9VA 1CB6A 3T9UA 1NH7A 1MPCA 4LZ7A 2Y7IA 4E0XA 4GQOA 1DTZA 1M5DA 4M1VA 1NH8A 4GXAA 2DXYA 3TELA 4GL0A 4GLIA 3GZGA 3H03A 4THIA 1NNTA 4GF8A 4G68A 2Z22A 1JVXA 2NXOA 4R9GA 1SI0A 3VDFA 4BDQA 2QRYA 3MWBA 2OK2A 4JSDA 5H8SA 3TODA 2QS4A 2HZLA 2XD2A 2WKYA 4RXLA 1MXZA 5I57B 1SW2A 4MBPA 1QUKA 3K1NA 2I4CA 1ZKBA 2DVCA 3D4GA 3TEPA 4GIZA 1AL3A 3FVKA 2CMOA 3SEXA 1MH3A 4HTGA 1PB7A 3C34A 2I49A 3IJOB 4NF8B 5LOMA 1XVYA 2F7CA 3M8UA 5B70A 3CIJA 3USDA 1N84A 3FV1A 5FTHA 4RJZA 3K6UA 2H5YA 3VE1B 4R74A 3O6IA 1EU8A 4KYEA 4KCDA 2G93A 3OSRA 5I59A 3CFXA 3Q25A 3ILUB 1ZBMA 4F1UA 1P1OA 3IO6A 3R6UA 2UVJA 1LBCA 1S7YA 4LQ5A 1OQGA 4U4XA 3TTRA 2XX9A 4F31B 1MY0A 4K3FA 1ANFA 2QJEA 3S4UA 3K02A 4DZ1A 4Z7EA 1ELJA 4WEPA 2RKMA 3KG2A 3CSGA 2V3TA 3VLUA 4H5FA 4KQPA 3KN8A 1P99A 5EYFA 3UGWA 1TFDA 1B3LA 1JEVA 3VVFA 3KOSA 5L9MA 4X48A 1FQDA 2YJPA 4POWA 3KOTA 4F1VA 5H8QA 4I8CA 1UTHA 2P0SA 2H9BA 1D4NA 4XKRA 4TQUQ 1IEJA 4EQ9A 1OMPA 1Z7NE 2ZNTA 3TKDA 1MQHA 5EHSA 3MVYA 3MVXA 4LZ5A 1O63A 2DXRA 1YPNA 4E0WA 4G8NA 2E1SA 2XD3A 4Q8RA 5L9OA 5ITPA 1Y3NA 1RYXA 4U23A 2O84X 4G2ZA 4PFTA 2I4BA 3TQWA 1A54A 4C0RA 5L9SA 3EHUA 3GBBA 1URGA 5FHMA 1B40A 5H8HB 4H65A 1LAHE 4QHQA 2REJA 5ISUA 3IJXB 3VLWA 4G4PA 3KFMA 1OIBA 4YKKA 4ECFA 1J1NA 4F1YA 4RK2A 4ELRA 3UP9A 4H0WA 4F22A 3V89B 3MPLA 1DSNA 4OXVA 3B6WA 5JEIA 4ELOA 3FVGA 4OESA 1AMFA 4GVOA 3TQLA 3FUZA 1MQJA 1XVXA 1LFIA 2F5XA 4LP2B 1H3DA 4X1DA 5I59B 3C33A 4RY1A 3PGFA 4H8JA 1II5A 3TZAA 4NTLA 5DVIA 3IX1A 4HS7A 3H6UA 4MLVA 4YU0A 4G8MA 3LSLA 3FGSA 1SYIA 1RKMA 3CSBA 4PE5B 3DP8A 5FTIA 3PMVA 4I62A 1MG1A 1MDP1 4H6DA 3IB1A 1I6BA 2KLFA 1EZPA 4H1XA 1B58A 3E9XA 1B6HA 1TXFA 4DXUA 2O68A 4EF1A 2V3QA 4P11A 1IXGA 4LONB 3S2VA 4G68C 1N7XA 4ZEFA 5H8QB 1Z7ME 1CE2A 1UTBA 1UTHB 1QJMA 2PT2A 3HPIA 4FEDA 5JK4A 1FQEA 2UXAA 3Q27A 5IAIA 5HPQA 2UVGA 4ZDMA 2ESNA 1MXVA 4R2BA 3PPRA 1B7HA 3PPPA 1MQDA 2NWJA 2IA4A 5A5XA 5FHOA 3T22A 2Q2AA 3H3GA 4YICA 2ZYKA 1WDNA 3K1MA 1A99A 4GWOA 3MW0A 1LLSA 3ILTB 4N07A 3IOWA 2I3VA 1MY4A 4OQOA 1LAXA 3PV0E 3MUQA 4IY6A 4OETA 5TP9B 2M8CA 3K6WA 3OELA 1XT8A 3MP1A 4OMBA 2XXPA 1PBPA 2PX1A 2HAUA 1B0LA 4XKPA 4OVJA 4C1TA 4QFLA 1NNPA 4RK9A 1PBQA 2A5SA 3DELB 3O6GA 3DP6A 3TMGA 3VXCA 1POY1 1O64A 1R1NA 4YMBA 1H76A 1LAFE 4R6YA 2REGA 1IZ1A 1IIWA 2XXHA 3FXUA 5CMKA 3U1OA 4RA1A 3IOVA 2PVUA 3WAFA 1BIYA 3CR9A 1Y20A 2QPQA 3C32A 4H5GA 4NWDA 1Y4TA 2DWHA 3HO7A 4R9FA 4M4GA 4DCXA 1SI1A 1Y1ZA 4IO5A 3SERA 4ZZEA 5I56A 1N3WA 4KI0E 4JB7A 4F2OA 3G3KA 3G3IA 1JW4A 2Y84A 2ZYNA 2Q9TA 3N5LA 2QS2A 2QMXA 4ZZAA 5AE4A 3ZS6A 3CI8A 4G77A 2DP8A 2O1MA 3HSTA 1BKAA 2F7BA 2UYFA 1QKBA 1MM7A 1S9TA 5FHNA 4HCWA 3BFUA 2F7AA 2VD2A 4WEDA 4R72A 4DXCA 2ONKE 3S9LC 1UTBB 3CFZA 5K2XA 2OWSA 2YPNA 2F36A 4YKPA 3TAJA 4JWYA 4F2QA 1R9QA 4ZE9A 5AA3A 3BFTA 4O3AA 4LUBA 2I0BA 2PBWA 1Y1MA 1OVBA 3O6HA 1LFGA 4H8IA 5A5XB 5DVJA 1HSEA 2O69A 1SW1A 1HSJA 3QUFA 3G3JA 4DE8A 5H8HA 4KHZE 4LATA 3RGYA 4FJPA 5DTBA 2XXXA 2HQ0A 1SW5A 1GV8A 4O3CA 2ZNSA 3VLVA 5CRYA 1MH4A 3C4MA 3R7XA 3SEVA 3A3CA 2R9JA 1JQFA 2G29A 1QVSA 2VD3A 3LC8A 1M5CA 5HM4B 2DE4A 2I58A 3L6GA 4YAHX 4LZ8A 2W7YA 3N6TA 3OO6A 3SEWA 1FTLA 2HAVA 4HCYA 3TDJA 1GGGA 3TCHA 1LAGE 4ELPA 4F3GA 3FD3A 2OLBA 2NVUB 3QK6A 2PT1A 4IGRA 1LBBA 4Q0CA 3E4RA 4YKIA 3VFJA 1N76A 2B3FA 3C36A 2RC7A 4N6PA 1I6AA 1JVYA 4PFUA 3K0VA 2DWJA 1JEUA 5BUUA 1Y3PA 3H06B 1I69A 5I2KA 4U1ZA 4JBZA 2F6GA 2I0CA 4O3BA 2RF1A 2A5TA 3O29A 1N0TA 2XHDA 1B9JA 2GHBA 5I56B 1MQGA 1QUIA 4WXJA 4YB7A 5ICQA 2BJJX 4EXKA 1BP5A 4NF6A 1B3EA 5CM6A 3A09A 4F3BA 4FAJA 4POXA 3PUZE 4F39A 2O1LA 1WVJA 1B32A 1FCKA 1YCJA 3PD9A 2OBGA 3KGCA 1ZJLA 3G3HA 3PUYE 1XHYA 4QFOA 3G3FA 4QRZA 1URDA 3RN8A 3KZGA 3IOUA 4U1OA 1EH3A 4FECA 3LR1A 1B3HA 1ATGA 2X7QA 1B2HA 3HN0A 4ZEIA 4IB2A 4U21A 3PPQA 3RNNA 1MS7A 1JNFA 1XOCA 2V93A 1MXUA 1OVTA 1OLCA 1YAEA 2P1SA 3KJTA 3TTLA 2ABHA 5TP9A 3KJ7A 1VSOA 3JV9A 3UIFA 3OEKA 3K6VA 4MH5A 3BKIB 2ONSA 1LB9A 2UVIA 4IO3A 4QSDA 1NL5A 4MF3A 1MXWA 2ANJA 2R6GE 3KEIA 3IB2A 2ZXTA 1FQBA 3FIRA 3KN7A 3TPAA 3OOAA 1AOVA 2F97A 1A8EA 2O7UA 2Y7RA 2ZYOA 3CG1A 4IY5A 2V84A 1MY3A 3W15C 3RY3A 1DPPA 4OTEA 4FORA 4ESWA 1Q35A 2HZKA 1ZMGA 1B3GA 2E0SA 4P0IA 2D5WA 3E13X 4MFIA 4TLLB 3T9XB 3HV1A 3G7WA 1BTJA 4XKNA 2VOZA 3TCFA 1DMBA 3S9EA 3ECRA 3GXAA 3K4UA 2QL3A 3IORA 3RQTA 1M5FA 2H25A 5I2KB 2QS1A 1B7ZA 1POTA 4OFLA 3LSXA 2OCUA 2A5TB 4KD5A 2OJTA 2V3UA 4DIGA 3PMXA 1P1NA 3U72A 3VVDA 3A3UA 3ODBA 1MPBA 3OO9A 3IB0A 4NF6B 1SD3A 4ZECA 4RPNA 1D9YA 2YLNA 4PETA 3OO8A 2XX8A 3OEMA 3HHGA 4H67A 3H6WA 3EQ1A 3IL1B 2GH9A 1PEBA 3FJGA 2H4IA 1URSA 1M5BA 4PFYA 2VGQA 3FJMA 1IITA 5I58A 1MDQA 3UORA 4GFRA 3R26A 2O7IA 1USYH 3MVWA 1XS5A 1VFDA 1VFEA 3N26A 2VP1A 1SVXB 1Y3QA 5AA4A 1ZTYA 3W9VA 3S9NC 4KPTA 2PYYA 3GLBA 2DWIA 4NE4A 2AIXA 2DSFA 3FZVA 3QAXA 3D4CA 4UA8A 1AH5A 1MY2A 2HXWA 3TUSA 2HEUA 5F7VA 3IOTA 2HCAA 2CZLA 4EXLA 3W9WA 4EUOA 4ISUA 4NEDA 3SEUA 1TT1A 1QULA 4MLQA 1B7UA 3Q28A 2QMWA 3ZSFA 1Q1KA 2GHAA 3OD7A 1YTVA 3K1PA 3MJNA 4Q5TA 1QW0A 1BLFA 3QUJA 1D3KA 1ZU0A 4XXUA 3MAMA 4BDOA 1GVCA 1FQAA 4YB5A 4YB6A 5CMCA 4ESXA 4OYVA 3MVZA 3JYRA 4ZEKA 1B5HA 1SQYA 4F18A 2XXWA 4NF4A 1MQIA 4F19A 3VV5A 4F3SA 3O28A 3N6UA 2H98A 2R71A 4IO6A 3MZ1A 3FXRA 4X1BA 1PC3A 4P0GA 2RINA 4PP0A 4BDNA 4OEUA 3PPOA 4QFKA 1NNKA 1IUDA 2DS9A 4F29A 5H8NA 4N13A 3FVOA 1LCTA 4KCCA 1FTOA 2F6PA 3HHFA 3G3GA 4GOTA 3OMBA 2Z8DA 3UK4A 3H4ZA 4IO4A 3TTNA 4RPOA 3LSFB 1B5IA 3CVGA 1B52A 1AIVA 3TFLA 3H6TA 4OFOA 3Q29A 1H43A 1B05A 4NF5A 1MRPA 1PB9A 2Z8FA 3QXMA 1H45A 5DEXA 1NNFA 4R73A 3P7IA 1N3XA 2D21A 1PB8A 2I6EA 1MXXA 3TYHA 4ELQA 3O97A 5F1QA 1B0HA 5I58B 2O51A 1N7WA 3SDFA 5AA2A 3PMWA 4OWDA 5ITOA 3RTWB 5AA4B 2I3WA 2I48A 3K00A 2VHAA 2XXRA 3QSLA 4IGTA 1I6QA 2OZZA 3M3KA 3IO4A 4IO7A 4OERA 1L5TA 1JETA 2FNCA 1B51A 2V25A 1EZ9A 1GR2A 4EF2A 4DCYA 1A8FA 5J1DA 5EHMA 2FA7A 4PFWA 3PUWE 3UA8A 3H6VA 3C9HA 2THIA 3FJ7A 3KN3A 5DT6A 4U22A 2XXUA 1EZOA 4F3PA 3KSXA 1JW1A 2DYXA 1UIUA 1FTKA 2GRVA 4JXIA 3S9MC 4ZE8A 2RCAA 4G8HA 3BBRA 4JWXA 2B65A 3I3VA 2Q89A 4X9TA 3M3LA 4KFQA 4KYSA 5I2NA 2DE2A 1DOTA 3O66A 2F35A 4NF4B 4Z0IA 3HCQA 4WKMA 2Y7PA 5KCJA 2AL5A 1O7TA 2NUVA 4DLDA 3PU5A 3MBPA 4YKJA 3FVNA 4JSOA 4I9DA 1NKXA 3RT8A 3L6HA 4NMYA 3E3KA 3OXNA 3PPNA 3TTKA 2D3IA 5H8NB 5ICTA 1QKAA 1B4HA 4ND9A 1NMUA 3IAZA 4QFNA 1F9BA 5H8FA 4EQ7A 4AB5A 3T93B 4FE8A 4R6HA 1OQHA 4QSEA 2XXIA 5DVFA 2Q8JA 5JTYA 3OSQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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