3KFMA

Crystal structure of the glua4 ligand-binding domain l651v mutant in complex with kainate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTVDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYTEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Enhanced efficacy without further cleft closure: reevaluating twist as a source of agonist efficacy in AMPA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 4
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kfmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kfmA02
3PGFA 4KFQA 2DVCA 1MQGA 1MY4A 2XX8A 3MAMA 5DVIA 4U23A 1B51A 4QSCA 3TFLA 1MQHA 3C36A 3IK6B 3FJGA 1B5JA 4IO7A 4YMBA 1B0HA 1SDXA 2YJPA 5AA1A 1VE4A 3RN8A 2O7UA 4OZ9A 4O3BA 3A3CA 1D9VA 3PPPA 3IORA 2F6GA 2DS9A 3VLVA 1SVXB 3BKIB 1WODA 3UP9A 4NF4A 3MVXA 2PT1A 3FGSA 4OVJA 2OBGA 4F31B 1CB6A 4TOZA 1B5HA 5CI5A 2REGA 2HQ0A 3E3KA 3HN0A 2FNCA 3ZSFA 4JSDA 3EQ1A 2ONKE 4H6DA 2B65A 1MY1A 4YICA 1B0LA 4KHZE 2PT2A 1TXFA 4H1XA 1VFDA 2E1SA 3LR1A 1KWHA 4LZ5A 1TWYA 2RKMA 2Z8DA 1JW5A 2XXXA 4DXCA 4ZZEA 2O1LA 5TP9B 1LGBC 1GV8A 3K01A 2F7CA 1FQFA 1EZ9A 5TU0A 4ECFA 2W7YA 4LATA 2GHAA 1H44A 5I58A 4YMAA 3KSXA 2O1MA 1FQAA 1N76A 1YTVA 1B6HA 3O66A 4KQPA 2QS4A 4GXAA 1DMBA 2QL3A 1QVSA 3FD3A 3T9UA 4U22A 4OXVA 5H8HB 2G93A 1B5IA 4F3GA 4F2QA 4FIMA 1S9TA 4RNSA 3EF7A 3ILUB 4XKNA 3FV2A 3S4UA 1H43A 4EQ7A 3MZ9A 3FXUA 1PB8A 4BDNA 4JWYA 2DE4A 3HHFA 3CSGA 5CBRA 4F3PA 3N6UA 4JWXA 4ZEIA 4GLIA 3SESA 4OFOA 1F9BA 3S9EA 3FJMA 2Y7KA 3UIFA 2ZYMA 2Q9TA 4U2RA 1XOCA 4KCDA 1A40A 5I57A 4H67A 4F2OA 3UN6A 2NOOA 2I58A 1UIVA 3FUZA 2OCUA 2H5YA 4LONB 4U1OA 2RC9A 1FQDA 2R9JA 3RT8A 2DWJA 3FIRA 1NNTA 1EZOA 4GF8A 3PMWA 4F1YA 2I3VA 2RC7A 4IGRA 2Y7RA 1O7TA 1B9JA 2Y84A 4DE8A 4EUOA 3KN3A 3K1MA 3OEMA 3EPEA 5FHNA 1OVTA 2YLNA 3IAZA 1DPEA 2XXHA 3FZVA 4OEUA 2ZYKA 4G4PA 1QKBA 2UYEA 5L8DA 4DZ1A 5AA3A 3N6TA 3ZKKA 4LZ7A 3DP4A 4ZZAA 3TZAA 3TTNA 4U1ZA 4YB5A 3IOTA 1SYIA 1ANFA 3G3HA 3LSXA 4N6PA 3OENA 1ATGA 4RYAA 5J1DA 5H8SA 4F3BA 3OO9A 1MG1A 5I59A 4POWA 1B58A 3KN7A 4BDRA 4R2BA 4OESA 3PUZE 3T9HB 4YAHX 5ICQA 4L17A 3VLUA 2Z8FA 3RPWA 4YKIA 4ONYA 2Q2AA 4ELRA 2UYFA 3OEKA 2ALUA 2HXWA 2FA7A 3PPOA 4MBPA 1N3WA 1B4ZA 3O2AA 3PPRA 5JTYA 5AA2D 5DVJA 3FVGA 1SW2A 4DIGA 5A5XB 3M3LA 1XHYA 4NF5A 3Q28A 1MPDA 3TTKA 1R9LA 1A99A 3IO4A 1IXIA 4JWOA 1CE2A 3C9HA 3CG3A 3H4ZA 3MVZA 3B6QA 4GL0A 3LUYA 1QW0A 3PPNA 4IO2A 3Q25A 3WAFA 1NNKA 3K6UA 3T9XB 4OFJA 4H0WA 3S9LC 1SQYA 4FORA 1NH7A 2V3QA 3VFJA 2XXIA 4IB2A 3L6GA 4OETA 1Z7NE 2D21A 3TYHA 1URDA 1IUDA 1SI1A 1QULA 2ZNSA 2HZKA 1H45A 2F8DA 2XD2A 3TQWA 4RPOA 2GHBA 2DXYA 4ZE8A 4PFYA 1UTBA 3PUVE 2ZNTA 1AOVA 1Y20A 3SEUA 4F29A 4EQBA 2PX1A 3KZGA 1UTHA 3T22A 3TEPA 5DVFA 4GFRA 4WEDA 3TELA 4JSOA 1NMUA 3OELA 3M3FA 3V83A 4DDDA 3ILTB 3U94A 4QSDA 1JVYA 4X1BA 2PVUA 2I49A 2VD2A 4X48A 3S9MC 1URGA 1HSLA 4EXKA 1ZJLA 3H6UA 1LCTA 2RC8A 4ZDMA 3KGCA 1OQHA 3MP8A 4THIA 4ZEKA 1OLAA 1MH3A 4KCCA 4OFLA 2OLBA 3MP6A 1MM6A 1GR2A 1NKXA 3H6TA 2R6GE 3C32A 1HSJA 2NWJA 4BDQA 4YB6A 4E0XA 2OK2A 3VVFA 1FW0A 3TCFA 1P99A 4POXA 5F1QA 3IR1A 3BBRA 5B70A 4NE4A 2Q8JA 2DE3A 3PUYE 4XKPA 3T93B 3IX1A 3VV5A 5CMKA 3K2DA 1L5TA 4JBZA 1M5EA 2O6AA 4PP0A 2DXRA 1SW5A 1Y4TA 1MRPA 3T9VA 5FTHA 2H4IA 5CBSA 5L9MA 1Y1ZA 1Y9UA 1Y1MA 4FAJA 1B46A 3TODA 5HM4B 2UXAA 3UORA 3U93A 5DTBA 5DT6A 4QHQA 3RQTA 1M5FA 4F19A 2QJEA 2ZYOA 3C33A 1MQIA 3G3KA 2Z22A 1IXHA 4ZECA 1A8FA 1P1UA 2B3BA 3IJOB 2NVUB 4OHNA 3B7DA 3PV0E 4NF4B 3G7WA 3RGYA 4NF6A 4QFOA 3DM0A 3Q29A 1IQ7A 5FHOA 3A3UA 1LAXA 1IZ1A 3CG1A 3JYRA 2B3FA 2DOJA 4XKQA 3PMVA 1MDP1 3QIMA 1JQFA 1URSA 1PEBA 3U1OA 4LQ2A 4U4XA 1SW1A 2Z8EA 4KD5A 2PMSA 1JVXA 3H3GA 3V5AA 3KBRA 5I58B 3K6XA 3FXQA 3HCQA 4EF2A 2XXPA 4KPTA 1USYE 1SYHA 2QRYA 2REJA 2GFEA 4IO6A 1D4NA 3C4MA 3C31A 2IEEA 3C35A 5CRYA 1N0TA 5BUUA 2AL5A 2ANJA 3QAXA 5DYHA 1BIYA 1FQEA 2FYIA 2F35A 4PETA 2KLFA 5KCJB 2QS3A 4ZEFA 4LZ8A 2Q2CA 4P0IA 3UK4A 2V3TA 2OJTA 1QKAA 1B7UA 3IB0A 1POY1 3F11A 1BLFA 4FATA 3O29A 1MQDA 3QXMA 1FTLA 4HTGA 2HEUA 5KCJA 3S9NC 2UVIA 1LFGA 1ZIUA 5K2XA 4TLMB 1YCJA 4LVQA 2YPNA 1WDNA 4BDLA 4IO4A 4F1UA 4FEDA 5I57B 2HAVA 3PUWE 2NUVA 1P1OA 3KJ7A 3ONMA 4NWDA 2I48A 3SETA 2XXVA 3LC8A 1N3XA 2RCBA 1DTGA 4O3AA 3TPAA 3D4GA 1I6BA 1ZTYA 4R73A 3KJTA 1A55A 4KYDA 2DE2A 4MFIA 1B7ZA 1OIBA 4BLAA 3QUFA 1B2HA 1XT8A 3AXFA 4RY1A 4IO3A 4WEPA 1AL3A 4KYSA 2V84A 1GVCA 5ITOA 2F6PA 3K6WA 1N04A 2UVJA 4IY6A 3TUSA 4ZE9A 1D3KA 1MY0A 2I0CA 5JK4A 2P2AA 3O6GA 1Q1KA 3WAEA 3MQ9A 1LBBA 3SERA 3OXNA 4ESWA 4F1VA 3E4RA 2QMWA 3KOTA 5I59B 3W9VA 1N7XA 2UVHA 2OWSA 4QFLA 1DSNA 1DTZA 2F7AA 3SEVA 3VXBA 1ZBMA 1LCFA 1ZLQA 5JEIA 5FTIA 3CVGA 4R6YA 4GVOA 4NMYA 1PB7A 2P1SA 1B1HA 1LSTA 3FATA 4Q5TA 4XTCQ 1GTKA 4ZS9A 1I6QA 1XVXA 2A5SA 2D5WA 5JTYB 3TDJA 1B32A 4NF5B 3G3FA 4YKKA 2DWIA 5I84A 4Z7EA 4DXBA 1Y4CA 2F36A 2VHAA 3OMBA 4DLDA 4LUBA 3KOSA 4DXUA 1A7LA 3LSLA 3T66A 1PC3A 1LLSA 4G68C 4C1UA 1US4A 2ONRA 3UA8A 4XIGQ 1LAHE 1PDAA 3HO7A 1FCKA 4KYEA 4C1TA 4C0RA 3QUJA 1BP5A 2XXWA 3MBPA 4OMBA 1TT1A 2DYXA 3B6WA 1R9QA 1II5A 2Y7PA 4Q8RA 3EHSA 2GH9A 4PFWA 2HAUA 3ODBA 1H76A 1UTBB 4I62A 3FVNA 1B05A 3L6HA 3LBSA 1UTHB 3CFXA 4F3SA 1J1NA 2AYSA 4OENA 4QFNA 4EQ9A 3CSBA 1DOTA 1M5DA 1FTKA 3GBBA 3RY3A 4U4SA 4RXLA 3E13X 1D9YA 4YU0A 1MQJA 1LAFE 4UA8A 1PBPA 2V93A 3RT6B 4FECA 2BJJX 4LA9A 1HSEA 3TTRA 2A5TA 5ELVA 2DP8A 3Q27A 3PD9A 4QF9A 2H99A 5TPAA 4R72A 4GRKA 2UVGA 2ESNA 1EZPA 1DPPA 1P1WA 1PBQA 1AMFA 3G3GA 5EHMA 4ELPA 3BFUA 3KSJA 4MLQA 3ZKLA 1GGGA 5H8FA 2XD3A 4N13A 1MXVA 3RLFE 2O7IA 2Q88A 4ESXA 4TLLB 3IOUA 3MVYA 5B7DA 1EU8A 4H5FA 5KDTA 1N84A 3G3JA 2V3UA 1JETA 1LFIA 3GBAA 4IO5A 3OD7A 1MY3A 4ND9A 4ELOA 1P1QA 1LBCA 2ZXTA 3MUQA 4JB7A 3N94A 3K00A 5EYFA 3SKPA 3K4UA 4N07A 4GD5A 3OO7A 5AA2A 1AH5A 5HPQA 4G8HA 1A54A 1US5A 4I9DA 4RA1A 1VFEA 2CMOA 5I2KA 4G2ZA 1SW4A 4IY5A 4G8NA 2X7PA 4R9FA 1MY2A 3IOVA 3P7IA 3SEXA 4EXLA 4LP2B 2VGQA 3TAJA 4HS7A 5IAIA 4OWDA 1LAGE 2X26A 3RTFB 1MXXA 3MJNA 1MXZA 1MDQA 5FHMA 1NL5A 1O64A 2H9BA 1FQCA 5LOMA 5AA4B 3RNNA 3IB1A 4QSEA 1NFTA 4NF6B 2RCAA 2QS1A 5DEXA 4G68A 1Y3QA 1T0KA 3I6VA 3PU5A 2XXTA 3OOAA 3HV1A 4O3CA 3EHTA 5AA4A 3U72A 3JZJA 2DQVA 3BFTA 3O9PA 4PFTA 2I4BA 1B3FA 1QJMA 4JXIA 5CMMA 3PMXA 2VOZA 3ZS6A 1AIVA 3MPKA 2I0BA 4GXSB 1SBPA 1JW1A 4OEVA 3DP8A 1XS5A 4GQOA 3M8UA 3JV9A 1OLCA 3CFLA 1MM7A 2DSFA 3K02A 5CMBA 2XXRA 1OVBA 2O68A 4NF8B 4RPNA 1NH8A 3PUXE 2ZMBA 4YZZA 4ZEBA 1B4HA 2F5XA 2F78A 4QFPA 2H98A 4P0GA 4NWCA 2HCAA 3O97A 1QUIA 5F7VA 5H8NB 4OQOA 4NF8A 1IXCA 2QMXA 1LB8A 4X1DA 1P1NA 1NNPA 3MZ1A 1TFDA 1IEJA 4ZEDA 5H8NA 1MXWA 3GLBA 1LFHA 2M8CA 3H6WA 1MS7A 3KN8A 4YKPA 3KFMA 1H3DA 5I56B 3HHGA 3W15C 2XX7A 2Y7WA 4F22A 1VSOA 5TP9A 3IOWA 3UGWA 3IO6A 2P0SA 4Q30B 3OSRA 1TFAA 2DWHA 4YB7A 3TKDA 1UQWA 3RTWB 5I56A 1R6ZA 4XXUA 3M3KA 4EDPA 3FASA 1I69A 1FTMA 4G77A 2X7QA 1EH3A 1VR5A 1USYH 3H7MA 3Q26A 4RJZA 3D4CA 3K1PA 4QRZA 3KG2A 4ELQA 5H8HA 2I4CA 5I2NB 4XKRA 1B1XA 1MXYA 3TTMA 3CR9A 3CI8A 3TTLA 2Z23A 5L9OA 4R2FA 3K0VA 1Y3PA 3MVWA 3V89B 3MPLA 3QYTA 2DVZA 5I2NA 1N7WA 2XXUA 3H06B 4HW8A 2V25A 4F18A 2I6EA 2R71A 2CZLA 1JNFA 4HCYA 5EHSA 5L9SA 2HFBA 1QUKA 4F39A 4R6KA 3KEIA 1SI0A 3LSWA 3HSTA 3VLWA 1ZMGA 1BTJA 2VP1A 2PBWA 3IB2A 2O84X 2Q89A 3OSQA 3OO6A 3MP1A 2QSXA 3H6VA 4OTEA 2XXQA 3W9WA 2QPQA 1B7HA 1B3LA 2DWAA 2ONSA 3I3VA 4U21A 1Y3NA 3PD8A 4BDOA 4GWOA 4Z0IA 3QK6A 4YKJA 3GXAA 2RINA 1WVJA 4M4GA 2XHDA 4AB6A 2G29A 3TMGA 1ZU0A 4NTLA 1R1NA 3CFZA 4TQUQ 1PB9A 1A8EA 1SD3A 1Q35A 3I5OA 2O51A 3DELB 2XXYA 1M5CA 2E0SA 3HPIA 3VDFA 4MF3A 2XX9A 3K1NA 2OZZA 1OMPA 4OERA 3ECRA 1RKMA 3K6VA 3FVOA 4NEDA 3CRBA 3EHUA 4HCWA 5ITPA 4AQ4A 3B6TA 3MW0A 3USDA 1MPCA 4RK9A 1FTJA 2ZYNA 4KI0E 4BDMA 4MLVA 4M1VA 3OO8A 4H65A 2RF1A 3PPQA 5BWJA 1OQGA 3SEWA 3A09A 4I1DA 3O6HA 1LB9A 2F97A 5KZTA 1I6AA 2QS2A 1YAEA 4Q0CA 1QUJA 1ELJA 5K2YA 5A5XA 1JW4A 5M2VA 3CIJA 5IKBA 4QFKA 2O69A 3H03A 1B52A 4RK2A 1B40A 2F34A 2A5TB 2F7BA 4R75A 1JEUA 5ICTA 2OWTA 1S7YA 4FJPA 3IL1B 5TPAB 3VXCA 3U8QA 2ABHA 5H8QB 2LAOA 2H25A 3O6IA 3N5LA 4IGTA 3MC2A 3G3IA 5AE4A 5H8FB 1S50A 2IA4A 5H8QA 1RYOA 4UACA 1B3GA 4DCYA 3MZBA 5CC2A 3EN3A 3FJ7A 2GRVA 5KDTB 4KR5A 4DCXA 4JDFA 3THIA 1IIWA 1IITA 2I3WA 3DP6A 3DLNA 3N26A 3O28A 1YPNA 4FE8A 4PQJA 3T96B 4EF1A 3R7XA 3RUMA 1MPBA 5ISUA 1B3EA 5AA2B 3MWBA 3R26A 3VVEA 4PFUA 2AIXA 1XC1A 3E9XA 3FV1A 4WKMA 5I2KB 3SDFA 3FVKA 3TCGA 2ZNUA 1O63A 4AB5A 3LSFB 3C34A 2D3IA 3TQLA 1M5BA 3R6UA 4GOTA 1UIUA 3V8XB 1NNFA 4I8CA 2PYYA 3VE1B 4GIZA 2NXOA 3IJXB 1MH4A 4R6HA 4H8IA 4X9TA 1RYXA 4P11A 4MH5A 3S2VA 3GZGA 4LQ5A 2WKYA 1Z7ME 3FXRA 1FTOA 4H5GA 5DEXB 3QSLA 1FQBA 4G68B 4WXJA 4G8MA 4OYVA 1BKAA 2Y7IA 3SEYA 2VD3A 2AL4A 1POTA 1ZKBA 4R74A 4R9GA 3U92A 2THIA 1JEVA 3TCHA 4E0WA 4ISUA 2HZLA 4PE5B 1IXGA 1MXUA 5HBCA 4K3FA 1B3HA 4H8JA 4GL8A 1XVYA 4FEBA 5CMCA 3VVDA 5CM6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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